Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub access, assembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1		 n/a 15,735
(2.44 %)		 50,184
(6.16 %)		 n/a 40.90
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 203
(100.00 %)		 1,781,283
(37.65 %)		 444,047
(7.93 %)		 4,765,080
(37.01 %)		 39,918
(2.01 %)
2 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1		 54,226
(11.15 %)		 13,427
(2.67 %)		 46,903
(5.94 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 144
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 1,200,994
(30.62 %)		 143,062
(2.20 %)		 3,921,676
(38.03 %)		 67,978
(8.92 %)
3 allis shad
GCF_017589495.1		 48,507
(8.47 %)		 15,371
(2.28 %)		 58,686
(5.84 %)		 n/a 42.99
(99.91 %)		 1,541
(0.09 %)		 1,095
(100.00 %)		 1,190,406
(9.30 %)		 1,205,679
(11.28 %)		 3,960,328
(38.81 %)		 36,494
(1.83 %)
4 Amazon molly
GCF_000485575.1		 56,958
(11.69 %)		 15,117
(2.64 %)		 30,114
(6.60 %)		 n/a 39.16
(95.38 %)		 36,429
(4.64 %)		 31,058
(95.36 %)		 346,461
(2.03 %)		 188,557
(1.44 %)		 5,139,633
(26.01 %)		 35,229
(1.82 %)
5 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1		 47,198
(13.10 %)		 15,500
(3.14 %)		 41,230
(6.67 %)		 n/a 40.79
(99.99 %)		 150
(0.01 %)		 31
(100.00 %)		 1,230,524
(26.57 %)		 398,694
(5.41 %)		 4,106,609
(25.60 %)		 15,656
(0.99 %)
6 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1		 n/a 15,901
(2.25 %)		 61,133
(6.37 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,411
(100.00 %)		 2,043,181
(23.64 %)		 1,141,539
(11.35 %)		 3,668,314
(38.60 %)		 40,218
(2.14 %)
7 American shad (fAloSap1 primary hap 2021)
GCF_018492685.1		 70,400
(9.39 %)		 16,145
(2.29 %)		 60,087
(6.26 %)		 76,974
(8.55 %)		 43.18
(99.45 %)		 1,639
(0.55 %)		 74
(100.00 %)		 1,297,174
(9.39 %)		 1,245,221
(12.59 %)		 3,857,267
(39.43 %)		 42,699
(2.23 %)
8 Andian cavefish (hap1 2023)
GCF_030014385.1		 42,881
(5.97 %)		 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
9 annual killifish
GCF_001266775.1		 38,517
(8.87 %)		 14,027
(2.45 %)		 27,798
(5.86 %)		 n/a 39.29
(80.23 %)		 1,025,519
(19.94 %)		 168,368
(80.17 %)		 349,927
(2.63 %)		 296,826
(3.18 %)		 5,039,517
(28.69 %)		 26,364
(1.18 %)
10 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1		 n/a 16,678
(0.56 %)		 151,361
(4.03 %)		 n/a 44.57
(99.91 %)		 15,113
(0.09 %)		 5,983
(100.00 %)		 12,251,532
(51.73 %)		 3,521,157
(17.69 %)		 10,051,020
(68.37 %)		 494,595
(10.52 %)
11 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1		 n/a 17,318
(1.49 %)		 80,097
(5.79 %)		 n/a 43.49
(100.00 %)		 n/a 11,436
(100.00 %)		 5,482,467
(36.71 %)		 1,454,729
(18.84 %)		 6,756,226
(47.56 %)		 92,057
(3.50 %)
12 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1		 n/a 17,342
(1.44 %)		 78,914
(5.48 %)		 n/a 43.57
(99.96 %)		 3,179
(0.04 %)		 1,901
(100.00 %)		 5,980,457
(37.18 %)		 1,633,782
(21.76 %)		 6,279,725
(52.83 %)		 104,688
(3.57 %)
13 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1		 n/a 14,859
(1.97 %)		 60,431
(5.73 %)		 n/a 41.82
(99.99 %)		 1,039
(0.01 %)		 1,541
(100.00 %)		 461,253
(3.08 %)		 434,124
(6.81 %)		 3,499,945
(42.99 %)		 60,941
(3.20 %)
14 Arctic char
GCF_002910315.2		 67,196
(4.99 %)		 23,967
(1.55 %)		 45,775
(3.69 %)		 n/a 43.16
(93.25 %)		 1,718,015
(6.84 %)		 16,700
(99.99 %)		 1,011,348
(4.06 %)		 1,666,148
(10.50 %)		 10,597,529
(44.77 %)		 76,282
(1.94 %)
15 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1		 n/a 22,376
(1.44 %)		 97,559
(4.71 %)		 n/a 43.37
(99.97 %)		 3,235
(0.03 %)		 4,404
(99.97 %)		 999,920
(4.22 %)		 1,630,911
(26.08 %)		 7,875,105
(58.08 %)		 70,947
(2.59 %)
16 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1		 n/a 14,032
(2.44 %)		 39,770
(4.92 %)		 n/a 38.85
(100.00 %)		 n/a 7,617
(100.00 %)		 1,808,149
(37.98 %)		 583,449
(10.56 %)		 4,203,368
(40.67 %)		 24,867
(2.06 %)
17 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1		 n/a 15,455
(2.53 %)		 40,077
(4.90 %)		 86,346
(8.45 %)		 38.90
(99.98 %)		 795
(0.02 %)		 241
(100.00 %)		 2,045,691
(38.70 %)		 669,975
(11.72 %)		 4,638,765
(42.07 %)		 28,277
(1.93 %)
18 Arkansas darter
GCF_013103735.1		 51,282
(9.79 %)		 14,588
(2.90 %)		 42,306
(6.27 %)		 n/a 40.52
(99.50 %)		 35,052
(0.52 %)		 4,664
(100.00 %)		 418,294
(3.29 %)		 331,380
(3.74 %)		 4,153,309
(26.60 %)		 15,489
(0.95 %)
19 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1		 n/a 17,862
(2.29 %)		 70,667
(5.50 %)		 n/a 40.01
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 2,876,989
(50.39 %)		 700,511
(9.88 %)		 5,977,913
(44.08 %)		 104,320
(8.02 %)
20 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1		 n/a 18,025
(2.28 %)		 71,255
(5.50 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 318
(0.00 %)		 341
(100.00 %)		 2,884,301
(50.42 %)		 702,464
(9.98 %)		 5,989,299
(44.18 %)		 105,945
(8.03 %)
21 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1		 50,315
(9.13 %)		 16,526
(2.73 %)		 38,780
(6.64 %)		 72,662
(8.52 %)		 44.16
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 72
(100.00 %)		 504,673
(3.06 %)		 216,136
(1.69 %)		 4,323,242
(26.50 %)		 88,517
(10.73 %)
22 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2		 n/a 16,053
(2.73 %)		 74,777
(7.26 %)		 n/a 44.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,006
(100.00 %)		 482,351
(3.03 %)		 207,018
(1.68 %)		 4,139,370
(26.26 %)		 85,546
(10.82 %)
23 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1		 51,017
(10.40 %)		 15,549
(2.60 %)		 42,858
(5.39 %)		 n/a 39.70
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,718,992
(31.80 %)		 749,009
(14.09 %)		 4,206,758
(37.30 %)		 19,230
(1.16 %)
24 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCA_963924715.1		 n/a 15,722
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 120
(100.00 %)		 1,608,686
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,115
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
25 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCF_963924715.1		 54,426
(12.09 %)		 15,720
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 119
(100.00 %)		 1,608,682
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,078
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
26 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1		 51,642
(11.92 %)		 14,055
(2.62 %)		 36,761
(8.42 %)		 68,438
(9.50 %)		 45.64
(96.48 %)		 1,216
(3.52 %)		 227
(100.00 %)		 790,946
(10.54 %)		 855,327
(13.06 %)		 2,851,161
(33.38 %)		 97,133
(7.82 %)
27 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1		 n/a 13,366
(2.68 %)		 66,599
(9.29 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,592
(100.00 %)		 696,727
(10.13 %)		 749,876
(13.00 %)		 2,554,769
(33.77 %)		 87,167
(8.03 %)
28 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1		 52,130
(11.46 %)		 14,961
(3.19 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,662
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,321
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,981
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
29 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1		 n/a 16,554
(3.01 %)		 54,832
(7.45 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 4,053
(100.00 %)		 494,008
(4.23 %)		 299,066
(3.87 %)		 4,272,649
(24.46 %)		 36,868
(2.33 %)
30 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2		 50,946
(10.35 %)		 16,394
(2.60 %)		 61,637
(7.20 %)		 n/a 44.16
(99.89 %)		 1,990
(0.11 %)		 3,687
(99.89 %)		 1,269,688
(11.71 %)		 1,318,661
(13.43 %)		 3,732,801
(32.49 %)		 35,959
(1.97 %)
31 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2		 n/a 15,331
(2.42 %)		 52,370
(6.91 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 74
(0.00 %)		 1,049
(100.00 %)		 1,454,631
(18.29 %)		 383,946
(4.34 %)		 4,363,016
(32.69 %)		 56,416
(3.08 %)
32 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2		 n/a 15,262
(2.42 %)		 51,857
(6.86 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 153
(100.00 %)		 1,454,219
(18.25 %)		 384,609
(4.72 %)		 4,338,083
(32.80 %)		 56,553
(3.08 %)
33 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCA_963691925.1		 n/a 15,291
(2.56 %)		 43,206
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 666
(100.00 %)		 1,496,244
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,761
(29.92 %)		 13,309
(0.75 %)
34 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCF_963691925.1		 34,357
(8.10 %)		 15,289
(2.56 %)		 43,205
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 665
(100.00 %)		 1,496,240
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,726
(29.93 %)		 13,308
(0.75 %)
35 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1		 112,906
(5.61 %)		 28,077
(1.40 %)		 115,207
(3.75 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 1,300,611
(4.84 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
36 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1		 109,794
(5.45 %)		 26,968
(1.35 %)		 202,772
(19.11 %)		 n/a 43.10
(88.27 %)		 138,207
(11.73 %)		 241,570
(99.97 %)		 1,628,119
(9.46 %)		 2,496,917
(19.18 %)		 10,390,780
(51.80 %)		 79,791
(1.60 %)
37 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1		 60,214
(14.44 %)		 14,860
(3.40 %)		 50,921
(8.07 %)		 76,242
(9.93 %)		 43.38
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 449,865
(5.00 %)		 299,255
(7.03 %)		 3,274,219
(25.77 %)		 67,338
(7.00 %)
38 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1		 42,362
(9.30 %)		 16,129
(2.44 %)		 33,854
(5.87 %)		 n/a 40.89
(99.98 %)		 257
(0.02 %)		 13,466
(100.00 %)		 503,078
(3.93 %)		 321,407
(5.60 %)		 4,329,412
(30.36 %)		 21,221
(1.07 %)
39 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1		 n/a 15,142
(2.66 %)		 43,601
(6.21 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,221,802
(30.10 %)		 290,738
(7.79 %)		 4,164,845
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
40 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1		 48,592
(12.09 %)		 15,140
(2.66 %)		 43,304
(6.14 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 946
(99.98 %)		 1,221,797
(30.10 %)		 290,736
(7.79 %)		 4,164,799
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
41 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1		 n/a 15,211
(3.23 %)		 41,620
(7.14 %)		 n/a 41.08
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,393
(100.00 %)		 785,178
(17.57 %)		 249,148
(8.36 %)		 3,391,653
(26.49 %)		 13,787
(0.93 %)
42 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1		 42,399
(11.11 %)		 15,310
(3.17 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 463,524
(3.35 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
43 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1		 n/a 15,122
(1.44 %)		 65,809
(4.50 %)		 n/a 41.23
(99.74 %)		 293
(0.26 %)		 331
(100.00 %)		 2,545,429
(50.53 %)		 451,939
(5.50 %)		 5,807,705
(42.18 %)		 94,695
(3.92 %)
44 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1		 n/a 15,024
(1.45 %)		 65,141
(4.53 %)		 n/a 41.23
(99.52 %)		 373
(0.48 %)		 196
(100.00 %)		 2,509,508
(50.53 %)		 441,892
(5.11 %)		 6,245,443
(38.22 %)		 93,198
(3.82 %)
45 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1		 n/a 26,794
(3.15 %)		 76,434
(5.64 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 8,035
(100.00 %)		 4,084,361
(52.18 %)		 538,411
(4.25 %)		 7,659,980
(38.94 %)		 58,008
(2.90 %)
46 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1		 n/a 31,876
(3.30 %)		 85,063
(5.65 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 4,839,533
(52.47 %)		 646,636
(4.57 %)		 8,240,279
(42.13 %)		 71,384
(3.04 %)
47 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2		 53,646
(13.68 %)		 16,073
(3.06 %)		 44,214
(6.63 %)		 n/a 40.76
(98.88 %)		 674
(1.12 %)		 2,997
(100.00 %)		 986,469
(19.78 %)		 237,272
(4.32 %)		 3,983,840
(23.58 %)		 16,237
(1.03 %)
48 bicolor damselfish
GCF_000690725.1		 32,951
(8.67 %)		 15,181
(2.55 %)		 31,420
(5.94 %)		 n/a 41.66
(93.68 %)		 44,409
(6.34 %)		 42,059
(93.66 %)		 351,453
(2.61 %)		 180,113
(1.20 %)		 5,016,154
(23.41 %)		 46,423
(2.30 %)
49 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1		 n/a 14,534
(2.11 %)		 56,906
(6.41 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 n/a 3,523
(100.00 %)		 2,445,373
(45.07 %)		 452,878
(9.46 %)		 4,195,077
(39.49 %)		 77,592
(4.86 %)
50 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1		 n/a 14,455
(2.06 %)		 56,488
(6.31 %)		 n/a 42.10
(99.99 %)		 636
(0.01 %)		 298
(100.00 %)		 3,230,397
(55.09 %)		 494,440
(10.43 %)		 4,359,169
(40.46 %)		 81,684
(4.81 %)
51 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1		 n/a 31,847
(2.01 %)		 153,565
(6.53 %)		 n/a 41.78
(99.99 %)		 639
(0.00 %)		 63,422
(100.00 %)		 2,786,840
(18.28 %)		 1,016,389
(7.50 %)		 8,844,631
(26.90 %)		 130,556
(4.42 %)
52 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022)
GCA_022577435.1		 n/a 14,991
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,017,149
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,526
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
53 black rockcod
GCF_000735185.1		 35,176
(8.54 %)		 12,601
(2.15 %)		 42,589
(6.13 %)		 n/a 40.62
(97.93 %)		 59,164
(2.09 %)		 72,571
(97.92 %)		 268,591
(2.71 %)		 238,334
(3.18 %)		 3,425,479
(29.48 %)		 31,009
(2.11 %)
54 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1		 43,392
(8.45 %)		 15,522
(2.13 %)		 48,255
(5.50 %)		 n/a 38.69
(100.00 %)		 341
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 1,651,919
(22.26 %)		 782,601
(7.55 %)		 5,398,047
(38.87 %)		 24,508
(1.19 %)
55 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1		 n/a 15,274
(2.92 %)		 51,453
(7.45 %)		 n/a 43.07
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,239,364
(29.69 %)		 354,703
(9.63 %)		 3,006,556
(30.35 %)		 53,503
(4.48 %)
56 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1		 n/a 15,043
(2.96 %)		 50,860
(7.54 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 366
(0.01 %)		 109
(100.00 %)		 1,210,142
(29.44 %)		 340,820
(9.19 %)		 2,986,750
(29.89 %)		 52,010
(4.20 %)
57 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1		 44,847
(11.30 %)		 15,364
(2.86 %)		 51,122
(6.88 %)		 n/a 39.48
(99.99 %)		 89
(0.01 %)		 415
(100.00 %)		 1,160,519
(28.33 %)		 183,082
(4.75 %)		 4,354,804
(27.83 %)		 40,207
(2.97 %)
58 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1		 n/a 17,403
(2.99 %)		 45,903
(5.38 %)		 n/a 38.64
(99.99 %)		 709
(0.01 %)		 673
(100.00 %)		 2,141,901
(35.77 %)		 482,931
(17.18 %)		 4,297,133
(46.82 %)		 41,889
(2.32 %)
59 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1		 n/a 17,486
(2.97 %)		 46,833
(5.41 %)		 n/a 38.79
(99.99 %)		 720
(0.01 %)		 413
(100.00 %)		 2,165,269
(36.18 %)		 490,692
(17.84 %)		 4,251,333
(47.54 %)		 42,744
(2.37 %)
60 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1		 48,916
(10.27 %)		 15,574
(2.62 %)		 44,035
(5.21 %)		 n/a 39.80
(98.04 %)		 171
(1.96 %)		 43
(100.00 %)		 2,180,806
(45.14 %)		 625,260
(6.63 %)		 5,137,199
(35.52 %)		 31,164
(1.89 %)
61 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1		 36,881
(7.40 %)		 15,408
(2.38 %)		 27,235
(5.59 %)		 n/a 40.42
(89.87 %)		 53,539
(10.15 %)		 12,952
(100.00 %)		 867,639
(16.39 %)		 195,137
(1.62 %)		 5,293,484
(23.10 %)		 21,238
(1.02 %)
62 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1		 57,860
(9.04 %)		 15,494
(1.98 %)		 57,878
(5.63 %)		 56,939
(8.11 %)		 40.66
(99.97 %)		 723
(0.03 %)		 304
(100.00 %)		 1,055,724
(20.14 %)		 324,841
(3.27 %)		 5,000,753
(32.08 %)		 32,357
(1.59 %)
63 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1		 n/a 13,097
(2.93 %)		 55,097
(8.76 %)		 n/a 45.82
(99.88 %)		 3,055
(0.12 %)		 3,832
(100.00 %)		 1,337,604
(32.27 %)		 749,185
(17.27 %)		 2,363,606
(35.06 %)		 78,815
(8.25 %)
64 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1		 n/a 14,996
(2.68 %)		 44,244
(6.44 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 59
(100.00 %)		 1,619,681
(30.07 %)		 337,749
(4.31 %)		 4,541,709
(29.20 %)		 14,576
(0.85 %)
65 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1		 63,345
(14.83 %)		 14,387
(3.54 %)		 43,563
(7.96 %)		 n/a 41.68
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 842,739
(18.67 %)		 356,558
(12.86 %)		 2,720,911
(41.08 %)		 40,187
(4.66 %)
66 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1		 n/a 12,494
(1.93 %)		 44,967
(5.14 %)		 n/a 38.20
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,675
(100.00 %)		 608,174
(4.23 %)		 390,755
(4.71 %)		 4,977,071
(42.41 %)		 23,532
(1.46 %)
67 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2		 n/a 14,499
(1.97 %)		 51,213
(5.47 %)		 n/a 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 442
(100.00 %)		 731,731
(4.21 %)		 471,623
(4.92 %)		 5,974,055
(42.88 %)		 29,052
(1.48 %)
68 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1		 n/a 13,882
(2.27 %)		 45,919
(5.98 %)		 n/a 39.50
(99.99 %)		 45
(0.01 %)		 3,194
(100.00 %)		 803,073
(13.60 %)		 258,404
(4.19 %)		 4,674,614
(28.36 %)		 15,524
(1.02 %)
69 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 primary hap 2021)
GCF_017639745.1		 51,238
(8.77 %)		 15,174
(2.24 %)		 51,552
(6.21 %)		 n/a 39.65
(99.63 %)		 440
(0.37 %)		 93
(100.00 %)		 542,278
(3.15 %)		 303,669
(4.77 %)		 5,189,645
(29.11 %)		 18,525
(1.10 %)
70 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1		 n/a 16,964
(1.77 %)		 67,673
(5.93 %)		 n/a 42.61
(99.97 %)		 1,785
(0.03 %)		 979
(100.00 %)		 4,285,965
(30.73 %)		 1,222,431
(20.69 %)		 6,105,881
(46.99 %)		 73,543
(3.28 %)
71 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1		 n/a 12,424
(1.95 %)		 46,550
(6.00 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 4,619
(100.00 %)		 789,207
(14.61 %)		 348,482
(20.98 %)		 3,447,241
(38.72 %)		 27,035
(4.16 %)
72 bonti-bonti (fTelBon1 primary hap 2022)
GCA_933228915.1		 n/a 14,929
(1.93 %)		 55,343
(5.90 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,329
(0.03 %)		 146
(100.00 %)		 998,246
(14.90 %)		 443,155
(22.40 %)		 4,319,947
(40.01 %)		 34,018
(4.16 %)
73 bony fish N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1		 n/a 17,996
(2.00 %)		 89,591
(7.93 %)		 n/a 45.22
(99.94 %)		 3,299
(0.06 %)		 1,177
(100.00 %)		 2,828,457
(30.93 %)		 1,676,413
(19.87 %)		 4,137,400
(48.69 %)		 78,669
(4.37 %)
74 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1		 86,420
(8.25 %)		 22,100
(2.28 %)		 59,296
(4.66 %)		 n/a 38.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 3,555,303
(40.49 %)		 538,181
(9.64 %)		 6,137,303
(50.16 %)		 71,533
(4.06 %)
75 bony fish P.klunzingeri (RE-2024bhap1 2024)
GCA_042242105.1		 n/a 14,592
(2.84 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 442
(100.00 %)		 1,764,545
(30.13 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,092
(24.53 %)		 19,771
(1.39 %)
76 bony fish P.klunzingeri (RE-2024bhap2 2024)
GCA_042242125.1		 n/a 14,475
(2.89 %)		 44,413
(7.11 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 84
(100.00 %)		 1,762,151
(30.90 %)		 262,291
(5.80 %)		 3,580,461
(24.37 %)		 19,851
(1.40 %)
77 bony fish R.sp. 'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1		 n/a 15,501
(2.18 %)		 54,090
(6.20 %)		 n/a 41.17
(99.99 %)		 422
(0.01 %)		 82
(100.00 %)		 1,727,328
(38.16 %)		 259,351
(4.71 %)		 4,381,278
(33.25 %)		 35,281
(1.93 %)
78 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1		 43,278
(10.19 %)		 15,613
(2.96 %)		 39,340
(5.77 %)		 n/a 39.31
(99.98 %)		 291
(0.02 %)		 78
(100.00 %)		 1,563,305
(33.23 %)		 689,312
(9.96 %)		 3,954,578
(35.31 %)		 20,152
(1.50 %)
79 bowfin (hap1 2024)
GCA_036373705.1		 n/a 13,851
(1.83 %)		 27,058
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 953,497
(13.69 %)		 387,700
(7.91 %)		 4,552,410
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
80 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1		 n/a 17,999
(1.60 %)		 76,655
(5.58 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 10,799
(100.00 %)		 5,994,257
(39.29 %)		 1,126,685
(10.35 %)		 6,996,991
(46.02 %)		 71,016
(3.36 %)
81 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1		 n/a 17,865
(1.56 %)		 76,506
(5.59 %)		 n/a 42.15
(99.96 %)		 2,704
(0.04 %)		 676
(100.00 %)		 6,391,921
(39.62 %)		 1,227,487
(11.70 %)		 6,669,558
(49.73 %)		 76,828
(3.96 %)
82 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1		 49,639
(15.87 %)		 13,630
(3.98 %)		 43,263
(9.12 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 495
(100.00 %)		 727,223
(20.88 %)		 290,624
(20.53 %)		 1,369,709
(43.82 %)		 51,671
(14.43 %)
83 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1		 92,568
(6.87 %)		 26,875
(1.47 %)		 114,101
(4.26 %)		 n/a 43.70
(99.83 %)		 4,299
(0.17 %)		 2,721
(100.00 %)		 5,005,012
(52.10 %)		 2,055,293
(26.66 %)		 9,701,968
(57.04 %)		 89,897
(2.49 %)
84 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1		 49,205
(8.52 %)		 15,634
(1.92 %)		 53,710
(4.99 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 632,147
(3.01 %)		 371,482
(3.01 %)		 6,438,110
(31.32 %)		 26,136
(0.96 %)
85 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1		 47,805
(10.97 %)		 14,997
(2.72 %)		 25,504
(5.86 %)		 n/a 40.51
(84.10 %)		 61,073
(15.93 %)		 69,067
(84.07 %)		 311,174
(3.20 %)		 125,534
(0.72 %)		 4,461,288
(20.25 %)		 17,722
(0.91 %)
86 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1		 52,584
(12.38 %)		 15,229
(2.54 %)		 47,264
(5.92 %)		 n/a 40.68
(89.05 %)		 32,418
(10.97 %)		 7,421
(100.00 %)		 812,382
(17.52 %)		 158,486
(1.12 %)		 4,571,794
(23.61 %)		 22,763
(1.21 %)
87 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1		 n/a 15,228
(3.42 %)		 41,322
(7.36 %)		 n/a 41.47
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,592
(100.00 %)		 972,098
(18.43 %)		 155,031
(1.41 %)		 3,452,400
(21.36 %)		 15,255
(1.12 %)
88 butterfish (fScaArg1 primary hap 2021)
GCF_020382885.2		 52,828
(14.10 %)		 15,261
(3.43 %)		 40,580
(7.38 %)		 n/a 41.49
(99.70 %)		 77
(0.30 %)		 48
(100.00 %)		 413,775
(3.11 %)		 160,299
(1.55 %)		 3,420,994
(21.24 %)		 15,574
(1.13 %)
89 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1		 n/a 14,403
(2.47 %)		 61,860
(7.37 %)		 n/a 43.15
(99.96 %)		 1,625
(0.04 %)		 525
(100.00 %)		 959,651
(12.16 %)		 517,137
(13.14 %)		 3,775,081
(32.47 %)		 81,881
(6.68 %)
90 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1		 n/a 19,842
(2.16 %)		 72,007
(6.04 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 2,679
(0.02 %)		 15,877
(99.98 %)		 1,911,945
(24.70 %)		 364,933
(8.56 %)		 6,201,042
(32.00 %)		 39,114
(1.56 %)
91 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1		 n/a 15,277
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 1,369,186
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,065
(31.90 %)		 27,134
(1.64 %)
92 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1		 40,788
(11.04 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
93 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1		 n/a 15,980
(2.79 %)		 53,680
(6.62 %)		 n/a 40.96
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 11,565
(100.00 %)		 451,656
(4.76 %)		 321,158
(5.51 %)		 3,800,099
(26.83 %)		 20,338
(1.21 %)
94 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3		 59,187
(10.70 %)		 15,782
(2.57 %)		 45,562
(5.15 %)		 n/a 39.82
(99.35 %)		 100
(0.65 %)		 137
(100.00 %)		 2,257,240
(46.82 %)		 671,926
(8.67 %)		 5,043,664
(36.53 %)		 34,284
(2.16 %)
95 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1		 80,307
(5.31 %)		 27,171
(1.38 %)		 123,048
(4.00 %)		 n/a 44.12
(99.94 %)		 4,047
(0.06 %)		 18,306
(100.00 %)		 1,207,353
(5.23 %)		 2,779,869
(27.93 %)		 11,429,057
(55.56 %)		 83,137
(1.99 %)
96 chevron butterflyfish (hap1 2024)
GCA_039877785.1		 n/a 15,255
(2.94 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 49
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 465,710
(3.82 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,999
(23.28 %)		 30,971
(2.02 %)
97 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1		 n/a 15,116
(2.91 %)		 47,839
(7.01 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 463,848
(3.80 %)		 254,561
(4.23 %)		 3,654,295
(24.08 %)		 30,593
(1.99 %)
98 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1		 61,496
(12.33 %)		 15,296
(2.30 %)		 50,818
(6.10 %)		 n/a 40.92
(100.00 %)		 942
(0.00 %)		 823
(100.00 %)		 920,881
(19.96 %)		 193,629
(1.36 %)		 4,724,179
(28.98 %)		 28,565
(1.65 %)
99 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1		 48,058
(11.91 %)		 16,738
(3.72 %)		 46,295
(6.80 %)		 n/a 39.61
(98.56 %)		 9,510
(1.45 %)		 1,039
(100.00 %)		 1,469,931
(44.44 %)		 188,838
(2.34 %)		 3,624,116
(35.94 %)		 44,615
(5.01 %)
100 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1		 49,677
(9.64 %)		 15,266
(2.70 %)		 40,151
(5.21 %)		 n/a 38.75
(99.82 %)		 597
(0.18 %)		 286
(100.00 %)		 772,209
(6.45 %)		 630,039
(7.45 %)		 4,729,261
(37.48 %)		 24,310
(1.76 %)
101 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2		 89,005
(6.31 %)		 26,613
(1.64 %)		 77,184
(3.14 %)		 n/a 39.08
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 9,298,177
(59.91 %)		 977,119
(3.49 %)		 13,499,422
(52.38 %)		 100,309
(2.90 %)
102 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1		 81,340
(5.14 %)		 27,462
(1.53 %)		 54,538
(3.80 %)		 n/a 43.55
(97.26 %)		 272,151
(2.76 %)		 15,944
(99.99 %)		 1,207,194
(4.55 %)		 2,524,408
(13.75 %)		 12,127,831
(47.56 %)		 87,959
(2.02 %)
103 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1		 92,383
(5.73 %)		 26,372
(1.57 %)		 107,059
(4.12 %)		 157,582
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,334
(0.01 %)		 9,978
(99.99 %)		 1,483,168
(7.79 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,888
(54.54 %)		 62,726
(1.40 %)
104 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1		 n/a 15,165
(2.44 %)		 46,105
(6.16 %)		 n/a 39.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,163
(100.00 %)		 1,546,066
(27.08 %)		 537,737
(9.87 %)		 4,485,153
(30.70 %)		 14,774
(0.81 %)
105 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1		 34,390
(6.95 %)		 15,348
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 360
(100.00 %)		 1,669,322
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,373
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
106 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1		 76,338
(6.27 %)		 23,186
(1.70 %)		 90,881
(4.14 %)		 n/a 43.06
(95.36 %)		 242,238
(4.66 %)		 28,109
(99.98 %)		 1,143,292
(6.07 %)		 1,487,818
(12.14 %)		 8,992,314
(46.24 %)		 51,797
(1.25 %)
107 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1		 205,915
(6.68 %)		 26,582
(1.42 %)		 119,437
(4.14 %)		 120,379
(5.87 %)		 43.89
(99.99 %)		 3,433
(0.01 %)		 17,480
(99.99 %)		 1,160,500
(5.63 %)		 2,584,312
(31.72 %)		 10,621,107
(55.67 %)		 68,538
(1.53 %)
108 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1		 n/a 14,940
(3.51 %)		 39,688
(7.41 %)		 n/a 40.40
(99.61 %)		 36
(0.39 %)		 2,641
(100.00 %)		 307,993
(2.63 %)		 121,935
(1.79 %)		 3,190,928
(20.98 %)		 10,131
(0.86 %)
109 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 67,055
(11.68 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 633,883
(15.28 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,008
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
110 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1		 53,567
(9.24 %)		 15,685
(2.23 %)		 33,477
(5.63 %)		 n/a 39.47
(99.94 %)		 1,406
(0.06 %)		 6,405
(100.00 %)		 431,950
(2.92 %)		 381,394
(4.84 %)		 4,952,343
(31.95 %)		 23,543
(1.15 %)
111 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1		 53,912
(11.11 %)		 15,702
(2.37 %)		 47,805
(5.50 %)		 n/a 39.59
(99.98 %)		 1,454
(0.02 %)		 354
(100.00 %)		 1,346,903
(35.25 %)		 401,782
(5.36 %)		 4,891,035
(31.59 %)		 23,489
(1.28 %)
112 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2		 100,850
(6.58 %)		 27,072
(1.56 %)		 50,811
(3.95 %)		 125,873
(5.26 %)		 43.55
(99.98 %)		 5,631
(0.02 %)		 4,482
(100.00 %)		 1,491,966
(6.88 %)		 2,135,217
(25.52 %)		 10,152,659
(54.74 %)		 65,662
(1.36 %)
113 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1		 n/a 18,114
(2.63 %)		 66,549
(6.11 %)		 n/a 38.62
(99.99 %)		 685
(0.01 %)		 215
(100.00 %)		 2,639,968
(48.46 %)		 659,243
(7.55 %)		 5,950,358
(40.47 %)		 62,337
(3.61 %)
114 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1		 n/a 30,973
(3.47 %)		 83,657
(5.95 %)		 n/a 37.06
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 674
(100.00 %)		 3,324,121
(41.45 %)		 707,134
(4.72 %)		 8,110,561
(39.08 %)		 44,388
(1.60 %)
115 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1		 91,210
(7.89 %)		 31,041
(2.89 %)		 89,244
(5.01 %)		 n/a 37.11
(99.53 %)		 26,351
(0.48 %)		 6,701
(100.00 %)		 1,634,612
(6.00 %)		 919,239
(3.97 %)		 10,192,037
(38.56 %)		 52,638
(1.62 %)
116 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1		 36,211
(8.34 %)		 14,995
(2.62 %)		 50,844
(6.89 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 275
(0.01 %)		 338
(100.00 %)		 1,186,799
(32.17 %)		 307,864
(16.34 %)		 3,562,802
(35.00 %)		 41,657
(2.72 %)
117 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1		 60,947
(12.28 %)		 13,706
(2.67 %)		 42,956
(5.71 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 1,259
(100.00 %)		 1,417,848
(37.47 %)		 173,323
(3.85 %)		 3,968,694
(40.23 %)		 70,253
(6.29 %)
118 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1		 n/a 14,904
(2.99 %)		 43,194
(7.09 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 n/a 1,318
(100.00 %)		 1,128,080
(18.77 %)		 328,975
(8.35 %)		 3,952,898
(31.64 %)		 26,979
(2.08 %)
119 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1		 55,359
(12.02 %)		 14,844
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 242
(100.00 %)		 1,149,243
(19.12 %)		 342,238
(9.71 %)		 3,906,753
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
120 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1		 n/a 29,103
(1.36 %)		 124,287
(3.94 %)		 n/a 43.87
(99.96 %)		 5,995
(0.04 %)		 11,150
(100.00 %)		 1,655,140
(4.68 %)		 1,843,550
(17.63 %)		 9,367,555
(61.56 %)		 112,654
(3.84 %)
121 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1		 n/a 25,968
(1.48 %)		 104,922
(4.18 %)		 n/a 43.67
(99.96 %)		 4,689
(0.04 %)		 8,669
(99.96 %)		 1,320,339
(4.08 %)		 1,364,334
(15.61 %)		 7,674,742
(61.10 %)		 94,019
(3.82 %)
122 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1		 n/a 5,231
(0.27 %)		 47,644
(1.48 %)		 n/a 44.62
(99.99 %)		 144
(0.01 %)		 21,561
(99.99 %)		 2,803,873
(49.20 %)		 655,416
(2.69 %)		 7,558,550
(67.05 %)		 181,626
(10.52 %)
123 convict blenny (fPhoLeu1 primary hap 2021)
GCA_020510985.1		 n/a n/a 134,417
(1.50 %)		 n/a 44.52
(99.13 %)		 2,580
(0.87 %)		 512
(100.00 %)		 9,062,541
(49.33 %)		 2,097,650
(2.66 %)		 3,092
(99.13 %)		 568,042
(10.14 %)
124 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1		 n/a 13,622
(2.81 %)		 43,285
(6.93 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,125
(100.00 %)		 1,741,373
(32.89 %)		 182,926
(2.01 %)		 3,659,106
(21.68 %)		 27,693
(1.89 %)
125 copperband butterflyfish (fCheRos1 primary hap 2021)
GCF_017976325.1		 35,291
(10.46 %)		 15,210
(3.03 %)		 44,916
(6.99 %)		 61,755
(8.99 %)		 42.57
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 406,118
(2.95 %)		 199,450
(2.10 %)		 3,861,745
(21.57 %)		 29,106
(1.85 %)
126 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1		 n/a 14,740
(2.91 %)		 45,483
(7.26 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 1,379
(0.04 %)		 395
(100.00 %)		 936,676
(24.41 %)		 306,192
(9.29 %)		 3,495,456
(28.75 %)		 29,142
(2.35 %)
127 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1		 n/a 14,695
(2.68 %)		 51,799
(6.37 %)		 n/a 42.12
(100.00 %)		 n/a 2,080
(100.00 %)		 1,969,654
(37.02 %)		 663,295
(11.19 %)		 3,764,275
(45.19 %)		 67,226
(8.43 %)
128 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1		 n/a 4,509
(3.03 %)		 16,936
(7.22 %)		 n/a 38.67
(100.00 %)		 n/a 3,713
(100.00 %)		 430,197
(46.38 %)		 101,926
(7.54 %)		 1,077,239
(32.21 %)		 10,612
(4.11 %)
129 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1		 90,094
(6.75 %)		 29,386
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 3,481,382
(45.81 %)		 802,773
(6.54 %)		 8,190,783
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
130 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1		 51,190
(10.37 %)		 15,144
(2.59 %)		 43,207
(5.98 %)		 n/a 40.77
(99.98 %)		 570
(0.02 %)		 324
(100.00 %)		 1,435,625
(29.39 %)		 330,276
(12.54 %)		 4,196,830
(33.83 %)		 19,310
(1.01 %)
131 cunner (fRauAds1 primary hap 2021)
GCA_020745685.1		 n/a 15,192
(2.74 %)		 43,564
(6.38 %)		 n/a 41.31
(99.41 %)		 283
(0.59 %)		 64
(100.00 %)		 1,419,667
(30.50 %)		 243,024
(4.81 %)		 4,334,690
(27.65 %)		 17,974
(1.06 %)
132 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1		 n/a 14,861
(2.74 %)		 42,996
(6.34 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 31
(0.01 %)		 1,476
(100.00 %)		 1,373,727
(30.17 %)		 220,572
(4.38 %)		 4,176,936
(27.32 %)		 17,129
(1.04 %)
133 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1		 49,108
(12.72 %)		 16,501
(4.06 %)		 40,671
(7.11 %)		 n/a 38.77
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 1,213,719
(40.21 %)		 134,299
(3.43 %)		 3,676,403
(30.98 %)		 29,879
(3.18 %)
134 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1		 n/a 16,341
(3.18 %)		 41,545
(5.47 %)		 n/a 38.57
(98.69 %)		 8,366
(1.31 %)		 36,005
(98.69 %)		 300,659
(2.50 %)		 212,357
(6.15 %)		 4,267,143
(35.05 %)		 23,311
(2.18 %)
135 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1		 n/a 15,965
(3.73 %)		 37,421
(5.87 %)		 n/a 38.52
(94.12 %)		 18,487
(5.88 %)		 29,831
(94.12 %)		 251,333
(2.28 %)		 132,120
(1.41 %)		 4,061,554
(28.83 %)		 16,871
(1.57 %)
136 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1		 56,220
(7.59 %)		 15,422
(1.71 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 72
(100.00 %)		 369,606
(1.86 %)		 176,954
(1.87 %)		 6,142,638
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
137 delta smelt
GCF_021917145.1		 41,807
(14.97 %)		 14,549
(4.09 %)		 44,849
(9.74 %)		 n/a 44.99
(99.92 %)		 1,474
(0.08 %)		 376
(100.00 %)		 387,882
(5.57 %)		 383,522
(9.22 %)		 1,814,696
(32.48 %)		 28,299
(3.33 %)
138 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2		 n/a 14,119
(3.95 %)		 47,988
(8.57 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,972
(100.00 %)		 312,660
(2.77 %)		 160,575
(2.83 %)		 2,525,528
(27.70 %)		 50,830
(8.72 %)
139 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2		 n/a 16,559
(3.78 %)		 58,823
(8.66 %)		 74,128
(10.47 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 461
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,284
(4.61 %)		 2,948,738
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
140 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1		 n/a 16,788
(2.12 %)		 50,338
(4.68 %)		 n/a 41.27
(98.12 %)		 641
(1.88 %)		 182
(100.00 %)		 2,709,759
(34.74 %)		 798,364
(14.84 %)		 5,418,190
(36.02 %)		 30,055
(1.31 %)
141 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1		 n/a 16,799
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 104
(100.00 %)		 2,693,928
(34.60 %)		 805,807
(14.65 %)		 5,615,731
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
142 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2		 n/a 14,760
(4.56 %)		 56,353
(11.37 %)		 n/a 45.56
(99.97 %)		 1,033
(0.03 %)		 1,158
(100.00 %)		 292,029
(9.69 %)		 192,568
(5.53 %)		 1,623,924
(22.71 %)		 51,743
(9.31 %)
143 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1		 51,353
(12.50 %)		 13,736
(3.19 %)		 50,537
(7.64 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 213
(100.00 %)		 986,789
(36.30 %)		 235,862
(13.25 %)		 2,323,084
(41.85 %)		 68,121
(17.75 %)
144 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5		 n/a 15,552
(2.29 %)		 52,465
(6.26 %)		 86,437
(9.40 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 1,309,350
(35.93 %)		 217,916
(1.89 %)		 4,547,434
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
145 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1		 n/a 12,020
(3.63 %)		 38,881
(7.31 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 n/a 2,629
(100.00 %)		 429,509
(7.66 %)		 432,260
(11.41 %)		 2,049,609
(24.32 %)		 35,597
(4.37 %)
146 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1		 48,958
(12.10 %)		 15,950
(3.66 %)		 48,976
(7.25 %)		 54,541
(8.42 %)		 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 89
(100.00 %)		 567,625
(7.41 %)		 564,286
(10.86 %)		 2,935,360
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
147 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1		 40,618
(11.48 %)		 15,837
(3.85 %)		 23,074
(6.63 %)		 n/a 42.56
(96.95 %)		 119,361
(3.09 %)		 8,786
(100.00 %)		 519,014
(5.41 %)		 516,718
(6.65 %)		 3,020,801
(21.49 %)		 41,947
(3.71 %)
148 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1		 82,153
(9.98 %)		 16,513
(2.13 %)		 79,047
(6.37 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 234
(0.01 %)		 1,425
(100.00 %)		 923,543
(11.79 %)		 425,650
(9.45 %)		 3,525,237
(34.97 %)		 91,552
(5.39 %)
149 emerald rockcod
GCF_902827165.1		 44,179
(8.48 %)		 15,275
(2.20 %)		 57,830
(6.43 %)		 63,731
(6.65 %)		 40.94
(99.99 %)		 932
(0.01 %)		 864
(100.00 %)		 460,185
(3.64 %)		 399,729
(6.87 %)		 3,533,188
(40.09 %)		 52,191
(2.51 %)
150 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1		 n/a 17,920
(3.03 %)		 59,697
(6.61 %)		 n/a 39.13
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 4,949
(100.00 %)		 2,285,870
(44.17 %)		 480,649
(10.13 %)		 4,833,803
(39.56 %)		 57,737
(4.15 %)
151 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1		 n/a 17,661
(3.01 %)		 58,218
(6.54 %)		 n/a 39.21
(99.98 %)		 881
(0.02 %)		 125
(100.00 %)		 2,346,939
(44.27 %)		 502,415
(11.23 %)		 4,890,830
(40.45 %)		 60,482
(4.22 %)
152 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1		 48,154
(5.87 %)		 15,415
(1.33 %)		 77,712
(5.08 %)		 n/a 44.45
(99.99 %)		 9,202
(0.02 %)		 1,922
(100.00 %)		 4,406,534
(31.73 %)		 2,331,293
(15.35 %)		 6,863,540
(50.47 %)		 80,927
(2.32 %)
153 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1		 n/a 17,416
(2.74 %)		 60,936
(6.02 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 7,437
(100.00 %)		 2,377,147
(47.98 %)		 578,235
(8.27 %)		 5,267,308
(40.22 %)		 50,909
(3.45 %)
154 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1		 n/a 18,028
(2.64 %)		 64,206
(6.04 %)		 n/a 38.73
(99.99 %)		 588
(0.01 %)		 106
(100.00 %)		 2,649,943
(48.88 %)		 666,129
(9.08 %)		 5,751,610
(41.56 %)		 58,471
(3.64 %)
155 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1		 n/a 14,690
(3.17 %)		 48,422
(7.90 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 1,915
(100.00 %)		 1,138,190
(26.31 %)		 249,865
(4.72 %)		 3,352,038
(25.55 %)		 36,828
(3.13 %)
156 European flounder (primary hap 2023)
GCA_949316205.1		 n/a 14,753
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 109
(100.00 %)		 1,160,784
(27.06 %)		 251,985
(5.23 %)		 3,353,121
(26.00 %)		 37,130
(2.79 %)
157 European flounder (primary hap 2023)
GCF_949316205.1		 48,969
(12.45 %)		 14,751
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 108
(100.00 %)		 1,160,781
(27.06 %)		 251,983
(5.23 %)		 3,353,086
(26.00 %)		 37,129
(2.79 %)
158 European perch
GCF_010015445.1		 55,605
(8.20 %)		 15,430
(2.07 %)		 55,499
(5.43 %)		 n/a 40.90
(99.97 %)		 801
(0.03 %)		 303
(100.00 %)		 684,094
(5.16 %)		 634,788
(7.48 %)		 5,182,241
(37.07 %)		 44,049
(1.94 %)
159 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1		 n/a 14,619
(2.94 %)		 50,389
(7.92 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,222
(100.00 %)		 430,112
(3.88 %)		 299,581
(6.89 %)		 3,182,258
(27.97 %)		 40,094
(3.66 %)
160 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1		 46,468
(10.51 %)		 14,818
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 355
(100.00 %)		 476,314
(3.63 %)		 520,729
(13.27 %)		 3,283,360
(33.55 %)		 47,050
(4.45 %)
161 European seabass (2021)
GCF_905237075.1		 62,457
(13.08 %)		 15,582
(2.89 %)		 44,472
(6.56 %)		 69,435
(12.92 %)		 40.38
(99.85 %)		 272
(0.15 %)		 303
(100.00 %)		 1,210,970
(24.30 %)		 278,140
(4.02 %)		 4,343,442
(26.18 %)		 15,975
(0.93 %)
162 European smelt (primary hap 2023)
GCA_963692335.1		 n/a 15,640
(3.79 %)		 50,248
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,038
(100.00 %)		 1,648,435
(31.35 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,832
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
163 European smelt (primary hap 2023)
GCF_963692335.1		 46,762
(14.07 %)		 15,639
(3.79 %)		 50,238
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,007
(100.00 %)		 1,648,428
(31.34 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,793
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
164 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1		 n/a 16,181
(2.44 %)		 63,544
(7.17 %)		 n/a 43.83
(99.96 %)		 1,501
(0.04 %)		 387
(100.00 %)		 2,109,362
(31.42 %)		 1,300,159
(14.91 %)		 3,634,744
(35.44 %)		 35,552
(1.87 %)
165 fathead minnow
GCF_016745375.1		 57,312
(8.34 %)		 18,039
(3.02 %)		 52,431
(6.01 %)		 n/a 38.45
(86.78 %)		 5,594
(13.23 %)		 911
(100.00 %)		 657,027
(4.09 %)		 444,571
(6.23 %)		 4,902,960
(35.69 %)		 49,361
(2.78 %)
166 flathead mullet
GCF_022458985.1		 48,689
(12.71 %)		 14,908
(3.00 %)		 45,084
(6.96 %)		 75,582
(11.23 %)		 41.90
(99.97 %)		 445
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 469,841
(3.23 %)		 207,738
(2.31 %)		 3,955,233
(24.74 %)		 45,885
(3.03 %)
167 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1		 n/a 17,494
(2.06 %)		 62,257
(5.73 %)		 n/a 41.17
(99.98 %)		 13
(0.02 %)		 9,305
(99.98 %)		 1,140,986
(16.60 %)		 316,083
(2.17 %)		 6,036,560
(30.48 %)		 26,445
(1.22 %)
168 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1		 43,842
(8.12 %)		 15,434
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 188
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,035
(2.21 %)		 5,305,890
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
169 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1		 n/a 13,745
(2.58 %)		 50,416
(6.72 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 5,171
(100.00 %)		 442,646
(4.09 %)		 276,927
(5.42 %)		 3,741,267
(26.25 %)		 28,827
(2.28 %)
170 freshwater garfish (fXenCan1 primary hap 2020)
GCA_014839995.1		 n/a 14,625
(2.57 %)		 52,879
(6.72 %)		 n/a 41.41
(98.98 %)		 1,373
(1.02 %)		 410
(100.00 %)		 492,828
(4.29 %)		 318,631
(5.94 %)		 3,977,536
(27.41 %)		 32,390
(2.33 %)
171 giant grouper
GCF_005281545.1		 45,328
(7.65 %)		 15,661
(1.91 %)		 53,910
(4.91 %)		 n/a 41.26
(96.40 %)		 23,415
(3.61 %)		 4,201
(100.00 %)		 604,763
(2.71 %)		 357,944
(2.52 %)		 6,501,327
(30.28 %)		 26,431
(0.91 %)
172 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1		 n/a 13,090
(2.37 %)		 48,927
(6.41 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 7,241
(100.00 %)		 422,758
(2.89 %)		 231,452
(2.54 %)		 3,818,141
(24.36 %)		 38,368
(2.40 %)
173 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2		 n/a 15,752
(2.45 %)		 56,395
(6.58 %)		 n/a 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 1,474,134
(29.50 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,691
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
174 golden-line barbel
GCF_001515645.1		 74,071
(6.71 %)		 29,486
(2.77 %)		 55,545
(5.32 %)		 n/a 37.54
(89.58 %)		 136,894
(10.45 %)		 168,074
(89.55 %)		 1,118,646
(5.04 %)		 718,426
(6.54 %)		 9,092,306
(37.16 %)		 70,606
(1.91 %)
175 goldfish
GCF_003368295.1		 116,745
(8.75 %)		 35,097
(2.94 %)		 68,251
(6.12 %)		 n/a 37.48
(99.99 %)		 2,247
(0.01 %)		 8,463
(99.99 %)		 1,693,800
(5.39 %)		 916,195
(5.01 %)		 9,731,118
(40.19 %)		 66,585
(2.06 %)
176 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1		 67,810
(11.16 %)		 18,195
(3.27 %)		 48,459
(5.67 %)		 n/a 37.48
(99.98 %)		 150
(0.02 %)		 31
(100.00 %)		 654,416
(3.33 %)		 429,734
(3.77 %)		 5,501,085
(40.21 %)		 26,282
(1.58 %)
177 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1		 36,344
(7.09 %)		 14,512
(1.92 %)		 45,809
(4.61 %)		 n/a 39.76
(99.63 %)		 3,407
(0.37 %)		 600
(100.00 %)		 2,662,894
(54.47 %)		 803,911
(10.32 %)		 5,763,692
(48.31 %)		 53,808
(2.65 %)
178 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1		 25,822
(5.19 %)		 14,212
(1.97 %)		 27,894
(4.68 %)		 n/a 39.49
(93.15 %)		 92,327
(6.89 %)		 108,947
(93.11 %)		 552,368
(5.00 %)		 742,395
(8.07 %)		 5,901,720
(42.46 %)		 44,972
(1.97 %)
179 greater amberjack
GCF_002260705.1		 33,756
(9.11 %)		 15,336
(2.93 %)		 22,220
(6.07 %)		 n/a 40.86
(99.17 %)		 9,742
(0.82 %)		 34,656
(100.00 %)		 573,770
(4.04 %)		 368,800
(3.72 %)		 4,449,534
(24.71 %)		 15,850
(0.98 %)
180 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1		 n/a 15,483
(3.45 %)		 47,484
(7.95 %)		 n/a 44.71
(100.00 %)		 n/a 4,805
(100.00 %)		 1,400,150
(23.78 %)		 738,163
(17.35 %)		 2,460,977
(35.90 %)		 20,794
(2.09 %)
181 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1		 n/a 16,553
(3.15 %)		 51,766
(7.37 %)		 n/a 44.75
(99.95 %)		 1,752
(0.05 %)		 1,085
(100.00 %)		 1,674,762
(26.07 %)		 900,455
(18.62 %)		 2,849,256
(39.22 %)		 26,022
(2.30 %)
182 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1		 n/a 10,795
(5.59 %)		 33,380
(12.07 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,848
(100.00 %)		 140,376
(2.96 %)		 81,000
(3.32 %)		 1,318,564
(23.30 %)		 34,104
(12.82 %)
183 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1		 47,335
(18.32 %)		 13,477
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 37,563
(15.76 %)		 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,407
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,327
(10.97 %)
184 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1		 n/a 13,412
(4.76 %)		 45,946
(11.50 %)		 n/a 44.34
(99.99 %)		 95
(0.01 %)		 251
(100.00 %)		 494,547
(20.10 %)		 204,804
(10.66 %)		 1,444,044
(34.08 %)		 47,904
(17.47 %)
185 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1		 n/a 13,681
(4.93 %)		 45,034
(11.64 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 4,533
(100.00 %)		 460,038
(18.47 %)		 163,838
(7.90 %)		 1,681,190
(29.08 %)		 47,523
(15.60 %)
186 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1		 n/a 13,432
(2.10 %)		 50,930
(6.39 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 4,952
(100.00 %)		 2,495,763
(38.80 %)		 473,105
(6.27 %)		 3,444,123
(38.56 %)		 35,298
(1.94 %)
187 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1		 n/a 15,028
(2.35 %)		 50,436
(6.30 %)		 n/a 41.10
(99.97 %)		 1,188
(0.03 %)		 1,568
(100.00 %)		 2,688,222
(39.74 %)		 549,362
(7.60 %)		 3,564,661
(40.05 %)		 37,043
(1.94 %)
188 green swordtail
GCF_003331165.1		 52,602
(11.81 %)		 14,955
(2.58 %)		 47,115
(6.33 %)		 n/a 39.09
(99.71 %)		 661
(0.29 %)		 272
(100.00 %)		 328,469
(2.10 %)		 162,178
(2.35 %)		 4,801,050
(28.86 %)		 37,217
(2.39 %)
189 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1		 n/a 14,752
(2.74 %)		 58,725
(8.49 %)		 n/a 43.13
(99.98 %)		 553
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 1,860,845
(35.64 %)		 378,045
(9.39 %)		 3,208,482
(30.12 %)		 66,857
(4.99 %)
190 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1		 n/a 16,645
(1.92 %)		 62,533
(4.55 %)		 n/a 39.69
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 7,253
(100.00 %)		 5,166,731
(67.78 %)		 750,850
(11.35 %)		 5,903,440
(54.20 %)		 90,235
(5.58 %)
191 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1		 n/a 17,136
(1.90 %)		 63,611
(4.50 %)		 n/a 39.74
(99.99 %)		 1,046
(0.01 %)		 233
(100.00 %)		 5,662,029
(68.75 %)		 825,757
(11.99 %)		 6,236,024
(55.15 %)		 99,559
(5.68 %)
192 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2		 53,176
(17.83 %)		 13,439
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 495
(100.00 %)		 644,597
(20.82 %)		 180,309
(16.78 %)		 1,339,434
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
193 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1		 58,587
(18.27 %)		 13,442
(4.00 %)		 41,565
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 253,033
(3.86 %)		 180,311
(16.78 %)		 1,339,521
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
194 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4		 n/a 13,441
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 644,601
(20.82 %)		 180,310
(16.78 %)		 1,339,461
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
195 guppy
GCF_000633615.1		 48,290
(11.24 %)		 14,436
(2.72 %)		 44,759
(6.24 %)		 n/a 39.33
(90.86 %)		 458,354
(9.22 %)		 40,143
(90.84 %)		 340,480
(2.43 %)		 167,943
(1.50 %)		 4,695,380
(25.63 %)		 35,188
(1.91 %)
196 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1		 n/a 15,058
(2.50 %)		 46,340
(5.85 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 2,131
(100.00 %)		 1,642,351
(37.42 %)		 389,169
(5.43 %)		 4,687,710
(35.55 %)		 34,408
(1.75 %)
197 honeycomb rockfish (fSebUmb1 primary hap 2020)
GCF_015220745.1		 57,752
(9.94 %)		 15,244
(2.44 %)		 47,034
(5.98 %)		 63,546
(8.88 %)		 40.77
(99.83 %)		 215
(0.17 %)		 138
(100.00 %)		 524,161
(3.79 %)		 422,265
(6.20 %)		 4,827,148
(36.22 %)		 37,878
(1.84 %)
198 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1		 74,585
(6.94 %)		 30,802
(3.11 %)		 57,655
(5.63 %)		 n/a 37.18
(91.91 %)		 150,790
(8.11 %)		 314,962
(91.89 %)		 1,147,234
(4.93 %)		 708,513
(4.77 %)		 9,080,512
(35.95 %)		 63,217
(1.71 %)
199 humphead wrasse
GCF_018320785.1		 42,229
(6.60 %)		 15,287
(1.66 %)		 47,025
(4.13 %)		 n/a 39.53
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 447,458
(2.27 %)		 310,170
(4.65 %)		 8,002,463
(32.97 %)		 12,252
(0.38 %)
200 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1		 n/a 14,412
(3.70 %)		 41,944
(8.58 %)		 n/a 42.27
(99.58 %)		 230
(0.42 %)		 2,242
(100.00 %)		 304,774
(2.86 %)		 140,555
(2.80 %)		 2,689,154
(24.08 %)		 15,419
(1.38 %)
201 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2		 n/a 15,339
(3.60 %)		 44,099
(8.47 %)		 57,867
(10.10 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 157
(100.00 %)		 346,399
(3.02 %)		 163,524
(3.00 %)		 2,755,274
(25.07 %)		 17,931
(1.47 %)
202 Indian medaka
GCF_002922805.2		 49,295
(10.27 %)		 14,591
(2.49 %)		 52,982
(6.37 %)		 n/a 39.04
(94.83 %)		 51,550
(5.20 %)		 8,493
(100.00 %)		 319,151
(2.20 %)		 208,690
(2.67 %)		 5,412,546
(33.29 %)		 40,721
(2.36 %)
203 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1		 41,583
(6.91 %)		 18,302
(2.47 %)		 29,762
(5.45 %)		 74,968
(7.01 %)		 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,558
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,985
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
204 Japanese flounder
GCF_001970005.1		 37,838
(12.25 %)		 14,521
(3.39 %)		 30,773
(7.34 %)		 n/a 41.64
(81.04 %)		 40,314
(18.97 %)		 9,525
(100.00 %)		 332,322
(2.84 %)		 164,916
(1.16 %)		 3,476,344
(17.36 %)		 21,768
(1.42 %)
205 Japanese medaka
GCF_002234675.1		 50,526
(10.32 %)		 14,325
(2.50 %)		 27,912
(6.71 %)		 91,652
(11.67 %)		 40.84
(99.93 %)		 491
(0.07 %)		 25
(100.00 %)		 384,317
(4.42 %)		 163,041
(3.07 %)		 4,631,750
(34.91 %)		 41,215
(2.89 %)
206 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1		 42,877
(8.61 %)		 15,188
(2.40 %)		 41,262
(7.86 %)		 58,418
(6.97 %)		 44.34
(98.69 %)		 602
(1.31 %)		 203
(100.00 %)		 667,122
(4.21 %)		 442,004
(5.09 %)		 4,388,570
(26.54 %)		 121,464
(9.36 %)
207 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1		 n/a 15,945
(2.17 %)		 101,825
(8.93 %)		 n/a 44.49
(99.63 %)		 9
(0.37 %)		 4,516
(100.00 %)		 744,228
(4.25 %)		 519,896
(5.73 %)		 4,677,160
(28.52 %)		 138,484
(9.55 %)
208 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1		 n/a 14,960
(2.23 %)		 74,436
(6.65 %)		 n/a 43.94
(100.00 %)		 n/a 5,370
(100.00 %)		 1,620,688
(23.00 %)		 902,057
(13.66 %)		 4,547,953
(39.90 %)		 129,990
(12.07 %)
209 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1		 n/a 14,906
(2.33 %)		 72,029
(6.72 %)		 n/a 43.92
(99.98 %)		 887
(0.02 %)		 191
(100.00 %)		 1,609,654
(22.82 %)		 897,264
(13.58 %)		 4,548,467
(39.80 %)		 129,147
(11.75 %)
210 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1		 45,779
(8.57 %)		 15,561
(1.99 %)		 53,188
(5.12 %)		 n/a 41.32
(97.02 %)		 48,394
(2.99 %)		 4,563
(100.00 %)		 574,889
(2.73 %)		 367,135
(2.64 %)		 6,420,280
(29.10 %)		 28,979
(1.07 %)
211 lake trout
GCF_016432855.1		 65,012
(4.57 %)		 26,528
(1.53 %)		 112,119
(4.47 %)		 76,885
(3.80 %)		 43.50
(99.99 %)		 3,264
(0.01 %)		 4,121
(100.00 %)		 1,387,896
(5.81 %)		 1,797,785
(19.28 %)		 9,643,314
(54.44 %)		 85,419
(2.52 %)
212 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1		 78,867
(4.31 %)		 27,579
(1.38 %)		 113,850
(3.63 %)		 n/a 44.18
(100.00 %)		 1,716
(0.00 %)		 6,355
(100.00 %)		 1,729,029
(6.03 %)		 1,781,307
(15.24 %)		 9,311,548
(61.16 %)		 126,142
(4.04 %)
213 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1		 87,246
(4.53 %)		 28,366
(1.38 %)		 117,266
(3.71 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 1,159
(0.00 %)		 7,334
(100.00 %)		 1,768,537
(6.02 %)		 1,793,716
(15.51 %)		 9,525,312
(61.13 %)		 126,485
(3.95 %)
214 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1		 n/a 17,851
(1.28 %)		 83,249
(5.18 %)		 n/a 42.69
(99.97 %)		 2,397
(0.03 %)		 709
(100.00 %)		 7,797,173
(37.37 %)		 1,593,818
(10.64 %)		 7,610,300
(54.05 %)		 127,942
(3.84 %)
215 large yellow croaker
GCF_000972845.2		 49,914
(11.76 %)		 15,365
(3.00 %)		 26,101
(6.66 %)		 n/a 41.34
(99.67 %)		 7,424
(0.33 %)		 9,998
(100.00 %)		 478,685
(3.50 %)		 306,063
(3.37 %)		 4,199,578
(24.80 %)		 28,138
(2.09 %)
216 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1		 n/a 15,841
(2.36 %)		 79,276
(8.51 %)		 n/a 46.35
(100.00 %)		 n/a 5,761
(100.00 %)		 2,935,570
(42.17 %)		 1,208,602
(21.28 %)		 3,157,730
(42.63 %)		 88,759
(6.30 %)
217 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1		 n/a 16,376
(2.19 %)		 82,947
(7.99 %)		 n/a 46.31
(99.94 %)		 2,631
(0.06 %)		 1,522
(100.00 %)		 3,333,323
(43.58 %)		 1,553,932
(25.91 %)		 3,393,507
(46.78 %)		 99,668
(6.39 %)
218 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1		 n/a 15,790
(2.31 %)		 50,332
(5.65 %)		 n/a 40.87
(99.96 %)		 672
(0.04 %)		 202
(100.00 %)		 464,845
(2.71 %)		 255,513
(3.69 %)		 5,124,388
(29.65 %)		 25,920
(1.67 %)
219 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1		 55,170
(9.49 %)		 16,635
(2.18 %)		 56,707
(5.52 %)		 n/a 40.86
(99.85 %)		 2,909
(0.15 %)		 4,753
(100.00 %)		 497,281
(2.60 %)		 269,495
(3.70 %)		 5,496,732
(29.60 %)		 28,733
(1.66 %)
220 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1		 n/a 8,132
(2.11 %)		 25,878
(4.67 %)		 n/a 38.55
(100.00 %)		 n/a 5,088
(100.00 %)		 260,789
(2.73 %)		 158,564
(2.12 %)		 3,023,128
(27.39 %)		 9,678
(1.02 %)
221 largescale foureyes (fAnaAna1 primary hap 2020)
GCA_014839685.1		 n/a 14,774
(2.18 %)		 42,858
(4.83 %)		 58,247
(6.94 %)		 38.54
(99.96 %)		 107
(0.04 %)		 33
(100.00 %)		 506,950
(2.73 %)		 305,170
(2.13 %)		 6,194,879
(29.85 %)		 17,881
(0.94 %)
222 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1		 46,242
(10.23 %)		 13,712
(2.62 %)		 43,369
(5.56 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 1,537
(100.00 %)		 1,406,779
(35.37 %)		 202,983
(7.44 %)		 3,933,128
(41.19 %)		 70,560
(7.78 %)
223 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1		 n/a 14,961
(2.55 %)		 52,234
(6.83 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 409
(0.01 %)		 1,601
(100.00 %)		 1,233,052
(39.33 %)		 366,741
(18.98 %)		 3,296,338
(36.77 %)		 44,712
(2.85 %)
224 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1		 38,671
(7.52 %)		 15,538
(2.18 %)		 57,480
(5.26 %)		 n/a 39.54
(98.22 %)		 3,611
(1.77 %)		 94,260
(100.00 %)		 629,451
(3.42 %)		 385,539
(3.83 %)		 6,343,655
(29.35 %)		 27,018
(1.26 %)
225 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1		 n/a 15,487
(0.88 %)		 85,135
(3.39 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 6,593
(100.00 %)		 5,572,163
(49.59 %)		 1,052,072
(6.02 %)		 7,246,646
(62.69 %)		 157,768
(4.38 %)
226 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1		 53,323
(3.35 %)		 15,955
(0.92 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 6,041,262
(71.88 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
227 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1		 n/a 13,792
(2.19 %)		 51,353
(6.60 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,620
(100.00 %)		 2,536,362
(38.05 %)		 513,115
(7.50 %)		 3,542,854
(37.60 %)		 31,814
(1.79 %)
228 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1		 n/a 13,908
(2.19 %)		 50,634
(6.50 %)		 n/a 41.22
(99.97 %)		 1,017
(0.03 %)		 701
(100.00 %)		 2,698,640
(39.19 %)		 577,328
(8.51 %)		 3,615,231
(39.17 %)		 33,251
(1.82 %)
229 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1		 n/a 15,269
(2.44 %)		 52,449
(6.28 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 606
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,879,201
(31.40 %)		 449,901
(9.89 %)		 4,248,556
(33.21 %)		 43,864
(3.01 %)
230 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1		 n/a 15,033
(2.98 %)		 51,296
(7.68 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,700
(100.00 %)		 1,099,919
(28.68 %)		 314,919
(9.57 %)		 2,620,601
(30.23 %)		 49,248
(4.19 %)
231 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1		 n/a 15,060
(2.89 %)		 50,064
(7.31 %)		 n/a 41.88
(99.98 %)		 589
(0.02 %)		 534
(100.00 %)		 1,116,427
(28.18 %)		 315,489
(13.14 %)		 2,598,812
(33.21 %)		 50,192
(3.82 %)
232 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1		 n/a 14,632
(3.51 %)		 40,441
(7.51 %)		 n/a 41.42
(99.96 %)		 19
(0.04 %)		 1,405
(100.00 %)		 435,742
(3.57 %)		 139,003
(1.51 %)		 3,161,165
(22.06 %)		 16,302
(1.34 %)
233 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2		 n/a 14,975
(3.53 %)		 40,908
(7.56 %)		 n/a 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 772,309
(14.49 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,473
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
234 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1		 n/a 15,137
(3.09 %)		 52,499
(7.75 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 n/a 1,778
(100.00 %)		 448,166
(4.67 %)		 416,181
(8.95 %)		 3,288,388
(27.99 %)		 55,747
(4.41 %)
235 longspined bullhead (fTauBub2.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1		 n/a 15,027
(3.10 %)		 51,137
(7.71 %)		 n/a 42.22
(99.99 %)		 242
(0.01 %)		 27
(100.00 %)		 452,844
(4.81 %)		 417,308
(9.63 %)		 3,262,282
(28.51 %)		 55,527
(4.38 %)
236 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1		 n/a 12,848
(3.32 %)		 43,711
(8.09 %)		 n/a 42.84
(100.00 %)		 n/a 1,866
(100.00 %)		 407,698
(6.03 %)		 360,501
(11.29 %)		 2,456,041
(28.07 %)		 45,916
(5.21 %)
237 lumpfish (primary hap v1 2019 refseq)
GCF_009769545.1		 41,612
(11.11 %)		 14,752
(3.31 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 48
(100.00 %)		 478,386
(6.02 %)		 421,632
(11.07 %)		 2,928,619
(27.99 %)		 53,321
(5.09 %)
238 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1		 n/a 14,944
(3.23 %)		 50,328
(8.09 %)		 n/a 42.82
(99.97 %)		 954
(0.03 %)		 232
(100.00 %)		 1,034,598
(25.93 %)		 434,819
(13.21 %)		 2,907,371
(30.18 %)		 55,066
(5.20 %)
239 lyretail cichlid
GCF_000239395.1		 38,260
(10.03 %)		 14,804
(2.69 %)		 23,751
(5.79 %)		 n/a 40.44
(80.94 %)		 109,100
(19.10 %)		 118,181
(80.90 %)		 695,696
(14.49 %)		 119,381
(1.10 %)		 4,539,429
(19.49 %)		 18,098
(0.91 %)
240 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1		 64,831
(12.89 %)		 15,283
(2.75 %)		 43,349
(6.02 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 65
(100.00 %)		 441,324
(3.38 %)		 206,420
(2.54 %)		 4,582,841
(27.41 %)		 15,999
(1.17 %)
241 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2		 49,016
(12.41 %)		 14,186
(3.08 %)		 55,502
(8.05 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 321,832
(4.91 %)		 114,318
(16.04 %)		 2,300,636
(32.10 %)		 46,312
(5.05 %)
242 mangrove rivulus
GCF_001649575.2		 46,200
(11.83 %)		 14,522
(2.87 %)		 46,641
(6.86 %)		 n/a 40.03
(94.31 %)		 32,278
(5.70 %)		 300
(100.00 %)		 345,678
(2.32 %)		 146,263
(1.33 %)		 4,718,292
(27.30 %)		 39,541
(2.69 %)
243 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1		 n/a 14,564
(1.72 %)		 71,604
(6.41 %)		 n/a 41.49
(100.00 %)		 n/a 8,737
(100.00 %)		 1,662,251
(42.29 %)		 439,119
(12.96 %)		 3,776,125
(45.00 %)		 56,507
(2.83 %)
244 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1		 n/a 15,070
(1.79 %)		 71,367
(6.50 %)		 n/a 41.46
(99.92 %)		 4,157
(0.08 %)		 943
(100.00 %)		 1,717,591
(42.63 %)		 474,348
(12.30 %)		 4,011,319
(44.93 %)		 59,531
(2.83 %)
245 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1		 44,363
(10.91 %)		 14,032
(2.80 %)		 60,400
(8.09 %)		 n/a 43.84
(99.86 %)		 974
(0.14 %)		 200
(100.00 %)		 1,157,953
(36.57 %)		 569,832
(12.19 %)		 2,864,996
(37.65 %)		 98,423
(9.53 %)
246 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2		 47,018
(6.00 %)		 16,516
(1.68 %)		 33,920
(4.24 %)		 n/a 38.00
(96.73 %)		 621
(3.27 %)		 2,415
(100.00 %)		 1,125,511
(6.89 %)		 1,113,607
(11.76 %)		 8,546,053
(42.44 %)		 44,933
(1.77 %)
247 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1		 71,254
(7.50 %)		 16,674
(1.63 %)		 52,903
(4.12 %)		 101,896
(6.64 %)		 38.24
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,155,823
(4.90 %)		 1,363,316
(12.23 %)		 7,667,721
(47.23 %)		 48,358
(1.88 %)
248 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1		 n/a 16,698
(1.62 %)		 62,818
(5.14 %)		 74,339
(6.58 %)		 38.41
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 195
(100.00 %)		 1,194,830
(5.04 %)		 1,460,981
(11.81 %)		 7,590,179
(47.66 %)		 50,533
(2.46 %)
249 milkfish (2019)
GCF_902362185.1		 30,812
(7.61 %)		 16,869
(3.41 %)		 21,377
(6.58 %)		 n/a 41.53
(99.36 %)		 112
(0.64 %)		 31
(100.00 %)		 958,774
(8.18 %)		 731,733
(9.10 %)		 3,702,024
(26.31 %)		 22,089
(1.27 %)
250 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1		 n/a 16,565
(3.38 %)		 42,094
(6.75 %)		 n/a 41.51
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,937
(100.00 %)		 930,392
(8.11 %)		 708,375
(9.04 %)		 3,612,575
(26.46 %)		 21,531
(1.27 %)
251 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1		 n/a 17,701
(1.62 %)		 73,433
(5.69 %)		 n/a 42.20
(99.98 %)		 1,398
(0.02 %)		 388
(100.00 %)		 6,438,444
(40.32 %)		 1,202,669
(11.51 %)		 7,055,665
(47.04 %)		 74,954
(3.44 %)
252 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1		 n/a 15,176
(3.17 %)		 47,458
(7.48 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 927
(0.02 %)		 486
(100.00 %)		 1,167,409
(26.98 %)		 438,114
(8.08 %)		 3,351,987
(27.25 %)		 45,298
(3.39 %)
253 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1		 n/a 14,480
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 725
(100.00 %)		 1,101,582
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,480
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
254 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1		 40,276
(12.25 %)		 14,478
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 1,660
(99.98 %)		 1,101,578
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,428
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
255 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1		 53,087
(12.11 %)		 14,672
(2.71 %)		 27,552
(6.74 %)		 n/a 39.02
(99.85 %)		 229
(0.15 %)		 68
(100.00 %)		 305,761
(2.11 %)		 134,157
(2.14 %)		 4,687,726
(28.26 %)		 33,082
(2.28 %)
256 mudskipper P.magnuspinnatus (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1		 n/a 13,470
(2.34 %)		 42,799
(5.73 %)		 n/a 40.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,799
(100.00 %)		 394,414
(4.41 %)		 509,973
(7.17 %)		 4,581,968
(38.91 %)		 34,522
(2.54 %)
257 mudskipper P.magnuspinnatus (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3		 33,236
(8.44 %)		 14,601
(2.46 %)		 44,145
(5.80 %)		 n/a 40.22
(99.05 %)		 701
(0.95 %)		 122
(100.00 %)		 1,755,227
(42.93 %)		 551,482
(7.22 %)		 4,887,087
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
258 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1		 41,183
(7.38 %)		 14,602
(1.92 %)		 57,194
(5.03 %)		 35,597
(6.40 %)		 40.58
(91.29 %)		 123,625
(8.75 %)		 120,723
(91.25 %)		 447,158
(2.19 %)		 235,336
(1.39 %)		 6,518,990
(26.03 %)		 54,589
(2.39 %)
259 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2		 56,612
(6.89 %)		 15,361
(1.60 %)		 69,801
(5.20 %)		 n/a 40.76
(99.88 %)		 2,820
(0.12 %)		 1,031
(100.00 %)		 636,480
(2.75 %)		 392,130
(3.32 %)		 7,023,777
(32.98 %)		 81,101
(3.45 %)
260 New Zealand spotty (2019)
GCA_009762535.1		 n/a 14,609
(2.22 %)		 43,262
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 468
(100.00 %)		 519,324
(4.65 %)		 393,329
(5.54 %)		 4,522,265
(33.34 %)		 18,302
(0.85 %)
261 New Zealand spotty (alternate hap 2019)
GCA_009762545.1		 n/a 13,566
(2.17 %)		 40,774
(5.21 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 n/a 3,286
(100.00 %)		 472,659
(4.46 %)		 348,429
(5.17 %)		 4,169,213
(33.57 %)		 16,368
(0.83 %)
262 Nile tilapia
GCF_001858045.2		 77,384
(10.86 %)		 15,599
(1.99 %)		 32,839
(6.04 %)		 n/a 40.73
(99.99 %)		 551
(0.01 %)		 2,460
(100.00 %)		 600,869
(5.40 %)		 291,105
(3.17 %)		 4,958,128
(31.15 %)		 32,038
(1.81 %)
263 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1		 n/a 13,050
(3.93 %)		 44,650
(10.12 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 n/a 1,934
(100.00 %)		 512,583
(14.83 %)		 156,305
(8.46 %)		 2,005,803
(27.09 %)		 59,674
(9.19 %)
264 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1		 51,166
(15.31 %)		 14,765
(3.99 %)		 49,191
(9.80 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 341
(0.01 %)		 1,667
(100.00 %)		 380,357
(3.60 %)		 188,301
(6.29 %)		 2,422,266
(25.70 %)		 72,584
(9.69 %)
265 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCA_949316345.1		 n/a 14,600
(3.83 %)		 49,927
(9.98 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 175
(100.00 %)		 599,088
(14.68 %)		 186,747
(10.27 %)		 2,273,942
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
266 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCF_949316345.1		 57,816
(15.11 %)		 14,598
(3.83 %)		 49,473
(9.87 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 174
(100.00 %)		 599,085
(14.68 %)		 186,746
(10.27 %)		 2,273,889
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
267 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1		 51,073
(7.42 %)		 15,809
(2.17 %)		 43,728
(4.54 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 n/a 48
(100.00 %)		 2,472,286
(44.73 %)		 560,123
(5.68 %)		 6,203,876
(38.64 %)		 42,187
(2.72 %)
268 northern pike
GCF_004634155.1		 66,389
(9.11 %)		 16,778
(2.37 %)		 27,040
(5.41 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 584
(0.01 %)		 908
(100.00 %)		 1,065,458
(31.14 %)		 531,451
(7.80 %)		 4,677,366
(33.26 %)		 44,793
(2.82 %)
269 northern pike (2020 refseq)
GCF_011004845.1		 63,733
(9.28 %)		 16,618
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,941
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 984,415
(29.15 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,096
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
270 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1		 n/a 11,782
(2.41 %)		 40,748
(5.68 %)		 n/a 42.32
(99.93 %)		 11
(0.07 %)		 3,813
(100.00 %)		 700,818
(30.15 %)		 372,729
(7.71 %)		 3,058,655
(31.76 %)		 29,687
(2.57 %)
271 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1		 61,639
(13.32 %)		 15,131
(2.87 %)		 35,444
(5.74 %)		 n/a 39.76
(100.00 %)		 52
(0.00 %)		 291
(100.00 %)		 830,033
(26.45 %)		 152,304
(8.77 %)		 3,778,846
(29.39 %)		 8,436
(0.70 %)
272 Old Calabar mormyrid
GCF_002872115.1		 61,915
(11.48 %)		 15,987
(2.73 %)		 33,963
(6.66 %)		 n/a 43.93
(92.03 %)		 49,579
(7.99 %)		 4,666
(100.00 %)		 348,463
(2.27 %)		 314,129
(2.95 %)		 4,259,711
(20.83 %)		 76,846
(4.18 %)
273 orangethroat darter
GCF_008692095.1		 55,448
(8.29 %)		 15,000
(2.25 %)		 49,918
(5.41 %)		 n/a 40.91
(99.57 %)		 101,221
(0.47 %)		 3,119
(100.00 %)		 566,915
(3.75 %)		 509,018
(6.60 %)		 5,142,090
(31.18 %)		 26,702
(1.46 %)
274 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1		 46,571
(5.47 %)		 15,761
(1.50 %)		 31,563
(4.00 %)		 59,905
(3.98 %)		 37.90
(99.73 %)		 1,844
(0.27 %)		 340
(100.00 %)		 1,257,250
(5.57 %)		 979,214
(8.64 %)		 6,386,731
(48.59 %)		 29,320
(0.87 %)
275 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1		 n/a 14,018
(1.51 %)		 45,251
(3.61 %)		 n/a 37.73
(99.94 %)		 142
(0.06 %)		 7,038
(99.94 %)		 1,041,393
(5.09 %)		 744,623
(6.94 %)		 6,250,631
(45.53 %)		 22,522
(0.77 %)
276 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1		 68,779
(8.54 %)		 17,223
(2.28 %)		 49,697
(5.11 %)		 n/a 38.10
(99.99 %)		 614
(0.01 %)		 358
(100.00 %)		 2,925,549
(40.35 %)		 402,676
(5.35 %)		 5,933,365
(45.71 %)		 56,843
(3.18 %)
277 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1		 40,001
(9.36 %)		 14,904
(2.72 %)		 24,732
(5.87 %)		 n/a 40.60
(84.20 %)		 60,817
(15.83 %)		 68,050
(84.17 %)		 306,171
(3.27 %)		 124,292
(0.75 %)		 4,414,831
(20.66 %)		 18,455
(0.96 %)
278 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1		 49,417
(13.66 %)		 13,542
(2.89 %)		 64,214
(9.77 %)		 n/a 45.55
(99.92 %)		 4,826
(0.09 %)		 24
(100.00 %)		 1,117,561
(38.30 %)		 685,851
(13.38 %)		 2,330,116
(34.15 %)		 87,761
(8.68 %)
279 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1		 48,776
(12.61 %)		 14,747
(3.15 %)		 45,075
(7.30 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 410,917
(4.22 %)		 246,500
(4.66 %)		 3,680,698
(25.23 %)		 31,508
(2.30 %)
280 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2		 46,684
(12.50 %)		 14,862
(3.15 %)		 45,824
(7.30 %)		 n/a 42.17
(99.95 %)		 1,131
(0.05 %)		 53
(100.00 %)		 407,699
(3.94 %)		 247,330
(3.84 %)		 3,838,896
(24.75 %)		 31,782
(2.27 %)
281 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1		 54,344
(6.52 %)		 15,214
(1.67 %)		 74,345
(6.13 %)		 n/a 41.49
(99.96 %)		 900
(0.04 %)		 759
(100.00 %)		 805,776
(5.16 %)		 849,901
(11.48 %)		 4,645,552
(43.92 %)		 106,026
(5.14 %)
282 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1		 40,657
(5.52 %)		 17,858
(2.46 %)		 42,119
(3.16 %)		 n/a 36.32
(98.82 %)		 1,821
(1.18 %)		 342
(100.00 %)		 3,973,354
(56.67 %)		 940,639
(7.81 %)		 8,701,639
(50.54 %)		 29,684
(1.18 %)
283 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1		 n/a 15,421
(1.80 %)		 62,324
(6.15 %)		 n/a 42.79
(99.90 %)		 4,955
(0.10 %)		 4,978
(99.90 %)		 4,032,523
(34.18 %)		 982,411
(16.51 %)		 5,189,655
(46.47 %)		 64,543
(3.14 %)
284 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1		 n/a 16,917
(1.64 %)		 72,190
(5.85 %)		 n/a 42.91
(99.96 %)		 2,729
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 4,976,327
(35.08 %)		 1,258,755
(18.52 %)		 6,268,804
(48.21 %)		 81,193
(3.23 %)
285 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1		 42,701
(12.59 %)		 14,986
(3.15 %)		 46,289
(7.75 %)		 n/a 40.99
(99.97 %)		 380
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 1,031,762
(25.30 %)		 219,393
(4.63 %)		 3,436,780
(25.57 %)		 16,570
(1.12 %)
286 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1		 n/a 15,242
(2.07 %)		 60,994
(6.53 %)		 n/a 41.51
(99.99 %)		 282
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 975,354
(15.76 %)		 315,625
(10.49 %)		 3,601,904
(35.09 %)		 49,121
(3.07 %)
287 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1		 n/a 15,317
(2.02 %)		 61,647
(6.35 %)		 n/a 41.37
(99.99 %)		 135
(0.01 %)		 469
(99.99 %)		 981,519
(15.40 %)		 319,637
(12.45 %)		 3,706,473
(36.77 %)		 50,353
(2.98 %)
288 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1		 n/a 16,729
(3.56 %)		 56,451
(8.61 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 5,701
(100.00 %)		 1,153,359
(18.94 %)		 829,887
(14.54 %)		 2,793,018
(28.79 %)		 49,469
(4.32 %)
289 peladilla (fAplTae1 primary hap 2021)
GCA_017639675.1		 n/a 13,829
(3.83 %)		 41,932
(8.64 %)		 n/a 45.01
(98.24 %)		 1,158
(1.77 %)		 41
(100.00 %)		 930,246
(18.49 %)		 660,569
(13.71 %)		 2,316,198
(27.66 %)		 41,023
(4.40 %)
290 pike-perch
GCF_008315115.2		 65,418
(8.54 %)		 15,731
(2.23 %)		 52,240
(5.69 %)		 n/a 40.87
(99.98 %)		 711
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 629,999
(5.16 %)		 567,578
(7.41 %)		 4,697,709
(36.49 %)		 39,666
(1.93 %)
291 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1		 40,770
(8.72 %)		 15,738
(2.42 %)		 26,691
(5.69 %)		 57,069
(6.14 %)		 41.83
(99.78 %)		 253
(0.22 %)		 87
(100.00 %)		 1,063,888
(5.90 %)		 646,820
(4.30 %)		 4,938,857
(28.11 %)		 41,636
(2.04 %)
292 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1		 n/a 15,563
(2.38 %)		 54,264
(6.19 %)		 n/a 41.81
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,193
(100.00 %)		 1,040,418
(5.81 %)		 623,499
(4.08 %)		 4,888,400
(27.89 %)		 40,331
(2.02 %)
293 pink salmon
GCF_021184085.1		 91,127
(4.89 %)		 27,187
(1.37 %)		 124,120
(3.88 %)		 n/a 44.28
(99.96 %)		 5,213
(0.04 %)		 22,556
(99.99 %)		 1,343,135
(0.00 %)		 2,906,520
(28.95 %)		 10,882,087
(57.26 %)		 97,805
(3.04 %)
294 ploughfish
GCF_902827175.1		 50,551
(7.66 %)		 14,699
(1.83 %)		 66,348
(6.06 %)		 62,492
(5.74 %)		 41.52
(99.98 %)		 1,569
(0.02 %)		 2,618
(100.00 %)		 467,937
(3.05 %)		 412,361
(6.64 %)		 3,498,382
(45.08 %)		 73,879
(3.55 %)
295 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1		 n/a 14,050
(2.77 %)		 63,249
(8.86 %)		 n/a 45.41
(100.00 %)		 n/a 4,970
(100.00 %)		 708,455
(9.71 %)		 797,241
(15.67 %)		 2,785,159
(33.18 %)		 78,151
(7.95 %)
296 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1		 n/a 14,126
(2.81 %)		 61,907
(8.75 %)		 n/a 45.67
(99.94 %)		 1,810
(0.06 %)		 616
(100.00 %)		 753,034
(10.17 %)		 850,189
(15.72 %)		 2,888,555
(33.70 %)		 80,883
(8.43 %)
297 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1		 56,688
(7.63 %)		 17,670
(2.67 %)		 54,522
(5.25 %)		 n/a 37.95
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,087,358
(61.37 %)		 553,846
(7.14 %)		 6,036,124
(43.52 %)		 47,942
(3.56 %)
298 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1		 45,404
(2.55 %)		 14,664
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,310,663
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
299 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1		 n/a 10,944
(0.64 %)		 59,123
(2.21 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 19,587
(100.00 %)		 947,336
(2.69 %)		 554,284
(3.27 %)		 7,314,941
(58.56 %)		 125,285
(5.42 %)
300 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1		 n/a 15,639
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 365
(100.00 %)		 1,655,350
(30.53 %)		 511,512
(12.09 %)		 2,015,264
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
301 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1		 39,606
(12.43 %)		 15,641
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 366
(100.00 %)		 1,655,356
(30.53 %)		 511,513
(12.09 %)		 2,015,303
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
302 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2		 119,284
(6.51 %)		 27,513
(1.62 %)		 109,524
(4.38 %)		 138,073
(5.21 %)		 43.45
(99.74 %)		 486
(0.26 %)		 939
(100.00 %)		 1,537,455
(7.32 %)		 2,083,211
(23.10 %)		 10,092,840
(53.71 %)		 73,586
(2.16 %)
303 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1		 79,299
(6.41 %)		 25,179
(1.70 %)		 98,339
(4.18 %)		 115,853
(5.33 %)		 42.67
(88.52 %)		 427,894
(11.54 %)		 139,800
(99.96 %)		 1,332,141
(5.52 %)		 1,604,760
(8.18 %)		 9,451,984
(44.00 %)		 56,604
(1.05 %)
304 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1		 71,991
(5.94 %)		 27,195
(1.88 %)		 81,269
(3.63 %)		 n/a 39.59
(99.96 %)		 1,873
(0.04 %)		 1,746
(100.00 %)		 7,035,382
(51.89 %)		 1,021,269
(5.98 %)		 12,768,853
(46.85 %)		 109,185
(4.70 %)
305 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1		 n/a 15,655
(3.01 %)		 47,717
(6.87 %)		 n/a 40.98
(95.57 %)		 11,577
(4.42 %)		 34,462
(100.00 %)		 470,579
(3.16 %)		 231,051
(1.91 %)		 4,345,700
(23.24 %)		 20,149
(1.25 %)
306 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1		 n/a 4,539
(2.01 %)		 14,061
(4.35 %)		 n/a 40.48
(100.00 %)		 n/a 1,751
(100.00 %)		 759,605
(49.59 %)		 161,693
(7.99 %)		 1,684,737
(29.93 %)		 7,525
(1.31 %)
307 red-bellied piranha (fPygNat1 primary hap 2020)
GCF_015220715.1		 54,818
(7.05 %)		 16,817
(1.87 %)		 52,672
(4.24 %)		 76,011
(5.65 %)		 40.58
(99.17 %)		 303
(0.83 %)		 55
(100.00 %)		 817,566
(5.40 %)		 689,236
(8.30 %)		 7,296,459
(35.73 %)		 33,087
(1.38 %)
308 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1		 47,129
(6.06 %)		 17,089
(1.80 %)		 33,378
(4.02 %)		 n/a 40.45
(97.38 %)		 62,964
(2.59 %)		 325,620
(97.41 %)		 898,445
(4.81 %)		 863,000
(6.48 %)		 7,757,382
(34.74 %)		 34,329
(1.24 %)
309 reedfish (2021)
GCF_900747795.2		 44,479
(2.01 %)		 13,108
(0.46 %)		 23,157
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,636,520
(39.34 %)		 1,069,643
(2.91 %)		 19,980,572
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
310 reedfish (alternate hap)
GCA_900700845.2		 n/a 9,950
(0.37 %)		 31,611
(1.22 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 38,598
(100.00 %)		 1,300,565
(2.57 %)		 685,834
(2.21 %)		 14,691,576
(45.66 %)		 63,365
(1.11 %)
311 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1		 56,261
(13.18 %)		 14,197
(2.71 %)		 45,193
(6.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 157
(100.00 %)		 941,095
(17.66 %)		 238,999
(5.27 %)		 4,283,692
(41.06 %)		 43,014
(4.07 %)
312 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 137,348
(9.74 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 635,526
(3.14 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
313 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2		 n/a 27,928
(1.66 %)		 110,791
(4.44 %)		 n/a 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 4,690,842
(57.30 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,763
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
314 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1		 n/a 18,165
(2.73 %)		 62,580
(6.00 %)		 n/a 38.74
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,612
(100.00 %)		 2,483,904
(48.29 %)		 584,363
(7.55 %)		 5,582,076
(40.38 %)		 60,229
(3.53 %)
315 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1		 n/a 18,132
(2.65 %)		 63,523
(6.01 %)		 n/a 38.80
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 86
(100.00 %)		 2,613,900
(48.90 %)		 625,102
(8.21 %)		 5,738,444
(41.24 %)		 65,328
(3.68 %)
316 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2		 n/a 15,291
(3.29 %)		 45,865
(7.56 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,165
(100.00 %)		 1,131,154
(25.69 %)		 269,583
(5.08 %)		 3,371,712
(24.64 %)		 36,810
(2.68 %)
317 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2		 n/a 15,181
(3.34 %)		 44,153
(7.53 %)		 51,135
(7.40 %)		 42.31
(99.98 %)		 418
(0.02 %)		 101
(100.00 %)		 1,121,704
(25.48 %)		 269,467
(4.88 %)		 3,358,709
(24.69 %)		 36,987
(3.02 %)
318 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1		 52,554
(8.81 %)		 17,664
(3.05 %)		 48,403
(5.24 %)		 n/a 36.06
(83.93 %)		 5,144
(16.07 %)		 2,870
(100.00 %)		 2,600,095
(49.94 %)		 683,499
(4.34 %)		 6,000,462
(35.96 %)		 33,741
(1.62 %)
319 Rosablanca catfish (hap1 2023)
GCA_030014385.1		 n/a 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
320 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1		 n/a 15,434
(2.01 %)		 44,991
(4.63 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 302
(100.00 %)		 2,506,810
(40.54 %)		 613,867
(8.67 %)		 5,070,851
(48.32 %)		 46,071
(2.57 %)
321 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1		 n/a 17,895
(2.55 %)		 64,448
(5.84 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 418
(0.01 %)		 110
(100.00 %)		 2,661,155
(49.83 %)		 673,071
(10.59 %)		 5,755,954
(42.48 %)		 66,952
(4.46 %)
322 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1		 n/a 18,254
(2.38 %)		 68,852
(5.71 %)		 n/a 39.02
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 759
(100.00 %)		 2,854,977
(51.13 %)		 754,287
(11.81 %)		 5,942,764
(44.17 %)		 72,686
(4.52 %)
323 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1		 34,548
(9.49 %)		 15,280
(3.00 %)		 46,259
(6.95 %)		 n/a 40.45
(99.99 %)		 723
(0.01 %)		 8,212
(99.99 %)		 1,335,152
(28.19 %)		 415,384
(6.53 %)		 3,948,379
(27.81 %)		 22,854
(1.61 %)
324 sailfin molly
GCF_001443285.1		 53,986
(11.41 %)		 15,048
(2.71 %)		 33,482
(6.71 %)		 n/a 39.18
(83.41 %)		 41,735
(16.61 %)		 54,623
(83.39 %)		 357,919
(2.18 %)		 189,502
(1.23 %)		 4,873,063
(22.51 %)		 34,138
(1.62 %)
325 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1		 56,010
(20.10 %)		 13,998
(4.84 %)		 48,737
(11.56 %)		 n/a 45.63
(99.99 %)		 250
(0.01 %)		 868
(100.00 %)		 304,980
(15.98 %)		 171,631
(4.98 %)		 1,616,965
(21.60 %)		 48,338
(9.79 %)
326 sardine (primary hap 2023)
GCA_963854185.1		 n/a 16,071
(2.33 %)		 64,180
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 241
(100.00 %)		 1,503,111
(11.74 %)		 1,507,024
(15.48 %)		 4,027,638
(37.52 %)		 68,874
(3.56 %)
327 sardine (primary hap 2023)
GCF_963854185.1		 48,146
(9.15 %)		 16,069
(2.33 %)		 64,178
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 240
(100.00 %)		 1,503,108
(11.74 %)		 1,507,022
(15.48 %)		 4,027,614
(37.52 %)		 68,873
(3.56 %)
328 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1		 51,270
(7.00 %)		 13,854
(1.32 %)		 48,980
(3.46 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,805,346
(21.21 %)		 512,153
(12.76 %)		 6,260,589
(63.96 %)		 96,908
(3.65 %)
329 Senegalese sole
GCF_019176455.1		 46,446
(12.02 %)		 15,155
(3.15 %)		 43,828
(7.31 %)		 n/a 40.92
(99.99 %)		 662
(0.01 %)		 1,937
(100.00 %)		 522,618
(4.22 %)		 317,280
(4.23 %)		 4,040,245
(28.25 %)		 26,946
(1.79 %)
330 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1		 n/a 14,728
(2.46 %)		 62,094
(7.09 %)		 n/a 42.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,847
(100.00 %)		 939,151
(11.90 %)		 472,983
(7.68 %)		 4,326,183
(28.40 %)		 64,290
(4.16 %)
331 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1		 n/a 15,032
(2.44 %)		 62,625
(6.97 %)		 n/a 42.07
(99.98 %)		 598
(0.02 %)		 847
(100.00 %)		 967,197
(11.85 %)		 498,286
(8.15 %)		 4,397,828
(28.96 %)		 65,744
(4.06 %)
332 sheepshead minnow
GCF_000732505.1		 37,879
(7.01 %)		 14,749
(2.02 %)		 25,480
(4.66 %)		 n/a 38.19
(86.93 %)		 113,210
(13.10 %)		 110,959
(86.90 %)		 363,397
(1.88 %)		 195,191
(1.43 %)		 6,444,762
(27.47 %)		 18,269
(0.66 %)
333 shortfin molly
GCF_001443325.1		 54,473
(11.42 %)		 15,104
(2.72 %)		 33,717
(6.74 %)		 n/a 39.23
(84.81 %)		 37,507
(15.20 %)		 50,598
(84.80 %)		 328,347
(2.03 %)		 172,112
(1.18 %)		 4,876,942
(22.80 %)		 34,271
(1.66 %)
334 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4		 59,278
(19.85 %)		 14,594
(4.32 %)		 55,265
(10.96 %)		 n/a 45.31
(99.99 %)		 321
(0.01 %)		 36
(100.00 %)		 384,203
(19.38 %)		 175,898
(4.39 %)		 1,946,630
(23.16 %)		 70,331
(13.13 %)
335 Siamese fighting fish (v5.1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1		 n/a 14,510
(4.12 %)		 60,058
(10.77 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,705
(100.00 %)		 249,671
(3.68 %)		 182,366
(4.87 %)		 1,939,533
(22.55 %)		 72,474
(13.55 %)
336 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2		 n/a 14,737
(4.05 %)		 61,568
(10.70 %)		 n/a 45.50
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 3,872
(100.00 %)		 392,585
(19.23 %)		 190,741
(5.09 %)		 1,994,824
(23.20 %)		 74,259
(13.49 %)
337 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1		 131,166
(9.80 %)		 29,612
(2.99 %)		 81,338
(5.43 %)		 n/a 37.63
(99.92 %)		 2,597
(0.08 %)		 51
(100.00 %)		 3,277,259
(45.05 %)		 801,192
(7.96 %)		 7,910,205
(42.51 %)		 60,236
(2.18 %)
338 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1		 n/a 13,661
(1.11 %)		 75,418
(4.21 %)		 n/a 45.01
(99.96 %)		 3,120
(0.04 %)		 1,059
(100.00 %)		 4,634,757
(53.53 %)		 1,006,319
(17.13 %)		 5,273,732
(51.16 %)		 145,115
(7.59 %)
339 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1		 34,018
(4.17 %)		 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
340 smallmouth bass
GCF_021292245.1		 55,919
(9.40 %)		 15,509
(2.37 %)		 49,387
(5.61 %)		 n/a 40.72
(99.65 %)		 34,581
(0.36 %)		 15,020
(100.00 %)		 445,979
(2.50 %)		 249,630
(2.49 %)		 5,071,015
(28.28 %)		 23,875
(1.36 %)
341 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1		 57,883
(4.39 %)		 15,654
(1.03 %)		 72,123
(3.58 %)		 n/a 38.64
(100.00 %)		 2,564
(0.00 %)		 424
(100.00 %)		 3,149,025
(23.73 %)		 1,621,410
(19.58 %)		 7,534,195
(67.22 %)		 122,765
(3.07 %)
342 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2		 75,628
(6.10 %)		 24,075
(1.71 %)		 98,364
(4.30 %)		 n/a 43.37
(96.15 %)		 25,658
(3.85 %)		 36,660
(99.99 %)		 949,725
(3.53 %)		 1,465,583
(10.82 %)		 8,853,884
(48.52 %)		 62,850
(1.45 %)
343 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1		 80,798
(5.59 %)		 26,218
(1.35 %)		 116,746
(3.87 %)		 n/a 44.03
(99.93 %)		 4,351
(0.07 %)		 12,436
(100.00 %)		 6,356,046
(54.95 %)		 2,840,516
(31.41 %)		 10,575,179
(57.52 %)		 77,648
(1.61 %)
344 South Georgia icefish
GCF_902827115.1		 41,307
(6.47 %)		 14,776
(1.79 %)		 68,734
(6.16 %)		 61,643
(5.52 %)		 42.07
(99.94 %)		 2,461
(0.06 %)		 1,563
(100.00 %)		 498,451
(3.42 %)		 474,032
(7.20 %)		 3,613,731
(45.83 %)		 88,984
(4.31 %)
345 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1		 n/a 15,727
(2.61 %)		 43,177
(5.74 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 n/a 895
(100.00 %)		 1,590,386
(33.53 %)		 246,800
(2.86 %)		 5,173,834
(26.85 %)		 14,473
(0.87 %)
346 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1		 58,429
(11.06 %)		 15,626
(2.56 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 554,276
(3.42 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,851
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
347 southern platyfish
GCF_002775205.1		 46,367
(11.15 %)		 14,674
(2.66 %)		 28,368
(6.82 %)		 n/a 38.97
(99.53 %)		 156
(0.47 %)		 102
(100.00 %)		 323,402
(2.76 %)		 146,477
(2.33 %)		 4,741,552
(28.27 %)		 34,667
(2.13 %)
348 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1		 74,317
(6.97 %)		 30,906
(3.19 %)		 55,474
(5.66 %)		 n/a 37.28
(92.69 %)		 168,741
(7.34 %)		 254,423
(92.66 %)		 1,129,104
(5.02 %)		 730,197
(4.59 %)		 8,910,005
(36.97 %)		 64,238
(1.79 %)
349 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1		 57,720
(10.03 %)		 15,810
(2.14 %)		 58,218
(5.77 %)		 n/a 40.33
(99.99 %)		 871
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 1,505,948
(35.31 %)		 346,542
(4.71 %)		 5,210,329
(31.65 %)		 36,529
(1.65 %)
350 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1		 38,931
(8.84 %)		 15,624
(2.29 %)		 35,942
(5.59 %)		 n/a 40.01
(85.05 %)		 209,115
(15.01 %)		 30,414
(100.00 %)		 372,901
(2.33 %)		 278,854
(1.99 %)		 5,622,334
(22.61 %)		 25,079
(0.95 %)
351 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1		 n/a 13,641
(5.13 %)		 57,982
(13.46 %)		 n/a 46.43
(91.24 %)		 18,974
(8.76 %)		 44,686
(91.24 %)		 252,877
(4.38 %)		 159,939
(3.51 %)		 1,689,462
(18.66 %)		 51,580
(13.42 %)
352 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1		 46,818
(8.35 %)		 14,938
(2.04 %)		 55,475
(6.12 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 792
(100.00 %)		 505,488
(2.57 %)		 269,742
(4.14 %)		 4,697,020
(30.74 %)		 30,399
(1.90 %)
353 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2		 48,380
(8.37 %)		 15,470
(2.04 %)		 57,237
(6.11 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 791
(100.00 %)		 523,070
(2.57 %)		 277,554
(4.08 %)		 4,872,723
(30.67 %)		 31,383
(1.89 %)
354 sterlet (maternal 2020)
GCA_902713425.1		 n/a 22,306
(1.80 %)		 33,366
(4.09 %)		 n/a 39.56
(99.99 %)		 402
(0.01 %)		 245
(100.00 %)		 1,126,738
(3.36 %)		 889,853
(6.73 %)		 8,766,715
(39.22 %)		 51,356
(1.84 %)
355 sterlet (paternal 2020)
GCA_902713435.1		 n/a 22,718
(1.81 %)		 34,093
(4.15 %)		 57,768
(4.88 %)		 39.60
(100.00 %)		 422
(0.01 %)		 224
(100.00 %)		 1,145,503
(3.39 %)		 912,936
(6.84 %)		 8,839,174
(39.17 %)		 52,560
(1.82 %)
356 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1		 n/a 16,177
(4.18 %)		 40,160
(7.35 %)		 n/a 39.58
(100.00 %)		 n/a 2,237
(100.00 %)		 1,208,781
(38.02 %)		 121,854
(7.96 %)		 2,956,942
(32.61 %)		 27,787
(3.58 %)
357 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1		 n/a 16,419
(3.98 %)		 40,677
(7.21 %)		 n/a 39.69
(99.97 %)		 825
(0.03 %)		 100
(100.00 %)		 1,324,513
(39.84 %)		 143,170
(9.30 %)		 3,000,881
(34.30 %)		 30,130
(3.71 %)
358 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1		 59,497
(6.82 %)		 17,172
(2.25 %)		 57,383
(4.85 %)		 n/a 39.18
(99.99 %)		 497
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 4,750,810
(63.58 %)		 649,426
(10.14 %)		 6,511,384
(46.74 %)		 74,723
(4.45 %)
359 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1		 56,498
(4.86 %)		 14,602
(1.00 %)		 64,279
(2.96 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 1,172
(0.00 %)		 473
(100.00 %)		 2,984,285
(27.54 %)		 1,402,691
(20.35 %)		 7,915,062
(67.02 %)		 140,374
(3.90 %)
360 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1		 45,220
(12.66 %)		 14,509
(3.35 %)		 46,221
(7.95 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 791,570
(25.79 %)		 305,491
(6.68 %)		 3,000,938
(29.61 %)		 36,818
(4.17 %)
361 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1		 n/a 15,871
(2.85 %)		 42,287
(5.51 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,274
(100.00 %)		 1,826,752
(37.53 %)		 592,022
(6.69 %)		 4,899,884
(32.33 %)		 17,357
(1.25 %)
362 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1		 53,860
(11.99 %)		 16,033
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 58
(100.00 %)		 1,870,234
(37.80 %)		 605,570
(6.82 %)		 5,059,429
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
363 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1		 50,044
(9.61 %)		 15,665
(2.76 %)		 41,398
(5.35 %)		 n/a 38.86
(99.98 %)		 463
(0.02 %)		 150
(100.00 %)		 777,186
(5.69 %)		 603,962
(6.24 %)		 5,141,987
(32.41 %)		 17,264
(1.20 %)
364 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1		 40,992
(9.44 %)		 15,295
(2.91 %)		 20,865
(5.31 %)		 n/a 38.71
(97.32 %)		 23,755
(2.69 %)		 567
(100.00 %)		 693,498
(4.75 %)		 489,286
(3.69 %)		 4,849,313
(30.04 %)		 15,076
(0.95 %)
365 striped sea-bass
GCF_004916995.1		 32,103
(10.78 %)		 14,422
(3.07 %)		 38,188
(6.41 %)		 n/a 40.19
(99.19 %)		 73,335
(0.86 %)		 630
(100.00 %)		 365,581
(2.59 %)		 142,967
(0.99 %)		 4,151,813
(22.73 %)		 13,730
(0.95 %)
366 Sumatra barb
GCF_018831695.1		 54,947
(11.16 %)		 18,745
(3.98 %)		 49,520
(6.36 %)		 n/a 38.24
(99.95 %)		 5,075
(0.05 %)		 1,122
(100.00 %)		 638,783
(6.33 %)		 357,159
(7.71 %)		 4,520,846
(32.46 %)		 46,339
(3.96 %)
367 swamp eel
GCF_001952655.1		 43,831
(10.64 %)		 14,741
(2.98 %)		 20,099
(5.80 %)		 n/a 40.90
(92.01 %)		 51,257
(8.01 %)		 71,879
(91.99 %)		 266,195
(1.84 %)		 95,726
(1.16 %)		 3,596,747
(21.95 %)		 7,065
(0.42 %)
368 swordfish
GCF_016859285.1		 47,986
(9.92 %)		 15,208
(2.84 %)		 42,556
(5.91 %)		 n/a 40.69
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 1,482
(100.00 %)		 484,543
(3.59 %)		 230,762
(3.41 %)		 4,496,150
(23.94 %)		 27,129
(2.10 %)
369 tambaqui
GCF_904425465.1		 46,601
(6.55 %)		 17,150
(1.88 %)		 50,327
(4.03 %)		 n/a 39.33
(100.00 %)		 420
(0.00 %)		 1,269
(100.00 %)		 753,112
(4.00 %)		 676,948
(5.71 %)		 8,317,676
(35.32 %)		 25,784
(0.92 %)
370 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1		 n/a 14,720
(2.58 %)		 45,918
(6.44 %)		 n/a 40.37
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 1,242,704
(17.37 %)		 518,293
(15.23 %)		 3,986,694
(40.18 %)		 51,441
(3.53 %)
371 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1		 n/a 15,347
(2.73 %)		 50,294
(7.25 %)		 n/a 42.30
(99.98 %)		 610
(0.02 %)		 393
(100.00 %)		 1,157,324
(26.70 %)		 229,196
(4.33 %)		 3,694,790
(27.54 %)		 38,929
(2.20 %)
372 three-spined stickleback
GCF_016920845.1		 50,181
(16.09 %)		 14,935
(3.99 %)		 53,773
(9.96 %)		 n/a 44.66
(99.24 %)		 3,125
(0.76 %)		 2,937
(100.00 %)		 368,987
(9.09 %)		 160,564
(2.89 %)		 2,308,841
(21.91 %)		 80,336
(11.49 %)
373 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1		 n/a 13,912
(1.87 %)		 62,727
(6.28 %)		 n/a 42.90
(99.99 %)		 894
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 1,981,480
(37.86 %)		 652,950
(27.50 %)		 3,680,829
(47.75 %)		 96,414
(8.01 %)
374 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1		 n/a 14,276
(1.78 %)		 66,576
(6.32 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 820
(100.00 %)		 2,127,818
(38.86 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,452
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
375 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2		 47,024
(13.33 %)		 13,806
(3.76 %)		 52,367
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.08 %)		 22,977
(6.92 %)		 55,891
(93.08 %)		 356,857
(3.66 %)		 155,338
(3.36 %)		 2,806,278
(24.56 %)		 61,010
(7.71 %)
376 tongue sole
GCF_000523025.1		 45,186
(16.40 %)		 14,186
(3.98 %)		 20,816
(8.22 %)		 n/a 40.82
(94.88 %)		 33,269
(5.14 %)		 62,912
(94.86 %)		 423,833
(4.34 %)		 235,739
(3.33 %)		 3,085,031
(24.78 %)		 17,094
(1.42 %)
377 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3		 n/a 13,635
(4.82 %)		 48,723
(11.83 %)		 n/a 45.60
(99.82 %)		 38
(0.18 %)		 2,012
(100.00 %)		 249,793
(9.32 %)		 151,193
(4.49 %)		 1,577,144
(20.25 %)		 46,936
(9.72 %)
378 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2		 53,479
(18.31 %)		 14,527
(4.79 %)		 28,597
(10.65 %)		 55,587
(14.38 %)		 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 281,011
(10.36 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
379 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3		 n/a 14,527
(4.79 %)		 51,181
(11.72 %)		 n/a 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 325,077
(14.03 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,754
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
380 trahira (fHopMal1hap1 2024)
GCF_029633855.1		 55,764
(7.71 %)		 17,259
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 598
(100.00 %)		 2,407,637
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,475
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
381 trahira (hap2 2023)
GCA_029633875.1		 n/a 16,216
(2.00 %)		 45,209
(4.32 %)		 n/a 41.03
(96.02 %)		 907
(3.98 %)		 452
(100.00 %)		 2,280,303
(30.80 %)		 708,327
(15.59 %)		 5,394,248
(39.01 %)		 28,386
(2.18 %)
382 trahira (v2 hap1 2024)
GCA_029633855.2		 n/a 17,256
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 597
(100.00 %)		 2,407,631
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,418
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
383 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1		 n/a 14,816
(3.44 %)		 49,680
(8.16 %)		 n/a 43.40
(99.97 %)		 805
(0.03 %)		 108
(100.00 %)		 808,348
(19.20 %)		 301,230
(7.15 %)		 3,267,772
(25.91 %)		 66,132
(6.90 %)
384 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1		 57,285
(14.93 %)		 14,887
(3.52 %)		 49,403
(8.32 %)		 87,351
(14.65 %)		 43.54
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 455,017
(0.00 %)		 297,185
(5.03 %)		 3,312,612
(24.33 %)		 65,633
(7.08 %)
385 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1		 40,373
(7.85 %)		 14,339
(2.08 %)		 84,906
(20.47 %)		 57,218
(6.01 %)		 42.51
(68.98 %)		 85,562
(31.04 %)		 68,911
(68.97 %)		 392,114
(2.78 %)		 307,607
(2.09 %)		 4,777,941
(27.62 %)		 61,105
(2.15 %)
386 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1		 54,488
(6.75 %)		 14,227
(1.27 %)		 69,161
(4.33 %)		 n/a 44.33
(93.22 %)		 3,093
(6.78 %)		 2,681
(100.00 %)		 2,760,581
(47.64 %)		 635,213
(25.56 %)		 4,136,925
(56.55 %)		 110,696
(10.50 %)
387 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1		 n/a 15,895
(2.18 %)		 46,934
(4.73 %)		 n/a 39.83
(99.95 %)		 605
(0.05 %)		 3,484
(100.00 %)		 1,061,538
(6.25 %)		 611,618
(5.19 %)		 5,978,835
(37.11 %)		 54,666
(3.50 %)
388 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1		 49,084
(12.15 %)		 14,241
(2.71 %)		 70,653
(9.29 %)		 n/a 45.59
(99.96 %)		 2,816
(0.04 %)		 168
(100.00 %)		 1,274,742
(38.63 %)		 797,757
(14.11 %)		 2,725,416
(34.38 %)		 95,149
(8.09 %)
389 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1		 n/a 14,197
(3.33 %)		 44,782
(7.70 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 n/a 2,294
(100.00 %)		 396,279
(4.74 %)		 275,154
(5.76 %)		 2,933,132
(29.41 %)		 35,104
(4.08 %)
390 warty frogfish (fAntMac1 primary hap 2020)
GCA_013358685.1		 n/a 14,494
(3.34 %)		 45,310
(7.77 %)		 n/a 41.86
(99.87 %)		 219
(0.13 %)		 155
(100.00 %)		 413,753
(4.95 %)		 290,313
(6.11 %)		 3,010,996
(29.71 %)		 36,840
(4.18 %)
391 western mosquitofish
GCF_019740435.1		 54,029
(12.31 %)		 14,667
(2.80 %)		 44,358
(6.62 %)		 n/a 38.94
(97.42 %)		 181
(2.58 %)		 37
(100.00 %)		 348,476
(2.56 %)		 158,728
(2.21 %)		 4,604,959
(26.85 %)		 30,624
(1.94 %)
392 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1		 46,203
(5.36 %)		 16,945
(2.57 %)		 65,343
(6.35 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 n/a 930
(100.00 %)		 2,528,154
(48.24 %)		 549,447
(8.24 %)		 5,157,802
(41.42 %)		 84,874
(6.05 %)
393 White Sands pupfish
GCF_016077235.1		 46,084
(6.27 %)		 14,817
(1.71 %)		 52,055
(4.88 %)		 n/a 39.01
(100.00 %)		 n/a 2,003
(100.00 %)		 489,894
(2.67 %)		 304,277
(3.91 %)		 6,371,712
(38.05 %)		 41,820
(1.75 %)
394 wolf-eel
GCF_004355925.1		 43,625
(14.00 %)		 14,930
(3.24 %)		 31,372
(7.30 %)		 n/a 42.10
(92.86 %)		 23,891
(7.15 %)		 33,400
(92.85 %)		 379,343
(3.26 %)		 244,853
(2.39 %)		 3,432,622
(22.07 %)		 30,581
(2.04 %)
395 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1		 n/a 14,753
(3.49 %)		 49,516
(8.47 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 458,382
(5.18 %)		 420,718
(8.01 %)		 3,146,054
(25.71 %)		 69,817
(7.20 %)
396 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1		 n/a 14,847
(3.48 %)		 50,136
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 443
(100.00 %)		 461,903
(5.20 %)		 422,251
(8.03 %)		 3,180,804
(25.81 %)		 70,183
(7.15 %)
397 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1		 42,410
(12.47 %)		 14,845
(3.48 %)		 50,132
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 661
(100.00 %)		 461,895
(5.20 %)		 422,249
(8.03 %)		 3,180,722
(25.81 %)		 70,181
(7.15 %)
398 worm pipefish (RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1		 73,681
(3.43 %)		 25,892
(1.02 %)		 114,154
(3.30 %)		 n/a 39.45
(100.00 %)		 146
(0.00 %)		 630
(100.00 %)		 4,795,312
(24.37 %)		 2,093,730
(16.74 %)		 13,132,465
(67.32 %)		 248,526
(4.59 %)
399 Wuchang bream
GCF_018812025.1		 68,768
(8.86 %)		 18,247
(2.62 %)		 57,323
(5.24 %)		 n/a 37.64
(99.83 %)		 1,281
(0.17 %)		 243
(100.00 %)		 801,110
(0.00 %)		 559,399
(5.04 %)		 6,340,567
(43.09 %)		 45,067
(2.52 %)
400 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1		 63,925
(10.50 %)		 17,502
(3.25 %)		 52,519
(5.86 %)		 n/a 37.23
(99.62 %)		 617
(0.38 %)		 353
(100.00 %)		 2,297,102
(50.34 %)		 368,423
(3.28 %)		 5,171,389
(38.98 %)		 32,824
(2.00 %)
401 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1		 64,819
(11.15 %)		 15,680
(2.87 %)		 41,108
(5.68 %)		 n/a 39.49
(99.94 %)		 817
(0.06 %)		 517
(100.00 %)		 839,496
(9.42 %)		 756,396
(11.12 %)		 4,051,149
(35.45 %)		 24,342
(1.72 %)
402 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1		 54,374
(10.66 %)		 15,584
(2.85 %)		 22,598
(5.58 %)		 n/a 39.55
(99.11 %)		 1,760
(0.89 %)		 663
(100.00 %)		 883,218
(10.65 %)		 797,020
(11.09 %)		 4,092,065
(35.46 %)		 24,238
(1.72 %)
403 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1		 47,108
(7.77 %)		 15,458
(2.26 %)		 28,572
(5.62 %)		 n/a 40.84
(99.95 %)		 831
(0.05 %)		 268
(100.00 %)		 620,402
(4.92 %)		 540,302
(7.26 %)		 4,770,842
(35.92 %)		 35,251
(1.63 %)
404 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1		 n/a 814
(1.87 %)		 3,814
(6.84 %)		 n/a 42.36
(99.98 %)		 80
(0.02 %)		 349
(100.00 %)		 38,000
(5.03 %)		 29,516
(7.35 %)		 232,988
(20.37 %)		 2,289
(2.07 %)
405 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1		 63,974
(13.26 %)		 15,178
(2.82 %)		 46,332
(6.73 %)		 84,160
(11.62 %)		 42.09
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 499,939
(3.43 %)		 254,361
(2.64 %)		 4,420,217
(22.81 %)		 31,005
(1.79 %)
406 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1		 n/a 15,959
(2.63 %)		 43,025
(5.73 %)		 n/a 39.71
(100.00 %)		 n/a 640
(100.00 %)		 1,427,221
(28.44 %)		 257,108
(3.15 %)		 5,197,531
(26.91 %)		 13,909
(0.83 %)
407 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1		 57,835
(11.36 %)		 15,616
(2.53 %)		 42,750
(5.72 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 569,665
(3.53 %)		 259,656
(3.34 %)		 5,175,692
(27.05 %)		 14,420
(0.88 %)
408 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2		 40,935
(9.94 %)		 15,673
(2.75 %)		 53,235
(6.33 %)		 n/a 40.72
(97.79 %)		 33,661
(2.21 %)		 98,345
(100.00 %)		 1,337,427
(24.48 %)		 522,121
(4.83 %)		 4,649,096
(25.00 %)		 16,819
(0.86 %)
409 Zealand spotty
GCF_009762535.1		 45,555
(9.06 %)		 14,609
(2.22 %)		 43,259
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 467
(100.00 %)		 517,755
(4.63 %)		 393,328
(5.54 %)		 4,522,224
(33.34 %)		 18,299
(0.85 %)
410 zebra mbuna
GCF_000238955.4		 51,012
(8.37 %)		 15,901
(2.10 %)		 32,136
(6.12 %)		 n/a 41.16
(99.99 %)		 641
(0.01 %)		 1,690
(100.00 %)		 565,771
(6.22 %)		 253,037
(2.53 %)		 4,679,743
(31.57 %)		 36,689
(2.00 %)
411 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1		 n/a 6,365
(2.41 %)		 16,467
(3.26 %)		 n/a 36.72
(100.00 %)		 n/a 4,719
(100.00 %)		 1,317,027
(59.43 %)		 323,062
(10.58 %)		 3,014,570
(45.46 %)		 14,563
(1.98 %)
412 zebrafish (fDanRer4 primary hap 2022)
GCA_944039275.1		 n/a 18,065
(2.46 %)		 44,526
(3.30 %)		 n/a 37.08
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,804,769
(44.04 %)		 954,645
(10.72 %)		 8,694,743
(51.88 %)		 44,936
(2.02 %)
413 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1		 n/a 17,774
(2.54 %)		 44,221
(3.24 %)		 n/a 36.52
(99.87 %)		 20,876
(0.14 %)		 20,901
(99.86 %)		 4,138,008
(61.22 %)		 894,145
(6.79 %)		 9,494,379
(47.68 %)		 42,482
(2.03 %)
414 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1		 n/a 17,535
(2.50 %)		 44,169
(3.34 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 712
(0.01 %)		 1,252
(100.00 %)		 3,891,854
(61.07 %)		 927,173
(7.78 %)		 8,621,517
(50.27 %)		 44,554
(2.12 %)
415 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2		 n/a 17,692
(2.51 %)		 43,578
(3.27 %)		 n/a 36.56
(99.99 %)		 1,352
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 3,937,397
(60.86 %)		 936,258
(7.76 %)		 8,732,369
(50.44 %)		 44,812
(2.09 %)
416 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6		 65,219
(5.63 %)		 22,246
(2.54 %)		 51,134
(7.13 %)		 n/a 36.60
(99.72 %)		 20,258
(0.28 %)		 34,617
(99.73 %)		 4,595,932
(57.92 %)		 1,077,677
(6.47 %)		 10,772,232
(49.45 %)		 53,471
(2.06 %)
417 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1		 n/a 1,204
(2.88 %)		 4,065
(7.13 %)		 n/a 41.24
(99.99 %)		 n/a 1,437
(100.00 %)		 26,319
(3.19 %)		 14,209
(3.21 %)		 211,357
(18.05 %)		 1,253
(1.49 %)
418 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2		 44,988
(12.00 %)		 15,037
(3.35 %)		 40,235
(7.28 %)		 60,496
(9.39 %)		 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 348,230
(2.87 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
419 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3		 n/a 15,036
(3.35 %)		 40,234
(7.28 %)		 n/a 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 671,614
(20.98 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,040
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 419

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 218 assemblies assembly stats track stats
Mammals 564 assemblies assembly stats track stats
Birds 393 assemblies assembly stats track stats
Fishes 419 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 269 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1103 assemblies assembly stats track stats
Plants 303 assemblies assembly stats track stats
Fungi 899 assemblies assembly stats track stats
Viruses 287 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 107 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 522 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 952 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 769 assemblies assembly stats track stats