Viral Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of viral only.

See also: hub accessassembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiGene gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 adeno-associated virus 2 (1993)
GCF_000838645.1
14
(89.01 %)
53.80
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(3.18 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(54.43 %)
2 Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005)
GCF_000864245.1
11
(95.04 %)
33.42
(99.83 %)
n/a 11
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.20 %)
37
(2.83 %)
0
(0.00 %)
3 Aichi virus 1 (A846/88 1998)
GCF_000861885.1
1
(88.50 %)
58.90
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.09 %)
n/a 8
(2.47 %)
1
(81.27 %)
4 Alkhumra hemorrhagic fever virus (Zaki #2 2012)
GCA_031116565.1
1
(95.14 %)
54.00
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.40 %)
n/a 2
(0.13 %)
0
(0.00 %)
5 Alphapapillomavirus 4 (1991)
GCF_000864945.1
7
(86.62 %)
48.40
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.34 %)
1
(0.50 %)
7
(2.05 %)
0
(0.00 %)
6 Anatid alphaherpesvirus 1 (2085 2023)
GCA_008791745.1
78
(79.40 %)
44.93
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(0.18 %)
13
(1.23 %)
226
(2.34 %)
5
(4.61 %)
7 Anjozorobe virus (Anjozorobe/Em/MDG/2009/ATD49 2017)
GCF_002145785.1
3
(93.60 %)
37.87
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
6
(0.78 %)
1
(0.36 %)
16
(2.19 %)
0
(0.00 %)
8 Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003)
GCF_000856545.1
4
(95.69 %)
41.57
(99.95 %)
n/a 2
(100.00 %)
4
(0.24 %)
1
(0.48 %)
2
(0.58 %)
0
(0.00 %)
9 Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012)
GCF_000895575.1
3
(99.13 %)
40.52
(99.93 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(2.01 %)
0
(0.00 %)
10 Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012)
GCF_000899535.1
3
(99.15 %)
40.00
(99.93 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(2.19 %)
0
(0.00 %)
11 Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012)
GCF_000901475.1
3
(98.01 %)
41.78
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.29 %)
0
(0.00 %)
12 Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012)
GCF_000897955.1
3
(97.62 %)
42.99
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.11 %)
0
(0.00 %)
13 Atlantic salmon calicivirus (Nordland/2011 2014)
GCF_000919195.1
2
(97.89 %)
53.49
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
3
(56.39 %)
14 Australian bat lyssavirus (insectivorous isolate 1999)
GCF_000850325.1
5
(91.79 %)
44.15
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.61 %)
0
(0.00 %)
15 Bacillus phage PfNC7401 (2016)
GCA_002611025.1
79
(85.50 %)
36.55
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.12 %)
4
(0.31 %)
121
(3.62 %)
0
(0.00 %)
16 Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000)
GCF_000858185.1
12
(86.10 %)
39.33
(99.89 %)
n/a 12
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(0.64 %)
0
(0.00 %)
17 Barmah Forest virus (BH2193 1997)
GCF_000847585.1
5
(95.39 %)
48.55
(99.97 %)
2
(0.02 %)
3
(99.98 %)
4
(0.59 %)
n/a 7
(2.47 %)
5
(15.26 %)
18 Bat sapovirus (Bat-SaV/Limbe65/CAM/2014 2017)
GCF_002005625.1
2
(97.81 %)
46.98
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 5
(0.75 %)
1
(5.51 %)
19 Bat sapovirus (TLC58/HK 2012)
GCF_000894635.1
2
(96.96 %)
60.16
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.49 %)
n/a 6
(0.66 %)
1
(94.41 %)
20 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCF_000837645.1
18
(99.29 %)
40.76
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(4.54 %)
15
(4.33 %)
0
(0.00 %)
21 Bovine calicivirus strain (Kirklareli 2016)
GCF_001714355.1
2
(98.04 %)
58.37
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.09 %)
1
(96.34 %)
22 Bovine herpesvirus type 1.1 (NVSL challenge 97-11 2022)
GCF_008777455.1
75
(84.84 %)
72.42
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 116
(4.31 %)
1,304
(33.41 %)
1
(99.99 %)
23 Bowe virus (VN1512 2017)
GCF_002118085.1
3
(94.38 %)
36.23
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(1.00 %)
1
(0.29 %)
12
(2.09 %)
0
(0.00 %)
24 Bruges virus (BE/Vieux-Genappe/TE/2013/1 2017)
GCF_002117675.1
3
(93.06 %)
38.99
(99.93 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.47 %)
n/a 8
(1.00 %)
0
(0.00 %)
25 Bunyamwera virus (1991)
GCF_000849925.1
4
(95.34 %)
35.16
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 30
(3.12 %)
0
(0.00 %)
26 Cache Valley virus (6V633 2019)
GCF_004789995.1
4
(95.45 %)
35.43
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(0.75 %)
0
(0.00 %)
27 Calicivirus chicken/V0021/Bayern/2004 (Bavaria04V0021 2023)
GCF_004786895.1
2
(98.62 %)
54.02
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.64 %)
1
(4.06 %)
28 Calicivirus isolate (TCG 14 2005)
GCF_000859525.1
2
(98.09 %)
56.20
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.19 %)
n/a 2
(1.07 %)
2
(69.58 %)
29 Calicivirus pig/AB90/CAN (AB90 2009)
GCF_000883855.1
2
(99.21 %)
54.31
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.39 %)
1
(0.39 %)
10
(1.83 %)
0
(0.00 %)
30 California encephalitis virus (BFS 283 2021)
GCF_003972565.1
4
(94.87 %)
36.45
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.66 %)
0
(0.00 %)
31 Camel Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (camel/Abu Dhabi/B84 2020)
GCA_032106395.1
3
(96.30 %)
43.00
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.56 %)
n/a 16
(0.70 %)
0
(0.00 %)
32 Canine vesivirus (2003)
GCF_000851085.1
3
(97.08 %)
45.89
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.63 %)
0
(0.00 %)
33 Capira virus (VP-366G 2015)
GCA_031322265.1
4
(95.28 %)
38.38
(99.97 %)
2
(0.03 %)
5
(99.97 %)
4
(1.01 %)
6
(0.94 %)
4
(1.22 %)
0
(0.00 %)
34 Carnivore chapparvovirus 1 (VRI 849 2020)
GCA_031190585.1
2
(83.55 %)
37.38
(99.90 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.90 %)
n/a 3
(1.98 %)
0
(0.00 %)
35 Cercopithecine alphaherpesvirus 2 (B264 2004)
GCF_000846965.1
80
(78.07 %)
75.97
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
169
(6.25 %)
180
(5.92 %)
1,059
(33.71 %)
1
(100.00 %)
36 Chandipura virus (CIN 0451 2013)
GCF_000906815.1
5
(96.34 %)
42.53
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.29 %)
n/a 19
(1.75 %)
0
(0.00 %)
37 Chicken calicivirus (RS/BR/2015 2017)
GCF_001963095.1
2
(95.46 %)
54.17
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.38 %)
1
(2.63 %)
38 Chikungunya virus (S27-African prototype 2002)
GCF_000854045.1
2
(94.47 %)
50.04
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.87 %)
n/a 3
(1.76 %)
7
(34.06 %)
39 Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009)
GCF_000885595.1
1
(83.53 %)
43.75
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.63 %)
n/a 5
(1.90 %)
0
(0.00 %)
40 Cowpox virus (Brighton Red 2002)
GCF_000839185.1
233
(91.92 %)
33.40
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
41
(0.80 %)
64
(2.52 %)
1,041
(9.40 %)
0
(0.00 %)
41 Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003)
GCF_000854165.1
3
(95.80 %)
42.23
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.22 %)
26
(1.53 %)
0
(0.00 %)
42 Crosse virus (La Crosse/original 1994)
GCA_002831285.1
6
(94.68 %)
36.60
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 17
(1.43 %)
0
(0.00 %)
43 Dandenong virus (0710-2678 2007)
GCA_031580275.1
4
(95.83 %)
43.24
(99.99 %)
n/a 2
(100.00 %)
4
(0.73 %)
1
(0.31 %)
5
(1.88 %)
0
(0.00 %)
44 Deer tick virus (ctb30 CT95 2001)
GCA_004786555.1
1
(94.89 %)
52.70
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(0.86 %)
1
(2.25 %)
45 Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997)
GCF_000862125.1
1
(94.82 %)
46.67
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.68 %)
0
(0.00 %)
46 Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993)
GCF_000871845.1
5
(98.86 %)
45.82
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 2
(0.16 %)
0
(0.00 %)
47 Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2007)
GCF_000866625.1
5
(98.92 %)
46.71
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.60 %)
0
(0.00 %)
48 Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001)
GCF_000865065.1
4
(98.81 %)
47.13
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.27 %)
0
(0.00 %)
49 Dengue virus type 3 (H87 2023)
GCA_004788295.1
1
(95.11 %)
46.65
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.19 %)
0
(0.00 %)
50 Dengue virus type 4 (814669 2023)
GCA_004786575.1
1
(95.45 %)
47.05
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.27 %)
0
(0.00 %)
51 Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017)
GCF_002116195.1
6
(95.15 %)
45.84
(99.90 %)
n/a 6
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.33 %)
0
(0.00 %)
52 Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995)
GCF_000850985.1
3
(96.61 %)
40.19
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 41
(3.15 %)
0
(0.00 %)
53 Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013)
GCF_000905375.1
5
(90.59 %)
44.22
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.72 %)
0
(0.00 %)
54 Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018)
GCF_003032765.1
5
(93.39 %)
37.99
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.77 %)
n/a 8
(0.77 %)
0
(0.00 %)
55 Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991)
GCF_000862705.1
5
(96.00 %)
48.71
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.91 %)
n/a 3
(0.64 %)
5
(23.55 %)
56 ebolavirus (Reston virus/M.fascicularis-tc/USA/1989/Philippines89-Pennsylvania 2002)
GCF_000854085.1
11
(98.80 %)
40.62
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.55 %)
n/a 6
(0.28 %)
0
(0.00 %)
57 ebolavirus (Sudan virus/H.sapiens-tc/UGA/2000/Gulu-808892 2004)
GCF_000855585.1
11
(96.95 %)
41.34
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.38 %)
n/a 10
(0.49 %)
0
(0.00 %)
58 ebolavirus (Tai Forest virus/H.sapiens-tc/CIV/1994/Pauleoula-CI 2010)
GCF_000888475.1
11
(96.41 %)
42.26
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.50 %)
n/a 24
(1.26 %)
0
(0.00 %)
59 Ectromelia virus (Moscow 2002)
GCF_000841905.1
173
(80.43 %)
33.18
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
45
(0.96 %)
22
(1.55 %)
1,122
(9.40 %)
0
(0.00 %)
60 Encephalomyocarditis virus (Ruckert 1993)
GCF_000862985.1
3
(87.80 %)
49.47
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.68 %)
1
(1.68 %)
2
(1.83 %)
0
(0.00 %)
61 Enterovirus 5666/sin/002209 (2001)
GCA_031116435.1
1
(88.81 %)
48.02
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(1.00 %)
1
(3.40 %)
62 Enterovirus 5865/sin/000009 (2001)
GCA_031116425.1
1
(88.81 %)
48.03
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(1.15 %)
1
(3.40 %)
63 Enterovirus A (1994)
GCF_000861905.1
1
(88.79 %)
47.94
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.09 %)
1
(3.32 %)
64 Enterovirus A71 (BrCr 1996)
GCA_008766895.1
1
(88.85 %)
47.66
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.63 %)
1
(5.09 %)
65 Enterovirus A71 (pinf7-54A 2005)
GCA_031109255.1
1
(88.18 %)
47.90
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.72 %)
1
(0.72 %)
1
(0.74 %)
0
(0.00 %)
66 Enterovirus C (human poliovirus 1 Mahoney 1982)
GCF_000861165.1
5
(98.35 %)
46.34
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.40 %)
1
(6.95 %)
67 Enterovirus D (Enterovirus 70 1993)
GCF_000861205.1
1
(89.14 %)
42.80
(100.00 %)
3
(0.04 %)
4
(99.96 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
68 enterovirus D68 (Fermon 2018)
GCF_002816725.1
1
(89.14 %)
41.07
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.27 %)
0
(0.00 %)
69 Eothenomys miletus hantavirus (LX309 2018)
GCF_002827125.1
3
(91.02 %)
37.39
(99.94 %)
1
(0.01 %)
4
(99.99 %)
5
(0.87 %)
n/a 18
(2.75 %)
0
(0.00 %)
70 Epstein-Barr virus (Raji 2005)
GCF_002402265.1
98
(77.44 %)
59.50
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
30
(0.66 %)
34
(5.62 %)
577
(10.56 %)
27
(45.97 %)
71 Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007)
GCF_000872045.1
114
(68.90 %)
59.54
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
34
(0.79 %)
29
(5.78 %)
498
(10.10 %)
24
(45.98 %)
72 Equine herpesvirus 1 (Ab4 1993)
GCA_000844025.1
81
(83.51 %)
56.66
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
23
(0.73 %)
28
(3.15 %)
306
(5.68 %)
2
(99.10 %)
73 Escherichia phage Lambda (2000)
GCF_000840245.1
92
(95.32 %)
49.86
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.20 %)
n/a 36
(0.81 %)
4
(51.36 %)
74 European bat 1 lyssavirus (RV9; 9395GER 2007)
GCF_000870765.1
5
(90.43 %)
44.65
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.08 %)
0
(0.00 %)
75 European brown hare syndrome virus (EBHSV-GD 2000)
GCF_000857785.1
2
(98.66 %)
49.34
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.79 %)
1
(3.24 %)
76 Fathead minnow calicivirus (FHMCV/USA/MN/2012 2017)
GCF_002285005.1
2
(98.66 %)
50.67
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(1.25 %)
3
(65.78 %)
77 Feline calicivirus (2023)
GCF_008767155.1
2
(95.03 %)
46.14
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.22 %)
0
(0.00 %)
78 Feline calicivirus (Urbana 2003)
GCF_000853345.1
3
(100.00 %)
45.17
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.39 %)
0
(0.00 %)
79 Fugong virus (FG10 2017)
GCF_002118945.1
3
(93.43 %)
36.93
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.38 %)
n/a 15
(1.61 %)
0
(0.00 %)
80 Gallid alphaherpesvirus 1 (SA-2 1999)
GCA_000847005.2
90
(80.77 %)
47.74
(99.98 %)
n/a 14
(100.00 %)
11
(0.22 %)
9
(0.61 %)
221
(1.97 %)
23
(30.48 %)
81 Gallid alphaherpesvirus 3 (HPRS24 2000)
GCF_000838845.1
78
(74.47 %)
53.61
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
47
(1.57 %)
60
(2.83 %)
387
(6.28 %)
1
(99.49 %)
82 GB virus C (1996)
GCF_000862005.1
1
(91.81 %)
59.09
(99.98 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 15
(1.67 %)
2
(82.30 %)
83 GIII (Norovirus Bo/GIII.2/Adam/2006/No 2016)
GCF_001595675.1
3
(99.14 %)
57.11
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(1.01 %)
6
(36.84 %)
84 Goatpox virus (Pellor 2002)
GCF_000840165.1
150
(93.15 %)
25.31
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
51
(1.59 %)
8
(0.24 %)
1,548
(24.38 %)
0
(0.00 %)
85 Goose calicivirus (N 2014)
GCF_000920715.1
2
(97.15 %)
54.67
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.25 %)
1
(41.13 %)
86 Hantaan orthohantavirus (76-118 2003)
GCF_000856085.1
3
(94.17 %)
38.56
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(0.78 %)
0
(0.00 %)
87 Hantavirus (Z10 2004)
GCF_000855785.1
3
(94.13 %)
39.29
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.38 %)
1
(0.30 %)
14
(1.40 %)
0
(0.00 %)
88 Heartland virus (Patient1 2014)
GCF_000922255.1
4
(96.17 %)
46.33
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.27 %)
0
(0.00 %)
89 Heartland virus (TN 2023)
GCF_013086545.1
4
(96.63 %)
46.52
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.18 %)
0
(0.00 %)
90 Hendra henipavirus (1998)
GCF_000852685.1
9
(82.12 %)
39.43
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.38 %)
n/a 13
(0.75 %)
0
(0.00 %)
91 Hepatitis B virus (2015)
GCF_000861825.2
4
(55.31 %)
48.46
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(12.45 %)
92 Hepatitis C virus genotype 1 (H77 1997)
GCF_000861845.1
3
(93.68 %)
58.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.33 %)
6
(1.40 %)
13
(2.88 %)
1
(90.43 %)
93 Hepatitis delta virus (1993)
GCF_000856565.1
2
(38.35 %)
58.81
(99.88 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(2.68 %)
1
(3.63 %)
1
(71.11 %)
94 Hepatovirus A (1993)
GCF_000860505.1
3
(100.00 %)
37.87
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
1
(0.47 %)
1
(0.53 %)
0
(0.00 %)
95 Hepatovirus A (2ID 2023)
GCA_008776015.1
1
(89.26 %)
33.72
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.57 %)
n/a 12
(3.99 %)
0
(0.00 %)
96 Herpes simplex virus type 1 (17 1990)
GCF_000859985.2
81
(86.40 %)
68.30
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
81
(2.72 %)
51
(2.90 %)
932
(18.12 %)
1
(100.00 %)
97 Herpes simplex virus type 1 (HSV-H15119 2019)
GCA_027936425.1
80
(76.71 %)
68.05
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2
(100.00 %)
92
(2.63 %)
60
(4.91 %)
1,082
(18.73 %)
1
(100.00 %)
98 human adenovirus 1 (2004)
GCF_000858645.1
44
(91.94 %)
55.26
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
12
(0.98 %)
2
(0.11 %)
103
(4.79 %)
6
(70.17 %)
99 human adenovirus 2 (2004)
GCF_000859465.1
42
(90.84 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.89 %)
1
(0.12 %)
105
(4.66 %)
5
(70.08 %)
100 human adenovirus 35 (2004)
GCF_000857885.1
44
(93.67 %)
48.88
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.68 %)
3
(0.30 %)
80
(3.56 %)
6
(39.41 %)
101 human adenovirus 5 (2004)
GCF_000857865.1
42
(90.68 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
12
(0.95 %)
n/a 99
(4.47 %)
5
(69.88 %)
102 human adenovirus 54 (Kobe-H 2009)
GCF_000885675.1
40
(91.15 %)
54.91
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.74 %)
n/a 65
(2.61 %)
3
(66.98 %)
103 human adenovirus 7 (2004)
GCF_000859485.1
45
(92.24 %)
51.27
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.56 %)
1
(1.54 %)
61
(2.28 %)
7
(43.72 %)
104 human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013)
GCF_000858385.2
86
(83.37 %)
70.38
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
124
(3.80 %)
64
(3.26 %)
1,158
(23.65 %)
1
(99.99 %)
105 human associated cyclovirus 10 (7078A 2014)
GCF_000918035.2
2
(86.20 %)
43.41
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
106 human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015)
GCF_001448435.1
4
(89.04 %)
51.81
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.89 %)
1
(1.89 %)
1
(2.24 %)
1
(97.10 %)
107 human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018)
GCF_003033475.1
2
(69.15 %)
42.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
108 human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018)
GCF_003033485.1
2
(69.81 %)
43.97
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(1.38 %)
2
(0.57 %)
0
(0.00 %)
109 human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018)
GCF_003033495.1
2
(70.27 %)
42.28
(99.84 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.79 %)
0
(0.00 %)
110 human associated porprismacovirus 2 (SF2 2015)
GCF_000931315.1
2
(74.85 %)
48.83
(99.84 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.55 %)
1
(41.76 %)
111 human astrovirus (1993)
GCF_000861865.1
3
(97.58 %)
44.83
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.88 %)
1
(1.34 %)
9
(2.08 %)
0
(0.00 %)
112 human astrovirus BF34 (BF34 2014)
GCF_000923215.1
4
(97.29 %)
43.77
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.47 %)
0
(0.00 %)
113 human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004)
GCF_000845245.1
194
(84.91 %)
57.48
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
74
(1.33 %)
28
(0.67 %)
1,047
(7.96 %)
1
(99.99 %)
114 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq)
GCF_000845685.2
115
(79.56 %)
42.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
3
(13.72 %)
115 human betaherpesvirus 6B (Z29 1999)
GCF_000846365.1
128
(82.45 %)
42.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
27
(1.57 %)
20
(3.84 %)
652
(8.84 %)
6
(15.35 %)
116 human betaherpesvirus 7 (RK 1995)
GCF_000848125.1
111
(79.51 %)
36.22
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
16
(1.65 %)
34
(8.04 %)
791
(15.85 %)
3
(5.14 %)
117 human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009)
GCF_000882675.1
4
(87.74 %)
41.59
(99.98 %)
1
(0.02 %)
2
(99.98 %)
5
(1.23 %)
n/a 5
(0.98 %)
0
(0.00 %)
118 human bocavirus 3 (W471 2009)
GCF_000882855.1
4
(88.44 %)
42.16
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.95 %)
1
(4.96 %)
119 human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009)
GCF_000886375.1
6
(92.83 %)
40.41
(99.92 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.06 %)
0
(0.00 %)
120 human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014)
GCF_000924015.1
4
(85.08 %)
47.13
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.85 %)
n/a 1
(0.25 %)
2
(49.61 %)
121 human coronavirus 229E (2001)
GCF_000853505.1
9
(97.14 %)
38.26
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.31 %)
2
(0.29 %)
57
(2.91 %)
0
(0.00 %)
122 human coronavirus HKU1 (HKU1 2004)
GCF_000858765.1
10
(98.07 %)
32.06
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.72 %)
1
(1.60 %)
89
(5.62 %)
0
(0.00 %)
123 human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004)
GCF_000853865.1
8
(97.86 %)
34.46
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(1.09 %)
n/a 84
(5.24 %)
0
(0.00 %)
124 human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019)
GCF_003972325.1
11
(97.82 %)
36.79
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.43 %)
1
(0.09 %)
90
(3.88 %)
0
(0.00 %)
125 human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014)
GCF_000920655.1
1
(81.59 %)
43.53
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.59 %)
0
(0.00 %)
126 human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009)
GCF_000884955.1
1
(88.49 %)
43.79
(100.00 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
4
(0.47 %)
n/a 6
(1.35 %)
0
(0.00 %)
127 human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013)
GCF_000908835.1
3
(84.17 %)
46.45
(99.89 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.38 %)
1
(13.92 %)
128 human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019)
GCF_003727435.1
1
(6.26 %)
53.36
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.89 %)
n/a 3
(0.59 %)
1
(93.16 %)
129 human endogenous retrovirus K113 (2013)
GCF_000913595.1
1
(22.17 %)
41.86
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.60 %)
n/a 14
(2.49 %)
0
(0.00 %)
130 human enterovirus 71 HZ08/Hangzhou/2008 (HZ08 2011)
GCA_031128755.1
1
(88.89 %)
47.98
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.14 %)
1
(4.77 %)
131 human erythrovirus V9 (V9 2001)
GCF_000841965.1
6
(90.67 %)
42.09
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.75 %)
0
(0.00 %)
132 human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017)
GCF_002219885.1
5
(72.08 %)
31.11
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(5.43 %)
n/a 20
(11.11 %)
0
(0.00 %)
133 human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017)
GCF_002219525.1
2
(84.04 %)
32.53
(99.90 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(1.60 %)
0
(0.00 %)
134 human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017)
GCF_002219705.1
2
(81.18 %)
45.77
(99.87 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.34 %)
0
(0.00 %)
135 human feces pecovirus (PeCV-NI 2019)
GCF_003726995.1
2
(72.77 %)
50.00
(99.90 %)
1
(0.03 %)
2
(99.97 %)
5
(2.46 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(55.12 %)
136 human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018)
GCF_003033575.1
2
(74.86 %)
46.00
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.54 %)
1
(19.22 %)
137 human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017)
GCF_002271185.1
2
(72.89 %)
46.99
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(2.66 %)
1
(1.56 %)
4
(1.25 %)
0
(0.00 %)
138 human gammaherpesvirus 8 (BCBL-1 2019)
GCA_027939675.1
n/a 53.47
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.10 %)
29
(2.97 %)
135
(3.68 %)
8
(83.99 %)
139 human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007)
GCF_000838265.1
113
(85.53 %)
53.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.18 %)
29
(2.88 %)
151
(3.93 %)
9
(84.42 %)
140 human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2009)
GCA_027939395.1
102
(83.23 %)
53.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.00 %)
29
(3.04 %)
198
(4.58 %)
9
(84.78 %)
141 human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2019)
GCA_027939375.1
102
(83.23 %)
53.78
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.00 %)
29
(3.04 %)
198
(4.58 %)
9
(84.78 %)
142 human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2021)
GCA_027939385.1
102
(83.23 %)
53.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.00 %)
29
(3.04 %)
198
(4.58 %)
9
(84.78 %)
143 human gammaherpesvirus 8 (UNC_BCBL-1 2022)
GCA_027939455.1
114
(84.22 %)
53.75
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.18 %)
29
(2.87 %)
145
(3.86 %)
9
(84.42 %)
144 human gemycircularvirus (GeTz1 2018)
GCF_002826025.1
4
(77.38 %)
49.05
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(1.23 %)
0
(0.00 %)
145 human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015)
GCF_000973295.1
4
(80.18 %)
54.85
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(1.21 %)
1
(91.86 %)
146 human hepegivirus (AK-790 2018)
GCF_002821385.1
1
(96.18 %)
53.60
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.51 %)
2
(88.97 %)
147 human immunodeficiency virus 1 (1998)
GCF_000864765.1
14
(93.78 %)
42.11
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.57 %)
1
(0.34 %)
18
(3.29 %)
1
(2.29 %)
148 human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993)
GCF_000856385.1
12
(84.81 %)
45.66
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.98 %)
10
(1.44 %)
0
(0.00 %)
149 human lung-associated vientovirus FB (2021)
GCF_013088445.1
3
(86.49 %)
33.94
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.15 %)
1
(1.34 %)
3
(6.81 %)
0
(0.00 %)
150 human mastadenovirus A (2004)
GCF_000884295.1
41
(94.00 %)
46.52
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.61 %)
n/a 73
(3.33 %)
6
(30.52 %)
151 human mastadenovirus A (Huie 1993)
GCF_000846805.1
43
(94.41 %)
46.52
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.61 %)
n/a 73
(3.33 %)
6
(30.52 %)
152 human mastadenovirus B (GB 2008)
GCF_000880515.1
48
(93.42 %)
51.05
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.47 %)
1
(0.18 %)
41
(1.61 %)
7
(43.26 %)
153 human mastadenovirus B (Slobitski 2008)
GCF_000857085.1
46
(93.74 %)
48.88
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.82 %)
3
(0.30 %)
50
(2.47 %)
6
(39.41 %)
154 human mastadenovirus C (1993)
GCF_000845085.1
63
(97.51 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.89 %)
1
(0.12 %)
105
(4.66 %)
5
(70.08 %)
155 human mastadenovirus D (2004)
GCF_000858625.1
21
(47.83 %)
56.58
(100.00 %)
4
(0.01 %)
5
(99.99 %)
12
(1.24 %)
n/a 61
(3.14 %)
3
(66.84 %)
156 human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008)
GCF_000845985.1
47
(93.93 %)
57.10
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.92 %)
1
(0.13 %)
59
(2.95 %)
3
(67.41 %)
157 human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001)
GCF_000859665.1
40
(96.48 %)
57.67
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.65 %)
n/a 107
(4.08 %)
5
(73.25 %)
158 human mastadenovirus F (Dugan 1993)
GCF_000846685.1
44
(94.91 %)
51.22
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.32 %)
n/a 63
(2.23 %)
1
(62.53 %)
159 human metapneumovirus (00-1 2018)
GCF_002815375.1
9
(93.36 %)
36.29
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(1.38 %)
1
(0.34 %)
27
(3.46 %)
0
(0.00 %)
160 human orthopneumovirus (2018)
GCF_002815475.1
12
(97.34 %)
33.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.64 %)
1
(0.24 %)
19
(3.32 %)
0
(0.00 %)
161 human orthopneumovirus (B1 1997)
GCF_000855545.1
10
(97.35 %)
33.56
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.61 %)
2
(0.52 %)
16
(3.21 %)
0
(0.00 %)
162 human orthorubulavirus 2 (1991)
GCF_000863525.1
8
(98.61 %)
38.41
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.38 %)
n/a 6
(0.27 %)
0
(0.00 %)
163 human papillomavirus (SE379 2015)
GCF_001274345.1
6
(93.54 %)
37.49
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.98 %)
1
(2.70 %)
21
(3.02 %)
0
(0.00 %)
164 human papillomavirus 103 (Qv33725 2006)
GCF_000868225.1
6
(88.01 %)
41.58
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
n/a 19
(3.06 %)
0
(0.00 %)
165 human papillomavirus 108 (2009)
GCF_000883655.1
5
(88.56 %)
42.65
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.38 %)
0
(0.00 %)
166 human papillomavirus 109 (2009)
GCF_000883695.1
7
(92.87 %)
38.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.94 %)
1
(0.48 %)
19
(3.13 %)
1
(3.23 %)
167 human papillomavirus 116 (HPV116 2009)
GCF_000884175.1
7
(93.82 %)
38.50
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.40 %)
1
(4.73 %)
168 human papillomavirus 121 (NJ3301 2010)
GCF_000889075.1
7
(92.45 %)
37.74
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.41 %)
n/a 9
(0.98 %)
0
(0.00 %)
169 human papillomavirus 126 (HPV126 2011)
GCF_000896435.1
7
(91.96 %)
38.05
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 18
(2.68 %)
1
(2.92 %)
170 human papillomavirus 127 (R3a 2010)
GCF_000890115.1
8
(93.50 %)
36.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(0.79 %)
18
(2.79 %)
1
(3.20 %)
171 human papillomavirus 132 (27-50 2011)
GCF_000888015.1
7
(93.36 %)
37.94
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.89 %)
0
(0.00 %)
172 human papillomavirus 134 (39-65 2011)
GCF_000889695.1
7
(92.69 %)
38.14
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.48 %)
0
(0.00 %)
173 human papillomavirus 135 (NJ3500 2012)
GCF_000898235.1
7
(92.24 %)
36.86
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.56 %)
1
(0.67 %)
14
(2.77 %)
0
(0.00 %)
174 human papillomavirus 136 (CL3865 2012)
GCF_000899695.1
7
(91.83 %)
38.51
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.85 %)
n/a 19
(3.31 %)
0
(0.00 %)
175 human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012)
GCF_000898855.1
7
(91.69 %)
39.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.79 %)
n/a 4
(1.28 %)
0
(0.00 %)
176 human papillomavirus 154 (PV77 2013)
GCF_000908695.1
7
(92.75 %)
37.93
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.37 %)
0
(0.00 %)
177 human papillomavirus 161 (KC1 2018)
GCF_002826985.1
6
(92.39 %)
37.73
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.36 %)
0
(0.00 %)
178 human papillomavirus 163 (KC3 2015)
GCF_001430115.1
6
(93.54 %)
37.69
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.80 %)
0
(0.00 %)
179 human papillomavirus 166 (KC9 2012)
GCF_000899515.1
6
(92.72 %)
38.29
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.79 %)
0
(0.00 %)
180 human papillomavirus 167 (KC10 2013)
GCF_000913075.1
6
(92.78 %)
35.83
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 23
(5.24 %)
0
(0.00 %)
181 human papillomavirus 172 (2018)
GCF_002827005.1
7
(95.04 %)
37.77
(99.96 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
5
(1.22 %)
n/a 4
(0.60 %)
0
(0.00 %)
182 human papillomavirus 175 (SE87 2018)
GCF_002827025.1
7
(93.05 %)
38.87
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
4
(0.29 %)
n/a 8
(1.00 %)
1
(3.46 %)
183 human papillomavirus 178 (2014)
GCF_000918095.1
7
(92.49 %)
38.15
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.53 %)
2
(0.59 %)
8
(1.35 %)
0
(0.00 %)
184 human papillomavirus 179 (SIBX16 2013)
GCF_000912535.1
6
(92.78 %)
36.76
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.87 %)
n/a 7
(1.67 %)
0
(0.00 %)
185 human papillomavirus 18 (2000)
GCF_000865665.1
8
(87.96 %)
40.43
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.70 %)
n/a 12
(3.67 %)
0
(0.00 %)
186 human papillomavirus 184 (SIBX17 2018)
GCF_002987365.1
6
(92.71 %)
36.89
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.98 %)
1
(0.53 %)
4
(0.40 %)
0
(0.00 %)
187 human papillomavirus 187 (ACS447 2018)
GCF_003055605.1
6
(92.85 %)
38.90
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.36 %)
0
(0.00 %)
188 human papillomavirus 201 (HPV201 2015)
GCF_001184845.1
7
(93.33 %)
37.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.48 %)
n/a 5
(0.95 %)
0
(0.00 %)
189 human papillomavirus 203 (SE369 2019)
GCF_004133345.1
7
(92.96 %)
37.54
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.43 %)
n/a 10
(1.33 %)
0
(0.00 %)
190 human papillomavirus 204 (A342 2018)
GCF_002827045.1
7
(92.47 %)
37.84
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.50 %)
n/a 6
(1.44 %)
1
(2.92 %)
191 human papillomavirus 30 (2018)
GCF_002987345.1
6
(84.46 %)
40.39
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(2.31 %)
2
(1.03 %)
14
(4.22 %)
0
(0.00 %)
192 human papillomavirus 4 (1993)
GCF_000864845.1
7
(92.18 %)
38.53
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.71 %)
1
(0.35 %)
23
(3.75 %)
0
(0.00 %)
193 human papillomavirus 5 (1993)
GCF_000866505.1
8
(92.64 %)
42.39
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(2.94 %)
1
(0.39 %)
13
(3.01 %)
1
(7.11 %)
194 human papillomavirus 71 (2018)
GCF_002826825.1
1
(24.06 %)
44.38
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.47 %)
3
(1.63 %)
11
(3.93 %)
0
(0.00 %)
195 human papillomavirus 9 (1993)
GCF_000863685.1
7
(94.00 %)
41.00
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.14 %)
2
(0.93 %)
13
(2.45 %)
1
(4.63 %)
196 human papillomavirus KC5 (KC5 2015)
GCF_000989155.1
7
(92.99 %)
36.78
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.71 %)
0
(0.00 %)
197 human papillomavirus type 10 (1993)
GCF_000864905.1
7
(84.68 %)
45.89
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.78 %)
n/a 16
(3.86 %)
0
(0.00 %)
198 human papillomavirus type 101 (Qv23954 2006)
GCF_000869845.1
6
(89.06 %)
43.12
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.33 %)
n/a 5
(0.61 %)
0
(0.00 %)
199 human papillomavirus type 112 (2009)
GCF_000882135.1
7
(93.62 %)
37.52
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.73 %)
1
(3.81 %)
200 human papillomavirus type 128 (2011)
GCF_000889675.1
7
(92.33 %)
35.98
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(3.18 %)
0
(0.00 %)
201 human papillomavirus type 129 (2011)
GCF_000891495.1
7
(93.07 %)
37.31
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.82 %)
n/a 3
(0.35 %)
0
(0.00 %)
202 human papillomavirus type 131 (27-49 2011)
GCF_000890535.1
7
(93.15 %)
37.03
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(2.73 %)
0
(0.00 %)
203 human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012)
GCF_000897255.1
7
(93.60 %)
37.57
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 16
(2.39 %)
0
(0.00 %)
204 human papillomavirus type 144 (CL3740 2012)
GCF_000898255.1
7
(92.09 %)
38.23
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.32 %)
0
(0.00 %)
205 human papillomavirus type 156 (GC01 2017)
GCF_002006915.1
7
(92.47 %)
36.18
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.86 %)
0
(0.00 %)
206 human papillomavirus type 16 (1993)
GCF_000863945.3
11
(87.67 %)
36.53
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(3.26 %)
1
(0.32 %)
12
(4.50 %)
0
(0.00 %)
207 human papillomavirus type 26 (1993)
GCF_000866485.1
6
(84.85 %)
38.60
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(2.74 %)
2
(0.45 %)
14
(5.89 %)
0
(0.00 %)
208 human papillomavirus type 32 (1993)
GCF_000864925.1
6
(84.42 %)
40.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.83 %)
n/a 9
(1.96 %)
0
(0.00 %)
209 human papillomavirus type 34 (1993)
GCF_000863965.1
6
(85.10 %)
38.25
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(2.33 %)
3
(1.17 %)
8
(3.52 %)
0
(0.00 %)
210 human papillomavirus type 41 (1991)
GCF_000863845.1
11
(90.82 %)
46.94
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
n/a 3
(0.28 %)
1
(3.68 %)
211 human papillomavirus type 48 (1995)
GCF_000839365.1
7
(93.41 %)
36.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.58 %)
18
(3.61 %)
1
(4.07 %)
212 human papillomavirus type 49 (1993)
GCF_000862825.1
6
(93.19 %)
41.11
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.81 %)
n/a 11
(2.66 %)
0
(0.00 %)
213 human papillomavirus type 50 (1995)
GCF_000841625.1
7
(92.78 %)
36.85
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.53 %)
14
(2.00 %)
0
(0.00 %)
214 human papillomavirus type 53 (1993)
GCF_000865685.1
7
(66.96 %)
40.14
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(2.47 %)
n/a 24
(6.16 %)
0
(0.00 %)
215 human papillomavirus type 54 (1995)
GCF_000864725.1
7
(84.57 %)
41.88
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(2.32 %)
n/a 9
(3.05 %)
0
(0.00 %)
216 human papillomavirus type 60 (1995)
GCF_000838505.1
7
(92.85 %)
36.94
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.83 %)
n/a 12
(2.15 %)
1
(3.27 %)
217 human papillomavirus type 63 (1993)
GCF_000865565.1
7
(91.55 %)
40.44
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.20 %)
1
(0.59 %)
5
(0.53 %)
0
(0.00 %)
218 human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985)
GCF_000861945.1
9
(89.64 %)
40.87
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.39 %)
1
(0.76 %)
15
(3.21 %)
0
(0.00 %)
219 human papillomavirus type 7 (1993)
GCF_000861925.1
6
(82.97 %)
39.53
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.73 %)
1
(0.59 %)
13
(3.49 %)
0
(0.00 %)
220 human papillomavirus type 85 (114B 2017)
GCF_002153865.1
8
(90.54 %)
37.76
(98.31 %)
7
(1.95 %)
8
(98.05 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(4.34 %)
0
(0.00 %)
221 human papillomavirus type 88 (2008)
GCF_000874925.1
7
(92.19 %)
40.11
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.35 %)
6
(0.71 %)
1
(4.00 %)
222 human papillomavirus type 90 (2002)
GCF_000862685.1
7
(82.73 %)
46.65
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.95 %)
n/a 10
(3.96 %)
1
(2.53 %)
223 human papillomavirus type 92 (2003)
GCF_000846285.1
7
(93.86 %)
39.96
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.48 %)
3
(1.50 %)
7
(2.92 %)
1
(4.21 %)
224 human papillomavirus type 96 (2003)
GCF_000864825.1
7
(97.38 %)
40.31
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.81 %)
n/a 21
(3.83 %)
1
(4.33 %)
225 human parainfluenza virus 4a (M-25 2013)
GCF_000910675.1
7
(83.27 %)
36.23
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.23 %)
1
(0.22 %)
13
(1.18 %)
0
(0.00 %)
226 human parechovirus 1 (2018)
GCF_002817305.1
1
(89.15 %)
39.06
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(1.29 %)
0
(0.00 %)
227 human parvovirus 4 G1 (2005)
GCF_000861005.1
2
(89.92 %)
44.94
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.87 %)
2
(1.52 %)
4
(0.70 %)
1
(3.85 %)
228 human parvovirus B19 (J35 1999)
GCF_000839645.1
6
(81.47 %)
43.81
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4
(2.93 %)
13
(4.72 %)
2
(12.12 %)
229 human pegivirus 2 (UC0125.US 2015)
GCF_001310135.2
1
(92.98 %)
53.96
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.49 %)
2
(90.06 %)
230 human picobirnavirus (Hy005102 2005)
GCF_000859285.1
3
(92.15 %)
46.02
(100.00 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
231 human poliovirus strain (Sabin 1 2023)
GCA_008766755.1
1
(89.10 %)
46.26
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.23 %)
1
(7.15 %)
232 human polyomavirus 1 (1993)
GCF_000837865.1
7
(89.15 %)
39.53
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(2.45 %)
13
(4.13 %)
0
(0.00 %)
233 human polyomavirus 12 (hu1403 2013)
GCF_000906235.1
6
(89.41 %)
39.60
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.64 %)
1
(0.91 %)
27
(6.74 %)
0
(0.00 %)
234 human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007)
GCF_000873085.1
6
(88.17 %)
39.37
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.85 %)
26
(6.90 %)
0
(0.00 %)
235 human polyomavirus 6 (607a 2010)
GCF_000888495.1
6
(89.67 %)
42.66
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.83 %)
0
(0.00 %)
236 human polyomavirus 7 (713a 2010)
GCF_000889175.1
6
(89.14 %)
42.91
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(1.25 %)
0
(0.00 %)
237 human polyomavirus 9 (HPyV9 2011)
GCF_000891615.1
6
(88.18 %)
39.16
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 20
(4.74 %)
0
(0.00 %)
238 human respirovirus 1 (Washington 1964 2002)
GCF_000848705.1
10
(99.19 %)
37.24
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.19 %)
1
(0.25 %)
4
(1.69 %)
0
(0.00 %)
239 human respirovirus 3 (1998)
GCF_000850205.1
9
(93.58 %)
34.52
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.09 %)
n/a 11
(1.89 %)
0
(0.00 %)
240 human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018)
GCF_002816885.1
1
(92.58 %)
43.40
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
241 human rotavirus B (Bang373 2013)
GCF_000907835.1
13
(95.17 %)
36.97
(99.88 %)
n/a 11
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 18
(1.22 %)
0
(0.00 %)
242 human RSV respiratory syncytial virus A (S2 ts1C 2000)
GCF_000856445.1
13
(98.68 %)
33.21
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.89 %)
1
(0.26 %)
23
(3.73 %)
0
(0.00 %)
243 human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015)
GCF_000929235.1
2
(69.15 %)
43.94
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
244 human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018)
GCF_002819605.1
2
(93.58 %)
43.54
(99.76 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(1.24 %)
0
(0.00 %)
245 human T-cell leukemia virus type I (1993)
GCA_003102335.1
3
(59.99 %)
53.88
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 15
(2.55 %)
3
(15.21 %)
246 human T-cell leukemia virus type I (1998)
GCF_000863585.1
11
(81.17 %)
53.47
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.33 %)
n/a 19
(2.50 %)
2
(12.06 %)
247 human T-lymphotropic virus 2 (1993)
GCF_000847505.1
9
(94.24 %)
53.82
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.11 %)
n/a 16
(2.41 %)
2
(6.46 %)
248 human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009)
GCF_000882595.1
8
(77.85 %)
56.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.51 %)
n/a 30
(5.68 %)
3
(16.69 %)
249 human TMEV-like cardiovirus (2008)
GCF_000875265.1
3
(86.45 %)
43.58
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.84 %)
0
(0.00 %)
250 I virus (Cowden 2000)
GCF_000849945.1
2
(99.13 %)
53.50
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.57 %)
1
(10.49 %)
251 Igbo Ora virus (IBH10964 1998)
GCA_002888815.1
2
(95.47 %)
48.08
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.42 %)
1
(1.24 %)
2
(0.48 %)
5
(13.59 %)
252 Influenza A virus (A/California/07/2009 2015)
GCF_001343785.1
14
(99.84 %)
43.70
(99.90 %)
4
(0.03 %)
12
(99.97 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(0.83 %)
0
(0.00 %)
253 Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005)
GCF_000864105.1
15
(96.68 %)
44.12
(99.93 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.35 %)
0
(0.00 %)
254 Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003)
GCF_000851145.1
12
(97.14 %)
44.07
(99.90 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(0.81 %)
0
(0.00 %)
255 Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005)
GCF_000866645.1
15
(97.49 %)
43.41
(99.89 %)
1
(0.01 %)
9
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.28 %)
0
(0.00 %)
256 Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005)
GCF_000865085.1
15
(96.37 %)
42.94
(99.91 %)
n/a 8
(100.00 %)
4
(0.57 %)
n/a 6
(0.33 %)
0
(0.00 %)
257 Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982)
GCF_000865725.1
15
(96.32 %)
43.40
(99.90 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.68 %)
0
(0.00 %)
258 Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015)
GCF_000928555.1
15
(99.34 %)
44.36
(99.92 %)
1
(0.01 %)
9
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.30 %)
0
(0.00 %)
259 Influenza B virus (B/Lee/1940 1993)
GCF_000820495.2
11
(92.51 %)
40.19
(99.88 %)
n/a 8
(100.00 %)
5
(0.51 %)
n/a 23
(1.85 %)
0
(0.00 %)
260 Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004)
GCF_000856665.10
11
(95.87 %)
37.28
(99.91 %)
n/a 7
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 42
(4.23 %)
0
(0.00 %)
261 Isfahan virus (2013)
GCF_000906835.1
5
(96.29 %)
41.93
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 20
(1.82 %)
0
(0.00 %)
262 Japanese encephalitis virus (1993)
GCF_000862145.1
3
(93.83 %)
51.43
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.15 %)
0
(0.00 %)
263 JC polyomavirus (Mad1 1993)
GCF_000863805.1
9
(96.55 %)
40.45
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(3.82 %)
17
(5.52 %)
0
(0.00 %)
264 Jeju virus (10-11 2017)
GCF_002117615.1
3
(93.96 %)
36.20
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
6
(1.02 %)
1
(0.28 %)
16
(2.20 %)
0
(0.00 %)
265 Kenkeme virus (Fuyuan-Sr-326 2017)
GCF_002146025.1
3
(95.18 %)
37.73
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.26 %)
n/a 16
(1.40 %)
0
(0.00 %)
266 Kunjin virus (MRM61C 2023)
GCA_004786635.1
1
(96.61 %)
50.58
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(2.43 %)
267 Kyasanur Forest disease virus (2018)
GCF_002820625.1
1
(98.80 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.38 %)
n/a 1
(0.11 %)
3
(6.73 %)
268 La Crosse virus (human/78 2002)
GCF_000850965.1
4
(94.68 %)
36.68
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 26
(2.75 %)
0
(0.00 %)
269 La Crosse virus (LACV/human/1960 2023)
GCF_004789695.1
4
(94.68 %)
36.75
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 17
(1.56 %)
0
(0.00 %)
270 Lagos bat lyssavirus (0406SEN 2013)
GCF_000905975.1
5
(90.15 %)
43.48
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.41 %)
0
(0.00 %)
271 Lake Victoria marburgvirus - Angola2005 (Ang1379c 2006)
GCA_031121245.1
n/a 38.40
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(0.91 %)
0
(0.00 %)
272 Lake Victoria marburgvirus - Ci67 (2007)
GCA_031121995.1
n/a 38.45
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.38 %)
0
(0.00 %)
273 Lake Victoria marburgvirus - DRC1999 (07DRC99 2006)
GCA_031121255.1
n/a 38.19
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.27 %)
0
(0.00 %)
274 Lake Victoria marburgvirus - (Leiden 2011)
GCA_031129775.1
7
(76.60 %)
38.11
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.25 %)
0
(0.00 %)
275 Langat virus (TP21 2000)
GCF_000860805.1
1
(93.62 %)
54.31
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.56 %)
1
(2.18 %)
276 Langya virus (SDQD_H1801 2022)
GCA_031319335.1
9
(81.86 %)
38.30
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.26 %)
n/a 18
(1.31 %)
0
(0.00 %)
277 Lassa mammarenavirus (Josiah 1998)
GCF_000851705.1
4
(94.96 %)
42.06
(99.94 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.37 %)
9
(1.70 %)
0
(0.00 %)
278 Louping ill virus (369/T2 1997)
GCF_000863165.1
1
(94.24 %)
54.86
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.52 %)
3
(12.29 %)
279 Lumpy skin disease virus NI- (Neethling 2490 2001)
GCF_000839805.1
156
(95.76 %)
25.91
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
55
(1.76 %)
20
(0.65 %)
1,542
(23.51 %)
0
(0.00 %)
280 Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993)
GCF_000851025.1
4
(97.52 %)
42.29
(99.99 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.07 %)
0
(0.00 %)
281 Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003)
GCF_000853725.1
4
(94.98 %)
41.77
(99.95 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.62 %)
0
(0.00 %)
282 Mammarenavirus chapareense (810419 2008)
GCF_000879235.1
4
(96.22 %)
40.03
(99.96 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.75 %)
0
(0.00 %)
283 Mammarenavirus choriomeningitidis (Armstrong 53b 2023)
GCF_004789475.1
4
(95.06 %)
43.03
(99.96 %)
n/a 2
(100.00 %)
4
(1.05 %)
1
(0.43 %)
3
(1.37 %)
1
(2.40 %)
284 Mammarenavirus guanaritoense (INH-95551 2003)
GCF_000853765.1
4
(96.01 %)
40.64
(99.96 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.75 %)
0
(0.00 %)
285 Mammarenavirus lassaense (Alzey 2016)
GCA_900094045.1
4
(94.91 %)
42.17
(99.98 %)
n/a 2
(100.00 %)
4
(0.33 %)
2
(0.37 %)
7
(1.51 %)
0
(0.00 %)
286 Mammarenavirus lujoense (2009)
GCF_000885555.1
4
(96.94 %)
42.40
(99.93 %)
n/a 2
(100.00 %)
4
(0.40 %)
n/a 7
(0.88 %)
0
(0.00 %)
287 Marburg virus - Musoke, Kenya, 1980 (Musoke 2024)
GCA_000857325.3
n/a 38.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(1.05 %)
0
(0.00 %)
288 Maporal virus (HV 97021050 2017)
GCF_002145825.3
3
(92.24 %)
38.51
(99.91 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.25 %)
1
(0.22 %)
11
(1.32 %)
0
(0.00 %)
289 Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994)
GCF_000857325.2
7
(98.72 %)
38.29
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(1.05 %)
0
(0.00 %)
290 Marmot norovirus (HT16 2019)
GCF_004130475.1
1
(92.61 %)
55.57
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.19 %)
0
(0.00 %)
291 Mayaro virus (2002)
GCF_000863385.1
5
(96.78 %)
50.37
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.76 %)
n/a 4
(1.59 %)
5
(42.02 %)
292 Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998)
GCF_000854845.1
7
(94.55 %)
47.43
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(0.91 %)
1
(3.88 %)
293 Merkel cell polyomavirus (R17b 2008)
GCF_000874865.1
5
(88.06 %)
40.69
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(1.78 %)
0
(0.00 %)
294 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012)
GCF_000901155.1
12
(97.48 %)
41.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.12 %)
n/a 4
(0.14 %)
0
(0.00 %)
295 Mink calicivirus (MCV-DL/2007/CN 2012)
GCF_000901135.1
3
(95.62 %)
45.47
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.21 %)
n/a 1
(0.21 %)
0
(0.00 %)
296 Mokola lyssavirus (2004)
GCF_000856485.1
5
(98.49 %)
44.42
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.73 %)
0
(0.00 %)
297 Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996)
GCF_000843325.1
163
(85.07 %)
63.36
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
128
(3.25 %)
92
(4.74 %)
1,361
(17.29 %)
1
(99.95 %)
298 Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022)
GCF_014621545.1
179
(83.90 %)
33.03
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
38
(0.78 %)
22
(0.54 %)
1,097
(9.44 %)
0
(0.00 %)
299 Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021)
GCF_000857045.1
180
(84.71 %)
33.09
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
37
(0.96 %)
24
(0.57 %)
1,102
(9.51 %)
0
(0.00 %)
300 Mopeia Lassa virus reassortant 29 (ML29 IGS-15 2004)
GCF_000855745.1
4
(95.68 %)
43.06
(99.97 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(1.48 %)
0
(0.00 %)
301 Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000)
GCF_000856685.1
8
(92.81 %)
42.49
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 10
(0.59 %)
0
(0.00 %)
302 Mupapillomavirus 1 (1982)
GCF_000866405.1
7
(86.17 %)
40.28
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.47 %)
1
(0.40 %)
7
(1.87 %)
1
(2.75 %)
303 Murine herpesvirus 68 (WUMS 2007)
GCA_000845665.1
80
(90.74 %)
47.23
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.12 %)
31
(3.40 %)
69
(4.25 %)
4
(4.97 %)
304 Murray Valley encephalitis virus (1999)
GCF_000863565.1
3
(93.56 %)
48.72
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.23 %)
1
(1.84 %)
305 Myxoma virus (Lausanne 2002)
GCF_000843685.1
170
(95.89 %)
43.56
(100.00 %)
7
(0.00 %)
8
(100.00 %)
11
(0.16 %)
15
(0.33 %)
578
(5.25 %)
0
(0.00 %)
306 Nebraska virus (NB 2002)
GCF_000851625.1
2
(98.09 %)
56.55
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.72 %)
n/a 1
(0.30 %)
2
(68.70 %)
307 Newbury agent 1 (2006)
GCF_000867125.1
2
(98.08 %)
56.20
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.19 %)
n/a 3
(1.18 %)
2
(62.74 %)
308 Nipah henipavirus (2000)
GCF_000863625.1
11
(82.06 %)
38.17
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.17 %)
n/a 8
(0.37 %)
0
(0.00 %)
309 Norovirus (dog/GVI.1/HKU_Ca026F/2007/HKG 2019)
GCF_007609015.1
3
(97.97 %)
56.44
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(1.17 %)
3
(66.91 %)
310 Norovirus GI (1993)
GCF_000864005.1
3
(99.09 %)
48.03
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.52 %)
1
(0.35 %)
3
(0.31 %)
0
(0.00 %)
311 Norovirus GI (Hu/BD/2011/GI.7PNA2/Dhaka1882 2019)
GCF_008704025.1
3
(99.22 %)
48.46
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.27 %)
0
(0.00 %)
312 Norovirus GI (Hu/JP/1998/GI.6PNA4/No20-Saitama-98-17 2019)
GCF_008703965.1
3
(98.91 %)
49.94
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.56 %)
n/a 3
(0.36 %)
0
(0.00 %)
313 Norovirus GI (Hu/JP/2000/GI.6PNA1/WUG1 2019)
GCF_008703985.1
3
(98.82 %)
49.62
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.43 %)
n/a 12
(1.55 %)
0
(0.00 %)
314 Norovirus GI/Hu/JP/2007/GI.P3_GI.3/Shimizu/KK2866 (Shimizu/KK2866 2018)
GCF_003813225.1
3
(99.03 %)
48.57
(100.00 %)
2
(0.03 %)
3
(99.97 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.56 %)
1
(3.89 %)
315 Norovirus GII (Hu/GII.PNA4-GII.NA4/PNV06929/2008/PER 2019)
GCF_008711635.1
3
(99.19 %)
47.69
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.29 %)
0
(0.00 %)
316 Norovirus GII (NORO_176-1_17_12_2015 2019)
GCF_004193815.1
3
(99.64 %)
50.31
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.13 %)
0
(0.00 %)
317 Norovirus GII (NORO_226_06_01_2016 2018)
GCF_003638685.1
3
(99.23 %)
48.61
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.86 %)
0
(0.00 %)
318 Norovirus GII.17 (Hu/GII.P17_GII.17/KR/2015/CAU-267 2018)
GCF_003638645.1
3
(99.14 %)
48.14
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.71 %)
0
(0.00 %)
319 Norovirus GII.2 (BJSMQ 2018)
GCF_003638665.1
3
(99.36 %)
48.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.19 %)
0
(0.00 %)
320 Norovirus GII/Hu/JP/2007/GII.P15_GII.15/Sapporo/HK299 (Sapporo/HK299 2019)
GCF_007608995.1
3
(99.01 %)
49.25
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.29 %)
0
(0.00 %)
321 Norovirus GII/Hu/JP/2011/GII/Yuzawa/Gira2HS (Yuzawa/Gira2HS 2019)
GCF_007609035.1
3
(98.91 %)
48.63
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.30 %)
0
(0.00 %)
322 Norovirus GIV (CU081210E/USA/2010 2020)
GCF_010478905.1
3
(98.55 %)
58.56
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.28 %)
1
(98.56 %)
323 Norovirus GIV (Hu/GIV.1/LakeMacquarie/NSW268O/2010/AU 2016)
GCF_001595715.1
3
(98.88 %)
50.71
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.37 %)
1
(3.69 %)
324 Norovirus GIV (Hu/US/2016/GIV.NA1PNA1/WI7002 2019)
GCF_008704005.1
3
(99.96 %)
51.14
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.55 %)
1
(2.78 %)
325 Norovirus GV (Mu/NoV/GV/MNV1/2002/USA 2006)
GCF_000868425.1
4
(98.92 %)
56.72
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.42 %)
n/a 5
(0.60 %)
4
(18.84 %)
326 Norwalk-like virus (Hu/Norovirus/hiroshima/1999/JP9912-02F 2016)
GCF_001595695.1
3
(99.32 %)
50.06
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.23 %)
0
(0.00 %)
327 Omsk hemorrhagic fever virus (Bogoluvovska 2003)
GCF_000855505.1
1
(94.98 %)
53.64
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.20 %)
0
(0.00 %)
328 Onyong-nyong virus (1993)
GCF_000863005.1
5
(100.00 %)
48.32
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(1.28 %)
7
(1.39 %)
5
(15.80 %)
329 Onyong-nyong virus (SG650 2023)
GCF_002888795.1
2
(95.47 %)
48.09
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.42 %)
1
(1.22 %)
4
(0.63 %)
4
(13.44 %)
330 Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004)
GCF_000844845.1
130
(89.67 %)
63.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
56
(2.03 %)
37
(1.70 %)
1,076
(16.55 %)
1
(100.00 %)
331 Oropouche virus (2004)
GCF_000853785.1
4
(97.72 %)
35.40
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 33
(3.75 %)
0
(0.00 %)
332 Orthohantavirus asikkalaense (CZ/Beskydy/412/2010/Sm 2019)
GCF_002815935.1
3
(93.28 %)
38.58
(99.89 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.33 %)
0
(0.00 %)
333 Orthohantavirus bayoui (HV F0260003 2018)
GCF_002816435.1
3
(91.68 %)
39.50
(99.93 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.48 %)
n/a 11
(1.72 %)
0
(0.00 %)
334 Orthohantavirus caobangense (3 2017)
GCF_002119025.1
3
(93.00 %)
36.66
(99.93 %)
n/a 3
(100.00 %)
7
(1.60 %)
2
(0.38 %)
10
(1.22 %)
0
(0.00 %)
335 Orthohantavirus delgaditoense (VHV-574 2017)
GCF_002145545.1
3
(91.23 %)
37.63
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.29 %)
3
(0.77 %)
6
(0.87 %)
0
(0.00 %)
336 Orthohantavirus dobravaense (DOBV/Ano-Poroia/Afl9/1999 2003)
GCF_000863045.1
3
(94.21 %)
39.24
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.68 %)
2
(0.46 %)
13
(1.44 %)
0
(0.00 %)
337 Orthohantavirus khabarovskense (Fuyuan-Mm-217 2017)
GCF_002146125.1
3
(92.38 %)
38.20
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.46 %)
n/a 17
(1.58 %)
0
(0.00 %)
338 Orthohantavirus montanoense (104/2006 2017)
GCF_002117715.1
3
(91.77 %)
36.28
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
5
(1.70 %)
15
(2.97 %)
0
(0.00 %)
339 Orthohantavirus prospectense (PH-1 2018)
GCF_002994685.1
2
(82.88 %)
39.99
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.28 %)
n/a 4
(0.55 %)
0
(0.00 %)
340 Orthohantavirus robinaense (P17-14855 2021)
GCF_018594985.1
3
(100.04 %)
40.35
(99.96 %)
5
(0.04 %)
8
(99.96 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.54 %)
0
(0.00 %)
341 Orthohantavirus sangassouense (SA14 2017)
GCF_002145925.1
3
(93.52 %)
38.80
(99.97 %)
1
(0.01 %)
4
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(1.29 %)
0
(0.00 %)
342 Orthohantavirus sinnombreense (NM H10 2003)
GCF_000854765.1
4
(90.70 %)
38.42
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.95 %)
5
(1.33 %)
11
(1.93 %)
0
(0.00 %)
343 Orthohantavirus sinnombreense (NM R11 2023)
GCF_002830985.1
3
(90.70 %)
38.39
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.95 %)
5
(1.33 %)
11
(1.91 %)
0
(0.00 %)
344 Orthohantavirus tatenalense (Upton_Heath 2021)
GCF_018595015.1
3
(100.00 %)
38.26
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 14
(1.55 %)
0
(0.00 %)
345 Orthohantavirus tulaense (Moravia/5302v/95 2003)
GCF_000855225.1
4
(92.64 %)
38.04
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.94 %)
n/a 9
(0.58 %)
0
(0.00 %)
346 Orthohepevirus A (Xinjiang 1993)
GCF_000861105.1
3
(98.65 %)
57.95
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.80 %)
1
(89.53 %)
347 Orthomarburgvirus marburgense (Ravn virus/H.sapiens-tc/KEN/1987/Kitum Cave-810040 2014)
GCF_000943645.1
n/a 37.76
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.17 %)
n/a 21
(1.20 %)
0
(0.00 %)
348 Parainfluenza virus 5 (W3A 2004)
GCF_000854805.1
9
(99.06 %)
42.27
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 3
(0.30 %)
0
(0.00 %)
349 Paramecium bursaria Chlorella virus 1 (2011)
GCF_000847045.1
814
(95.11 %)
39.97
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
75
(0.98 %)
146
(4.42 %)
1,227
(8.76 %)
23
(3.04 %)
350 Parechovirus A (Gregory 1998)
GCF_000861505.1
1
(89.00 %)
39.48
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.30 %)
n/a 6
(0.98 %)
0
(0.00 %)
351 Pichinde virus (AN3739 2004)
GCF_000856465.1
4
(96.57 %)
41.84
(99.94 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.44 %)
0
(0.00 %)
352 Poliovirus 2 (Lansing 2023)
GCA_003108605.1
1
(89.03 %)
46.71
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.13 %)
1
(4.73 %)
353 Poliovirus 3 (2023)
GCA_008766715.1
1
(89.09 %)
46.90
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.11 %)
1
(5.49 %)
354 Powassan virus (LB 1993)
GCF_000860485.1
1
(94.55 %)
53.32
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 14
(1.20 %)
1
(3.47 %)
355 Primate norovirus (SimianNoV-nj 2016)
GCF_001755385.1
3
(97.68 %)
48.57
(99.96 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
6
(1.52 %)
1
(0.43 %)
7
(1.64 %)
0
(0.00 %)
356 Pseudomonas phage phi6 (S2 2006)
GCA_002966185.1
12
(78.79 %)
55.86
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.40 %)
3
(97.30 %)
357 Punta Toro virus (Adames 2018)
GCF_002815115.1
4
(92.61 %)
40.36
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(1.74 %)
3
(0.77 %)
16
(3.35 %)
0
(0.00 %)
358 Punta Toro virus (PAN472868 2015)
GCA_001021295.1
4
(92.38 %)
39.48
(99.92 %)
1
(0.01 %)
4
(99.99 %)
4
(0.98 %)
8
(1.26 %)
8
(2.86 %)
0
(0.00 %)
359 Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003)
GCF_000854405.1
3
(39.37 %)
36.97
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.66 %)
n/a 33
(3.47 %)
0
(0.00 %)
360 Rabbit calicivirus Australia 1 (MIC-07 2008)
GCF_000882575.1
2
(99.12 %)
47.88
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(3.68 %)
361 Rabbit hemorrhagic disease virus (FRG 2000)
GCF_000861285.1
2
(99.09 %)
50.20
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.61 %)
1
(0.56 %)
8
(1.18 %)
0
(0.00 %)
362 Rabbit vesivirus (2006)
GCF_000867805.1
3
(96.54 %)
47.74
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.01 %)
1
(1.01 %)
8
(1.87 %)
2
(7.00 %)
363 Rabies lyssavirus (1993)
GCF_000859625.1
5
(95.29 %)
45.10
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(1.15 %)
0
(0.00 %)
364 Reticuloendotheliosis virus (HA9901 2005)
GCF_000858025.1
3
(81.69 %)
52.71
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.86 %)
2
(1.01 %)
9
(1.35 %)
3
(8.85 %)
365 Rhinovirus A (1993)
GCF_000862245.1
1
(90.81 %)
39.05
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.15 %)
0
(0.00 %)
366 Rift Valley fever virus (ZH-548 2010)
GCF_000847345.1
4
(95.24 %)
45.11
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.49 %)
n/a 8
(1.04 %)
0
(0.00 %)
367 Rockport virus (MSB57412 2018)
GCF_002830685.1
3
(92.73 %)
35.05
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.71 %)
n/a 22
(1.83 %)
0
(0.00 %)
368 Rosavirus A2 (GA7403 2014)
GCF_000918175.1
1
(82.95 %)
51.41
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.67 %)
1
(4.60 %)
369 Ross River virus (NB5092 1993)
GCF_000862165.1
5
(96.96 %)
51.41
(99.90 %)
20
(0.47 %)
20
(99.53 %)
4
(0.90 %)
n/a 4
(1.54 %)
8
(48.39 %)
370 Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008)
GCF_000880735.1
12
(94.00 %)
33.67
(99.88 %)
n/a 11
(100.00 %)
4
(0.19 %)
n/a 21
(1.24 %)
0
(0.00 %)
371 Rotavirus C (Bristol 2005)
GCF_000864225.1
11
(95.04 %)
31.63
(99.89 %)
n/a 11
(100.00 %)
7
(1.19 %)
n/a 33
(2.72 %)
0
(0.00 %)
372 Rubella virus (F-Therien 1993)
GCF_000863025.1
2
(99.15 %)
69.60
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.85 %)
n/a 54
(9.70 %)
1
(98.66 %)
373 Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005)
GCF_000866785.1
1
(94.09 %)
49.75
(100.00 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.35 %)
1
(3.05 %)
374 Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009)
GCF_000886535.1
1
(89.26 %)
56.70
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(2.15 %)
2
(48.16 %)
375 San Miguel sea lion virus 8 (2014)
GCF_000925155.1
3
(98.48 %)
51.28
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.14 %)
3
(47.28 %)
376 Sandfly fever Naples virus (Toscana ISS.Phl.3 2004)
GCF_000854285.1
4
(98.01 %)
44.60
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.30 %)
n/a 13
(2.02 %)
0
(0.00 %)
377 Sapovirus (Hu/Dresden/pJG-Sap01/DE 2004)
GCF_000854265.1
3
(98.76 %)
50.63
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(1.06 %)
1
(3.94 %)
378 Sapovirus (Hu/GI/Sapporo/MT-2010/1982 2023)
GCF_008792745.1
3
(98.75 %)
50.70
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(1.09 %)
1
(5.79 %)
379 Sapovirus (Mc10 2004)
GCF_000853825.1
2
(98.38 %)
51.46
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.13 %)
0
(0.00 %)
380 Sapovirus C12 (C12 2004)
GCF_000855765.1
2
(98.27 %)
51.73
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.13 %)
2
(7.50 %)
381 Sapovirus Hu/Nagoya/NGY-1/2012/JPN (Hu/SaV/Nagoya/NGY-1/2012/JPN 2015)
GCF_001008475.1
2
(98.47 %)
49.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.60 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
382 SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003)
GCF_000864885.1
16
(97.60 %)
40.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.08 %)
n/a 18
(0.74 %)
0
(0.00 %)
383 Semliki Forest virus (1987)
GCF_000860285.1
4
(96.64 %)
53.22
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.66 %)
n/a 4
(1.46 %)
1
(92.56 %)
384 Seoul orthohantavirus (80-39 2003)
GCF_000855645.1
3
(93.29 %)
39.00
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.56 %)
n/a 14
(1.15 %)
0
(0.00 %)
385 Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (HNXH 2019)
GCF_003087855.1
4
(98.45 %)
48.84
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.21 %)
n/a 5
(0.39 %)
0
(0.00 %)
386 Sheeppox virus (TU-V02127 2002)
GCF_000840205.1
148
(93.28 %)
25.01
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
46
(1.32 %)
13
(0.59 %)
1,524
(24.28 %)
0
(0.00 %)
387 Simian foamy virus (1994)
GCF_000848485.1
6
(78.31 %)
38.96
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.50 %)
n/a 7
(0.57 %)
0
(0.00 %)
388 Sindbis virus (1993)
GCF_000860545.1
5
(100.00 %)
50.91
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.34 %)
n/a 3
(0.28 %)
1
(93.38 %)
389 Singapore grouper iridovirus (2004)
GCF_000846905.1
162
(89.23 %)
48.64
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.23 %)
26
(2.80 %)
285
(4.52 %)
1
(0.16 %)
390 smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993)
GCF_000859885.1
197
(87.60 %)
32.73
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
31
(0.69 %)
7
(0.57 %)
1,031
(9.09 %)
0
(0.00 %)
391 Snowshoe hare virus (2021)
GCF_004789895.1
4
(96.87 %)
37.25
(99.93 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.83 %)
n/a 15
(1.23 %)
0
(0.00 %)
392 Steller sea lion vesivirus (V1415 SSL2004-250F 2008)
GCF_000879655.1
3
(97.56 %)
48.57
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(1.29 %)
10
(1.29 %)
3
(13.70 %)
393 Suid alphaherpesvirus 1 (PRV-MdBio PRV-MdBio 2017)
GCA_900230325.1
170
(86.10 %)
73.56
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2
(100.00 %)
202
(7.85 %)
166
(7.32 %)
1,126
(32.56 %)
1
(99.40 %)
394 Tick-borne encephalitis virus (2000)
GCF_000863125.1
1
(91.96 %)
53.78
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.48 %)
1
(0.44 %)
7
(0.87 %)
2
(7.65 %)
395 Tick-borne encephalitis virus (Vasilchenko 2023)
GCA_004788235.1
1
(93.76 %)
54.70
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.45 %)
4
(9.01 %)
396 Torque teno virus 1 (VT416 1998)
GCF_000857545.1
5
(70.74 %)
49.06
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.80 %)
n/a 17
(6.93 %)
2
(35.41 %)
397 Tulane virus (2019)
GCF_004786795.1
3
(98.38 %)
46.66
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.21 %)
0
(0.00 %)
398 Tupaia hepatovirus A (TN1 2016)
GCF_001502175.1
1
(90.12 %)
39.41
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.63 %)
n/a 2
(0.97 %)
0
(0.00 %)
399 Turkey calicivirus (L11043 2019)
GCF_004786995.1
2
(98.47 %)
50.01
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
2
(7.99 %)
400 Turkey herpesvirus (FC126 Burmester 2001)
GCF_000839725.1
84
(78.98 %)
47.56
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.36 %)
14
(1.60 %)
256
(2.38 %)
0
(0.00 %)
401 Uukuniemi virus (2003)
GCF_000851865.1
4
(96.08 %)
47.69
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.86 %)
0
(0.00 %)
402 Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005)
GCF_000860085.1
223
(88.80 %)
33.34
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
26
(0.57 %)
10
(3.43 %)
744
(9.15 %)
0
(0.00 %)
403 Varicella-zoster virus (Dumas 1987)
GCF_000858285.1
74
(89.36 %)
46.02
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
14
(0.32 %)
17
(0.92 %)
421
(5.39 %)
1
(0.20 %)
404 Venezuelan equine encephalitis virus (1993)
GCF_000862105.1
6
(100.00 %)
50.12
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
1
(0.30 %)
6
(1.47 %)
4
(15.75 %)
405 Venezuelan equine encephalitis virus (Trinidad donkey donkey/Trinidad/1943 2023)
GCF_002889695.1
4
(100.00 %)
49.79
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.51 %)
1
(0.30 %)
6
(1.28 %)
4
(12.87 %)
406 Vesicular exanthema of swine virus (2000)
GCF_000847705.1
3
(97.55 %)
47.83
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.86 %)
1
(3.04 %)
407 Vesicular stomatitis Indiana virus (1993)
GCF_000850045.1
4
(91.34 %)
41.74
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.60 %)
0
(0.00 %)
408 vesivirus (Hom-1 2017)
GCF_002118765.1
3
(97.57 %)
48.33
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.10 %)
1
(3.05 %)
409 Vesivirus ferret badger/JX12/China/2012 (FBCV-JX12 2015)
GCF_001019935.1
3
(98.23 %)
45.18
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.14 %)
0
(0.00 %)
410 Walrus calicivirus (2003)
GCF_000852525.1
3
(97.71 %)
48.23
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.49 %)
3
(9.51 %)
411 West Nile virus (956 1993)
GCF_000861085.1
3
(93.90 %)
51.06
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.19 %)
3
(7.47 %)
412 West Nile virus (NY99 385-99 2007)
GCF_000875385.1
5
(93.41 %)
51.17
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.07 %)
1
(2.23 %)
413 Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000)
GCF_000850885.1
4
(96.79 %)
49.21
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.64 %)
3
(52.96 %)
414 Western equine encephalitis virus (AG80-646 2023)
GCF_002889215.1
2
(96.04 %)
48.32
(99.98 %)
8
(0.07 %)
9
(99.93 %)
4
(0.29 %)
n/a 5
(1.46 %)
3
(7.08 %)
415 WU Polyomavirus (B0 2007)
GCF_000870785.1
6
(85.79 %)
39.18
(99.92 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.03 %)
1
(0.71 %)
16
(3.46 %)
0
(0.00 %)
416 Yaba monkey tumor virus (2003)
GCF_000845705.1
140
(94.29 %)
29.83
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
24
(0.67 %)
6
(0.47 %)
1,223
(18.16 %)
0
(0.00 %)
417 Yaba-like disease virus (2001)
GCF_000847185.1
152
(95.76 %)
27.00
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
39
(1.06 %)
10
(0.44 %)
1,396
(21.09 %)
0
(0.00 %)
418 Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986)
GCF_000857725.1
1
(100.00 %)
49.72
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 1
(0.28 %)
0
(0.00 %)
419 Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999)
GCF_000848505.1
11
(95.31 %)
41.07
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.18 %)
n/a 4
(0.15 %)
1
(1.12 %)
420 Zika virus (MR 766 2009)
GCF_000882815.3
1
(95.05 %)
50.95
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.26 %)
0
(0.00 %)
421 Zika virus (Natal RGN 2017)
GCF_002366285.1
1
(95.04 %)
51.26
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.18 %)
0
(0.00 %)
TOTALS:total assembly count 421

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 223 assemblies assembly stats track stats
Mammals 678 assemblies assembly stats track stats
Birds 430 assemblies assembly stats track stats
Fishes 472 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 312 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1155 assemblies assembly stats track stats
Plants 312 assemblies assembly stats track stats
Fungi 921 assemblies assembly stats track stats
Viruses 421 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 121 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 557 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1186 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 974 assemblies assembly stats track stats