Viral Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of viral only.

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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)

count	common name link to genome browser	ncbiGene	gc5 base	gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	cpg islands
1	Adeno-associated virus - 1 (2000) GCF_000863065.1	2 (86.54 %)	56.52 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.86 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (71.49 %)
2	Adeno-associated virus - 3 (3H 2000) GCF_000841585.1	2 (86.46 %)	53.88 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (53.20 %)
3	Adeno-associated virus - 4 (ATCC VR-646 2000) GCF_000836885.1	2 (85.53 %)	57.46 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	2 (74.41 %)
4	Adeno-associated virus - 7 (2004) GCF_000845645.1	2 (86.55 %)	57.33 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (70.20 %)
5	Adeno-associated virus - 8 (2004) GCF_000846525.1	2 (93.22 %)	57.06 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.84 %)	n/a	2 (0.32 %)	1 (63.24 %)
6	adeno-associated virus 2 (1993) GCF_000838645.1	14 (89.01 %)	53.80 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (3.18 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (54.43 %)
7	adeno-associated virus 5 (2004) GCF_000846385.1	2 (86.34 %)	55.15 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.65 %)	n/a	4 (0.60 %)	2 (79.06 %)
8	Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005) GCF_000864245.1	11 (95.04 %)	33.42 (99.83 %)	n/a	11 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.20 %)	37 (2.83 %)	0 (0.00 %)
9	African swine fever virus (26544/OG10 2019) GCF_003032925.1	164 (88.73 %)	38.56 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.58 %)	59 (1.70 %)	1,341 (13.78 %)	17 (3.41 %)
10	African swine fever virus (47/Ss/2008 2019) GCF_003033005.1	235 (88.78 %)	38.48 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	27 (0.61 %)	59 (2.29 %)	1,387 (14.30 %)	17 (3.38 %)
11	African swine fever virus (ASFV Georgia 2007/1 2020) GCF_003047755.2	195 (89.23 %)	38.39 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	19 (0.33 %)	54 (1.73 %)	1,342 (13.47 %)	16 (3.41 %)
12	African swine fever virus (BA71 2019) GCF_003032875.1	161 (89.06 %)	38.81 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.57 %)	61 (2.86 %)	1,343 (14.57 %)	17 (3.46 %)
13	African swine fever virus (BA71V 2014) GCF_000858485.1	152 (88.20 %)	38.95 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.57 %)	55 (3.36 %)	1,176 (14.34 %)	17 (3.67 %)
14	African swine fever virus (Benin 97/1 2019) GCF_003047675.1	156 (88.61 %)	38.59 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.59 %)	59 (1.90 %)	1,380 (14.38 %)	17 (3.44 %)
15	African swine fever virus (E75 2019) GCF_003047715.1	171 (86.69 %)	38.66 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	25 (0.59 %)	56 (1.72 %)	1,332 (13.80 %)	17 (3.44 %)
16	African swine fever virus (Ken05/Tk1 2019) GCF_003032905.1	168 (88.02 %)	38.25 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	17 (0.33 %)	73 (2.13 %)	1,263 (12.68 %)	12 (2.54 %)
17	African swine fever virus (Ken06.Bus 2019) GCF_003032915.1	161 (87.27 %)	38.53 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	20 (0.43 %)	82 (2.27 %)	1,244 (12.87 %)	11 (3.08 %)
18	African swine fever virus (L60 2019) GCF_003032865.1	163 (89.33 %)	38.61 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.58 %)	57 (1.89 %)	1,368 (14.10 %)	17 (3.42 %)
19	African swine fever virus (NHV 2019) GCF_003032885.1	158 (89.62 %)	38.87 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.59 %)	53 (2.09 %)	1,299 (14.32 %)	18 (3.77 %)
20	African swine fever virus (OURT 88/3 2019) GCF_003047695.1	157 (89.68 %)	38.86 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.59 %)	49 (1.75 %)	1,293 (14.30 %)	18 (3.78 %)
21	Aichi virus 1 (A846/88 1998) GCF_000861885.1	1 (88.50 %)	58.90 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.09 %)	n/a	8 (2.47 %)	1 (81.27 %)
22	Aigai virus (AP92 2023) GCF_018594555.1	3 (95.48 %)	44.05 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (1.33 %)	0 (0.00 %)
23	Akhmeta virus (Akhmeta_2013-88 2021) GCF_006452035.1	220 (91.30 %)	33.52 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	46 (0.98 %)	34 (1.69 %)	1,169 (9.68 %)	0 (0.00 %)
24	Alenquer virus (2021) GCF_013086385.1	4 (95.09 %)	39.86 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.29 %)	13 (1.66 %)	0 (0.00 %)
25	Alkhumra hemorrhagic fever virus (Zaki #2 2012) GCA_031116565.1	1 (95.14 %)	54.00 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.40 %)	n/a	2 (0.13 %)	0 (0.00 %)
26	Alphapapillomavirus 12 (2000) GCF_000836865.1	8 (86.97 %)	48.06 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.36 %)	1 (0.51 %)	13 (3.72 %)	1 (4.50 %)
27	Alphapapillomavirus 3 (2000) GCF_000862805.1	7 (82.89 %)	46.32 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.79 %)	1 (0.95 %)	16 (5.23 %)	0 (0.00 %)
28	Alphapapillomavirus 4 (1991) GCF_000864945.1	7 (86.62 %)	48.40 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.34 %)	1 (0.50 %)	7 (2.05 %)	0 (0.00 %)
29	Anatid alphaherpesvirus 1 (2085 2023) GCA_008791745.1	78 (79.40 %)	44.93 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (0.18 %)	13 (1.23 %)	226 (2.34 %)	5 (4.61 %)
30	Anelloviridae sp. (ctbb016 2023) GCF_004286455.1	2 (74.06 %)	37.47 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.56 %)	11 (7.40 %)	0 (0.00 %)
31	Anelloviridae sp. (ctbc019 2023) GCF_004285675.1	2 (81.37 %)	36.92 (99.89 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (6.97 %)	0 (0.00 %)
32	Anelloviridae sp. (ctbd020 2023) GCF_004286695.1	2 (84.88 %)	37.93 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.35 %)	7 (5.11 %)	0 (0.00 %)
33	Anelloviridae sp. (ctbf014 2023) GCF_004286755.1	3 (79.12 %)	35.76 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (8.44 %)	0 (0.00 %)
34	Anelloviridae sp. (ctbf050 2023) GCF_004285795.1	3 (82.06 %)	37.83 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (12.62 %)	0 (0.00 %)
35	Anelloviridae sp. (ctbg056 2023) GCF_004285195.1	4 (89.12 %)	35.92 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.64 %)	1 (1.13 %)	19 (15.20 %)	0 (0.00 %)
36	Anelloviridae sp. (ctbi042 2023) GCF_004286375.1	1 (85.84 %)	32.36 (99.77 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (9.17 %)	0 (0.00 %)
37	Anelloviridae sp. (ctcd026 2023) GCF_004287315.1	2 (80.01 %)	37.81 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (4.86 %)	0 (0.00 %)
38	Anelloviridae sp. (ctcf040 2023) GCF_004287355.1	2 (84.67 %)	35.84 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.18 %)	n/a	9 (5.57 %)	0 (0.00 %)
39	Anelloviridae sp. (ctea38 2023) GCF_004287275.1	3 (79.81 %)	36.34 (99.85 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (6.46 %)	0 (0.00 %)
40	Anelloviridae sp. (ctei055 2023) GCF_004286855.1	2 (66.81 %)	34.97 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.20 %)	n/a	9 (13.25 %)	0 (0.00 %)
41	Anelloviridae sp. (ctga035 2023) GCF_004286675.1	2 (74.70 %)	37.19 (99.86 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.54 %)	1 (2.52 %)	3 (4.91 %)	0 (0.00 %)
42	Anelloviridae sp. (vzttmv5 2023) GCF_006370125.1	2 (74.68 %)	39.93 (99.86 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.75 %)	1 (3.25 %)	9 (7.81 %)	0 (0.00 %)
43	Anjozorobe virus (Anjozorobe/Em/MDG/2009/ATD49 2017) GCF_002145785.1	3 (93.60 %)	37.87 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (0.78 %)	1 (0.36 %)	16 (2.19 %)	0 (0.00 %)
44	Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003) GCF_000856545.1	4 (95.69 %)	41.57 (99.95 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.24 %)	1 (0.48 %)	2 (0.58 %)	0 (0.00 %)
45	Arthrobacter phage Corgi (2023) GCF_003692095.1	26 (95.88 %)	67.58 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.24 %)	n/a	99 (8.18 %)	1 (99.92 %)
46	Astrovirus (MLB1 2008) GCF_000880715.1	3 (98.83 %)	40.86 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	4 (1.15 %)	0 (0.00 %)
47	Astrovirus (VA1 2009) GCF_000885815.1	4 (97.94 %)	41.93 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.67 %)	n/a	7 (0.87 %)	0 (0.00 %)
48	Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012) GCF_000895575.1	3 (99.13 %)	40.52 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (2.01 %)	0 (0.00 %)
49	Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012) GCF_000899535.1	3 (99.15 %)	40.00 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (2.19 %)	0 (0.00 %)
50	Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012) GCF_000901475.1	3 (98.01 %)	41.78 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.29 %)	0 (0.00 %)
51	Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012) GCF_000897955.1	3 (97.62 %)	42.99 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0.00 %)
52	Atlantic salmon calicivirus (Nordland/2011 2014) GCF_000919195.1	2 (97.89 %)	53.49 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	3 (56.39 %)
53	Australian bat lyssavirus (insectivorous isolate 1999) GCF_000850325.1	5 (91.79 %)	44.15 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.61 %)	0 (0.00 %)
54	Bacillus phage PfNC7401 (2016) GCA_002611025.1	79 (85.50 %)	36.55 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	4 (0.31 %)	121 (3.62 %)	0 (0.00 %)
55	Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000) GCF_000858185.1	12 (86.10 %)	39.33 (99.89 %)	n/a	12 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.64 %)	0 (0.00 %)
56	Barmah Forest virus (BH2193 1997) GCF_000847585.1	5 (95.39 %)	48.55 (99.97 %)	2 (0.02 %)	3 (99.98 %)	4 (0.59 %)	n/a	7 (2.47 %)	5 (15.26 %)
57	Bastrovirus 7 (2017) GCF_002285025.1	3 (97.74 %)	58.36 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.27 %)	4 (52.22 %)
58	Bat sapovirus (Bat-SaV/Limbe65/CAM/2014 2017) GCF_002005625.1	2 (97.81 %)	46.98 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	5 (0.75 %)	1 (5.51 %)
59	Bat sapovirus (TLC58/HK 2012) GCF_000894635.1	2 (96.96 %)	60.16 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.49 %)	n/a	6 (0.66 %)	1 (94.41 %)
60	Beiji nairovirus (H160 2023) GCF_029888155.1	2 (86.68 %)	43.91 (99.97 %)	2 (0.01 %)	4 (99.99 %)	5 (0.59 %)	n/a	17 (2.03 %)	0 (0.00 %)
61	Betacoronavirus (England 1 H123990006 2018) GCF_002816195.1	12 (97.48 %)	41.18 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	n/a	2 (0.06 %)	0 (0.00 %)
62	Betapolyomavirus macacae (2000) GCF_000837645.1	18 (99.29 %)	40.76 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (4.54 %)	15 (4.33 %)	0 (0.00 %)
63	Bhanja virus (ibAr2709 2015) GCF_001019855.1	4 (96.85 %)	45.34 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.56 %)	0 (0.00 %)
64	Bocaparvovirus primate1 (Salvador1 2023) GCF_003033285.1	9 (85.80 %)	42.31 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.52 %)	n/a	6 (1.64 %)	0 (0.00 %)
65	Borna disease virus 2 (No/98 2016) GCF_000847565.3	6 (97.61 %)	50.10 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	3 (0.24 %)	3 (11.20 %)
66	Bourbon virus (MO-2013-2499 2023) GCF_023156645.1	6 (95.52 %)	45.81 (99.91 %)	1 (0.01 %)	7 (99.99 %)	3 (0.00 %)	1 (0.36 %)	5 (0.62 %)	0 (0.00 %)
67	Bovine adeno-associated virus (2004) GCF_000846165.1	2 (86.17 %)	53.77 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.43 %)	2 (50.44 %)
68	Bovine calicivirus strain (Kirklareli 2016) GCF_001714355.1	2 (98.04 %)	58.37 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.09 %)	1 (96.34 %)
69	Bovine herpesvirus type 1.1 (NVSL challenge 97-11 2022) GCF_008777455.1	75 (84.84 %)	72.42 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	116 (4.31 %)	1,304 (33.41 %)	1 (99.99 %)
70	Bovine leukemia virus (2000) GCF_000853665.1	14 (100.00 %)	54.17 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.73 %)	3 (12.09 %)
71	Bowe virus (VN1512 2017) GCF_002118085.1	3 (94.38 %)	36.23 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (1.00 %)	1 (0.29 %)	12 (2.09 %)	0 (0.00 %)
72	Bruges virus (BE/Vieux-Genappe/TE/2013/1 2017) GCF_002117675.1	3 (93.06 %)	38.99 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.47 %)	n/a	8 (1.00 %)	0 (0.00 %)
73	Bufavirus-3 (BTN-63 2014) GCF_000924255.1	5 (95.27 %)	39.77 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.31 %)	1 (0.78 %)	18 (5.18 %)	0 (0.00 %)
74	Bunyamwera virus (1991) GCF_000849925.1	4 (95.34 %)	35.16 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	30 (3.12 %)	0 (0.00 %)
75	Caaingua virus (MS681 2021) GCF_018585185.1	2 (96.38 %)	51.29 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.81 %)	n/a	5 (0.75 %)	4 (85.60 %)
76	Cache Valley virus (6V633 2019) GCF_004789995.1	4 (95.45 %)	35.43 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.75 %)	0 (0.00 %)
77	Calicivirus chicken/V0021/Bayern/2004 (Bavaria04V0021 2023) GCF_004786895.1	2 (98.62 %)	54.02 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.64 %)	1 (4.06 %)
78	Calicivirus isolate (TCG 14 2005) GCF_000859525.1	2 (98.09 %)	56.20 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.19 %)	n/a	2 (1.07 %)	2 (69.58 %)
79	Calicivirus pig/AB90/CAN (AB90 2009) GCF_000883855.1	2 (99.21 %)	54.31 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.39 %)	1 (0.39 %)	10 (1.83 %)	0 (0.00 %)
80	California encephalitis virus (BFS 283 2021) GCF_003972565.1	4 (94.87 %)	36.45 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.66 %)	0 (0.00 %)
81	Camel Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (camel/Abu Dhabi/B84 2020) GCA_032106395.1	3 (96.30 %)	43.00 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.56 %)	n/a	16 (0.70 %)	0 (0.00 %)
82	Canine vesivirus (2003) GCF_000851085.1	3 (97.08 %)	45.89 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.63 %)	0 (0.00 %)
83	Capira virus (VP-366G 2015) GCA_031322265.1	4 (95.28 %)	38.38 (99.97 %)	2 (0.03 %)	5 (99.97 %)	4 (1.01 %)	6 (0.94 %)	4 (1.22 %)	0 (0.00 %)
84	Carnivore chapparvovirus 1 (VRI 849 2020) GCA_031190585.1	2 (83.55 %)	37.38 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.90 %)	n/a	3 (1.98 %)	0 (0.00 %)
85	Catu virus (BeH 151 2018) GCF_002831305.1	3 (98.05 %)	37.20 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (0.91 %)	0 (0.00 %)
86	Central cimpanzee simian foamy virus (Pan troglodytes troglodytes BAD327 2018) GCF_003032755.1	6 (75.24 %)	38.61 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.88 %)	0 (0.00 %)
87	Cercopithecine alphaherpesvirus 2 (B264 2004) GCF_000846965.1	80 (78.07 %)	75.97 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	169 (6.25 %)	180 (5.92 %)	1,059 (33.71 %)	1 (100.00 %)
88	Chandipura virus (CIN 0451 2013) GCF_000906815.1	5 (96.34 %)	42.53 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.29 %)	n/a	19 (1.75 %)	0 (0.00 %)
89	Chandiru virus (2011) GCF_000891915.1	4 (94.55 %)	39.54 (99.96 %)	6 (0.06 %)	9 (99.94 %)	4 (0.24 %)	1 (0.42 %)	21 (2.82 %)	0 (0.00 %)
90	Changuinola virus (CGLV/BE AN 28873 2013) GCF_000911195.1	10 (96.06 %)	42.18 (99.89 %)	n/a	10 (100.00 %)	6 (0.61 %)	n/a	7 (0.79 %)	2 (3.32 %)
91	Chicken calicivirus (RS/BR/2015 2017) GCF_001963095.1	2 (95.46 %)	54.17 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.38 %)	1 (2.63 %)
92	Chikungunya virus (S27-African prototype 2002) GCF_000854045.1	2 (94.47 %)	50.04 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.87 %)	n/a	3 (1.76 %)	7 (34.06 %)
93	Chimpanzee adenovirus Y25 (2012) GCF_000897015.1	37 (82.60 %)	58.78 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (1.03 %)	3 (0.46 %)	100 (4.44 %)	5 (75.08 %)
94	Circo-like virus-Brazil (hs1 2014) GCF_000919735.1	4 (87.77 %)	34.73 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.05 %)	1 (2.26 %)	8 (7.21 %)	0 (0.00 %)
95	Circular ssDNA virus sp. (2023) GCF_023122845.1	2 (76.33 %)	57.82 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.59 %)	3 (1.77 %)	3 (2.41 %)	1 (83.33 %)
96	Circular ssDNA virus sp. (HV-CV1 2016) GCF_001678815.1	3 (73.09 %)	52.61 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.25 %)	1 (78.14 %)
97	Cocal virus (Indiana 2 2015) GCF_001440915.1	7 (99.82 %)	43.98 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.34 %)	n/a	7 (0.53 %)	0 (0.00 %)
98	Cocle virus (GML244915 2023) GCF_013086615.1	4 (91.78 %)	40.00 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (2.05 %)	9 (1.44 %)	13 (3.57 %)	0 (0.00 %)
99	Colobus guereza papillomavirus 2 (CgPV2 2011) GCF_000892175.1	6 (92.13 %)	47.13 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.54 %)	2 (1.95 %)	5 (2.71 %)	3 (15.12 %)
100	Colorado tick fever virus (Florio; N-7180 2002) GCF_000853265.1	13 (95.61 %)	46.56 (99.92 %)	n/a	12 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	32 (1.25 %)	7 (8.12 %)
101	Corriparta virus (AUS1960/01 2018) GCF_002829365.1	12 (95.17 %)	44.27 (99.91 %)	n/a	10 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	2 (0.32 %)	3 (6.68 %)
102	Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009) GCF_000885595.1	1 (83.53 %)	43.75 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.63 %)	n/a	5 (1.90 %)	0 (0.00 %)
103	Cosavirus D (HCoSV-D1 5004 2009) GCF_000886475.1	1 (88.44 %)	42.47 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.18 %)	0 (0.00 %)
104	Cosavirus E (HCoSV-E1 2009) GCF_000886455.1	1 (96.38 %)	41.93 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	5 (0.79 %)	0 (0.00 %)
105	Cosavirus F (PK5006 2017) GCF_002117635.1	1 (95.96 %)	44.40 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.93 %)	0 (0.00 %)
106	Cosavirus JMY-2014 (Cosa-CHN 2014) GCF_000930055.1	1 (88.17 %)	42.21 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.25 %)	0 (0.00 %)
107	Cowpox virus (Brighton Red 2002) GCF_000839185.1	233 (91.92 %)	33.40 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	41 (0.80 %)	64 (2.52 %)	1,041 (9.40 %)	0 (0.00 %)
108	Coxsackievirus A2 (Fleetwood CA2 2018) GCF_002816655.1	1 (88.90 %)	48.26 (99.96 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.64 %)	1 (4.18 %)
109	Coxsackievirus B3 (2018) GCF_002816685.1	1 (88.63 %)	47.67 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.11 %)	0 (0.00 %)
110	Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003) GCF_000854165.1	3 (95.80 %)	42.23 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.22 %)	26 (1.53 %)	0 (0.00 %)
111	Crosse virus (La Crosse/original 1994) GCA_002831285.1	6 (94.68 %)	36.60 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	17 (1.43 %)	0 (0.00 %)
112	Cuevavirus lloviuense (Lloviu virus/M.schreibersii-wt/ESP/2003/Asturias-Bat86 2011) GCF_000896415.1	9 (80.46 %)	45.99 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	13 (0.66 %)	0 (0.00 %)
113	Cutavirus (BR-337 2018) GCF_003033315.1	6 (99.33 %)	38.92 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (3.34 %)	n/a	15 (7.76 %)	0 (0.00 %)
114	Cyclovirus (NG12 2018) GCF_002820165.1	2 (83.78 %)	47.65 (99.78 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
115	Cyclovirus (NG14 2018) GCF_002820185.1	2 (86.35 %)	46.41 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.56 %)	1 (40.17 %)
116	Cyclovirus (PK5006 2018) GCF_002820085.1	2 (86.65 %)	43.66 (99.83 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.80 %)	1 (17.18 %)
117	Cyclovirus (PK5034 2018) GCF_002820145.1	2 (83.54 %)	48.09 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
118	Cyclovirus (PK5222 2018) GCF_002820105.1	2 (85.80 %)	43.62 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.33 %)	n/a	4 (5.29 %)	1 (23.56 %)
119	Cyclovirus (PK5510 2018) GCF_002820065.1	2 (84.59 %)	44.67 (99.77 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.91 %)	0 (0.00 %)
120	Cyclovirus (SL-108277 2018) GCF_002820225.1	2 (87.89 %)	41.99 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.99 %)	n/a	2 (1.52 %)	1 (15.67 %)
121	Cyclovirus (TN25 2018) GCF_002820125.1	3 (81.95 %)	45.20 (99.89 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.50 %)	1 (12.37 %)
122	Cyclovirus VN (hcf2 2018) GCF_002820205.1	3 (81.79 %)	46.20 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.62 %)	0 (0.00 %)
123	Dandenong virus (0710-2678 2007) GCA_031580275.1	4 (95.83 %)	43.24 (99.99 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.73 %)	1 (0.31 %)	5 (1.88 %)	0 (0.00 %)
124	Dar es Salaam virus (TZ-189 2023) GCF_018595055.1	3 (92.94 %)	40.08 (99.92 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.67 %)	n/a	14 (2.66 %)	0 (0.00 %)
125	Deer tick virus (ctb30 CT95 2001) GCA_004786555.1	1 (94.89 %)	52.70 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.86 %)	1 (2.25 %)
126	Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997) GCF_000862125.1	1 (94.82 %)	46.67 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.68 %)	0 (0.00 %)
127	Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993) GCF_000871845.1	5 (98.86 %)	45.82 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	2 (0.16 %)	0 (0.00 %)
128	Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2007) GCF_000866625.1	5 (98.92 %)	46.71 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.60 %)	0 (0.00 %)
129	Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001) GCF_000865065.1	4 (98.81 %)	47.13 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0.00 %)
130	Dengue virus type 3 (H87 2023) GCA_004788295.1	1 (95.11 %)	46.65 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0.00 %)
131	Dengue virus type 4 (814669 2023) GCA_004786575.1	1 (95.45 %)	47.05 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0.00 %)
132	Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017) GCF_002116195.1	6 (95.15 %)	45.84 (99.90 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.33 %)	0 (0.00 %)
133	Dianlovirus menglaense (Rousettus-wt/CHN/2015/Sharen-Bat9447-1 2021) GCF_013088285.1	7 (98.97 %)	36.55 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.22 %)	n/a	10 (0.75 %)	0 (0.00 %)
134	Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995) GCF_000850985.1	3 (96.61 %)	40.19 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	41 (3.15 %)	0 (0.00 %)
135	Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013) GCF_000905375.1	5 (90.59 %)	44.22 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.72 %)	0 (0.00 %)
136	Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018) GCF_003032765.1	5 (93.39 %)	37.99 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.77 %)	n/a	8 (0.77 %)	0 (0.00 %)
137	Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991) GCF_000862705.1	5 (96.00 %)	48.71 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.91 %)	n/a	3 (0.64 %)	5 (23.55 %)
138	ebolavirus (Bundibugyo virus/H.sapiens-tc/UGA/2007/Butalya-811250 2010) GCF_000889155.1	11 (96.40 %)	42.01 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.45 %)	n/a	17 (0.92 %)	0 (0.00 %)
139	ebolavirus (Reston virus/M.fascicularis-tc/USA/1989/Philippines89-Pennsylvania 2002) GCF_000854085.1	11 (98.80 %)	40.62 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.55 %)	n/a	6 (0.28 %)	0 (0.00 %)
140	ebolavirus (Sudan virus/H.sapiens-tc/UGA/2000/Gulu-808892 2004) GCF_000855585.1	11 (96.95 %)	41.34 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	10 (0.49 %)	0 (0.00 %)
141	ebolavirus (Tai Forest virus/H.sapiens-tc/CIV/1994/Pauleoula-CI 2010) GCF_000888475.1	11 (96.41 %)	42.26 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.50 %)	n/a	24 (1.26 %)	0 (0.00 %)
142	Echarate virus (2021) GCF_013086425.1	4 (94.01 %)	39.66 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.97 %)	2 (0.45 %)	20 (2.92 %)	0 (0.00 %)
143	Ectromelia virus (Moscow 2002) GCF_000841905.1	173 (80.43 %)	33.18 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	45 (0.96 %)	22 (1.55 %)	1,122 (9.40 %)	0 (0.00 %)
144	Ekpoma virus 1 (EKV-1 2018) GCF_002815855.1	8 (98.40 %)	40.35 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (0.96 %)	0 (0.00 %)
145	Ekpoma virus 2 (EKV-2 2018) GCF_002815875.1	8 (96.76 %)	39.26 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.54 %)	1 (3.07 %)	16 (1.81 %)	0 (0.00 %)
146	Encephalomyocarditis virus (Ruckert 1993) GCF_000862985.1	3 (87.80 %)	49.47 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.68 %)	1 (1.68 %)	2 (1.83 %)	0 (0.00 %)
147	Enterovirus 5666/sin/002209 (2001) GCA_031116435.1	1 (88.81 %)	48.02 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.00 %)	1 (3.40 %)
148	Enterovirus 5865/sin/000009 (2001) GCA_031116425.1	1 (88.81 %)	48.03 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.15 %)	1 (3.40 %)
149	Enterovirus A (1994) GCF_000861905.1	1 (88.79 %)	47.94 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.09 %)	1 (3.32 %)
150	enterovirus A114 (V13-0285 2016) GCF_001684625.1	1 (89.76 %)	47.55 (99.97 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (5.74 %)
151	Enterovirus A71 (BrCr 1996) GCA_008766895.1	1 (88.85 %)	47.66 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.63 %)	1 (5.09 %)
152	Enterovirus A71 (pinf7-54A 2005) GCA_031109255.1	1 (88.18 %)	47.90 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.72 %)	1 (0.72 %)	1 (0.74 %)	0 (0.00 %)
153	Enterovirus C (human poliovirus 1 Mahoney 1982) GCF_000861165.1	5 (98.35 %)	46.34 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.40 %)	1 (6.95 %)
154	Enterovirus D (Enterovirus 70 1993) GCF_000861205.1	1 (89.14 %)	42.80 (100.00 %)	3 (0.04 %)	4 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
155	enterovirus D68 (Fermon 2018) GCF_002816725.1	1 (89.14 %)	41.07 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.27 %)	0 (0.00 %)
156	Eothenomys miletus hantavirus (LX309 2018) GCF_002827125.1	3 (91.02 %)	37.39 (99.94 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	5 (0.87 %)	n/a	18 (2.75 %)	0 (0.00 %)
157	Epstein-Barr virus (Raji 2005) GCF_002402265.1	98 (77.44 %)	59.50 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	30 (0.66 %)	34 (5.62 %)	577 (10.56 %)	27 (45.97 %)
158	Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007) GCF_000872045.1	114 (68.90 %)	59.54 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	34 (0.79 %)	29 (5.78 %)	498 (10.10 %)	24 (45.98 %)
159	Equine herpesvirus 1 (Ab4 1993) GCA_000844025.1	81 (83.51 %)	56.66 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	23 (0.73 %)	28 (3.15 %)	306 (5.68 %)	2 (99.10 %)
160	Erve virus (2012) GCA_001629985.1	3 (97.03 %)	38.56 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.67 %)	0 (0.00 %)
161	Escherichia phage Lambda (2000) GCF_000840245.1	92 (95.32 %)	49.86 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.20 %)	n/a	36 (0.81 %)	4 (51.36 %)
162	European bat 1 lyssavirus (RV9; 9395GER 2007) GCF_000870765.1	5 (90.43 %)	44.65 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.08 %)	0 (0.00 %)
163	European bat 2 lyssavirus (RV1333 2015) GCF_000871625.2	5 (90.69 %)	44.80 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.50 %)	0 (0.00 %)
164	European brown hare syndrome virus (EBHSV-GD 2000) GCF_000857785.1	2 (98.66 %)	49.34 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.79 %)	1 (3.24 %)
165	Fathead minnow calicivirus (FHMCV/USA/MN/2012 2017) GCF_002285005.1	2 (98.66 %)	50.67 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.25 %)	3 (65.78 %)
166	Feline calicivirus (2023) GCF_008767155.1	2 (95.03 %)	46.14 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.22 %)	0 (0.00 %)
167	Feline calicivirus (Urbana 2003) GCF_000853345.1	3 (100.00 %)	45.17 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.39 %)	0 (0.00 %)
168	Fiwi virus (FIWIV CH17 2023) GCF_023131885.1	7 (94.31 %)	53.32 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.81 %)	4 (7.96 %)
169	Foot-and-mouth disease virus O (O6 o6pirbright iso58 2018) GCF_002816555.1	1 (85.34 %)	53.82 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.30 %)	2 (0.34 %)	2 (90.85 %)
170	Fort Sherman virus (86MSP18 2019) GCF_004789975.1	4 (95.36 %)	34.88 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.80 %)	n/a	19 (1.87 %)	0 (0.00 %)
171	Fugong virus (FG10 2017) GCF_002118945.1	3 (93.43 %)	36.93 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	15 (1.61 %)	0 (0.00 %)
172	Gallid alphaherpesvirus 1 (SA-2 1999) GCA_000847005.2	90 (80.77 %)	47.74 (99.98 %)	n/a	14 (100.00 %)	11 (0.22 %)	9 (0.61 %)	221 (1.97 %)	23 (30.48 %)
173	Gallid alphaherpesvirus 3 (HPRS24 2000) GCF_000838845.1	78 (74.47 %)	53.61 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	47 (1.57 %)	60 (2.83 %)	387 (6.28 %)	1 (99.49 %)
174	Gammapapillomavirus sp. (GammaDyskD_w07c34d 2019) GCF_004131625.1	6 (92.05 %)	35.95 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.82 %)	1 (0.86 %)	23 (5.21 %)	0 (0.00 %)
175	Gammapapillomavirus sp. (Gammai915_ga2c70 2019) GCF_004131645.1	7 (92.78 %)	37.08 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.56 %)	8 (1.03 %)	0 (0.00 %)
176	Gammapapillomavirus sp. (GammaiCH2_EV03c434 2019) GCF_004131665.1	7 (92.78 %)	35.74 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.66 %)	1 (3.79 %)
177	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_LCOSOc196 2019) GCF_004131525.1	7 (92.90 %)	37.15 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (3.44 %)	1 (3.35 %)
178	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w11C51 2019) GCF_004131545.1	7 (93.37 %)	36.15 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.31 %)	n/a	9 (1.36 %)	0 (0.00 %)
179	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w23c08c 2019) GCF_004131565.1	7 (92.58 %)	37.70 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	n/a	12 (1.77 %)	0 (0.00 %)
180	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w27c03a 2019) GCF_004131685.1	7 (93.31 %)	38.27 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	1 (3.22 %)
181	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w27c157c 2019) GCF_004131585.1	6 (92.56 %)	35.63 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	14 (1.98 %)	0 (0.00 %)
182	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w34c04a 2019) GCF_004131605.1	6 (92.68 %)	35.88 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (3.39 %)	0 (0.00 %)
183	GB virus C (1996) GCF_000862005.1	1 (91.81 %)	59.09 (99.98 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (1.67 %)	2 (82.30 %)
184	Gemycircularvirus (HV-GcV1 2016) GCF_001679855.1	4 (85.16 %)	52.74 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.31 %)	2 (84.05 %)
185	Gemycircularvirus (HV-GcV2 2016) GCF_001679875.1	3 (86.34 %)	53.63 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.40 %)	1 (88.59 %)
186	Gemycircularvirus (SL1 2015) GCF_000973195.1	3 (87.86 %)	50.89 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.46 %)	1 (1.46 %)	1 (1.46 %)	1 (90.45 %)
187	Gemycircularvirus C1c (GemyC1c 2018) GCF_002826005.1	1 (45.38 %)	50.12 (99.81 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.42 %)	1 (2.42 %)	3 (4.36 %)	2 (56.47 %)
188	Gemycircularvirus sp. (Vietnam 2023) GCF_018591295.1	3 (87.17 %)	47.97 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.32 %)	1 (44.43 %)
189	GIII (Norovirus Bo/GIII.2/Adam/2006/No 2016) GCF_001595675.1	3 (99.14 %)	57.11 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.01 %)	6 (36.84 %)
190	Goatpox virus (Pellor 2002) GCF_000840165.1	150 (93.15 %)	25.31 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	51 (1.59 %)	8 (0.24 %)	1,548 (24.38 %)	0 (0.00 %)
191	Goose calicivirus (N 2014) GCF_000920715.1	2 (97.15 %)	54.67 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.25 %)	1 (41.13 %)
192	Great Island virus (CanAr 42 2010) GCF_000887635.1	11 (95.17 %)	57.79 (99.90 %)	n/a	10 (100.00 %)	4 (0.19 %)	n/a	17 (1.06 %)	10 (95.67 %)
193	Grotenhout virus (Gierle-1 2023) GCF_018594915.1	2 (86.62 %)	44.02 (99.96 %)	n/a	2 (100.00 %)	5 (0.45 %)	n/a	18 (1.68 %)	0 (0.00 %)
194	Guaroa virus (BeH22063 2017) GCF_002118805.1	5 (95.03 %)	34.13 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.46 %)	n/a	10 (1.74 %)	0 (0.00 %)
195	Guenon simian foamy virus (Cercopithecus nictitans AG16 2019) GCF_003032775.1	6 (76.21 %)	38.62 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (1.09 %)	n/a	5 (0.38 %)	0 (0.00 %)
196	Gyrovirus (Tu243 2013) GCF_000913875.1	3 (75.54 %)	48.51 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (5.69 %)	1 (17.67 %)
197	Gyrovirus (Tu789 2013) GCF_000912415.1	3 (80.81 %)	52.68 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (3.94 %)	12 (10.96 %)	1 (43.30 %)
198	Gyrovirus 4 (D137 2012) GCF_000899075.1	2 (74.58 %)	49.46 (99.80 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (3.88 %)	1 (43.41 %)
199	Gyrovirus GyV3 (FecGy 2012) GCF_000896975.1	3 (81.48 %)	52.70 (99.83 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.97 %)	n/a	6 (4.83 %)	1 (43.37 %)
200	Hantaan orthohantavirus (76-118 2003) GCF_000856085.1	3 (94.17 %)	38.56 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.78 %)	0 (0.00 %)
201	Hantavirus (Z10 2004) GCF_000855785.1	3 (94.13 %)	39.29 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.38 %)	1 (0.30 %)	14 (1.40 %)	0 (0.00 %)
202	Heartland virus (Patient1 2014) GCF_000922255.1	4 (96.17 %)	46.33 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.27 %)	0 (0.00 %)
203	Heartland virus (TN 2023) GCF_013086545.1	4 (96.63 %)	46.52 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.18 %)	0 (0.00 %)
204	Hendra henipavirus (1998) GCF_000852685.1	9 (82.12 %)	39.43 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.38 %)	n/a	13 (0.75 %)	0 (0.00 %)
205	Hepacivirus platyrrhini (2018) GCF_002820785.1	1 (94.01 %)	50.47 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	1 (0.30 %)	4 (0.52 %)	2 (5.22 %)
206	Hepatitis B virus (2015) GCF_000861825.2	4 (55.31 %)	48.46 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (12.45 %)
207	Hepatitis C virus genotype 1 (H77 1997) GCF_000861845.1	3 (93.68 %)	58.24 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.33 %)	6 (1.40 %)	13 (2.88 %)	1 (90.43 %)
208	Hepatitis C virus genotype 3 (NZL1 2007) GCF_000874285.1	3 (95.88 %)	55.65 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	8 (0.95 %)	6 (52.40 %)
209	Hepatitis C virus genotype 4 (ED43 2007) GCF_000874265.1	3 (96.50 %)	56.18 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	5 (0.66 %)	n/a	5 (0.51 %)	4 (70.23 %)
210	Hepatitis C virus genotype 5 (EUH1480 2007) GCF_000873605.1	3 (96.81 %)	57.09 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.62 %)	3 (70.82 %)
211	Hepatitis C virus genotype 7 (QC69 2016) GCF_001712785.1	3 (95.88 %)	56.81 (99.97 %)	12 (0.13 %)	13 (99.87 %)	4 (0.27 %)	1 (0.26 %)	8 (0.84 %)	10 (48.13 %)
212	hepatitis D virus 1 (TW2667 2023) GCF_018547865.1	2 (38.48 %)	58.93 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.46 %)	1 (1.97 %)	3 (4.47 %)	1 (80.79 %)
213	hepatitis D virus 2 (TW2476 2023) GCF_018547875.1	2 (38.30 %)	59.58 (99.76 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (2.02 %)	1 (72.92 %)
214	hepatitis D virus 4 (TW-2b Taiwan isolate 2023) GCF_003033645.1	1 (34.90 %)	60.66 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.42 %)	1 (99.52 %)
215	Hepatitis delta virus (1993) GCF_000856565.1	2 (38.35 %)	58.81 (99.88 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.68 %)	1 (3.63 %)	1 (71.11 %)
216	Hepatitis delta virus (dFr2005 2023) GCF_018547925.1	1 (38.42 %)	60.24 (99.88 %)	8 (0.47 %)	9 (99.53 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (4.51 %)	1 (80.44 %)
217	Hepatitis delta virus (dFr2072 2023) GCF_018547915.1	1 (35.06 %)	60.78 (99.94 %)	3 (0.24 %)	4 (99.76 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (4.94 %)	1 (76.26 %)
218	Hepatitis delta virus (dFr2158 2023) GCF_018547935.1	1 (38.90 %)	60.42 (99.76 %)	15 (0.96 %)	16 (99.04 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (3.70 %)	1 (96.83 %)
219	Hepatitis delta virus (VnzD8349 2023) GCF_018547805.1	1 (35.22 %)	60.46 (99.82 %)	10 (0.72 %)	11 (99.28 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.54 %)	2 (87.09 %)
220	Hepatovirus A (1993) GCF_000860505.1	3 (100.00 %)	37.87 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.45 %)	1 (0.47 %)	1 (0.53 %)	0 (0.00 %)
221	Hepatovirus A (2ID 2023) GCA_008776015.1	1 (89.26 %)	33.72 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.57 %)	n/a	12 (3.99 %)	0 (0.00 %)
222	Herpes simplex virus type 1 (17 1990) GCF_000859985.2	81 (86.40 %)	68.30 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	81 (2.72 %)	51 (2.90 %)	932 (18.12 %)	1 (100.00 %)
223	Herpes simplex virus type 1 (HSV-H15119 2019) GCA_027936425.1	80 (76.71 %)	68.05 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	92 (2.63 %)	60 (4.91 %)	1,082 (18.73 %)	1 (100.00 %)
224	HMO Astrovirus A (NI-295 2009) GCF_000884395.1	4 (97.57 %)	43.54 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0.00 %)
225	Hudisavirus sp. (P22 2017) GCF_002375055.1	2 (81.59 %)	51.99 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.86 %)	1 (1.08 %)	3 (1.39 %)	2 (18.65 %)
226	human adenovirus 1 (2004) GCF_000858645.1	44 (91.94 %)	55.26 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	12 (0.98 %)	2 (0.11 %)	103 (4.79 %)	6 (70.17 %)
227	human adenovirus 2 (2004) GCF_000859465.1	42 (90.84 %)	55.20 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (0.89 %)	1 (0.12 %)	105 (4.66 %)	5 (70.08 %)
228	human adenovirus 35 (2004) GCF_000857885.1	44 (93.67 %)	48.88 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.68 %)	3 (0.30 %)	80 (3.56 %)	6 (39.41 %)
229	human adenovirus 5 (2004) GCF_000857865.1	42 (90.68 %)	55.20 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	12 (0.95 %)	n/a	99 (4.47 %)	5 (69.88 %)
230	human adenovirus 54 (Kobe-H 2009) GCF_000885675.1	40 (91.15 %)	54.91 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (0.74 %)	n/a	65 (2.61 %)	3 (66.98 %)
231	human adenovirus 7 (2004) GCF_000859485.1	45 (92.24 %)	51.27 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (0.56 %)	1 (1.54 %)	61 (2.28 %)	7 (43.72 %)
232	human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013) GCF_000858385.2	86 (83.37 %)	70.38 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	124 (3.80 %)	64 (3.26 %)	1,158 (23.65 %)	1 (99.99 %)
233	human associated cyclovirus 10 (7078A 2014) GCF_000918035.2	2 (86.20 %)	43.41 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
234	human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015) GCF_001448435.1	4 (89.04 %)	51.81 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.89 %)	1 (1.89 %)	1 (2.24 %)	1 (97.10 %)
235	human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018) GCF_003033475.1	2 (69.15 %)	42.76 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
236	human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018) GCF_003033485.1	2 (69.81 %)	43.97 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.38 %)	2 (0.57 %)	0 (0.00 %)
237	human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018) GCF_003033495.1	2 (70.27 %)	42.28 (99.84 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.79 %)	0 (0.00 %)
238	human associated porprismacovirus (16845x3_952 2023) GCF_018583805.1	2 (70.54 %)	47.72 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.58 %)	0 (0.00 %)
239	human associated porprismacovirus 2 (SF2 2015) GCF_000931315.1	2 (74.85 %)	48.83 (99.84 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.55 %)	1 (41.76 %)
240	human associated porprismacovirus 3 (16806x66_213 2023) GCF_018583635.1	2 (72.49 %)	48.72 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.72 %)	1 (9.00 %)
241	human astrovirus (1993) GCF_000861865.1	3 (97.58 %)	44.83 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.88 %)	1 (1.34 %)	9 (2.08 %)	0 (0.00 %)
242	human astrovirus BF34 (BF34 2014) GCF_000923215.1	4 (97.29 %)	43.77 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.47 %)	0 (0.00 %)
243	human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004) GCF_000845245.1	194 (84.91 %)	57.48 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	74 (1.33 %)	28 (0.67 %)	1,047 (7.96 %)	1 (99.99 %)
244	human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq) GCF_000845685.2	115 (79.56 %)	42.44 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	33 (1.67 %)	36 (4.27 %)	603 (9.83 %)	3 (13.72 %)
245	human betaherpesvirus 6B (Z29 1999) GCF_000846365.1	128 (82.45 %)	42.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	27 (1.57 %)	20 (3.84 %)	652 (8.84 %)	6 (15.35 %)
246	human betaherpesvirus 7 (RK 1995) GCF_000848125.1	111 (79.51 %)	36.22 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	16 (1.65 %)	34 (8.04 %)	791 (15.85 %)	3 (5.14 %)
247	human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009) GCF_000882675.1	4 (87.74 %)	41.59 (99.98 %)	1 (0.02 %)	2 (99.98 %)	5 (1.23 %)	n/a	5 (0.98 %)	0 (0.00 %)
248	human bocavirus 3 (W471 2009) GCF_000882855.1	4 (88.44 %)	42.16 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.95 %)	1 (4.96 %)
249	human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009) GCF_000886375.1	6 (92.83 %)	40.41 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.06 %)	0 (0.00 %)
250	human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014) GCF_000924015.1	4 (85.08 %)	47.13 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.85 %)	n/a	1 (0.25 %)	2 (49.61 %)
251	human coronavirus 229E (2001) GCF_000853505.1	9 (97.14 %)	38.26 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.31 %)	2 (0.29 %)	57 (2.91 %)	0 (0.00 %)
252	human coronavirus HKU1 (HKU1 2004) GCF_000858765.1	10 (98.07 %)	32.06 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.72 %)	1 (1.60 %)	89 (5.62 %)	0 (0.00 %)
253	human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004) GCF_000853865.1	8 (97.86 %)	34.46 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (1.09 %)	n/a	84 (5.24 %)	0 (0.00 %)
254	human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019) GCF_003972325.1	11 (97.82 %)	36.79 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.43 %)	1 (0.09 %)	90 (3.88 %)	0 (0.00 %)
255	human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014) GCF_000920655.1	1 (81.59 %)	43.53 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.59 %)	0 (0.00 %)
256	human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009) GCF_000884955.1	1 (88.49 %)	43.79 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.47 %)	n/a	6 (1.35 %)	0 (0.00 %)
257	human CSF-associated densovirus (21 2023) GCF_029883595.1	5 (90.42 %)	40.04 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.66 %)	n/a	2 (0.38 %)	0 (0.00 %)
258	human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013) GCF_000908835.1	3 (84.17 %)	46.45 (99.89 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.38 %)	1 (13.92 %)
259	human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019) GCF_003727435.1	1 (6.26 %)	53.36 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.89 %)	n/a	3 (0.59 %)	1 (93.16 %)
260	human echovirus 1 (Bryson 2023) GCA_008800515.1	1 (100.00 %)	48.54 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (9.98 %)
261	human endogenous retrovirus K113 (2013) GCF_000913595.1	1 (22.17 %)	41.86 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.60 %)	n/a	14 (2.49 %)	0 (0.00 %)
262	human enterovirus 71 HZ08/Hangzhou/2008 (HZ08 2011) GCA_031128755.1	1 (88.89 %)	47.98 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	1 (4.77 %)
263	human erythrovirus V9 (V9 2001) GCF_000841965.1	6 (90.67 %)	42.09 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.75 %)	0 (0.00 %)
264	human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017) GCF_002219885.1	5 (72.08 %)	31.11 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (5.43 %)	n/a	20 (11.11 %)	0 (0.00 %)
265	human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017) GCF_002219525.1	2 (84.04 %)	32.53 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.60 %)	0 (0.00 %)
266	human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017) GCF_002219705.1	2 (81.18 %)	45.77 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.34 %)	0 (0.00 %)
267	human feces pecovirus (PeCV-NI 2019) GCF_003726995.1	2 (72.77 %)	50.00 (99.90 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	5 (2.46 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (55.12 %)
268	human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018) GCF_003033575.1	2 (74.86 %)	46.00 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.54 %)	1 (19.22 %)
269	human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017) GCF_002271185.1	2 (72.89 %)	46.99 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.66 %)	1 (1.56 %)	4 (1.25 %)	0 (0.00 %)
270	human feces smacovirus 3 (SmaCV3_ETH_P15_2016 2023) GCF_003963575.1	2 (72.88 %)	47.89 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.91 %)	2 (0.56 %)	1 (24.13 %)
271	human gammaherpesvirus 8 (BCBL-1 2019) GCA_027939675.1	n/a	53.47 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.10 %)	29 (2.97 %)	135 (3.68 %)	8 (83.99 %)
272	human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007) GCF_000838265.1	113 (85.53 %)	53.76 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.18 %)	29 (2.88 %)	151 (3.93 %)	9 (84.42 %)
273	human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2009) GCA_027939395.1	102 (83.23 %)	53.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.00 %)	29 (3.04 %)	198 (4.58 %)	9 (84.78 %)
274	human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2019) GCA_027939375.1	102 (83.23 %)	53.78 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.00 %)	29 (3.04 %)	198 (4.58 %)	9 (84.78 %)
275	human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2021) GCA_027939385.1	102 (83.23 %)	53.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.00 %)	29 (3.04 %)	198 (4.58 %)	9 (84.78 %)
276	human gammaherpesvirus 8 (UNC_BCBL-1 2022) GCA_027939455.1	114 (84.22 %)	53.75 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.18 %)	29 (2.87 %)	145 (3.86 %)	9 (84.42 %)
277	human gemycircularvirus (GeTz1 2018) GCF_002826025.1	4 (77.38 %)	49.05 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.23 %)	0 (0.00 %)
278	human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015) GCF_000973295.1	4 (80.18 %)	54.85 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (1.21 %)	1 (91.86 %)
279	human hepegivirus (AK-790 2018) GCF_002821385.1	1 (96.18 %)	53.60 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.51 %)	2 (88.97 %)
280	human immunodeficiency virus 1 (1998) GCF_000864765.1	14 (93.78 %)	42.11 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.57 %)	1 (0.34 %)	18 (3.29 %)	1 (2.29 %)
281	human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993) GCF_000856385.1	12 (84.81 %)	45.66 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.98 %)	10 (1.44 %)	0 (0.00 %)
282	human lung-associated brisavirus AA (2023) GCA_014883685.1	3 (85.41 %)	34.45 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.12 %)	1 (1.25 %)	3 (6.59 %)	0 (0.00 %)
283	human lung-associated brisavirus II (2023) GCA_014883695.1	3 (86.04 %)	33.48 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.16 %)	1 (1.36 %)	2 (4.96 %)	0 (0.00 %)
284	human lung-associated brisavirus MD (2023) GCA_014883705.1	3 (77.31 %)	33.41 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.15 %)	2 (2.62 %)	5 (6.75 %)	0 (0.00 %)
285	human lung-associated brisavirus RC (2023) GCA_014883715.1	3 (88.73 %)	35.17 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (2.45 %)	1 (1.35 %)	3 (5.95 %)	0 (0.00 %)
286	human lung-associated vientovirus FB (2021) GCF_013088445.1	3 (86.49 %)	33.94 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.15 %)	1 (1.34 %)	3 (6.81 %)	0 (0.00 %)
287	human mastadenovirus A (2004) GCF_000884295.1	41 (94.00 %)	46.52 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.61 %)	n/a	73 (3.33 %)	6 (30.52 %)
288	human mastadenovirus A (Huie 1993) GCF_000846805.1	43 (94.41 %)	46.52 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.61 %)	n/a	73 (3.33 %)	6 (30.52 %)
289	human mastadenovirus B (GB 2008) GCF_000880515.1	48 (93.42 %)	51.05 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.47 %)	1 (0.18 %)	41 (1.61 %)	7 (43.26 %)
290	human mastadenovirus B (Slobitski 2008) GCF_000857085.1	46 (93.74 %)	48.88 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.82 %)	3 (0.30 %)	50 (2.47 %)	6 (39.41 %)
291	human mastadenovirus C (1993) GCF_000845085.1	63 (97.51 %)	55.20 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (0.89 %)	1 (0.12 %)	105 (4.66 %)	5 (70.08 %)
292	human mastadenovirus D (2004) GCF_000858625.1	21 (47.83 %)	56.58 (100.00 %)	4 (0.01 %)	5 (99.99 %)	12 (1.24 %)	n/a	61 (3.14 %)	3 (66.84 %)
293	human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008) GCF_000845985.1	47 (93.93 %)	57.10 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.92 %)	1 (0.13 %)	59 (2.95 %)	3 (67.41 %)
294	human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001) GCF_000859665.1	40 (96.48 %)	57.67 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (0.65 %)	n/a	107 (4.08 %)	5 (73.25 %)
295	human mastadenovirus F (Dugan 1993) GCF_000846685.1	44 (94.91 %)	51.22 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.32 %)	n/a	63 (2.23 %)	1 (62.53 %)
296	human metapneumovirus (00-1 2018) GCF_002815375.1	9 (93.36 %)	36.29 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (1.38 %)	1 (0.34 %)	27 (3.46 %)	0 (0.00 %)
297	human orthopneumovirus (2018) GCF_002815475.1	12 (97.34 %)	33.24 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.64 %)	1 (0.24 %)	19 (3.32 %)	0 (0.00 %)
298	human orthopneumovirus (B1 1997) GCF_000855545.1	10 (97.35 %)	33.56 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.61 %)	2 (0.52 %)	16 (3.21 %)	0 (0.00 %)
299	human orthorubulavirus 2 (1991) GCF_000863525.1	8 (98.61 %)	38.41 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.38 %)	n/a	6 (0.27 %)	0 (0.00 %)
300	human papillomavirus (SE379 2015) GCF_001274345.1	6 (93.54 %)	37.49 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.98 %)	1 (2.70 %)	21 (3.02 %)	0 (0.00 %)
301	human papillomavirus 103 (Qv33725 2006) GCF_000868225.1	6 (88.01 %)	41.58 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.45 %)	n/a	19 (3.06 %)	0 (0.00 %)
302	human papillomavirus 108 (2009) GCF_000883655.1	5 (88.56 %)	42.65 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.38 %)	0 (0.00 %)
303	human papillomavirus 109 (2009) GCF_000883695.1	7 (92.87 %)	38.28 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.94 %)	1 (0.48 %)	19 (3.13 %)	1 (3.23 %)
304	human papillomavirus 116 (HPV116 2009) GCF_000884175.1	7 (93.82 %)	38.50 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.40 %)	1 (4.73 %)
305	human papillomavirus 121 (NJ3301 2010) GCF_000889075.1	7 (92.45 %)	37.74 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	9 (0.98 %)	0 (0.00 %)
306	human papillomavirus 126 (HPV126 2011) GCF_000896435.1	7 (91.96 %)	38.05 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.68 %)	1 (2.92 %)
307	human papillomavirus 127 (R3a 2010) GCF_000890115.1	8 (93.50 %)	36.98 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (0.79 %)	18 (2.79 %)	1 (3.20 %)
308	human papillomavirus 132 (27-50 2011) GCF_000888015.1	7 (93.36 %)	37.94 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.89 %)	0 (0.00 %)
309	human papillomavirus 134 (39-65 2011) GCF_000889695.1	7 (92.69 %)	38.14 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.48 %)	0 (0.00 %)
310	human papillomavirus 135 (NJ3500 2012) GCF_000898235.1	7 (92.24 %)	36.86 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.56 %)	1 (0.67 %)	14 (2.77 %)	0 (0.00 %)
311	human papillomavirus 136 (CL3865 2012) GCF_000899695.1	7 (91.83 %)	38.51 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.85 %)	n/a	19 (3.31 %)	0 (0.00 %)
312	human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012) GCF_000898855.1	7 (91.69 %)	39.71 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.79 %)	n/a	4 (1.28 %)	0 (0.00 %)
313	human papillomavirus 154 (PV77 2013) GCF_000908695.1	7 (92.75 %)	37.93 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.37 %)	0 (0.00 %)
314	human papillomavirus 161 (KC1 2018) GCF_002826985.1	6 (92.39 %)	37.73 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.36 %)	0 (0.00 %)
315	human papillomavirus 163 (KC3 2015) GCF_001430115.1	6 (93.54 %)	37.69 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.80 %)	0 (0.00 %)
316	human papillomavirus 166 (KC9 2012) GCF_000899515.1	6 (92.72 %)	38.29 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.79 %)	0 (0.00 %)
317	human papillomavirus 167 (KC10 2013) GCF_000913075.1	6 (92.78 %)	35.83 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (5.24 %)	0 (0.00 %)
318	human papillomavirus 172 (2018) GCF_002827005.1	7 (95.04 %)	37.77 (99.96 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	5 (1.22 %)	n/a	4 (0.60 %)	0 (0.00 %)
319	human papillomavirus 175 (SE87 2018) GCF_002827025.1	7 (93.05 %)	38.87 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.29 %)	n/a	8 (1.00 %)	1 (3.46 %)
320	human papillomavirus 178 (2014) GCF_000918095.1	7 (92.49 %)	38.15 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.53 %)	2 (0.59 %)	8 (1.35 %)	0 (0.00 %)
321	human papillomavirus 179 (SIBX16 2013) GCF_000912535.1	6 (92.78 %)	36.76 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.87 %)	n/a	7 (1.67 %)	0 (0.00 %)
322	human papillomavirus 18 (2000) GCF_000865665.1	8 (87.96 %)	40.43 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	12 (3.67 %)	0 (0.00 %)
323	human papillomavirus 184 (SIBX17 2018) GCF_002987365.1	6 (92.71 %)	36.89 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.98 %)	1 (0.53 %)	4 (0.40 %)	0 (0.00 %)
324	human papillomavirus 187 (ACS447 2018) GCF_003055605.1	6 (92.85 %)	38.90 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.36 %)	0 (0.00 %)
325	human papillomavirus 201 (HPV201 2015) GCF_001184845.1	7 (93.33 %)	37.71 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	n/a	5 (0.95 %)	0 (0.00 %)
326	human papillomavirus 203 (SE369 2019) GCF_004133345.1	7 (92.96 %)	37.54 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	10 (1.33 %)	0 (0.00 %)
327	human papillomavirus 204 (A342 2018) GCF_002827045.1	7 (92.47 %)	37.84 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.50 %)	n/a	6 (1.44 %)	1 (2.92 %)
328	human papillomavirus 30 (2018) GCF_002987345.1	6 (84.46 %)	40.39 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.31 %)	2 (1.03 %)	14 (4.22 %)	0 (0.00 %)
329	human papillomavirus 4 (1993) GCF_000864845.1	7 (92.18 %)	38.53 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.71 %)	1 (0.35 %)	23 (3.75 %)	0 (0.00 %)
330	human papillomavirus 5 (1993) GCF_000866505.1	8 (92.64 %)	42.39 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.94 %)	1 (0.39 %)	13 (3.01 %)	1 (7.11 %)
331	human papillomavirus 71 (2018) GCF_002826825.1	1 (24.06 %)	44.38 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.47 %)	3 (1.63 %)	11 (3.93 %)	0 (0.00 %)
332	human papillomavirus 9 (1993) GCF_000863685.1	7 (94.00 %)	41.00 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.14 %)	2 (0.93 %)	13 (2.45 %)	1 (4.63 %)
333	human papillomavirus KC5 (KC5 2015) GCF_000989155.1	7 (92.99 %)	36.78 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.71 %)	0 (0.00 %)
334	human papillomavirus type 10 (1993) GCF_000864905.1	7 (84.68 %)	45.89 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.78 %)	n/a	16 (3.86 %)	0 (0.00 %)
335	human papillomavirus type 101 (Qv23954 2006) GCF_000869845.1	6 (89.06 %)	43.12 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	5 (0.61 %)	0 (0.00 %)
336	human papillomavirus type 112 (2009) GCF_000882135.1	7 (93.62 %)	37.52 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.73 %)	1 (3.81 %)
337	human papillomavirus type 128 (2011) GCF_000889675.1	7 (92.33 %)	35.98 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (3.18 %)	0 (0.00 %)
338	human papillomavirus type 129 (2011) GCF_000891495.1	7 (93.07 %)	37.31 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.82 %)	n/a	3 (0.35 %)	0 (0.00 %)
339	human papillomavirus type 131 (27-49 2011) GCF_000890535.1	7 (93.15 %)	37.03 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (2.73 %)	0 (0.00 %)
340	human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012) GCF_000897255.1	7 (93.60 %)	37.57 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	16 (2.39 %)	0 (0.00 %)
341	human papillomavirus type 144 (CL3740 2012) GCF_000898255.1	7 (92.09 %)	38.23 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.32 %)	0 (0.00 %)
342	human papillomavirus type 156 (GC01 2017) GCF_002006915.1	7 (92.47 %)	36.18 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.86 %)	0 (0.00 %)
343	human papillomavirus type 16 (1993) GCF_000863945.3	11 (87.67 %)	36.53 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (3.26 %)	1 (0.32 %)	12 (4.50 %)	0 (0.00 %)
344	human papillomavirus type 26 (1993) GCF_000866485.1	6 (84.85 %)	38.60 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.74 %)	2 (0.45 %)	14 (5.89 %)	0 (0.00 %)
345	human papillomavirus type 32 (1993) GCF_000864925.1	6 (84.42 %)	40.98 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.83 %)	n/a	9 (1.96 %)	0 (0.00 %)
346	human papillomavirus type 34 (1993) GCF_000863965.1	6 (85.10 %)	38.25 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.33 %)	3 (1.17 %)	8 (3.52 %)	0 (0.00 %)
347	human papillomavirus type 41 (1991) GCF_000863845.1	11 (90.82 %)	46.94 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.45 %)	n/a	3 (0.28 %)	1 (3.68 %)
348	human papillomavirus type 48 (1995) GCF_000839365.1	7 (93.41 %)	36.76 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.58 %)	18 (3.61 %)	1 (4.07 %)
349	human papillomavirus type 49 (1993) GCF_000862825.1	6 (93.19 %)	41.11 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.81 %)	n/a	11 (2.66 %)	0 (0.00 %)
350	human papillomavirus type 50 (1995) GCF_000841625.1	7 (92.78 %)	36.85 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.53 %)	14 (2.00 %)	0 (0.00 %)
351	human papillomavirus type 53 (1993) GCF_000865685.1	7 (66.96 %)	40.14 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (2.47 %)	n/a	24 (6.16 %)	0 (0.00 %)
352	human papillomavirus type 54 (1995) GCF_000864725.1	7 (84.57 %)	41.88 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.32 %)	n/a	9 (3.05 %)	0 (0.00 %)
353	human papillomavirus type 60 (1995) GCF_000838505.1	7 (92.85 %)	36.94 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.83 %)	n/a	12 (2.15 %)	1 (3.27 %)
354	human papillomavirus type 63 (1993) GCF_000865565.1	7 (91.55 %)	40.44 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.20 %)	1 (0.59 %)	5 (0.53 %)	0 (0.00 %)
355	human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985) GCF_000861945.1	9 (89.64 %)	40.87 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.39 %)	1 (0.76 %)	15 (3.21 %)	0 (0.00 %)
356	human papillomavirus type 7 (1993) GCF_000861925.1	6 (82.97 %)	39.53 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.73 %)	1 (0.59 %)	13 (3.49 %)	0 (0.00 %)
357	human papillomavirus type 85 (114B 2017) GCF_002153865.1	8 (90.54 %)	37.76 (98.31 %)	7 (1.95 %)	8 (98.05 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (4.34 %)	0 (0.00 %)
358	human papillomavirus type 88 (2008) GCF_000874925.1	7 (92.19 %)	40.11 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.35 %)	6 (0.71 %)	1 (4.00 %)
359	human papillomavirus type 90 (2002) GCF_000862685.1	7 (82.73 %)	46.65 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.95 %)	n/a	10 (3.96 %)	1 (2.53 %)
360	human papillomavirus type 92 (2003) GCF_000846285.1	7 (93.86 %)	39.96 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.48 %)	3 (1.50 %)	7 (2.92 %)	1 (4.21 %)
361	human papillomavirus type 96 (2003) GCF_000864825.1	7 (97.38 %)	40.31 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.81 %)	n/a	21 (3.83 %)	1 (4.33 %)
362	human parainfluenza virus 4a (M-25 2013) GCF_000910675.1	7 (83.27 %)	36.23 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.23 %)	1 (0.22 %)	13 (1.18 %)	0 (0.00 %)
363	human parechovirus 1 (2018) GCF_002817305.1	1 (89.15 %)	39.06 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.29 %)	0 (0.00 %)
364	human parvovirus 4 G1 (2005) GCF_000861005.1	2 (89.92 %)	44.94 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.87 %)	2 (1.52 %)	4 (0.70 %)	1 (3.85 %)
365	human parvovirus B19 (J35 1999) GCF_000839645.1	6 (81.47 %)	43.81 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	4 (2.93 %)	13 (4.72 %)	2 (12.12 %)
366	human pegivirus 2 (UC0125.US 2015) GCF_001310135.2	1 (92.98 %)	53.96 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.49 %)	2 (90.06 %)
367	human picobirnavirus (Hy005102 2005) GCF_000859285.1	3 (92.15 %)	46.02 (100.00 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
368	human poliovirus strain (Sabin 1 2023) GCA_008766755.1	1 (89.10 %)	46.26 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.23 %)	1 (7.15 %)
369	human polyomavirus 1 (1993) GCF_000837865.1	7 (89.15 %)	39.53 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (2.45 %)	13 (4.13 %)	0 (0.00 %)
370	human polyomavirus 12 (hu1403 2013) GCF_000906235.1	6 (89.41 %)	39.60 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.64 %)	1 (0.91 %)	27 (6.74 %)	0 (0.00 %)
371	human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007) GCF_000873085.1	6 (88.17 %)	39.37 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.85 %)	26 (6.90 %)	0 (0.00 %)
372	human polyomavirus 6 (607a 2010) GCF_000888495.1	6 (89.67 %)	42.66 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.83 %)	0 (0.00 %)
373	human polyomavirus 7 (713a 2010) GCF_000889175.1	6 (89.14 %)	42.91 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (1.25 %)	0 (0.00 %)
374	human polyomavirus 9 (HPyV9 2011) GCF_000891615.1	6 (88.18 %)	39.16 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (4.74 %)	0 (0.00 %)
375	human PoSCV5-like circular virus (MRJ 2023) GCF_013087445.1	2 (86.31 %)	33.91 (99.90 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	5 (2.29 %)	1 (1.36 %)	2 (5.00 %)	0 (0.00 %)
376	human respirovirus 1 (Washington 1964 2002) GCF_000848705.1	10 (99.19 %)	37.24 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.19 %)	1 (0.25 %)	4 (1.69 %)	0 (0.00 %)
377	human respirovirus 3 (1998) GCF_000850205.1	9 (93.58 %)	34.52 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.09 %)	n/a	11 (1.89 %)	0 (0.00 %)
378	human respirovirus 3 (ZHYMgz01 Guangzhou 2023) GCF_006298365.1	6 (94.02 %)	35.29 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.93 %)	n/a	13 (1.30 %)	0 (0.00 %)
379	human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018) GCF_002816885.1	1 (92.58 %)	43.40 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
380	human rotavirus B (Bang373 2013) GCF_000907835.1	13 (95.17 %)	36.97 (99.88 %)	n/a	11 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (1.22 %)	0 (0.00 %)
381	human RSV respiratory syncytial virus A (S2 ts1C 2000) GCF_000856445.1	13 (98.68 %)	33.21 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.89 %)	1 (0.26 %)	23 (3.73 %)	0 (0.00 %)
382	human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015) GCF_000929235.1	2 (69.15 %)	43.94 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
383	human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018) GCF_002819605.1	2 (93.58 %)	43.54 (99.76 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (1.24 %)	0 (0.00 %)
384	human T-cell leukemia virus type I (1993) GCA_003102335.1	3 (59.99 %)	53.88 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (2.55 %)	3 (15.21 %)
385	human T-cell leukemia virus type I (1998) GCF_000863585.1	11 (81.17 %)	53.47 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	19 (2.50 %)	2 (12.06 %)
386	human T-lymphotropic virus 2 (1993) GCF_000847505.1	9 (94.24 %)	53.82 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.11 %)	n/a	16 (2.41 %)	2 (6.46 %)
387	human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009) GCF_000882595.1	8 (77.85 %)	56.28 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.51 %)	n/a	30 (5.68 %)	3 (16.69 %)
388	human TMEV-like cardiovirus (2008) GCF_000875265.1	3 (86.45 %)	43.58 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.84 %)	0 (0.00 %)
389	Husavirus sp. (16370_59 2016) GCF_002374975.1	1 (98.06 %)	52.82 (99.99 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	4 (0.37 %)	n/a	2 (0.25 %)	1 (99.41 %)
390	I virus (Cowden 2000) GCF_000849945.1	2 (99.13 %)	53.50 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.57 %)	1 (10.49 %)
391	IAS virus (2020) GCF_003443495.1	116 (90.03 %)	32.03 (99.98 %)	180 (0.31 %)	181 (99.69 %)	28 (1.11 %)	2 (0.08 %)	327 (5.48 %)	0 (0.00 %)
392	Igbo Ora virus (IBH10964 1998) GCA_002888815.1	2 (95.47 %)	48.08 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	1 (1.24 %)	2 (0.48 %)	5 (13.59 %)
393	Ilesha virus (R5964 2019) GCF_004789595.1	4 (95.33 %)	32.35 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	21 (2.74 %)	0 (0.00 %)
394	Imjin virus (2017) GCF_002146225.1	3 (94.30 %)	36.50 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (2.23 %)	6 (1.29 %)	9 (2.75 %)	0 (0.00 %)
395	Indian encephalitis associated cyclovirus (IECSF08 2017) GCF_001939215.2	3 (78.82 %)	43.78 (99.83 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.41 %)	0 (0.00 %)
396	Influenza A virus (A/California/07/2009 2015) GCF_001343785.1	14 (99.84 %)	43.70 (99.90 %)	4 (0.03 %)	12 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.83 %)	0 (0.00 %)
397	Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005) GCF_000864105.1	15 (96.68 %)	44.12 (99.93 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.35 %)	0 (0.00 %)
398	Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003) GCF_000851145.1	12 (97.14 %)	44.07 (99.90 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.81 %)	0 (0.00 %)
399	Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005) GCF_000866645.1	15 (97.49 %)	43.41 (99.89 %)	1 (0.01 %)	9 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.28 %)	0 (0.00 %)
400	Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005) GCF_000865085.1	15 (96.37 %)	42.94 (99.91 %)	n/a	8 (100.00 %)	4 (0.57 %)	n/a	6 (0.33 %)	0 (0.00 %)
401	Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982) GCF_000865725.1	15 (96.32 %)	43.40 (99.90 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.68 %)	0 (0.00 %)
402	Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015) GCF_000928555.1	15 (99.34 %)	44.36 (99.92 %)	1 (0.01 %)	9 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.30 %)	0 (0.00 %)
403	Influenza B virus (B/Lee/1940 1993) GCF_000820495.2	11 (92.51 %)	40.19 (99.88 %)	n/a	8 (100.00 %)	5 (0.51 %)	n/a	23 (1.85 %)	0 (0.00 %)
404	Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004) GCF_000856665.10	11 (95.87 %)	37.28 (99.91 %)	n/a	7 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	42 (4.23 %)	0 (0.00 %)
405	Influenza D virus (D/swine/Oklahoma/1334/2011 2018) GCF_002867775.1	9 (96.50 %)	41.45 (99.88 %)	n/a	7 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (2.47 %)	0 (0.00 %)
406	Isfahan virus (2013) GCF_000906835.1	5 (96.29 %)	41.93 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (1.82 %)	0 (0.00 %)
407	Issyk-Kul virus (LEIV-315K 2023) GCF_014883185.1	3 (95.40 %)	40.21 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.22 %)	6 (0.25 %)	0 (0.00 %)
408	Japanese encephalitis virus (1993) GCF_000862145.1	3 (93.83 %)	51.43 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.15 %)	0 (0.00 %)
409	JC polyomavirus (Mad1 1993) GCF_000863805.1	9 (96.55 %)	40.45 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (3.82 %)	17 (5.52 %)	0 (0.00 %)
410	Jeju virus (10-11 2017) GCF_002117615.1	3 (93.96 %)	36.20 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (1.02 %)	1 (0.28 %)	16 (2.20 %)	0 (0.00 %)
411	Jos virus (2023) GCF_023156725.1	6 (96.99 %)	46.01 (99.92 %)	1 (0.01 %)	7 (99.99 %)	4 (0.39 %)	n/a	15 (1.52 %)	0 (0.00 %)
412	Kander virus (CH17 2023) GCF_023155475.1	6 (94.29 %)	52.48 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.32 %)	0 (0.00 %)
413	Kasokero virus (Z-52963 2018) GCF_002288735.2	3 (96.72 %)	42.73 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.35 %)	n/a	29 (2.09 %)	0 (0.00 %)
414	Kenkeme virus (Fuyuan-Sr-326 2017) GCF_002146025.1	3 (95.18 %)	37.73 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.26 %)	n/a	16 (1.40 %)	0 (0.00 %)
415	Kunjin virus (MRM61C 2023) GCA_004786635.1	1 (96.61 %)	50.58 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (2.43 %)
416	Kyasanur Forest disease virus (2018) GCF_002820625.1	1 (98.80 %)	55.20 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	1 (0.11 %)	3 (6.73 %)
417	La Crosse virus (human/78 2002) GCF_000850965.1	4 (94.68 %)	36.68 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	26 (2.75 %)	0 (0.00 %)
418	La Crosse virus (LACV/human/1960 2023) GCF_004789695.1	4 (94.68 %)	36.75 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	17 (1.56 %)	0 (0.00 %)
419	Lagos bat lyssavirus (0406SEN 2013) GCF_000905975.1	5 (90.15 %)	43.48 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.41 %)	0 (0.00 %)
420	Lake Victoria marburgvirus - (Leiden 2011) GCA_031129775.1	7 (76.60 %)	38.11 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.25 %)	0 (0.00 %)
421	Lake Victoria marburgvirus - Angola2005 (Ang1379c 2006) GCA_031121245.1	7 (98.72 %)	38.40 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (0.91 %)	0 (0.00 %)
422	Lake Victoria marburgvirus - Ci67 (2007) GCA_031121995.1	7 (98.72 %)	38.45 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.38 %)	0 (0.00 %)
423	Lake Victoria marburgvirus - DRC1999 (07DRC99 2006) GCA_031121255.1	7 (98.72 %)	38.19 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.27 %)	0 (0.00 %)
424	Langat virus (TP21 2000) GCF_000860805.1	1 (93.62 %)	54.31 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.56 %)	1 (2.18 %)
425	Langya virus (SDQD_H1801 2022) GCA_031319335.1	9 (81.86 %)	38.30 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.26 %)	n/a	18 (1.31 %)	0 (0.00 %)
426	Lassa mammarenavirus (Josiah 1998) GCF_000851705.1	4 (94.96 %)	42.06 (99.94 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.37 %)	9 (1.70 %)	0 (0.00 %)
427	Le Dantec virus (DakHD763 2017) GCF_002118505.1	6 (97.47 %)	37.82 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	18 (1.72 %)	0 (0.00 %)
428	Lebombo virus (SAAR 3896 2018) GCF_002829425.1	11 (96.53 %)	47.16 (99.91 %)	n/a	10 (100.00 %)	5 (0.77 %)	n/a	6 (0.77 %)	5 (14.49 %)
429	LI polyomavirus (LIPyV 2017) GCF_002080215.1	6 (90.04 %)	39.85 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (3.95 %)	0 (0.00 %)
430	Louping ill virus (369/T2 1997) GCF_000863165.1	1 (94.24 %)	54.86 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.52 %)	3 (12.29 %)
431	Lumpy skin disease virus NI- (Neethling 2490 2001) GCF_000839805.1	156 (95.76 %)	25.91 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	55 (1.76 %)	20 (0.65 %)	1,542 (23.51 %)	0 (0.00 %)
432	Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993) GCF_000851025.1	4 (97.52 %)	42.29 (99.99 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.07 %)	0 (0.00 %)
433	Macaca fascicularis papillomavirus 2 (Mac191 2011) GCF_000892835.1	7 (91.76 %)	48.74 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.97 %)	2 (1.35 %)	3 (1.51 %)	2 (12.66 %)
434	Macaca mulatta papillomavirus 6 (PM084S3_c170482 2019) GCF_004134585.1	7 (83.26 %)	51.82 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.70 %)	1 (0.34 %)	36 (7.23 %)	2 (16.69 %)
435	Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003) GCF_000853725.1	4 (94.98 %)	41.77 (99.95 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.62 %)	0 (0.00 %)
436	Madariaga virus (MADV/Cebus apella/BRA/BEAN5122/1956 2014) GCF_000917835.1	2 (95.96 %)	49.14 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.74 %)	1 (1.31 %)	6 (0.83 %)	5 (18.11 %)
437	Madariaga virus (PE-3.0815 2023) GCF_002888955.1	2 (96.12 %)	49.30 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.55 %)	1 (1.31 %)	5 (0.65 %)	5 (17.39 %)
438	Madrid virus (BT4075 2017) GCF_002118405.1	4 (93.18 %)	34.25 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	22 (2.75 %)	0 (0.00 %)
439	Maldonado virus (FMD 0077 2021) GCF_013086435.1	4 (97.39 %)	39.95 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.84 %)	n/a	7 (1.82 %)	0 (0.00 %)
440	Mamastrovirus 1 (V1347 2016) GCF_001736695.1	2 (100.00 %)	44.60 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.68 %)	n/a	6 (1.65 %)	0 (0.00 %)
441	Mammalian orthoreovirus 3 (MPC/04 2009) GCF_000924315.1	11 (98.51 %)	47.01 (99.91 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (0.81 %)	3 (5.61 %)
442	Mammalian orthoreovirus 3 (T3D Dearing 2023) GCF_006298385.1	10 (96.87 %)	46.94 (99.94 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	24 (1.20 %)	3 (4.20 %)
443	Mammarenavirus chapareense (810419 2008) GCF_000879235.1	4 (96.22 %)	40.03 (99.96 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.75 %)	0 (0.00 %)
444	Mammarenavirus choriomeningitidis (Armstrong 53b 2023) GCF_004789475.1	4 (95.06 %)	43.03 (99.96 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (1.05 %)	1 (0.43 %)	3 (1.37 %)	1 (2.40 %)
445	Mammarenavirus guanaritoense (INH-95551 2003) GCF_000853765.1	4 (96.01 %)	40.64 (99.96 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.75 %)	0 (0.00 %)
446	Mammarenavirus lassaense (Alzey 2016) GCA_900094045.1	4 (94.91 %)	42.17 (99.98 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.33 %)	2 (0.37 %)	7 (1.51 %)	0 (0.00 %)
447	Mammarenavirus lujoense (2009) GCF_000885555.1	4 (96.94 %)	42.40 (99.93 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.40 %)	n/a	7 (0.88 %)	0 (0.00 %)
448	Maporal virus (HV 97021050 2017) GCF_002145825.3	3 (92.24 %)	38.51 (99.91 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.25 %)	1 (0.22 %)	11 (1.32 %)	0 (0.00 %)
449	Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994) GCF_000857325.2	7 (98.72 %)	38.29 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (1.05 %)	0 (0.00 %)
450	Marburg virus - Musoke, Kenya, 1980 (Musoke 2024) GCA_000857325.3	7 (98.72 %)	38.28 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (1.05 %)	0 (0.00 %)
451	Marmot norovirus (HT16 2019) GCF_004130475.1	1 (92.61 %)	55.57 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.19 %)	0 (0.00 %)
452	Mayaro virus (2002) GCF_000863385.1	5 (96.78 %)	50.37 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.76 %)	n/a	4 (1.59 %)	5 (42.02 %)
453	Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998) GCF_000854845.1	7 (94.55 %)	47.43 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.91 %)	1 (3.88 %)
454	Menangle virus (Australia/bat/2009/Cedar Grove 2018) GCF_002815295.1	7 (90.94 %)	42.02 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.41 %)	0 (0.00 %)
455	Merkel cell polyomavirus (R17b 2008) GCF_000874865.1	5 (88.06 %)	40.69 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.78 %)	0 (0.00 %)
456	Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012) GCF_000901155.1	12 (97.48 %)	41.24 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	n/a	4 (0.14 %)	0 (0.00 %)
457	Mink calicivirus (MCV-DL/2007/CN 2012) GCF_000901135.1	3 (95.62 %)	45.47 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	1 (0.21 %)	0 (0.00 %)
458	Mokola lyssavirus (2004) GCF_000856485.1	5 (98.49 %)	44.42 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.73 %)	0 (0.00 %)
459	Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996) GCF_000843325.1	163 (85.07 %)	63.36 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	128 (3.25 %)	92 (4.74 %)	1,361 (17.29 %)	1 (99.95 %)
460	monkey B virus (8100812 2023) GCF_018580855.1	97 (76.06 %)	75.59 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	167 (5.56 %)	151 (4.68 %)	1,200 (33.97 %)	1 (99.99 %)
461	monkey B virus (E2490 2003) GCF_000844145.1	80 (76.11 %)	74.46 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	139 (4.30 %)	119 (5.55 %)	1,144 (32.51 %)	1 (99.99 %)
462	monkey B virus (KQ 2023) GCF_018580865.1	97 (76.48 %)	75.30 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	135 (4.65 %)	142 (6.00 %)	1,151 (34.13 %)	1 (100.00 %)
463	Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022) GCF_014621545.1	179 (83.90 %)	33.03 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	38 (0.78 %)	22 (0.54 %)	1,097 (9.44 %)	0 (0.00 %)
464	Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021) GCF_000857045.1	180 (84.71 %)	33.09 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	37 (0.96 %)	24 (0.57 %)	1,102 (9.51 %)	0 (0.00 %)
465	Mopeia Lassa virus reassortant 29 (ML29 IGS-15 2004) GCF_000855745.1	4 (95.68 %)	43.06 (99.97 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (1.48 %)	0 (0.00 %)
466	Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000) GCF_000856685.1	8 (92.81 %)	42.49 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	10 (0.59 %)	0 (0.00 %)
467	Mundri virus (A14 2023) GCF_029887105.1	8 (98.82 %)	40.65 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	1 (0.34 %)	14 (1.28 %)	0 (0.00 %)
468	Mupapillomavirus 1 (1982) GCF_000866405.1	7 (86.17 %)	40.28 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.47 %)	1 (0.40 %)	7 (1.87 %)	1 (2.75 %)
469	Murine herpesvirus 68 (WUMS 2007) GCA_000845665.1	80 (90.74 %)	47.23 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.12 %)	31 (3.40 %)	69 (4.25 %)	4 (4.97 %)
470	Murray Valley encephalitis virus (1999) GCF_000863565.1	3 (93.56 %)	48.72 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.23 %)	1 (1.84 %)
471	MW polyomavirus (MA095 2012) GCF_000898335.1	6 (91.25 %)	36.91 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (4.00 %)	0 (0.00 %)
472	Myxoma virus (Lausanne 2002) GCF_000843685.1	170 (95.89 %)	43.56 (100.00 %)	7 (0.00 %)	8 (100.00 %)	11 (0.16 %)	15 (0.33 %)	578 (5.25 %)	0 (0.00 %)
473	Nairobi sheep disease virus (Jilin 2017) GCF_002117695.1	3 (97.66 %)	44.18 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	45 (2.54 %)	0 (0.00 %)
474	Nebraska virus (NB 2002) GCF_000851625.1	2 (98.09 %)	56.55 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.72 %)	n/a	1 (0.30 %)	2 (68.70 %)
475	New Jersey polyomavirus-2013 (NJ-PyV-2013 2014) GCF_000922675.1	9 (89.72 %)	39.28 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.06 %)	n/a	12 (3.58 %)	0 (0.00 %)
476	Newbury agent 1 (2006) GCF_000867125.1	2 (98.08 %)	56.20 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.19 %)	n/a	3 (1.18 %)	2 (62.74 %)
477	Nipah henipavirus (2000) GCF_000863625.1	11 (82.06 %)	38.17 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.17 %)	n/a	8 (0.37 %)	0 (0.00 %)
478	Nkolbisson virus (YM 31-65 2017) GCF_002145865.1	5 (97.26 %)	42.98 (99.97 %)	1 (0.02 %)	2 (99.98 %)	4 (0.67 %)	n/a	7 (0.52 %)	0 (0.00 %)
479	Norovirus (dog/GVI.1/HKU_Ca026F/2007/HKG 2019) GCF_007609015.1	3 (97.97 %)	56.44 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.17 %)	3 (66.91 %)
480	Norovirus GI (1993) GCF_000864005.1	3 (99.09 %)	48.03 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.52 %)	1 (0.35 %)	3 (0.31 %)	0 (0.00 %)
481	Norovirus GI (Hu/BD/2011/GI.7PNA2/Dhaka1882 2019) GCF_008704025.1	3 (99.22 %)	48.46 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0.00 %)
482	Norovirus GI (Hu/JP/1998/GI.6PNA4/No20-Saitama-98-17 2019) GCF_008703965.1	3 (98.91 %)	49.94 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.56 %)	n/a	3 (0.36 %)	0 (0.00 %)
483	Norovirus GI (Hu/JP/2000/GI.6PNA1/WUG1 2019) GCF_008703985.1	3 (98.82 %)	49.62 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	12 (1.55 %)	0 (0.00 %)
484	Norovirus GI/Hu/JP/2007/GI.P3_GI.3/Shimizu/KK2866 (Shimizu/KK2866 2018) GCF_003813225.1	3 (99.03 %)	48.57 (100.00 %)	2 (0.03 %)	3 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.56 %)	1 (3.89 %)
485	Norovirus GII (Hu/GII.PNA4-GII.NA4/PNV06929/2008/PER 2019) GCF_008711635.1	3 (99.19 %)	47.69 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.29 %)	0 (0.00 %)
486	Norovirus GII (NORO_176-1_17_12_2015 2019) GCF_004193815.1	3 (99.64 %)	50.31 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0.00 %)
487	Norovirus GII (NORO_226_06_01_2016 2018) GCF_003638685.1	3 (99.23 %)	48.61 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.86 %)	0 (0.00 %)
488	Norovirus GII.17 (Hu/GII.P17_GII.17/KR/2015/CAU-267 2018) GCF_003638645.1	3 (99.14 %)	48.14 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.71 %)	0 (0.00 %)
489	Norovirus GII.2 (BJSMQ 2018) GCF_003638665.1	3 (99.36 %)	48.71 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0.00 %)
490	Norovirus GII/Hu/JP/2007/GII.P15_GII.15/Sapporo/HK299 (Sapporo/HK299 2019) GCF_007608995.1	3 (99.01 %)	49.25 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.29 %)	0 (0.00 %)
491	Norovirus GII/Hu/JP/2011/GII/Yuzawa/Gira2HS (Yuzawa/Gira2HS 2019) GCF_007609035.1	3 (98.91 %)	48.63 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.30 %)	0 (0.00 %)
492	Norovirus GIV (CU081210E/USA/2010 2020) GCF_010478905.1	3 (98.55 %)	58.56 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.28 %)	1 (98.56 %)
493	Norovirus GIV (Hu/GIV.1/LakeMacquarie/NSW268O/2010/AU 2016) GCF_001595715.1	3 (98.88 %)	50.71 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.37 %)	1 (3.69 %)
494	Norovirus GIV (Hu/US/2016/GIV.NA1PNA1/WI7002 2019) GCF_008704005.1	3 (99.96 %)	51.14 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.55 %)	1 (2.78 %)
495	Norovirus GV (Mu/NoV/GV/MNV1/2002/USA 2006) GCF_000868425.1	4 (98.92 %)	56.72 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	n/a	5 (0.60 %)	4 (18.84 %)
496	Norwalk-like virus (Hu/Norovirus/hiroshima/1999/JP9912-02F 2016) GCF_001595695.1	3 (99.32 %)	50.06 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.23 %)	0 (0.00 %)
497	NY_014 poxvirus (2013 2017) GCF_002270605.1	197 (91.70 %)	29.52 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	42 (0.94 %)	15 (0.77 %)	1,374 (12.16 %)	0 (0.00 %)
498	Omsk hemorrhagic fever virus (Bogoluvovska 2003) GCF_000855505.1	1 (94.98 %)	53.64 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.20 %)	0 (0.00 %)
499	Onyong-nyong virus (1993) GCF_000863005.1	5 (100.00 %)	48.32 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (1.28 %)	7 (1.39 %)	5 (15.80 %)
500	Onyong-nyong virus (SG650 2023) GCF_002888795.1	2 (95.47 %)	48.09 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	1 (1.22 %)	4 (0.63 %)	4 (13.44 %)
501	Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004) GCF_000844845.1	130 (89.67 %)	63.44 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	56 (2.03 %)	37 (1.70 %)	1,076 (16.55 %)	1 (100.00 %)
502	Oropouche virus (2004) GCF_000853785.1	4 (97.72 %)	35.40 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	33 (3.75 %)	0 (0.00 %)
503	Orthobunyavirus bwambaense (M459 2017) GCF_002118905.1	4 (94.10 %)	31.34 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	8 (2.54 %)	5 (1.00 %)	23 (5.73 %)	0 (0.00 %)
504	Orthohantavirus andesense (Chile-9717869 2002) GCF_000850405.1	4 (92.25 %)	38.53 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.38 %)	0 (0.00 %)
505	Orthohantavirus asikkalaense (CZ/Beskydy/412/2010/Sm 2019) GCF_002815935.1	3 (93.28 %)	38.58 (99.89 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.33 %)	0 (0.00 %)
506	Orthohantavirus bayoui (HV F0260003 2018) GCF_002816435.1	3 (91.68 %)	39.50 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.48 %)	n/a	11 (1.72 %)	0 (0.00 %)
507	Orthohantavirus caobangense (3 2017) GCF_002119025.1	3 (93.00 %)	36.66 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	7 (1.60 %)	2 (0.38 %)	10 (1.22 %)	0 (0.00 %)
508	Orthohantavirus delgaditoense (VHV-574 2017) GCF_002145545.1	3 (91.23 %)	37.63 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.29 %)	3 (0.77 %)	6 (0.87 %)	0 (0.00 %)
509	Orthohantavirus dobravaense (DOBV/Ano-Poroia/Afl9/1999 2003) GCF_000863045.1	3 (94.21 %)	39.24 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.68 %)	2 (0.46 %)	13 (1.44 %)	0 (0.00 %)
510	Orthohantavirus khabarovskense (Fuyuan-Mm-217 2017) GCF_002146125.1	3 (92.38 %)	38.20 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.46 %)	n/a	17 (1.58 %)	0 (0.00 %)
511	Orthohantavirus montanoense (104/2006 2017) GCF_002117715.1	3 (91.77 %)	36.28 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	5 (1.70 %)	15 (2.97 %)	0 (0.00 %)
512	Orthohantavirus prospectense (PH-1 2018) GCF_002994685.1	2 (82.88 %)	39.99 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	4 (0.55 %)	0 (0.00 %)
513	Orthohantavirus robinaense (P17-14855 2021) GCF_018594985.1	3 (100.04 %)	40.35 (99.96 %)	5 (0.04 %)	8 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.54 %)	0 (0.00 %)
514	Orthohantavirus sangassouense (SA14 2017) GCF_002145925.1	3 (93.52 %)	38.80 (99.97 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.29 %)	0 (0.00 %)
515	Orthohantavirus sinnombreense (NM H10 2003) GCF_000854765.1	4 (90.70 %)	38.42 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.95 %)	5 (1.33 %)	11 (1.93 %)	0 (0.00 %)
516	Orthohantavirus sinnombreense (NM R11 2023) GCF_002830985.1	3 (90.70 %)	38.39 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.95 %)	5 (1.33 %)	11 (1.91 %)	0 (0.00 %)
517	Orthohantavirus tatenalense (Upton_Heath 2021) GCF_018595015.1	3 (100.00 %)	38.26 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.55 %)	0 (0.00 %)
518	Orthohantavirus tulaense (Moravia/5302v/95 2003) GCF_000855225.1	4 (92.64 %)	38.04 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.94 %)	n/a	9 (0.58 %)	0 (0.00 %)
519	Orthohepevirus A (Xinjiang 1993) GCF_000861105.1	3 (98.65 %)	57.95 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.80 %)	1 (89.53 %)
520	Orthomarburgvirus marburgense (Ravn virus/H.sapiens-tc/KEN/1987/Kitum Cave-810040 2014) GCF_000943645.1	7 (98.72 %)	37.76 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.17 %)	n/a	21 (1.20 %)	0 (0.00 %)
521	Orthonairovirus tomdiense (TT1 2023) GCF_018595155.1	3 (100.00 %)	45.30 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	9 (0.50 %)	0 (0.00 %)
522	Orthorubulavirus mapueraense (BeAnn 370284 2007) GCF_000873165.1	9 (96.64 %)	44.68 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.90 %)	0 (0.00 %)
523	Orungo virus (UGMP 359 2018) GCF_002829445.1	11 (96.63 %)	45.83 (99.93 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.24 %)	2 (7.81 %)
524	Oz virus (EH8 2019) GCF_004117175.1	6 (94.83 %)	43.72 (99.95 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.36 %)	0 (0.00 %)
525	Papio hamadryas papillomavirus 1 (Mac2085 2012) GCF_000896995.1	8 (85.63 %)	49.41 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.56 %)	1 (0.51 %)	9 (4.48 %)	1 (5.12 %)
526	Parainfluenza virus 5 (W3A 2004) GCF_000854805.1	9 (99.06 %)	42.27 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	3 (0.30 %)	0 (0.00 %)
527	Paramecium bursaria Chlorella virus 1 (2011) GCF_000847045.1	814 (95.11 %)	39.97 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	75 (0.98 %)	146 (4.42 %)	1,227 (8.76 %)	23 (3.04 %)
528	Parechovirus A (Gregory 1998) GCF_000861505.1	1 (89.00 %)	39.48 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	6 (0.98 %)	0 (0.00 %)
529	Parvovirus NIH-CQV (2013) GCF_000910875.1	3 (80.08 %)	45.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (2.04 %)	0 (0.00 %)	2 (32.09 %)
530	Paslahepevirus balayani (2023) GCF_002826225.1	3 (98.54 %)	58.02 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.86 %)	1 (92.98 %)
531	Paslahepevirus balayani (AlgSwe2012 2023) GCF_023120075.1	3 (97.76 %)	58.57 (99.97 %)	6 (0.09 %)	7 (99.91 %)	6 (1.04 %)	1 (0.37 %)	22 (4.83 %)	1 (97.93 %)
532	Paslahepevirus balayani (little egret/kocsag02/2014/HUN 2023) GCF_023120345.1	3 (96.92 %)	51.40 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (2.22 %)	3 (11.05 %)
533	Pegivirus platyrrhini (2000) GCF_000847425.1	1 (93.48 %)	57.91 (100.00 %)	25 (0.26 %)	26 (99.74 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (1.65 %)	7 (35.01 %)
534	Pegivirus platyrrhini (2023) GCF_002821105.1	1 (92.91 %)	57.84 (99.97 %)	110 (1.15 %)	111 (98.85 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.15 %)	6 (66.95 %)
535	Pichinde virus (AN3739 2004) GCF_000856465.1	4 (96.57 %)	41.84 (99.94 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.44 %)	0 (0.00 %)
536	Piry virus (BeAn2423 2018) GCF_002816055.1	5 (96.19 %)	43.18 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.33 %)	12 (1.08 %)	0 (0.00 %)
537	Poliovirus 2 (Lansing 2023) GCA_003108605.1	1 (89.03 %)	46.71 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	1 (4.73 %)
538	Poliovirus 3 (2023) GCA_008766715.1	1 (89.09 %)	46.90 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	1 (5.49 %)
539	Potato leafroll virus (2000) GCF_000856725.1	9 (93.42 %)	49.46 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.30 %)	0 (0.00 %)	1 (9.72 %)
540	Potato leafroll virus (Canada 2023) GCF_021461725.1	n/a	49.44 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.33 %)	1 (0.17 %)	1 (9.89 %)
541	Powassan virus (LB 1993) GCF_000860485.1	1 (94.55 %)	53.32 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.20 %)	1 (3.47 %)
542	Primate norovirus (SimianNoV-nj 2016) GCF_001755385.1	3 (97.68 %)	48.57 (99.96 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	6 (1.52 %)	1 (0.43 %)	7 (1.64 %)	0 (0.00 %)
543	Primate T-lymphotropic virus 1 (Tan90 2000) GCF_000861125.1	4 (68.45 %)	53.76 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (2.27 %)	3 (15.46 %)
544	Primate T-lymphotropic virus 3 (CTO-604 2002) GCF_000847845.1	7 (60.22 %)	53.22 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.66 %)	3 (6.99 %)
545	Protoparvovirus primate1 (BF.86 2018) GCF_002827465.1	5 (93.20 %)	40.10 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.78 %)	1 (1.27 %)	20 (5.83 %)	0 (0.00 %)
546	Pseudomonas phage phi6 (S2 2006) GCA_002966185.1	12 (78.79 %)	55.86 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.40 %)	3 (97.30 %)
547	Pulau reovirus (2018) GCF_002829605.1	12 (96.55 %)	48.18 (99.94 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.40 %)	7 (10.97 %)
548	Punta Toro virus (Adames 2018) GCF_002815115.1	4 (92.61 %)	40.36 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (1.74 %)	3 (0.77 %)	16 (3.35 %)	0 (0.00 %)
549	Punta Toro virus (PAN472868 2015) GCA_001021295.1	4 (92.38 %)	39.48 (99.92 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	4 (0.98 %)	8 (1.26 %)	8 (2.86 %)	0 (0.00 %)
550	Punta Toro virus (PAN472868 2015) GCF_001021295.1	4 (92.38 %)	39.48 (99.92 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	4 (0.98 %)	8 (1.26 %)	8 (2.86 %)	0 (0.00 %)
551	Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003) GCF_000854405.1	3 (39.37 %)	36.97 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.66 %)	n/a	33 (3.47 %)	0 (0.00 %)
552	Rabbit calicivirus Australia 1 (MIC-07 2008) GCF_000882575.1	2 (99.12 %)	47.88 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (3.68 %)
553	Rabbit hemorrhagic disease virus (FRG 2000) GCF_000861285.1	2 (99.09 %)	50.20 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.61 %)	1 (0.56 %)	8 (1.18 %)	0 (0.00 %)
554	Rabbit vesivirus (2006) GCF_000867805.1	3 (96.54 %)	47.74 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.01 %)	1 (1.01 %)	8 (1.87 %)	2 (7.00 %)
555	Rabies lyssavirus (1993) GCF_000859625.1	5 (95.29 %)	45.10 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.15 %)	0 (0.00 %)
556	Reticuloendotheliosis virus (HA9901 2005) GCF_000858025.1	3 (81.69 %)	52.71 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.86 %)	2 (1.01 %)	9 (1.35 %)	3 (8.85 %)
557	Rhinovirus A (1993) GCF_000862245.1	1 (90.81 %)	39.05 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.15 %)	0 (0.00 %)
558	rhinovirus A1 (ATCC VR-1559 2018) GCF_002816835.1	1 (90.75 %)	37.47 (99.97 %)	3 (0.04 %)	4 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (2.02 %)	0 (0.00 %)
559	rhinovirus B14 (2000) GCF_000861265.1	1 (90.68 %)	40.58 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
560	rhinovirus B3 (2018) GCF_002816855.1	1 (90.69 %)	39.94 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.15 %)	0 (0.00 %)
561	Rhinovirus C (024 2007) GCF_000872325.1	1 (90.65 %)	42.80 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
562	Rift Valley fever virus (ZH-548 2010) GCF_000847345.1	4 (95.24 %)	45.11 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.49 %)	n/a	8 (1.04 %)	0 (0.00 %)
563	Rockport virus (MSB57412 2018) GCF_002830685.1	3 (92.73 %)	35.05 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.71 %)	n/a	22 (1.83 %)	0 (0.00 %)
564	Rosavirus A2 (GA7403 2014) GCF_000918175.1	1 (82.95 %)	51.41 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.67 %)	1 (4.60 %)
565	Ross River virus (NB5092 1993) GCF_000862165.1	5 (96.96 %)	51.41 (99.90 %)	20 (0.47 %)	20 (99.53 %)	4 (0.90 %)	n/a	4 (1.54 %)	8 (48.39 %)
566	Ross River virus (QML 1 2023) GCF_002889255.1	2 (94.13 %)	51.05 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.26 %)	3 (2.11 %)	6 (2.51 %)	7 (49.69 %)
567	Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008) GCF_000880735.1	12 (94.00 %)	33.67 (99.88 %)	n/a	11 (100.00 %)	4 (0.19 %)	n/a	21 (1.24 %)	0 (0.00 %)
568	Rotavirus C (Bristol 2005) GCF_000864225.1	11 (95.04 %)	31.63 (99.89 %)	n/a	11 (100.00 %)	7 (1.19 %)	n/a	33 (2.72 %)	0 (0.00 %)
569	Rubella virus (F-Therien 1993) GCF_000863025.1	2 (99.15 %)	69.60 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.85 %)	n/a	54 (9.70 %)	1 (98.66 %)
570	Rubella virus (RVi/Bismarck.ND.USA/23.08/2B 2023) GCF_024749945.1	2 (97.77 %)	69.96 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.29 %)	3 (0.97 %)	54 (9.60 %)	1 (98.93 %)
571	Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005) GCF_000866785.1	1 (94.09 %)	49.75 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.35 %)	1 (3.05 %)
572	Salivirus A (02394-01 2009) GCF_000885035.1	1 (89.05 %)	56.70 (99.95 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.51 %)	n/a	14 (3.28 %)	3 (36.06 %)
573	Salivirus FHB (SaliV-FHB 2014) GCF_000926235.1	1 (88.75 %)	57.26 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.35 %)	1 (0.38 %)	13 (1.96 %)	2 (63.43 %)
574	Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009) GCF_000886535.1	1 (89.26 %)	56.70 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (2.15 %)	2 (48.16 %)
575	San Miguel sea lion virus 8 (2014) GCF_000925155.1	3 (98.48 %)	51.28 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	3 (47.28 %)
576	Sandfly fever Naples virus (Toscana ISS.Phl.3 2004) GCF_000854285.1	4 (98.01 %)	44.60 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	13 (2.02 %)	0 (0.00 %)
577	sandfly fever Turkey virus (Izmir 19 2011) GCF_000891955.1	4 (93.98 %)	43.66 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (2.77 %)	0 (0.00 %)
578	Sapovirus (Hu/Dresden/pJG-Sap01/DE 2004) GCF_000854265.1	3 (98.76 %)	50.63 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.06 %)	1 (3.94 %)
579	Sapovirus (Hu/GI/Sapporo/MT-2010/1982 2023) GCF_008792745.1	3 (98.75 %)	50.70 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.09 %)	1 (5.79 %)
580	Sapovirus (Mc10 2004) GCF_000853825.1	2 (98.38 %)	51.46 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0.00 %)
581	Sapovirus C12 (C12 2004) GCF_000855765.1	2 (98.27 %)	51.73 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	2 (7.50 %)
582	Sapovirus Hu/Nagoya/NGY-1/2012/JPN (Hu/SaV/Nagoya/NGY-1/2012/JPN 2015) GCF_001008475.1	2 (98.47 %)	49.71 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.60 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
583	SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003) GCF_000864885.1	16 (97.60 %)	40.76 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.08 %)	n/a	18 (0.74 %)	0 (0.00 %)
584	Semliki Forest virus (1987) GCF_000860285.1	4 (96.64 %)	53.22 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.66 %)	n/a	4 (1.46 %)	1 (92.56 %)
585	Seoul orthohantavirus (80-39 2003) GCF_000855645.1	3 (93.29 %)	39.00 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.56 %)	n/a	14 (1.15 %)	0 (0.00 %)
586	Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (HNXH 2019) GCF_003087855.1	4 (98.45 %)	48.84 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	5 (0.39 %)	0 (0.00 %)
587	Sewage-associated gemycircularvirus-10a (BS3980 2015) GCF_000930855.1	4 (82.35 %)	52.52 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.02 %)	2 (76.08 %)
588	SFTS virus (HB29 2012) GCF_000897355.1	4 (96.58 %)	48.80 (99.91 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	2 (0.12 %)	0 (0.00 %)
589	Sheeppox virus (TU-V02127 2002) GCF_000840205.1	148 (93.28 %)	25.01 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	46 (1.32 %)	13 (0.59 %)	1,524 (24.28 %)	0 (0.00 %)
590	simian adenovirus 1 (ATCC VR-195 2005) GCF_000847325.1	42 (94.47 %)	55.21 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (0.98 %)	1 (0.08 %)	49 (2.50 %)	6 (69.90 %)
591	Simian foamy virus (1994) GCF_000848485.1	6 (78.31 %)	38.96 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.50 %)	n/a	7 (0.57 %)	0 (0.00 %)
592	Simian pegivirus (SPgVkrc SPgVkrc_RC08 2014) GCF_000921975.1	1 (91.31 %)	56.63 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.02 %)	3 (66.17 %)
593	Simian T-cell lymphotropic virus 6 (Cmo8699AB 2008) GCF_000881775.1	8 (76.72 %)	51.89 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.79 %)	n/a	9 (1.53 %)	2 (8.06 %)
594	Simian T-lymphotropic virus 2 (PP1664 STLV-2PP1664 2000) GCF_000860005.1	13 (80.53 %)	54.76 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (3.20 %)	2 (8.40 %)
595	Sindbis virus (1993) GCF_000860545.1	5 (100.00 %)	50.91 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.34 %)	n/a	3 (0.28 %)	1 (93.38 %)
596	Singapore grouper iridovirus (2004) GCF_000846905.1	162 (89.23 %)	48.64 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.23 %)	26 (2.80 %)	285 (4.52 %)	1 (0.16 %)
597	Sinu virus (CoB 38d 2023) GCF_023157055.1	6 (93.02 %)	32.86 (99.93 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	42 (4.53 %)	0 (0.00 %)
598	Small anellovirus 1 (2005) GCF_000859305.1	3 (93.20 %)	38.22 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.67 %)	10 (8.23 %)	0 (0.00 %)
599	Small anellovirus 2 (2005) GCF_000860145.1	5 (91.76 %)	39.54 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.76 %)	n/a	4 (5.35 %)	0 (0.00 %)
600	smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993) GCF_000859885.1	197 (87.60 %)	32.73 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	31 (0.69 %)	7 (0.57 %)	1,031 (9.09 %)	0 (0.00 %)
601	Snowshoe hare virus (2021) GCF_004789895.1	4 (96.87 %)	37.25 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.83 %)	n/a	15 (1.23 %)	0 (0.00 %)
602	Soldado virus (TRVL 52214 2023) GCF_014883305.1	3 (95.70 %)	37.14 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.28 %)	1 (1.67 %)	45 (3.44 %)	0 (0.00 %)
603	Songling virus (HLJ1202 2023) GCF_029888075.1	3 (95.45 %)	48.99 (99.99 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.66 %)	5 (0.64 %)	15 (1.44 %)	0 (0.00 %)
604	Sosuga virus (2012 2014) GCF_000924495.1	7 (90.76 %)	42.38 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.47 %)	1 (0.26 %)	7 (0.73 %)	0 (0.00 %)
605	Staphylococcus phage 6ec (2014) GCF_000921075.1	144 (88.32 %)	29.29 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	34 (1.71 %)	10 (0.46 %)	603 (15.13 %)	0 (0.00 %)
606	Steller sea lion vesivirus (V1415 SSL2004-250F 2008) GCF_000879655.1	3 (97.56 %)	48.57 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.29 %)	10 (1.29 %)	3 (13.70 %)
607	STL polyomavirus (MA138 2013) GCF_000904055.1	8 (92.55 %)	36.63 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (2.91 %)	0 (0.00 %)
608	Suid alphaherpesvirus 1 (PRV-MdBio PRV-MdBio 2017) GCA_900230325.1	170 (86.10 %)	73.56 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	202 (7.85 %)	166 (7.32 %)	1,126 (32.56 %)	1 (99.40 %)
609	Tacheng Tick Virus 1 (TC253 2016) GCF_001755105.1	3 (90.86 %)	47.86 (99.97 %)	5 (0.03 %)	8 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.81 %)	1 (2.17 %)
610	Tamdy virus (XJ01 2019) GCA_014883335.1	3 (93.06 %)	45.18 (100.00 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.16 %)	n/a	23 (1.59 %)	0 (0.00 %)
611	Terrapene box turtle adintovirus (5272 2023) GCF_018547995.1	13 (88.29 %)	46.24 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.20 %)	n/a	53 (6.79 %)	2 (6.45 %)
612	Thailand tick thogotovirus (THOV/Boophilus sp./Thailand 2023) GCF_023156685.1	7 (97.28 %)	45.06 (99.92 %)	n/a	6 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	24 (2.75 %)	0 (0.00 %)
613	Thogotovirus thogotoense (SiAr 126 2004) GCF_000854245.1	7 (96.85 %)	48.02 (99.89 %)	1 (0.01 %)	6 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (1.95 %)	0 (0.00 %)
614	Thottapalayam virus (VRC 66412 2008) GCF_000879955.1	3 (94.84 %)	37.56 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.96 %)	4 (0.55 %)	9 (1.26 %)	0 (0.00 %)
615	Tibrovirus congo (BASV-1 2019) GCF_002815815.1	8 (98.64 %)	38.79 (99.98 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.34 %)	n/a	10 (1.48 %)	0 (0.00 %)
616	Tick-borne encephalitis virus (2000) GCF_000863125.1	1 (91.96 %)	53.78 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	1 (0.44 %)	7 (0.87 %)	2 (7.65 %)
617	Tick-borne encephalitis virus (Vasilchenko 2023) GCA_004788235.1	1 (93.76 %)	54.70 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.45 %)	4 (9.01 %)
618	Tomato mottle virus (Florida 2000) GCF_000837105.1	5 (57.20 %)	42.94 (99.90 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (2.22 %)	1 (4.02 %)
619	Torque teno midi virus 1 (MD1-032 2007) GCF_000870545.1	6 (73.90 %)	42.59 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.41 %)	2 (2.62 %)	15 (12.39 %)	1 (7.12 %)
620	Torque teno midi virus 10 (MDJN14 2018) GCF_002818685.1	6 (73.73 %)	43.50 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.31 %)	2 (2.83 %)	7 (8.63 %)	1 (14.83 %)
621	Torque teno midi virus 11 (MDJN47 2018) GCF_002818705.1	6 (73.86 %)	43.29 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.88 %)	1 (0.94 %)	12 (10.19 %)	1 (6.91 %)
622	Torque teno midi virus 12 (MDJN51 2018) GCF_002818725.1	6 (73.45 %)	41.70 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (8.35 %)	1 (1.88 %)	9 (9.88 %)	0 (0.00 %)
623	Torque teno midi virus 13 (MDJN69 2018) GCF_002818745.1	6 (73.78 %)	43.72 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.92 %)	1 (1.86 %)	13 (9.57 %)	1 (6.84 %)
624	Torque teno midi virus 14 (MDJN97 2018) GCF_002818765.1	6 (73.84 %)	42.73 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (6.42 %)	1 (1.86 %)	12 (9.12 %)	1 (6.86 %)
625	Torque teno midi virus 2 (MD2-013 2010) GCF_000887335.1	6 (73.90 %)	42.92 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.20 %)	1 (1.84 %)	9 (7.78 %)	1 (6.79 %)
626	Torque teno midi virus 3 (2PoSMA 2018) GCF_002818545.1	2 (89.86 %)	38.65 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.00 %)	n/a	4 (3.85 %)	0 (0.00 %)
627	Torque teno midi virus 4 (6PoSMA 2018) GCF_002818565.1	3 (89.24 %)	40.29 (99.84 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (5.99 %)	0 (0.00 %)
628	Torque teno midi virus 5 (MDJHem2 2018) GCF_002818585.1	6 (73.91 %)	42.62 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (6.45 %)	2 (2.87 %)	20 (11.94 %)	1 (6.89 %)
629	Torque teno midi virus 6 (MDJHem3-1 2018) GCF_002818605.1	6 (74.14 %)	43.04 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.60 %)	1 (1.88 %)	11 (10.54 %)	1 (6.91 %)
630	Torque teno midi virus 7 (MDJHem3-2 2018) GCF_002818625.1	6 (73.98 %)	42.35 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.69 %)	2 (2.82 %)	15 (9.38 %)	1 (6.91 %)
631	Torque teno midi virus 8 (MDJN1 2018) GCF_002818645.1	6 (73.75 %)	42.95 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (5.49 %)	1 (1.86 %)	9 (8.53 %)	1 (6.86 %)
632	Torque teno midi virus 9 (MDJN2 2018) GCF_002818665.1	6 (73.45 %)	42.48 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.02 %)	2 (3.17 %)	11 (10.13 %)	0 (0.00 %)
633	Torque teno mini virus (SHA 2023) GCF_018580825.1	3 (75.69 %)	38.19 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (9.48 %)	0 (0.00 %)
634	Torque teno mini virus 1 (TLMV-CBD279 2010) GCF_000887355.1	3 (74.96 %)	38.14 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.84 %)	10 (6.55 %)	0 (0.00 %)
635	Torque teno mini virus 10 (BNI-700620-G1-CSF 2023) GCF_018583595.1	4 (82.54 %)	37.16 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.87 %)	11 (9.75 %)	0 (0.00 %)
636	Torque teno mini virus 10 (BNI-700835-G3-CSF 2023) GCF_018583605.1	4 (81.01 %)	39.58 (99.86 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.75 %)	1 (2.78 %)	11 (7.15 %)	0 (0.00 %)
637	Torque teno mini virus 10 (LIL-y1 2018) GCF_002818445.1	4 (81.09 %)	38.93 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.53 %)	1 (3.67 %)	4 (7.86 %)	0 (0.00 %)
638	Torque teno mini virus 11 (LIL-y2 2018) GCF_002818465.1	3 (82.86 %)	38.33 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.51 %)	11 (6.30 %)	0 (0.00 %)
639	Torque teno mini virus 12 (LIL-y3 2018) GCF_002818485.1	4 (81.35 %)	39.11 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.96 %)	3 (2.27 %)	6 (11.23 %)	0 (0.00 %)
640	Torque teno mini virus 18 (222 2016) GCF_001661815.1	3 (74.46 %)	38.25 (99.89 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.82 %)	1 (2.89 %)	10 (8.67 %)	0 (0.00 %)
641	Torque teno mini virus 2 (TLMV-NLC023 2010) GCF_000888275.1	3 (73.96 %)	39.35 (100.00 %)	4 (0.14 %)	5 (99.86 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (5.39 %)	0 (0.00 %)
642	Torque teno mini virus 3 (TLMV-NLC026 2010) GCF_000887315.1	3 (75.17 %)	37.98 (99.93 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	3 (0.00 %)	3 (3.83 %)	22 (14.67 %)	0 (0.00 %)
643	Torque teno mini virus 4 (Pt-TTV8-II 2010) GCF_000888295.1	2 (76.45 %)	39.93 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.15 %)	n/a	9 (8.29 %)	0 (0.00 %)
644	Torque teno mini virus 5 (TGP96 2010) GCF_000888975.1	3 (75.79 %)	37.04 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.20 %)	1 (2.82 %)	6 (9.70 %)	0 (0.00 %)
645	Torque teno mini virus 6 (TLMV-CBD203 2010) GCF_000888315.1	3 (74.32 %)	37.34 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.62 %)	2 (3.31 %)	0 (0.00 %)
646	Torque teno mini virus 7 (TLMV-CLC156 2010) GCF_000888255.1	2 (74.00 %)	36.14 (99.93 %)	2 (0.07 %)	3 (99.93 %)	3 (0.00 %)	3 (3.90 %)	8 (13.25 %)	0 (0.00 %)
647	Torque teno mini virus 8 (PB4TL 2010) GCF_000887215.1	2 (76.15 %)	37.80 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.27 %)	8 (7.29 %)	0 (0.00 %)
648	Torque teno mini virus 9 (TLMV-CLC062 2000) GCF_000837005.1	3 (77.41 %)	38.42 (100.00 %)	3 (0.21 %)	4 (99.79 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (4.01 %)	0 (0.00 %)
649	Torque teno mini virus ALA22 (TTMV-ALA22 2014) GCF_000930495.1	3 (75.94 %)	38.28 (99.86 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.05 %)	n/a	11 (7.69 %)	0 (0.00 %)
650	Torque teno mini virus ALH8 (TTMV-ALH8 2014) GCF_000929855.1	2 (74.78 %)	38.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.19 %)	1 (2.73 %)	8 (8.09 %)	0 (0.00 %)
651	Torque teno virus (Human/Japan/KS025/2016 2023) GCF_018580895.1	3 (82.70 %)	36.62 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.17 %)	n/a	11 (8.58 %)	0 (0.00 %)
652	Torque teno virus 1 (VT416 1998) GCF_000857545.1	5 (70.74 %)	49.06 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.80 %)	n/a	17 (6.93 %)	2 (35.41 %)
653	Torque teno virus 10 (JT34F 2010) GCF_000887255.1	6 (71.49 %)	51.22 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.00 %)	n/a	5 (4.22 %)	2 (38.57 %)
654	Torque teno virus 13 (TCHN-A 2018) GCF_002818305.1	2 (76.54 %)	52.27 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.24 %)	0 (0.00 %)	2 (49.70 %)
655	Torque teno virus 17 (2019) GCF_002986165.1	n/a	49.83 (99.88 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.51 %)	1 (1.26 %)	3 (2.37 %)	1 (20.50 %)
656	Torque teno virus 18 (2019) GCF_002986195.1	n/a	52.78 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.44 %)	n/a	3 (0.81 %)	2 (29.67 %)
657	Torque teno virus 20 (2018) GCF_002818335.1	6 (83.33 %)	50.00 (99.88 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.79 %)	1 (1.27 %)	0 (0.00 %)	1 (20.90 %)
658	Torque teno virus 21 (TCHN-B 2018) GCF_002818355.1	2 (79.99 %)	45.33 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.54 %)	n/a	10 (3.87 %)	1 (20.27 %)
659	Torque teno virus 29 (TTVyon-KC009 2018) GCF_002818425.1	3 (68.19 %)	52.69 (99.97 %)	7 (0.19 %)	8 (99.81 %)	4 (0.95 %)	n/a	11 (3.81 %)	2 (36.04 %)
660	Torque teno virus 3 (HEL32 2010) GCF_000888935.1	10 (70.14 %)	51.35 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.72 %)	n/a	8 (4.06 %)	2 (36.13 %)
661	Torque teno virus 4 (Pt-TTV6 2010) GCF_000886355.1	2 (68.92 %)	53.55 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.92 %)	n/a	12 (7.51 %)	2 (37.05 %)
662	Torque teno virus 5 (TCHN-C1 2018) GCF_002818195.1	2 (67.73 %)	51.69 (99.88 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.27 %)	3 (0.74 %)	1 (20.04 %)
663	Torque teno virus 6 (KAV 2010) GCF_000888995.1	6 (70.15 %)	49.96 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.65 %)	n/a	4 (3.43 %)	2 (44.59 %)
664	Torque teno virus 7 (PMV 2010) GCF_000887275.1	3 (73.96 %)	48.41 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.14 %)	n/a	5 (1.61 %)	2 (24.36 %)
665	Torque teno virus 9 (BM1C 2018) GCF_002818245.1	1 (15.76 %)	46.54 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.74 %)	n/a	1 (0.23 %)	1 (22.88 %)
666	Toscana virus (181135-14 2017) GCA_031497085.1	2 (39.49 %)	44.69 (99.94 %)	13 (0.12 %)	16 (99.88 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.06 %)	0 (0.00 %)
667	Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus (2010) GCF_000887495.1	6 (85.68 %)	40.08 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.92 %)	0 (0.00 %)
668	TTV-like mini virus (D11 2023) GCF_018580215.1	3 (75.99 %)	36.75 (99.89 %)	10 (0.42 %)	11 (99.58 %)	3 (0.00 %)	1 (1.89 %)	11 (8.38 %)	0 (0.00 %)
669	TTV-like mini virus (Emory1 2023) GCF_018580655.1	3 (76.93 %)	37.31 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (5.05 %)	0 (0.00 %)
670	TTV-like mini virus (Emory2 2023) GCF_018580665.1	3 (82.23 %)	36.35 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (3.40 %)	0 (0.00 %)
671	TTV-like mini virus (TTMV_LY1 2013) GCF_000905335.1	3 (75.48 %)	38.63 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.72 %)	2 (2.71 %)	7 (9.51 %)	0 (0.00 %)
672	TTV-like mini virus (TTMV_LY3 2023) GCF_018580125.1	3 (73.76 %)	39.86 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (4.43 %)	6 (7.51 %)	0 (0.00 %)
673	TTV-like mini virus (vzttmv4 2023) GCF_018584815.1	3 (82.18 %)	38.42 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.79 %)	4 (4.88 %)	0 (0.00 %)
674	TTV-like mini virus (zhenjiang 2023) GCF_018580875.1	3 (75.71 %)	37.86 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.65 %)	7 (6.22 %)	0 (0.00 %)
675	Tulane virus (2019) GCF_004786795.1	3 (98.38 %)	46.66 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.21 %)	0 (0.00 %)
676	Tupaia hepatovirus A (TN1 2016) GCF_001502175.1	1 (90.12 %)	39.41 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.63 %)	n/a	2 (0.97 %)	0 (0.00 %)
677	Turkey calicivirus (L11043 2019) GCF_004786995.1	2 (98.47 %)	50.01 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	2 (7.99 %)
678	Turkey herpesvirus (FC126 Burmester 2001) GCF_000839725.1	84 (78.98 %)	47.56 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (0.36 %)	14 (1.60 %)	256 (2.38 %)	0 (0.00 %)
679	Upolu virus (2023) GCF_023156825.1	6 (94.48 %)	42.76 (99.92 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	26 (2.56 %)	0 (0.00 %)
680	Uukuniemi virus (2003) GCF_000851865.1	4 (96.08 %)	47.69 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.86 %)	0 (0.00 %)
681	Vaccinia virus (VACV_li 2020) GCA_010978085.1	235 (89.55 %)	33.43 (99.90 %)	2 (0.10 %)	3 (99.90 %)	20 (0.42 %)	6 (0.38 %)	1,065 (8.83 %)	0 (0.00 %)
682	Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005) GCF_000860085.1	223 (88.80 %)	33.34 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	26 (0.57 %)	10 (3.43 %)	744 (9.15 %)	0 (0.00 %)
683	Varicella-zoster virus (Dumas 1987) GCF_000858285.1	74 (89.36 %)	46.02 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	14 (0.32 %)	17 (0.92 %)	421 (5.39 %)	1 (0.20 %)
684	Variegated bornavirus 1 (squirrel brain 2016) GCF_001698295.1	6 (99.17 %)	42.84 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.16 %)	0 (0.00 %)
685	Venezuelan equine encephalitis virus (1993) GCF_000862105.1	6 (100.00 %)	50.12 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	1 (0.30 %)	6 (1.47 %)	4 (15.75 %)
686	Venezuelan equine encephalitis virus (Trinidad donkey donkey/Trinidad/1943 2023) GCF_002889695.1	4 (100.00 %)	49.79 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.51 %)	1 (0.30 %)	6 (1.28 %)	4 (12.87 %)
687	Vesicular exanthema of swine virus (2000) GCF_000847705.1	3 (97.55 %)	47.83 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.86 %)	1 (3.04 %)
688	Vesicular stomatitis Alagoas virus (Indiana 3 2014) GCF_000924515.1	6 (99.38 %)	42.58 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.36 %)	n/a	12 (0.94 %)	0 (0.00 %)
689	Vesicular stomatitis Indiana virus (1993) GCF_000850045.1	4 (91.34 %)	41.74 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.60 %)	0 (0.00 %)
690	Vesicular stomatitis Indiana virus (98COE 2018) GCF_002815995.1	6 (99.37 %)	41.75 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	5 (0.31 %)	0 (0.00 %)
691	Vesicular stomatitis New Jersey virus (NJ1184HDB 2014) GCF_000923855.1	6 (95.91 %)	39.89 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	19 (1.57 %)	0 (0.00 %)
692	vesivirus (Hom-1 2017) GCF_002118765.1	3 (97.57 %)	48.33 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.10 %)	1 (3.05 %)
693	Vesivirus ferret badger/JX12/China/2012 (FBCV-JX12 2015) GCF_001019935.1	3 (98.23 %)	45.18 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	0 (0.00 %)
694	virus (MSSI2.225 ms23.49 2014) GCF_000923355.1	3 (85.39 %)	51.80 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.31 %)	1 (70.83 %)
695	Walrus calicivirus (2003) GCF_000852525.1	3 (97.71 %)	48.23 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.49 %)	3 (9.51 %)
696	Wenling frogfish filovirus (XYHYS28627 2021) GCF_004788975.1	10 (92.19 %)	49.85 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	3 (0.17 %)	1 (1.26 %)
697	Wenling thamnaconus septentrionalis filovirus (LQMMTII17328 2021) GCF_004788995.1	6 (91.55 %)	47.74 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.22 %)	n/a	6 (0.57 %)	0 (0.00 %)
698	Wesselsbron virus (SAH177 2009) GCF_000883915.1	1 (94.49 %)	47.65 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.37 %)	0 (0.00 %)
699	West Nile virus (956 1993) GCF_000861085.1	3 (93.90 %)	51.06 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	3 (7.47 %)
700	West Nile virus (NY99 385-99 2007) GCF_000875385.1	5 (93.41 %)	51.17 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.07 %)	1 (2.23 %)
701	Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000) GCF_000850885.1	4 (96.79 %)	49.21 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.64 %)	3 (52.96 %)
702	Western equine encephalitis virus (AG80-646 2023) GCF_002889215.1	2 (96.04 %)	48.32 (99.98 %)	8 (0.07 %)	9 (99.93 %)	4 (0.29 %)	n/a	5 (1.46 %)	3 (7.08 %)
703	WU Polyomavirus (B0 2007) GCF_000870785.1	6 (85.79 %)	39.18 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.03 %)	1 (0.71 %)	16 (3.46 %)	0 (0.00 %)
704	Yaba monkey tumor virus (2003) GCF_000845705.1	140 (94.29 %)	29.83 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.67 %)	6 (0.47 %)	1,223 (18.16 %)	0 (0.00 %)
705	Yaba-like disease virus (2001) GCF_000847185.1	152 (95.76 %)	27.00 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	39 (1.06 %)	10 (0.44 %)	1,396 (21.09 %)	0 (0.00 %)
706	Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986) GCF_000857725.1	1 (100.00 %)	49.72 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	1 (0.28 %)	0 (0.00 %)
707	Yezo virus (HH003-2020 2023) GCF_029888495.1	3 (95.97 %)	45.30 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (1.09 %)	0 (0.00 %)
708	Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999) GCF_000848505.1	11 (95.31 %)	41.07 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	4 (0.15 %)	1 (1.12 %)
709	Zika virus (MR 766 2009) GCF_000882815.3	1 (95.05 %)	50.95 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.26 %)	0 (0.00 %)
710	Zika virus (Natal RGN 2017) GCF_002366285.1	1 (95.04 %)	51.26 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.18 %)	0 (0.00 %)
TOTALS:	total assembly count 710

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	601 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	690 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	442 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	500 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	324 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1360 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	341 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	947 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	710 assemblies	assembly stats	track stats
Archaea	757 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	21315 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	686 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	464 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	1633 assemblies	assembly stats	track stats

Viral Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links