Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abingdon island giant tortoise
GCF_003597395.1
50,402
(2.95 %)
14,990
(1.01 %)
19,565
(1.58 %)
34,846
(1.54 %)
43.71
(94.31 %)
63,430
(5.70 %)
10,618
(100.00 %)
1,553,204
(12.95 %)
274,155
(1.11 %)
12,664,684
(27.42 %)
62,829
(1.59 %)
2 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1
n/a 13,898
(1.18 %)
20,039
(1.94 %)
n/a 41.09
(99.99 %)
1,057
(0.01 %)
480
(100.00 %)
3,740,180
(50.44 %)
792,731
(6.25 %)
7,621,640
(45.94 %)
116,506
(4.68 %)
3 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1
n/a 12,344
(1.22 %)
17,320
(1.89 %)
n/a 41.00
(99.99 %)
908
(0.01 %)
1,256
(99.99 %)
3,221,370
(48.42 %)
681,209
(5.18 %)
6,734,253
(44.26 %)
99,366
(4.44 %)
4 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1
n/a 2,101
(1.18 %)
5,350
(2.76 %)
n/a 43.70
(99.99 %)
3
(0.00 %)
4,811
(100.00 %)
103,373
(4.27 %)
58,480
(3.90 %)
895,535
(27.44 %)
10,399
(2.84 %)
5 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1
57,514
(4.49 %)
14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
94,745
(2.70 %)
6 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1
n/a 13,258
(1.31 %)
15,309
(2.28 %)
n/a 38.30
(89.51 %)
121,461
(10.52 %)
5,411
(100.00 %)
491,540
(1.54 %)
401,074
(2.30 %)
8,595,741
(27.94 %)
14,854
(0.31 %)
7 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1
80,912
(3.89 %)
23,666
(1.59 %)
32,527
(2.45 %)
112,506
(5.21 %)
39.34
(99.94 %)
667
(0.06 %)
55
(100.00 %)
4,269,095
(35.49 %)
1,028,861
(6.46 %)
14,246,823
(43.67 %)
108,774
(1.25 %)
8 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1
60,799
(4.33 %)
14,383
(0.98 %)
18,600
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
161
(0.70 %)
195
(100.00 %)
3,322,624
(43.19 %)
478,208
(1.77 %)
12,316,424
(32.01 %)
49,792
(2.45 %)
9 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3
51,013
(3.53 %)
14,424
(1.06 %)
19,690
(1.51 %)
n/a 44.30
(97.86 %)
236,641
(2.19 %)
7,094
(100.00 %)
2,842,761
(36.86 %)
291,584
(0.69 %)
12,464,318
(27.91 %)
35,531
(1.28 %)
10 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3
67,474
(10.58 %)
17,131
(2.21 %)
34,322
(5.40 %)
n/a 43.73
(99.99 %)
985
(0.01 %)
967
(100.00 %)
766,696
(5.03 %)
756,877
(7.81 %)
5,766,995
(27.42 %)
133,933
(8.63 %)
11 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1
47,555
(4.15 %)
13,005
(1.05 %)
17,560
(1.65 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
331
(0.00 %)
748
(100.00 %)
1,484,082
(7.70 %)
1,033,385
(5.12 %)
8,266,544
(48.89 %)
105,815
(4.08 %)
12 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1
42,994
(1.39 %)
14,061
(0.43 %)
43,525
(1.76 %)
36,577
(1.09 %)
44.37
(98.21 %)
3,874
(1.79 %)
748
(100.00 %)
1,577,809
(1.79 %)
2,975,473
(12.67 %)
18,834,930
(58.75 %)
415,605
(4.12 %)
13 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1
46,374
(1.72 %)
7,719
(0.19 %)
59,788
(2.68 %)
n/a 44.23
(99.94 %)
4,876
(0.06 %)
4,270
(100.00 %)
2,094,143
(3.54 %)
3,212,025
(29.83 %)
8,998,320
(75.15 %)
408,391
(12.65 %)
14 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1
n/a 6,662
(0.20 %)
45,484
(2.63 %)
n/a 44.32
(99.97 %)
4,412
(0.03 %)
4,004
(100.00 %)
1,698,449
(3.61 %)
2,644,659
(27.70 %)
7,620,145
(74.29 %)
331,404
(12.87 %)
15 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1
60,922
(2.51 %)
12,544
(0.38 %)
28,250
(1.22 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
2,989
(100.00 %)
8,579,099
(49.81 %)
831,222
(15.75 %)
21,718,178
(51.79 %)
105,821
(2.42 %)
16 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1
n/a 11,960
(0.40 %)
25,618
(1.25 %)
n/a 42.94
(99.99 %)
1,633
(0.01 %)
1,412
(100.00 %)
7,453,535
(49.31 %)
686,063
(13.00 %)
19,985,605
(50.32 %)
86,138
(2.16 %)
17 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1
34,090
(2.80 %)
12,481
(1.05 %)
13,920
(1.38 %)
n/a 43.90
(94.72 %)
97,039
(5.30 %)
70
(100.00 %)
2,480,154
(36.88 %)
215,190
(0.56 %)
11,196,176
(26.22 %)
26,647
(0.98 %)
18 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3
n/a 16,280
(0.07 %)
186,628
(1.11 %)
n/a 46.01
(99.99 %)
184,422
(0.01 %)
27,157
(100.00 %)
28,291,633
(68.19 %)
7,299,053
(4.96 %)
211,579
(99.99 %)
2,388,998
(5.24 %)
19 axolotl (Mex_15411 2024)
GCF_040938575.1
96,841
(0.40 %)
18,564
(0.07 %)
184,527
(1.17 %)
n/a 46.34
(100.00 %)
2,095
(0.00 %)
221
(100.00 %)
27,951,551
(67.11 %)
8,561,025
(9.70 %)
2,316
(100.00 %)
2,452,305
(5.31 %)
20 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1
n/a 13,757
(0.41 %)
22,690
(1.04 %)
n/a 44.49
(99.99 %)
2,778
(0.01 %)
5,088
(100.00 %)
6,693,687
(65.70 %)
1,238,350
(12.60 %)
21,698,294
(51.34 %)
113,759
(1.90 %)
21 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1
n/a 13,515
(0.42 %)
21,374
(1.06 %)
n/a 44.47
(99.99 %)
2,740
(0.01 %)
6,569
(99.99 %)
6,483,403
(66.87 %)
1,041,828
(9.99 %)
21,142,745
(50.24 %)
107,555
(1.88 %)
22 Bellinger river turtle (BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1
n/a 14,732
(1.14 %)
18,988
(1.77 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
57
(0.00 %)
129
(100.00 %)
1,130,950
(11.22 %)
213,212
(1.80 %)
11,049,280
(26.48 %)
53,923
(2.09 %)
23 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1
n/a 12,696
(0.93 %)
14,818
(1.50 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
64
(0.00 %)
52
(100.00 %)
1,468,805
(6.73 %)
739,796
(3.28 %)
10,900,584
(40.56 %)
76,786
(1.60 %)
24 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1
n/a 13,944
(0.92 %)
16,009
(1.45 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
73
(0.00 %)
78
(100.00 %)
1,636,825
(6.67 %)
826,053
(3.24 %)
12,398,166
(40.90 %)
86,825
(1.61 %)
25 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1
n/a 11,900
(0.54 %)
27,568
(1.55 %)
n/a 44.98
(99.98 %)
2,269
(0.02 %)
1,647
(100.00 %)
8,972,805
(66.20 %)
1,061,811
(8.11 %)
11,599,498
(58.72 %)
278,499
(6.42 %)
26 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1
55,474
(7.85 %)
13,848
(1.83 %)
27,055
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
97
(0.00 %)
389
(100.00 %)
953,492
(13.69 %)
387,699
(7.91 %)
4,552,359
(37.72 %)
46,301
(2.99 %)
27 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
43,764
(2.79 %)
28 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1
38,099
(3.25 %)
14,028
(1.05 %)
19,932
(1.81 %)
n/a 41.14
(98.37 %)
114,440
(1.64 %)
118,178
(98.36 %)
1,376,455
(6.78 %)
1,094,843
(5.18 %)
9,127,396
(44.98 %)
46,291
(1.18 %)
29 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1
n/a 14,463
(1.05 %)
20,625
(1.90 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
191
(0.00 %)
29
(100.00 %)
1,456,556
(7.33 %)
1,162,200
(6.85 %)
9,275,690
(46.71 %)
44,738
(1.08 %)
30 Brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1
41,782
(3.73 %)
14,463
(1.05 %)
20,186
(1.84 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
191
(0.00 %)
29
(100.00 %)
1,456,556
(7.33 %)
1,162,200
(6.85 %)
9,275,690
(46.71 %)
44,738
(1.08 %)
31 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1
n/a 12,479
(1.04 %)
16,886
(1.81 %)
n/a 41.00
(100.00 %)
172
(0.00 %)
41
(100.00 %)
1,249,920
(6.94 %)
941,401
(5.42 %)
8,402,482
(44.77 %)
37,299
(1.02 %)
32 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1
n/a 11,753
(1.00 %)
29,468
(1.83 %)
n/a 40.67
(98.13 %)
169,987
(1.84 %)
753,655
(98.16 %)
1,167,225
(5.67 %)
768,909
(2.88 %)
8,825,109
(34.93 %)
53,035
(1.80 %)
33 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2
24,323
(2.63 %)
14,045
(1.20 %)
27,133
(2.20 %)
n/a 39.97
(92.15 %)
115,571
(7.86 %)
167,851
(92.14 %)
1,227,118
(8.97 %)
819,247
(3.70 %)
8,328,674
(35.16 %)
68,858
(2.06 %)
34 Burmese python
GCF_000186305.1
35,663
(4.16 %)
13,718
(1.31 %)
20,498
(2.06 %)
n/a 39.61
(96.54 %)
235,132
(3.52 %)
274,244
(96.48 %)
727,874
(3.19 %)
409,033
(2.06 %)
8,318,382
(25.30 %)
29,212
(1.10 %)
35 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1
n/a 13,973
(0.70 %)
47,231
(2.71 %)
n/a 41.26
(99.97 %)
5,955
(0.03 %)
60,824
(99.97 %)
1,793,416
(10.43 %)
1,374,078
(8.30 %)
10,043,407
(46.03 %)
89,437
(4.63 %)
36 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1
n/a 13,386
(1.04 %)
21,767
(2.35 %)
n/a 40.56
(100.00 %)
256
(0.00 %)
140
(100.00 %)
1,354,500
(9.93 %)
998,712
(8.21 %)
8,504,468
(46.70 %)
78,768
(3.37 %)
37 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1
77,919
(2.56 %)
11,965
(0.44 %)
20,833
(1.25 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
1,443
(0.01 %)
595
(100.00 %)
4,902,644
(34.96 %)
1,040,891
(17.82 %)
16,403,243
(54.79 %)
113,936
(1.69 %)
38 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1
n/a 11,692
(0.46 %)
19,961
(1.22 %)
n/a 42.79
(99.99 %)
1,507
(0.01 %)
445
(100.00 %)
4,781,152
(36.16 %)
876,063
(14.65 %)
16,060,040
(52.49 %)
101,598
(1.64 %)
39 central bearded dragon
GCF_900067755.1
42,304
(3.53 %)
13,856
(1.19 %)
17,956
(1.96 %)
n/a 41.81
(96.03 %)
90,546
(3.99 %)
13,749
(100.00 %)
821,868
(3.44 %)
570,849
(3.46 %)
9,494,309
(29.78 %)
48,137
(1.31 %)
40 Chinese alligator
GCF_000455745.1
49,884
(3.04 %)
14,431
(1.00 %)
15,854
(1.43 %)
n/a 44.49
(96.86 %)
167,965
(3.17 %)
177,282
(96.83 %)
2,919,372
(38.76 %)
346,310
(1.06 %)
12,332,417
(29.19 %)
46,638
(1.19 %)
41 Chinese soft-shelled turtle
GCF_000230535.1
45,441
(3.08 %)
13,715
(0.96 %)
16,798
(1.50 %)
n/a 44.42
(95.68 %)
185,476
(4.35 %)
205,380
(95.65 %)
1,193,608
(10.92 %)
455,163
(3.06 %)
11,234,886
(32.34 %)
95,997
(2.06 %)
42 coelacanth
GCF_000225785.1
40,763
(2.63 %)
13,493
(0.78 %)
17,640
(1.50 %)
n/a 41.15
(76.37 %)
269,010
(23.67 %)
291,829
(76.33 %)
2,026,776
(9.13 %)
571,917
(1.19 %)
14,630,157
(34.87 %)
42,857
(0.54 %)
43 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1
40,046
(2.75 %)
13,820
(0.63 %)
17,285
(1.40 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
154
(0.00 %)
197
(100.00 %)
2,064,326
(2.75 %)
1,047,267
(3.01 %)
15,613,479
(54.45 %)
140,027
(2.34 %)
44 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1
n/a 13,999
(1.21 %)
18,145
(2.02 %)
n/a 44.85
(100.00 %)
286
(0.00 %)
827
(100.00 %)
844,126
(6.57 %)
462,086
(2.56 %)
8,237,807
(37.72 %)
30,098
(0.96 %)
45 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1
n/a 13,266
(1.21 %)
16,750
(1.98 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
372
(0.00 %)
350
(100.00 %)
782,672
(6.46 %)
434,795
(2.20 %)
7,788,697
(37.04 %)
28,089
(0.98 %)
46 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1
n/a 13,073
(0.44 %)
43,036
(1.95 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
14
(0.00 %)
12,033
(100.00 %)
1,489,788
(2.18 %)
2,621,157
(9.04 %)
17,154,926
(55.44 %)
581,115
(7.68 %)
47 common garter snake
GCF_001077635.1
26,656
(3.83 %)
11,623
(1.25 %)
17,501
(2.23 %)
n/a 39.92
(78.84 %)
246,220
(21.21 %)
175,977
(78.79 %)
606,040
(3.22 %)
543,646
(2.36 %)
6,946,141
(27.08 %)
36,264
(1.27 %)
48 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1
45,869
(6.34 %)
14,279
(1.46 %)
19,710
(2.38 %)
n/a 44.05
(99.99 %)
683
(0.01 %)
48
(100.00 %)
4,128,183
(45.62 %)
513,318
(3.73 %)
7,172,928
(37.61 %)
92,858
(2.90 %)
49 common newt (primary hap 2024)
GCA_964263255.1
n/a 17,972
(0.09 %)
229,830
(1.61 %)
n/a 45.06
(100.00 %)
4,030
(0.00 %)
15,265
(100.00 %)
4,807,454
(1.50 %)
10,258,109
(12.52 %)
19,295
(100.00 %)
2,684,793
(7.99 %)
50 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1
n/a 14,564
(0.56 %)
46,435
(2.21 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
349
(0.00 %)
161
(100.00 %)
1,677,382
(3.51 %)
3,229,435
(13.31 %)
15,027,089
(51.43 %)
282,389
(3.86 %)
51 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1
42,170
(1.55 %)
14,560
(0.56 %)
46,435
(2.21 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
349
(0.00 %)
159
(100.00 %)
1,677,374
(3.51 %)
3,229,434
(13.31 %)
15,027,049
(51.43 %)
282,389
(3.86 %)
52 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1
n/a 12,074
(0.39 %)
46,329
(1.82 %)
n/a 44.48
(99.99 %)
156
(0.01 %)
24,351
(99.99 %)
1,186,360
(1.65 %)
2,279,941
(13.33 %)
14,665,548
(61.48 %)
405,097
(4.49 %)
53 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1
45,085
(1.10 %)
14,240
(0.38 %)
46,470
(1.68 %)
37,594
(0.91 %)
44.49
(99.80 %)
4,199
(0.20 %)
1,306
(100.00 %)
1,658,204
(1.79 %)
3,099,513
(13.49 %)
19,236,510
(62.70 %)
539,919
(4.45 %)
54 common wall lizard (hap1 2024)
GCA_964188315.1
n/a 14,322
(1.36 %)
19,700
(2.31 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
827
(0.01 %)
185
(100.00 %)
868,785
(4.15 %)
544,999
(4.79 %)
7,097,077
(38.69 %)
120,725
(3.71 %)
55 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1
n/a 13,838
(1.39 %)
19,262
(2.35 %)
n/a 44.17
(99.99 %)
734
(0.01 %)
825
(99.99 %)
815,808
(4.07 %)
494,366
(4.53 %)
6,739,651
(37.84 %)
113,458
(3.63 %)
56 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1
56,506
(4.85 %)
14,453
(1.36 %)
20,529
(2.31 %)
n/a 44.18
(99.81 %)
4,085
(0.19 %)
2,161
(100.00 %)
1,089,164
(8.31 %)
506,669
(2.12 %)
7,474,116
(36.15 %)
122,507
(3.69 %)
57 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1
53,076
(4.72 %)
13,697
(1.21 %)
20,819
(2.22 %)
n/a 40.33
(96.60 %)
3,553
(3.40 %)
4,019
(96.60 %)
4,116,616
(49.72 %)
917,455
(3.96 %)
8,460,248
(40.76 %)
64,946
(2.08 %)
58 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1
48,995
(3.92 %)
13,316
(1.14 %)
23,595
(2.17 %)
29,466
(2.61 %)
40.35
(95.32 %)
84,947
(4.70 %)
34,268
(100.00 %)
1,243,828
(6.50 %)
884,533
(3.25 %)
8,373,398
(40.31 %)
66,926
(2.14 %)
59 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1
n/a 14,955
(0.23 %)
n/a n/a 45.61
(99.80 %)
2,431
(0.20 %)
5,958
(99.80 %)
20,007,151
(76.28 %)
5,951,819
(19.40 %)
5,958
(99.80 %)
991,009
(4.86 %)
60 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1
140,657
(1.12 %)
15,461
(0.24 %)
54,344
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
3,521,281
(2.88 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
990,274
(4.84 %)
61 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1
n/a 13,192
(1.36 %)
19,293
(2.32 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
n/a 1,936
(100.00 %)
808,341
(4.31 %)
467,532
(2.91 %)
6,418,809
(38.02 %)
107,080
(3.15 %)
62 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1
n/a 14,249
(1.37 %)
19,304
(2.27 %)
n/a 43.87
(100.00 %)
47
(0.00 %)
55
(100.00 %)
882,564
(4.30 %)
511,174
(3.24 %)
7,094,363
(38.65 %)
117,222
(3.18 %)
63 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1
50,318
(3.53 %)
15,109
(1.08 %)
19,280
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
110,838
(2.71 %)
64 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1
n/a 15,081
(1.08 %)
19,115
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.98 %)
127
(0.02 %)
59
(100.00 %)
4,093,707
(46.36 %)
404,046
(1.70 %)
11,113,266
(33.78 %)
111,129
(2.68 %)
65 eastern brown snake
GCF_900518735.1
34,614
(3.30 %)
13,625
(1.22 %)
21,795
(2.00 %)
n/a 39.84
(97.54 %)
59,472
(2.47 %)
28,550
(100.00 %)
1,020,240
(5.86 %)
663,810
(2.41 %)
8,140,554
(39.61 %)
52,895
(2.12 %)
66 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1
n/a 13,413
(1.19 %)
18,038
(1.85 %)
n/a 44.58
(99.99 %)
553
(0.01 %)
771
(99.99 %)
1,003,504
(9.02 %)
621,617
(3.54 %)
8,327,948
(30.44 %)
117,734
(4.05 %)
67 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1
n/a 13,632
(0.43 %)
35,630
(1.52 %)
n/a 46.77
(99.99 %)
1,773
(0.01 %)
590
(100.00 %)
1,759,193
(1.98 %)
2,013,186
(16.21 %)
16,138,898
(60.55 %)
614,432
(5.85 %)
68 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1
n/a 13,882
(0.43 %)
35,323
(1.46 %)
n/a 46.78
(99.99 %)
1,745
(0.01 %)
1,002
(100.00 %)
1,769,293
(1.99 %)
2,023,109
(16.33 %)
16,148,710
(60.55 %)
618,204
(5.89 %)
69 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1
32,553
(4.75 %)
11,542
(1.51 %)
18,900
(3.25 %)
n/a 42.85
(99.99 %)
14,404
(0.01 %)
3,822
(99.99 %)
1,971,730
(36.60 %)
433,955
(3.92 %)
5,654,656
(37.91 %)
41,081
(3.43 %)
70 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1
n/a 12,650
(0.38 %)
20,614
(1.06 %)
n/a 42.75
(97.99 %)
3,552
(2.01 %)
4,000
(100.00 %)
9,489,793
(70.34 %)
976,827
(6.97 %)
21,183,330
(44.32 %)
42,917
(1.08 %)
71 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1
43,156
(1.65 %)
12,749
(0.40 %)
19,519
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
3,716
(1.95 %)
1,962
(100.00 %)
9,420,365
(63.82 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,566
(43.88 %)
41,682
(1.08 %)
72 European common frog (2021)
GCF_905171775.1
51,633
(1.57 %)
13,864
(0.46 %)
39,978
(1.88 %)
57,578
(1.85 %)
44.15
(99.36 %)
1,860
(0.64 %)
554
(100.00 %)
1,804,642
(3.42 %)
2,925,830
(9.39 %)
18,921,726
(55.43 %)
641,799
(7.66 %)
73 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
120,990
(6.12 %)
74 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1
n/a 17,177
(2.21 %)
36,037
(5.58 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
n/a 2,338
(100.00 %)
811,567
(5.37 %)
759,871
(7.97 %)
5,672,321
(27.30 %)
127,837
(8.05 %)
75 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1
64,143
(9.57 %)
17,054
(2.22 %)
34,278
(5.56 %)
79,684
(7.37 %)
43.64
(99.61 %)
640
(0.40 %)
54
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,521
(8.15 %)
5,700,890
(27.40 %)
130,346
(8.19 %)
76 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1
24,643
(2.02 %)
14,238
(1.16 %)
21,782
(2.17 %)
n/a 44.68
(99.77 %)
153
(0.23 %)
591
(100.00 %)
1,174,615
(6.99 %)
436,937
(2.95 %)
8,308,817
(39.80 %)
83,089
(2.82 %)
77 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1
n/a 14,220
(1.16 %)
21,979
(2.19 %)
n/a 44.64
(99.68 %)
177
(0.32 %)
381
(100.00 %)
1,169,660
(6.57 %)
432,998
(2.45 %)
8,403,791
(39.55 %)
82,695
(2.80 %)
78 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1
n/a 14,802
(0.99 %)
19,772
(1.60 %)
n/a 44.74
(99.86 %)
148
(0.14 %)
106
(100.00 %)
1,526,737
(12.44 %)
460,562
(2.12 %)
11,130,580
(35.42 %)
136,002
(2.92 %)
79 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1
27,890
(1.81 %)
14,802
(0.99 %)
19,772
(1.60 %)
n/a 44.74
(99.86 %)
148
(0.14 %)
106
(100.00 %)
1,526,737
(12.44 %)
460,562
(2.12 %)
11,130,580
(35.42 %)
136,002
(2.92 %)
80 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1
n/a 14,971
(1.00 %)
20,099
(1.61 %)
n/a 44.79
(99.77 %)
130
(0.23 %)
156
(100.00 %)
1,536,611
(12.44 %)
471,903
(2.16 %)
11,129,943
(35.50 %)
138,047
(2.94 %)
81 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1
n/a 7,757
(0.73 %)
36,797
(4.29 %)
n/a 49.25
(99.97 %)
1,795
(0.03 %)
1,497
(100.00 %)
657,405
(7.80 %)
1,165,422
(20.23 %)
4,931,883
(50.78 %)
149,123
(44.61 %)
82 Far Eastern brook lamprey (LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1
37,946
(7.32 %)
7,797
(0.72 %)
39,285
(4.37 %)
n/a 48.80
(98.99 %)
3,287
(1.01 %)
1,946
(100.00 %)
716,804
(6.02 %)
1,192,268
(15.54 %)
5,304,945
(47.85 %)
170,623
(43.14 %)
83 fence lizard
GCF_019175285.1
48,391
(3.65 %)
14,000
(1.07 %)
17,384
(1.71 %)
n/a 41.25
(97.53 %)
48,138
(2.47 %)
45,012
(100.00 %)
1,357,856
(6.95 %)
596,824
(1.92 %)
11,090,372
(34.38 %)
67,007
(1.51 %)
84 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1
n/a 14,292
(1.37 %)
20,325
(2.33 %)
n/a 43.79
(99.99 %)
872
(0.01 %)
353
(100.00 %)
840,209
(4.04 %)
484,479
(4.00 %)
7,010,158
(37.94 %)
87,924
(2.61 %)
85 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1
n/a 13,804
(1.42 %)
19,450
(2.39 %)
n/a 43.73
(99.99 %)
795
(0.01 %)
937
(99.99 %)
782,998
(3.95 %)
448,089
(3.61 %)
6,735,032
(36.83 %)
81,312
(2.54 %)
86 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1
n/a 2,936
(0.15 %)
17,722
(1.38 %)
n/a 38.51
(100.00 %)
n/a 13,751
(100.00 %)
919,882
(3.50 %)
1,443,294
(10.50 %)
7,705,012
(57.28 %)
74,669
(1.25 %)
87 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1
38,238
(0.68 %)
15,452
(0.21 %)
47,500
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
7,009
(1.99 %)
2,467
(100.00 %)
4,258,941
(3.44 %)
7,150,261
(12.27 %)
9,476
(98.01 %)
n/a
88 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1
n/a 14,321
(0.67 %)
22,672
(1.51 %)
n/a 40.32
(99.87 %)
1,421
(0.13 %)
2,806
(100.00 %)
1,320,578
(5.87 %)
1,506,550
(13.49 %)
13,293,397
(46.37 %)
63,677
(0.85 %)
89 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1
n/a 14,224
(0.69 %)
22,406
(1.57 %)
n/a 40.75
(99.89 %)
1,383
(0.12 %)
914
(100.00 %)
1,300,452
(3.37 %)
1,495,355
(10.56 %)
13,385,401
(44.67 %)
64,121
(0.88 %)
90 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1
n/a 14,392
(0.90 %)
17,909
(1.50 %)
n/a 42.86
(99.84 %)
213
(0.16 %)
836
(99.84 %)
1,440,070
(7.19 %)
620,131
(2.54 %)
10,919,950
(45.21 %)
47,933
(1.03 %)
91 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1
n/a 14,331
(0.90 %)
17,854
(1.51 %)
n/a 42.86
(99.72 %)
242
(0.28 %)
78
(100.00 %)
1,426,833
(7.17 %)
616,690
(2.63 %)
10,819,054
(45.31 %)
47,454
(1.03 %)
92 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1
65,314
(3.47 %)
14,331
(0.90 %)
17,853
(1.51 %)
n/a 42.86
(99.72 %)
242
(0.28 %)
76
(100.00 %)
1,426,827
(7.17 %)
616,687
(2.63 %)
10,819,019
(45.31 %)
47,453
(1.03 %)
93 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1
n/a 12,821
(0.47 %)
30,612
(1.44 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,651
(100.00 %)
1,139,595
(1.64 %)
1,170,215
(3.77 %)
17,091,511
(52.44 %)
235,170
(4.50 %)
94 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2
n/a 14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,331,879
(1.68 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,806
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
95 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1
32,284
(2.61 %)
12,194
(1.03 %)
12,758
(1.30 %)
n/a 43.95
(73.60 %)
248,526
(26.44 %)
81
(100.00 %)
2,589,103
(36.89 %)
243,334
(0.51 %)
11,279,606
(20.80 %)
26,651
(0.60 %)
96 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1
n/a 14,254
(0.94 %)
23,016
(2.00 %)
n/a 45.13
(99.95 %)
61
(0.05 %)
298
(100.00 %)
1,230,357
(13.08 %)
350,230
(2.85 %)
11,854,314
(33.03 %)
39,919
(1.95 %)
97 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1
n/a 14,151
(0.94 %)
23,338
(1.95 %)
n/a 45.15
(99.95 %)
118
(0.05 %)
160
(100.00 %)
1,232,693
(12.81 %)
332,737
(2.19 %)
11,907,298
(32.91 %)
40,660
(1.87 %)
98 giant manta (hap1 2023)
GCA_030028105.1
n/a 12,432
(0.38 %)
24,821
(1.16 %)
n/a 43.26
(99.23 %)
1,810
(0.77 %)
4,715
(100.00 %)
7,913,208
(49.68 %)
969,352
(14.22 %)
20,235,210
(54.42 %)
110,678
(1.74 %)
99 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1
n/a 12,198
(0.42 %)
23,127
(1.17 %)
n/a 42.85
(98.49 %)
1,742
(1.51 %)
1,558
(100.00 %)
7,431,472
(52.41 %)
716,951
(7.28 %)
19,456,793
(50.99 %)
91,414
(1.45 %)
100 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2
57,442
(3.17 %)
14,852
(1.00 %)
18,125
(1.49 %)
31,841
(1.80 %)
44.14
(98.71 %)
562
(1.29 %)
383
(100.00 %)
1,630,271
(13.86 %)
387,796
(2.00 %)
11,572,827
(33.36 %)
71,687
(2.29 %)
101 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1
n/a 13,359
(0.95 %)
19,347
(1.51 %)
n/a 44.27
(100.00 %)
n/a 8,736
(100.00 %)
1,404,513
(13.79 %)
334,726
(2.35 %)
9,735,007
(33.33 %)
61,680
(2.32 %)
102 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023)
GCA_029215685.1
n/a 12,291
(1.06 %)
19,125
(2.02 %)
n/a 40.55
(100.00 %)
584
(0.00 %)
1,233
(100.00 %)
1,259,781
(7.92 %)
925,571
(7.56 %)
7,739,320
(45.92 %)
73,681
(2.81 %)
103 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1
n/a 13,289
(1.09 %)
20,513
(2.09 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
603
(0.00 %)
1,029
(100.00 %)
1,325,747
(8.26 %)
973,338
(7.56 %)
8,352,703
(45.38 %)
72,941
(2.59 %)
104 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1
86,666
(4.30 %)
14,269
(0.91 %)
18,195
(1.57 %)
n/a 44.82
(100.00 %)
42
(0.00 %)
44
(100.00 %)
1,644,976
(6.04 %)
823,058
(3.00 %)
11,991,046
(41.43 %)
80,718
(1.90 %)
105 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1
n/a 14,094
(1.03 %)
17,875
(1.65 %)
n/a 41.62
(99.95 %)
28
(0.05 %)
30
(100.00 %)
1,100,228
(6.21 %)
423,695
(1.33 %)
11,521,828
(32.55 %)
62,978
(2.00 %)
106 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1
n/a 13,758
(1.02 %)
16,909
(1.62 %)
n/a 41.53
(99.01 %)
19
(0.99 %)
52
(99.01 %)
1,069,189
(6.12 %)
410,262
(1.25 %)
11,390,195
(32.28 %)
60,835
(1.92 %)
107 gray bichir
GCF_016835505.1
48,178
(1.88 %)
12,963
(0.44 %)
24,479
(1.21 %)
n/a 39.32
(99.96 %)
3,166
(0.04 %)
9,856
(100.00 %)
1,765,862
(2.54 %)
1,017,723
(2.38 %)
20,924,763
(47.66 %)
98,862
(1.64 %)
108 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1
n/a 20
(0.30 %)
63
(2.06 %)
n/a 45.02
(99.98 %)
28
(0.02 %)
39
(100.00 %)
8,165
(60.43 %)
2,740
(27.09 %)
15,863
(31.63 %)
167
(5.51 %)
109 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1
49,865
(1.46 %)
13,010
(0.37 %)
19,263
(0.92 %)
46,152
(1.30 %)
45.21
(99.55 %)
2,645
(0.45 %)
719
(100.00 %)
1,046,023
(4.00 %)
1,584,100
(21.25 %)
23,278,563
(52.42 %)
77,021
(1.94 %)
110 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1
56,324
(5.85 %)
14,020
(1.12 %)
20,096
(1.86 %)
n/a 40.60
(98.38 %)
841
(1.62 %)
211
(100.00 %)
4,859,635
(53.14 %)
909,429
(5.19 %)
8,304,332
(44.07 %)
56,404
(1.78 %)
111 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1
38,096
(3.63 %)
13,021
(1.08 %)
20,780
(1.86 %)
38,266
(3.08 %)
40.32
(94.57 %)
35,533
(5.44 %)
41,987
(94.56 %)
2,415,433
(28.92 %)
702,538
(2.99 %)
8,199,653
(39.69 %)
42,151
(1.18 %)
112 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2
38,096
(3.63 %)
13,140
(1.11 %)
20,772
(1.86 %)
38,229
(3.08 %)
40.32
(94.57 %)
35,530
(5.44 %)
41,986
(94.56 %)
4,455,733
(51.37 %)
702,537
(2.99 %)
8,199,580
(39.69 %)
42,151
(1.18 %)
113 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2
n/a 13,635
(1.05 %)
19,414
(1.61 %)
n/a 44.16
(99.95 %)
60
(0.05 %)
6,797
(99.95 %)
3,221,668
(44.97 %)
275,275
(1.28 %)
9,802,895
(32.14 %)
45,469
(1.48 %)
114 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2
84,366
(4.63 %)
14,725
(1.06 %)
17,444
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
298
(0.56 %)
93
(100.00 %)
1,701,640
(14.83 %)
304,306
(1.25 %)
11,135,147
(31.96 %)
49,025
(1.44 %)
115 High Himalaya frog
GCF_000935625.1
26,109
(1.87 %)
13,695
(0.94 %)
28,085
(2.39 %)
n/a 42.55
(96.32 %)
122,325
(3.70 %)
147,513
(96.30 %)
536,058
(1.39 %)
794,563
(5.48 %)
11,465,450
(37.44 %)
219,772
(3.92 %)
116 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1
n/a 15,006
(0.28 %)
22,481
(0.80 %)
n/a 45.05
(99.53 %)
2,781
(0.47 %)
2,532
(99.97 %)
1,344,546
(5.76 %)
2,364,825
(28.34 %)
5,088
(99.53 %)
89,340
(2.10 %)
117 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1
n/a 12,766
(0.30 %)
21,591
(0.87 %)
n/a 44.88
(99.43 %)
2,790
(0.57 %)
1,496
(100.00 %)
1,008,880
(5.19 %)
1,596,129
(22.32 %)
22,180,341
(62.98 %)
82,276
(1.85 %)
118 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1
60,844
(1.44 %)
15,004
(0.28 %)
22,510
(0.76 %)
n/a 45.05
(99.53 %)
2,781
(0.47 %)
2,306
(100.00 %)
1,344,541
(5.76 %)
2,364,824
(28.34 %)
5,087
(99.53 %)
89,340
(2.10 %)
119 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1
n/a 14,359
(0.89 %)
32,575
(2.67 %)
n/a 43.88
(95.18 %)
788
(4.82 %)
3,358
(95.18 %)
922,807
(2.38 %)
1,744,603
(15.45 %)
10,318,168
(48.47 %)
244,270
(5.02 %)
120 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1
50,542
(2.91 %)
14,058
(0.89 %)
30,599
(2.64 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
235,277
(5.56 %)
121 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1
n/a 14,141
(0.97 %)
22,232
(2.16 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
262
(0.00 %)
99
(100.00 %)
944,742
(4.86 %)
1,927,659
(22.26 %)
8,988,510
(49.29 %)
77,721
(1.73 %)
122 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1
n/a 15,136
(0.10 %)
n/a n/a 45.95
(100.00 %)
922
(0.00 %)
296
(100.00 %)
4,478,794
(1.33 %)
6,452,537
(8.86 %)
1,189
(100.00 %)
1,581,360
(4.00 %)
123 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1
57,032
(0.47 %)
15,184
(0.10 %)
72,314
(0.62 %)
n/a 45.93
(100.00 %)
1,829
(0.00 %)
616
(100.00 %)
4,343,624
(1.32 %)
6,295,886
(8.29 %)
2,445
(100.00 %)
1,546,882
(4.02 %)
124 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1
n/a 13,028
(1.10 %)
17,854
(1.73 %)
n/a 40.46
(93.80 %)
11,910
(6.20 %)
1,897
(100.00 %)
1,114,498
(5.61 %)
671,854
(2.20 %)
8,205,261
(40.40 %)
47,381
(1.37 %)
125 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1
n/a 17,858
(2.43 %)
32,738
(5.46 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4,333
(100.00 %)
583,632
(3.71 %)
418,411
(3.74 %)
5,198,155
(21.50 %)
76,879
(3.71 %)
126 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1
n/a 14,241
(1.31 %)
20,399
(2.26 %)
n/a 44.32
(99.99 %)
762
(0.01 %)
296
(100.00 %)
832,389
(5.27 %)
530,449
(8.28 %)
6,937,083
(40.38 %)
106,667
(3.79 %)
127 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1
n/a 13,696
(1.37 %)
19,278
(2.32 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
690
(0.01 %)
842
(99.99 %)
763,893
(4.21 %)
451,861
(6.69 %)
6,696,380
(38.71 %)
98,815
(3.65 %)
128 Japanese sawshark (hap1 2024)
GCA_044704955.1
n/a 14,672
(0.28 %)
30,181
(0.79 %)
n/a 47.02
(99.98 %)
5,985
(0.02 %)
4,317
(100.00 %)
1,167,498
(3.08 %)
2,399,496
(18.16 %)
10,302
(99.98 %)
503,637
(6.56 %)
129 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1
n/a 14,833
(0.26 %)
30,853
(0.75 %)
n/a 47.12
(99.98 %)
5,953
(0.02 %)
5,626
(100.00 %)
1,238,549
(4.06 %)
2,718,867
(21.85 %)
11,579
(99.98 %)
518,286
(6.88 %)
130 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1
43,331
(4.33 %)
13,543
(1.31 %)
18,081
(2.11 %)
n/a 44.04
(99.03 %)
19,737
(0.97 %)
1,411
(100.00 %)
753,603
(4.91 %)
263,965
(1.41 %)
8,061,012
(24.65 %)
49,808
(4.28 %)
131 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1
n/a 13,155
(1.15 %)
22,239
(2.06 %)
n/a 41.01
(100.00 %)
1
(0.00 %)
6,800
(100.00 %)
1,155,093
(7.75 %)
707,777
(4.25 %)
7,071,611
(44.00 %)
104,556
(4.39 %)
132 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1
n/a 13,350
(1.17 %)
18,904
(1.93 %)
n/a 40.96
(99.78 %)
769
(0.22 %)
56
(100.00 %)
1,209,793
(7.69 %)
762,735
(5.06 %)
7,424,674
(44.80 %)
110,631
(4.07 %)
133 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2
n/a 11,035
(1.05 %)
16,064
(1.50 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
7
(0.00 %)
9,006
(100.00 %)
2,685,200
(47.08 %)
208,060
(1.19 %)
7,184,246
(33.31 %)
25,133
(1.42 %)
134 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3
73,318
(3.97 %)
14,610
(1.03 %)
16,358
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
668
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,694,449
(14.90 %)
304,773
(1.14 %)
11,121,962
(34.21 %)
35,485
(1.36 %)
135 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1
37,120
(2.89 %)
14,358
(0.93 %)
23,080
(1.92 %)
n/a 44.06
(100.00 %)
62
(0.00 %)
76
(100.00 %)
969,188
(4.21 %)
557,245
(2.88 %)
11,096,222
(37.91 %)
82,956
(2.56 %)
136 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1
49,601
(2.40 %)
12,335
(0.44 %)
22,690
(1.20 %)
n/a 42.91
(100.00 %)
697
(0.00 %)
200
(100.00 %)
7,453,775
(54.11 %)
677,453
(5.15 %)
18,943,414
(51.98 %)
87,750
(1.43 %)
137 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1
n/a 14,239
(1.41 %)
19,740
(2.33 %)
n/a 43.80
(99.98 %)
2,346
(0.02 %)
2,149
(100.00 %)
830,790
(4.33 %)
445,450
(2.12 %)
7,171,057
(36.69 %)
86,200
(2.56 %)
138 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1
40,008
(3.35 %)
11,836
(0.67 %)
25,770
(1.80 %)
n/a 44.13
(100.00 %)
862
(0.00 %)
1,769
(100.00 %)
8,221,960
(66.45 %)
1,044,111
(3.71 %)
10,050,264
(53.79 %)
205,567
(4.36 %)
139 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1
n/a 13,670
(0.79 %)
19,028
(1.31 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
18
(0.00 %)
39
(100.00 %)
1,040,467
(4.86 %)
924,221
(6.37 %)
9,015,048
(56.81 %)
248,142
(10.84 %)
140 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1
n/a 13,625
(1.22 %)
18,049
(1.96 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
12
(0.00 %)
23
(100.00 %)
833,693
(2.81 %)
607,040
(2.82 %)
7,939,139
(42.05 %)
52,987
(2.59 %)
141 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1
n/a 14,091
(1.26 %)
20,552
(2.20 %)
n/a 44.36
(99.99 %)
1,005
(0.01 %)
509
(100.00 %)
932,842
(5.02 %)
555,337
(4.34 %)
6,595,536
(41.39 %)
119,467
(4.32 %)
142 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1
n/a 13,653
(1.34 %)
19,764
(2.32 %)
n/a 44.23
(99.99 %)
817
(0.01 %)
1,444
(99.99 %)
857,503
(4.68 %)
507,819
(4.16 %)
6,632,822
(39.41 %)
103,858
(4.10 %)
143 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1
n/a 13,858
(1.33 %)
19,727
(2.31 %)
n/a 43.80
(99.99 %)
836
(0.01 %)
326
(100.00 %)
885,596
(4.43 %)
527,127
(3.30 %)
7,008,185
(38.56 %)
89,737
(2.87 %)
144 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1
n/a 13,817
(1.35 %)
21,024
(2.50 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
811
(0.01 %)
1,458
(99.99 %)
890,080
(4.42 %)
526,749
(3.38 %)
7,001,691
(37.94 %)
89,526
(2.96 %)
145 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1
n/a 14,289
(1.31 %)
20,112
(2.23 %)
n/a 44.03
(99.99 %)
823
(0.01 %)
387
(100.00 %)
830,352
(7.87 %)
552,452
(8.32 %)
6,838,068
(40.20 %)
90,074
(2.82 %)
146 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1
n/a 13,759
(1.39 %)
19,452
(2.34 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
754
(0.01 %)
954
(99.99 %)
768,595
(5.31 %)
448,816
(5.54 %)
6,722,284
(37.88 %)
82,575
(2.83 %)
147 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2
n/a 14,314
(1.36 %)
20,522
(2.35 %)
n/a 43.98
(99.98 %)
1,506
(0.02 %)
337
(100.00 %)
858,648
(4.22 %)
473,134
(2.71 %)
7,061,380
(38.21 %)
96,600
(3.21 %)
148 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2
n/a 13,828
(1.41 %)
19,048
(2.34 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,365
(0.02 %)
1,548
(99.98 %)
803,451
(4.16 %)
440,340
(2.30 %)
6,774,254
(37.14 %)
89,229
(3.04 %)
149 lizards T.scincoides (rTilSci1hap2 2024)
GCF_035046505.1
33,280
(3.42 %)
13,266
(1.21 %)
16,752
(1.98 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
372
(0.00 %)
350
(100.00 %)
782,672
(6.46 %)
434,795
(2.20 %)
7,788,697
(37.04 %)
28,089
(0.98 %)
150 loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1
61,631
(3.99 %)
14,678
(1.05 %)
17,405
(1.52 %)
42,180
(2.89 %)
44.04
(99.90 %)
745
(0.10 %)
2,008
(100.00 %)
1,279,721
(12.58 %)
319,729
(1.29 %)
10,705,612
(33.91 %)
49,015
(1.39 %)
151 mainland tiger snake
GCF_900518725.1
34,251
(3.18 %)
13,445
(1.15 %)
23,410
(1.90 %)
n/a 39.72
(95.17 %)
79,478
(4.84 %)
52,414
(100.00 %)
1,081,503
(6.00 %)
711,408
(2.47 %)
8,047,065
(40.24 %)
61,669
(2.47 %)
152 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1
n/a 13,269
(1.19 %)
18,533
(1.94 %)
n/a 39.87
(99.25 %)
1,631
(0.75 %)
448
(100.00 %)
1,104,569
(6.42 %)
703,174
(3.07 %)
8,451,422
(40.97 %)
65,260
(2.74 %)
153 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1
n/a 13,646
(1.27 %)
18,378
(2.09 %)
n/a 42.67
(94.37 %)
166,840
(5.67 %)
3,826
(100.00 %)
809,278
(4.31 %)
439,020
(1.66 %)
8,665,254
(33.02 %)
41,638
(1.70 %)
154 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1
n/a 10,549
(1.13 %)
20,171
(2.08 %)
n/a 41.02
(100.00 %)
12
(0.00 %)
9,587
(100.00 %)
889,533
(7.84 %)
565,831
(6.37 %)
5,968,624
(41.74 %)
73,632
(3.80 %)
155 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1
n/a 13,282
(1.16 %)
18,653
(1.90 %)
n/a 40.93
(99.98 %)
1,819
(0.02 %)
384
(100.00 %)
1,187,501
(7.72 %)
762,639
(6.28 %)
7,428,147
(45.35 %)
101,007
(3.95 %)
156 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1
n/a 14,442
(0.44 %)
24,630
(1.28 %)
n/a 41.94
(99.99 %)
2,032
(0.01 %)
464
(100.00 %)
1,928,361
(2.22 %)
2,955,095
(11.97 %)
25,178,773
(53.55 %)
165,699
(1.23 %)
157 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1
n/a 13,824
(0.44 %)
23,296
(1.27 %)
n/a 41.86
(99.99 %)
2,009
(0.01 %)
656
(100.00 %)
1,860,053
(2.17 %)
2,751,941
(10.76 %)
24,252,866
(53.00 %)
157,012
(1.21 %)
158 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1
62,007
(3.15 %)
14,883
(0.96 %)
18,524
(1.48 %)
n/a 44.69
(96.36 %)
1,866
(3.64 %)
621
(100.00 %)
1,372,189
(11.32 %)
472,501
(3.42 %)
11,362,604
(34.69 %)
73,700
(2.04 %)
159 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1
n/a 15,425
(0.94 %)
20,005
(1.48 %)
n/a 44.46
(95.51 %)
1,790
(4.49 %)
4,782
(95.51 %)
1,404,726
(11.28 %)
453,302
(2.47 %)
11,996,092
(34.08 %)
77,167
(2.14 %)
160 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1
n/a 14,957
(0.34 %)
n/a n/a 44.95
(100.00 %)
765
(0.00 %)
1,686
(100.00 %)
1,716,760
(1.89 %)
4,088,695
(23.45 %)
2,437
(100.00 %)
n/a
161 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1
53,268
(1.27 %)
14,955
(0.34 %)
42,108
(1.16 %)
n/a 44.95
(100.00 %)
765
(0.00 %)
1,672
(100.00 %)
1,716,755
(1.89 %)
4,088,682
(23.45 %)
2,436
(100.00 %)
694,865
(6.34 %)
162 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1
66,226
(6.17 %)
21,806
(1.85 %)
31,525
(3.80 %)
n/a 39.02
(99.89 %)
2,963
(0.11 %)
7,192
(99.89 %)
1,126,936
(3.66 %)
877,525
(6.33 %)
9,039,918
(36.85 %)
29,954
(1.06 %)
163 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2
48,414
(3.72 %)
14,988
(1.18 %)
20,316
(1.85 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
n/a 3,735
(100.00 %)
1,108,636
(10.97 %)
229,329
(1.01 %)
11,088,528
(25.43 %)
49,188
(1.67 %)
164 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1
n/a 12,816
(1.09 %)
18,099
(1.83 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
84
(0.00 %)
224
(100.00 %)
1,081,107
(4.01 %)
728,703
(4.64 %)
6,961,724
(42.46 %)
128,617
(3.90 %)
165 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1
n/a 13,531
(1.08 %)
18,971
(1.81 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
85
(0.00 %)
289
(100.00 %)
1,138,891
(3.99 %)
798,941
(5.00 %)
7,476,142
(42.85 %)
135,874
(3.88 %)
166 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1
n/a 14,212
(1.00 %)
20,203
(1.65 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
1,800
(0.01 %)
2,508
(100.00 %)
4,246,095
(48.91 %)
442,393
(1.88 %)
10,453,096
(35.71 %)
134,572
(3.12 %)
167 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1
n/a 14,862
(1.02 %)
19,830
(1.62 %)
n/a 44.76
(100.00 %)
148
(0.00 %)
48
(100.00 %)
4,413,681
(48.88 %)
459,701
(1.92 %)
11,014,102
(35.89 %)
141,800
(3.08 %)
168 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1
n/a 13,448
(1.31 %)
17,745
(2.07 %)
n/a 40.20
(99.98 %)
73
(0.02 %)
116
(99.98 %)
741,052
(2.98 %)
411,477
(3.31 %)
7,668,994
(30.14 %)
34,560
(2.18 %)
169 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1
n/a 13,421
(1.31 %)
17,659
(2.08 %)
n/a 40.15
(99.66 %)
93
(0.34 %)
158
(99.66 %)
733,358
(2.95 %)
403,552
(3.04 %)
7,746,871
(29.97 %)
34,363
(2.08 %)
170 one-colored caecilian (2021)
GCA_901765095.2
n/a 14,569
(0.43 %)
30,498
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,894,383
(1.68 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,143
(52.43 %)
414,828
(3.91 %)
171 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2
n/a 6,827
(0.82 %)
38,010
(4.29 %)
n/a 48.07
(86.05 %)
63,604
(13.95 %)
141,124
(100.00 %)
2,948,140
(52.71 %)
971,264
(7.81 %)
4,836,103
(36.27 %)
186,153
(29.43 %)
172 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1
n/a 7,223
(0.52 %)
11,927
(1.11 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
76
(0.00 %)
4,081
(100.00 %)
988,792
(3.99 %)
1,766,202
(10.24 %)
9,974,001
(52.99 %)
64,462
(1.33 %)
173 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1
n/a 14,522
(0.54 %)
21,861
(1.14 %)
n/a 39.52
(98.39 %)
3,681
(1.61 %)
1,318
(100.00 %)
1,928,844
(4.34 %)
3,684,477
(13.44 %)
19,091,818
(55.21 %)
127,760
(1.34 %)
174 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1
n/a 17,611
(0.09 %)
227,382
(1.73 %)
n/a 45.09
(100.00 %)
5,245
(0.00 %)
448
(100.00 %)
4,668,195
(1.49 %)
9,253,372
(10.94 %)
5,693
(100.00 %)
2,493,727
(7.98 %)
175 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1
n/a 13,365
(1.26 %)
17,388
(1.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
99
(0.00 %)
279
(100.00 %)
726,428
(2.81 %)
331,756
(2.05 %)
7,184,711
(33.57 %)
51,973
(2.70 %)
176 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1
n/a 13,390
(1.26 %)
17,496
(1.99 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
101
(0.00 %)
150
(100.00 %)
728,574
(2.82 %)
348,605
(2.13 %)
7,199,124
(33.55 %)
51,807
(2.69 %)
177 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1
31,826
(3.55 %)
13,389
(1.26 %)
17,495
(1.99 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
101
(0.00 %)
149
(100.00 %)
728,567
(2.82 %)
348,603
(2.13 %)
7,199,026
(33.55 %)
51,807
(2.69 %)
178 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1
n/a 21,977
(1.55 %)
31,925
(2.52 %)
n/a 39.40
(99.99 %)
1,072
(0.01 %)
1,183
(100.00 %)
825,817
(1.86 %)
1,047,172
(7.89 %)
12,996,911
(44.48 %)
99,118
(1.26 %)
179 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1
n/a 23,766
(1.52 %)
34,093
(2.42 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
500
(0.00 %)
897
(100.00 %)
919,152
(1.89 %)
1,157,711
(8.01 %)
14,217,996
(45.44 %)
108,139
(1.26 %)
180 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1
n/a 14,675
(1.05 %)
16,697
(1.47 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
12
(0.00 %)
134
(100.00 %)
3,772,260
(47.94 %)
322,081
(1.52 %)
11,123,166
(34.14 %)
129,645
(3.29 %)
181 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2
n/a 10,906
(1.98 %)
19,820
(4.33 %)
n/a 40.04
(100.00 %)
n/a 1,516
(100.00 %)
390,896
(3.25 %)
482,493
(7.83 %)
4,361,670
(34.36 %)
52,508
(3.70 %)
182 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1
41,009
(4.67 %)
13,912
(2.00 %)
25,745
(4.50 %)
n/a 40.45
(99.61 %)
102
(0.39 %)
17
(100.00 %)
497,976
(3.84 %)
645,915
(10.08 %)
5,232,342
(36.26 %)
72,598
(4.35 %)
183 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1
35,366
(2.07 %)
14,394
(0.79 %)
23,371
(1.60 %)
n/a 44.78
(99.99 %)
1,608
(0.01 %)
661
(100.00 %)
1,995,033
(8.75 %)
823,022
(6.51 %)
12,116,860
(46.84 %)
117,191
(3.14 %)
184 Puerto Rican coqui (aEleCoq1hap1 2024)
GCF_035609145.1
44,598
(2.13 %)
13,879
(0.57 %)
31,890
(1.61 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
659
(0.00 %)
956
(100.00 %)
1,044,176
(1.98 %)
1,442,184
(16.51 %)
14,710,122
(54.00 %)
501,931
(8.81 %)
185 Puerto Rican coqui (hap1 2024)
GCA_035609145.1
n/a 13,881
(0.57 %)
32,313
(1.67 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
659
(0.00 %)
963
(100.00 %)
1,044,181
(1.98 %)
1,442,189
(16.51 %)
14,710,175
(54.00 %)
501,931
(8.81 %)
186 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1
n/a 13,892
(0.57 %)
32,011
(1.64 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
685
(0.00 %)
843
(100.00 %)
1,042,636
(2.00 %)
1,430,690
(16.22 %)
14,621,029
(53.91 %)
503,166
(8.84 %)
187 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1
47,272
(3.27 %)
13,909
(1.05 %)
16,674
(1.54 %)
n/a 43.81
(96.14 %)
25,390
(3.86 %)
138
(100.00 %)
1,686,633
(15.06 %)
271,837
(0.81 %)
10,802,900
(30.74 %)
93,811
(1.90 %)
188 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3
n/a 11,382
(0.41 %)
28,399
(1.33 %)
n/a 39.39
(99.99 %)
17
(0.01 %)
17,099
(99.99 %)
6,708,926
(37.23 %)
883,916
(2.81 %)
16,745,782
(46.94 %)
74,951
(1.15 %)
189 Reeves's turtle
GCF_016161935.1
86,238
(3.40 %)
15,165
(0.98 %)
21,405
(1.66 %)
n/a 44.98
(100.00 %)
398
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,854,279
(14.68 %)
448,403
(2.11 %)
11,329,581
(34.64 %)
119,002
(2.82 %)
190 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1
n/a 26,401
(0.36 %)
90,909
(1.63 %)
n/a 44.93
(100.00 %)
19
(0.00 %)
14,096
(100.00 %)
4,036,529
(2.70 %)
6,299,339
(18.78 %)
14,096
(100.00 %)
1,426,030
(6.65 %)
191 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1
62,635
(1.63 %)
14,072
(0.39 %)
44,953
(1.74 %)
n/a 44.98
(99.99 %)
3,039
(0.01 %)
477
(100.00 %)
2,058,700
(2.53 %)
3,206,511
(15.84 %)
20,407,989
(60.26 %)
741,520
(6.10 %)
192 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1
n/a 13,357
(1.06 %)
20,426
(1.94 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
723
(0.00 %)
444
(100.00 %)
1,451,537
(9.36 %)
1,095,484
(10.35 %)
7,870,309
(48.66 %)
142,495
(4.04 %)
193 royal ground snake (hap1 2023)
GCA_031021105.1
n/a 13,327
(0.96 %)
20,347
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
1,983,903
(10.40 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,707
(53.44 %)
130,852
(4.47 %)
194 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1
n/a 13,845
(0.96 %)
23,108
(1.86 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
n/a 1,128
(100.00 %)
2,008,682
(10.16 %)
1,718,408
(7.36 %)
9,467,451
(52.99 %)
140,557
(4.65 %)
195 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1
n/a 12,606
(0.83 %)
22,421
(1.62 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
n/a 3,543
(100.00 %)
2,080,172
(11.19 %)
1,814,619
(9.22 %)
8,889,119
(57.36 %)
145,328
(4.63 %)
196 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1
n/a 13,727
(0.84 %)
24,896
(2.06 %)
n/a 42.95
(99.51 %)
973
(0.49 %)
2,266
(100.00 %)
729,332
(2.15 %)
1,402,564
(24.45 %)
8,156,596
(55.96 %)
175,180
(3.64 %)
197 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1
n/a 13,538
(0.88 %)
24,311
(2.15 %)
n/a 42.96
(99.07 %)
976
(0.93 %)
1,266
(100.00 %)
711,895
(2.18 %)
1,219,160
(21.56 %)
7,988,458
(54.14 %)
170,920
(3.48 %)
198 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1
n/a 14,039
(1.09 %)
19,528
(1.85 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
31
(0.00 %)
122
(100.00 %)
1,307,065
(5.31 %)
672,219
(3.50 %)
9,949,858
(39.30 %)
83,890
(3.97 %)
199 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1
n/a 14,065
(1.09 %)
19,430
(1.84 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
21
(0.00 %)
155
(100.00 %)
1,307,771
(5.32 %)
672,054
(3.42 %)
9,846,806
(39.03 %)
83,805
(3.99 %)
200 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1
n/a 13,288
(1.15 %)
18,137
(1.98 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
44
(0.00 %)
227
(100.00 %)
909,096
(6.37 %)
544,302
(5.70 %)
8,280,652
(39.20 %)
51,923
(2.21 %)
201 San Diegan tiger whiptail (HBS 135688 2022)
GCA_023333525.1
n/a 10,727
(1.18 %)
14,669
(1.99 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
39
(0.00 %)
113
(100.00 %)
741,937
(6.29 %)
448,194
(5.60 %)
7,227,870
(36.97 %)
42,621
(2.15 %)
202 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1
n/a 14,107
(1.14 %)
19,600
(1.95 %)
n/a 43.58
(100.00 %)
27
(0.00 %)
627
(100.00 %)
1,563,836
(7.79 %)
758,521
(4.15 %)
9,213,810
(40.44 %)
81,126
(2.79 %)
203 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1
n/a 14,075
(1.15 %)
19,587
(1.99 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
23
(0.00 %)
85
(100.00 %)
1,577,744
(7.81 %)
774,690
(3.78 %)
9,248,062
(40.42 %)
80,183
(2.48 %)
204 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2
n/a 14,093
(1.15 %)
19,338
(1.96 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
73
(0.00 %)
35
(100.00 %)
1,577,751
(7.81 %)
774,117
(3.78 %)
9,248,069
(40.42 %)
80,183
(2.48 %)
205 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1
33,415
(3.07 %)
14,091
(1.15 %)
19,337
(1.96 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
73
(0.00 %)
34
(100.00 %)
1,577,747
(7.81 %)
774,112
(3.78 %)
9,248,016
(40.42 %)
80,183
(2.48 %)
206 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1
n/a 10,911
(1.00 %)
17,586
(1.79 %)
n/a 41.17
(100.00 %)
572
(0.00 %)
2,064
(100.00 %)
1,265,045
(10.30 %)
989,149
(13.38 %)
6,503,035
(50.62 %)
123,274
(4.17 %)
207 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1
n/a 14,226
(1.28 %)
25,396
(2.33 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
2
(0.00 %)
12,662
(100.00 %)
1,001,433
(5.27 %)
445,157
(1.79 %)
7,227,826
(34.26 %)
80,300
(2.76 %)
208 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1
41,701
(3.64 %)
14,350
(1.48 %)
19,231
(2.45 %)
32,804
(4.14 %)
43.75
(99.75 %)
379
(0.25 %)
29
(100.00 %)
975,474
(5.32 %)
425,414
(1.76 %)
7,135,165
(34.49 %)
76,053
(2.68 %)
209 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1
108,406
(1.98 %)
13,959
(0.46 %)
n/a n/a 43.90
(99.99 %)
2,297
(0.01 %)
3,474
(100.00 %)
1,903,654
(2.85 %)
2,970,691
(16.56 %)
15,354,577
(64.31 %)
652,708
(8.36 %)
210 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1
n/a 14,077
(0.47 %)
36,608
(1.60 %)
n/a 43.86
(99.99 %)
2,097
(0.01 %)
2,802
(100.00 %)
1,819,971
(2.73 %)
2,865,173
(16.12 %)
15,335,602
(63.85 %)
651,438
(8.09 %)
211 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1
25,177
(1.78 %)
14,549
(0.82 %)
28,002
(1.69 %)
n/a 45.48
(96.46 %)
143,970
(3.54 %)
335,470
(96.46 %)
889,760
(2.21 %)
666,492
(2.83 %)
12,865,811
(39.14 %)
160,022
(2.80 %)
212 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1
n/a 6,180
(0.71 %)
31,191
(4.14 %)
n/a 48.30
(100.00 %)
11
(0.00 %)
4,064
(100.00 %)
1,494,745
(38.42 %)
891,392
(20.02 %)
4,259,383
(49.70 %)
147,499
(35.87 %)
213 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1
41,241
(6.50 %)
7,638
(0.70 %)
36,336
(4.06 %)
83,714
(10.03 %)
48.31
(98.62 %)
930
(1.38 %)
1,434
(100.00 %)
1,920,851
(39.36 %)
1,194,165
(21.47 %)
5,320,620
(50.50 %)
178,590
(35.88 %)
214 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCF_035084215.1
51,418
(2.53 %)
12,778
(0.49 %)
24,541
(1.38 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
1,834
(0.01 %)
1,879
(100.00 %)
597,115
(2.28 %)
1,112,121
(17.97 %)
12,108,003
(57.48 %)
117,585
(3.42 %)
215 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCA_035084215.1
n/a 12,780
(0.49 %)
24,543
(1.38 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
1,834
(0.01 %)
1,880
(100.00 %)
597,122
(2.28 %)
1,112,137
(17.97 %)
12,108,056
(57.48 %)
117,585
(3.42 %)
216 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1
n/a 12,603
(0.52 %)
23,419
(1.42 %)
n/a 44.36
(99.99 %)
1,695
(0.01 %)
2,889
(99.99 %)
559,171
(2.08 %)
973,228
(15.01 %)
11,768,442
(55.69 %)
108,468
(3.25 %)
217 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1
n/a 13,756
(1.40 %)
19,148
(2.33 %)
n/a 43.77
(99.99 %)
783
(0.01 %)
127
(100.00 %)
790,266
(3.86 %)
448,558
(4.00 %)
6,780,108
(37.51 %)
86,165
(2.71 %)
218 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1
n/a 14,245
(1.36 %)
19,892
(2.29 %)
n/a 43.82
(99.99 %)
883
(0.01 %)
211
(100.00 %)
838,357
(3.88 %)
479,922
(4.42 %)
7,039,963
(38.21 %)
93,005
(2.80 %)
219 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2
n/a 14,245
(1.36 %)
19,892
(2.29 %)
n/a 43.82
(99.99 %)
883
(0.01 %)
211
(100.00 %)
838,357
(3.88 %)
479,922
(4.42 %)
7,039,963
(38.21 %)
93,005
(2.80 %)
220 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2
n/a 11,589
(0.31 %)
32,603
(1.10 %)
n/a 47.54
(100.00 %)
6
(0.00 %)
26,655
(100.00 %)
1,346,532
(1.83 %)
1,273,326
(5.35 %)
19,727,443
(51.55 %)
427,693
(8.25 %)
221 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2
n/a 12,587
(0.36 %)
23,986
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
7,146
(1.52 %)
645
(100.00 %)
1,451,634
(1.94 %)
1,448,619
(6.25 %)
20,884,741
(51.41 %)
456,658
(8.18 %)
222 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1
n/a 9,086
(0.58 %)
20,468
(1.57 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
n/a 10,892
(100.00 %)
315,695
(1.23 %)
320,148
(1.73 %)
8,305,059
(38.33 %)
37,147
(1.43 %)
223 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1
40,257
(2.94 %)
12,157
(0.69 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
698
(0.91 %)
172
(100.00 %)
4,824,261
(54.91 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,260
(38.19 %)
45,398
(1.34 %)
224 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1
n/a 13,534
(1.08 %)
19,681
(1.86 %)
n/a 41.70
(99.98 %)
2,010
(0.02 %)
494
(100.00 %)
1,264,981
(8.07 %)
885,992
(7.35 %)
8,475,795
(46.16 %)
117,174
(4.31 %)
225 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1
n/a 11,975
(1.14 %)
16,941
(1.86 %)
n/a 41.42
(99.98 %)
1,674
(0.02 %)
2,176
(99.98 %)
1,088,721
(8.03 %)
743,110
(5.43 %)
7,446,281
(43.88 %)
96,764
(4.19 %)
226 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1
n/a 13,671
(0.83 %)
18,931
(1.39 %)
n/a 44.53
(100.00 %)
22
(0.00 %)
135
(100.00 %)
1,004,404
(4.81 %)
870,596
(5.97 %)
9,017,362
(54.42 %)
217,977
(8.25 %)
227 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1
n/a 13,381
(1.17 %)
19,541
(1.96 %)
n/a 39.82
(100.00 %)
34
(0.00 %)
340
(100.00 %)
1,137,408
(8.97 %)
740,163
(7.59 %)
7,520,676
(44.43 %)
47,268
(1.61 %)
228 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1
n/a 12,626
(1.16 %)
18,965
(1.95 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
443
(0.01 %)
1,139
(99.99 %)
1,095,605
(9.34 %)
713,734
(8.45 %)
6,942,208
(44.93 %)
46,378
(2.04 %)
229 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1
n/a 14,998
(0.98 %)
20,146
(1.60 %)
n/a 44.84
(100.00 %)
64
(0.00 %)
324
(100.00 %)
1,562,785
(12.68 %)
484,638
(2.00 %)
11,089,433
(36.29 %)
143,601
(3.21 %)
230 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1
n/a 14,971
(0.99 %)
19,756
(1.60 %)
n/a 44.77
(100.00 %)
53
(0.00 %)
106
(100.00 %)
1,545,155
(12.63 %)
465,697
(1.95 %)
11,181,681
(36.13 %)
142,383
(3.05 %)
231 spotted gar
GCF_000242695.1
45,681
(8.02 %)
13,054
(1.95 %)
46,362
(15.00 %)
n/a 39.59
(91.93 %)
43,276
(8.08 %)
45,199
(91.92 %)
203,614
(1.02 %)
123,247
(0.80 %)
5,837,321
(22.82 %)
38,507
(2.24 %)
232 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1
n/a 13,777
(1.63 %)
24,910
(4.29 %)
n/a 40.54
(100.00 %)
76
(0.00 %)
831
(100.00 %)
1,218,814
(33.09 %)
230,177
(10.66 %)
5,685,909
(34.46 %)
52,438
(3.69 %)
233 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1
64,638
(7.15 %)
13,839
(1.51 %)
23,965
(3.48 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
95
(0.00 %)
816
(100.00 %)
1,319,033
(34.80 %)
245,717
(12.50 %)
5,536,919
(38.20 %)
57,935
(3.78 %)
234 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1
n/a 10,920
(1.26 %)
14,403
(2.60 %)
n/a 43.46
(99.96 %)
2,088
(0.04 %)
1,042
(100.00 %)
3,325,883
(44.48 %)
604,780
(8.87 %)
5,926,808
(44.92 %)
64,249
(4.00 %)
235 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1
n/a 10,694
(1.38 %)
13,221
(2.62 %)
n/a 42.85
(99.96 %)
1,952
(0.04 %)
532
(100.00 %)
3,108,151
(44.68 %)
498,592
(6.00 %)
5,634,132
(43.16 %)
50,785
(2.94 %)
236 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1
n/a 12,755
(0.42 %)
23,706
(1.15 %)
n/a 45.69
(99.98 %)
3,590
(0.02 %)
5,314
(100.00 %)
1,153,000
(3.16 %)
1,250,073
(11.36 %)
14,207,513
(54.93 %)
114,313
(3.65 %)
237 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1
n/a 12,414
(0.43 %)
22,037
(1.15 %)
n/a 45.49
(99.98 %)
3,505
(0.02 %)
7,908
(99.98 %)
1,083,980
(2.93 %)
1,065,586
(9.57 %)
13,986,241
(53.49 %)
105,379
(3.46 %)
238 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1
110,154
(7.62 %)
25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
64,522
(2.85 %)
239 sterlet (paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
65,007
(2.74 %)
240 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2
73,195
(5.77 %)
24,716
(1.77 %)
39,692
(3.97 %)
n/a 39.75
(99.93 %)
6,251
(0.07 %)
3,368
(100.00 %)
3,869,521
(43.26 %)
1,093,425
(6.82 %)
9,976,052
(39.33 %)
60,325
(1.97 %)
241 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1
n/a 14,713
(1.06 %)
18,602
(1.60 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
290
(0.00 %)
366
(100.00 %)
1,352,115
(12.17 %)
388,630
(1.94 %)
10,550,154
(33.42 %)
113,023
(3.09 %)
242 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1
n/a 12,226
(1.01 %)
14,117
(1.42 %)
n/a 43.77
(100.00 %)
361
(0.00 %)
199
(100.00 %)
1,202,345
(11.93 %)
304,674
(1.45 %)
9,752,924
(32.81 %)
92,993
(2.75 %)
243 tailed frog (A.truei hap1 2024)
GCA_040206685.1
n/a 14,490
(0.54 %)
41,227
(1.77 %)
n/a 44.92
(99.97 %)
6,020
(0.03 %)
3,549
(100.00 %)
1,783,455
(4.78 %)
3,426,339
(20.31 %)
15,662,323
(55.70 %)
442,764
(6.61 %)
244 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1
n/a 14,405
(0.55 %)
41,584
(1.88 %)
n/a 44.89
(99.97 %)
6,023
(0.03 %)
2,779
(100.00 %)
1,770,524
(4.86 %)
3,429,564
(18.94 %)
15,718,939
(55.22 %)
441,543
(6.61 %)
245 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1
n/a 5,885
(0.35 %)
24,457
(1.45 %)
n/a 44.61
(100.00 %)
3
(0.00 %)
21,995
(100.00 %)
553,415
(2.65 %)
761,469
(4.53 %)
6,043,769
(57.75 %)
159,552
(5.54 %)
246 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020)
GCF_010909765.2
45,968
(2.40 %)
11,437
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
n/a 44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
888,163
(2.58 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
247 three-toed box turtle
GCF_002925995.2
35,807
(2.28 %)
16,429
(1.00 %)
26,460
(1.60 %)
33,673
(1.75 %)
44.26
(94.87 %)
53,635
(5.13 %)
48,497
(100.00 %)
2,007,347
(15.00 %)
351,871
(0.86 %)
12,385,245
(31.74 %)
138,405
(2.40 %)
248 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1
58,085
(4.72 %)
13,597
(1.18 %)
20,553
(2.03 %)
n/a 39.88
(100.00 %)
n/a 4,228
(100.00 %)
1,142,521
(7.92 %)
739,406
(5.17 %)
7,749,366
(42.91 %)
45,588
(1.61 %)
249 tiny Cayenne caecilian
GCF_901765095.1
41,333
(1.27 %)
14,569
(0.43 %)
30,499
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,835,191
(1.59 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
414,828
(3.91 %)
250 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1
n/a 12,197
(0.36 %)
33,747
(1.15 %)
n/a 43.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
23,871
(100.00 %)
1,453,442
(1.57 %)
1,309,062
(3.23 %)
17,953,416
(52.19 %)
326,452
(3.86 %)
251 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2
41,266
(3.35 %)
13,505
(1.05 %)
19,294
(1.78 %)
n/a 45.92
(99.99 %)
2,590
(0.01 %)
1,742
(100.00 %)
938,800
(8.81 %)
627,869
(5.78 %)
9,306,892
(38.57 %)
91,919
(2.91 %)
252 tropical clawed frog
GCF_000004195.4
50,557
(4.71 %)
14,679
(1.97 %)
20,138
(2.76 %)
52,028
(5.20 %)
40.73
(99.80 %)
684
(0.20 %)
167
(100.00 %)
2,289,618
(34.82 %)
708,472
(13.14 %)
6,816,377
(41.73 %)
52,647
(1.35 %)
253 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894005.1
n/a 13,678
(0.88 %)
29,720
(2.41 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
436
(0.00 %)
961
(100.00 %)
734,036
(2.54 %)
1,217,326
(21.42 %)
8,925,883
(52.53 %)
211,590
(5.08 %)
254 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894015.1
n/a 13,192
(0.88 %)
29,242
(2.52 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
507
(0.00 %)
819
(100.00 %)
736,700
(2.60 %)
1,165,044
(20.79 %)
8,671,642
(52.60 %)
207,553
(4.71 %)
255 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1
n/a 13,456
(0.33 %)
47,486
(1.34 %)
n/a 44.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
27,233
(100.00 %)
1,968,437
(1.91 %)
1,716,136
(3.97 %)
25,847,315
(43.76 %)
523,234
(6.59 %)
256 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2
n/a 14,449
(0.38 %)
40,573
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,274,606
(1.91 %)
2,036,107
(4.34 %)
29,400,957
(44.09 %)
602,911
(6.66 %)
257 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1
n/a 13,267
(1.12 %)
21,667
(2.38 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
403
(0.00 %)
226
(100.00 %)
1,344,601
(8.29 %)
1,035,785
(7.00 %)
8,436,473
(45.10 %)
82,750
(2.69 %)
258 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1
n/a 12,430
(1.10 %)
20,286
(2.36 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
446
(0.00 %)
413
(100.00 %)
1,299,478
(9.62 %)
1,018,398
(8.41 %)
7,790,758
(46.28 %)
81,352
(2.71 %)
259 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1
47,034
(5.17 %)
14,311
(1.43 %)
20,571
(2.35 %)
32,442
(3.15 %)
43.97
(97.04 %)
51,275
(2.97 %)
25,252
(100.00 %)
949,801
(5.41 %)
498,048
(1.91 %)
7,668,731
(34.21 %)
88,947
(2.62 %)
260 West African lungfish (Aquariam Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1
n/a 14,330
(0.04 %)
83,285
(0.50 %)
n/a 39.97
(99.99 %)
24,438
(0.01 %)
7,125
(100.00 %)
17,253,560
(4.05 %)
15,370,489
(7.85 %)
31,563
(99.99 %)
548,408
(0.58 %)
261 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1
41,847
(0.19 %)
n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)
n/a 12,668
(100.00 %)
16,163,808
(2.67 %)
13,992,750
(5.30 %)
n/a 502,751
(0.52 %)
262 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1
n/a 26,067
(1.12 %)
46,795
(2.72 %)
n/a 41.28
(100.00 %)
51
(0.00 %)
1,771
(100.00 %)
2,075,491
(6.60 %)
1,603,401
(7.34 %)
15,565,775
(40.61 %)
184,134
(3.16 %)
263 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1
n/a 24,835
(1.20 %)
42,146
(2.78 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
51
(0.00 %)
659
(100.00 %)
1,842,497
(6.34 %)
1,335,245
(6.14 %)
15,103,683
(37.84 %)
158,311
(2.92 %)
264 western painted turtle (R12L10 2023)
GCF_011386835.1
101,708
(5.23 %)
15,332
(1.01 %)
21,055
(1.60 %)
n/a 44.88
(99.98 %)
1,270
(0.02 %)
9,850
(100.00 %)
4,178,966
(47.39 %)
457,400
(2.29 %)
11,325,467
(35.43 %)
127,896
(2.94 %)
265 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5
64,782
(3.76 %)
15,184
(1.08 %)
21,463
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
259,085
(87.52 %)
4,079,404
(44.68 %)
316,232
(0.93 %)
11,848,718
(27.60 %)
103,623
(1.74 %)
266 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1
n/a 14,019
(1.31 %)
17,620
(2.13 %)
n/a 45.76
(100.00 %)
15
(0.00 %)
39
(100.00 %)
862,216
(4.87 %)
557,627
(3.17 %)
8,002,559
(36.95 %)
183,292
(4.74 %)
267 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1
n/a 13,064
(1.32 %)
16,407
(2.16 %)
n/a 45.81
(100.00 %)
12
(0.00 %)
50
(100.00 %)
794,996
(4.86 %)
514,021
(3.46 %)
7,339,914
(37.02 %)
168,847
(4.76 %)
268 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1
n/a 13,914
(1.72 %)
27,496
(4.28 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
198
(0.00 %)
677
(100.00 %)
600,622
(4.04 %)
783,931
(10.70 %)
5,362,245
(41.82 %)
100,334
(5.41 %)
269 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1
n/a 13,991
(1.72 %)
27,685
(4.24 %)
n/a 40.90
(100.00 %)
190
(0.00 %)
541
(100.00 %)
620,188
(5.00 %)
800,411
(11.19 %)
5,338,766
(42.25 %)
101,603
(5.32 %)
270 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1
n/a 13,101
(0.94 %)
24,980
(1.75 %)
n/a 41.02
(99.93 %)
19
(0.07 %)
13,642
(99.93 %)
1,410,212
(7.70 %)
1,080,385
(4.56 %)
9,112,844
(43.96 %)
91,606
(2.53 %)
271 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1
33,492
(3.42 %)
13,074
(1.13 %)
18,807
(1.93 %)
31,660
(2.61 %)
40.95
(97.72 %)
1,518
(2.28 %)
365
(100.00 %)
1,271,255
(7.73 %)
979,057
(4.48 %)
8,396,200
(42.63 %)
81,829
(2.47 %)
272 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1
42,052
(2.43 %)
12,059
(0.52 %)
18,460
(1.22 %)
38,963
(1.77 %)
41.51
(91.61 %)
95,208
(8.40 %)
16,684
(100.00 %)
402,747
(0.97 %)
389,119
(1.49 %)
15,298,245
(34.14 %)
21,050
(0.30 %)
273 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1
31,857
(1.52 %)
11,884
(0.43 %)
28,482
(1.15 %)
n/a 41.78
(100.00 %)
900,650
(0.03 %)
57,334
(100.00 %)
413,201
(1.16 %)
426,542
(2.75 %)
16,418,143
(38.85 %)
35,192
(0.95 %)
274 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1
54,886
(2.03 %)
12,065
(0.44 %)
19,805
(1.08 %)
n/a 42.06
(94.27 %)
156,554
(5.74 %)
101,977
(100.00 %)
559,291
(0.96 %)
641,094
(3.66 %)
19,566,199
(38.21 %)
28,353
(0.49 %)
275 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205295.1
n/a 16,029
(0.23 %)
46,442
(0.92 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
6,671
(0.01 %)
4,887
(100.00 %)
4,307,097
(3.52 %)
7,435,469
(14.36 %)
11,428
(99.99 %)
423,705
(1.55 %)
276 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205305.1
n/a 16,306
(0.23 %)
45,587
(0.94 %)
n/a 38.94
(99.99 %)
6,811
(0.01 %)
10,308
(99.99 %)
4,195,244
(3.50 %)
7,201,985
(14.20 %)
10,308
(99.99 %)
412,512
(1.53 %)
277 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1
65,526
(3.36 %)
15,560
(0.99 %)
21,233
(1.66 %)
n/a 45.17
(96.24 %)
1,041
(3.76 %)
595
(100.00 %)
1,904,996
(14.25 %)
468,779
(2.21 %)
11,403,005
(33.86 %)
135,646
(3.23 %)
278 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1
48,447
(2.64 %)
11,974
(0.57 %)
15,459
(1.26 %)
n/a 41.78
(93.81 %)
87,372
(6.20 %)
1,266
(100.00 %)
392,676
(0.96 %)
348,115
(1.22 %)
15,176,805
(32.93 %)
20,647
(0.38 %)
279 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1
58,105
(2.61 %)
12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
45,284
(1.67 %)
280 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1
n/a 12,516
(0.44 %)
17,465
(1.05 %)
n/a 44.66
(99.65 %)
1,203
(0.35 %)
2,136
(99.65 %)
8,278,458
(59.68 %)
903,434
(18.42 %)
14,975,344
(48.25 %)
48,378
(1.60 %)
TOTALS:total assembly count 280

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Primates 221 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1067 assemblies assembly stats track stats
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HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 775 assemblies assembly stats track stats