Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2018)
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 62,829
(1.59 %)
2 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2025)
GCF_003597395.2		 45,809
(3.10 %)		 14,668
(1.02 %)		 17,810
(1.52 %)		 n/a 43.77
(96.56 %)		 39,154
(3.45 %)		 3,850
(100.00 %)		 1,222,218
(10.47 %)		 272,032
(1.07 %)		 12,528,821
(28.39 %)		 63,912
(1.75 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
4 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1		 n/a 12,344
(1.22 %)		 17,320
(1.89 %)		 n/a 41.00
(99.99 %)		 908
(0.01 %)		 1,256
(99.99 %)		 3,221,370
(48.42 %)		 681,209
(5.18 %)		 6,734,253
(44.26 %)		 99,366
(4.44 %)
5 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 10,399
(2.84 %)
6 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
7 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 14,854
(0.31 %)
8 African bullfrog (2023)
GCF_032062135.1		 39,241
(5.22 %)		 13,325
(1.31 %)		 16,015
(2.29 %)		 n/a 38.30
(97.16 %)		 40,350
(2.85 %)		 8,090
(100.00 %)		 490,197
(1.53 %)		 403,071
(2.55 %)		 8,536,428
(30.37 %)		 16,231
(0.36 %)
9 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,899
(3.89 %)		 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 108,774
(1.25 %)
10 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
11 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 35,531
(1.28 %)
12 American bullfrog (primary hap 2024)
GCA_037953035.1		 n/a 14,830
(0.29 %)		 47,571
(1.22 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 4,071
(100.00 %)		 3,008,729
(2.34 %)		 4,764,040
(10.52 %)		 28,440,050
(58.60 %)		 446,366
(2.65 %)
13 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 133,933
(8.63 %)
14 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 105,815
(4.08 %)
15 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 415,605
(4.12 %)
16 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 408,391
(12.65 %)
17 Atlantic hagfish (primary hap 2024)
GCA_964187855.1		 n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
18 Atlantic ridley (rLepKem1 hap1 2025)
GCA_965140285.1		 n/a 14,835
(1.03 %)		 17,938
(1.53 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 1,346,135
(12.58 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
19 Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 refseq)
GCF_965140265.1		 67,187
(3.84 %)		 14,601
(1.02 %)		 17,367
(1.50 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 245
(0.00 %)		 332
(100.00 %)		 1,335,525
(12.58 %)		 314,640
(2.13 %)		 10,517,469
(34.27 %)		 45,940
(1.37 %)
20 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
21 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 86,138
(2.16 %)
22 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,103
(2.80 %)		 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 26,647
(0.98 %)
23 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 134,345,177
(46.63 %)		 2,388,998
(5.24 %)
24 axolotl (Mex_15411 2024)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 126,532,504
(50.15 %)		 2,452,305
(5.31 %)
25 basking shark (sCetMax3.hap1.1 2024)
GCA_964194155.1		 n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
26 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 107,555
(1.88 %)
27 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 53,921
(2.09 %)
28 beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024)
GCA_036884735.1		 n/a 24,635
(1.65 %)		 38,296
(3.71 %)		 n/a 39.96
(99.90 %)		 3,967
(0.10 %)		 1,383
(100.00 %)		 1,315,442
(3.30 %)		 1,268,850
(7.99 %)		 10,595,211
(41.03 %)		 65,207
(2.45 %)
29 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 76,786
(1.60 %)
30 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 86,825
(1.61 %)
31 blonde ray (primary hap 2023)
GCA_963514005.1		 n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
32 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
33 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
34 Brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
35 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 37,299
(1.02 %)
36 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 53,035
(1.80 %)
37 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,336
(2.63 %)		 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 68,858
(2.06 %)
38 brownbanded bambooshark (Juve2018m 2025)
GCF_047496795.1		 60,935
(1.72 %)		 12,494
(0.29 %)		 21,756
(0.89 %)		 n/a 44.10
(99.99 %)		 2,891
(0.01 %)		 1,989
(100.00 %)		 1,123,600
(4.34 %)		 1,904,298
(18.02 %)		 24,059,272
(54.04 %)		 56,396
(1.81 %)
39 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,676
(4.16 %)		 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 29,212
(1.10 %)
40 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 89,437
(4.63 %)
41 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 78,768
(3.37 %)
42 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
43 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 101,598
(1.64 %)
44 central bearded dragon (2017)
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 48,137
(1.31 %)
45 central bearded dragon (2025)
GCF_047335585.1		 55,907
(5.04 %)		 13,840
(1.12 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 985,251
(3.91 %)		 586,669
(2.40 %)		 9,004,514
(35.92 %)		 67,220
(2.06 %)
46 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 46,638
(1.19 %)
47 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1		 n/a 15,365
(1.01 %)		 20,233
(1.64 %)		 n/a 44.88
(100.00 %)		 852
(0.00 %)		 1,553
(100.00 %)		 2,058,732
(7.85 %)		 845,208
(2.04 %)		 11,639,209
(43.21 %)		 116,459
(3.04 %)
48 Chinese soft-shelled turtle
GCF_000230535.1		 45,454
(3.08 %)		 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 95,997
(2.06 %)
49 cloudy catshark (Kashiwa2021f 2025)
GCF_047496885.1		 69,529
(1.56 %)		 13,335
(0.25 %)		 28,473
(0.76 %)		 n/a 49.26
(99.99 %)		 4,654
(0.01 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,668,127
(2.89 %)		 2,316,011
(21.50 %)		 22,209,447
(67.48 %)		 706,094
(13.30 %)
50 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 42,857
(0.54 %)
51 coelacanth (fLatCha1 primary hap 2024)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 140,027
(2.34 %)
52 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
53 Columbretes wall lizard (hap2.1 2025)
GCA_965178375.1		 n/a 13,776
(1.35 %)		 19,389
(2.28 %)		 n/a 43.97
(99.99 %)		 867
(0.01 %)		 1,011
(99.99 %)		 816,540
(4.18 %)		 497,364
(6.95 %)		 6,729,569
(39.28 %)		 89,601
(3.31 %)
54 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 30,098
(0.96 %)
55 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
56 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 581,115
(7.68 %)
57 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 36,264
(1.27 %)
58 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
59 common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025)
GCA_965207765.1		 n/a 14,100
(1.43 %)		 19,472
(2.36 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 884,631
(4.70 %)		 507,148
(3.64 %)		 7,206,478
(37.26 %)		 89,393
(2.87 %)
60 common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025)
GCA_965208345.1		 n/a 14,258
(1.44 %)		 19,379
(2.37 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 169
(100.00 %)		 884,140
(4.69 %)		 506,524
(3.53 %)		 7,214,124
(37.18 %)		 89,651
(2.88 %)
61 common newt (primary hap 2024)
GCA_964263255.1		 n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 101,185,912
(47.58 %)		 2,684,793
(7.99 %)
62 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
63 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
64 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 405,097
(4.49 %)
65 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
66 common wall lizard (hap1 2024)
GCA_964188315.1		 n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
67 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 113,458
(3.63 %)
68 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,519
(4.85 %)		 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 122,507
(3.69 %)
69 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 64,946
(2.08 %)
70 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 66,926
(2.14 %)
71 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 24,118,603
(71.52 %)		 991,009
(4.86 %)
72 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 24,178,131
(71.23 %)		 990,274
(4.84 %)
73 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 107,080
(3.15 %)
74 Cretan wall lizard (primary hap 2023)
GCA_951804945.1		 n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
75 crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024)
GCA_040207535.1		 n/a 13,876
(1.22 %)		 18,274
(2.01 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 1,021,810
(6.04 %)		 410,843
(1.76 %)		 8,147,007
(34.90 %)		 79,154
(2.34 %)
76 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
77 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 111,129
(2.68 %)
78 dyeing poison frog (UK_male_01 2024)
GCF_039654945.1		 65,453
(1.48 %)		 14,300
(0.31 %)		 45,268
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 1,777,277
(2.39 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
79 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 52,895
(2.12 %)
80 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 117,734
(4.05 %)
81 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 614,432
(5.85 %)
82 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 618,204
(5.89 %)
83 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 41,081
(3.43 %)
84 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 42,917
(1.08 %)
85 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
86 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
87 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 127,837
(8.05 %)
88 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
89 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
90 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 82,695
(2.80 %)
91 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
92 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
93 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 138,047
(2.94 %)
94 European river lamprey (primary hap 2024)
GCA_964198595.1		 n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
95 Far Eastern brook lamprey (LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
96 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 67,007
(1.51 %)
97 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap1.1 2024)
GCA_964270895.1		 n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
98 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 81,312
(2.54 %)
99 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 74,669
(1.25 %)
100 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,236
(0.68 %)		 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 34,823,806
(63.74 %)		 n/a
101 flatback sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152275.1		 48,321
(3.34 %)		 14,858
(1.05 %)		 18,090
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,289,321
(12.22 %)		 319,643
(1.38 %)		 10,785,197
(32.95 %)		 52,168
(1.81 %)
102 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1		 n/a 14,229
(1.06 %)		 16,514
(1.49 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 261
(0.00 %)		 322
(100.00 %)		 4,567,737
(43.65 %)		 288,964
(1.17 %)		 10,681,579
(32.83 %)		 47,249
(1.62 %)
103 Fleay's barred frog (hap1 2024)
GCA_038048845.1		 n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
104 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 64,121
(0.88 %)
105 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 47,933
(1.03 %)
106 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 47,454
(1.03 %)
107 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 47,453
(1.03 %)
108 frog A.baeobatrachus (hap1 2025)
GCA_048569485.1		 n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
109 frog A.baeobatrachus (hap2 2025)
GCA_048569465.1		 n/a 13,992
(0.31 %)		 43,409
(1.27 %)		 n/a 46.36
(99.99 %)		 3,799
(0.01 %)		 2,426
(100.00 %)		 1,997,963
(2.50 %)		 4,002,458
(19.16 %)		 20,517,633
(69.30 %)		 1,152,817
(12.93 %)
110 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 235,170
(4.50 %)
111 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
112 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,297
(2.61 %)		 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 26,651
(0.60 %)
113 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 39,919
(1.95 %)
114 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 40,660
(1.87 %)
115 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1		 53,223
(2.04 %)		 12,432
(0.38 %)		 25,243
(1.14 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 863,834
(1.59 %)		 947,015
(13.41 %)		 20,234,736
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
116 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 91,414
(1.45 %)
117 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1		 n/a 14,628
(0.85 %)		 18,382
(1.34 %)		 n/a 44.78
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 2,039
(100.00 %)		 1,254,940
(9.13 %)		 434,666
(6.73 %)		 12,070,445
(35.52 %)		 51,563
(1.91 %)
118 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 51,411
(1.88 %)
119 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 164,021
(2.52 %)
120 golden mantella (hap2 2025)
GCA_048565335.1		 n/a 13,400
(0.55 %)		 28,454
(1.70 %)		 n/a 40.91
(99.98 %)		 3,921
(0.02 %)		 2,611
(100.00 %)		 1,203,975
(3.36 %)		 2,447,119
(16.68 %)		 14,661,554
(53.34 %)		 160,856
(2.46 %)
121 golden poison dart frog (yellow primary hap 2024)
GCF_046119375.1		 128,151
(0.97 %)		 15,383
(0.19 %)		 56,843
(1.14 %)		 n/a 44.28
(100.00 %)		 1,234
(0.00 %)		 9,343
(100.00 %)		 2,355,255
(2.05 %)		 5,350,104
(37.88 %)		 20,333,848
(81.77 %)		 874,818
(5.79 %)
122 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,455
(3.18 %)		 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
123 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 61,680
(2.32 %)
124 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq)
GCF_029215685.1		 28,358
(2.73 %)		 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,792
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,127
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
125 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 72,941
(2.59 %)
126 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,664
(4.30 %)		 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 80,718
(1.90 %)
127 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 62,978
(2.00 %)
128 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 60,835
(1.92 %)
129 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,165
(1.88 %)		 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 98,862
(1.64 %)
130 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 167
(5.51 %)
131 great white shark (primary hap 2021)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
132 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 56,404
(1.78 %)
133 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,109
(3.63 %)		 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
134 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
135 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 45,469
(1.48 %)
136 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,353
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
137 hawksbill sea turtle (B2_1 2023)
GCA_030012505.1		 n/a 14,897
(1.00 %)		 18,251
(1.51 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 1,315,164
(12.07 %)		 347,678
(3.60 %)		 10,892,216
(35.32 %)		 49,532
(1.65 %)
138 hawksbill sea turtle (hap1 2025)
GCA_965152235.1		 n/a 14,710
(1.02 %)		 17,589
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 63
(100.00 %)		 1,289,035
(12.18 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,433
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
139 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1		 n/a 14,843
(1.02 %)		 18,006
(1.54 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 132
(0.12 %)		 173
(99.88 %)		 1,288,292
(12.14 %)		 318,803
(2.15 %)		 11,148,397
(34.07 %)		 46,922
(1.41 %)
140 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,122
(1.87 %)		 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 219,772
(3.92 %)
141 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 89,340
(2.10 %)
142 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 82,276
(1.85 %)
143 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 20,630,058
(68.85 %)		 89,340
(2.10 %)
144 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1		 n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 244,270
(5.02 %)
145 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
146 Iberian parsley frog (aPelIbe1 2024)
GCA_036172795.1		 n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 77,721
(1.73 %)
147 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 81,311,590
(56.46 %)		 1,581,360
(4.00 %)
148 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1		 57,032
(0.47 %)		 15,184
(0.10 %)		 72,314
(0.62 %)		 n/a 45.93
(100.00 %)		 1,829
(0.00 %)		 616
(100.00 %)		 4,343,624
(1.32 %)		 6,295,886
(8.29 %)		 2,445
(100.00 %)		 1,546,882
(4.02 %)
149 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 47,381
(1.37 %)
150 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1		 n/a 14,623
(1.04 %)		 18,405
(1.58 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 629
(100.00 %)		 1,283,544
(11.43 %)		 298,912
(1.85 %)		 10,728,482
(32.52 %)		 72,908
(2.13 %)
151 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 74,354
(2.05 %)
152 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 76,879
(3.71 %)
153 Italian wall lizard (rPodSic1.hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 106,667
(3.79 %)
154 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 98,815
(3.65 %)
155 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 503,637
(6.56 %)
156 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1		 n/a 14,833
(0.26 %)		 30,853
(0.75 %)		 n/a 47.12
(99.98 %)		 5,953
(0.02 %)		 5,626
(100.00 %)		 1,238,549
(4.06 %)		 2,718,867
(21.85 %)		 20,608,860
(73.38 %)		 518,286
(6.88 %)
157 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 49,808
(4.28 %)
158 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 104,556
(4.39 %)
159 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 110,631
(4.07 %)
160 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 25,133
(1.42 %)
161 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
162 leopard gecko (TG4126 2023)
GCF_028583425.1		 37,133
(2.89 %)		 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
163 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 87,750
(1.43 %)
164 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 86,200
(2.56 %)
165 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,021
(3.35 %)		 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 205,567
(4.36 %)
166 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 248,142
(10.84 %)
167 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 208,005
(7.18 %)
168 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1		 n/a 12,359
(0.99 %)		 16,644
(1.66 %)		 n/a 45.69
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 1,109,222
(8.21 %)		 607,835
(4.09 %)		 9,080,052
(42.56 %)		 158,727
(6.84 %)
169 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 52,987
(2.59 %)
170 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
171 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 103,858
(4.10 %)
172 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
173 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 89,526
(2.96 %)
174 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
175 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 82,575
(2.83 %)
176 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap1.2 2024)
GCA_964106645.2		 n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
177 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 89,229
(3.04 %)
178 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
179 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,935
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 1,037,146
(4.72 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
180 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
181 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1		 n/a 13,794
(1.32 %)		 19,189
(2.22 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 852
(0.01 %)		 151
(100.00 %)		 841,282
(5.59 %)		 483,392
(6.01 %)		 6,750,191
(40.39 %)		 101,153
(3.51 %)
182 lizards T.scincoides (rTilSci1hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
183 loggerhead turtle (SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,644
(3.99 %)		 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
184 loggerhead turtle (hap1 2025)
GCA_965140235.1		 n/a 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
185 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1		 n/a 14,889
(1.04 %)		 17,867
(1.54 %)		 n/a 44.11
(99.97 %)		 52
(0.03 %)		 85
(99.97 %)		 1,300,553
(12.44 %)		 332,623
(1.45 %)		 10,721,628
(34.40 %)		 53,746
(1.50 %)
186 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 61,669
(2.47 %)
187 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 65,260
(2.74 %)
188 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 41,638
(1.70 %)
189 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 73,632
(3.80 %)
190 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
191 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 165,699
(1.23 %)
192 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 157,012
(1.21 %)
193 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
194 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 77,167
(2.14 %)
195 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 n/a
196 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 16,441,719
(72.26 %)		 694,865
(6.34 %)
197 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,213
(6.17 %)		 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 29,954
(1.06 %)
198 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 49,188
(1.67 %)
199 Northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 128,617
(3.90 %)
200 Northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 135,874
(3.88 %)
201 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 134,572
(3.12 %)
202 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 141,800
(3.08 %)
203 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 34,560
(2.18 %)
204 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 34,363
(2.08 %)
205 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 186,153
(29.43 %)
206 Pacific ridley (hap1 2025)
GCA_965140295.1		 n/a 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
207 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1		 n/a 14,883
(1.03 %)		 17,736
(1.52 %)		 n/a 44.14
(99.96 %)		 76
(0.04 %)		 115
(99.96 %)		 1,337,786
(12.39 %)		 317,205
(2.38 %)		 10,851,496
(34.73 %)		 47,955
(1.47 %)
208 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 64,462
(1.33 %)
209 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 127,760
(1.34 %)
210 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
211 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 51,973
(2.70 %)
212 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
213 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
214 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1		 n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 99,118
(1.26 %)
215 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501925.1		 n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 108,139
(1.26 %)
216 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023)
GCA_033958435.1		 n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
217 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 52,508
(3.70 %)
218 plains spadefoot toad (primary hap 2022)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
219 pool frog (hap1 2025)
GCA_965119305.1		 n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
220 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1		 n/a 14,335
(0.34 %)		 39,545
(1.24 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 3,680
(99.99 %)		 2,706,037
(2.56 %)		 3,712,706
(12.97 %)		 23,911,913
(60.10 %)		 553,381
(4.05 %)
221 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,381
(2.07 %)		 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 117,191
(3.14 %)
222 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
223 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 503,166
(8.84 %)
224 red stingray (2025)
GCF_048418815.1		 55,797
(2.16 %)		 12,249
(0.37 %)		 26,981
(1.23 %)		 n/a 43.17
(94.93 %)		 2,066
(5.07 %)		 261
(100.00 %)		 832,690
(1.45 %)		 801,096
(12.24 %)		 21,031,370
(49.66 %)		 108,035
(1.85 %)
225 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 93,811
(1.90 %)
226 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 74,951
(1.15 %)
227 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 119,002
(2.82 %)
228 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1,426,030
(6.65 %)
229 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 primary hap 2024)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
230 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 142,495
(4.04 %)
231 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
232 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 140,557
(4.65 %)
233 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 145,328
(4.63 %)
234 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 175,180
(3.64 %)
235 rufous frog (hap2 2023)
GCA_031893055.1		 n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
236 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 83,890
(3.97 %)
237 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 83,805
(3.99 %)
238 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 51,923
(2.21 %)
239 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 51,910
(2.22 %)
240 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
241 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
242 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
243 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
244 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 123,274
(4.17 %)
245 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 80,300
(2.76 %)
246 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
247 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
248 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 651,438
(8.09 %)
249 Schlegel's Japanese gecko
GCF_001447785.1		 25,190
(1.78 %)		 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 160,022
(2.80 %)
250 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 alternate hap 2025)
GCA_048941845.1		 n/a 6,576
(0.51 %)		 43,825
(3.94 %)		 n/a 47.88
(100.00 %)		 n/a 7,128
(100.00 %)		 4,390,525
(64.21 %)		 1,225,707
(31.71 %)		 4,578,596
(61.04 %)		 190,615
(29.92 %)
251 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025)
GCA_048934315.1		 n/a 8,243
(0.45 %)		 53,092
(3.72 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,203
(100.00 %)		 813,148
(7.99 %)		 1,963,193
(37.59 %)		 5,212,133
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
252 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 147,499
(35.87 %)
253 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
254 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
255 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCA_035084215.1		 n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
256 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 108,468
(3.25 %)
257 Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024)
GCA_037043045.1		 n/a 13,255
(0.98 %)		 17,598
(1.51 %)		 n/a 40.56
(99.93 %)		 641
(0.07 %)		 1,450
(99.93 %)		 1,165,384
(5.77 %)		 720,981
(3.46 %)		 8,068,978
(51.52 %)		 120,786
(6.16 %)
258 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 86,165
(2.71 %)
259 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
260 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
261 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 427,693
(8.25 %)
262 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
263 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 37,147
(1.43 %)
264 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
265 snake N.helvetica (rNatHel1.hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
266 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 96,764
(4.19 %)
267 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 217,977
(8.25 %)
268 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 47,268
(1.61 %)
269 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 46,378
(2.04 %)
270 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 143,601
(3.21 %)
271 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 142,383
(3.05 %)
272 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 38,507
(2.24 %)
273 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 52,438
(3.69 %)
274 spotted gar (fLepOcu1hap2 2024)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
275 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 64,249
(4.00 %)
276 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 50,785
(2.94 %)
277 starry smooth-hound (sMusAst1.hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
278 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 105,379
(3.46 %)
279 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,208
(5.77 %)		 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 60,325
(1.97 %)
280 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 113,023
(3.09 %)
281 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 92,993
(2.75 %)
282 tailed frog (A.truei hap1 2024)
GCA_040206685.1		 n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
283 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 441,543
(6.61 %)
284 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 159,552
(5.54 %)
285 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
286 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 138,405
(2.40 %)
287 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 45,588
(1.61 %)
288 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
289 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 326,452
(3.86 %)
290 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 91,919
(2.91 %)
291 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,570
(4.71 %)		 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 52,647
(1.35 %)
292 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
293 Tungara frog (aEngPut4 paternal hap 2024)
GCA_040894015.1		 n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 207,553
(4.71 %)
294 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 523,234
(6.59 %)
295 two-lined caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
296 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025)
GCA_965153285.1		 n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
297 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1		 n/a 13,496
(1.42 %)		 18,862
(2.37 %)		 n/a 43.96
(99.99 %)		 983
(0.01 %)		 306
(100.00 %)		 780,565
(4.36 %)		 422,625
(4.27 %)		 6,551,041
(36.66 %)		 89,693
(2.97 %)
298 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 82,750
(2.69 %)
299 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 81,352
(2.71 %)
300 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 88,947
(2.62 %)
301 warty newt (primary hap 2024)
GCA_964204655.1		 n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 2,159,665
(8.20 %)
302 West African lungfish (Aquariam Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 180,606,722
(55.17 %)		 548,408
(0.58 %)
303 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 502,751
(0.52 %)
304 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 184,134
(3.16 %)
305 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 158,311
(2.92 %)
306 western painted turtle (R12L10 2023)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 127,896
(2.94 %)
307 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 103,623
(1.74 %)
308 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 183,292
(4.74 %)
309 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 168,847
(4.76 %)
310 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 100,334
(5.41 %)
311 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 101,603
(5.32 %)
312 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 91,606
(2.53 %)
313 western terrestrial garter snake (primary hap 2019)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
314 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 21,050
(0.30 %)
315 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 35,192
(0.95 %)
316 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 28,353
(0.49 %)
317 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a 14,756
(0.22 %)		 45,590
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 18,937,194
(70.69 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 30,457,322
(66.19 %)		 412,512
(1.53 %)
318 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a 15,637
(0.22 %)		 46,444
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 19,544,300
(70.77 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 31,317,575
(66.35 %)		 423,705
(1.55 %)
319 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,539
(3.36 %)		 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 135,646
(3.23 %)
320 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 20,647
(0.38 %)
321 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
322 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 48,378
(1.60 %)
TOTALS:total assembly count 322

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 600 assemblies assembly stats track stats
Mammals 689 assemblies assembly stats track stats
Birds 441 assemblies assembly stats track stats
Fishes 500 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 322 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1194 assemblies assembly stats track stats
Plants 340 assemblies assembly stats track stats
Fungi 932 assemblies assembly stats track stats
Viruses 708 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 323 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 684 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 1633 assemblies assembly stats track stats