Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2018)
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 62,829
(1.59 %)
2 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2025)
GCF_003597395.2		 45,809
(3.10 %)		 14,668
(1.02 %)		 17,810
(1.52 %)		 n/a 43.77
(96.56 %)		 39,154
(3.45 %)		 3,850
(100.00 %)		 1,222,218
(10.47 %)		 272,032
(1.07 %)		 12,528,821
(28.39 %)		 63,912
(1.75 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
4 adder (hap1.1 2024)
GCF_964194415.1		 38,942
(3.52 %)		 13,890
(1.18 %)		 20,037
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 1,535
(99.99 %)		 3,498,446
(50.64 %)		 792,729
(6.25 %)		 7,621,218
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
5 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1		 n/a 12,344
(1.22 %)		 17,320
(1.89 %)		 n/a 41.00
(99.99 %)		 908
(0.01 %)		 1,256
(99.99 %)		 3,221,370
(48.42 %)		 681,209
(5.18 %)		 6,734,253
(44.26 %)		 99,366
(4.44 %)
6 Adriatic sturgeon (hap1 F7M8 2026)
GCA_055691345.2		 n/a 20,098
(1.33 %)		 37,942
(3.78 %)		 n/a 40.71
(99.97 %)		 2,714
(0.03 %)		 2,382
(100.00 %)		 4,085,077
(45.81 %)		 1,195,562
(15.56 %)		 8,443,108
(46.99 %)		 78,180
(4.69 %)
7 Adriatic sturgeon (hap2 F7M8 2026)
GCA_055691285.1		 n/a 20,124
(1.49 %)		 36,410
(4.04 %)		 n/a 40.53
(99.97 %)		 3,327
(0.04 %)		 5,697
(99.96 %)		 3,667,553
(45.24 %)		 1,048,673
(13.73 %)		 7,864,141
(44.81 %)		 69,458
(4.21 %)
8 Adriatic sturgeon (hap3 F7M8 2026)
GCA_055691255.1		 n/a 19,683
(1.55 %)		 35,408
(4.15 %)		 n/a 40.38
(99.96 %)		 3,793
(0.04 %)		 5,674
(99.96 %)		 3,521,733
(44.95 %)		 947,487
(11.83 %)		 7,840,137
(43.35 %)		 65,008
(3.89 %)
9 Adriatic sturgeon (hap4 F7M8 2026)
GCA_055691465.1		 n/a 22,119
(1.53 %)		 41,296
(4.20 %)		 n/a 40.48
(99.96 %)		 4,779
(0.04 %)		 8,217
(99.96 %)		 3,962,795
(44.66 %)		 1,085,414
(12.53 %)		 8,556,153
(43.56 %)		 72,066
(4.06 %)
10 Aegean wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964252035.1		 60,400
(5.15 %)		 13,944
(1.37 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 4,972,179
(51.37 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,007,850
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
11 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 10,399
(2.84 %)
12 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
13 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 14,854
(0.31 %)
14 African bullfrog (2023)
GCF_032062135.1		 39,241
(5.22 %)		 13,325
(1.31 %)		 16,015
(2.29 %)		 n/a 38.30
(97.16 %)		 40,350
(2.85 %)		 8,090
(100.00 %)		 490,197
(1.53 %)		 403,071
(2.55 %)		 8,536,428
(30.37 %)		 16,231
(0.36 %)
15 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,899
(3.89 %)		 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 108,774
(1.25 %)
16 Aldabra giant tortoise (Hermania_blood 2022)
GCA_026122505.1		 n/a 14,963
(0.99 %)		 18,852
(1.52 %)		 n/a 44.33
(101.34 %)		 321
(0.01 %)		 777
(100.00 %)		 5,237,461
(54.70 %)		 394,170
(2.15 %)		 11,669,021
(34.40 %)		 62,996
(2.39 %)
17 alligator gar (hap1 2026 genbank)
GCA_055471065.1		 n/a 13,707
(1.53 %)		 23,913
(3.61 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 1,306,252
(35.92 %)		 239,317
(13.52 %)		 5,624,757
(36.27 %)		 50,268
(3.81 %)
18 alligator gar (hap1 2026 refseq)
GCF_055471065.1		 45,013
(6.25 %)		 13,822
(1.56 %)		 24,806
(3.66 %)		 n/a 40.64
(101.40 %)		 64
(0.00 %)		 355
(100.00 %)		 1,495,191
(40.90 %)		 239,575
(13.49 %)		 5,624,730
(36.27 %)		 50,268
(3.81 %)
19 alligator gar (hap2 2026)
GCA_055504755.1		 n/a 13,844
(1.62 %)		 23,436
(3.73 %)		 n/a 40.48
(102.64 %)		 81
(0.00 %)		 234
(100.00 %)		 1,286,170
(34.39 %)		 223,198
(11.10 %)		 5,672,865
(34.23 %)		 49,009
(3.64 %)
20 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
21 American alligator (hap1 2026)
GCA_057657785.1		 n/a 14,447
(0.97 %)		 18,772
(1.45 %)		 n/a 45.07
(100.00 %)		 144
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,387,982
(42.95 %)		 644,426
(2.34 %)		 12,507,993
(32.71 %)		 49,984
(3.01 %)
22 American alligator (hap2 2026)
GCA_057657805.1		 n/a 14,449
(0.98 %)		 18,986
(1.47 %)		 n/a 44.99
(100.00 %)		 139
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 3,389,572
(43.14 %)		 480,395
(1.63 %)		 12,514,775
(32.21 %)		 50,383
(2.34 %)
23 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 35,531
(1.28 %)
24 American bullfrog (2022-GZ 2024)
GCF_042186555.1		 56,135
(1.53 %)		 14,245
(0.30 %)		 40,001
(1.08 %)		 n/a 43.44
(99.96 %)		 4,773
(0.04 %)		 5,033
(99.96 %)		 2,922,485
(2.38 %)		 4,625,082
(10.64 %)		 27,250,040
(58.60 %)		 429,691
(2.65 %)
25 American bullfrog (primary hap 2024)
GCA_037953035.1		 n/a 14,830
(0.29 %)		 47,571
(1.22 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 4,071
(100.00 %)		 3,008,729
(2.34 %)		 4,764,040
(10.52 %)		 28,440,050
(58.60 %)		 446,366
(2.65 %)
26 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 133,933
(8.63 %)
27 Andalusian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965113315.1		 64,111
(5.17 %)		 14,387
(1.31 %)		 20,338
(2.18 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 5,139,265
(54.13 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
28 angelshark (IRGN 9GIWDBWNYT 2023)
GCA_031763465.1		 n/a 5,514
(0.36 %)		 13,241
(0.85 %)		 n/a 44.21
(86.22 %)		 226,036
(13.68 %)		 1,378,695
(86.32 %)		 204,591
(1.55 %)		 649,587
(7.45 %)		 7,948,984
(32.06 %)		 83,350
(2.20 %)
29 Arctic lamprey (IMCB_JLM_01 2021)
GCA_018977245.1		 n/a 7,773
(0.68 %)		 37,576
(3.58 %)		 n/a 48.75
(99.99 %)		 578,345
(0.06 %)		 4,710
(99.99 %)		 3,940,419
(60.65 %)		 1,287,992
(15.83 %)		 6,017,598
(47.20 %)		 172,876
(42.56 %)
30 Argentine snake-necked turtle (alternate hap 2025)
GCA_049999975.1		 n/a 14,806
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 3,247,149
(41.23 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 47,683
(1.86 %)
31 Argentine snake-necked turtle (primary hap 2025)
GCA_049999965.1		 n/a 14,773
(1.27 %)		 19,240
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 114
(0.02 %)		 40
(100.00 %)		 3,245,307
(41.27 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 47,799
(1.87 %)
32 Asian narrow-headed softshell turtle (alternate hap 2025)
GCA_052575425.1		 n/a 449
(0.60 %)		 896
(1.17 %)		 n/a 44.87
(100.00 %)		 n/a 940
(100.00 %)		 181,438
(48.98 %)		 15,458
(1.40 %)		 479,760
(25.10 %)		 3,011
(2.57 %)
33 Asian narrow-headed softshell turtle (primary hap 2025)
GCA_052575445.1		 n/a 14,806
(1.06 %)		 19,069
(1.59 %)		 n/a 45.16
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 3,923,051
(46.22 %)		 376,799
(1.35 %)		 11,484,179
(34.72 %)		 77,209
(2.05 %)
34 Asian spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_060175755.1		 n/a 13,691
(0.76 %)		 26,981
(1.84 %)		 n/a 41.25
(102.77 %)		 519
(0.00 %)		 183
(100.00 %)		 4,957,171
(42.46 %)		 1,021,404
(10.29 %)		 11,309,051
(52.32 %)		 218,366
(4.93 %)
35 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 105,815
(4.08 %)
36 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 415,605
(4.12 %)
37 Atlantic hagfish (alternate hap 2024)
GCA_964187825.1		 n/a 6,253
(0.19 %)		 56,915
(3.08 %)		 n/a 44.52
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 24,878
(100.00 %)		 1,607,558
(3.68 %)		 2,446,041
(23.93 %)		 7,370,810
(72.27 %)		 307,758
(13.12 %)
38 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 408,391
(12.65 %)
39 Atlantic hagfish (primary hap 2024 genbank)
GCA_964187855.1		 n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
40 Atlantic hagfish (primary hap 2024 refseq)
GCF_964187855.1		 47,605
(1.95 %)		 6,660
(0.20 %)		 45,489
(2.63 %)		 n/a 44.25
(100.59 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,003
(100.00 %)		 1,712,039
(3.61 %)		 2,644,653
(27.70 %)		 7,619,436
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
41 Atlantic ridley (hap1 2025)
GCA_965140285.1		 n/a 14,835
(1.03 %)		 17,938
(1.53 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 1,346,135
(12.58 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
42 Atlantic ridley (hap2 2025 refseq)
GCF_965140265.1		 67,187
(3.84 %)		 14,601
(1.02 %)		 17,367
(1.50 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 245
(0.00 %)		 332
(100.00 %)		 1,335,525
(12.58 %)		 314,640
(2.13 %)		 10,517,469
(34.27 %)		 45,940
(1.37 %)
43 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
44 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 86,138
(2.16 %)
45 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,103
(2.80 %)		 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 26,647
(0.98 %)
46 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 134,345,177
(46.63 %)		 2,388,998
(5.24 %)
47 axolotl (Mex_15411 2024 refseq)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 126,532,504
(50.15 %)		 2,452,305
(5.31 %)
48 barred grass snake (hap1.1 2024)
GCF_964273705.1		 43,483
(3.75 %)		 13,680
(1.11 %)		 19,683
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 487
(100.00 %)		 4,187,944
(53.38 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,184
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
49 basking shark (hap1.1 2024 genbank)
GCA_964194155.1		 n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
50 basking shark (hap1.1 2024 refseq)
GCF_964194155.1		 49,591
(1.78 %)		 13,754
(0.41 %)		 22,698
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,087
(100.00 %)		 6,782,578
(65.71 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,697,546
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
51 basking shark (hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 107,555
(1.88 %)
52 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 53,921
(2.09 %)
53 beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024)
GCA_036884735.1		 n/a 24,635
(1.65 %)		 38,296
(3.71 %)		 n/a 39.96
(99.90 %)		 3,967
(0.10 %)		 1,383
(100.00 %)		 1,315,442
(3.30 %)		 1,268,850
(7.99 %)		 10,595,211
(41.03 %)		 65,207
(2.45 %)
54 big-headed turtle (DO16091913 2018)
GCA_003942145.1		 n/a 15,845
(1.05 %)		 56,185
(2.12 %)		 n/a 44.63
(100.70 %)		 109,876
(1.58 %)		 469,569
(98.42 %)		 4,392,283
(44.70 %)		 468,071
(2.04 %)		 12,128,150
(32.03 %)		 156,196
(2.96 %)
55 big-headed turtle (hap1 2026)
GCA_057946115.1		 n/a 14,847
(1.07 %)		 19,128
(1.60 %)		 n/a 44.63
(102.82 %)		 187
(0.00 %)		 114
(100.00 %)		 4,043,109
(46.63 %)		 482,481
(2.68 %)		 10,707,787
(34.65 %)		 112,432
(2.96 %)
56 big-headed turtle (hap2 2026)
GCA_057946265.1		 n/a 14,614
(1.05 %)		 18,669
(1.58 %)		 n/a 44.54
(100.00 %)		 173
(0.00 %)		 81
(100.00 %)		 4,114,841
(46.68 %)		 464,722
(2.78 %)		 10,645,107
(34.66 %)		 110,978
(2.80 %)
57 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 76,786
(1.60 %)
58 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 86,825
(1.61 %)
59 blonde ray (alternate hap 2023)
GCA_963513955.1		 n/a 11,554
(0.52 %)		 31,983
(1.58 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 n/a 10,683
(100.00 %)		 8,320,120
(69.63 %)		 991,438
(7.00 %)		 11,337,728
(57.98 %)		 262,962
(6.35 %)
60 blonde ray (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514005.1		 n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
61 blonde ray (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514005.1		 40,007
(2.48 %)		 11,887
(0.54 %)		 27,557
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,646
(100.00 %)		 8,552,615
(70.14 %)		 1,061,810
(8.11 %)		 11,598,911
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
62 Bocage's wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964188305.1		 64,048
(5.17 %)		 14,155
(1.28 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 507
(100.00 %)		 5,192,766
(54.55 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,204
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
63 Boie's wart frog (hap1 2025)
GCA_054083975.1		 n/a 15,085
(0.57 %)		 28,221
(1.65 %)		 n/a 40.37
(102.96 %)		 1,684
(0.01 %)		 628
(100.00 %)		 10,732,399
(63.17 %)		 3,007,479
(16.48 %)		 16,720,184
(55.88 %)		 121,575
(2.15 %)
64 brilliant-thighed poison frog (Ecuador 8001 2023)
GCA_033576535.1		 n/a 13,834
(0.34 %)		 48,455
(1.58 %)		 n/a 45.66
(99.96 %)		 21,710
(0.04 %)		 28,356
(99.96 %)		 9,462,827
(38.75 %)		 4,882,500
(15.53 %)		 25,372,114
(54.97 %)		 734,430
(7.27 %)
65 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
66 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
67 brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
68 brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 37,299
(1.02 %)
69 brown hagfish (PATA_SCHIZ_1 2024)
GCA_035128595.1		 n/a 6,299
(0.25 %)		 35,377
(2.04 %)		 n/a 43.49
(94.65 %)		 706,165
(5.46 %)		 64,533
(99.47 %)		 1,452,558
(4.27 %)		 1,950,334
(8.89 %)		 14,106,206
(47.44 %)		 224,843
(9.74 %)
70 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 53,035
(1.80 %)
71 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,336
(2.63 %)		 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 68,858
(2.06 %)
72 brownbanded bambooshark (Juve2018m 2025)
GCF_047496795.1		 60,935
(1.72 %)		 12,494
(0.29 %)		 21,756
(0.89 %)		 n/a 44.10
(99.99 %)		 2,891
(0.01 %)		 1,989
(100.00 %)		 1,123,600
(4.34 %)		 1,904,298
(18.02 %)		 24,059,272
(54.04 %)		 56,396
(1.81 %)
73 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,676
(4.16 %)		 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 29,212
(1.10 %)
74 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 89,437
(4.63 %)
75 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 78,768
(3.37 %)
76 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap1 2025)
GCA_047715975.2		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,926
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,492,668
(30.18 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
77 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap2 2025)
GCA_047715955.2		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,934
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 3,500,548
(30.07 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
78 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
79 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 101,598
(1.64 %)
80 Catalonian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965112155.1		 76,765
(6.15 %)		 14,333
(1.34 %)		 20,157
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 5,086,552
(52.93 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,595
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
81 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025 genbank)
GCA_051106095.1		 n/a 13,804
(1.14 %)		 17,976
(1.89 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 91
(100.00 %)		 940,145
(4.00 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,484
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
82 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025 refseq)
GCF_051106095.1		 67,761
(7.72 %)		 13,968
(1.18 %)		 17,955
(1.90 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 90
(100.00 %)		 3,462,868
(44.39 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,488
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
83 central bearded dragon (v1 2017)
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 48,137
(1.31 %)
84 central bearded dragon (v2 2025)
GCF_047335585.1		 55,907
(5.04 %)		 13,840
(1.12 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 985,251
(3.91 %)		 586,669
(2.40 %)		 9,004,514
(35.92 %)		 67,220
(2.06 %)
85 Chile mountains false toad (hap1 2026)
GCA_060712405.1		 n/a 14,336
(0.42 %)		 27,367
(1.07 %)		 n/a 43.15
(102.75 %)		 2,470
(0.01 %)		 823
(100.00 %)		 9,080,556
(47.42 %)		 3,920,854
(20.34 %)		 16,577,137
(63.23 %)		 220,660
(2.16 %)
86 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 46,638
(1.19 %)
87 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1		 n/a 15,365
(1.01 %)		 20,233
(1.64 %)		 n/a 44.88
(100.00 %)		 852
(0.00 %)		 1,553
(100.00 %)		 2,058,732
(7.85 %)		 845,208
(2.04 %)		 11,639,209
(43.21 %)		 116,459
(3.04 %)
88 Chinese soft-shelled turtle (Daiwa-1 2012)
GCF_000230535.1		 45,454
(3.08 %)		 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 95,997
(2.06 %)
89 Chinese soft-shelled turtle (JC-2024 2025)
GCF_049634645.1		 71,700
(4.67 %)		 14,353
(0.98 %)		 21,113
(1.70 %)		 n/a 45.70
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 276
(100.00 %)		 1,130,433
(10.15 %)		 509,375
(2.85 %)		 10,803,789
(36.98 %)		 142,416
(4.34 %)
90 cliff chirping frog (hap1 2026)
GCA_055470875.1		 n/a 14,195
(0.41 %)		 37,646
(1.41 %)		 n/a 44.76
(102.71 %)		 1,094
(0.00 %)		 1,175
(100.00 %)		 8,999,851
(42.06 %)		 2,656,367
(21.89 %)		 19,256,217
(59.70 %)		 564,413
(7.00 %)
91 cloudy catshark (Kashiwa2021f 2025)
GCF_047496885.1		 69,529
(1.56 %)		 13,335
(0.25 %)		 28,473
(0.76 %)		 n/a 49.26
(99.99 %)		 4,654
(0.01 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,668,127
(2.89 %)		 2,316,011
(21.50 %)		 22,209,447
(67.48 %)		 706,094
(13.30 %)
92 Cochin Forest cane turtle (hap1 2026)
GCA_060712455.1		 n/a 14,910
(1.02 %)		 18,757
(1.53 %)		 n/a 45.04
(102.84 %)		 394
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 4,892,633
(53.58 %)		 444,811
(4.35 %)		 10,374,622
(36.24 %)		 118,141
(3.29 %)
93 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 42,857
(0.54 %)
94 coelacanth (alternate hap 2024)
GCA_037215105.1		 n/a 6,557
(0.42 %)		 33,169
(3.43 %)		 n/a 42.50
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 34,012
(100.00 %)		 3,932,420
(65.13 %)		 507,198
(3.35 %)		 6,831,314
(53.31 %)		 66,510
(2.53 %)
95 coelacanth (primary hap 2024 genbank)
GCA_037176945.1		 n/a 14,050
(0.65 %)		 28,429
(2.77 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 8,627,529
(65.90 %)		 1,047,268
(3.01 %)		 15,613,476
(54.44 %)		 140,027
(2.34 %)
96 coelacanth (primary hap 2024 refseq)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 140,027
(2.34 %)
97 collared eel (2026)
GCA_978019975.1		 n/a 16,771
(1.95 %)		 29,104
(4.65 %)		 n/a 42.54
(102.83 %)		 91
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 2,469,340
(30.58 %)		 621,719
(7.65 %)		 6,463,607
(28.25 %)		 90,015
(4.18 %)
98 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
99 Columbretes wall lizard (hap2.1 2025)
GCA_965178375.1		 n/a 13,776
(1.35 %)		 19,389
(2.28 %)		 n/a 43.97
(99.99 %)		 867
(0.01 %)		 1,011
(99.99 %)		 816,540
(4.18 %)		 497,364
(6.95 %)		 6,729,569
(39.28 %)		 89,601
(3.31 %)
100 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 30,098
(0.96 %)
101 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
102 common eastern froglet (primary hap 2026)
GCF_055691185.1		 75,766
(2.52 %)		 14,208
(0.61 %)		 40,998
(2.50 %)		 n/a 44.69
(99.99 %)		 1,804
(0.01 %)		 872
(100.00 %)		 4,569,042
(21.79 %)		 2,371,776
(18.54 %)		 14,121,769
(49.79 %)		 487,488
(7.45 %)
103 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 581,115
(7.68 %)
104 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 36,264
(1.27 %)
105 common lizard (alternate hap 2023)
GCA_963506595.1		 n/a 12,464
(1.37 %)		 21,834
(2.42 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 n/a 8,057
(100.00 %)		 3,484,058
(44.97 %)		 434,014
(3.31 %)		 6,610,967
(35.30 %)		 78,299
(2.87 %)
106 common lizard (primary hap 2023)
GCA_963506605.1		 n/a 14,281
(1.46 %)		 19,707
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 49
(100.00 %)		 4,263,449
(45.66 %)		 513,321
(3.73 %)		 7,172,746
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
107 common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025)
GCA_965207765.1		 n/a 14,100
(1.43 %)		 19,472
(2.36 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 884,631
(4.70 %)		 507,148
(3.64 %)		 7,206,478
(37.26 %)		 89,393
(2.87 %)
108 common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025)
GCA_965208345.1		 n/a 14,258
(1.44 %)		 19,379
(2.37 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 169
(100.00 %)		 884,140
(4.69 %)		 506,524
(3.53 %)		 7,214,124
(37.18 %)		 89,651
(2.88 %)
109 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
110 common musk turtle (alternate hap 2023)
GCA_032164215.1		 n/a 14,229
(1.29 %)		 18,555
(1.90 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,045
(0.01 %)		 1,120
(99.99 %)		 3,408,527
(40.89 %)		 590,538
(3.26 %)		 8,678,744
(30.12 %)		 118,052
(4.00 %)
111 common newt (v1 alternate hap 2024)
GCA_964261385.1		 n/a 14,340
(0.07 %)		 256,786
(1.73 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 2,255,303
(7.95 %)
112 common newt (v1 primary hap 2024 genbank)
GCA_964263255.1		 n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 101,185,912
(47.58 %)		 2,684,793
(7.99 %)
113 common newt (v2 alternate hap 2026)
GCA_964261385.2		 n/a 14,340
(0.07 %)		 258,898
(1.73 %)		 n/a 44.54
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 2,255,303
(7.95 %)
114 common newt (v2 primary hap 2026 refseq)
GCF_964263255.1		 64,379
(0.42 %)		 16,999
(0.08 %)		 229,922
(1.61 %)		 n/a 45.02
(101.29 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,248
(100.00 %)		 4,839,266
(1.50 %)		 10,251,753
(12.52 %)		 101,183,555
(47.58 %)		 2,684,759
(7.99 %)
115 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
116 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
117 common stingray (2026)
GCA_987106705.1		 n/a 12,606
(0.38 %)		 26,958
(1.17 %)		 n/a 43.42
(102.68 %)		 1,662
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 10,190,334
(68.59 %)		 952,015
(14.78 %)		 20,089,208
(55.29 %)		 115,829
(2.54 %)
118 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 405,097
(4.49 %)
119 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
120 common wall lizard (hap1 2024 genbank)
GCA_964188315.1		 n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
121 common wall lizard (hap1 2024 refseq)
GCF_964188315.1		 58,901
(5.59 %)		 14,352
(1.39 %)		 20,013
(2.30 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 4,727,760
(49.94 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,096,752
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
122 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 113,458
(3.63 %)
123 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,519
(4.85 %)		 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 122,507
(3.69 %)
124 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 64,946
(2.08 %)
125 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 66,926
(2.14 %)
126 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 24,118,603
(71.52 %)		 991,009
(4.86 %)
127 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 24,178,131
(71.23 %)		 990,274
(4.84 %)
128 Couch's spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_054954225.1		 n/a 13,528
(1.90 %)		 19,914
(3.61 %)		 n/a 39.98
(98.72 %)		 605
(1.28 %)		 578
(100.00 %)		 2,481,494
(34.56 %)		 623,950
(10.48 %)		 5,737,146
(34.46 %)		 42,554
(2.79 %)
129 Couch's spadefoot toad (hap2 2026)
GCA_054954145.1		 n/a 13,481
(1.82 %)		 21,941
(3.80 %)		 n/a 39.97
(99.23 %)		 620
(0.77 %)		 494
(100.00 %)		 2,625,418
(35.92 %)		 713,292
(13.02 %)		 5,588,085
(36.90 %)		 42,871
(2.71 %)
130 crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024)
GCA_040207535.1		 n/a 13,876
(1.22 %)		 18,274
(2.01 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 1,021,810
(6.04 %)		 410,843
(1.76 %)		 8,147,007
(34.90 %)		 79,154
(2.34 %)
131 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 107,080
(3.15 %)
132 Cretan wall lizard (primary hap 2023 genbank)
GCA_951804945.1		 n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
133 Cretan wall lizard (primary hap 2023 refseq)
GCF_951804945.1		 62,110
(5.47 %)		 14,322
(1.40 %)		 19,303
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,986,518
(46.26 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,353
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
134 cuckoo ray (2025)
GCA_965643135.1		 n/a 11,948
(0.63 %)		 26,240
(1.77 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 2,173
(0.01 %)		 1,503
(100.00 %)		 9,829,377
(67.19 %)		 1,120,890
(8.92 %)		 10,135,837
(56.08 %)		 194,688
(3.92 %)
135 Dalmatian wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964234715.1		 61,269
(4.93 %)		 14,329
(1.34 %)		 20,474
(2.25 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 386
(100.00 %)		 4,958,256
(53.05 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,837,755
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
136 Darwin's frog (hap1 2025)
GCF_050947455.1		 75,763
(2.00 %)		 13,808
(0.52 %)		 34,029
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,942
(100.00 %)		 1,105,374
(2.22 %)		 2,251,358
(18.25 %)		 13,843,878
(63.42 %)		 443,624
(6.38 %)
137 Darwin's frog (hap2 2025)
GCA_050947465.1		 n/a 13,442
(0.54 %)		 32,134
(1.61 %)		 n/a 42.92
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 10,591,581
(59.76 %)		 2,041,017
(15.35 %)		 13,574,848
(62.16 %)		 428,658
(6.43 %)
138 Delalande's beaked blind snake (hap1 2026)
GCA_057127545.1		 n/a 13,330
(1.11 %)		 17,807
(1.86 %)		 n/a 41.60
(99.99 %)		 642
(0.01 %)		 125
(100.00 %)		 4,372,440
(36.86 %)		 631,618
(2.38 %)		 8,665,237
(37.98 %)		 70,554
(2.23 %)
139 Delalande's beaked blind snake (hap2 2026)
GCA_057127535.1		 n/a 13,373
(1.12 %)		 17,783
(1.85 %)		 n/a 41.60
(99.99 %)		 624
(0.01 %)		 111
(100.00 %)		 4,361,437
(36.83 %)		 631,970
(2.38 %)		 8,688,526
(38.15 %)		 70,030
(2.21 %)
140 desert lancehead (hap1 2026)
GCA_058248175.2		 n/a 15,061
(1.16 %)		 20,290
(1.86 %)		 n/a 40.66
(102.78 %)		 393
(0.00 %)		 205
(100.00 %)		 3,578,028
(54.47 %)		 933,805
(10.67 %)		 7,669,382
(47.52 %)		 91,099
(2.76 %)
141 diablito poison frog (Paru LO004 2023)
GCA_033576555.1		 n/a 11,147
(0.26 %)		 39,500
(1.20 %)		 n/a 44.55
(99.89 %)		 56,659
(0.11 %)		 71,942
(99.89 %)		 9,076,667
(51.42 %)		 3,074,045
(13.04 %)		 16,014,353
(69.89 %)		 606,993
(6.09 %)
142 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
143 diamondback terrapin (hap2 2023)
GCA_027887205.1		 n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 111,129
(2.68 %)
144 duckbill oceanic eel (2026)
GCA_987430295.1		 n/a 18,348
(0.97 %)		 58,748
(4.23 %)		 n/a 43.11
(102.85 %)		 301
(0.00 %)		 152
(100.00 %)		 6,695,343
(51.23 %)		 1,348,923
(14.73 %)		 8,982,328
(52.54 %)		 198,946
(5.68 %)
145 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 genbank)
GCA_039654945.1		 n/a 14,300
(0.31 %)		 45,262
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 10,980,035
(47.79 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
146 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 refseq)
GCF_039654945.1		 65,453
(1.48 %)		 14,300
(0.31 %)		 45,268
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 1,777,277
(2.39 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
147 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 52,895
(2.12 %)
148 eastern musk turtle (MuskTurtle02 alternate hap 2026)
GCA_032164215.2		 n/a 13,592
(1.23 %)		 18,011
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 769
(99.99 %)		 3,417,560
(41.81 %)		 621,567
(3.54 %)		 8,327,641
(30.43 %)		 117,733
(4.04 %)
149 Eastern musk turtle (MuskTurtle02 primary hap 2026)
GCA_032164245.2		 n/a 14,208
(1.29 %)		 18,423
(1.89 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,079
(0.01 %)		 74
(100.00 %)		 3,408,591
(40.89 %)		 590,719
(3.26 %)		 8,678,800
(30.12 %)		 118,053
(4.00 %)
150 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 117,734
(4.05 %)
151 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 614,432
(5.85 %)
152 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 618,204
(5.89 %)
153 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 41,081
(3.43 %)
154 elongated tortoise (hap1 2025)
GCA_050000095.2		 n/a 14,769
(1.01 %)		 18,561
(1.53 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 169
(0.00 %)		 207
(100.00 %)		 5,015,434
(53.77 %)		 367,754
(2.17 %)		 10,980,259
(34.90 %)		 82,369
(2.28 %)
155 elongated tortoise (hap2 2025)
GCA_050000115.1		 n/a 14,858
(1.00 %)		 18,820
(1.51 %)		 n/a 44.35
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 586
(100.00 %)		 5,006,492
(53.37 %)		 397,554
(3.24 %)		 10,915,197
(35.50 %)		 82,579
(2.28 %)
156 Emei moustache toad (SX-2025 2025)
GCA_054131545.1		 n/a 13,782
(0.57 %)		 40,311
(2.03 %)		 n/a 43.92
(100.00 %)		 1,479
(0.00 %)		 1,492
(100.00 %)		 9,232,515
(76.18 %)		 2,040,137
(11.03 %)		 12,972,928
(60.26 %)		 511,382
(8.34 %)
157 epaulette shark (alternate hap 2021)
GCA_020745765.1		 n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 42,917
(1.08 %)
158 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
159 Erhard's wall lizard (hap1.2 2026 genbank)
GCA_964252035.2		 n/a 13,941
(1.37 %)		 19,666
(2.30 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 4,971,098
(51.39 %)		 526,603
(3.30 %)		 7,004,419
(38.57 %)		 89,692
(2.87 %)
160 Erhard's wall lizard (hap1.2 2026 refseq)
GCF_964252035.2		 60,399
(5.16 %)		 13,941
(1.37 %)		 19,667
(2.30 %)		 n/a 43.79
(101.43 %)		 836
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 4,771,967
(51.33 %)		 526,687
(3.30 %)		 7,004,420
(38.57 %)		 89,692
(2.87 %)
161 Erhard's wall lizard (hap2.2 2026)
GCA_964251985.2		 n/a 13,878
(1.40 %)		 20,097
(2.41 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,202
(99.99 %)		 4,873,253
(50.27 %)		 516,963
(3.38 %)		 6,833,738
(37.92 %)		 87,923
(2.92 %)
162 European brook lamprey (2025)
GCF_965212315.1		 37,400
(7.69 %)		 8,181
(0.85 %)		 37,330
(4.57 %)		 n/a 48.46
(99.98 %)		 873
(0.02 %)		 3,066
(99.98 %)		 3,708,295
(61.62 %)		 873,872
(14.29 %)		 4,763,033
(46.24 %)		 139,528
(43.10 %)
163 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
164 European conger (alternate hap 2023)
GCA_963514125.1		 n/a 16,952
(1.95 %)		 37,050
(5.24 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 n/a 3,769
(100.00 %)		 2,413,696
(36.12 %)		 866,233
(11.37 %)		 5,685,752
(33.48 %)		 112,201
(5.57 %)
165 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 127,837
(8.05 %)
166 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
167 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
168 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 82,695
(2.80 %)
169 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
170 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
171 European pond turtle (hap2 2023)
GCA_028017845.1		 n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 138,047
(2.94 %)
172 European river lamprey (alternate hap 2024)
GCA_964198585.1		 n/a 7,082
(0.70 %)		 37,019
(4.34 %)		 n/a 49.03
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 5,726
(100.00 %)		 3,762,664
(64.70 %)		 1,005,839
(17.80 %)		 4,592,233
(49.09 %)		 153,841
(41.42 %)
173 European river lamprey (primary hap 2024 genbank)
GCA_964198595.1		 n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
174 European river lamprey (primary hap 2024 refseq)
GCF_964198595.1		 36,555
(6.20 %)		 7,604
(0.70 %)		 36,803
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,496
(100.00 %)		 4,068,759
(65.84 %)		 1,165,417
(20.23 %)		 4,931,505
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
175 Far Eastern brook lamprey (v1 LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
176 Far Eastern brook lamprey (v2 LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.2		 37,933
(7.32 %)		 7,858
(0.72 %)		 39,278
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,945
(100.00 %)		 4,065,593
(61.75 %)		 1,192,260
(15.54 %)		 5,304,096
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
177 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 67,007
(1.51 %)
178 Filfola wall lizard (hap1.1 2024 genbank)
GCA_964270895.1		 n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
179 Filfola wall lizard (hap1.1 2024 refseq)
GCF_964270895.1		 74,789
(6.22 %)		 14,358
(1.40 %)		 20,324
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 349
(100.00 %)		 4,963,872
(50.70 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,009,851
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
180 Filfola wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 81,312
(2.54 %)
181 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 74,669
(1.25 %)
182 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,236
(0.68 %)		 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 34,823,806
(63.74 %)		 n/a
183 flapper skate (hap1.1 2026)
GCA_983203515.1		 n/a 12,020
(0.45 %)		 32,606
(1.57 %)		 n/a 44.80
(100.53 %)		 4,961
(0.02 %)		 3,667
(100.00 %)		 11,646,386
(74.12 %)		 2,050,507
(10.64 %)		 12,597,039
(62.58 %)		 337,808
(5.43 %)
184 flapper skate (hap2.1 2026)
GCA_983203605.1		 n/a 11,699
(0.49 %)		 29,667
(1.60 %)		 n/a 44.55
(99.99 %)		 4,331
(0.02 %)		 2,143
(100.00 %)		 10,758,595
(73.15 %)		 1,664,028
(8.60 %)		 11,722,103
(60.48 %)		 299,094
(5.16 %)
185 flatback sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152275.1		 48,321
(3.34 %)		 14,858
(1.05 %)		 18,090
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,289,321
(12.22 %)		 319,643
(1.38 %)		 10,785,197
(32.95 %)		 52,168
(1.81 %)
186 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1		 n/a 14,229
(1.06 %)		 16,514
(1.49 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 261
(0.00 %)		 322
(100.00 %)		 4,567,737
(43.65 %)		 288,964
(1.17 %)		 10,681,579
(32.83 %)		 47,249
(1.62 %)
187 Fleay's barred frog (hap1 2024 genbank)
GCA_038048845.1		 n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
188 Fleay's barred frog (hap1 2024 refseq)
GCF_038048845.1		 56,722
(2.42 %)		 14,321
(0.67 %)		 22,670
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,683
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,292,724
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
189 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 64,121
(0.88 %)
190 Florida worm lizard (hap1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 47,933
(1.03 %)
191 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 47,454
(1.03 %)
192 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 47,453
(1.03 %)
193 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 genbank)
GCA_048569485.1		 n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
194 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 refseq)
GCF_048569485.1		 69,304
(1.30 %)		 13,964
(0.31 %)		 43,453
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,773
(0.01 %)		 3,643
(100.00 %)		 2,033,939
(2.50 %)		 4,040,312
(20.45 %)		 20,439,939
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
195 frog A.baeobatrachus (hap2 2025)
GCA_048569465.1		 n/a 13,992
(0.31 %)		 43,409
(1.27 %)		 n/a 46.36
(99.99 %)		 3,799
(0.01 %)		 2,426
(100.00 %)		 1,997,963
(2.50 %)		 4,002,458
(19.16 %)		 20,517,633
(69.30 %)		 1,152,817
(12.93 %)
196 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 235,170
(4.50 %)
197 Gaboon caecilian (primary hap 2021)
GCF_902459505.2		 54,715
(1.72 %)		 14,269
(0.52 %)		 29,024
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 596
(99.85 %)		 11,725,554
(74.57 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,602
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
198 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
199 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,297
(2.61 %)		 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 26,651
(0.60 %)
200 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 39,919
(1.95 %)
201 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 40,660
(1.87 %)
202 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1		 53,223
(2.04 %)		 12,432
(0.38 %)		 25,243
(1.14 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 863,834
(1.59 %)		 947,015
(13.41 %)		 20,234,736
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
203 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 91,414
(1.45 %)
204 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1		 n/a 14,628
(0.85 %)		 18,382
(1.34 %)		 n/a 44.78
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 2,039
(100.00 %)		 1,254,940
(9.13 %)		 434,666
(6.73 %)		 12,070,445
(35.52 %)		 51,563
(1.91 %)
205 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 51,411
(1.88 %)
206 Gila monster (Gila_16-S 2026)
GCF_057233095.1		 66,395
(3.96 %)		 14,385
(0.86 %)		 17,870
(1.34 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 20
(100.00 %)		 6,454,936
(49.83 %)		 703,981
(7.97 %)		 11,888,999
(48.87 %)		 165,685
(5.15 %)
207 gold dust stingray (hap1 2026)
GCA_055471165.1		 n/a 12,763
(0.32 %)		 26,283
(0.98 %)		 n/a 41.62
(102.78 %)		 1,114
(0.00 %)		 1,101
(100.00 %)		 10,563,952
(74.49 %)		 946,334
(14.98 %)		 22,595,289
(58.96 %)		 74,808
(0.84 %)
208 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 164,021
(2.52 %)
209 golden mantella (hap2 2025)
GCA_048565335.1		 n/a 13,400
(0.55 %)		 28,454
(1.70 %)		 n/a 40.91
(99.98 %)		 3,921
(0.02 %)		 2,611
(100.00 %)		 1,203,975
(3.36 %)		 2,447,119
(16.68 %)		 14,661,554
(53.34 %)		 160,856
(2.46 %)
210 golden poison dart frog (yellow primary hap 2024)
GCF_046119375.1		 128,151
(0.97 %)		 15,383
(0.19 %)		 56,843
(1.14 %)		 n/a 44.28
(100.00 %)		 1,234
(0.00 %)		 9,343
(100.00 %)		 2,355,255
(2.05 %)		 5,350,104
(37.88 %)		 20,333,848
(81.77 %)		 874,818
(5.79 %)
211 goldentail moray (2026)
GCA_987191265.1		 n/a 15,751
(0.97 %)		 40,333
(3.49 %)		 n/a 41.72
(102.85 %)		 76
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 5,191,739
(59.75 %)		 765,480
(6.84 %)		 9,935,402
(42.21 %)		 116,467
(2.57 %)
212 goldspotted eel (2025)
GCA_975146105.1		 n/a 16,879
(1.43 %)		 38,748
(4.22 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 147
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,198,550
(33.91 %)		 741,217
(8.84 %)		 7,140,094
(39.50 %)		 136,266
(4.25 %)
213 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,455
(3.18 %)		 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
214 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 61,680
(2.32 %)
215 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan lineage primary hap 2019)
GCA_007399415.1		 n/a 14,852
(1.00 %)		 18,597
(1.55 %)		 31,974
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,268
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
216 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq)
GCF_029215685.1		 28,358
(2.73 %)		 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,792
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,127
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
217 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 72,941
(2.59 %)
218 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,664
(4.30 %)		 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 80,718
(1.90 %)
219 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 62,978
(2.00 %)
220 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 60,835
(1.92 %)
221 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,165
(1.88 %)		 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 98,862
(1.64 %)
222 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 167
(5.51 %)
223 great white shark (primary hap 2021 genbank)
GCA_017639515.1		 n/a 13,511
(0.38 %)		 19,263
(0.92 %)		 n/a 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 7,178,936
(64.10 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,189
(52.42 %)		 77,057
(2.22 %)
224 great white shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
225 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 56,404
(1.78 %)
226 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,109
(3.63 %)		 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
227 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
228 green sea turtle (primary hap 2021)
GCA_015237465.2		 n/a 15,016
(1.11 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 92
(100.00 %)		 3,631,238
(44.71 %)		 304,302
(1.25 %)		 11,135,013
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
229 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 45,469
(1.48 %)
230 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,353
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
231 Greenland sleeper shark (GS21.2 2025 genbank)
GCA_052327205.1		 n/a 13,229
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 11,933
(0.09 %)		 4,461
(99.98 %)		 1,160,458
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,819
(75.59 %)		 668,934
(10.22 %)
232 Greenland sleeper shark (GS21.2 2025 refseq)
GCF_052327205.1		 60,259
(1.57 %)		 13,227
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 11,933
(0.09 %)		 2,111
(100.00 %)		 1,160,455
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,792
(75.59 %)		 668,934
(10.22 %)
233 grey reef shark (hapA 2025)
GCF_965287045.1		 42,414
(2.31 %)		 13,005
(0.55 %)		 18,669
(1.27 %)		 n/a 43.98
(100.00 %)		 883
(0.00 %)		 1,521
(100.00 %)		 7,459,423
(58.87 %)		 658,213
(6.81 %)		 13,646,347
(46.40 %)		 36,259
(1.07 %)
234 grey reef shark (hapB 2025)
GCA_965295155.1		 n/a 12,988
(0.54 %)		 18,753
(1.27 %)		 n/a 44.00
(100.00 %)		 876
(0.00 %)		 2,410
(100.00 %)		 7,462,980
(58.92 %)		 660,217
(6.95 %)		 13,645,872
(46.47 %)		 36,662
(1.11 %)
235 hawksbill sea turtle (B2_1 2023)
GCA_030012505.1		 n/a 14,897
(1.00 %)		 18,251
(1.51 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 1,315,164
(12.07 %)		 347,678
(3.60 %)		 10,892,216
(35.32 %)		 49,532
(1.65 %)
236 hawksbill sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152235.1		 n/a 14,710
(1.02 %)		 17,589
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 63
(100.00 %)		 1,289,035
(12.18 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,433
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
237 hawksbill sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152235.1		 41,141
(2.68 %)		 14,805
(1.06 %)		 17,460
(1.51 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 57
(100.00 %)		 4,249,522
(49.54 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,437
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
238 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1		 n/a 14,843
(1.02 %)		 18,006
(1.54 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 132
(0.12 %)		 173
(99.88 %)		 1,288,292
(12.14 %)		 318,803
(2.15 %)		 11,148,397
(34.07 %)		 46,922
(1.41 %)
239 hellbender (hap1 2026)
GCA_060551615.1		 n/a 16,634
(0.04 %)		 215,099
(0.73 %)		 n/a 49.06
(101.33 %)		 24,119
(0.00 %)		 15,812
(100.00 %)		 42,614,233
(21.00 %)		 82,063,457
(21.73 %)		 159,296,257
(65.08 %)		 2,185,612
(3.11 %)
240 hickatee (hap1 2025)
GCA_054099655.1		 n/a 14,920
(1.21 %)		 18,649
(1.75 %)		 n/a 43.67
(100.00 %)		 132
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 3,220,305
(41.80 %)		 325,597
(8.20 %)		 9,635,325
(31.95 %)		 49,601
(1.77 %)
241 hickatee (hap2 2025)
GCA_054099715.1		 n/a 14,893
(1.22 %)		 18,699
(1.80 %)		 n/a 43.79
(100.00 %)		 137
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 3,212,991
(39.89 %)		 328,796
(6.89 %)		 9,501,793
(30.78 %)		 49,575
(1.79 %)
242 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,122
(1.87 %)		 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 219,772
(3.92 %)
243 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 89,340
(2.10 %)
244 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 82,276
(1.85 %)
245 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 20,630,058
(68.85 %)		 89,340
(2.10 %)
246 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1		 n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 244,270
(5.02 %)
247 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
248 Hungarian meadow viper (primary hap 2022)
GCF_947247035.1		 36,135
(3.46 %)		 13,432
(1.20 %)		 18,654
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 3,633,666
(50.97 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,427,621
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
249 Iberian parsley frog (primary hap 2024)
GCA_036172795.1		 n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 77,721
(1.73 %)
250 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 81,311,590
(56.46 %)		 1,581,360
(4.00 %)
251 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1		 57,032
(0.47 %)		 15,184
(0.10 %)		 72,314
(0.62 %)		 n/a 45.93
(100.00 %)		 1,829
(0.00 %)		 616
(100.00 %)		 4,343,624
(1.32 %)		 6,295,886
(8.29 %)		 2,445
(100.00 %)		 1,546,882
(4.02 %)
252 Ibiza wall lizard (hap1.3 2026 genbank)
GCA_964106645.3		 n/a 14,358
(1.39 %)		 20,037
(2.30 %)		 n/a 43.97
(99.98 %)		 1,505
(0.02 %)		 305
(100.00 %)		 4,977,258
(51.04 %)		 473,070
(2.71 %)		 7,060,127
(38.23 %)		 96,567
(3.15 %)
253 Ibiza wall lizard (hap1.3 2026 refseq)
GCF_964106645.2		 68,228
(5.99 %)		 14,361
(1.39 %)		 20,038
(2.30 %)		 n/a 43.95
(101.31 %)		 1,505
(0.02 %)		 305
(100.00 %)		 4,780,857
(50.99 %)		 473,079
(2.71 %)		 7,060,124
(38.23 %)		 96,567
(3.15 %)
254 Ibiza wall lizard (hap2.3 2026)
GCA_964106635.3		 n/a 13,838
(1.44 %)		 19,052
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,541
(99.98 %)		 4,712,744
(49.63 %)		 440,320
(2.30 %)		 6,773,549
(37.14 %)		 89,220
(3.03 %)
255 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 47,381
(1.37 %)
256 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1		 n/a 14,623
(1.04 %)		 18,405
(1.58 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 629
(100.00 %)		 1,283,544
(11.43 %)		 298,912
(1.85 %)		 10,728,482
(32.52 %)		 72,908
(2.13 %)
257 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 74,354
(2.05 %)
258 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 76,879
(3.71 %)
259 Indo-Pacific tarpon (primary hap 2020)
GCA_013368585.1		 n/a 18,305
(2.47 %)		 29,764
(5.45 %)		 n/a 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,530
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,961
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
260 inshore hagfish (2023)
GCA_900186335.3		 n/a 6,137
(0.40 %)		 23,364
(2.60 %)		 n/a 46.68
(54.88 %)		 332,729
(45.17 %)		 342,008
(54.83 %)		 1,099,633
(8.08 %)		 1,181,678
(6.90 %)		 7,860,245
(28.44 %)		 142,778
(3.95 %)
261 inshore hagfish (2026)
GCF_056783735.1		 69,177
(4.47 %)		 6,275
(0.30 %)		 31,017
(2.64 %)		 n/a 42.67
(99.92 %)		 3,288
(0.08 %)		 3,194
(100.00 %)		 1,279,433
(8.97 %)		 1,549,601
(15.25 %)		 8,247,316
(62.71 %)		 168,414
(11.99 %)
262 Italian wall lizard (hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 106,667
(3.79 %)
263 Italian wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 98,815
(3.65 %)
264 Japanese eel (BU-2020EF 2022)
GCA_025169545.1		 n/a 17,160
(2.12 %)		 34,420
(5.19 %)		 n/a 43.64
(99.43 %)		 725
(0.57 %)		 86
(100.00 %)		 902,705
(5.61 %)		 903,851
(8.80 %)		 5,865,906
(28.58 %)		 131,092
(7.95 %)
265 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 503,637
(6.56 %)
266 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1		 n/a 14,833
(0.26 %)		 30,853
(0.75 %)		 n/a 47.12
(99.98 %)		 5,953
(0.02 %)		 5,626
(100.00 %)		 1,238,549
(4.06 %)		 2,718,867
(21.85 %)		 20,608,860
(73.38 %)		 518,286
(6.88 %)
267 Kemp's ridley sea turtle (hap1 2025)
GCF_965140285.1		 65,480
(3.90 %)		 14,975
(1.06 %)		 17,809
(1.52 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 4,215,923
(50.05 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
268 Kenyan clawed frog (NASCO 2022)
GCA_024363595.1		 n/a 21,451
(1.69 %)		 23,652
(2.05 %)		 n/a 38.65
(79.93 %)		 233,029
(20.10 %)		 23,435
(100.00 %)		 5,285,530
(44.53 %)		 579,815
(1.62 %)		 12,925,637
(32.47 %)		 63,201
(0.69 %)
269 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 49,808
(4.28 %)
270 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 104,556
(4.39 %)
271 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 110,631
(4.07 %)
272 leatherback sea turtle (primary hap 2021)
GCA_009764565.4		 n/a 14,844
(1.08 %)		 16,357
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 41
(100.00 %)		 4,070,850
(47.24 %)		 304,774
(1.14 %)		 11,121,781
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
273 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 25,133
(1.42 %)
274 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
275 Leishan spiny toad (GZLS1 2019)
GCA_009667805.1		 n/a 14,385
(0.55 %)		 44,355
(2.02 %)		 n/a 43.74
(99.99 %)		 3,282
(0.01 %)		 5,302
(100.00 %)		 1,177,889
(2.23 %)		 2,229,424
(11.42 %)		 13,846,381
(60.05 %)		 527,079
(7.98 %)
276 leopard gecko (TG4126 2023 genbank)
GCA_028583425.1		 n/a 14,382
(0.95 %)		 23,083
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 61
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 5,522,949
(40.69 %)		 557,242
(2.88 %)		 11,096,121
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
277 leopard gecko (TG4126 2023 refseq)
GCF_028583425.1		 37,133
(2.89 %)		 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
278 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 87,750
(1.43 %)
279 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 86,200
(2.56 %)
280 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,021
(3.35 %)		 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 205,567
(4.36 %)
281 lizards A.tigris stejnegeri (HBS 135688 alternate hap 2025)
GCA_023333555.2		 n/a 11,547
(1.21 %)		 15,609
(1.97 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 3,683,979
(51.31 %)		 480,268
(5.67 %)		 7,021,351
(38.84 %)		 45,241
(2.12 %)
282 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
283 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,935
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 1,037,146
(4.72 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
284 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 248,142
(10.84 %)
285 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 208,005
(7.18 %)
286 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1		 n/a 12,359
(0.99 %)		 16,644
(1.66 %)		 n/a 45.69
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 1,109,222
(8.21 %)		 607,835
(4.09 %)		 9,080,052
(42.56 %)		 158,727
(6.84 %)
287 lizards E.multicarinata webbii (San Diego HBS135686 alternate hap 2024)
GCA_023053675.2		 n/a 14,236
(1.17 %)		 19,573
(1.94 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 28
(0.00 %)		 655
(100.00 %)		 6,106,640
(52.43 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,804
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
288 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 52,987
(2.59 %)
289 lizards L.agilis (primary hap 2019)
GCA_009819535.1		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,235
(2.45 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,417
(1.76 %)		 7,135,058
(34.49 %)		 76,055
(2.68 %)
290 lizards P.bocagei (hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
291 lizards P.bocagei (hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 103,858
(4.10 %)
292 lizards P.erhardii (hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
293 lizards P.erhardii (hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 89,526
(2.96 %)
294 lizards P.melisellensis (hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
295 lizards P.melisellensis (hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 82,575
(2.83 %)
296 lizards P.pityusensis (hap1.2 2024 genbank)
GCA_964106645.2		 n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
297 lizards P.pityusensis (hap1.2 2024 refseq)
GCF_964106645.1		 68,289
(5.99 %)		 14,362
(1.39 %)		 20,488
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 336
(100.00 %)		 4,977,407
(51.01 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,060,761
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
298 lizards P.pityusensis (hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 89,229
(3.04 %)
299 lizards P.tiliguerta (hap2.2 2025)
GCA_965153305.2		 n/a 13,808
(1.46 %)		 19,314
(2.39 %)		 n/a 44.01
(99.99 %)		 1,003
(0.01 %)		 307
(100.00 %)		 4,685,494
(49.03 %)		 429,388
(4.28 %)		 6,635,321
(36.92 %)		 92,746
(3.04 %)
300 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
301 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1		 n/a 13,794
(1.32 %)		 19,189
(2.22 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 852
(0.01 %)		 151
(100.00 %)		 841,282
(5.59 %)		 483,392
(6.01 %)		 6,750,191
(40.39 %)		 101,153
(3.51 %)
302 lizards T.scincoides (hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
303 loggerhead turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965140235.1		 n/a 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
304 loggerhead turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965140235.1		 65,475
(4.14 %)		 14,764
(1.02 %)		 17,658
(1.52 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
305 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1		 n/a 14,889
(1.04 %)		 17,867
(1.54 %)		 n/a 44.11
(99.97 %)		 52
(0.03 %)		 85
(99.97 %)		 1,300,553
(12.44 %)		 332,623
(1.45 %)		 10,721,628
(34.40 %)		 53,746
(1.50 %)
306 loggerhead turtle (v1 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,644
(3.99 %)		 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
307 loggerhead turtle (v2 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.2		 61,631
(3.99 %)		 14,676
(1.05 %)		 17,408
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.90 %)		 744
(0.10 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,254,882
(12.49 %)		 319,728
(1.29 %)		 10,705,331
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
308 longcomb sawfish (2026)
GCA_988281235.1		 n/a 12,441
(0.65 %)		 19,960
(1.52 %)		 n/a 42.60
(102.73 %)		 759
(0.01 %)		 1,116
(99.99 %)		 5,006,729
(55.79 %)		 451,782
(4.42 %)		 11,722,101
(40.90 %)		 57,705
(1.86 %)
309 Madagascar ground gecko (Pp20150507F 2025)
GCF_049243985.1		 63,376
(4.98 %)		 14,114
(1.20 %)		 21,281
(2.04 %)		 n/a 44.75
(98.94 %)		 2,618
(1.06 %)		 80
(100.00 %)		 4,103,102
(50.19 %)		 494,624
(8.01 %)		 8,310,560
(39.86 %)		 87,981
(3.16 %)
310 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 61,669
(2.47 %)
311 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 65,260
(2.74 %)
312 marbled electric ray (2025)
GCA_977017645.1		 n/a 12,155
(0.24 %)		 25,844
(0.70 %)		 n/a 43.83
(99.99 %)		 3,402
(0.01 %)		 4,566
(100.00 %)		 10,762,422
(61.06 %)		 1,754,113
(25.79 %)		 13,259,628
(78.62 %)		 445,127
(7.22 %)
313 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 41,638
(1.70 %)
314 marine toad (2024)
GCA_900303285.2		 n/a 14,493
(0.58 %)		 34,827
(1.87 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 6,072
(0.25 %)		 13,196
(99.75 %)		 7,310,953
(73.85 %)		 2,117,104
(17.81 %)		 13,354,560
(61.28 %)		 255,756
(3.08 %)
315 McCord's box turtle (ISIS_951048 2018)
GCA_003846335.1		 n/a 16,317
(1.05 %)		 26,320
(1.64 %)		 n/a 44.69
(94.58 %)		 50,040
(5.43 %)		 141,912
(94.57 %)		 4,185,106
(47.48 %)		 331,791
(1.03 %)		 11,180,962
(31.97 %)		 126,459
(3.07 %)
316 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 73,632
(3.80 %)
317 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
318 Mediterranean moray (2026)
GCA_978019965.1		 n/a 16,427
(1.01 %)		 45,776
(4.00 %)		 n/a 41.64
(102.72 %)		 58
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,557,255
(27.83 %)		 801,510
(11.48 %)		 9,376,875
(41.09 %)		 125,556
(2.63 %)
319 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 165,699
(1.23 %)
320 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 157,012
(1.21 %)
321 Mexican gopher tortoise (maternal hap 2022)
GCA_025201925.1		 n/a 14,970
(1.00 %)		 18,525
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 622
(100.00 %)		 4,639,733
(52.18 %)		 472,502
(3.42 %)		 11,362,004
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
322 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
323 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 77,167
(2.14 %)
324 Mexican spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_054668525.1		 n/a 13,828
(2.09 %)		 25,439
(4.41 %)		 n/a 40.23
(100.00 %)		 267
(0.00 %)		 504
(100.00 %)		 2,096,085
(40.85 %)		 598,367
(11.73 %)		 5,067,467
(36.37 %)		 61,483
(4.17 %)
325 Mexican spadefoot toad (hap2 2026)
GCA_054668515.1		 n/a 13,495
(2.09 %)		 25,018
(4.52 %)		 n/a 40.14
(100.00 %)		 264
(0.00 %)		 292
(100.00 %)		 2,067,301
(40.12 %)		 572,672
(10.63 %)		 4,990,706
(35.30 %)		 60,199
(4.15 %)
326 mimic poison frog (alternate hap 2023)
GCA_032442605.1		 n/a 25
(0.76 %)		 202
(6.98 %)		 n/a 51.33
(100.00 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4,414
(23.25 %)		 1,907
(64.24 %)		 6,592
(56.32 %)		 305
(4.46 %)
327 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 n/a
328 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 16,441,719
(72.26 %)		 694,865
(6.34 %)
329 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,213
(6.17 %)		 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 29,954
(1.06 %)
330 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 49,188
(1.67 %)
331 natterjack toad (hap1.1 2026)
GCA_978041865.1		 n/a 14,208
(0.53 %)		 29,948
(1.62 %)		 n/a 43.25
(102.85 %)		 566
(0.00 %)		 549
(100.00 %)		 10,491,328
(76.75 %)		 2,105,613
(18.02 %)		 15,911,863
(60.52 %)		 227,983
(2.30 %)
332 natterjack toad (hap2.1 2026)
GCA_978041805.1		 n/a 14,163
(0.53 %)		 29,749
(1.58 %)		 n/a 43.25
(100.00 %)		 542
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 10,527,100
(76.82 %)		 2,103,391
(17.75 %)		 15,923,083
(60.50 %)		 227,482
(2.26 %)
333 nervous shark (hap1 2026)
GCA_988281195.1		 n/a 13,279
(0.53 %)		 19,375
(1.29 %)		 n/a 43.93
(101.30 %)		 2,005
(0.01 %)		 2,864
(99.99 %)		 9,687,582
(65.76 %)		 690,841
(6.77 %)		 14,011,315
(47.02 %)		 34,052
(1.10 %)
334 Nile crocodile (hap1 2026)
GCA_054954115.1		 n/a 14,644
(0.99 %)		 19,094
(1.48 %)		 n/a 45.35
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 3,197,557
(41.29 %)		 411,882
(3.33 %)		 12,292,120
(32.84 %)		 41,659
(2.72 %)
335 Nile crocodile (hap2 2026)
GCA_054825085.1		 n/a 14,603
(0.98 %)		 18,975
(1.46 %)		 n/a 45.39
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,204,046
(41.22 %)		 450,353
(3.49 %)		 12,134,419
(32.77 %)		 42,362
(2.73 %)
336 northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 128,617
(3.90 %)
337 northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 135,874
(3.88 %)
338 northern wobbegong (sOreWar1 hap1 2026)
GCA_988240335.1		 n/a 12,737
(0.34 %)		 21,258
(0.94 %)		 n/a 44.79
(101.13 %)		 910
(0.00 %)		 5,369
(100.00 %)		 12,171,758
(70.72 %)		 1,348,476
(22.04 %)		 19,343,992
(55.66 %)		 91,520
(2.51 %)
339 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 134,572
(3.12 %)
340 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 141,800
(3.08 %)
341 nurse shark (FLO180531 2022)
GCA_024137785.1		 n/a 11,376
(0.58 %)		 14,375
(1.25 %)		 n/a 41.63
(56.77 %)		 68,882
(43.24 %)		 69,171
(56.76 %)		 8,181,216
(65.52 %)		 260,159
(0.44 %)		 14,324,615
(20.45 %)		 13,165
(0.13 %)
342 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 34,560
(2.18 %)
343 olive python (hap1 2026)
GCA_057929095.1		 n/a 13,636
(1.36 %)		 17,657
(2.07 %)		 n/a 40.20
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 2,869,112
(39.35 %)		 413,970
(3.27 %)		 7,686,808
(30.21 %)		 34,733
(2.18 %)
344 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 34,363
(2.08 %)
345 olive python (hap2 2026)
GCA_057929265.1		 n/a 13,629
(1.36 %)		 17,640
(2.07 %)		 n/a 40.19
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 2,868,493
(39.34 %)		 413,676
(3.27 %)		 7,686,615
(30.20 %)		 34,728
(2.16 %)
346 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 186,153
(29.43 %)
347 Pacific ridley (hap1 2025 genbank)
GCA_965140295.1		 n/a 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
348 Pacific ridley (hap1 2025 refseq)
GCF_965140295.1		 48,786
(3.33 %)		 14,876
(1.07 %)		 17,430
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 112
(99.98 %)		 4,157,740
(50.14 %)		 313,430
(2.43 %)		 10,832,284
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
349 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1		 n/a 14,883
(1.03 %)		 17,736
(1.52 %)		 n/a 44.14
(99.96 %)		 76
(0.04 %)		 115
(99.96 %)		 1,337,786
(12.39 %)		 317,205
(2.38 %)		 10,851,496
(34.73 %)		 47,955
(1.47 %)
350 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 64,462
(1.33 %)
351 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 127,760
(1.34 %)
352 palmate newt (alternate hap 2024)
GCA_964258895.1		 n/a 13,011
(0.06 %)		 269,650
(1.87 %)		 n/a 44.94
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 233,842
(100.00 %)		 4,147,487
(1.62 %)		 8,364,812
(13.65 %)		 78,522,792
(49.21 %)		 2,116,175
(7.96 %)
353 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
354 palmate newt (primary hap 2026)
GCA_964261635.2		 n/a 16,530
(0.09 %)		 227,377
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,696,508
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
355 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 51,973
(2.70 %)
356 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
357 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
358 Peter's clawed frog (maternal hap 2024)
GCA_038501915.1		 n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 99,118
(1.26 %)
359 Peter's clawed frog (paternal hap 2024)
GCA_038501925.1		 n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 108,139
(1.26 %)
360 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 genbank)
GCA_033958435.1		 n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
361 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 refseq)
GCF_033958435.1		 49,040
(3.30 %)		 14,310
(1.00 %)		 16,693
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 987,712
(8.97 %)		 322,082
(1.52 %)		 11,123,189
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
362 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 52,508
(3.70 %)
363 plains spadefoot toad (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358695.2		 n/a 13,760
(2.05 %)		 25,743
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 2,153,589
(42.02 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,323
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
364 plains spadefoot toad (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
365 pool frog (hap1 2025 genbank)
GCA_965119305.1		 n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
366 pool frog (hap1 2025 refseq)
GCF_965119305.1		 35,542
(0.88 %)		 14,446
(0.34 %)		 39,587
(1.24 %)		 n/a 43.74
(101.38 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,328
(100.00 %)		 2,757,940
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,848
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
367 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1		 n/a 14,335
(0.34 %)		 39,545
(1.24 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 3,680
(99.99 %)		 2,706,037
(2.56 %)		 3,712,706
(12.97 %)		 23,911,913
(60.10 %)		 553,381
(4.05 %)
368 porcupine ray (hap1 2026)
GCA_988281385.1		 n/a 12,562
(0.43 %)		 26,637
(1.32 %)		 n/a 42.29
(102.84 %)		 377
(0.00 %)		 865
(100.00 %)		 8,713,783
(67.07 %)		 602,920
(6.59 %)		 21,309,284
(45.88 %)		 120,275
(2.54 %)
369 Potamotrygon marinae (hap2 2026)
GCA_055471215.1		 n/a 11,848
(0.34 %)		 21,950
(0.94 %)		 n/a 41.36
(102.95 %)		 1,012
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 9,567,782
(73.65 %)		 740,953
(13.73 %)		 20,017,437
(57.75 %)		 52,576
(0.65 %)
370 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,381
(2.07 %)		 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 117,191
(3.14 %)
371 prickly shark (hap1 2026)
GCA_057877045.1		 n/a 13,126
(0.23 %)		 29,347
(0.82 %)		 n/a 48.14
(101.20 %)		 5,153
(0.01 %)		 3,906
(100.00 %)		 1,289,061
(6.83 %)		 3,350,270
(36.32 %)		 16,573,834
(77.52 %)		 662,154
(10.72 %)
372 prickly shark (hap2 2026)
GCA_057876775.1		 n/a 12,978
(0.26 %)		 28,116
(0.88 %)		 n/a 48.35
(99.98 %)		 4,924
(0.02 %)		 2,205
(100.00 %)		 1,101,970
(5.16 %)		 2,769,674
(32.64 %)		 15,562,460
(75.20 %)		 617,230
(10.59 %)
373 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
374 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 503,166
(8.84 %)
375 Puget Sound dogfish (hap1 2025)
GCA_050613905.1		 n/a 13,335
(0.31 %)		 32,914
(1.25 %)		 n/a 46.84
(99.98 %)		 4,275
(0.02 %)		 3,203
(100.00 %)		 996,444
(5.35 %)		 1,697,611
(29.47 %)		 16,252,127
(70.13 %)		 372,462
(5.80 %)
376 Puget Sound dogfish (hap2 2025)
GCA_050613895.1		 n/a 13,151
(0.34 %)		 29,417
(1.19 %)		 n/a 46.65
(99.98 %)		 4,144
(0.02 %)		 1,862
(100.00 %)		 887,790
(4.65 %)		 1,380,618
(26.09 %)		 14,838,724
(67.96 %)		 333,223
(5.63 %)
377 ray-finned fishes P.merretti (hap1 2026)
GCA_057931045.1		 n/a 17,686
(1.81 %)		 37,595
(4.88 %)		 n/a 43.71
(102.76 %)		 278
(0.00 %)		 126
(100.00 %)		 3,118,708
(34.41 %)		 852,554
(9.08 %)		 6,259,550
(34.71 %)		 144,915
(6.52 %)
378 ray-finned fishes P.merretti (hap2 2026)
GCA_057931065.1		 n/a 16,169
(1.87 %)		 33,742
(4.94 %)		 n/a 43.63
(100.00 %)		 236
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,757,145
(33.55 %)		 765,151
(8.12 %)		 5,640,514
(33.63 %)		 130,213
(6.47 %)
379 red stingray (2025)
GCF_048418815.1		 55,797
(2.16 %)		 12,249
(0.37 %)		 26,981
(1.23 %)		 n/a 43.17
(94.93 %)		 2,066
(5.07 %)		 261
(100.00 %)		 832,690
(1.45 %)		 801,096
(12.24 %)		 21,031,370
(49.66 %)		 108,035
(1.85 %)
380 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 93,811
(1.90 %)
381 reedfish (primary hap 2021)
GCA_900747795.4		 n/a 13,335
(0.48 %)		 23,159
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,317,123
(62.67 %)		 1,069,641
(2.91 %)		 19,980,246
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
382 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 74,951
(1.15 %)
383 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 119,002
(2.82 %)
384 Riggenbach's reed frog (alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1,426,030
(6.65 %)
385 Riggenbach's reed frog (primary hap 2024 genbank)
GCA_040937935.1		 n/a 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 4,172,191
(12.59 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,114
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
386 Riggenbach's reed frog (primary hap 2024 refseq)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
387 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 142,495
(4.04 %)
388 roundjaw bonefish (hap1 2026)
GCA_056783665.1		 n/a 17,717
(2.33 %)		 24,251
(4.97 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 1,315,104
(19.20 %)		 421,651
(7.42 %)		 5,642,373
(24.02 %)		 30,976
(1.25 %)
389 roundjaw bonefish (hap2 2026)
GCA_056776265.1		 n/a 17,768
(2.35 %)		 24,154
(4.96 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 1,309,049
(18.64 %)		 417,246
(7.24 %)		 5,611,567
(23.57 %)		 30,644
(1.20 %)
390 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
391 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 140,557
(4.65 %)
392 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 145,328
(4.63 %)
393 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 175,180
(3.64 %)
394 rufous frog (hap2 2023 genbank)
GCA_031893055.1		 n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
395 rufous frog (hap2 2023 refseq)
GCF_031893055.1		 36,767
(2.51 %)		 13,536
(0.88 %)		 24,404
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 712,068
(2.18 %)		 1,219,159
(21.56 %)		 7,988,199
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
396 rufous frog (hap2 2026)
GCA_031893055.2		 n/a 13,549
(0.89 %)		 24,388
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 5,738,417
(62.95 %)		 1,219,306
(21.56 %)		 7,988,200
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
397 Sabana Surinam toad (BJE4294 2021)
GCA_019650415.1		 n/a 11,460
(0.68 %)		 39,132
(1.41 %)		 n/a 37.70
(99.38 %)		 67,859
(0.60 %)		 351,451
(99.40 %)		 1,112,793
(9.46 %)		 523,672
(3.31 %)		 8,542,740
(36.81 %)		 42,115
(0.79 %)
398 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 83,890
(3.97 %)
399 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 83,805
(3.99 %)
400 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 51,923
(2.21 %)
401 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 51,910
(2.22 %)
402 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
403 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
404 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
405 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
406 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 123,274
(4.17 %)
407 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 80,300
(2.76 %)
408 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
409 sand tiger shark (hap1 2026)
GCA_055471155.1		 n/a 13,784
(0.34 %)		 21,567
(0.89 %)		 n/a 45.19
(101.28 %)		 1,643
(0.16 %)		 1,711
(100.00 %)		 7,932,159
(66.95 %)		 2,319,833
(17.54 %)		 24,061,588
(55.39 %)		 126,096
(2.69 %)
410 sand tiger shark (hap2 2026)
GCA_055471145.1		 n/a 13,439
(0.36 %)		 20,564
(0.93 %)		 n/a 45.10
(101.26 %)		 1,534
(0.23 %)		 1,171
(100.00 %)		 7,357,217
(66.76 %)		 1,982,014
(16.60 %)		 23,066,008
(54.15 %)		 113,116
(2.53 %)
411 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
412 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 651,438
(8.09 %)
413 Schlegel's Japanese gecko (2015)
GCF_001447785.1		 25,190
(1.78 %)		 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 160,022
(2.80 %)
414 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 147,499
(35.87 %)
415 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 alternate hap 2025)
GCA_048941845.1		 n/a 6,576
(0.51 %)		 43,825
(3.94 %)		 n/a 47.88
(100.00 %)		 n/a 7,128
(100.00 %)		 4,390,525
(64.21 %)		 1,225,707
(31.71 %)		 4,578,596
(61.04 %)		 190,615
(29.92 %)
416 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 genbank)
GCA_048934315.1		 n/a 8,243
(0.45 %)		 53,092
(3.72 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,203
(100.00 %)		 813,148
(7.99 %)		 1,963,193
(37.59 %)		 5,212,133
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
417 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 refseq)
GCF_048934315.1		 67,315
(6.94 %)		 8,244
(0.45 %)		 45,418
(3.02 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,204
(100.00 %)		 813,154
(7.99 %)		 1,963,197
(37.59 %)		 5,212,175
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
418 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
419 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCA_035084215.1		 n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
420 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
421 sharpnose sevengill shark (v1 hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 108,468
(3.25 %)
422 sharpnose sevengill shark (v2 hap2 2024)
GCA_035084135.2		 n/a 12,605
(0.51 %)		 23,661
(1.48 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 1,771
(0.01 %)		 1,143
(100.00 %)		 559,424
(2.10 %)		 990,550
(15.48 %)		 11,850,173
(56.04 %)		 109,272
(3.30 %)
423 Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024)
GCA_037043045.1		 n/a 13,255
(0.98 %)		 17,598
(1.51 %)		 n/a 40.56
(99.93 %)		 641
(0.07 %)		 1,450
(99.93 %)		 1,165,384
(5.77 %)		 720,981
(3.46 %)		 8,068,978
(51.52 %)		 120,786
(6.16 %)
424 shortnose gar (hap1 2026 genark)
GCA_059453375.1		 n/a 13,777
(1.48 %)		 24,433
(3.52 %)		 n/a 40.84
(102.72 %)		 45
(0.00 %)		 270
(100.00 %)		 1,368,384
(36.80 %)		 257,444
(13.92 %)		 5,510,116
(38.49 %)		 58,068
(3.96 %)
425 shortnose gar (hap1 2026 refseq)
GCF_059453375.1		 69,375
(7.82 %)		 13,889
(1.51 %)		 24,432
(3.52 %)		 n/a 40.84
(102.79 %)		 45
(0.00 %)		 269
(100.00 %)		 1,544,945
(42.60 %)		 257,444
(13.92 %)		 5,510,076
(38.49 %)		 58,068
(3.96 %)
426 shortnose gar (hap2 2026)
GCA_059453405.1		 n/a 13,581
(1.54 %)		 23,444
(3.57 %)		 n/a 40.67
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 214
(100.00 %)		 1,307,157
(34.74 %)		 226,116
(11.39 %)		 5,488,729
(36.58 %)		 55,305
(3.72 %)
427 Skyros wall lizard (hap1.2 2024)
GCF_964106915.1		 72,774
(5.99 %)		 14,298
(1.39 %)		 19,900
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 4,985,535
(51.28 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,654
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
428 Skyros wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 86,165
(2.71 %)
429 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
430 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
431 small-eyed ray (hap1.1 2026)
GCA_982319585.1		 n/a 12,092
(0.49 %)		 29,267
(1.46 %)		 n/a 45.39
(100.40 %)		 2,689
(0.01 %)		 4,225
(100.00 %)		 8,804,118
(72.17 %)		 1,666,575
(13.33 %)		 11,928,381
(61.47 %)		 300,552
(6.69 %)
432 small-eyed ray (hap2.1 2026)
GCA_982319545.1		 n/a 11,972
(0.50 %)		 28,154
(1.47 %)		 n/a 45.48
(99.99 %)		 2,688
(0.01 %)		 5,516
(99.99 %)		 8,685,236
(71.77 %)		 1,478,950
(12.77 %)		 11,816,313
(60.96 %)		 295,247
(6.93 %)
433 small-spotted catshark (primary hap 2021)
GCF_902713615.2		 55,748
(1.62 %)		 13,022
(0.37 %)		 23,990
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 10,880,918
(73.26 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,883,361
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
434 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 427,693
(8.25 %)
435 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
436 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 37,147
(1.43 %)
437 smalltooth sawfish (primary hap 2019)
GCA_009764475.2		 n/a 12,158
(0.69 %)		 18,625
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 4,923,143
(54.93 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,054
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
438 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
439 snake N.helvetica (hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
440 snake N.helvetica (hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 96,764
(4.19 %)
441 Somali helmeted turtle (alternate hap 2025)
GCA_051311595.1		 n/a 14,771
(1.19 %)		 18,963
(1.80 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 n/a 1,298
(100.00 %)		 3,524,256
(40.68 %)		 362,743
(1.52 %)		 9,689,320
(29.55 %)		 52,961
(1.73 %)
442 Somali helmeted turtle (primary hap 2025)
GCA_051311615.1		 n/a 14,695
(1.19 %)		 17,959
(1.73 %)		 n/a 43.06
(99.89 %)		 85
(0.11 %)		 67
(100.00 %)		 3,529,920
(40.73 %)		 365,058
(1.57 %)		 9,712,608
(29.62 %)		 53,463
(1.75 %)
443 South American lungfish (Aquarium Glaser DD20211129a alternate hap 2024)
GCA_040438655.1		 n/a 4,310
(0.01 %)		 72,538
(0.22 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 n/a 1,072,861
(100.00 %)		 16,794,805
(3.28 %)		 13,423,198
(21.65 %)		 196,414,313
(59.02 %)		 218,171
(0.23 %)
444 Southern California legless lizard (HBS135921 hap1 2026)
GCA_051312515.2		 n/a 14,187
(1.12 %)		 19,489
(1.86 %)		 n/a 43.68
(100.00 %)		 67
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 5,909,632
(46.54 %)		 670,448
(3.31 %)		 9,944,808
(39.15 %)		 83,929
(3.91 %)
445 Southern California legless lizard (HBS135921 hap2 2026)
GCA_051312545.2		 n/a 14,225
(1.12 %)		 19,592
(1.86 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 5,913,300
(46.41 %)		 672,138
(3.61 %)		 9,957,324
(39.35 %)		 83,771
(3.97 %)
446 southern Darwin's frog (hap1 2025)
GCA_050947455.1		 n/a 13,810
(0.52 %)		 34,024
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,943
(100.00 %)		 11,010,271
(59.26 %)		 2,251,360
(18.25 %)		 13,843,971
(63.42 %)		 443,624
(6.38 %)
447 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 217,977
(8.25 %)
448 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 47,268
(1.61 %)
449 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 46,378
(2.04 %)
450 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 143,601
(3.21 %)
451 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 142,383
(3.05 %)
452 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 38,507
(2.24 %)
453 spotted gar (hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 52,438
(3.69 %)
454 spotted gar (hap2 2024 genbank)
GCA_040954835.1		 n/a 13,842
(1.51 %)		 23,963
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 817
(100.00 %)		 1,332,243
(34.81 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,951
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
455 spotted gar (hap2 2024 refseq)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
456 spotted moray (2026)
GCA_978019835.1		 n/a 16,348
(1.04 %)		 38,313
(3.53 %)		 n/a 41.70
(102.87 %)		 71
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,160,132
(28.09 %)		 585,769
(10.39 %)		 9,925,217
(38.87 %)		 80,015
(1.64 %)
457 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 64,249
(4.00 %)
458 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 50,785
(2.94 %)
459 spotted ray (hap1.1 2026)
GCA_980250545.1		 n/a 11,917
(0.53 %)		 29,784
(1.58 %)		 n/a 44.43
(100.15 %)		 3,030
(0.02 %)		 4,542
(100.00 %)		 9,023,837
(69.78 %)		 1,317,538
(6.25 %)		 12,219,735
(58.18 %)		 278,007
(5.45 %)
460 spotted ray (hap2.1 2026)
GCA_980251185.1		 n/a 12,027
(0.53 %)		 30,226
(1.61 %)		 n/a 44.56
(99.98 %)		 2,873
(0.02 %)		 6,791
(99.98 %)		 9,053,482
(69.77 %)		 1,277,399
(6.17 %)		 12,285,515
(58.11 %)		 279,307
(5.47 %)
461 spotted thorius (hap1 2026)
GCA_060511645.1		 n/a 16,308
(0.08 %)		 281,976
(2.00 %)		 n/a 44.00
(101.39 %)		 1,347
(0.00 %)		 6,194
(100.00 %)		 7,654,632
(1.67 %)		 8,183,789
(8.39 %)		 92,968,603
(55.54 %)		 2,686,800
(7.14 %)
462 starry smooth-hound (hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
463 starry smooth-hound (hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 105,379
(3.46 %)
464 starry smooth-hound shark (hap1.1 2024)
GCF_964213995.1		 50,247
(1.97 %)		 12,752
(0.42 %)		 23,720
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,313
(100.00 %)		 1,161,214
(3.17 %)		 1,250,068
(11.36 %)		 14,206,585
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
465 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,208
(5.77 %)		 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 60,325
(1.97 %)
466 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 113,023
(3.09 %)
467 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 92,993
(2.75 %)
468 tailed frog (A.truei hap1 2024 genbank)
GCA_040206685.1		 n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
469 tailed frog (A.truei hap1 2024 refseq)
GCF_040206685.1		 69,065
(2.29 %)		 14,490
(0.54 %)		 41,218
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,526
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,660,933
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
470 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 441,543
(6.61 %)
471 tarantolino (hap1 2023)
GCA_029931775.1		 n/a 14,318
(1.18 %)		 21,784
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 592
(100.00 %)		 5,383,621
(53.79 %)		 436,945
(2.95 %)		 8,308,761
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
472 thornback ray (hap1.1 2026)
GCA_980434695.1		 n/a 12,036
(0.55 %)		 29,375
(1.65 %)		 n/a 44.43
(101.34 %)		 2,667
(0.01 %)		 1,860
(100.00 %)		 9,097,652
(68.82 %)		 1,275,313
(5.43 %)		 12,306,520
(57.27 %)		 270,118
(5.25 %)
473 thornback ray (hap2.1 2026)
GCA_980432155.1		 n/a 12,145
(0.53 %)		 30,300
(1.62 %)		 n/a 44.68
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 5,935
(99.99 %)		 9,407,764
(69.49 %)		 1,383,362
(6.40 %)		 12,478,479
(58.39 %)		 282,238
(5.47 %)
474 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 159,552
(5.54 %)
475 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.2		 n/a 11,697
(0.61 %)		 26,344
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 8,789,521
(68.75 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,963,149
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
476 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020 refseq)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
477 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 138,405
(2.40 %)
478 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 45,588
(1.61 %)
479 tiger salamander (Tig_M23 2026)
GCA_061212105.1		 n/a 23,961
(0.08 %)		 186,203
(1.15 %)		 n/a 46.27
(102.78 %)		 1,920
(0.00 %)		 3,762
(100.00 %)		 28,461,502
(65.74 %)		 8,376,884
(11.27 %)		 125,465,827
(51.73 %)		 2,444,237
(5.28 %)
480 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 326,452
(3.86 %)
481 tiny cayenne caecilian (primary hap 2021)
GCF_901765095.2		 41,335
(1.27 %)		 14,580
(0.44 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 3,532
(98.99 %)		 13,578,410
(71.92 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,206,278
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
482 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
483 tope shark (hap1 2025)
GCA_977071755.1		 n/a 12,861
(0.32 %)		 25,525
(1.16 %)		 n/a 47.84
(99.98 %)		 3,659
(0.02 %)		 10,777
(99.98 %)		 1,356,606
(3.72 %)		 1,445,979
(23.88 %)		 14,153,835
(65.90 %)		 141,501
(5.85 %)
484 tope shark (hap1 2026)
GCA_055755705.1		 n/a 12,842
(0.32 %)		 25,523
(1.16 %)		 n/a 47.73
(100.50 %)		 3,659
(0.02 %)		 8,367
(99.99 %)		 1,347,388
(3.72 %)		 1,449,325
(23.87 %)		 14,153,380
(65.90 %)		 141,501
(5.85 %)
485 tope shark (hap2 2025)
GCA_977071745.1		 n/a 9,480
(0.44 %)		 12,818
(1.02 %)		 n/a 45.32
(99.99 %)		 1,556
(0.01 %)		 1,593
(99.99 %)		 844,596
(2.20 %)		 605,996
(6.77 %)		 10,856,611
(52.57 %)		 83,694
(4.14 %)
486 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 91,919
(2.91 %)
487 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,570
(4.71 %)		 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 52,647
(1.35 %)
488 Tungara frog (maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
489 Tungara frog (paternal hap 2024)
GCA_040894015.1		 n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 207,553
(4.71 %)
490 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 523,234
(6.59 %)
491 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
492 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 refseq)
GCF_901001135.2		 56,619
(1.50 %)		 14,447
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 4,902
(99.36 %)		 7,642,637
(30.35 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,399,636
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
493 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025 genbank)
GCA_965153285.1		 n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
494 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025 refseq)
GCF_965153285.1		 74,360
(6.29 %)		 14,315
(1.44 %)		 20,248
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 4,922,311
(49.66 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
495 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1		 n/a 13,496
(1.42 %)		 18,862
(2.37 %)		 n/a 43.96
(99.99 %)		 983
(0.01 %)		 306
(100.00 %)		 780,565
(4.36 %)		 422,625
(4.27 %)		 6,551,041
(36.66 %)		 89,693
(2.97 %)
496 undulate ray (2026)
GCA_980436725.1		 n/a 12,010
(0.50 %)		 27,362
(1.45 %)		 n/a 45.02
(101.57 %)		 2,543
(0.01 %)		 1,253
(100.00 %)		 9,070,711
(71.40 %)		 1,216,218
(10.82 %)		 12,098,252
(61.01 %)		 281,244
(5.52 %)
497 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 82,750
(2.69 %)
498 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 81,352
(2.71 %)
499 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 88,947
(2.62 %)
500 warty newt (alternate hap 2024)
GCA_964204665.1		 n/a 7,653
(0.05 %)		 165,170
(1.80 %)		 n/a 45.74
(100.00 %)		 338
(0.00 %)		 179,793
(100.00 %)		 2,367,930
(1.81 %)		 4,993,795
(17.70 %)		 40,385,667
(52.18 %)		 1,135,490
(8.29 %)
501 warty newt (primary hap 2024 genbank)
GCA_964204655.1		 n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 2,159,665
(8.20 %)
502 warty newt (primary hap 2024 refseq)
GCF_964204655.1		 78,096
(0.50 %)		 16,122
(0.09 %)		 186,007
(1.43 %)		 n/a 45.52
(102.83 %)		 4,698
(0.00 %)		 6,001
(100.00 %)		 4,239,416
(1.37 %)		 8,725,286
(13.72 %)		 84,859,339
(50.88 %)		 2,159,664
(8.20 %)
503 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a alternate hap 2024)
GCA_040939495.1		 n/a 5,770
(0.02 %)		 51,747
(0.50 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 65,665
(100.00 %)		 8,636,983
(3.97 %)		 7,822,314
(7.96 %)		 97,649,351
(57.33 %)		 262,729
(0.56 %)
504 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 180,606,722
(55.17 %)		 548,408
(0.58 %)
505 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 502,751
(0.52 %)
506 western chorus frog (Ontario Canada JT22Mhap1 2026)
GCA_053478255.2		 n/a 14,324
(0.49 %)		 42,410
(2.02 %)		 n/a 45.04
(100.00 %)		 1,837
(0.00 %)		 1,100
(100.00 %)		 14,993,900
(65.43 %)		 3,145,831
(17.41 %)		 15,399,943
(62.39 %)		 575,163
(6.40 %)
507 western chorus frog (Ontario Canada JT22Mhap2 2026)
GCA_056512365.2		 n/a 13,981
(0.49 %)		 42,035
(2.07 %)		 n/a 45.01
(100.00 %)		 1,846
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 14,873,941
(65.52 %)		 3,092,457
(17.13 %)		 15,388,764
(62.36 %)		 569,249
(6.37 %)
508 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 184,134
(3.16 %)
509 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 158,311
(2.92 %)
510 western painted turtle (hap1 R12L10 2024)
GCA_035221575.1		 n/a 15,110
(1.01 %)		 20,192
(1.60 %)		 n/a 44.79
(99.98 %)		 2,300
(0.02 %)		 7,676
(99.98 %)		 4,166,116
(47.33 %)		 435,101
(2.23 %)		 11,124,856
(35.21 %)		 124,359
(2.87 %)
511 western painted turtle (hap2 R12L10 2024)
GCA_035221595.1		 n/a 15,098
(1.02 %)		 20,450
(1.60 %)		 n/a 44.76
(99.98 %)		 1,992
(0.02 %)		 11,363
(99.98 %)		 4,160,368
(47.32 %)		 430,205
(2.07 %)		 11,110,552
(34.96 %)		 124,000
(2.80 %)
512 western painted turtle (R12L10 2023 refseq)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 127,896
(2.94 %)
513 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 103,623
(1.74 %)
514 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 183,292
(4.74 %)
515 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 168,847
(4.76 %)
516 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 100,334
(5.41 %)
517 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 101,603
(5.32 %)
518 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 91,606
(2.53 %)
519 western terrestrial garter snake (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769535.1		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,806
(1.93 %)		 n/a 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,274,580
(7.75 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,395,695
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
520 western terrestrial garter snake (primary hap 2019 refseq)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
521 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 21,050
(0.30 %)
522 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 35,192
(0.95 %)
523 white-bellied softnose skate (Sanriku21f 2025)
GCF_053455715.1		 41,159
(3.03 %)		 11,907
(0.66 %)		 24,004
(1.82 %)		 n/a 44.94
(99.88 %)		 5,336
(0.12 %)		 3,942
(100.00 %)		 9,274,458
(62.02 %)		 1,451,144
(6.73 %)		 8,696,026
(55.50 %)		 191,431
(5.50 %)
524 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 28,353
(0.49 %)
525 whitespotted bambooshark (BGI_BamShark_2017 2019)
GCA_004010195.1		 n/a 12,118
(0.41 %)		 20,659
(1.02 %)		 n/a 42.30
(94.58 %)		 159,245
(5.41 %)		 601,049
(100.00 %)		 577,652
(1.03 %)		 935,689
(4.73 %)		 21,034,123
(39.29 %)		 37,965
(0.55 %)
526 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a 14,756
(0.22 %)		 45,590
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 18,937,194
(70.69 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 30,457,322
(66.19 %)		 412,512
(1.53 %)
527 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a 15,637
(0.22 %)		 46,444
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 19,544,300
(70.77 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 31,317,575
(66.35 %)		 423,705
(1.55 %)
528 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2025)
GCA_050000025.1		 n/a 14,891
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 2,747,806
(34.14 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 47,683
(1.86 %)
529 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2026)
GCA_050000025.2		 n/a 14,811
(0.94 %)		 30,371
(2.41 %)		 n/a 43.83
(100.00 %)		 n/a 2,436
(100.00 %)		 4,676,532
(48.44 %)		 412,438
(1.17 %)		 12,237,450
(31.63 %)		 48,675
(1.65 %)
530 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2025)
GCA_050000005.1		 n/a 14,852
(1.27 %)		 19,245
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 114
(0.02 %)		 73
(99.99 %)		 2,745,424
(34.17 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 47,799
(1.87 %)
531 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2026)
GCA_050000005.2		 n/a 14,683
(0.95 %)		 17,589
(1.40 %)		 n/a 43.85
(100.00 %)		 214
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,687,675
(48.54 %)		 412,242
(1.19 %)		 12,305,782
(31.82 %)		 48,972
(1.67 %)
532 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,539
(3.36 %)		 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 135,646
(3.23 %)
533 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 20,647
(0.38 %)
534 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
535 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 48,378
(1.60 %)
536 Zimmermann's poison frog (hap2 2025)
GCA_051348885.1		 n/a 14,010
(0.34 %)		 42,101
(1.22 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 227
(0.00 %)		 275
(100.00 %)		 10,423,157
(48.22 %)		 3,754,386
(17.74 %)		 16,835,345
(70.24 %)		 658,843
(7.16 %)
537 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 genbank)
GCA_051348905.1		 n/a 13,951
(0.34 %)		 41,627
(1.23 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 10,342,480
(47.98 %)		 3,714,881
(17.24 %)		 16,808,875
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
538 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 refseq)
GCF_051348905.1		 63,511
(1.45 %)		 13,949
(0.34 %)		 41,407
(1.21 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 286
(100.00 %)		 10,342,474
(47.98 %)		 3,714,877
(17.24 %)		 16,808,822
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
TOTALS:total assembly count 538

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 628 assemblies assembly stats track stats
Mammals 1006 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 2002 assemblies assembly stats track stats
Plants 466 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4136 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15117 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2977 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 23961 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 691 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats