Vertebrate Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of other vertebrates only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2018)
GCF_003597395.1		 50,402
(2.95 %)		 14,990
(1.01 %)		 19,565
(1.58 %)		 34,846
(1.54 %)		 43.71
(94.31 %)		 63,430
(5.70 %)		 10,618
(100.00 %)		 1,553,204
(12.95 %)		 274,155
(1.11 %)		 12,664,684
(27.42 %)		 62,829
(1.59 %)
2 Abingdon island giant tortoise (Lonesome George 2025)
GCF_003597395.2		 45,809
(3.10 %)		 14,668
(1.02 %)		 17,810
(1.52 %)		 n/a 43.77
(96.56 %)		 39,154
(3.45 %)		 3,850
(100.00 %)		 1,222,218
(10.47 %)		 272,032
(1.07 %)		 12,528,821
(28.39 %)		 63,912
(1.75 %)
3 adder (hap1 2024)
GCA_964194415.1		 n/a 13,898
(1.18 %)		 20,039
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 480
(100.00 %)		 3,740,180
(50.44 %)		 792,731
(6.25 %)		 7,621,640
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
4 adder (hap1.1 2024)
GCF_964194415.1		 38,942
(3.52 %)		 13,890
(1.18 %)		 20,037
(1.94 %)		 n/a 41.09
(99.99 %)		 1,057
(0.01 %)		 1,535
(99.99 %)		 3,498,446
(50.64 %)		 792,729
(6.25 %)		 7,621,218
(45.94 %)		 116,506
(4.68 %)
5 adder (hap2 2024)
GCA_964194405.1		 n/a 12,344
(1.22 %)		 17,320
(1.89 %)		 n/a 41.00
(99.99 %)		 908
(0.01 %)		 1,256
(99.99 %)		 3,221,370
(48.42 %)		 681,209
(5.18 %)		 6,734,253
(44.26 %)		 99,366
(4.44 %)
6 Adriatic sturgeon (hap1 F7M8 2026)
GCA_055691345.2		 n/a 20,098
(1.33 %)		 37,942
(3.78 %)		 n/a 40.71
(99.97 %)		 2,714
(0.03 %)		 2,382
(100.00 %)		 4,085,077
(45.81 %)		 1,195,562
(15.56 %)		 8,443,108
(46.99 %)		 78,180
(4.69 %)
7 Adriatic sturgeon (hap2 F7M8 2026)
GCA_055691285.1		 n/a 20,124
(1.49 %)		 36,410
(4.04 %)		 n/a 40.53
(99.97 %)		 3,327
(0.04 %)		 5,697
(99.96 %)		 3,667,553
(45.24 %)		 1,048,673
(13.73 %)		 7,864,141
(44.81 %)		 69,458
(4.21 %)
8 Adriatic sturgeon (hap3 F7M8 2026)
GCA_055691255.1		 n/a 19,683
(1.55 %)		 35,408
(4.15 %)		 n/a 40.38
(99.96 %)		 3,793
(0.04 %)		 5,674
(99.96 %)		 3,521,733
(44.95 %)		 947,487
(11.83 %)		 7,840,137
(43.35 %)		 65,008
(3.89 %)
9 Adriatic sturgeon (hap4 F7M8 2026)
GCA_055691465.1		 n/a 22,119
(1.53 %)		 41,296
(4.20 %)		 n/a 40.48
(99.96 %)		 4,779
(0.04 %)		 8,217
(99.96 %)		 3,962,795
(44.66 %)		 1,085,414
(12.53 %)		 8,556,153
(43.56 %)		 72,066
(4.06 %)
10 Aegean wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964252035.1		 60,400
(5.15 %)		 13,944
(1.37 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 4,972,179
(51.37 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,007,850
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
11 Aeolian wall lizard (La Canna islet alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 10,399
(2.84 %)
12 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 refseq)
GCF_027172205.1		 57,514
(4.49 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
13 African bullfrog (1538 2019)
GCA_004786255.1		 n/a 13,258
(1.31 %)		 15,309
(2.28 %)		 n/a 38.30
(89.51 %)		 121,461
(10.52 %)		 5,411
(100.00 %)		 491,540
(1.54 %)		 401,074
(2.30 %)		 8,595,741
(27.94 %)		 14,854
(0.31 %)
14 African bullfrog (2023)
GCF_032062135.1		 39,241
(5.22 %)		 13,325
(1.31 %)		 16,015
(2.29 %)		 n/a 38.30
(97.16 %)		 40,350
(2.85 %)		 8,090
(100.00 %)		 490,197
(1.53 %)		 403,071
(2.55 %)		 8,536,428
(30.37 %)		 16,231
(0.36 %)
15 African clawed frog (2021)
GCF_017654675.1		 80,899
(3.89 %)		 23,666
(1.59 %)		 32,527
(2.45 %)		 112,506
(5.21 %)		 39.34
(99.94 %)		 667
(0.06 %)		 55
(100.00 %)		 4,269,095
(35.49 %)		 1,028,861
(6.46 %)		 14,246,823
(43.67 %)		 108,774
(1.25 %)
16 African softshell turtle (2025)
GCA_977009205.1		 n/a 14,887
(1.00 %)		 20,847
(1.64 %)		 n/a 45.79
(102.82 %)		 67
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 4,127,877
(47.20 %)		 461,798
(1.96 %)		 11,464,440
(36.72 %)		 110,185
(3.36 %)
17 Aldabra giant tortoise (Hermania_blood 2022)
GCA_026122505.1		 n/a 14,963
(0.99 %)		 18,852
(1.52 %)		 n/a 44.33
(101.34 %)		 321
(0.01 %)		 777
(100.00 %)		 5,237,461
(54.70 %)		 394,170
(2.15 %)		 11,669,021
(34.40 %)		 62,996
(2.39 %)
18 alligator gar (hap1 2026 genbank)
GCA_055471065.1		 n/a 13,707
(1.53 %)		 23,913
(3.61 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 1,306,252
(35.92 %)		 239,317
(13.52 %)		 5,624,757
(36.27 %)		 50,268
(3.81 %)
19 alligator gar (hap1 2026 refseq)
GCF_055471065.1		 45,013
(6.25 %)		 13,822
(1.56 %)		 24,806
(3.66 %)		 n/a 40.64
(101.40 %)		 64
(0.00 %)		 355
(100.00 %)		 1,495,191
(40.90 %)		 239,575
(13.49 %)		 5,624,730
(36.27 %)		 50,268
(3.81 %)
20 alligator gar (hap2 2026)
GCA_055504755.1		 n/a 13,844
(1.62 %)		 23,436
(3.73 %)		 n/a 40.48
(102.64 %)		 81
(0.00 %)		 234
(100.00 %)		 1,286,170
(34.39 %)		 223,198
(11.10 %)		 5,672,865
(34.23 %)		 49,009
(3.64 %)
21 American alligator (2023 refseq)
GCF_030867095.1		 60,799
(4.33 %)		 14,383
(0.98 %)		 18,600
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 195
(100.00 %)		 3,322,624
(43.19 %)		 478,208
(1.77 %)		 12,316,424
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
22 American alligator (hap1 2026)
GCA_057657785.1		 n/a 14,447
(0.97 %)		 18,772
(1.45 %)		 n/a 45.07
(100.00 %)		 144
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,387,982
(42.95 %)		 644,426
(2.34 %)		 12,507,993
(32.71 %)		 49,984
(3.01 %)
23 American alligator (hap2 2026)
GCA_057657805.1		 n/a 14,449
(0.98 %)		 18,986
(1.47 %)		 n/a 44.99
(100.00 %)		 139
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 3,389,572
(43.14 %)		 480,395
(1.63 %)		 12,514,775
(32.21 %)		 50,383
(2.34 %)
24 American alligator (KSC_2009_1 2016)
GCF_000281125.3		 51,013
(3.53 %)		 14,424
(1.06 %)		 19,690
(1.51 %)		 n/a 44.30
(97.86 %)		 236,641
(2.19 %)		 7,094
(100.00 %)		 2,842,761
(36.86 %)		 291,584
(0.69 %)		 12,464,318
(27.91 %)		 35,531
(1.28 %)
25 American bullfrog (2022-GZ 2024)
GCF_042186555.1		 56,135
(1.53 %)		 14,245
(0.30 %)		 40,001
(1.08 %)		 n/a 43.44
(99.96 %)		 4,773
(0.04 %)		 5,033
(99.96 %)		 2,922,485
(2.38 %)		 4,625,082
(10.64 %)		 27,250,040
(58.60 %)		 429,691
(2.65 %)
26 American bullfrog (primary hap 2024)
GCA_037953035.1		 n/a 14,830
(0.29 %)		 47,571
(1.22 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 4,071
(100.00 %)		 3,008,729
(2.34 %)		 4,764,040
(10.52 %)		 28,440,050
(58.60 %)		 446,366
(2.65 %)
27 American eel (EN2019 2024)
GCF_018555375.3		 67,474
(10.58 %)		 17,131
(2.21 %)		 34,322
(5.40 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 985
(0.01 %)		 967
(100.00 %)		 766,696
(5.03 %)		 756,877
(7.81 %)		 5,766,995
(27.42 %)		 133,933
(8.63 %)
28 Amur rat snake (ZZ-2025 2025)
GCA_050231175.1		 n/a 13,403
(1.16 %)		 19,972
(2.10 %)		 n/a 40.32
(101.28 %)		 464
(0.01 %)		 602
(100.00 %)		 5,217,222
(55.62 %)		 936,557
(7.39 %)		 7,976,736
(44.95 %)		 77,945
(2.78 %)
29 Andalusian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965113315.1		 64,111
(5.17 %)		 14,387
(1.31 %)		 20,338
(2.18 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 5,139,265
(54.13 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
30 angelshark (IRGN 9GIWDBWNYT 2023)
GCA_031763465.1		 n/a 5,514
(0.36 %)		 13,241
(0.85 %)		 n/a 44.21
(86.22 %)		 226,036
(13.68 %)		 1,378,695
(86.32 %)		 204,591
(1.55 %)		 649,587
(7.45 %)		 7,948,984
(32.06 %)		 83,350
(2.20 %)
31 Arctic lamprey (IMCB_JLM_01 2021)
GCA_018977245.1		 n/a 7,773
(0.68 %)		 37,576
(3.58 %)		 n/a 48.75
(99.99 %)		 578,345
(0.06 %)		 4,710
(99.99 %)		 3,940,419
(60.65 %)		 1,287,992
(15.83 %)		 6,017,598
(47.20 %)		 172,876
(42.56 %)
32 Argentine snake-necked turtle (alternate hap 2025)
GCA_049999975.1		 n/a 14,806
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 3,247,149
(41.23 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 47,683
(1.86 %)
33 Argentine snake-necked turtle (primary hap 2025)
GCA_049999965.1		 n/a 14,773
(1.27 %)		 19,240
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 114
(0.02 %)		 40
(100.00 %)		 3,245,307
(41.27 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 47,799
(1.87 %)
34 Asian narrow-headed softshell turtle (alternate hap 2025)
GCA_052575425.1		 n/a 449
(0.60 %)		 896
(1.17 %)		 n/a 44.87
(100.00 %)		 n/a 940
(100.00 %)		 181,438
(48.98 %)		 15,458
(1.40 %)		 479,760
(25.10 %)		 3,011
(2.57 %)
35 Asian narrow-headed softshell turtle (primary hap 2025)
GCA_052575445.1		 n/a 14,806
(1.06 %)		 19,069
(1.59 %)		 n/a 45.16
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 3,923,051
(46.22 %)		 376,799
(1.35 %)		 11,484,179
(34.72 %)		 77,209
(2.05 %)
36 Asian spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_060175755.1		 n/a 13,691
(0.76 %)		 26,981
(1.84 %)		 n/a 41.25
(102.77 %)		 519
(0.00 %)		 183
(100.00 %)		 4,957,171
(42.46 %)		 1,021,404
(10.29 %)		 11,309,051
(52.32 %)		 218,366
(4.93 %)
37 Asian vine snake (Xishuangbanna 2023)
GCF_028640845.1		 47,555
(4.15 %)		 13,005
(1.05 %)		 17,560
(1.65 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 331
(0.00 %)		 748
(100.00 %)		 1,484,082
(7.70 %)		 1,033,385
(5.12 %)		 8,266,544
(48.89 %)		 105,815
(4.08 %)
38 Asiatic toad (SCDJY-AF-19 2020)
GCF_014858855.1		 42,994
(1.39 %)		 14,061
(0.43 %)		 43,525
(1.76 %)		 36,577
(1.09 %)		 44.37
(98.21 %)		 3,874
(1.79 %)		 748
(100.00 %)		 1,577,809
(1.79 %)		 2,975,473
(12.67 %)		 18,834,930
(58.75 %)		 415,605
(4.12 %)
39 Atlantic hagfish (alternate hap 2024)
GCA_964187825.1		 n/a 6,253
(0.19 %)		 56,915
(3.08 %)		 n/a 44.52
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 24,878
(100.00 %)		 1,607,558
(3.68 %)		 2,446,041
(23.93 %)		 7,370,810
(72.27 %)		 307,758
(13.12 %)
40 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 408,391
(12.65 %)
41 Atlantic hagfish (primary hap 2024 genbank)
GCA_964187855.1		 n/a 6,662
(0.20 %)		 45,484
(2.63 %)		 n/a 44.32
(99.97 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,004
(100.00 %)		 1,698,449
(3.61 %)		 2,644,659
(27.70 %)		 7,620,145
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
42 Atlantic hagfish (primary hap 2024 refseq)
GCF_964187855.1		 47,605
(1.95 %)		 6,660
(0.20 %)		 45,489
(2.63 %)		 n/a 44.25
(100.59 %)		 4,412
(0.03 %)		 4,003
(100.00 %)		 1,712,039
(3.61 %)		 2,644,653
(27.70 %)		 7,619,436
(74.29 %)		 331,404
(12.87 %)
43 Atlantic ridley (hap1 2025)
GCA_965140285.1		 n/a 14,835
(1.03 %)		 17,938
(1.53 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 1,346,135
(12.58 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
44 Atlantic ridley (hap2 2025 refseq)
GCF_965140265.1		 67,187
(3.84 %)		 14,601
(1.02 %)		 17,367
(1.50 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 245
(0.00 %)		 332
(100.00 %)		 1,335,525
(12.58 %)		 314,640
(2.13 %)		 10,517,469
(34.27 %)		 45,940
(1.37 %)
45 Atlantic stingray (hap1 2023 refseq)
GCF_030144855.1		 60,922
(2.51 %)		 12,544
(0.38 %)		 28,250
(1.22 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,989
(100.00 %)		 8,579,099
(49.81 %)		 831,222
(15.75 %)		 21,718,178
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
46 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 86,138
(2.16 %)
47 Australian saltwater crocodile
GCF_001723895.1		 34,103
(2.80 %)		 12,481
(1.05 %)		 13,920
(1.38 %)		 n/a 43.90
(94.72 %)		 97,039
(5.30 %)		 70
(100.00 %)		 2,480,154
(36.88 %)		 215,190
(0.56 %)		 11,196,176
(26.22 %)		 26,647
(0.98 %)
48 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 134,345,177
(46.63 %)		 2,388,998
(5.24 %)
49 axolotl (Mex_15411 2024 refseq)
GCF_040938575.1		 96,841
(0.40 %)		 18,564
(0.07 %)		 184,527
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 2,095
(0.00 %)		 221
(100.00 %)		 27,951,551
(67.11 %)		 8,561,025
(9.70 %)		 126,532,504
(50.15 %)		 2,452,305
(5.31 %)
50 Banna caecilian (Banna01 2023)
GCA_033557465.1		 n/a 14,628
(0.16 %)		 70,798
(0.93 %)		 n/a 45.89
(102.82 %)		 6,127
(0.02 %)		 348
(100.00 %)		 24,731,653
(51.86 %)		 3,528,513
(2.81 %)		 50,256,292
(61.81 %)		 1,057,733
(6.28 %)
51 barred grass snake (hap1.1 2024)
GCF_964273705.1		 43,483
(3.75 %)		 13,680
(1.11 %)		 19,683
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 487
(100.00 %)		 4,187,944
(53.38 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,184
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
52 basking shark (hap1.1 2024 genbank)
GCA_964194155.1		 n/a 13,757
(0.41 %)		 22,690
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,088
(100.00 %)		 6,693,687
(65.70 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,698,294
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
53 basking shark (hap1.1 2024 refseq)
GCF_964194155.1		 49,591
(1.78 %)		 13,754
(0.41 %)		 22,698
(1.04 %)		 n/a 44.49
(99.99 %)		 2,778
(0.01 %)		 5,087
(100.00 %)		 6,782,578
(65.71 %)		 1,238,350
(12.60 %)		 21,697,546
(51.34 %)		 113,759
(1.90 %)
54 basking shark (hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 107,555
(1.88 %)
55 Bellinger river turtle (v2 BRST_UC0152H_USYD 2025)
GCA_040894355.2		 n/a 14,713
(1.14 %)		 18,959
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 77
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 1,130,167
(11.21 %)		 213,193
(1.80 %)		 11,049,207
(26.48 %)		 53,921
(2.09 %)
56 beluga (Lower Danube River Hh-F2 2024)
GCA_036884735.1		 n/a 24,635
(1.65 %)		 38,296
(3.71 %)		 n/a 39.96
(99.90 %)		 3,967
(0.10 %)		 1,383
(100.00 %)		 1,315,442
(3.30 %)		 1,268,850
(7.99 %)		 10,595,211
(41.03 %)		 65,207
(2.45 %)
57 big-headed turtle (DO16091913 2018)
GCA_003942145.1		 n/a 15,845
(1.05 %)		 56,185
(2.12 %)		 n/a 44.63
(100.70 %)		 109,876
(1.58 %)		 469,569
(98.42 %)		 4,392,283
(44.70 %)		 468,071
(2.04 %)		 12,128,150
(32.03 %)		 156,196
(2.96 %)
58 big-headed turtle (hap1 2026)
GCA_057946115.1		 n/a 14,847
(1.07 %)		 19,128
(1.60 %)		 n/a 44.63
(102.82 %)		 187
(0.00 %)		 114
(100.00 %)		 4,043,109
(46.63 %)		 482,481
(2.68 %)		 10,707,787
(34.65 %)		 112,432
(2.96 %)
59 big-headed turtle (hap2 2026)
GCA_057946265.1		 n/a 14,614
(1.05 %)		 18,669
(1.58 %)		 n/a 44.54
(100.00 %)		 173
(0.00 %)		 81
(100.00 %)		 4,114,841
(46.68 %)		 464,722
(2.78 %)		 10,645,107
(34.66 %)		 110,978
(2.80 %)
60 Blainville's horned lizard (alternate hap 2022)
GCA_026167975.1		 n/a 12,696
(0.93 %)		 14,818
(1.50 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 52
(100.00 %)		 1,468,805
(6.73 %)		 739,796
(3.28 %)		 10,900,584
(40.56 %)		 76,786
(1.60 %)
61 Blainville's horned lizard (primary hap 2022)
GCA_026167985.1		 n/a 13,944
(0.92 %)		 16,009
(1.45 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 1,636,825
(6.67 %)		 826,053
(3.24 %)		 12,398,166
(40.90 %)		 86,825
(1.61 %)
62 blonde ray (alternate hap 2023)
GCA_963513955.1		 n/a 11,554
(0.52 %)		 31,983
(1.58 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 n/a 10,683
(100.00 %)		 8,320,120
(69.63 %)		 991,438
(7.00 %)		 11,337,728
(57.98 %)		 262,962
(6.35 %)
63 blonde ray (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514005.1		 n/a 11,900
(0.54 %)		 27,568
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,647
(100.00 %)		 8,972,805
(66.20 %)		 1,061,811
(8.11 %)		 11,599,498
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
64 blonde ray (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514005.1		 40,007
(2.48 %)		 11,887
(0.54 %)		 27,557
(1.55 %)		 n/a 44.98
(99.98 %)		 2,269
(0.02 %)		 1,646
(100.00 %)		 8,552,615
(70.14 %)		 1,061,810
(8.11 %)		 11,598,911
(58.72 %)		 278,499
(6.42 %)
65 blue shark (ZQ-2024 2024)
GCA_037974335.1		 n/a 12,361
(0.47 %)		 16,843
(1.10 %)		 n/a 44.21
(102.82 %)		 1,665
(0.01 %)		 239
(100.00 %)		 10,050,117
(67.49 %)		 704,409
(8.57 %)		 13,466,755
(51.04 %)		 31,682
(0.79 %)
66 Bocage's wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964188305.1		 64,048
(5.17 %)		 14,155
(1.28 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 507
(100.00 %)		 5,192,766
(54.55 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,204
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
67 Boie's wart frog (hap1 2025)
GCA_054083975.1		 n/a 15,085
(0.57 %)		 28,221
(1.65 %)		 n/a 40.37
(102.96 %)		 1,684
(0.01 %)		 628
(100.00 %)		 10,732,399
(63.17 %)		 3,007,479
(16.48 %)		 16,720,184
(55.88 %)		 121,575
(2.15 %)
68 brilliant-thighed poison frog (Ecuador 8001 2023)
GCA_033576535.1		 n/a 13,834
(0.34 %)		 48,455
(1.58 %)		 n/a 45.66
(99.96 %)		 21,710
(0.04 %)		 28,356
(99.96 %)		 9,462,827
(38.75 %)		 4,882,500
(15.53 %)		 25,372,114
(54.97 %)		 734,430
(7.27 %)
69 brown anole (Geneva1000 2022 refseq)
GCF_025583915.1		 38,099
(3.25 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,932
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 118,178
(98.36 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
70 brown anole (maternal hap 2024 genbank)
GCA_037176765.1		 n/a 14,463
(1.05 %)		 20,625
(1.90 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
71 brown anole (maternal hap 2024 refseq)
GCF_037176765.1		 41,782
(3.73 %)		 14,463
(1.05 %)		 20,186
(1.84 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 191
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 1,456,556
(7.33 %)		 1,162,200
(6.85 %)		 9,275,690
(46.71 %)		 44,738
(1.08 %)
72 brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 37,299
(1.02 %)
73 brown hagfish (PATA_SCHIZ_1 2024)
GCA_035128595.1		 n/a 6,299
(0.25 %)		 35,377
(2.04 %)		 n/a 43.49
(94.65 %)		 706,165
(5.46 %)		 64,533
(99.47 %)		 1,452,558
(4.27 %)		 1,950,334
(8.89 %)		 14,106,206
(47.44 %)		 224,843
(9.74 %)
74 brown house snake (FMNH 251328 2023)
GCA_027560395.1		 n/a 11,753
(1.00 %)		 29,468
(1.83 %)		 n/a 40.67
(98.13 %)		 169,987
(1.84 %)		 753,655
(98.16 %)		 1,167,225
(5.67 %)		 768,909
(2.88 %)		 8,825,109
(34.93 %)		 53,035
(1.80 %)
75 brown spotted pit viper
GCF_001527695.2		 24,336
(2.63 %)		 14,045
(1.20 %)		 27,133
(2.20 %)		 n/a 39.97
(92.15 %)		 115,571
(7.86 %)		 167,851
(92.14 %)		 1,227,118
(8.97 %)		 819,247
(3.70 %)		 8,328,674
(35.16 %)		 68,858
(2.06 %)
76 brownbanded bambooshark (Juve2018m 2025)
GCF_047496795.1		 60,935
(1.72 %)		 12,494
(0.29 %)		 21,756
(0.89 %)		 n/a 44.10
(99.99 %)		 2,891
(0.01 %)		 1,989
(100.00 %)		 1,123,600
(4.34 %)		 1,904,298
(18.02 %)		 24,059,272
(54.04 %)		 56,396
(1.81 %)
77 Burmese glass lizard (XH-2025 2025)
GCA_052054735.1		 n/a 12,007
(1.18 %)		 14,792
(1.79 %)		 n/a 43.48
(102.80 %)		 197
(0.00 %)		 216
(100.00 %)		 4,976,090
(46.37 %)		 581,958
(2.32 %)		 8,298,388
(37.65 %)		 55,992
(1.89 %)
78 Burmese python
GCF_000186305.1		 35,676
(4.16 %)		 13,718
(1.31 %)		 20,498
(2.06 %)		 n/a 39.61
(96.54 %)		 235,132
(3.52 %)		 274,244
(96.48 %)		 727,874
(3.19 %)		 409,033
(2.06 %)		 8,318,382
(25.30 %)		 29,212
(1.10 %)
79 Burmese python (LINGU-HERP-01145 2026)
GCF_059951505.1		 48,810
(5.84 %)		 13,612
(1.41 %)		 17,903
(2.18 %)		 n/a 39.97
(102.95 %)		 n/a 99
(100.00 %)		 2,449,858
(34.22 %)		 385,031
(1.62 %)		 7,891,658
(28.18 %)		 34,600
(2.09 %)
80 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 alternate hap 2022)
GCA_022578425.1		 n/a 13,973
(0.70 %)		 47,231
(2.71 %)		 n/a 41.26
(99.97 %)		 5,955
(0.03 %)		 60,824
(99.97 %)		 1,793,416
(10.43 %)		 1,374,078
(8.30 %)		 10,043,407
(46.03 %)		 89,437
(4.63 %)
81 California glossy snake (A.elegans occidentalis HBS 135684 primary hap 2022)
GCA_022577455.1		 n/a 13,386
(1.04 %)		 21,767
(2.35 %)		 n/a 40.56
(100.00 %)		 256
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 1,354,500
(9.93 %)		 998,712
(8.21 %)		 8,504,468
(46.70 %)		 78,768
(3.37 %)
82 Cantor's giant softshell turtle (Pc-202001 2023)
GCA_032595735.1		 n/a 14,677
(1.06 %)		 19,347
(1.63 %)		 n/a 45.29
(102.86 %)		 490
(0.00 %)		 64
(100.00 %)		 3,813,370
(46.07 %)		 429,148
(1.86 %)		 11,121,808
(34.71 %)		 88,607
(2.50 %)
83 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap1 2025)
GCA_047715975.2		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,926
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,492,668
(30.18 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
84 Cape dwarf chameleon (Western Cape Province JTBG20231 hap2 2025)
GCA_047715955.2		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,934
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 3,500,548
(30.07 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
85 Caribbean electric ray (hap1 2024 refseq)
GCF_036971445.1		 77,919
(2.56 %)		 11,965
(0.44 %)		 20,833
(1.25 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 4,902,644
(34.96 %)		 1,040,891
(17.82 %)		 16,403,243
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
86 Caribbean electric ray (hap2 2024)
GCA_036971175.1		 n/a 11,692
(0.46 %)		 19,961
(1.22 %)		 n/a 42.79
(99.99 %)		 1,507
(0.01 %)		 445
(100.00 %)		 4,781,152
(36.16 %)		 876,063
(14.65 %)		 16,060,040
(52.49 %)		 101,598
(1.64 %)
87 Carpathian newt (aLisMon1.hap1.1 2026)
GCA_988324385.1		 n/a 16,438
(0.08 %)		 243,084
(1.73 %)		 n/a 45.05
(102.80 %)		 3,972
(0.00 %)		 3,355
(100.00 %)		 5,109,099
(1.64 %)		 10,970,146
(13.59 %)		 102,583,082
(47.52 %)		 2,668,298
(7.75 %)
88 Catalonian wall lizard (hap1.1 2025)
GCF_965112155.1		 76,765
(6.15 %)		 14,333
(1.34 %)		 20,157
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 5,086,552
(52.93 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,595
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
89 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025 genbank)
GCA_051106095.1		 n/a 13,804
(1.14 %)		 17,976
(1.89 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 91
(100.00 %)		 940,145
(4.00 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,484
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
90 central bearded dragon (Pit_001003342236 2025 refseq)
GCF_051106095.1		 67,761
(7.72 %)		 13,968
(1.18 %)		 17,955
(1.90 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 90
(100.00 %)		 3,462,868
(44.39 %)		 525,574
(2.47 %)		 8,960,488
(34.90 %)		 60,425
(2.00 %)
91 central bearded dragon (v1 2017)
GCF_900067755.1		 42,304
(3.53 %)		 13,856
(1.19 %)		 17,956
(1.96 %)		 n/a 41.81
(96.03 %)		 90,546
(3.99 %)		 13,749
(100.00 %)		 821,868
(3.44 %)		 570,849
(3.46 %)		 9,494,309
(29.78 %)		 48,137
(1.31 %)
92 central bearded dragon (v2 2025)
GCF_047335585.1		 55,907
(5.04 %)		 13,840
(1.12 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 985,251
(3.91 %)		 586,669
(2.40 %)		 9,004,514
(35.92 %)		 67,220
(2.06 %)
93 Chile mountains false toad (hap1 2026)
GCA_060712405.1		 n/a 14,336
(0.42 %)		 27,367
(1.07 %)		 n/a 43.15
(102.75 %)		 2,470
(0.01 %)		 823
(100.00 %)		 9,080,556
(47.42 %)		 3,920,854
(20.34 %)		 16,577,137
(63.23 %)		 220,660
(2.16 %)
94 Chinese alligator
GCF_000455745.1		 49,884
(3.04 %)		 14,431
(1.00 %)		 15,854
(1.43 %)		 n/a 44.49
(96.86 %)		 167,965
(3.17 %)		 177,282
(96.83 %)		 2,919,372
(38.76 %)		 346,310
(1.06 %)		 12,332,417
(29.19 %)		 46,638
(1.19 %)
95 Chinese brown frog (zglwZSY 2025)
GCA_052815355.1		 n/a 13,643
(0.44 %)		 39,928
(1.70 %)		 n/a 44.25
(102.81 %)		 3,210
(0.01 %)		 311
(100.00 %)		 13,451,071
(77.45 %)		 3,070,971
(9.70 %)		 20,121,233
(55.92 %)		 636,593
(6.80 %)
96 Chinese crocodile lizard (Guangxi GXDGS128 2021)
GCA_021292165.1		 n/a 15,365
(1.01 %)		 20,233
(1.64 %)		 n/a 44.88
(100.00 %)		 852
(0.00 %)		 1,553
(100.00 %)		 2,058,732
(7.85 %)		 845,208
(2.04 %)		 11,639,209
(43.21 %)		 116,459
(3.04 %)
97 Chinese soft-shelled turtle (Daiwa-1 2012)
GCF_000230535.1		 45,454
(3.08 %)		 13,715
(0.96 %)		 16,798
(1.50 %)		 n/a 44.42
(95.68 %)		 185,476
(4.35 %)		 205,380
(95.65 %)		 1,193,608
(10.92 %)		 455,163
(3.06 %)		 11,234,886
(32.34 %)		 95,997
(2.06 %)
98 Chinese soft-shelled turtle (JC-2024 2025)
GCF_049634645.1		 71,700
(4.67 %)		 14,353
(0.98 %)		 21,113
(1.70 %)		 n/a 45.70
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 276
(100.00 %)		 1,130,433
(10.15 %)		 509,375
(2.85 %)		 10,803,789
(36.98 %)		 142,416
(4.34 %)
99 Chinese spiny frog (XW024 2026)
GCA_060123405.1		 n/a 13,786
(0.69 %)		 28,595
(2.10 %)		 n/a 43.64
(102.81 %)		 133
(0.00 %)		 484
(100.00 %)		 7,531,898
(59.95 %)		 1,596,340
(9.70 %)		 13,411,867
(49.25 %)		 434,135
(6.96 %)
100 Chinese sturgeon (BW-2024a 2025)
GCA_052858605.1		 n/a 21,593
(1.40 %)		 36,225
(3.72 %)		 n/a 40.75
(102.72 %)		 3,123
(0.08 %)		 324
(100.00 %)		 4,017,350
(48.28 %)		 1,172,606
(10.24 %)		 9,455,668
(44.92 %)		 88,265
(3.48 %)
101 Chuanan short-legged toad (LJT-LAB2023082_n 2026)
GCA_056747305.1		 n/a 14,111
(0.67 %)		 34,005
(1.97 %)		 n/a 42.53
(102.74 %)		 508
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 6,882,885
(44.58 %)		 2,027,522
(9.24 %)		 10,862,153
(56.66 %)		 379,664
(8.44 %)
102 cliff chirping frog (hap1 2026)
GCA_055470875.1		 n/a 14,195
(0.41 %)		 37,646
(1.41 %)		 n/a 44.76
(102.71 %)		 1,094
(0.00 %)		 1,175
(100.00 %)		 8,999,851
(42.06 %)		 2,656,367
(21.89 %)		 19,256,217
(59.70 %)		 564,413
(7.00 %)
103 cloudy catshark (Kashiwa2021f 2025)
GCF_047496885.1		 69,529
(1.56 %)		 13,335
(0.25 %)		 28,473
(0.76 %)		 n/a 49.26
(99.99 %)		 4,654
(0.01 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,668,127
(2.89 %)		 2,316,011
(21.50 %)		 22,209,447
(67.48 %)		 706,094
(13.30 %)
104 Cochin Forest cane turtle (hap1 2026)
GCA_060712455.1		 n/a 14,910
(1.02 %)		 18,757
(1.53 %)		 n/a 45.04
(102.84 %)		 394
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 4,892,633
(53.58 %)		 444,811
(4.35 %)		 10,374,622
(36.24 %)		 118,141
(3.29 %)
105 coelacanth
GCF_000225785.1		 40,763
(2.63 %)		 13,493
(0.78 %)		 17,640
(1.50 %)		 n/a 41.15
(76.37 %)		 269,010
(23.67 %)		 291,829
(76.33 %)		 2,026,776
(9.13 %)		 571,917
(1.19 %)		 14,630,157
(34.87 %)		 42,857
(0.54 %)
106 coelacanth (alternate hap 2024)
GCA_037215105.1		 n/a 6,557
(0.42 %)		 33,169
(3.43 %)		 n/a 42.50
(99.99 %)		 1
(0.00 %)		 34,012
(100.00 %)		 3,932,420
(65.13 %)		 507,198
(3.35 %)		 6,831,314
(53.31 %)		 66,510
(2.53 %)
107 coelacanth (primary hap 2024 genbank)
GCA_037176945.1		 n/a 14,050
(0.65 %)		 28,429
(2.77 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 8,627,529
(65.90 %)		 1,047,268
(3.01 %)		 15,613,476
(54.44 %)		 140,027
(2.34 %)
108 coelacanth (primary hap 2024 refseq)
GCF_037176945.1		 40,046
(2.75 %)		 13,820
(0.63 %)		 17,285
(1.40 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 2,064,326
(2.75 %)		 1,047,267
(3.01 %)		 15,613,479
(54.45 %)		 140,027
(2.34 %)
109 collared eel (2026)
GCA_978019975.1		 n/a 16,771
(1.95 %)		 29,104
(4.65 %)		 n/a 42.54
(102.83 %)		 91
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 2,469,340
(30.58 %)		 621,719
(7.65 %)		 6,463,607
(28.25 %)		 90,015
(4.18 %)
110 Columbretes wall lizard (hap1.1 2025)
GCA_965112155.1		 n/a 14,276
(1.31 %)		 20,158
(2.24 %)		 n/a 44.06
(99.99 %)		 921
(0.01 %)		 290
(100.00 %)		 871,508
(4.31 %)		 539,525
(6.79 %)		 7,116,593
(40.00 %)		 97,685
(3.45 %)
111 Columbretes wall lizard (hap2.1 2025)
GCA_965178375.1		 n/a 13,776
(1.35 %)		 19,389
(2.28 %)		 n/a 43.97
(99.99 %)		 867
(0.01 %)		 1,011
(99.99 %)		 816,540
(4.18 %)		 497,364
(6.95 %)		 6,729,569
(39.28 %)		 89,601
(3.31 %)
112 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 30,098
(0.96 %)
113 common blue-tongued skink (hap2 2024)
GCA_035046505.1		 n/a 13,266
(1.21 %)		 16,750
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
114 common eastern froglet (primary hap 2026)
GCF_055691185.1		 75,766
(2.52 %)		 14,208
(0.61 %)		 40,998
(2.50 %)		 n/a 44.69
(99.99 %)		 1,804
(0.01 %)		 872
(100.00 %)		 4,569,042
(21.79 %)		 2,371,776
(18.54 %)		 14,121,769
(49.79 %)		 487,488
(7.45 %)
115 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 581,115
(7.68 %)
116 common garter snake
GCF_001077635.1		 26,656
(3.83 %)		 11,623
(1.25 %)		 17,501
(2.23 %)		 n/a 39.92
(78.84 %)		 246,220
(21.21 %)		 175,977
(78.79 %)		 606,040
(3.22 %)		 543,646
(2.36 %)		 6,946,141
(27.08 %)		 36,264
(1.27 %)
117 common garter snake (CBP01778 primary hap 2026)
GCF_051295495.1		 40,365
(3.93 %)		 13,418
(1.20 %)		 18,876
(1.98 %)		 n/a 40.95
(102.84 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,301
(99.99 %)		 4,133,759
(49.65 %)		 1,003,323
(6.06 %)		 8,348,747
(43.87 %)		 79,401
(2.49 %)
118 Common green iguana (ATCC CCL-108 2025)
GCA_051529865.1		 n/a 14,162
(1.04 %)		 17,621
(1.64 %)		 n/a 41.58
(101.52 %)		 986
(0.00 %)		 1,262
(100.00 %)		 5,634,207
(50.82 %)		 425,187
(1.11 %)		 12,007,522
(32.62 %)		 60,423
(2.35 %)
119 common lizard (alternate hap 2023)
GCA_963506595.1		 n/a 12,464
(1.37 %)		 21,834
(2.42 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 n/a 8,057
(100.00 %)		 3,484,058
(44.97 %)		 434,014
(3.31 %)		 6,610,967
(35.30 %)		 78,299
(2.87 %)
120 common lizard (primary hap 2023)
GCA_963506605.1		 n/a 14,281
(1.46 %)		 19,707
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 49
(100.00 %)		 4,263,449
(45.66 %)		 513,321
(3.73 %)		 7,172,746
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
121 common lizard (rZooViv2.hap1.1 2025)
GCF_965207765.1		 62,004
(5.68 %)		 14,208
(1.47 %)		 19,329
(2.35 %)		 n/a 43.99
(102.81 %)		 108
(0.00 %)		 168
(100.00 %)		 4,113,258
(45.15 %)		 507,231
(3.64 %)		 7,206,360
(37.26 %)		 89,393
(2.87 %)
122 common lizard Z.vivipara (hap1.1 2025)
GCA_965207765.1		 n/a 14,100
(1.43 %)		 19,472
(2.36 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 884,631
(4.70 %)		 507,148
(3.64 %)		 7,206,478
(37.26 %)		 89,393
(2.87 %)
123 common lizard Z.vivipara (hap2.1 2025)
GCA_965208345.1		 n/a 14,258
(1.44 %)		 19,379
(2.37 %)		 n/a 43.99
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 169
(100.00 %)		 884,140
(4.69 %)		 506,524
(3.53 %)		 7,214,124
(37.18 %)		 89,651
(2.88 %)
124 common lizard Z.vivipara (primary hap 2023)
GCF_963506605.1		 45,869
(6.34 %)		 14,279
(1.46 %)		 19,710
(2.38 %)		 n/a 44.05
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 48
(100.00 %)		 4,128,183
(45.62 %)		 513,318
(3.73 %)		 7,172,928
(37.61 %)		 92,858
(2.90 %)
125 common musk turtle (alternate hap 2023)
GCA_032164215.1		 n/a 14,229
(1.29 %)		 18,555
(1.90 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,045
(0.01 %)		 1,120
(99.99 %)		 3,408,527
(40.89 %)		 590,538
(3.26 %)		 8,678,744
(30.12 %)		 118,052
(4.00 %)
126 common newt (v1 alternate hap 2024)
GCA_964261385.1		 n/a 14,340
(0.07 %)		 256,786
(1.73 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 2,255,303
(7.95 %)
127 common newt (v1 primary hap 2024 genbank)
GCA_964263255.1		 n/a 17,972
(0.09 %)		 229,830
(1.61 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,265
(100.00 %)		 4,807,454
(1.50 %)		 10,258,109
(12.52 %)		 101,185,912
(47.58 %)		 2,684,793
(7.99 %)
128 common newt (v2 alternate hap 2026)
GCA_964261385.2		 n/a 14,340
(0.07 %)		 258,898
(1.73 %)		 n/a 44.54
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 191,351
(100.00 %)		 4,242,242
(1.64 %)		 8,703,969
(13.90 %)		 85,122,310
(47.86 %)		 2,255,303
(7.95 %)
129 common newt (v2 primary hap 2026 refseq)
GCF_964263255.1		 64,379
(0.42 %)		 16,999
(0.08 %)		 229,922
(1.61 %)		 n/a 45.02
(101.29 %)		 4,030
(0.00 %)		 15,248
(100.00 %)		 4,839,266
(1.50 %)		 10,251,753
(12.52 %)		 101,183,555
(47.58 %)		 2,684,759
(7.99 %)
130 common spadefoot toad (primary hap 2024 genbank)
GCA_036172605.1		 n/a 14,564
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 1,677,382
(3.51 %)		 3,229,435
(13.31 %)		 15,027,089
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
131 common spadefoot toad (primary hap 2024 refseq)
GCF_036172605.1		 42,170
(1.55 %)		 14,560
(0.56 %)		 46,435
(2.21 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 349
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 1,677,374
(3.51 %)		 3,229,434
(13.31 %)		 15,027,049
(51.43 %)		 282,389
(3.86 %)
132 common stingray (2026)
GCA_987106705.1		 n/a 12,606
(0.38 %)		 26,958
(1.17 %)		 n/a 43.42
(102.68 %)		 1,662
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 10,190,334
(68.59 %)		 952,015
(14.78 %)		 20,089,208
(55.29 %)		 115,829
(2.54 %)
133 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 405,097
(4.49 %)
134 common toad (primary hap 2021)
GCF_905171765.1		 45,085
(1.10 %)		 14,240
(0.38 %)		 46,470
(1.68 %)		 37,594
(0.91 %)		 44.49
(99.80 %)		 4,199
(0.20 %)		 1,306
(100.00 %)		 1,658,204
(1.79 %)		 3,099,513
(13.49 %)		 19,236,510
(62.70 %)		 539,919
(4.45 %)
135 common wall lizard (hap1 2024 genbank)
GCA_964188315.1		 n/a 14,322
(1.36 %)		 19,700
(2.31 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 868,785
(4.15 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,097,077
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
136 common wall lizard (hap1 2024 refseq)
GCF_964188315.1		 58,901
(5.59 %)		 14,352
(1.39 %)		 20,013
(2.30 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 827
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 4,727,760
(49.94 %)		 544,999
(4.79 %)		 7,096,752
(38.69 %)		 120,725
(3.71 %)
137 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 113,458
(3.63 %)
138 common wall lizard (yellow 2019)
GCF_004329235.1		 56,519
(4.85 %)		 14,453
(1.36 %)		 20,529
(2.31 %)		 n/a 44.18
(99.81 %)		 4,085
(0.19 %)		 2,161
(100.00 %)		 1,089,164
(8.31 %)		 506,669
(2.12 %)		 7,474,116
(36.15 %)		 122,507
(3.69 %)
139 corn snake (Columbia U 2023)
GCF_029531705.1		 53,076
(4.72 %)		 13,697
(1.21 %)		 20,819
(2.22 %)		 n/a 40.33
(96.60 %)		 3,553
(3.40 %)		 4,019
(96.60 %)		 4,116,616
(49.72 %)		 917,455
(3.96 %)		 8,460,248
(40.76 %)		 64,946
(2.08 %)
140 corn snake (EG266 2020)
GCF_001185365.1		 48,995
(3.92 %)		 13,316
(1.14 %)		 23,595
(2.17 %)		 29,466
(2.61 %)		 40.35
(95.32 %)		 84,947
(4.70 %)		 34,268
(100.00 %)		 1,243,828
(6.50 %)		 884,533
(3.25 %)		 8,373,398
(40.31 %)		 66,926
(2.14 %)
141 corn snake (Tessera 2026)
GCF_059756535.1		 66,038
(5.11 %)		 13,487
(1.17 %)		 19,751
(2.09 %)		 n/a 40.40
(102.83 %)		 17
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 4,151,293
(51.01 %)		 940,976
(5.64 %)		 8,412,021
(43.55 %)		 66,782
(2.36 %)
142 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 24,118,603
(71.52 %)		 991,009
(4.86 %)
143 corroboree frog (hap2 2023 refseq)
GCF_028390025.1		 140,657
(1.12 %)		 15,461
(0.24 %)		 54,344
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 3,521,281
(2.88 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 24,178,131
(71.23 %)		 990,274
(4.84 %)
144 Couch's spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_054954225.1		 n/a 13,528
(1.90 %)		 19,914
(3.61 %)		 n/a 39.98
(98.72 %)		 605
(1.28 %)		 578
(100.00 %)		 2,481,494
(34.56 %)		 623,950
(10.48 %)		 5,737,146
(34.46 %)		 42,554
(2.79 %)
145 Couch's spadefoot toad (hap2 2026)
GCA_054954145.1		 n/a 13,481
(1.82 %)		 21,941
(3.80 %)		 n/a 39.97
(99.23 %)		 620
(0.77 %)		 494
(100.00 %)		 2,625,418
(35.92 %)		 713,292
(13.02 %)		 5,588,085
(36.90 %)		 42,871
(2.71 %)
146 crested gecko (US Hobby MAA-2024a 2024)
GCA_040207535.1		 n/a 13,876
(1.22 %)		 18,274
(2.01 %)		 n/a 45.06
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 1,021,810
(6.04 %)		 410,843
(1.76 %)		 8,147,007
(34.90 %)		 79,154
(2.34 %)
147 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 107,080
(3.15 %)
148 Cretan wall lizard (primary hap 2023 genbank)
GCA_951804945.1		 n/a 14,249
(1.37 %)		 19,304
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 882,564
(4.30 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,363
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
149 Cretan wall lizard (primary hap 2023 refseq)
GCF_951804945.1		 62,110
(5.47 %)		 14,322
(1.40 %)		 19,303
(2.27 %)		 n/a 43.87
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,986,518
(46.26 %)		 511,174
(3.24 %)		 7,094,353
(38.65 %)		 117,222
(3.18 %)
150 cuckoo ray (2025)
GCA_965643135.1		 n/a 11,948
(0.63 %)		 26,240
(1.77 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 2,173
(0.01 %)		 1,503
(100.00 %)		 9,829,377
(67.19 %)		 1,120,890
(8.92 %)		 10,135,837
(56.08 %)		 194,688
(3.92 %)
151 Dalmatian wall lizard (hap1.1 2024)
GCF_964234715.1		 61,269
(4.93 %)		 14,329
(1.34 %)		 20,474
(2.25 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 386
(100.00 %)		 4,958,256
(53.05 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,837,755
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
152 dark-spotted frog (GW-2025 2026)
GCA_054643415.1		 n/a 14,566
(0.39 %)		 36,959
(1.46 %)		 n/a 43.13
(102.67 %)		 844
(0.01 %)		 180
(100.00 %)		 2,578,722
(2.62 %)		 3,612,303
(10.79 %)		 23,708,206
(55.67 %)		 351,395
(2.26 %)
153 Darwin's frog (hap1 2025)
GCF_050947455.1		 75,763
(2.00 %)		 13,808
(0.52 %)		 34,029
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,942
(100.00 %)		 1,105,374
(2.22 %)		 2,251,358
(18.25 %)		 13,843,878
(63.42 %)		 443,624
(6.38 %)
154 Darwin's frog (hap2 2025)
GCA_050947465.1		 n/a 13,442
(0.54 %)		 32,134
(1.61 %)		 n/a 42.92
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 10,591,581
(59.76 %)		 2,041,017
(15.35 %)		 13,574,848
(62.16 %)		 428,658
(6.43 %)
155 Delalande's beaked blind snake (hap1 2026)
GCA_057127545.1		 n/a 13,330
(1.11 %)		 17,807
(1.86 %)		 n/a 41.60
(99.99 %)		 642
(0.01 %)		 125
(100.00 %)		 4,372,440
(36.86 %)		 631,618
(2.38 %)		 8,665,237
(37.98 %)		 70,554
(2.23 %)
156 Delalande's beaked blind snake (hap2 2026)
GCA_057127535.1		 n/a 13,373
(1.12 %)		 17,783
(1.85 %)		 n/a 41.60
(99.99 %)		 624
(0.01 %)		 111
(100.00 %)		 4,361,437
(36.83 %)		 631,970
(2.38 %)		 8,688,526
(38.15 %)		 70,030
(2.21 %)
157 desert lancehead (hap1 2026)
GCA_058248175.2		 n/a 15,061
(1.16 %)		 20,290
(1.86 %)		 n/a 40.66
(102.78 %)		 393
(0.00 %)		 205
(100.00 %)		 3,578,028
(54.47 %)		 933,805
(10.67 %)		 7,669,382
(47.52 %)		 91,099
(2.76 %)
158 Desirade skink (SBH274697 2026)
GCA_056883445.1		 n/a 13,792
(1.46 %)		 16,081
(2.16 %)		 n/a 43.42
(102.86 %)		 10,927,641
(0.82 %)		 21
(100.00 %)		 2,979,158
(25.91 %)		 348,872
(2.21 %)		 8,348,203
(31.66 %)		 17,700
(0.68 %)
159 diablito poison frog (Paru LO004 2023)
GCA_033576555.1		 n/a 11,147
(0.26 %)		 39,500
(1.20 %)		 n/a 44.55
(99.89 %)		 56,659
(0.11 %)		 71,942
(99.89 %)		 9,076,667
(51.42 %)		 3,074,045
(13.04 %)		 16,014,353
(69.89 %)		 606,993
(6.09 %)
160 diamondback terrapin (hap1 2023 refseq)
GCF_027887155.1		 50,318
(3.53 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,280
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
161 diamondback terrapin (hap2 2023)
GCA_027887205.1		 n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 111,129
(2.68 %)
162 duckbill oceanic eel (2026)
GCA_987430295.1		 n/a 18,348
(0.97 %)		 58,748
(4.23 %)		 n/a 43.11
(102.85 %)		 301
(0.00 %)		 152
(100.00 %)		 6,695,343
(51.23 %)		 1,348,923
(14.73 %)		 8,982,328
(52.54 %)		 198,946
(5.68 %)
163 dusky salamander (AMNH A-194068-9 2025)
GCA_050004315.1		 n/a 18,675
(0.12 %)		 122,637
(1.35 %)		 n/a 46.83
(100.73 %)		 4,269
(0.00 %)		 15,418
(100.00 %)		 4,404,135
(1.56 %)		 5,531,798
(5.54 %)		 57,222,162
(57.82 %)		 2,045,970
(7.25 %)
164 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 genbank)
GCA_039654945.1		 n/a 14,300
(0.31 %)		 45,262
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 10,980,035
(47.79 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
165 dyeing poison frog (UK_male_01 2024 refseq)
GCF_039654945.1		 65,453
(1.48 %)		 14,300
(0.31 %)		 45,268
(1.22 %)		 n/a 44.70
(100.00 %)		 n/a 830
(100.00 %)		 1,777,277
(2.39 %)		 4,029,040
(19.38 %)		 20,561,178
(70.58 %)		 683,383
(5.67 %)
166 eastern brown snake
GCF_900518735.1		 34,614
(3.30 %)		 13,625
(1.22 %)		 21,795
(2.00 %)		 n/a 39.84
(97.54 %)		 59,472
(2.47 %)		 28,550
(100.00 %)		 1,020,240
(5.86 %)		 663,810
(2.41 %)		 8,140,554
(39.61 %)		 52,895
(2.12 %)
167 eastern brown snake (UNSWEBS1 2025)
GCF_049901715.1		 52,863
(4.64 %)		 13,261
(1.30 %)		 17,510
(1.96 %)		 n/a 39.70
(101.39 %)		 1,177
(0.01 %)		 556
(100.00 %)		 2,901,288
(46.79 %)		 660,540
(3.18 %)		 7,879,564
(40.28 %)		 47,496
(2.07 %)
168 eastern musk turtle (MuskTurtle02 alternate hap 2026)
GCA_032164215.2		 n/a 13,592
(1.23 %)		 18,011
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 769
(99.99 %)		 3,417,560
(41.81 %)		 621,567
(3.54 %)		 8,327,641
(30.43 %)		 117,733
(4.04 %)
169 Eastern musk turtle (MuskTurtle02 primary hap 2026)
GCA_032164245.2		 n/a 14,208
(1.29 %)		 18,423
(1.89 %)		 n/a 44.57
(99.99 %)		 1,079
(0.01 %)		 74
(100.00 %)		 3,408,591
(40.89 %)		 590,719
(3.26 %)		 8,678,800
(30.12 %)		 118,053
(4.00 %)
170 eastern musk turtle (primary hap 2023)
GCA_032164245.1		 n/a 13,413
(1.19 %)		 18,038
(1.85 %)		 n/a 44.58
(99.99 %)		 553
(0.01 %)		 771
(99.99 %)		 1,003,504
(9.02 %)		 621,617
(3.54 %)		 8,327,948
(30.44 %)		 117,734
(4.05 %)
171 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 614,432
(5.85 %)
172 eastern narrow-mouthed toad (primary haplotype 2023)
GCA_027917425.1		 n/a 13,882
(0.43 %)		 35,323
(1.46 %)		 n/a 46.78
(99.99 %)		 1,745
(0.01 %)		 1,002
(100.00 %)		 1,769,293
(1.99 %)		 2,023,109
(16.33 %)		 16,148,710
(60.55 %)		 618,204
(5.89 %)
173 Eastern racer (BlueRacer01 primary hap 2024)
GCA_038048745.1		 n/a 14,465
(1.14 %)		 21,583
(2.08 %)		 n/a 40.41
(102.70 %)		 826
(0.01 %)		 349
(100.00 %)		 5,794,853
(55.93 %)		 1,032,854
(6.39 %)		 9,554,466
(43.47 %)		 51,856
(2.08 %)
174 Eaton's skate (JK-2026 2026)
GCA_061597785.1		 n/a 11,626
(0.67 %)		 24,078
(1.78 %)		 n/a 44.39
(100.03 %)		 3,081
(0.13 %)		 3,731
(100.00 %)		 9,594,624
(63.01 %)		 1,018,967
(4.27 %)		 8,710,360
(53.54 %)		 184,624
(4.86 %)
175 elephant shark (2021)
GCF_018977255.1		 32,553
(4.75 %)		 11,542
(1.51 %)		 18,900
(3.25 %)		 n/a 42.85
(99.99 %)		 14,404
(0.01 %)		 3,822
(99.99 %)		 1,971,730
(36.60 %)		 433,955
(3.92 %)		 5,654,656
(37.91 %)		 41,081
(3.43 %)
176 elongated tortoise (hap1 2025)
GCA_050000095.2		 n/a 14,769
(1.01 %)		 18,561
(1.53 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 169
(0.00 %)		 207
(100.00 %)		 5,015,434
(53.77 %)		 367,754
(2.17 %)		 10,980,259
(34.90 %)		 82,369
(2.28 %)
177 elongated tortoise (hap2 2025)
GCA_050000115.1		 n/a 14,858
(1.00 %)		 18,820
(1.51 %)		 n/a 44.35
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 586
(100.00 %)		 5,006,492
(53.37 %)		 397,554
(3.24 %)		 10,915,197
(35.50 %)		 82,579
(2.28 %)
178 Emei moustache toad (SX-2025 2025)
GCA_054131545.1		 n/a 13,782
(0.57 %)		 40,311
(2.03 %)		 n/a 43.92
(100.00 %)		 1,479
(0.00 %)		 1,492
(100.00 %)		 9,232,515
(76.18 %)		 2,040,137
(11.03 %)		 12,972,928
(60.26 %)		 511,382
(8.34 %)
179 epaulette shark (alternate hap 2021)
GCA_020745765.1		 n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 42,917
(1.08 %)
180 epaulette shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_020745735.1		 43,156
(1.65 %)		 12,749
(0.40 %)		 19,519
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,962
(100.00 %)		 9,420,365
(63.82 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,566
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
181 Erhard's wall lizard (hap1.2 2026 genbank)
GCA_964252035.2		 n/a 13,941
(1.37 %)		 19,666
(2.30 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 4,971,098
(51.39 %)		 526,603
(3.30 %)		 7,004,419
(38.57 %)		 89,692
(2.87 %)
182 Erhard's wall lizard (hap1.2 2026 refseq)
GCF_964252035.2		 60,399
(5.16 %)		 13,941
(1.37 %)		 19,667
(2.30 %)		 n/a 43.79
(101.43 %)		 836
(0.01 %)		 316
(100.00 %)		 4,771,967
(51.33 %)		 526,687
(3.30 %)		 7,004,420
(38.57 %)		 89,692
(2.87 %)
183 Erhard's wall lizard (hap2.2 2026)
GCA_964251985.2		 n/a 13,878
(1.40 %)		 20,097
(2.41 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,202
(99.99 %)		 4,873,253
(50.27 %)		 516,963
(3.38 %)		 6,833,738
(37.92 %)		 87,923
(2.92 %)
184 European brook lamprey (2025)
GCF_965212315.1		 37,400
(7.69 %)		 8,181
(0.85 %)		 37,330
(4.57 %)		 n/a 48.46
(99.98 %)		 873
(0.02 %)		 3,066
(99.98 %)		 3,708,295
(61.62 %)		 873,872
(14.29 %)		 4,763,033
(46.24 %)		 139,528
(43.10 %)
185 European common frog (2021)
GCF_905171775.1		 51,633
(1.57 %)		 13,864
(0.46 %)		 39,978
(1.88 %)		 57,578
(1.85 %)		 44.15
(99.36 %)		 1,860
(0.64 %)		 554
(100.00 %)		 1,804,642
(3.42 %)		 2,925,830
(9.39 %)		 18,921,726
(55.43 %)		 641,799
(7.66 %)
186 European conger (alternate hap 2023)
GCA_963514125.1		 n/a 16,952
(1.95 %)		 37,050
(5.24 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 n/a 3,769
(100.00 %)		 2,413,696
(36.12 %)		 866,233
(11.37 %)		 5,685,752
(33.48 %)		 112,201
(5.57 %)
187 European eel (alternate hap 2020)
GCA_013347865.1		 n/a 17,177
(2.21 %)		 36,037
(5.58 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 n/a 2,338
(100.00 %)		 811,567
(5.37 %)		 759,871
(7.97 %)		 5,672,321
(27.30 %)		 127,837
(8.05 %)
188 European eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013347855.1		 64,143
(9.57 %)		 17,054
(2.22 %)		 34,278
(5.56 %)		 79,684
(7.37 %)		 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 54
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,521
(8.15 %)		 5,700,890
(27.40 %)		 130,346
(8.19 %)
189 European green toad (Lasithi_1F 2023)
GCA_033119425.1		 n/a 13,962
(0.52 %)		 37,931
(1.72 %)		 n/a 43.01
(99.70 %)		 5,177
(0.54 %)		 13,319
(100.00 %)		 11,279,683
(76.62 %)		 2,004,029
(15.42 %)		 16,764,590
(57.18 %)		 311,721
(3.22 %)
190 European leaf-toed gecko (hap1 2023)
GCF_029931775.1		 24,643
(2.02 %)		 14,238
(1.16 %)		 21,782
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 591
(100.00 %)		 1,174,615
(6.99 %)		 436,937
(2.95 %)		 8,308,817
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
191 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 82,695
(2.80 %)
192 European pond turtle (hap1 2023 genbank)
GCA_028017835.1		 n/a 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
193 European pond turtle (hap1 2023 refseq)
GCF_028017835.1		 27,890
(1.81 %)		 14,802
(0.99 %)		 19,772
(1.60 %)		 n/a 44.74
(99.86 %)		 148
(0.14 %)		 106
(100.00 %)		 1,526,737
(12.44 %)		 460,562
(2.12 %)		 11,130,580
(35.42 %)		 136,002
(2.92 %)
194 European pond turtle (hap2 2023)
GCA_028017845.1		 n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 138,047
(2.94 %)
195 European river lamprey (alternate hap 2024)
GCA_964198585.1		 n/a 7,082
(0.70 %)		 37,019
(4.34 %)		 n/a 49.03
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 5,726
(100.00 %)		 3,762,664
(64.70 %)		 1,005,839
(17.80 %)		 4,592,233
(49.09 %)		 153,841
(41.42 %)
196 European river lamprey (primary hap 2024 genbank)
GCA_964198595.1		 n/a 7,757
(0.73 %)		 36,797
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,497
(100.00 %)		 657,405
(7.80 %)		 1,165,422
(20.23 %)		 4,931,883
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
197 European river lamprey (primary hap 2024 refseq)
GCF_964198595.1		 36,555
(6.20 %)		 7,604
(0.70 %)		 36,803
(4.29 %)		 n/a 49.25
(99.97 %)		 1,795
(0.03 %)		 1,496
(100.00 %)		 4,068,759
(65.84 %)		 1,165,417
(20.23 %)		 4,931,505
(50.78 %)		 149,123
(44.61 %)
198 Far Eastern brook lamprey (v1 LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.1		 37,946
(7.32 %)		 7,797
(0.72 %)		 39,285
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,946
(100.00 %)		 716,804
(6.02 %)		 1,192,268
(15.54 %)		 5,304,945
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
199 Far Eastern brook lamprey (v2 LAM-NWPU_2019-01 2020)
GCF_015708825.2		 37,933
(7.32 %)		 7,858
(0.72 %)		 39,278
(4.37 %)		 n/a 48.80
(98.99 %)		 3,287
(1.01 %)		 1,945
(100.00 %)		 4,065,593
(61.75 %)		 1,192,260
(15.54 %)		 5,304,096
(47.85 %)		 170,623
(43.14 %)
200 fence lizard
GCF_019175285.1		 48,391
(3.65 %)		 14,000
(1.07 %)		 17,384
(1.71 %)		 n/a 41.25
(97.53 %)		 48,138
(2.47 %)		 45,012
(100.00 %)		 1,357,856
(6.95 %)		 596,824
(1.92 %)		 11,090,372
(34.38 %)		 67,007
(1.51 %)
201 Filfola wall lizard (hap1.1 2024 genbank)
GCA_964270895.1		 n/a 14,292
(1.37 %)		 20,325
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 353
(100.00 %)		 840,209
(4.04 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,010,158
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
202 Filfola wall lizard (hap1.1 2024 refseq)
GCF_964270895.1		 74,789
(6.22 %)		 14,358
(1.40 %)		 20,324
(2.33 %)		 n/a 43.79
(99.99 %)		 872
(0.01 %)		 349
(100.00 %)		 4,963,872
(50.70 %)		 484,479
(4.00 %)		 7,009,851
(37.94 %)		 87,924
(2.61 %)
203 Filfola wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 81,312
(2.54 %)
204 fire-bellied toad (alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 74,669
(1.25 %)
205 fire-bellied toad (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579735.1		 38,236
(0.68 %)		 15,452
(0.21 %)		 47,500
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,467
(100.00 %)		 4,258,941
(3.44 %)		 7,150,261
(12.27 %)		 34,823,806
(63.74 %)		 n/a
206 flapper skate (hap1.1 2026)
GCA_983203515.1		 n/a 12,020
(0.45 %)		 32,606
(1.57 %)		 n/a 44.80
(100.53 %)		 4,961
(0.02 %)		 3,667
(100.00 %)		 11,646,386
(74.12 %)		 2,050,507
(10.64 %)		 12,597,039
(62.58 %)		 337,808
(5.43 %)
207 flapper skate (hap2.1 2026)
GCA_983203605.1		 n/a 11,699
(0.49 %)		 29,667
(1.60 %)		 n/a 44.55
(99.99 %)		 4,331
(0.02 %)		 2,143
(100.00 %)		 10,758,595
(73.15 %)		 1,664,028
(8.60 %)		 11,722,103
(60.48 %)		 299,094
(5.16 %)
208 flatback sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152275.1		 48,321
(3.34 %)		 14,858
(1.05 %)		 18,090
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,289,321
(12.22 %)		 319,643
(1.38 %)		 10,785,197
(32.95 %)		 52,168
(1.81 %)
209 flatback sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152195.1		 n/a 14,229
(1.06 %)		 16,514
(1.49 %)		 n/a 43.97
(100.00 %)		 261
(0.00 %)		 322
(100.00 %)		 4,567,737
(43.65 %)		 288,964
(1.17 %)		 10,681,579
(32.83 %)		 47,249
(1.62 %)
210 Fleay's barred frog (hap1 2024 genbank)
GCA_038048845.1		 n/a 14,321
(0.67 %)		 22,672
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,578
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,293,397
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
211 Fleay's barred frog (hap1 2024 refseq)
GCF_038048845.1		 56,722
(2.42 %)		 14,321
(0.67 %)		 22,670
(1.51 %)		 n/a 40.32
(99.87 %)		 1,421
(0.13 %)		 2,806
(100.00 %)		 1,320,683
(5.87 %)		 1,506,550
(13.49 %)		 13,292,724
(46.37 %)		 63,677
(0.85 %)
212 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 64,121
(0.88 %)
213 Florida worm lizard (hap1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 47,933
(1.03 %)
214 Florida worm lizard (hap2 2023 genbank)
GCA_030035675.1		 n/a 14,331
(0.90 %)		 17,854
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 78
(100.00 %)		 1,426,833
(7.17 %)		 616,690
(2.63 %)		 10,819,054
(45.31 %)		 47,454
(1.03 %)
215 Florida worm lizard (hap2 2023 refseq)
GCF_030035675.1		 65,314
(3.47 %)		 14,331
(0.90 %)		 17,853
(1.51 %)		 n/a 42.86
(99.72 %)		 242
(0.28 %)		 76
(100.00 %)		 1,426,827
(7.17 %)		 616,687
(2.63 %)		 10,819,019
(45.31 %)		 47,453
(1.03 %)
216 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 genbank)
GCA_048569485.1		 n/a 13,963
(0.31 %)		 43,460
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,772
(0.01 %)		 3,642
(100.00 %)		 2,033,935
(2.50 %)		 4,040,311
(20.45 %)		 20,439,907
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
217 frog A.baeobatrachus (hap1 2025 refseq)
GCF_048569485.1		 69,304
(1.30 %)		 13,964
(0.31 %)		 43,453
(1.20 %)		 n/a 46.27
(99.99 %)		 3,773
(0.01 %)		 3,643
(100.00 %)		 2,033,939
(2.50 %)		 4,040,312
(20.45 %)		 20,439,939
(69.96 %)		 1,159,163
(12.74 %)
218 frog A.baeobatrachus (hap2 2025)
GCA_048569465.1		 n/a 13,992
(0.31 %)		 43,409
(1.27 %)		 n/a 46.36
(99.99 %)		 3,799
(0.01 %)		 2,426
(100.00 %)		 1,997,963
(2.50 %)		 4,002,458
(19.16 %)		 20,517,633
(69.30 %)		 1,152,817
(12.93 %)
219 frog Boulenophrys sangzhiensis (2026)
GCA_056363575.1		 n/a 13,941
(0.70 %)		 42,804
(2.71 %)		 n/a 42.98
(102.85 %)		 330
(0.00 %)		 157
(100.00 %)		 6,689,190
(42.81 %)		 1,772,764
(10.83 %)		 11,474,724
(52.48 %)		 401,675
(10.89 %)
220 frog Ptychadena robeensis (15-139 2024)
GCA_036250615.1		 n/a 12,285
(1.02 %)		 24,703
(2.37 %)		 n/a 40.07
(100.00 %)		 212,285
(1.24 %)		 35,197
(99.94 %)		 2,477,675
(19.18 %)		 504,143
(3.43 %)		 9,642,619
(38.74 %)		 159,886
(3.90 %)
221 Gaboon caecilian (alternate hap 2019)
GCA_902459495.1		 n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 235,170
(4.50 %)
222 Gaboon caecilian (primary hap 2021)
GCF_902459505.2		 54,715
(1.72 %)		 14,269
(0.52 %)		 29,024
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 596
(99.85 %)		 11,725,554
(74.57 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,602
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
223 Gaboon caecilian (v1.2 2021 genbank)
GCA_902459505.2		 n/a 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,331,879
(1.68 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,806
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
224 gharial (Ggan-Ray 2016)
GCF_001723915.1		 32,297
(2.61 %)		 12,194
(1.03 %)		 12,758
(1.30 %)		 n/a 43.95
(73.60 %)		 248,526
(26.44 %)		 81
(100.00 %)		 2,589,103
(36.89 %)		 243,334
(0.51 %)		 11,279,606
(20.80 %)		 26,651
(0.60 %)
225 gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 39,919
(1.95 %)
226 gharial (hap2 2023)
GCA_030020295.1		 n/a 14,151
(0.94 %)		 23,338
(1.95 %)		 n/a 45.15
(99.95 %)		 118
(0.05 %)		 160
(100.00 %)		 1,232,693
(12.81 %)		 332,737
(2.19 %)		 11,907,298
(32.91 %)		 40,660
(1.87 %)
227 giant manta (hap1 2023 refseq)
GCF_030028105.1		 53,223
(2.04 %)		 12,432
(0.38 %)		 25,243
(1.14 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 863,834
(1.59 %)		 947,015
(13.41 %)		 20,234,736
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
228 giant manta (hap2 2023)
GCA_030035685.1		 n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 91,414
(1.45 %)
229 giant moray (Gymjav_1 2023)
GCA_029692085.1		 n/a 15,797
(0.94 %)		 41,248
(3.45 %)		 n/a 41.23
(101.36 %)		 823
(0.00 %)		 519
(100.00 %)		 5,215,352
(62.84 %)		 839,163
(6.77 %)		 10,111,295
(41.61 %)		 93,534
(1.75 %)
230 giant South American river turtle (hap1 2024)
GCA_045364785.1		 n/a 14,628
(0.85 %)		 18,382
(1.34 %)		 n/a 44.78
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 2,039
(100.00 %)		 1,254,940
(9.13 %)		 434,666
(6.73 %)		 12,070,445
(35.52 %)		 51,563
(1.91 %)
231 giant South American river turtle (hap2 2024)
GCA_045364815.1		 n/a 14,571
(0.87 %)		 18,363
(1.38 %)		 n/a 44.25
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 725
(100.00 %)		 1,243,321
(10.35 %)		 434,716
(4.30 %)		 12,200,714
(33.86 %)		 51,411
(1.88 %)
232 Gila monster (Gila_16-S 2026)
GCF_057233095.1		 66,395
(3.96 %)		 14,385
(0.86 %)		 17,870
(1.34 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 20
(100.00 %)		 6,454,936
(49.83 %)		 703,981
(7.97 %)		 11,888,999
(48.87 %)		 165,685
(5.15 %)
233 gold dust stingray (hap1 2026)
GCA_055471165.1		 n/a 12,763
(0.32 %)		 26,283
(0.98 %)		 n/a 41.62
(102.78 %)		 1,114
(0.00 %)		 1,101
(100.00 %)		 10,563,952
(74.49 %)		 946,334
(14.98 %)		 22,595,289
(58.96 %)		 74,808
(0.84 %)
234 golden lancehead (SB1851 2026)
GCA_055824665.1		 n/a 14,798
(1.29 %)		 18,919
(1.98 %)		 n/a 40.44
(102.76 %)		 589
(0.01 %)		 117
(100.00 %)		 3,439,320
(49.41 %)		 811,986
(5.35 %)		 7,552,500
(42.55 %)		 84,249
(2.80 %)
235 golden mantella (hap1 2025)
GCA_048565345.1		 n/a 13,675
(0.56 %)		 30,568
(1.85 %)		 n/a 41.00
(99.98 %)		 4,138
(0.02 %)		 3,088
(100.00 %)		 1,225,842
(2.74 %)		 2,478,484
(16.71 %)		 14,761,187
(53.21 %)		 164,021
(2.52 %)
236 golden mantella (hap2 2025)
GCA_048565335.1		 n/a 13,400
(0.55 %)		 28,454
(1.70 %)		 n/a 40.91
(99.98 %)		 3,921
(0.02 %)		 2,611
(100.00 %)		 1,203,975
(3.36 %)		 2,447,119
(16.68 %)		 14,661,554
(53.34 %)		 160,856
(2.46 %)
237 golden poison dart frog (yellow primary hap 2024)
GCF_046119375.1		 128,151
(0.97 %)		 15,383
(0.19 %)		 56,843
(1.14 %)		 n/a 44.28
(100.00 %)		 1,234
(0.00 %)		 9,343
(100.00 %)		 2,355,255
(2.05 %)		 5,350,104
(37.88 %)		 20,333,848
(81.77 %)		 874,818
(5.79 %)
238 goldentail moray (2026)
GCA_987191265.1		 n/a 15,751
(0.97 %)		 40,333
(3.49 %)		 n/a 41.72
(102.85 %)		 76
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 5,191,739
(59.75 %)		 765,480
(6.84 %)		 9,935,402
(42.21 %)		 116,467
(2.57 %)
239 goldspotted eel (2025)
GCA_975146105.1		 n/a 16,879
(1.43 %)		 38,748
(4.22 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 147
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,198,550
(33.91 %)		 741,217
(8.84 %)		 7,140,094
(39.50 %)		 136,266
(4.25 %)
240 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan 2019)
GCF_007399415.2		 57,455
(3.18 %)		 14,852
(1.00 %)		 18,125
(1.49 %)		 31,841
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,271
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
241 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan alternate hap 2019)
GCA_007399395.1		 n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 61,680
(2.32 %)
242 Goodes thornscrub tortoise (Sinaloan lineage primary hap 2019)
GCA_007399415.1		 n/a 14,852
(1.00 %)		 18,597
(1.55 %)		 31,974
(1.80 %)		 44.14
(98.71 %)		 562
(1.29 %)		 383
(100.00 %)		 1,630,268
(13.86 %)		 387,796
(2.00 %)		 11,572,827
(33.36 %)		 71,687
(2.29 %)
243 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 refseq)
GCF_029215685.1		 28,358
(2.73 %)		 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,792
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,127
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
244 gopher snake (HBS135680 primary hap 2023)
GCA_029215655.1		 n/a 13,289
(1.09 %)		 20,513
(2.09 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 603
(0.00 %)		 1,029
(100.00 %)		 1,325,747
(8.26 %)		 973,338
(7.56 %)		 8,352,703
(45.38 %)		 72,941
(2.59 %)
245 graceful crag lizard (Gifberg primary hap 2022)
GCF_027244095.1		 86,664
(4.30 %)		 14,269
(0.91 %)		 18,195
(1.57 %)		 n/a 44.82
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 1,644,976
(6.04 %)		 823,058
(3.00 %)		 11,991,046
(41.43 %)		 80,718
(1.90 %)
246 Grand Cayman blue iguana (hap1 2023)
GCA_030412105.1		 n/a 14,094
(1.03 %)		 17,875
(1.65 %)		 n/a 41.62
(99.95 %)		 28
(0.05 %)		 30
(100.00 %)		 1,100,228
(6.21 %)		 423,695
(1.33 %)		 11,521,828
(32.55 %)		 62,978
(2.00 %)
247 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 60,835
(1.92 %)
248 gray bichir
GCF_016835505.1		 48,165
(1.88 %)		 12,963
(0.44 %)		 24,479
(1.21 %)		 n/a 39.32
(99.96 %)		 3,166
(0.04 %)		 9,856
(100.00 %)		 1,765,862
(2.54 %)		 1,017,723
(2.38 %)		 20,924,763
(47.66 %)		 98,862
(1.64 %)
249 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 167
(5.51 %)
250 great white shark (primary hap 2021 genbank)
GCA_017639515.1		 n/a 13,511
(0.38 %)		 19,263
(0.92 %)		 n/a 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 7,178,936
(64.10 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,189
(52.42 %)		 77,057
(2.22 %)
251 great white shark (primary hap 2021 refseq)
GCF_017639515.1		 49,865
(1.46 %)		 13,010
(0.37 %)		 19,263
(0.92 %)		 46,152
(1.30 %)		 45.21
(99.55 %)		 2,645
(0.45 %)		 719
(100.00 %)		 1,046,023
(4.00 %)		 1,584,100
(21.25 %)		 23,278,563
(52.42 %)		 77,021
(1.94 %)
252 greater Saint Croix skink (242174 2026)
GCA_056884235.1		 n/a 13,823
(1.46 %)		 16,298
(2.20 %)		 n/a 43.52
(102.78 %)		 4,933,696
(0.36 %)		 49
(100.00 %)		 2,996,625
(25.96 %)		 369,536
(2.25 %)		 7,783,359
(32.72 %)		 18,675
(0.71 %)
253 green anole (JA03-04 2024)
GCF_035594765.1		 56,324
(5.85 %)		 14,020
(1.12 %)		 20,096
(1.86 %)		 n/a 40.60
(98.38 %)		 841
(1.62 %)		 211
(100.00 %)		 4,859,635
(53.14 %)		 909,429
(5.19 %)		 8,304,332
(44.07 %)		 56,404
(1.78 %)
254 green anole (v1 2011)
GCF_000090745.1		 38,109
(3.63 %)		 13,021
(1.08 %)		 20,780
(1.86 %)		 38,266
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,533
(5.44 %)		 41,987
(94.56 %)		 2,415,433
(28.92 %)		 702,538
(2.99 %)		 8,199,653
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
255 green anole (v2 2010)
GCF_000090745.2		 38,096
(3.63 %)		 13,140
(1.11 %)		 20,772
(1.86 %)		 38,229
(3.08 %)		 40.32
(94.57 %)		 35,530
(5.44 %)		 41,986
(94.56 %)		 4,455,733
(51.37 %)		 702,537
(2.99 %)		 8,199,580
(39.69 %)		 42,151
(1.18 %)
256 green sea turtle (primary hap 2021)
GCA_015237465.2		 n/a 15,016
(1.11 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 92
(100.00 %)		 3,631,238
(44.71 %)		 304,302
(1.25 %)		 11,135,013
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
257 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 45,469
(1.48 %)
258 green sea turtle (v2 primary hap 2021)
GCF_015237465.2		 84,353
(4.63 %)		 14,725
(1.06 %)		 17,444
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 298
(0.56 %)		 93
(100.00 %)		 1,701,640
(14.83 %)		 304,306
(1.25 %)		 11,135,147
(31.96 %)		 49,025
(1.44 %)
259 Greenland sleeper shark (GS21.2 2025 genbank)
GCA_052327205.1		 n/a 13,229
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 11,933
(0.09 %)		 4,461
(99.98 %)		 1,160,458
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,819
(75.59 %)		 668,934
(10.22 %)
260 Greenland sleeper shark (GS21.2 2025 refseq)
GCF_052327205.1		 60,259
(1.57 %)		 13,227
(0.25 %)		 29,200
(0.79 %)		 n/a 47.75
(99.91 %)		 11,933
(0.09 %)		 2,111
(100.00 %)		 1,160,455
(2.60 %)		 2,624,716
(21.03 %)		 16,338,792
(75.59 %)		 668,934
(10.22 %)
261 grey reef shark (hapA 2025)
GCF_965287045.1		 42,414
(2.31 %)		 13,005
(0.55 %)		 18,669
(1.27 %)		 n/a 43.98
(100.00 %)		 883
(0.00 %)		 1,521
(100.00 %)		 7,459,423
(58.87 %)		 658,213
(6.81 %)		 13,646,347
(46.40 %)		 36,259
(1.07 %)
262 grey reef shark (hapB 2025)
GCA_965295155.1		 n/a 12,988
(0.54 %)		 18,753
(1.27 %)		 n/a 44.00
(100.00 %)		 876
(0.00 %)		 2,410
(100.00 %)		 7,462,980
(58.92 %)		 660,217
(6.95 %)		 13,645,872
(46.47 %)		 36,662
(1.11 %)
263 hagfishes (Nan-Hai 2024)
GCA_041222605.1		 n/a 6,399
(0.33 %)		 35,228
(3.60 %)		 n/a 43.58
(101.45 %)		 2,308
(0.06 %)		 1,374
(100.00 %)		 1,393,396
(5.78 %)		 1,570,804
(12.54 %)		 7,379,144
(61.34 %)		 159,618
(13.48 %)
264 hawksbill sea turtle (B2_1 2023)
GCA_030012505.1		 n/a 14,897
(1.00 %)		 18,251
(1.51 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 1,315,164
(12.07 %)		 347,678
(3.60 %)		 10,892,216
(35.32 %)		 49,532
(1.65 %)
265 hawksbill sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152235.1		 n/a 14,710
(1.02 %)		 17,589
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 63
(100.00 %)		 1,289,035
(12.18 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,433
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
266 hawksbill sea turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965152235.1		 41,141
(2.68 %)		 14,805
(1.06 %)		 17,460
(1.51 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 131
(0.12 %)		 57
(100.00 %)		 4,249,522
(49.54 %)		 310,918
(1.75 %)		 10,994,437
(33.64 %)		 46,532
(1.40 %)
267 hawksbill sea turtle (hap2 2025)
GCA_965152285.1		 n/a 14,843
(1.02 %)		 18,006
(1.54 %)		 n/a 44.04
(99.88 %)		 132
(0.12 %)		 173
(99.88 %)		 1,288,292
(12.14 %)		 318,803
(2.15 %)		 11,148,397
(34.07 %)		 46,922
(1.41 %)
268 hellbender (hap1 2026)
GCA_060551615.1		 n/a 16,634
(0.04 %)		 215,099
(0.73 %)		 n/a 49.06
(101.33 %)		 24,119
(0.00 %)		 15,812
(100.00 %)		 42,614,233
(21.00 %)		 82,063,457
(21.73 %)		 159,296,257
(65.08 %)		 2,185,612
(3.11 %)
269 hickatee (hap1 2025)
GCA_054099655.1		 n/a 14,920
(1.21 %)		 18,649
(1.75 %)		 n/a 43.67
(100.00 %)		 132
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 3,220,305
(41.80 %)		 325,597
(8.20 %)		 9,635,325
(31.95 %)		 49,601
(1.77 %)
270 hickatee (hap2 2025)
GCA_054099715.1		 n/a 14,893
(1.22 %)		 18,699
(1.80 %)		 n/a 43.79
(100.00 %)		 137
(0.00 %)		 162
(100.00 %)		 3,212,991
(39.89 %)		 328,796
(6.89 %)		 9,501,793
(30.78 %)		 49,575
(1.79 %)
271 High Himalaya frog
GCF_000935625.1		 26,122
(1.87 %)		 13,695
(0.94 %)		 28,085
(2.39 %)		 n/a 42.55
(96.32 %)		 122,325
(3.70 %)		 147,513
(96.30 %)		 536,058
(1.39 %)		 794,563
(5.48 %)		 11,465,450
(37.44 %)		 219,772
(3.92 %)
272 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 89,340
(2.10 %)
273 horn shark (hap2 2024)
GCA_036365495.1		 n/a 12,766
(0.30 %)		 21,591
(0.87 %)		 n/a 44.88
(99.43 %)		 2,790
(0.57 %)		 1,496
(100.00 %)		 1,008,880
(5.19 %)		 1,596,129
(22.32 %)		 22,180,341
(62.98 %)		 82,276
(1.85 %)
274 horn shark (sHetFra1hap1 2024)
GCF_036365525.1		 60,844
(1.44 %)		 15,004
(0.28 %)		 22,510
(0.76 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,306
(100.00 %)		 1,344,541
(5.76 %)		 2,364,824
(28.34 %)		 20,630,058
(68.85 %)		 89,340
(2.10 %)
275 horseshoe snake (2026)
GCA_985781035.1		 n/a 13,810
(1.08 %)		 20,659
(1.97 %)		 n/a 41.18
(102.81 %)		 19
(0.00 %)		 56
(100.00 %)		 5,766,580
(57.35 %)		 1,131,744
(6.79 %)		 8,821,737
(46.23 %)		 122,065
(3.68 %)
276 hourglass treefrog (maternal 2023 genbank)
GCA_027789725.1		 n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 244,270
(5.02 %)
277 hourglass treefrog (paternal 2023 refseq)
GCF_027789765.1		 50,542
(2.91 %)		 14,058
(0.89 %)		 30,599
(2.64 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
278 Hubei keelback (MD-2024a 2024)
GCA_039707465.1		 n/a 13,612
(1.02 %)		 20,507
(1.76 %)		 n/a 42.16
(102.76 %)		 344
(0.00 %)		 405
(100.00 %)		 6,075,226
(57.03 %)		 1,343,329
(9.69 %)		 8,377,822
(51.25 %)		 186,520
(6.03 %)
279 Hungarian meadow viper (primary hap 2022)
GCF_947247035.1		 36,135
(3.46 %)		 13,432
(1.20 %)		 18,654
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 3,633,666
(50.97 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,427,621
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
280 Iberian parsley frog (primary hap 2024)
GCA_036172795.1		 n/a 14,141
(0.97 %)		 22,232
(2.16 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 944,742
(4.86 %)		 1,927,659
(22.26 %)		 8,988,510
(49.29 %)		 77,721
(1.73 %)
281 Iberian ribbed newt (20211129_DDA 2022 genbank)
GCA_026652325.1		 n/a 15,136
(0.10 %)		 n/a n/a 45.95
(100.00 %)		 922
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 4,478,794
(1.33 %)		 6,452,537
(8.86 %)		 81,311,590
(56.46 %)		 1,581,360
(4.00 %)
282 Iberian ribbed newt (hap1 20211129_DDA 2024 refseq)
GCF_031143425.1		 57,032
(0.47 %)		 15,184
(0.10 %)		 72,314
(0.62 %)		 n/a 45.93
(100.00 %)		 1,829
(0.00 %)		 616
(100.00 %)		 4,343,624
(1.32 %)		 6,295,886
(8.29 %)		 2,445
(100.00 %)		 1,546,882
(4.02 %)
283 Ibiza wall lizard (hap1.3 2026 genbank)
GCA_964106645.3		 n/a 14,358
(1.39 %)		 20,037
(2.30 %)		 n/a 43.97
(99.98 %)		 1,505
(0.02 %)		 305
(100.00 %)		 4,977,258
(51.04 %)		 473,070
(2.71 %)		 7,060,127
(38.23 %)		 96,567
(3.15 %)
284 Ibiza wall lizard (hap1.3 2026 refseq)
GCF_964106645.2		 68,228
(5.99 %)		 14,361
(1.39 %)		 20,038
(2.30 %)		 n/a 43.95
(101.31 %)		 1,505
(0.02 %)		 305
(100.00 %)		 4,780,857
(50.99 %)		 473,079
(2.71 %)		 7,060,124
(38.23 %)		 96,567
(3.15 %)
285 Ibiza wall lizard (hap2.3 2026)
GCA_964106635.3		 n/a 13,838
(1.44 %)		 19,052
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,541
(99.98 %)		 4,712,744
(49.63 %)		 440,320
(2.30 %)		 6,773,549
(37.14 %)		 89,220
(3.03 %)
286 Indian cobra (NN01 2019)
GCA_009733165.1		 n/a 13,028
(1.10 %)		 17,854
(1.73 %)		 n/a 40.46
(93.80 %)		 11,910
(6.20 %)		 1,897
(100.00 %)		 1,114,498
(5.61 %)		 671,854
(2.20 %)		 8,205,261
(40.40 %)		 47,381
(1.37 %)
287 Indian roofed turtle (hap1 2024)
GCA_045781095.1		 n/a 14,623
(1.04 %)		 18,405
(1.58 %)		 n/a 44.24
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 629
(100.00 %)		 1,283,544
(11.43 %)		 298,912
(1.85 %)		 10,728,482
(32.52 %)		 72,908
(2.13 %)
288 Indian roofed turtle (hap2 2024)
GCA_045781085.1		 n/a 14,682
(1.03 %)		 18,600
(1.58 %)		 n/a 44.26
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 449
(100.00 %)		 1,290,818
(11.46 %)		 301,464
(1.79 %)		 10,704,595
(32.71 %)		 74,354
(2.05 %)
289 Indian short-finned eel (HC-2024 2024)
GCA_039654925.2		 n/a 17,289
(2.02 %)		 35,147
(5.16 %)		 n/a 43.49
(102.77 %)		 375
(0.00 %)		 30
(100.00 %)		 2,208,920
(36.76 %)		 851,437
(12.74 %)		 5,658,115
(32.66 %)		 127,654
(7.35 %)
290 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 76,879
(3.71 %)
291 Indo-Pacific tarpon (primary hap 2020)
GCA_013368585.1		 n/a 18,305
(2.47 %)		 29,764
(5.45 %)		 n/a 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,530
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,961
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
292 inshore hagfish (2023)
GCA_900186335.3		 n/a 6,137
(0.40 %)		 23,364
(2.60 %)		 n/a 46.68
(54.88 %)		 332,729
(45.17 %)		 342,008
(54.83 %)		 1,099,633
(8.08 %)		 1,181,678
(6.90 %)		 7,860,245
(28.44 %)		 142,778
(3.95 %)
293 inshore hagfish (2026)
GCF_056783735.1		 69,177
(4.47 %)		 6,275
(0.30 %)		 31,017
(2.64 %)		 n/a 42.67
(99.92 %)		 3,288
(0.08 %)		 3,194
(100.00 %)		 1,279,433
(8.97 %)		 1,549,601
(15.25 %)		 8,247,316
(62.71 %)		 168,414
(11.99 %)
294 Italian stream frog (hap2 2026)
GCA_982398585.1		 n/a 13,531
(0.37 %)		 44,922
(1.67 %)		 n/a 44.49
(102.90 %)		 2,720
(0.01 %)		 297
(100.00 %)		 15,262,263
(79.04 %)		 3,729,151
(11.10 %)		 21,506,534
(59.26 %)		 764,694
(7.41 %)
295 Italian wall lizard (hap1.1 2024)
GCA_964188175.1		 n/a 14,241
(1.31 %)		 20,399
(2.26 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 762
(0.01 %)		 296
(100.00 %)		 832,389
(5.27 %)		 530,449
(8.28 %)		 6,937,083
(40.38 %)		 106,667
(3.79 %)
296 Italian wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 98,815
(3.65 %)
297 Japanese eel (BU-2020EF 2022)
GCA_025169545.1		 n/a 17,160
(2.12 %)		 34,420
(5.19 %)		 n/a 43.64
(99.43 %)		 725
(0.57 %)		 86
(100.00 %)		 902,705
(5.61 %)		 903,851
(8.80 %)		 5,865,906
(28.58 %)		 131,092
(7.95 %)
298 Japanese sawshark (hap1 2024 refseq)
GCF_044704955.1		 54,879
(1.24 %)		 12,978
(0.27 %)		 30,195
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,318
(100.00 %)		 11,412,024
(71.47 %)		 2,399,500
(18.16 %)		 20,051,385
(71.80 %)		 503,637
(6.56 %)
299 Japanese sawshark (hap2 2024)
GCA_044704965.1		 n/a 14,833
(0.26 %)		 30,853
(0.75 %)		 n/a 47.12
(99.98 %)		 5,953
(0.02 %)		 5,626
(100.00 %)		 1,238,549
(4.06 %)		 2,718,867
(21.85 %)		 20,608,860
(73.38 %)		 518,286
(6.88 %)
300 Kaup's arrowtooth eel (Taiwan WJC10195 2023)
GCA_029718625.1		 n/a 17,009
(1.43 %)		 41,545
(4.43 %)		 n/a 42.36
(102.64 %)		 5,609
(0.18 %)		 243
(100.00 %)		 3,406,521
(51.53 %)		 928,113
(11.03 %)		 5,886,107
(43.47 %)		 122,516
(4.25 %)
301 Kemp's ridley sea turtle (hap1 2025)
GCF_965140285.1		 65,480
(3.90 %)		 14,975
(1.06 %)		 17,809
(1.52 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 4,215,923
(50.05 %)		 326,849
(2.26 %)		 10,620,784
(34.46 %)		 46,936
(1.44 %)
302 Kenyan clawed frog (NASCO 2022)
GCA_024363595.1		 n/a 21,451
(1.69 %)		 23,652
(2.05 %)		 n/a 38.65
(79.93 %)		 233,029
(20.10 %)		 23,435
(100.00 %)		 5,285,530
(44.53 %)		 579,815
(1.62 %)		 12,925,637
(32.47 %)		 63,201
(0.69 %)
303 Komodo dragon (SLA01 2019)
GCF_004798865.1		 43,331
(4.33 %)		 13,543
(1.31 %)		 18,081
(2.11 %)		 n/a 44.04
(99.03 %)		 19,737
(0.97 %)		 1,411
(100.00 %)		 753,603
(4.91 %)		 263,965
(1.41 %)		 8,061,012
(24.65 %)		 49,808
(4.28 %)
304 Korean lamprey (ZD-2024d 2026)
GCA_056783725.1		 n/a 7,334
(0.75 %)		 33,856
(4.34 %)		 n/a 48.81
(101.62 %)		 632
(0.03 %)		 680
(99.99 %)		 3,803,524
(63.85 %)		 1,115,995
(17.45 %)		 4,790,086
(48.43 %)		 149,190
(42.84 %)
305 Kotschy's gecko (rMedKot1.hap1.1 2025)
GCA_965636955.1		 n/a 14,062
(1.16 %)		 19,832
(2.04 %)		 n/a 44.04
(102.80 %)		 96
(0.00 %)		 78
(100.00 %)		 5,404,758
(42.68 %)		 501,007
(3.72 %)		 9,126,850
(39.28 %)		 75,312
(2.56 %)
306 Kroombit tinker frog (2023)
GCF_031769625.1		 52,522
(1.28 %)		 14,291
(0.36 %)		 35,801
(1.15 %)		 n/a 43.56
(101.51 %)		 n/a 4,085
(100.00 %)		 11,988,581
(47.05 %)		 3,652,481
(26.73 %)		 20,577,888
(61.27 %)		 536,150
(4.98 %)
307 lampreys (CW_2021.1 2026)
GCA_062014791.1		 n/a 7,930
(0.63 %)		 38,610
(4.04 %)		 n/a 48.67
(101.20 %)		 1,293
(0.04 %)		 728
(100.00 %)		 4,241,920
(65.68 %)		 1,439,770
(31.13 %)		 5,270,445
(55.42 %)		 190,019
(33.55 %)
308 lampreys (kcIchGage1.somhap2 2026)
GCA_062039095.1		 n/a 7,696
(0.62 %)		 37,759
(3.92 %)		 n/a 48.19
(101.10 %)		 740
(0.01 %)		 792
(100.00 %)		 4,020,399
(64.74 %)		 1,166,767
(23.89 %)		 5,113,041
(54.85 %)		 197,657
(34.12 %)
309 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 104,556
(4.39 %)
310 Lataste's viper (primary hap 2022)
GCA_024294585.1		 n/a 13,350
(1.17 %)		 18,904
(1.93 %)		 n/a 40.96
(99.78 %)		 769
(0.22 %)		 56
(100.00 %)		 1,209,793
(7.69 %)		 762,735
(5.06 %)		 7,424,674
(44.80 %)		 110,631
(4.07 %)
311 leatherback sea turtle (primary hap 2021)
GCA_009764565.4		 n/a 14,844
(1.08 %)		 16,357
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 41
(100.00 %)		 4,070,850
(47.24 %)		 304,774
(1.14 %)		 11,121,781
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
312 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 25,133
(1.42 %)
313 leatherback sea turtle (v4 primary hap 2021 refseq)
GCF_009764565.3		 73,318
(3.97 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,358
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 668
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,694,449
(14.90 %)		 304,773
(1.14 %)		 11,121,962
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
314 Leishan spiny toad (GZLS1 2019)
GCA_009667805.1		 n/a 14,385
(0.55 %)		 44,355
(2.02 %)		 n/a 43.74
(99.99 %)		 3,282
(0.01 %)		 5,302
(100.00 %)		 1,177,889
(2.23 %)		 2,229,424
(11.42 %)		 13,846,381
(60.05 %)		 527,079
(7.98 %)
315 leopard gecko (TG4126 2023 genbank)
GCA_028583425.1		 n/a 14,382
(0.95 %)		 23,083
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 61
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 5,522,949
(40.69 %)		 557,242
(2.88 %)		 11,096,121
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
316 leopard gecko (TG4126 2023 refseq)
GCF_028583425.1		 37,133
(2.89 %)		 14,358
(0.93 %)		 23,080
(1.92 %)		 n/a 44.06
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 969,188
(4.21 %)		 557,245
(2.88 %)		 11,096,222
(37.91 %)		 82,956
(2.56 %)
317 lesser devil ray (2024)
GCF_963921235.1		 49,601
(2.40 %)		 12,335
(0.44 %)		 22,690
(1.20 %)		 n/a 42.91
(100.00 %)		 697
(0.00 %)		 200
(100.00 %)		 7,453,775
(54.11 %)		 677,453
(5.15 %)		 18,943,414
(51.98 %)		 87,750
(1.43 %)
318 Lilford's wall lizard (2023)
GCA_947686815.1		 n/a 14,239
(1.41 %)		 19,740
(2.33 %)		 n/a 43.80
(99.98 %)		 2,346
(0.02 %)		 2,149
(100.00 %)		 830,790
(4.33 %)		 445,450
(2.12 %)		 7,171,057
(36.69 %)		 86,200
(2.56 %)
319 little skate (New England 2023)
GCF_028641065.1		 40,021
(3.35 %)		 11,836
(0.67 %)		 25,770
(1.80 %)		 n/a 44.13
(100.00 %)		 862
(0.00 %)		 1,769
(100.00 %)		 8,221,960
(66.45 %)		 1,044,111
(3.71 %)		 10,050,264
(53.79 %)		 205,567
(4.36 %)
320 Little striped whiptail (17121 2025)
GCA_053572275.1		 n/a 13,808
(1.33 %)		 17,983
(2.11 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 85,668
(1.09 %)		 4,989
(99.96 %)		 3,985,129
(46.12 %)		 402,709
(1.61 %)		 8,404,161
(34.23 %)		 43,932
(1.71 %)
321 lizards A.caudivolvulus (BBC_2024a 2024)
GCA_042257475.1		 n/a 14,035
(1.20 %)		 20,075
(2.10 %)		 n/a 44.31
(102.81 %)		 242
(0.01 %)		 37
(100.00 %)		 6,035,811
(44.39 %)		 378,348
(1.69 %)		 9,312,530
(34.07 %)		 53,546
(1.83 %)
322 lizards A.duperreyi (Individual 364 2024)
GCA_041722995.2		 n/a 13,993
(1.31 %)		 18,535
(2.29 %)		 n/a 43.09
(102.83 %)		 54
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,211,562
(22.22 %)		 918,266
(8.47 %)		 7,114,608
(40.56 %)		 31,372
(1.03 %)
323 lizards A.tigris stejnegeri (HBS 135688 alternate hap 2025)
GCA_023333555.2		 n/a 11,547
(1.21 %)		 15,609
(1.97 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 42
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 3,683,979
(51.31 %)		 480,268
(5.67 %)		 7,021,351
(38.84 %)		 45,241
(2.12 %)
324 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap1 2025)
GCA_047715975.1		 n/a 13,605
(0.80 %)		 18,928
(1.32 %)		 n/a 44.97
(100.00 %)		 109
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,038,607
(4.70 %)		 891,233
(5.94 %)		 9,004,935
(56.47 %)		 245,845
(10.83 %)
325 lizards B.pumilum (Western Cape Province hap2 2025)
GCA_047715955.1		 n/a 13,631
(0.79 %)		 18,935
(1.32 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 1,037,146
(4.72 %)		 933,676
(6.26 %)		 9,009,528
(56.65 %)		 246,553
(10.79 %)
326 lizards B.pumilum (Western Cape Province JTBG20231 2024)
GCA_035047305.1		 n/a 13,670
(0.79 %)		 19,028
(1.31 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 1,040,467
(4.86 %)		 924,221
(6.37 %)		 9,015,048
(56.81 %)		 248,142
(10.84 %)
327 lizards C.egeriae (BTS541 2025)
GCA_030015325.2		 n/a 14,357
(1.44 %)		 17,539
(2.36 %)		 n/a 42.46
(102.83 %)		 12
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 3,025,600
(21.43 %)		 882,793
(4.91 %)		 7,177,884
(37.94 %)		 22,105
(0.71 %)
328 lizards C.ocellatus (2025)
GCA_965280105.1		 n/a 13,906
(1.36 %)		 17,878
(2.32 %)		 n/a 43.37
(102.82 %)		 40
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 3,328,556
(24.09 %)		 978,523
(6.21 %)		 6,722,563
(41.08 %)		 34,603
(1.26 %)
329 lizards C.pulcher (TD-2025a 2026)
GCA_055504975.1		 n/a 13,916
(1.37 %)		 18,194
(2.48 %)		 n/a 43.08
(102.81 %)		 44
(0.00 %)		 17
(100.00 %)		 3,176,241
(22.09 %)		 998,069
(8.03 %)		 6,892,287
(39.55 %)		 50,357
(2.32 %)
330 lizards C.scabrum (Arizona 2026)
GCA_054791115.1		 n/a 16,039
(1.17 %)		 23,296
(2.10 %)		 n/a 43.45
(102.81 %)		 157
(0.00 %)		 178
(100.00 %)		 5,723,743
(41.09 %)		 611,286
(2.86 %)		 10,656,963
(36.29 %)		 67,085
(2.26 %)
331 lizards D.cf. smithi (hap1 2024)
GCA_046126795.1		 n/a 14,308
(0.91 %)		 19,761
(1.58 %)		 n/a 45.95
(100.00 %)		 274
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 1,376,454
(8.31 %)		 744,560
(3.94 %)		 11,383,198
(44.04 %)		 208,005
(7.18 %)
332 lizards D.cf. smithi (hap2 2024)
GCA_046126825.1		 n/a 12,359
(0.99 %)		 16,644
(1.66 %)		 n/a 45.69
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 1,109,222
(8.21 %)		 607,835
(4.09 %)		 9,080,052
(42.56 %)		 158,727
(6.84 %)
333 lizards D.maculatus (Xishuangbanna Tropical Botanical Garden IS-2026a 2026)
GCA_056783515.1		 n/a 13,699
(1.14 %)		 20,557
(2.09 %)		 n/a 44.07
(102.85 %)		 948
(0.01 %)		 43
(100.00 %)		 5,027,683
(38.92 %)		 1,150,847
(6.84 %)		 8,064,452
(43.25 %)		 106,179
(4.57 %)
334 lizards E.multicarinata webbii (San Diego HBS135686 alternate hap 2024)
GCA_023053675.2		 n/a 14,236
(1.17 %)		 19,573
(1.94 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 28
(0.00 %)		 655
(100.00 %)		 6,106,640
(52.43 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,804
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
335 lizards F.pardalis (Fpa_1 2023)
GCA_030440675.1		 n/a 13,625
(1.22 %)		 18,049
(1.96 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 833,693
(2.81 %)		 607,040
(2.82 %)		 7,939,139
(42.05 %)		 52,987
(2.59 %)
336 lizards G.kuhli (2025)
GCA_051903775.2		 n/a 15,226
(0.93 %)		 23,917
(1.83 %)		 n/a 45.79
(102.91 %)		 823
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 6,877,522
(55.62 %)		 726,688
(3.63 %)		 12,103,227
(41.72 %)		 159,475
(3.97 %)
337 lizards L.agilis (primary hap 2019)
GCA_009819535.1		 n/a 14,350
(1.48 %)		 19,235
(2.45 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,417
(1.76 %)		 7,135,058
(34.49 %)		 76,055
(2.68 %)
338 lizards P.bocagei (hap1.1 2024)
GCA_964188305.1		 n/a 14,091
(1.26 %)		 20,552
(2.20 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,005
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 932,842
(5.02 %)		 555,337
(4.34 %)		 6,595,536
(41.39 %)		 119,467
(4.32 %)
339 lizards P.bocagei (hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 103,858
(4.10 %)
340 lizards P.erhardii (hap1.1 2024)
GCA_964252035.1		 n/a 13,858
(1.33 %)		 19,727
(2.31 %)		 n/a 43.80
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 326
(100.00 %)		 885,596
(4.43 %)		 527,127
(3.30 %)		 7,008,185
(38.56 %)		 89,737
(2.87 %)
341 lizards P.erhardii (hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 89,526
(2.96 %)
342 lizards P.guinanensis (GN01 2024)
GCA_037367245.1		 n/a 13,693
(1.11 %)		 18,704
(1.91 %)		 n/a 43.39
(102.83 %)		 1,220
(0.03 %)		 50
(100.00 %)		 4,912,309
(51.84 %)		 905,311
(3.40 %)		 8,543,101
(40.94 %)		 96,277
(3.47 %)
343 lizards P.melisellensis (hap1.1 2024)
GCA_964234715.1		 n/a 14,289
(1.31 %)		 20,112
(2.23 %)		 n/a 44.03
(99.99 %)		 823
(0.01 %)		 387
(100.00 %)		 830,352
(7.87 %)		 552,452
(8.32 %)		 6,838,068
(40.20 %)		 90,074
(2.82 %)
344 lizards P.melisellensis (hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 82,575
(2.83 %)
345 lizards P.pityusensis (hap1.2 2024 genbank)
GCA_964106645.2		 n/a 14,314
(1.36 %)		 20,522
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 858,648
(4.22 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,061,380
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
346 lizards P.pityusensis (hap1.2 2024 refseq)
GCF_964106645.1		 68,289
(5.99 %)		 14,362
(1.39 %)		 20,488
(2.35 %)		 n/a 43.98
(99.98 %)		 1,506
(0.02 %)		 336
(100.00 %)		 4,977,407
(51.01 %)		 473,134
(2.71 %)		 7,060,761
(38.21 %)		 96,600
(3.21 %)
347 lizards P.pityusensis (hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 89,229
(3.04 %)
348 lizards P.tiliguerta (hap2.2 2025)
GCA_965153305.2		 n/a 13,808
(1.46 %)		 19,314
(2.39 %)		 n/a 44.01
(99.99 %)		 1,003
(0.01 %)		 307
(100.00 %)		 4,685,494
(49.03 %)		 429,388
(4.28 %)		 6,635,321
(36.92 %)		 92,746
(3.04 %)
349 lizards P.vaucheri (hap1.1 2025)
GCA_965113315.1		 n/a 14,329
(1.28 %)		 20,152
(2.19 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 949
(0.01 %)		 285
(100.00 %)		 893,567
(5.89 %)		 524,077
(6.62 %)		 7,052,308
(41.37 %)		 109,507
(3.61 %)
350 lizards P.vaucheri (hap2.1 2025)
GCA_965113305.1		 n/a 13,794
(1.32 %)		 19,189
(2.22 %)		 n/a 44.16
(99.99 %)		 852
(0.01 %)		 151
(100.00 %)		 841,282
(5.59 %)		 483,392
(6.01 %)		 6,750,191
(40.39 %)		 101,153
(3.51 %)
351 lizards S.anegadae (242060 2026)
GCA_056883415.1		 n/a 13,822
(1.45 %)		 16,223
(2.21 %)		 n/a 43.52
(102.83 %)		 3,908,285
(0.29 %)		 24
(100.00 %)		 2,999,489
(25.96 %)		 371,944
(2.28 %)		 7,705,335
(32.99 %)		 18,492
(0.71 %)
352 lizards S.caicosae (RGR3006 2026)
GCA_056883335.1		 n/a 13,828
(1.45 %)		 16,361
(2.21 %)		 n/a 43.53
(102.89 %)		 3,397,230
(0.25 %)		 38
(100.00 %)		 3,001,718
(25.98 %)		 369,599
(2.27 %)		 7,624,601
(33.19 %)		 18,972
(0.72 %)
353 lizards S.culebrae (Spon5 2026)
GCA_056883235.1		 n/a 13,862
(1.46 %)		 16,356
(2.22 %)		 n/a 43.53
(102.89 %)		 2,704,449
(0.20 %)		 32
(100.00 %)		 3,000,211
(25.96 %)		 368,625
(2.27 %)		 7,560,908
(33.32 %)		 19,199
(0.73 %)
354 lizards S.fulgidus (SBH267958 2026)
GCA_056884295.1		 n/a 13,814
(1.46 %)		 16,160
(2.17 %)		 n/a 43.58
(102.82 %)		 9,489,911
(0.71 %)		 22
(100.00 %)		 3,015,936
(26.19 %)		 355,047
(2.23 %)		 8,218,837
(32.07 %)		 18,166
(0.69 %)
355 lizards S.macleani (USNM576303 2026)
GCA_056884245.1		 n/a 13,863
(1.45 %)		 16,450
(2.22 %)		 n/a 43.53
(102.81 %)		 2,726,656
(0.20 %)		 21
(100.00 %)		 2,997,435
(25.95 %)		 367,687
(2.26 %)		 7,577,106
(33.31 %)		 19,150
(0.73 %)
356 lizards S.monitae (USNM576301 2026)
GCA_056884155.1		 n/a 13,830
(1.45 %)		 16,551
(2.25 %)		 n/a 43.55
(102.85 %)		 1,679,513
(0.13 %)		 52
(100.00 %)		 3,006,793
(26.00 %)		 373,331
(2.28 %)		 7,325,410
(33.35 %)		 19,537
(0.74 %)
357 lizards S.nitidus (UPRMR694 2026)
GCA_056883755.1		 n/a 13,885
(1.45 %)		 16,474
(2.23 %)		 n/a 43.54
(102.85 %)		 1,431,826
(0.11 %)		 29
(100.00 %)		 3,014,447
(26.02 %)		 384,585
(2.32 %)		 7,188,576
(33.51 %)		 19,448
(0.74 %)
358 lizards S.powelli (SBH274774 2026)
GCA_056883725.1		 n/a 13,814
(1.45 %)		 15,958
(2.17 %)		 n/a 43.52
(102.82 %)		 6,868,127
(0.52 %)		 27
(100.00 %)		 3,000,984
(26.04 %)		 356,904
(2.23 %)		 8,154,782
(32.57 %)		 17,689
(0.68 %)
359 lizards S.semitaeniatus (SBH269171 2026)
GCA_056883555.1		 n/a 13,836
(1.46 %)		 16,388
(2.21 %)		 n/a 43.53
(102.87 %)		 5,667,557
(0.42 %)		 32
(100.00 %)		 2,990,526
(25.93 %)		 366,151
(2.25 %)		 7,825,909
(32.45 %)		 18,695
(0.71 %)
360 lizards S.sloanii (USNM576305 2026)
GCA_056883505.1		 n/a 13,861
(1.46 %)		 16,550
(2.22 %)		 n/a 43.53
(102.81 %)		 3,572,634
(0.26 %)		 47
(100.00 %)		 2,996,789
(25.95 %)		 366,222
(2.26 %)		 7,686,824
(33.07 %)		 18,944
(0.72 %)
361 lizards T.roborowskii (PY-2025 2025)
GCA_051473905.1		 n/a 14,461
(1.02 %)		 19,850
(1.79 %)		 n/a 43.85
(102.77 %)		 14
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 5,506,953
(43.20 %)		 458,896
(4.12 %)		 9,985,831
(38.55 %)		 76,938
(2.97 %)
362 lizards T.scincoides (hap2 2024)
GCF_035046505.1		 33,280
(3.42 %)		 13,266
(1.21 %)		 16,752
(1.98 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 782,672
(6.46 %)		 434,795
(2.20 %)		 7,788,697
(37.04 %)		 28,089
(0.98 %)
363 lizards U.stansburiana (SF-2025a 2026)
GCA_055773955.1		 n/a 14,031
(0.99 %)		 15,603
(1.54 %)		 n/a 41.25
(102.77 %)		 113
(0.00 %)		 110
(100.00 %)		 6,580,975
(50.71 %)		 842,566
(4.40 %)		 11,890,298
(39.19 %)		 30,589
(0.83 %)
364 lizards V.acanthurus (MtIsa-1 2025)
GCA_050042745.1		 n/a 13,908
(1.33 %)		 19,791
(2.11 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 3,351
(0.06 %)		 2,663
(100.00 %)		 2,968,776
(37.59 %)		 315,525
(1.53 %)		 7,756,715
(26.02 %)		 60,310
(5.28 %)
365 lizards X.vigilis (SCLL12 2025)
GCA_051940855.1		 n/a 14,878
(0.92 %)		 21,870
(1.72 %)		 n/a 45.87
(102.81 %)		 112
(0.00 %)		 133
(100.00 %)		 4,316,202
(28.34 %)		 599,589
(4.12 %)		 10,853,468
(41.85 %)		 237,398
(6.23 %)
366 loggerhead turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965140235.1		 n/a 14,764
(1.02 %)		 17,699
(1.53 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
367 loggerhead turtle (hap1 2025 refseq)
GCF_965140235.1		 65,475
(4.14 %)		 14,764
(1.02 %)		 17,658
(1.52 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 61
(0.03 %)		 97
(99.97 %)		 1,308,886
(12.45 %)		 334,985
(1.41 %)		 10,765,956
(34.66 %)		 54,290
(1.49 %)
368 loggerhead turtle (hap2 2025)
GCA_965140275.1		 n/a 14,889
(1.04 %)		 17,867
(1.54 %)		 n/a 44.11
(99.97 %)		 52
(0.03 %)		 85
(99.97 %)		 1,300,553
(12.44 %)		 332,623
(1.45 %)		 10,721,628
(34.40 %)		 53,746
(1.50 %)
369 loggerhead turtle (v1 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.1		 61,644
(3.99 %)		 14,678
(1.05 %)		 17,405
(1.52 %)		 42,180
(2.89 %)		 44.04
(99.90 %)		 745
(0.10 %)		 2,008
(100.00 %)		 1,279,721
(12.58 %)		 319,729
(1.29 %)		 10,705,612
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
370 loggerhead turtle (v2 SJ_126:Eziel1 2022)
GCF_023653815.2		 61,631
(3.99 %)		 14,676
(1.05 %)		 17,408
(1.52 %)		 n/a 44.04
(99.90 %)		 744
(0.10 %)		 2,007
(100.00 %)		 1,254,882
(12.49 %)		 319,728
(1.29 %)		 10,705,331
(33.91 %)		 49,015
(1.39 %)
371 longcomb sawfish (2026)
GCA_988281235.1		 n/a 12,441
(0.65 %)		 19,960
(1.52 %)		 n/a 42.60
(102.73 %)		 759
(0.01 %)		 1,116
(99.99 %)		 5,006,729
(55.79 %)		 451,782
(4.42 %)		 11,722,101
(40.90 %)		 57,705
(1.86 %)
372 Madagascar ground gecko (Pp20150507F 2025)
GCF_049243985.1		 63,376
(4.98 %)		 14,114
(1.20 %)		 21,281
(2.04 %)		 n/a 44.75
(98.94 %)		 2,618
(1.06 %)		 80
(100.00 %)		 4,103,102
(50.19 %)		 494,624
(8.01 %)		 8,310,560
(39.86 %)		 87,981
(3.16 %)
373 mainland tiger snake
GCF_900518725.1		 34,251
(3.18 %)		 13,445
(1.15 %)		 23,410
(1.90 %)		 n/a 39.72
(95.17 %)		 79,478
(4.84 %)		 52,414
(100.00 %)		 1,081,503
(6.00 %)		 711,408
(2.47 %)		 8,047,065
(40.24 %)		 61,669
(2.47 %)
374 mainland tiger snake (Mainland UNSWTSFEM 2025)
GCF_049901735.1		 52,308
(4.37 %)		 13,182
(1.25 %)		 17,251
(1.86 %)		 n/a 39.76
(102.78 %)		 945
(0.01 %)		 202
(100.00 %)		 3,116,177
(48.63 %)		 765,875
(3.85 %)		 7,724,269
(42.60 %)		 64,355
(2.76 %)
375 Mandarin rat snake (2026)
GCA_057127995.1		 n/a 13,412
(1.19 %)		 20,181
(2.17 %)		 n/a 40.73
(102.83 %)		 34
(0.00 %)		 56
(100.00 %)		 5,191,102
(54.62 %)		 940,018
(5.78 %)		 8,120,107
(43.33 %)		 78,072
(2.70 %)
376 many-banded krait (BM01 2022)
GCA_023653725.1		 n/a 13,269
(1.19 %)		 18,533
(1.94 %)		 n/a 39.87
(99.25 %)		 1,631
(0.75 %)		 448
(100.00 %)		 1,104,569
(6.42 %)		 703,174
(3.07 %)		 8,451,422
(40.97 %)		 65,260
(2.74 %)
377 map turtle (NorthernMapTurtle01 primary hap 2025)
GCA_037349215.2		 n/a 15,014
(1.06 %)		 19,134
(1.62 %)		 n/a 44.42
(102.65 %)		 301
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 4,089,455
(44.48 %)		 392,176
(1.59 %)		 11,172,869
(33.37 %)		 111,339
(2.54 %)
378 marbled electric ray (2025)
GCA_977017645.1		 n/a 12,155
(0.24 %)		 25,844
(0.70 %)		 n/a 43.83
(99.99 %)		 3,402
(0.01 %)		 4,566
(100.00 %)		 10,762,422
(61.06 %)		 1,754,113
(25.79 %)		 13,259,628
(78.62 %)		 445,127
(7.22 %)
379 marbled whiptail (SIMRID8450 2020)
GCA_014337955.1		 n/a 13,646
(1.27 %)		 18,378
(2.09 %)		 n/a 42.67
(94.37 %)		 166,840
(5.67 %)		 3,826
(100.00 %)		 809,278
(4.31 %)		 439,020
(1.66 %)		 8,665,254
(33.02 %)		 41,638
(1.70 %)
380 marine toad (2024)
GCA_900303285.2		 n/a 14,493
(0.58 %)		 34,827
(1.87 %)		 n/a 43.75
(99.75 %)		 6,072
(0.25 %)		 13,196
(99.75 %)		 7,310,953
(73.85 %)		 2,117,104
(17.81 %)		 13,354,560
(61.28 %)		 255,756
(3.08 %)
381 massasauga (EasternMassasaugaR01 primary hap 2024)
GCA_039880765.1		 n/a 13,166
(1.23 %)		 18,329
(1.95 %)		 n/a 39.94
(102.85 %)		 1,293
(0.02 %)		 265
(100.00 %)		 3,986,798
(54.49 %)		 722,734
(4.93 %)		 7,463,203
(42.71 %)		 52,744
(1.90 %)
382 McCord's box turtle (ISIS_951048 2018)
GCA_003846335.1		 n/a 16,317
(1.05 %)		 26,320
(1.64 %)		 n/a 44.69
(94.58 %)		 50,040
(5.43 %)		 141,912
(94.57 %)		 4,185,106
(47.48 %)		 331,791
(1.03 %)		 11,180,962
(31.97 %)		 126,459
(3.07 %)
383 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 73,632
(3.80 %)
384 meadow viper (primary hap 2022)
GCA_947247035.1		 n/a 13,282
(1.16 %)		 18,653
(1.90 %)		 n/a 40.93
(99.98 %)		 1,819
(0.02 %)		 384
(100.00 %)		 1,187,501
(7.72 %)		 762,639
(6.28 %)		 7,428,147
(45.35 %)		 101,007
(3.95 %)
385 Mediterranean moray (2026)
GCA_978019965.1		 n/a 16,427
(1.01 %)		 45,776
(4.00 %)		 n/a 41.64
(102.72 %)		 58
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,557,255
(27.83 %)		 801,510
(11.48 %)		 9,376,875
(41.09 %)		 125,556
(2.63 %)
386 Mediterranean spur-thighed tortoise (T. g. whitei from Iberian southeast TG-2024a 2024)
GCA_040782865.1		 n/a 14,964
(1.05 %)		 19,668
(1.49 %)		 n/a 39.79
(98.20 %)		 516,400
(5.40 %)		 164,422
(98.55 %)		 5,591,130
(50.11 %)		 317,117
(1.55 %)		 12,225,198
(28.87 %)		 63,003
(1.30 %)
387 Mexican burrowing toad (hap1 2024)
GCA_037306005.1		 n/a 14,442
(0.44 %)		 24,630
(1.28 %)		 n/a 41.94
(99.99 %)		 2,032
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 1,928,361
(2.22 %)		 2,955,095
(11.97 %)		 25,178,773
(53.55 %)		 165,699
(1.23 %)
388 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 157,012
(1.21 %)
389 Mexican gopher tortoise (maternal hap 2022)
GCA_025201925.1		 n/a 14,970
(1.00 %)		 18,525
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 622
(100.00 %)		 4,639,733
(52.18 %)		 472,502
(3.42 %)		 11,362,004
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
390 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFC01 2022)
GCF_025201925.1		 62,007
(3.15 %)		 14,883
(0.96 %)		 18,524
(1.48 %)		 n/a 44.69
(96.36 %)		 1,866
(3.64 %)		 621
(100.00 %)		 1,372,189
(11.32 %)		 472,501
(3.42 %)		 11,362,604
(34.69 %)		 73,700
(2.04 %)
391 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 77,167
(2.14 %)
392 Mexican spadefoot toad (hap1 2026)
GCA_054668525.1		 n/a 13,828
(2.09 %)		 25,439
(4.41 %)		 n/a 40.23
(100.00 %)		 267
(0.00 %)		 504
(100.00 %)		 2,096,085
(40.85 %)		 598,367
(11.73 %)		 5,067,467
(36.37 %)		 61,483
(4.17 %)
393 Mexican spadefoot toad (hap2 2026)
GCA_054668515.1		 n/a 13,495
(2.09 %)		 25,018
(4.52 %)		 n/a 40.14
(100.00 %)		 264
(0.00 %)		 292
(100.00 %)		 2,067,301
(40.12 %)		 572,672
(10.63 %)		 4,990,706
(35.30 %)		 60,199
(4.15 %)
394 mimic poison frog (alternate hap 2023)
GCA_032442605.1		 n/a 25
(0.76 %)		 202
(6.98 %)		 n/a 51.33
(100.00 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4,414
(23.25 %)		 1,907
(64.24 %)		 6,592
(56.32 %)		 305
(4.46 %)
395 mimic poison frog (primary hap 2023 genbank)
GCA_032444005.1		 n/a 14,957
(0.34 %)		 n/a n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,686
(100.00 %)		 1,716,760
(1.89 %)		 4,088,695
(23.45 %)		 2,437
(100.00 %)		 n/a
396 mimic poison frog (primary hap 2023 refseq)
GCF_032444005.1		 53,268
(1.27 %)		 14,955
(0.34 %)		 42,108
(1.16 %)		 n/a 44.95
(100.00 %)		 765
(0.00 %)		 1,672
(100.00 %)		 1,716,755
(1.89 %)		 4,088,682
(23.45 %)		 16,441,719
(72.26 %)		 694,865
(6.34 %)
397 Mississippi paddlefish
GCF_017654505.1		 66,213
(6.17 %)		 21,806
(1.85 %)		 31,525
(3.80 %)		 n/a 39.02
(99.89 %)		 2,963
(0.11 %)		 7,192
(99.89 %)		 1,126,936
(3.66 %)		 877,525
(6.33 %)		 9,039,918
(36.85 %)		 29,954
(1.06 %)
398 monk skink (Spon3 2026)
GCA_056884205.1		 n/a 13,876
(1.45 %)		 16,371
(2.22 %)		 n/a 43.53
(102.78 %)		 3,182,004
(0.24 %)		 62
(100.00 %)		 2,997,631
(25.94 %)		 368,339
(2.26 %)		 7,581,522
(33.20 %)		 19,177
(0.73 %)
399 Montpellier snake (2024)
GCA_964265115.1		 n/a 13,306
(1.10 %)		 19,276
(1.89 %)		 n/a 42.26
(102.73 %)		 80
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 6,869,152
(53.42 %)		 889,143
(4.29 %)		 8,612,740
(44.55 %)		 97,786
(4.30 %)
400 Moorish gecko (Portugal Tar1 2026)
GCA_056320045.1		 n/a 14,074
(0.98 %)		 19,789
(1.71 %)		 n/a 44.98
(102.74 %)		 120
(0.00 %)		 93
(100.00 %)		 6,882,398
(44.61 %)		 570,082
(3.97 %)		 10,552,943
(40.56 %)		 61,259
(2.09 %)
401 Murray river turtle (Brisbane River MOO-44397 2024)
GCF_026122565.2		 48,414
(3.72 %)		 14,988
(1.18 %)		 20,316
(1.85 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 3,735
(100.00 %)		 1,108,636
(10.97 %)		 229,329
(1.01 %)		 11,088,528
(25.43 %)		 49,188
(1.67 %)
402 natterjack toad (hap1.1 2026)
GCA_978041865.1		 n/a 14,208
(0.53 %)		 29,948
(1.62 %)		 n/a 43.25
(102.85 %)		 566
(0.00 %)		 549
(100.00 %)		 10,491,328
(76.75 %)		 2,105,613
(18.02 %)		 15,911,863
(60.52 %)		 227,983
(2.30 %)
403 natterjack toad (hap2.1 2026)
GCA_978041805.1		 n/a 14,163
(0.53 %)		 29,749
(1.58 %)		 n/a 43.25
(100.00 %)		 542
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 10,527,100
(76.82 %)		 2,103,391
(17.75 %)		 15,923,083
(60.50 %)		 227,482
(2.26 %)
404 nervous shark (hap1 2026)
GCA_988281195.1		 n/a 13,279
(0.53 %)		 19,375
(1.29 %)		 n/a 43.93
(101.30 %)		 2,005
(0.01 %)		 2,864
(99.99 %)		 9,687,582
(65.76 %)		 690,841
(6.77 %)		 14,011,315
(47.02 %)		 34,052
(1.10 %)
405 Nile crocodile (hap1 2026)
GCA_054954115.1		 n/a 14,644
(0.99 %)		 19,094
(1.48 %)		 n/a 45.35
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 3,197,557
(41.29 %)		 411,882
(3.33 %)		 12,292,120
(32.84 %)		 41,659
(2.72 %)
406 Nile crocodile (hap2 2026)
GCA_054825085.1		 n/a 14,603
(0.98 %)		 18,975
(1.46 %)		 n/a 45.39
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 3,204,046
(41.22 %)		 450,353
(3.49 %)		 12,134,419
(32.77 %)		 42,362
(2.73 %)
407 northern rubber boa (HBS 135849 alternate hap 2022)
GCA_023362785.1		 n/a 12,816
(1.09 %)		 18,099
(1.83 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 224
(100.00 %)		 1,081,107
(4.01 %)		 728,703
(4.64 %)		 6,961,724
(42.46 %)		 128,617
(3.90 %)
408 northern rubber boa (HBS 135849 primary hap 2022)
GCA_023362775.1		 n/a 13,531
(1.08 %)		 18,971
(1.81 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 1,138,891
(3.99 %)		 798,941
(5.00 %)		 7,476,142
(42.85 %)		 135,874
(3.88 %)
409 northern wobbegong (sOreWar1 hap1 2026)
GCA_988240335.1		 n/a 12,737
(0.34 %)		 21,258
(0.94 %)		 n/a 44.79
(101.13 %)		 910
(0.00 %)		 5,369
(100.00 %)		 12,171,758
(70.72 %)		 1,348,476
(22.04 %)		 19,343,992
(55.66 %)		 91,520
(2.51 %)
410 Northwestern pond turtle (WTP2003 alternate hap 2022)
GCA_022086895.1		 n/a 14,212
(1.00 %)		 20,203
(1.65 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 1,800
(0.01 %)		 2,508
(100.00 %)		 4,246,095
(48.91 %)		 442,393
(1.88 %)		 10,453,096
(35.71 %)		 134,572
(3.12 %)
411 Northwestern pond turtle (WTP2003 primary hap 2022)
GCA_022086475.1		 n/a 14,862
(1.02 %)		 19,830
(1.62 %)		 n/a 44.76
(100.00 %)		 148
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 4,413,681
(48.88 %)		 459,701
(1.92 %)		 11,014,102
(35.89 %)		 141,800
(3.08 %)
412 nurse shark (FLO180531 2022)
GCA_024137785.1		 n/a 11,376
(0.58 %)		 14,375
(1.25 %)		 n/a 41.63
(56.77 %)		 68,882
(43.24 %)		 69,171
(56.76 %)		 8,181,216
(65.52 %)		 260,159
(0.44 %)		 14,324,615
(20.45 %)		 13,165
(0.13 %)
413 ocellate spot skate (KY-2023 2024)
GCA_035221665.1		 n/a 11,712
(0.53 %)		 26,077
(1.44 %)		 n/a 43.87
(102.64 %)		 4,692
(0.08 %)		 1,141
(100.00 %)		 7,883,471
(68.43 %)		 1,306,196
(3.94 %)		 12,809,543
(57.74 %)		 258,995
(4.58 %)
414 olive python (hap1 2023)
GCA_030867105.1		 n/a 13,448
(1.31 %)		 17,745
(2.07 %)		 n/a 40.20
(99.98 %)		 73
(0.02 %)		 116
(99.98 %)		 741,052
(2.98 %)		 411,477
(3.31 %)		 7,668,994
(30.14 %)		 34,560
(2.18 %)
415 olive python (hap1 2026)
GCA_057929095.1		 n/a 13,636
(1.36 %)		 17,657
(2.07 %)		 n/a 40.20
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 2,869,112
(39.35 %)		 413,970
(3.27 %)		 7,686,808
(30.21 %)		 34,733
(2.18 %)
416 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 34,363
(2.08 %)
417 olive python (hap2 2026)
GCA_057929265.1		 n/a 13,629
(1.36 %)		 17,640
(2.07 %)		 n/a 40.19
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 2,868,493
(39.34 %)		 413,676
(3.27 %)		 7,686,615
(30.20 %)		 34,728
(2.16 %)
418 olive-headed seasnake (Western Australia SAMAR72044 2023)
GCA_033807585.1		 n/a 13,530
(0.90 %)		 18,509
(1.42 %)		 n/a 40.48
(101.31 %)		 477
(0.00 %)		 1,320
(100.00 %)		 3,955,365
(61.75 %)		 856,115
(7.07 %)		 8,301,763
(55.26 %)		 129,094
(5.58 %)
419 Pacific lamprey (Columbia River large-bodied, stream-maturing ecotype CRITFC18_GStd-0006 2020)
GCA_014621495.2		 n/a 6,827
(0.82 %)		 38,010
(4.29 %)		 n/a 48.07
(86.05 %)		 63,604
(13.95 %)		 141,124
(100.00 %)		 2,948,140
(52.71 %)		 971,264
(7.81 %)		 4,836,103
(36.27 %)		 186,153
(29.43 %)
420 Pacific ridley (hap1 2025 genbank)
GCA_965140295.1		 n/a 14,698
(1.03 %)		 17,429
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 44
(100.00 %)		 1,340,389
(12.41 %)		 313,433
(2.43 %)		 10,832,333
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
421 Pacific ridley (hap1 2025 refseq)
GCF_965140295.1		 48,786
(3.33 %)		 14,876
(1.07 %)		 17,430
(1.50 %)		 n/a 44.13
(99.98 %)		 69
(0.02 %)		 112
(99.98 %)		 4,157,740
(50.14 %)		 313,430
(2.43 %)		 10,832,284
(34.73 %)		 47,256
(1.42 %)
422 Pacific ridley (hap2 2025)
GCA_965140255.1		 n/a 14,883
(1.03 %)		 17,736
(1.52 %)		 n/a 44.14
(99.96 %)		 76
(0.04 %)		 115
(99.96 %)		 1,337,786
(12.39 %)		 317,205
(2.38 %)		 10,851,496
(34.73 %)		 47,955
(1.47 %)
423 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 64,462
(1.33 %)
424 painted frog (primary hap 2022)
GCA_027410445.1		 n/a 14,522
(0.54 %)		 21,861
(1.14 %)		 n/a 39.52
(98.39 %)		 3,681
(1.61 %)		 1,318
(100.00 %)		 1,928,844
(4.34 %)		 3,684,477
(13.44 %)		 19,091,818
(55.21 %)		 127,760
(1.34 %)
425 palmate newt (alternate hap 2024)
GCA_964258895.1		 n/a 13,011
(0.06 %)		 269,650
(1.87 %)		 n/a 44.94
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 233,842
(100.00 %)		 4,147,487
(1.62 %)		 8,364,812
(13.65 %)		 78,522,792
(49.21 %)		 2,116,175
(7.96 %)
426 palmate newt (primary hap 2024)
GCA_964261635.1		 n/a 17,611
(0.09 %)		 227,382
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,668,195
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
427 palmate newt (primary hap 2026)
GCA_964261635.2		 n/a 16,530
(0.09 %)		 227,377
(1.73 %)		 n/a 45.09
(100.00 %)		 5,245
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,696,508
(1.49 %)		 9,253,372
(10.94 %)		 95,073,160
(47.58 %)		 2,493,727
(7.98 %)
428 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 51,973
(2.70 %)
429 Papuan ground boa (hap2 2024 genbank)
GCA_035149785.1		 n/a 13,390
(1.26 %)		 17,496
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 150
(100.00 %)		 728,574
(2.82 %)		 348,605
(2.13 %)		 7,199,124
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
430 Papuan ground boa (hap2 2024 refseq)
GCF_035149785.1		 31,826
(3.55 %)		 13,389
(1.26 %)		 17,495
(1.99 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 149
(100.00 %)		 728,567
(2.82 %)		 348,603
(2.13 %)		 7,199,026
(33.55 %)		 51,807
(2.69 %)
431 Peter's clawed frog (maternal hap 2024)
GCA_038501915.1		 n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 99,118
(1.26 %)
432 Peter's clawed frog (paternal hap 2024)
GCA_038501925.1		 n/a 23,766
(1.52 %)		 34,093
(2.42 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 500
(0.00 %)		 897
(100.00 %)		 919,152
(1.89 %)		 1,157,711
(8.01 %)		 14,217,996
(45.44 %)		 108,139
(1.26 %)
433 pigmy rattlesnake (DRR0055 2026)
GCA_062034332.1		 n/a 13,444
(1.25 %)		 19,099
(1.98 %)		 n/a 39.62
(100.00 %)		 3,422
(0.02 %)		 3,003
(100.00 %)		 4,054,406
(53.59 %)		 722,049
(4.13 %)		 7,753,548
(41.91 %)		 50,932
(1.74 %)
434 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 genbank)
GCA_033958435.1		 n/a 14,675
(1.05 %)		 16,697
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 3,772,260
(47.94 %)		 322,081
(1.52 %)		 11,123,166
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
435 pitted-shelled turtle (YL-2023 2023 refseq)
GCF_033958435.1		 49,040
(3.30 %)		 14,310
(1.00 %)		 16,693
(1.47 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 987,712
(8.97 %)		 322,082
(1.52 %)		 11,123,189
(34.14 %)		 129,645
(3.29 %)
436 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 52,508
(3.70 %)
437 plains spadefoot toad (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358695.2		 n/a 13,760
(2.05 %)		 25,743
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 2,153,589
(42.02 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,323
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
438 plains spadefoot toad (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358695.1		 41,009
(4.67 %)		 13,912
(2.00 %)		 25,745
(4.50 %)		 n/a 40.45
(99.61 %)		 102
(0.39 %)		 17
(100.00 %)		 497,976
(3.84 %)		 645,915
(10.08 %)		 5,232,342
(36.26 %)		 72,598
(4.35 %)
439 plateau brown frog (CW2021 2023)
GCA_029574335.1		 n/a 14,584
(0.41 %)		 46,255
(1.70 %)		 n/a 44.36
(101.35 %)		 3,572
(0.01 %)		 2,983
(100.00 %)		 15,004,906
(78.64 %)		 3,504,364
(9.27 %)		 22,310,970
(56.66 %)		 729,606
(6.73 %)
440 pool frog (hap1 2025 genbank)
GCA_965119305.1		 n/a 14,446
(0.34 %)		 39,585
(1.24 %)		 n/a 43.75
(99.99 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,361
(100.00 %)		 2,734,844
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,849
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
441 pool frog (hap1 2025 refseq)
GCF_965119305.1		 35,542
(0.88 %)		 14,446
(0.34 %)		 39,587
(1.24 %)		 n/a 43.74
(101.38 %)		 3,044
(0.01 %)		 1,328
(100.00 %)		 2,757,940
(2.59 %)		 3,759,979
(13.10 %)		 24,289,848
(60.22 %)		 558,423
(4.11 %)
442 pool frog (hap2 2025)
GCA_965119315.1		 n/a 14,335
(0.34 %)		 39,545
(1.24 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 3,680
(99.99 %)		 2,706,037
(2.56 %)		 3,712,706
(12.97 %)		 23,911,913
(60.10 %)		 553,381
(4.05 %)
443 porcupine ray (hap1 2026)
GCA_988281385.1		 n/a 12,562
(0.43 %)		 26,637
(1.32 %)		 n/a 42.29
(102.84 %)		 377
(0.00 %)		 865
(100.00 %)		 8,713,783
(67.07 %)		 602,920
(6.59 %)		 21,309,284
(45.88 %)		 120,275
(2.54 %)
444 Potamotrygon marinae (hap2 2026)
GCA_055471215.1		 n/a 11,848
(0.34 %)		 21,950
(0.94 %)		 n/a 41.36
(102.95 %)		 1,012
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 9,567,782
(73.65 %)		 740,953
(13.73 %)		 20,017,437
(57.75 %)		 52,576
(0.65 %)
445 pouched lamprey (GAM24_3 2026)
GCA_062014767.1		 n/a 8,940
(1.11 %)		 36,840
(5.37 %)		 n/a 50.41
(101.12 %)		 135
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 2,369,093
(38.41 %)		 444,777
(7.40 %)		 3,722,247
(49.17 %)		 55,869
(71.30 %)
446 prickly gecko (False Entrance Well CCM8104 2023)
GCF_032191835.1		 35,381
(2.07 %)		 14,394
(0.79 %)		 23,371
(1.60 %)		 n/a 44.78
(99.99 %)		 1,608
(0.01 %)		 661
(100.00 %)		 1,995,033
(8.75 %)		 823,022
(6.51 %)		 12,116,860
(46.84 %)		 117,191
(3.14 %)
447 prickly shark (hap1 2026)
GCA_057877045.1		 n/a 13,126
(0.23 %)		 29,347
(0.82 %)		 n/a 48.14
(101.20 %)		 5,153
(0.01 %)		 3,906
(100.00 %)		 1,289,061
(6.83 %)		 3,350,270
(36.32 %)		 16,573,834
(77.52 %)		 662,154
(10.72 %)
448 prickly shark (hap2 2026)
GCA_057876775.1		 n/a 12,978
(0.26 %)		 28,116
(0.88 %)		 n/a 48.35
(99.98 %)		 4,924
(0.02 %)		 2,205
(100.00 %)		 1,101,970
(5.16 %)		 2,769,674
(32.64 %)		 15,562,460
(75.20 %)		 617,230
(10.59 %)
449 Puerto Rican coqui (hap1 2024 refseq)
GCF_035609145.1		 44,598
(2.13 %)		 13,879
(0.57 %)		 31,890
(1.61 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 956
(100.00 %)		 1,044,176
(1.98 %)		 1,442,184
(16.51 %)		 14,710,122
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
450 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 503,166
(8.84 %)
451 Puget Sound dogfish (hap1 2025)
GCA_050613905.1		 n/a 13,335
(0.31 %)		 32,914
(1.25 %)		 n/a 46.84
(99.98 %)		 4,275
(0.02 %)		 3,203
(100.00 %)		 996,444
(5.35 %)		 1,697,611
(29.47 %)		 16,252,127
(70.13 %)		 372,462
(5.80 %)
452 Puget Sound dogfish (hap2 2025)
GCA_050613895.1		 n/a 13,151
(0.34 %)		 29,417
(1.19 %)		 n/a 46.65
(99.98 %)		 4,144
(0.02 %)		 1,862
(100.00 %)		 887,790
(4.65 %)		 1,380,618
(26.09 %)		 14,838,724
(67.96 %)		 333,223
(5.63 %)
453 ray-finned fishes P.merretti (hap1 2026)
GCA_057931045.1		 n/a 17,686
(1.81 %)		 37,595
(4.88 %)		 n/a 43.71
(102.76 %)		 278
(0.00 %)		 126
(100.00 %)		 3,118,708
(34.41 %)		 852,554
(9.08 %)		 6,259,550
(34.71 %)		 144,915
(6.52 %)
454 ray-finned fishes P.merretti (hap2 2026)
GCA_057931065.1		 n/a 16,169
(1.87 %)		 33,742
(4.94 %)		 n/a 43.63
(100.00 %)		 236
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,757,145
(33.55 %)		 765,151
(8.12 %)		 5,640,514
(33.63 %)		 130,213
(6.47 %)
455 red coachwhip (AS-2025 2026)
GCA_060497075.1		 n/a 13,487
(1.21 %)		 18,639
(2.05 %)		 n/a 40.19
(102.85 %)		 6
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 5,052,678
(53.02 %)		 863,289
(4.17 %)		 8,794,103
(40.98 %)		 42,334
(1.94 %)
456 red stingray (2025)
GCF_048418815.1		 55,797
(2.16 %)		 12,249
(0.37 %)		 26,981
(1.23 %)		 n/a 43.17
(94.93 %)		 2,066
(5.07 %)		 261
(100.00 %)		 832,690
(1.45 %)		 801,096
(12.24 %)		 21,031,370
(49.66 %)		 108,035
(1.85 %)
457 red-eared slider turtle
GCF_013100865.1		 47,272
(3.27 %)		 13,909
(1.05 %)		 16,674
(1.54 %)		 n/a 43.81
(96.14 %)		 25,390
(3.86 %)		 138
(100.00 %)		 1,686,633
(15.06 %)		 271,837
(0.81 %)		 10,802,900
(30.74 %)		 93,811
(1.90 %)
458 reedfish (primary hap 2021)
GCA_900747795.4		 n/a 13,335
(0.48 %)		 23,159
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,317,123
(62.67 %)		 1,069,641
(2.91 %)		 19,980,246
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
459 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 74,951
(1.15 %)
460 Reeve's moray (2022-ZK-DYW-LXS-MUSCLE-01 2023)
GCA_029721435.1		 n/a 15,839
(0.92 %)		 41,347
(3.51 %)		 n/a 41.65
(102.79 %)		 146
(0.00 %)		 569
(100.00 %)		 5,175,857
(64.26 %)		 713,235
(8.06 %)		 9,939,950
(43.37 %)		 100,617
(2.22 %)
461 Reeves's turtle
GCF_016161935.1		 86,238
(3.40 %)		 15,165
(0.98 %)		 21,405
(1.66 %)		 n/a 44.98
(100.00 %)		 398
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,854,279
(14.68 %)		 448,403
(2.11 %)		 11,329,581
(34.64 %)		 119,002
(2.82 %)
462 Riggenbach's reed frog (alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1,426,030
(6.65 %)
463 Riggenbach's reed frog (primary hap 2024 genbank)
GCA_040937935.1		 n/a 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 4,172,191
(12.59 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,114
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
464 Riggenbach's reed frog (primary hap 2024 refseq)
GCF_040937935.1		 62,635
(1.63 %)		 14,072
(0.39 %)		 44,953
(1.74 %)		 n/a 44.98
(99.99 %)		 3,039
(0.01 %)		 477
(100.00 %)		 2,058,700
(2.53 %)		 3,206,511
(15.84 %)		 20,407,989
(60.26 %)		 741,520
(6.10 %)
465 Ringneck snake (HBS135679 primary hap 2022)
GCA_023053685.1		 n/a 13,357
(1.06 %)		 20,426
(1.94 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 444
(100.00 %)		 1,451,537
(9.36 %)		 1,095,484
(10.35 %)		 7,870,309
(48.66 %)		 142,495
(4.04 %)
466 roundjaw bonefish (hap1 2026)
GCA_056783665.1		 n/a 17,717
(2.33 %)		 24,251
(4.97 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 1,315,104
(19.20 %)		 421,651
(7.42 %)		 5,642,373
(24.02 %)		 30,976
(1.25 %)
467 roundjaw bonefish (hap2 2026)
GCA_056776265.1		 n/a 17,768
(2.35 %)		 24,154
(4.96 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 1,309,049
(18.64 %)		 417,246
(7.24 %)		 5,611,567
(23.57 %)		 30,644
(1.20 %)
468 Roux's giant gecko (US-hobby MAAG-2026a 2026)
GCA_058969105.1		 n/a 13,997
(1.26 %)		 18,565
(2.03 %)		 n/a 44.95
(102.80 %)		 16
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 4,780,379
(37.71 %)		 397,669
(1.73 %)		 8,199,893
(34.47 %)		 81,058
(2.33 %)
469 royal ground snake (hap1 2023 refseq)
GCF_031021105.1		 45,143
(3.26 %)		 13,488
(0.98 %)		 20,353
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 6,118,914
(59.42 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,283
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
470 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 140,557
(4.65 %)
471 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 145,328
(4.63 %)
472 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 175,180
(3.64 %)
473 rufous frog (hap2 2023 genbank)
GCA_031893055.1		 n/a 13,538
(0.88 %)		 24,311
(2.15 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,266
(100.00 %)		 711,895
(2.18 %)		 1,219,160
(21.56 %)		 7,988,458
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
474 rufous frog (hap2 2023 refseq)
GCF_031893055.1		 36,767
(2.51 %)		 13,536
(0.88 %)		 24,404
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 712,068
(2.18 %)		 1,219,159
(21.56 %)		 7,988,199
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
475 rufous frog (hap2 2026)
GCA_031893055.2		 n/a 13,549
(0.89 %)		 24,388
(2.13 %)		 n/a 42.96
(99.07 %)		 976
(0.93 %)		 1,265
(100.00 %)		 5,738,417
(62.95 %)		 1,219,306
(21.56 %)		 7,988,200
(54.14 %)		 170,920
(3.48 %)
476 Sabana Surinam toad (BJE4294 2021)
GCA_019650415.1		 n/a 11,460
(0.68 %)		 39,132
(1.41 %)		 n/a 37.70
(99.38 %)		 67,859
(0.60 %)		 351,451
(99.40 %)		 1,112,793
(9.46 %)		 523,672
(3.31 %)		 8,542,740
(36.81 %)		 42,115
(0.79 %)
477 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 83,890
(3.97 %)
478 San Diegan legless lizard (HBS135921 primary hap 2023)
GCA_029215775.1		 n/a 14,065
(1.09 %)		 19,430
(1.84 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 1,307,771
(5.32 %)		 672,054
(3.42 %)		 9,846,806
(39.03 %)		 83,805
(3.99 %)
479 San Diegan tiger whiptail (alternate hap HBS 135688 2022)
GCA_023333555.1		 n/a 13,288
(1.15 %)		 18,137
(1.98 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 227
(100.00 %)		 909,096
(6.37 %)		 544,302
(5.70 %)		 8,280,652
(39.20 %)		 51,923
(2.21 %)
480 San Diegan tiger whiptail (v1.1 HBS 135688 primary hap 2025)
GCA_023333525.2		 n/a 13,255
(1.15 %)		 17,876
(1.96 %)		 n/a 43.28
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 907,854
(6.31 %)		 539,629
(5.57 %)		 8,277,961
(39.11 %)		 51,910
(2.22 %)
481 San Diego alligator lizard (HBS135686 alternate hap 2022)
GCA_023053675.1		 n/a 14,107
(1.14 %)		 19,600
(1.95 %)		 n/a 43.58
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 627
(100.00 %)		 1,563,836
(7.79 %)		 758,521
(4.15 %)		 9,213,810
(40.44 %)		 81,126
(2.79 %)
482 San Diego alligator lizard (v1.0 HBS135686 primary hap 2022)
GCA_023053635.1		 n/a 14,075
(1.15 %)		 19,587
(1.99 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 1,577,744
(7.81 %)		 774,690
(3.78 %)		 9,248,062
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
483 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 genbank)
GCA_023053635.2		 n/a 14,093
(1.15 %)		 19,338
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 35
(100.00 %)		 1,577,751
(7.81 %)		 774,117
(3.78 %)		 9,248,069
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
484 San Diego alligator lizard (v1.1 HBS135686 primary hap 2024 refseq)
GCF_023053635.1		 33,415
(3.07 %)		 14,091
(1.15 %)		 19,337
(1.96 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 1,577,747
(7.81 %)		 774,112
(3.78 %)		 9,248,016
(40.42 %)		 80,183
(2.48 %)
485 San Diego ringneck snake (HBS135679 alternate hap 2022)
GCA_023053665.1		 n/a 10,911
(1.00 %)		 17,586
(1.79 %)		 n/a 41.17
(100.00 %)		 572
(0.00 %)		 2,064
(100.00 %)		 1,265,045
(10.30 %)		 989,149
(13.38 %)		 6,503,035
(50.62 %)		 123,274
(4.17 %)
486 sand lizard (alternate hap 2019)
GCA_009819545.1		 n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 80,300
(2.76 %)
487 sand lizard (primary hap 2019)
GCF_009819535.1		 41,714
(3.65 %)		 14,350
(1.48 %)		 19,231
(2.45 %)		 32,804
(4.14 %)		 43.75
(99.75 %)		 379
(0.25 %)		 29
(100.00 %)		 975,474
(5.32 %)		 425,414
(1.76 %)		 7,135,165
(34.49 %)		 76,053
(2.68 %)
488 sand tiger shark (hap1 2026)
GCA_055471155.1		 n/a 13,784
(0.34 %)		 21,567
(0.89 %)		 n/a 45.19
(101.28 %)		 1,643
(0.16 %)		 1,711
(100.00 %)		 7,932,159
(66.95 %)		 2,319,833
(17.54 %)		 24,061,588
(55.39 %)		 126,096
(2.69 %)
489 sand tiger shark (hap2 2026)
GCA_055471145.1		 n/a 13,439
(0.36 %)		 20,564
(0.93 %)		 n/a 45.10
(101.26 %)		 1,534
(0.23 %)		 1,171
(100.00 %)		 7,357,217
(66.76 %)		 1,982,014
(16.60 %)		 23,066,008
(54.15 %)		 113,116
(2.53 %)
490 sand viper (VAMM-2024 2025)
GCA_047301725.1		 n/a 13,318
(1.23 %)		 18,979
(2.05 %)		 n/a 40.71
(102.80 %)		 244
(0.00 %)		 24
(100.00 %)		 1,166,984
(7.70 %)		 698,784
(3.63 %)		 7,450,643
(42.34 %)		 92,145
(3.53 %)
491 Sardinian treefrog (hap1 2023 refseq)
GCF_029499605.1		 108,406
(1.98 %)		 13,959
(0.46 %)		 n/a n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,474
(100.00 %)		 1,903,654
(2.85 %)		 2,970,691
(16.56 %)		 15,354,577
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
492 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 651,438
(8.09 %)
493 Schlegel's Japanese gecko (2015)
GCF_001447785.1		 25,190
(1.78 %)		 14,549
(0.82 %)		 28,002
(1.69 %)		 n/a 45.48
(96.46 %)		 143,970
(3.54 %)		 335,470
(96.46 %)		 889,760
(2.21 %)		 666,492
(2.83 %)		 12,865,811
(39.14 %)		 160,022
(2.80 %)
494 sea lamprey (alternate hap 2020)
GCA_010993595.1		 n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 147,499
(35.87 %)
495 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 alternate hap 2025)
GCA_048941845.1		 n/a 6,576
(0.51 %)		 43,825
(3.94 %)		 n/a 47.88
(100.00 %)		 n/a 7,128
(100.00 %)		 4,390,525
(64.21 %)		 1,225,707
(31.71 %)		 4,578,596
(61.04 %)		 190,615
(29.92 %)
496 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 genbank)
GCA_048934315.1		 n/a 8,243
(0.45 %)		 53,092
(3.72 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,203
(100.00 %)		 813,148
(7.99 %)		 1,963,193
(37.59 %)		 5,212,133
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
497 sea lamprey (Great Lakes invasive population PM22_M1 primary hap 2025 refseq)
GCF_048934315.1		 67,315
(6.94 %)		 8,244
(0.45 %)		 45,418
(3.02 %)		 n/a 48.10
(99.99 %)		 992
(0.01 %)		 1,204
(100.00 %)		 813,154
(7.99 %)		 1,963,197
(37.59 %)		 5,212,175
(68.09 %)		 252,648
(29.41 %)
498 sea lamprey (primary hap 2020)
GCF_010993605.1		 41,241
(6.50 %)		 7,638
(0.70 %)		 36,336
(4.06 %)		 83,714
(10.03 %)		 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,434
(100.00 %)		 1,920,851
(39.36 %)		 1,194,165
(21.47 %)		 5,320,620
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
499 sharks & rays (2211 2026)
GCA_060307235.1		 n/a 12,051
(0.47 %)		 21,232
(1.25 %)		 n/a 42.38
(101.36 %)		 533
(0.00 %)		 1,562
(100.00 %)		 6,312,470
(47.93 %)		 894,420
(11.22 %)		 16,405,894
(51.70 %)		 107,948
(1.61 %)
500 sharks & rays (SO-2025 2026)
GCA_054367945.1		 n/a 12,633
(0.38 %)		 27,161
(1.14 %)		 n/a 42.00
(101.33 %)		 1,288
(0.00 %)		 1,158
(100.00 %)		 9,471,920
(67.02 %)		 837,721
(14.18 %)		 20,939,378
(52.80 %)		 150,103
(2.30 %)
501 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 genbank)
GCA_035084215.1		 n/a 12,780
(0.49 %)		 24,543
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,880
(100.00 %)		 597,122
(2.28 %)		 1,112,137
(17.97 %)		 12,108,056
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
502 sharpnose sevengill shark (hap1 2024 refseq)
GCF_035084215.1		 51,418
(2.53 %)		 12,778
(0.49 %)		 24,541
(1.38 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 1,834
(0.01 %)		 1,879
(100.00 %)		 597,115
(2.28 %)		 1,112,121
(17.97 %)		 12,108,003
(57.48 %)		 117,585
(3.42 %)
503 sharpnose sevengill shark (v1 hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 108,468
(3.25 %)
504 sharpnose sevengill shark (v2 hap2 2024)
GCA_035084135.2		 n/a 12,605
(0.51 %)		 23,661
(1.48 %)		 n/a 44.32
(99.99 %)		 1,771
(0.01 %)		 1,143
(100.00 %)		 559,424
(2.10 %)		 990,550
(15.48 %)		 11,850,173
(56.04 %)		 109,272
(3.30 %)
505 Shaw's sea snake (ss_UAE728 2024)
GCA_037043045.1		 n/a 13,255
(0.98 %)		 17,598
(1.51 %)		 n/a 40.56
(99.93 %)		 641
(0.07 %)		 1,450
(99.93 %)		 1,165,384
(5.77 %)		 720,981
(3.46 %)		 8,068,978
(51.52 %)		 120,786
(6.16 %)
506 shortnose gar (hap1 2026 genbank)
GCA_059453375.1		 n/a 13,777
(1.48 %)		 24,433
(3.52 %)		 n/a 40.84
(102.72 %)		 45
(0.00 %)		 270
(100.00 %)		 1,368,384
(36.80 %)		 257,444
(13.92 %)		 5,510,116
(38.49 %)		 58,068
(3.96 %)
507 shortnose gar (hap1 2026 refseq)
GCF_059453375.1		 69,375
(7.82 %)		 13,889
(1.51 %)		 24,432
(3.52 %)		 n/a 40.84
(102.79 %)		 45
(0.00 %)		 269
(100.00 %)		 1,544,945
(42.60 %)		 257,444
(13.92 %)		 5,510,076
(38.49 %)		 58,068
(3.96 %)
508 shortnose gar (hap2 2026)
GCA_059453405.1		 n/a 13,581
(1.54 %)		 23,444
(3.57 %)		 n/a 40.67
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 214
(100.00 %)		 1,307,157
(34.74 %)		 226,116
(11.39 %)		 5,488,729
(36.58 %)		 55,305
(3.72 %)
509 Siamese crocodile (JL-2025a 2025)
GCA_052110815.1		 n/a 14,068
(1.04 %)		 18,199
(1.50 %)		 n/a 44.88
(101.52 %)		 676
(0.00 %)		 860
(100.00 %)		 2,906,176
(41.75 %)		 289,417
(1.27 %)		 11,431,007
(31.18 %)		 36,200
(1.54 %)
510 Siberian wood frog (spRanAmu-1000001404 2026)
GCA_060496945.1		 n/a 14,403
(0.42 %)		 44,825
(1.74 %)		 n/a 44.45
(102.80 %)		 343
(0.00 %)		 685
(100.00 %)		 15,196,171
(77.32 %)		 3,713,759
(11.58 %)		 21,652,430
(58.15 %)		 764,860
(7.57 %)
511 silver chimaera (sChiPha1 2026)
GCA_057930315.1		 n/a 11,816
(1.51 %)		 13,743
(2.59 %)		 n/a 42.36
(100.00 %)		 850
(0.04 %)		 2,093
(100.00 %)		 3,319,760
(44.98 %)		 673,051
(4.57 %)		 6,052,480
(41.93 %)		 40,866
(2.05 %)
512 silvertip shark (SJ-STS2025 2026)
GCA_062034296.1		 n/a 11,996
(0.52 %)		 15,197
(1.20 %)		 n/a 42.90
(102.77 %)		 27,574
(4.66 %)		 27,615
(95.34 %)		 8,801,231
(65.21 %)		 383,737
(1.40 %)		 13,774,330
(41.04 %)		 17,839
(0.27 %)
513 Skyros wall lizard (hap1.2 2024)
GCF_964106915.1		 72,774
(5.99 %)		 14,298
(1.39 %)		 19,900
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 4,985,535
(51.28 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,654
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
514 Skyros wall lizard (hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 86,165
(2.71 %)
515 Skyros wall lizard (v1 hap1 2024)
GCA_964106915.1		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
516 Skyros wall lizard (v2 hap1 2024)
GCA_964106915.2		 n/a 14,245
(1.36 %)		 19,892
(2.29 %)		 n/a 43.82
(99.99 %)		 883
(0.01 %)		 211
(100.00 %)		 838,357
(3.88 %)		 479,922
(4.42 %)		 7,039,963
(38.21 %)		 93,005
(2.80 %)
517 small-eyed ray (hap1.1 2026)
GCA_982319585.1		 n/a 12,092
(0.49 %)		 29,267
(1.46 %)		 n/a 45.39
(100.40 %)		 2,689
(0.01 %)		 4,225
(100.00 %)		 8,804,118
(72.17 %)		 1,666,575
(13.33 %)		 11,928,381
(61.47 %)		 300,552
(6.69 %)
518 small-eyed ray (hap2.1 2026)
GCA_982319545.1		 n/a 11,972
(0.50 %)		 28,154
(1.47 %)		 n/a 45.48
(99.99 %)		 2,688
(0.01 %)		 5,516
(99.99 %)		 8,685,236
(71.77 %)		 1,478,950
(12.77 %)		 11,816,313
(60.96 %)		 295,247
(6.93 %)
519 small-spotted catshark (primary hap 2021)
GCF_902713615.2		 55,748
(1.62 %)		 13,022
(0.37 %)		 23,990
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 10,880,918
(73.26 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,883,361
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
520 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 427,693
(8.25 %)
521 smaller spotted catshark (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_902713615.2		 n/a 12,587
(0.36 %)		 23,986
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 645
(100.00 %)		 1,451,634
(1.94 %)		 1,448,619
(6.25 %)		 20,884,741
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
522 smalltooth sawfish (alternate hap 2019)
GCA_009764485.1		 n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 37,147
(1.43 %)
523 smalltooth sawfish (primary hap 2019)
GCA_009764475.2		 n/a 12,158
(0.69 %)		 18,625
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 4,923,143
(54.93 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,054
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
524 smalltooth sawfish (v2.1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009764475.1		 40,257
(2.94 %)		 12,157
(0.69 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 172
(100.00 %)		 4,824,261
(54.91 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,260
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
525 smooth skate (SmoothSkate02 primary hap 2024)
GCA_038087875.1		 n/a 7,998
(0.47 %)		 23,764
(1.91 %)		 n/a 44.02
(100.00 %)		 13,092
(0.13 %)		 6,182
(100.00 %)		 7,592,942
(72.49 %)		 957,387
(6.69 %)		 7,470,731
(59.29 %)		 195,339
(6.63 %)
526 snake B.irregularis (Birr_Female4 2026)
GCA_056881965.1		 n/a 12,450
(1.11 %)		 18,032
(1.87 %)		 n/a 41.15
(101.19 %)		 224
(0.00 %)		 433
(100.00 %)		 5,225,106
(56.94 %)		 954,312
(6.34 %)		 7,632,254
(46.72 %)		 72,499
(2.62 %)
527 snake C.gasperettii (CG1 2025)
GCA_046524025.1		 n/a 13,277
(1.16 %)		 17,868
(1.84 %)		 n/a 39.94
(102.83 %)		 792
(0.02 %)		 237
(100.00 %)		 1,104,071
(7.40 %)		 621,242
(4.74 %)		 7,969,137
(44.13 %)		 45,595
(1.55 %)
528 snake L.rosozonatus (Hainan Island endemic population YBU250033 2026)
GCA_061240095.1		 n/a 13,431
(1.13 %)		 20,565
(2.12 %)		 n/a 40.97
(102.80 %)		 57
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 5,995,609
(55.89 %)		 1,069,203
(4.88 %)		 8,343,323
(45.28 %)		 75,844
(2.59 %)
529 snake M.schweizeri (rMacScw1.hap1.1 2025)
GCA_965194845.1		 n/a 13,449
(1.19 %)		 19,267
(1.96 %)		 n/a 40.61
(101.32 %)		 1,364
(0.01 %)		 535
(100.00 %)		 3,640,611
(51.92 %)		 720,766
(7.75 %)		 7,413,566
(44.97 %)		 86,057
(3.30 %)
530 snake N.helvetica (hap1.1 2024)
GCA_964273705.1		 n/a 13,534
(1.08 %)		 19,681
(1.86 %)		 n/a 41.70
(99.98 %)		 2,010
(0.02 %)		 494
(100.00 %)		 1,264,981
(8.07 %)		 885,992
(7.35 %)		 8,475,795
(46.16 %)		 117,174
(4.31 %)
531 snake N.helvetica (hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 96,764
(4.19 %)
532 snake P.spiloides (GreyRatsnake01 primary hap 2026)
GCA_037575465.2		 n/a 14,226
(1.10 %)		 21,483
(2.05 %)		 n/a 40.40
(102.83 %)		 311
(0.00 %)		 111
(100.00 %)		 4,921,427
(55.77 %)		 1,017,940
(7.15 %)		 9,049,757
(45.25 %)		 82,928
(2.50 %)
533 snake R.lateralis (Jilin DL-2025a 2026)
GCA_062024719.1		 n/a 13,615
(0.93 %)		 20,185
(1.63 %)		 n/a 42.57
(101.39 %)		 1,025
(0.02 %)		 501
(100.00 %)		 6,445,749
(59.12 %)		 1,490,502
(11.60 %)		 8,514,446
(55.13 %)		 222,122
(6.57 %)
534 Somali helmeted turtle (alternate hap 2025)
GCA_051311595.1		 n/a 14,771
(1.19 %)		 18,963
(1.80 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 n/a 1,298
(100.00 %)		 3,524,256
(40.68 %)		 362,743
(1.52 %)		 9,689,320
(29.55 %)		 52,961
(1.73 %)
535 Somali helmeted turtle (primary hap 2025)
GCA_051311615.1		 n/a 14,695
(1.19 %)		 17,959
(1.73 %)		 n/a 43.06
(99.89 %)		 85
(0.11 %)		 67
(100.00 %)		 3,529,920
(40.73 %)		 365,058
(1.57 %)		 9,712,608
(29.62 %)		 53,463
(1.75 %)
536 South American lungfish (Aquarium Glaser DD20211129a alternate hap 2024)
GCA_040438655.1		 n/a 4,310
(0.01 %)		 72,538
(0.22 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 n/a 1,072,861
(100.00 %)		 16,794,805
(3.28 %)		 13,423,198
(21.65 %)		 196,414,313
(59.02 %)		 218,171
(0.23 %)
537 southeastern chorus frog (ECM19152 2026)
GCA_058322085.1		 n/a 13,943
(0.46 %)		 48,726
(2.00 %)		 n/a 42.96
(100.00 %)		 21,585
(0.26 %)		 46,493
(100.00 %)		 14,733,533
(66.21 %)		 3,141,717
(15.77 %)		 16,088,021
(61.29 %)		 579,413
(6.33 %)
538 Southern California legless lizard (HBS135921 hap1 2026)
GCA_051312515.2		 n/a 14,187
(1.12 %)		 19,489
(1.86 %)		 n/a 43.68
(100.00 %)		 67
(0.00 %)		 55
(100.00 %)		 5,909,632
(46.54 %)		 670,448
(3.31 %)		 9,944,808
(39.15 %)		 83,929
(3.91 %)
539 Southern California legless lizard (HBS135921 hap2 2026)
GCA_051312545.2		 n/a 14,225
(1.12 %)		 19,592
(1.86 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 5,913,300
(46.41 %)		 672,138
(3.61 %)		 9,957,324
(39.35 %)		 83,771
(3.97 %)
540 southern Darwin's frog (hap1 2025)
GCA_050947455.1		 n/a 13,810
(0.52 %)		 34,024
(1.59 %)		 n/a 43.01
(99.99 %)		 1,606
(0.01 %)		 2,943
(100.00 %)		 11,010,271
(59.26 %)		 2,251,360
(18.25 %)		 13,843,971
(63.42 %)		 443,624
(6.38 %)
541 Southern dwarf chameleon (Gauteng JTBG20232 2024)
GCA_035047345.1		 n/a 13,671
(0.83 %)		 18,931
(1.39 %)		 n/a 44.53
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 135
(100.00 %)		 1,004,404
(4.81 %)		 870,596
(5.97 %)		 9,017,362
(54.42 %)		 217,977
(8.25 %)
542 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 alternate hap 2022)
GCA_024509165.1		 n/a 13,381
(1.17 %)		 19,541
(1.96 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 34
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 1,137,408
(8.97 %)		 740,163
(7.59 %)		 7,520,676
(44.43 %)		 47,268
(1.61 %)
543 Southern Pacific rattlesnake (HBS135844 primary hap 2022)
GCA_024509115.1		 n/a 12,626
(1.16 %)		 18,965
(1.95 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 443
(0.01 %)		 1,139
(99.99 %)		 1,095,605
(9.34 %)		 713,734
(8.45 %)		 6,942,208
(44.93 %)		 46,378
(2.04 %)
544 Southwestern pond turtle (HBS135687 alternate hap 2022)
GCA_023634275.1		 n/a 14,998
(0.98 %)		 20,146
(1.60 %)		 n/a 44.84
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 1,562,785
(12.68 %)		 484,638
(2.00 %)		 11,089,433
(36.29 %)		 143,601
(3.21 %)
545 Southwestern pond turtle (HBS135687 primary hap 2022)
GCA_023634205.1		 n/a 14,971
(0.99 %)		 19,756
(1.60 %)		 n/a 44.77
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 1,545,155
(12.63 %)		 465,697
(1.95 %)		 11,181,681
(36.13 %)		 142,383
(3.05 %)
546 spiny dogfish (Lynn of Lorn, Scotland, UK JT-UK-2019 2023)
GCA_030390025.1		 n/a 12,723
(0.42 %)		 26,698
(1.22 %)		 n/a 45.89
(101.24 %)		 5,471
(0.05 %)		 3,882
(100.00 %)		 749,799
(1.84 %)		 1,076,756
(12.75 %)		 13,462,662
(62.21 %)		 295,477
(4.95 %)
547 spotted gar
GCF_000242695.1		 45,681
(8.02 %)		 13,054
(1.95 %)		 46,362
(15.00 %)		 n/a 39.59
(91.93 %)		 43,276
(8.08 %)		 45,199
(91.92 %)		 203,614
(1.02 %)		 123,247
(0.80 %)		 5,837,321
(22.82 %)		 38,507
(2.24 %)
548 spotted gar (hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 52,438
(3.69 %)
549 spotted gar (hap2 2024 genbank)
GCA_040954835.1		 n/a 13,842
(1.51 %)		 23,963
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 817
(100.00 %)		 1,332,243
(34.81 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,951
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
550 spotted gar (hap2 2024 refseq)
GCF_040954835.1		 64,638
(7.15 %)		 13,839
(1.51 %)		 23,965
(3.48 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 816
(100.00 %)		 1,319,033
(34.80 %)		 245,717
(12.50 %)		 5,536,919
(38.20 %)		 57,935
(3.78 %)
551 spotted moray (2026)
GCA_978019835.1		 n/a 16,348
(1.04 %)		 38,313
(3.53 %)		 n/a 41.70
(102.87 %)		 71
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,160,132
(28.09 %)		 585,769
(10.39 %)		 9,925,217
(38.87 %)		 80,015
(1.64 %)
552 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 64,249
(4.00 %)
553 spotted ratfish (hap2 2024)
GCA_035084275.1		 n/a 10,694
(1.38 %)		 13,221
(2.62 %)		 n/a 42.85
(99.96 %)		 1,952
(0.04 %)		 532
(100.00 %)		 3,108,151
(44.68 %)		 498,592
(6.00 %)		 5,634,132
(43.16 %)		 50,785
(2.94 %)
554 spotted ray (hap1.1 2026)
GCA_980250545.1		 n/a 11,917
(0.53 %)		 29,784
(1.58 %)		 n/a 44.43
(100.15 %)		 3,030
(0.02 %)		 4,542
(100.00 %)		 9,023,837
(69.78 %)		 1,317,538
(6.25 %)		 12,219,735
(58.18 %)		 278,007
(5.45 %)
555 spotted ray (hap2.1 2026)
GCA_980251185.1		 n/a 12,027
(0.53 %)		 30,226
(1.61 %)		 n/a 44.56
(99.98 %)		 2,873
(0.02 %)		 6,791
(99.98 %)		 9,053,482
(69.77 %)		 1,277,399
(6.17 %)		 12,285,515
(58.11 %)		 279,307
(5.47 %)
556 spotted thorius (hap1 2026)
GCA_060511645.1		 n/a 16,308
(0.08 %)		 281,976
(2.00 %)		 n/a 44.00
(101.39 %)		 1,347
(0.00 %)		 6,194
(100.00 %)		 7,654,632
(1.67 %)		 8,183,789
(8.39 %)		 92,968,603
(55.54 %)		 2,686,800
(7.14 %)
557 starry smooth-hound (hap1.1 2024)
GCA_964213995.1		 n/a 12,755
(0.42 %)		 23,706
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,314
(100.00 %)		 1,153,000
(3.16 %)		 1,250,073
(11.36 %)		 14,207,513
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
558 starry smooth-hound (hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 105,379
(3.46 %)
559 starry smooth-hound shark (hap1.1 2024)
GCF_964213995.1		 50,247
(1.97 %)		 12,752
(0.42 %)		 23,720
(1.15 %)		 n/a 45.69
(99.98 %)		 3,590
(0.02 %)		 5,313
(100.00 %)		 1,161,214
(3.17 %)		 1,250,068
(11.36 %)		 14,206,585
(54.93 %)		 114,313
(3.65 %)
560 Stejneger's bamboo snake (YBU240039 2025)
GCA_050613815.1		 n/a 13,474
(1.22 %)		 17,924
(1.92 %)		 n/a 40.19
(101.37 %)		 43
(0.00 %)		 617
(100.00 %)		 5,373,645
(51.79 %)		 756,052
(5.88 %)		 8,304,174
(43.59 %)		 70,655
(3.28 %)
561 sterlet (v2 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.2		 73,208
(5.77 %)		 24,716
(1.77 %)		 39,692
(3.97 %)		 n/a 39.75
(99.93 %)		 6,251
(0.07 %)		 3,368
(100.00 %)		 3,869,521
(43.26 %)		 1,093,425
(6.82 %)		 9,976,052
(39.33 %)		 60,325
(1.97 %)
562 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 113,023
(3.09 %)
563 Suwannee snapping turtle (hap2 2023)
GCA_033349115.1		 n/a 12,226
(1.01 %)		 14,117
(1.42 %)		 n/a 43.77
(100.00 %)		 361
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 1,202,345
(11.93 %)		 304,674
(1.45 %)		 9,752,924
(32.81 %)		 92,993
(2.75 %)
564 tailed frog (A.truei hap1 2024 genbank)
GCA_040206685.1		 n/a 14,490
(0.54 %)		 41,227
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,455
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,662,323
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
565 tailed frog (A.truei hap1 2024 refseq)
GCF_040206685.1		 69,065
(2.29 %)		 14,490
(0.54 %)		 41,218
(1.77 %)		 n/a 44.92
(99.97 %)		 6,020
(0.03 %)		 3,549
(100.00 %)		 1,783,526
(4.78 %)		 3,426,339
(20.31 %)		 15,660,933
(55.70 %)		 442,764
(6.61 %)
566 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 441,543
(6.61 %)
567 tarantolino (hap1 2023)
GCA_029931775.1		 n/a 14,318
(1.18 %)		 21,784
(2.17 %)		 n/a 44.68
(99.77 %)		 153
(0.23 %)		 592
(100.00 %)		 5,383,621
(53.79 %)		 436,945
(2.95 %)		 8,308,761
(39.80 %)		 83,089
(2.82 %)
568 thornback ray (hap1.1 2026)
GCA_980434695.1		 n/a 12,036
(0.55 %)		 29,375
(1.65 %)		 n/a 44.43
(101.34 %)		 2,667
(0.01 %)		 1,860
(100.00 %)		 9,097,652
(68.82 %)		 1,275,313
(5.43 %)		 12,306,520
(57.27 %)		 270,118
(5.25 %)
569 thornback ray (hap2.1 2026)
GCA_980432155.1		 n/a 12,145
(0.53 %)		 30,300
(1.62 %)		 n/a 44.68
(99.99 %)		 2,703
(0.01 %)		 5,935
(99.99 %)		 9,407,764
(69.49 %)		 1,383,362
(6.40 %)		 12,478,479
(58.39 %)		 282,238
(5.47 %)
570 thorny skate (alternate hap CabotCenter1 2020)
GCA_010909745.1		 n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 159,552
(5.54 %)
571 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.2		 n/a 11,697
(0.61 %)		 26,344
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 8,789,521
(68.75 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,963,149
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
572 thorny skate (v1.1 primary hap CabotCenter1 2020 refseq)
GCF_010909765.2		 45,968
(2.40 %)		 11,437
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 n/a 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 888,163
(2.58 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
573 three-toed box turtle
GCF_002925995.2		 35,807
(2.28 %)		 16,429
(1.00 %)		 26,460
(1.60 %)		 33,673
(1.75 %)		 44.26
(94.87 %)		 53,635
(5.13 %)		 48,497
(100.00 %)		 2,007,347
(15.00 %)		 351,871
(0.86 %)		 12,385,245
(31.74 %)		 138,405
(2.40 %)
574 tiger rattlesnake
GCF_016545835.1		 58,085
(4.72 %)		 13,597
(1.18 %)		 20,553
(2.03 %)		 n/a 39.88
(100.00 %)		 n/a 4,228
(100.00 %)		 1,142,521
(7.92 %)		 739,406
(5.17 %)		 7,749,366
(42.91 %)		 45,588
(1.61 %)
575 tiger salamander (Tig_M23 2026)
GCA_061212105.1		 n/a 23,961
(0.08 %)		 186,203
(1.15 %)		 n/a 46.27
(102.78 %)		 1,920
(0.00 %)		 3,762
(100.00 %)		 28,461,502
(65.74 %)		 8,376,884
(11.27 %)		 125,465,827
(51.73 %)		 2,444,237
(5.28 %)
576 tiny Cayenne caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901765105.1		 n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 326,452
(3.86 %)
577 tiny cayenne caecilian (primary hap 2021)
GCF_901765095.2		 41,335
(1.27 %)		 14,580
(0.44 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 3,532
(98.99 %)		 13,578,410
(71.92 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,206,278
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
578 tiny Cayenne caecilian (v2 2021)
GCA_901765095.2		 n/a 14,569
(0.43 %)		 30,498
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,894,383
(1.68 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,143
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
579 tope shark (hap1 2025)
GCA_977071755.1		 n/a 12,861
(0.32 %)		 25,525
(1.16 %)		 n/a 47.84
(99.98 %)		 3,659
(0.02 %)		 10,777
(99.98 %)		 1,356,606
(3.72 %)		 1,445,979
(23.88 %)		 14,153,835
(65.90 %)		 141,501
(5.85 %)
580 tope shark (hap1 2026)
GCA_055755705.1		 n/a 12,842
(0.32 %)		 25,523
(1.16 %)		 n/a 47.73
(100.50 %)		 3,659
(0.02 %)		 8,367
(99.99 %)		 1,347,388
(3.72 %)		 1,449,325
(23.87 %)		 14,153,380
(65.90 %)		 141,501
(5.85 %)
581 tope shark (hap2 2025)
GCA_977071745.1		 n/a 9,480
(0.44 %)		 12,818
(1.02 %)		 n/a 45.32
(99.99 %)		 1,556
(0.01 %)		 1,593
(99.99 %)		 844,596
(2.20 %)		 605,996
(6.77 %)		 10,856,611
(52.57 %)		 83,694
(4.14 %)
582 Townsend's dwarf sphaero (gecko TG3544 2022)
GCF_021028975.2		 41,266
(3.35 %)		 13,505
(1.05 %)		 19,294
(1.78 %)		 n/a 45.92
(99.99 %)		 2,590
(0.01 %)		 1,742
(100.00 %)		 938,800
(8.81 %)		 627,869
(5.78 %)		 9,306,892
(38.57 %)		 91,919
(2.91 %)
583 tropical clawed frog
GCF_000004195.4		 50,570
(4.71 %)		 14,679
(1.97 %)		 20,138
(2.76 %)		 52,028
(5.20 %)		 40.73
(99.80 %)		 684
(0.20 %)		 167
(100.00 %)		 2,289,618
(34.82 %)		 708,472
(13.14 %)		 6,816,377
(41.73 %)		 52,647
(1.35 %)
584 Tungara frog (maternal hap 2024 refseq)
GCF_040894005.1		 55,552
(3.50 %)		 13,678
(0.88 %)		 29,722
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 936
(100.00 %)		 734,279
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,807
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
585 Tungara frog (paternal hap 2024)
GCA_040894015.1		 n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 207,553
(4.71 %)
586 Turks Islands skink (RGR3008 2026)
GCA_056884325.1		 n/a 13,827
(1.45 %)		 16,448
(2.22 %)		 n/a 43.54
(102.79 %)		 2,560,899
(0.19 %)		 34
(100.00 %)		 3,004,480
(25.98 %)		 371,562
(2.28 %)		 7,548,517
(33.44 %)		 19,370
(0.73 %)
587 turtles (Mexican musk turtle STRM 2024)
GCA_044707075.1		 n/a 14,457
(1.38 %)		 18,917
(1.85 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 171,804
(6.96 %)		 29,375
(100.00 %)		 3,199,354
(35.51 %)		 202,620
(0.71 %)		 9,383,450
(24.08 %)		 54,489
(1.56 %)
588 two-lined caecilian (alternate hap 2019)
GCA_901001175.1		 n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 523,234
(6.59 %)
589 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 genbank)
GCA_901001135.2		 n/a 14,449
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,274,606
(1.91 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,400,957
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
590 two-lined caecilian (v1.2 primary hap 2021 refseq)
GCF_901001135.2		 56,619
(1.50 %)		 14,447
(0.38 %)		 40,573
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 4,902
(99.36 %)		 7,642,637
(30.35 %)		 2,036,107
(4.34 %)		 29,399,636
(44.09 %)		 602,911
(6.66 %)
591 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025 genbank)
GCA_965153285.1		 n/a 14,267
(1.41 %)		 20,319
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 833,273
(4.46 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
592 Tyrrhenian wall lizard (hap1 2025 refseq)
GCF_965153285.1		 74,360
(6.29 %)		 14,315
(1.44 %)		 20,248
(2.40 %)		 n/a 44.04
(99.99 %)		 1,024
(0.01 %)		 258
(100.00 %)		 4,922,311
(49.66 %)		 456,881
(4.04 %)		 6,995,048
(37.06 %)		 97,620
(3.04 %)
593 Tyrrhenian wall lizard (hap2 2025)
GCA_965153305.1		 n/a 13,496
(1.42 %)		 18,862
(2.37 %)		 n/a 43.96
(99.99 %)		 983
(0.01 %)		 306
(100.00 %)		 780,565
(4.36 %)		 422,625
(4.27 %)		 6,551,041
(36.66 %)		 89,693
(2.97 %)
594 undulate ray (2026)
GCA_980436725.1		 n/a 12,010
(0.50 %)		 27,362
(1.45 %)		 n/a 45.02
(101.57 %)		 2,543
(0.01 %)		 1,253
(100.00 %)		 9,070,711
(71.40 %)		 1,216,218
(10.82 %)		 12,098,252
(61.01 %)		 281,244
(5.52 %)
595 valley gartersnake (HBS 135685 alternate hap 2023)
GCA_029207655.1		 n/a 13,267
(1.12 %)		 21,667
(2.38 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 403
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 1,344,601
(8.29 %)		 1,035,785
(7.00 %)		 8,436,473
(45.10 %)		 82,750
(2.69 %)
596 valley gartersnake (HBS 135685 primary hap 2023)
GCA_029207665.1		 n/a 12,430
(1.10 %)		 20,286
(2.36 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 446
(0.00 %)		 413
(100.00 %)		 1,299,478
(9.62 %)		 1,018,398
(8.41 %)		 7,790,758
(46.28 %)		 81,352
(2.71 %)
597 veiled chameleon (AJP-2024a 2024)
GCA_043643385.1		 n/a 13,000
(1.03 %)		 14,947
(1.51 %)		 n/a 42.82
(101.43 %)		 546
(0.00 %)		 492
(100.00 %)		 3,475,887
(26.88 %)		 742,592
(4.05 %)		 9,688,124
(41.85 %)		 84,652
(2.86 %)
598 viperine water snake (2025)
GCA_964659585.1		 n/a 13,487
(1.13 %)		 19,333
(1.87 %)		 n/a 41.44
(102.77 %)		 75
(0.00 %)		 210
(100.00 %)		 4,142,066
(54.63 %)		 870,047
(5.04 %)		 8,557,674
(44.75 %)		 114,823
(4.54 %)
599 viviparous/common lizard
GCF_011800845.1		 47,034
(5.17 %)		 14,311
(1.43 %)		 20,571
(2.35 %)		 32,442
(3.15 %)		 43.97
(97.04 %)		 51,275
(2.97 %)		 25,252
(100.00 %)		 949,801
(5.41 %)		 498,048
(1.91 %)		 7,668,731
(34.21 %)		 88,947
(2.62 %)
600 warty newt (alternate hap 2024)
GCA_964204665.1		 n/a 7,653
(0.05 %)		 165,170
(1.80 %)		 n/a 45.74
(100.00 %)		 338
(0.00 %)		 179,793
(100.00 %)		 2,367,930
(1.81 %)		 4,993,795
(17.70 %)		 40,385,667
(52.18 %)		 1,135,490
(8.29 %)
601 warty newt (primary hap 2024 genbank)
GCA_964204655.1		 n/a 16,124
(0.09 %)		 186,006
(1.43 %)		 n/a 45.53
(100.00 %)		 4,698
(0.00 %)		 1,422
(100.00 %)		 4,239,451
(1.37 %)		 8,714,648
(13.78 %)		 84,859,372
(50.88 %)		 2,159,665
(8.20 %)
602 warty newt (primary hap 2024 refseq)
GCF_964204655.1		 78,096
(0.50 %)		 16,122
(0.09 %)		 186,007
(1.43 %)		 n/a 45.52
(102.83 %)		 4,698
(0.00 %)		 6,001
(100.00 %)		 4,239,416
(1.37 %)		 8,725,286
(13.72 %)		 84,859,339
(50.88 %)		 2,159,664
(8.20 %)
603 wattle-necked softshell turtle (PAS_2024 2025)
GCA_054135685.1		 n/a 14,873
(1.04 %)		 20,956
(1.70 %)		 n/a 45.39
(102.91 %)		 21
(0.00 %)		 74
(100.00 %)		 4,053,505
(47.00 %)		 496,780
(2.80 %)		 11,190,246
(35.73 %)		 107,755
(4.04 %)
604 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a alternate hap 2024)
GCA_040939495.1		 n/a 5,770
(0.02 %)		 51,747
(0.50 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 65,665
(100.00 %)		 8,636,983
(3.97 %)		 7,822,314
(7.96 %)		 97,649,351
(57.33 %)		 262,729
(0.56 %)
605 West African lungfish (Aquarium Glaser DD20220218a primary hap 2024)
GCA_040939525.1		 n/a 14,330
(0.04 %)		 83,285
(0.50 %)		 n/a 39.97
(99.99 %)		 24,438
(0.01 %)		 7,125
(100.00 %)		 17,253,560
(4.05 %)		 15,370,489
(7.85 %)		 180,606,722
(55.17 %)		 548,408
(0.58 %)
606 West African lungfish (FY-2018-M 2021)
GCF_019279795.1		 41,847
(0.19 %)		 n/a n/a n/a 40.21
(97.52 %)		 n/a 12,668
(100.00 %)		 16,163,808
(2.67 %)		 13,992,750
(5.30 %)		 n/a 502,751
(0.52 %)
607 western chorus frog (Ontario Canada JT22Mhap1 2026)
GCA_053478255.2		 n/a 14,324
(0.49 %)		 42,410
(2.02 %)		 n/a 45.04
(100.00 %)		 1,837
(0.00 %)		 1,100
(100.00 %)		 14,993,900
(65.43 %)		 3,145,831
(17.41 %)		 15,399,943
(62.39 %)		 575,163
(6.40 %)
608 western chorus frog (Ontario Canada JT22Mhap2 2026)
GCA_056512365.2		 n/a 13,981
(0.49 %)		 42,035
(2.07 %)		 n/a 45.01
(100.00 %)		 1,846
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 14,873,941
(65.52 %)		 3,092,457
(17.13 %)		 15,388,764
(62.36 %)		 569,249
(6.37 %)
609 western fence lizard (IW3139 2022)
GCA_023333635.1		 n/a 26,067
(1.12 %)		 46,795
(2.72 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 1,771
(100.00 %)		 2,075,491
(6.60 %)		 1,603,401
(7.34 %)		 15,565,775
(40.61 %)		 184,134
(3.16 %)
610 western fence lizard (IW3139 primary hap 2022)
GCA_023333645.1		 n/a 24,835
(1.20 %)		 42,146
(2.78 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 659
(100.00 %)		 1,842,497
(6.34 %)		 1,335,245
(6.14 %)		 15,103,683
(37.84 %)		 158,311
(2.92 %)
611 Western massasauga (CLP2594 2026)
GCA_062034334.1		 n/a 13,412
(1.28 %)		 19,185
(2.02 %)		 n/a 39.50
(100.00 %)		 2,743
(0.02 %)		 3,082
(100.00 %)		 4,052,490
(52.23 %)		 714,223
(4.46 %)		 7,668,555
(40.88 %)		 47,468
(1.67 %)
612 western painted turtle (hap1 R12L10 2024)
GCA_035221575.1		 n/a 15,110
(1.01 %)		 20,192
(1.60 %)		 n/a 44.79
(99.98 %)		 2,300
(0.02 %)		 7,676
(99.98 %)		 4,166,116
(47.33 %)		 435,101
(2.23 %)		 11,124,856
(35.21 %)		 124,359
(2.87 %)
613 western painted turtle (hap2 R12L10 2024)
GCA_035221595.1		 n/a 15,098
(1.02 %)		 20,450
(1.60 %)		 n/a 44.76
(99.98 %)		 1,992
(0.02 %)		 11,363
(99.98 %)		 4,160,368
(47.32 %)		 430,205
(2.07 %)		 11,110,552
(34.96 %)		 124,000
(2.80 %)
614 western painted turtle (R12L10 2023 refseq)
GCF_011386835.1		 101,708
(5.23 %)		 15,332
(1.01 %)		 21,055
(1.60 %)		 n/a 44.88
(99.98 %)		 1,270
(0.02 %)		 9,850
(100.00 %)		 4,178,966
(47.39 %)		 457,400
(2.29 %)		 11,325,467
(35.43 %)		 127,896
(2.94 %)
615 western painted turtle (v5 RCT428 2020)
GCF_000241765.5		 64,782
(3.76 %)		 15,184
(1.08 %)		 21,463
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 259,085
(87.52 %)		 4,079,404
(44.68 %)		 316,232
(0.93 %)		 11,848,718
(27.60 %)		 103,623
(1.74 %)
616 western red-tailed skink (HBS 135693 alternate hap 2022)
GCA_026170595.1		 n/a 14,019
(1.31 %)		 17,620
(2.13 %)		 n/a 45.76
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 39
(100.00 %)		 862,216
(4.87 %)		 557,627
(3.17 %)		 8,002,559
(36.95 %)		 183,292
(4.74 %)
617 western red-tailed skink (HBS 135693 primary hap 2022)
GCA_026170395.1		 n/a 13,064
(1.32 %)		 16,407
(2.16 %)		 n/a 45.81
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 794,996
(4.86 %)		 514,021
(3.46 %)		 7,339,914
(37.02 %)		 168,847
(4.76 %)
618 western spadefoot toad (2023)
GCA_933207985.1		 n/a 14,211
(0.63 %)		 32,941
(1.84 %)		 n/a 40.54
(100.76 %)		 64,928
(0.21 %)		 68,502
(99.79 %)		 4,432,511
(26.34 %)		 2,612,372
(7.66 %)		 15,680,118
(46.11 %)		 151,976
(2.08 %)
619 western spadefoot toad (hap1 HBS 135690 2023)
GCA_029215705.1		 n/a 13,914
(1.72 %)		 27,496
(4.28 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 600,622
(4.04 %)		 783,931
(10.70 %)		 5,362,245
(41.82 %)		 100,334
(5.41 %)
620 western spadefoot toad (hap2 HBS 135690 2023)
GCA_029215755.1		 n/a 13,991
(1.72 %)		 27,685
(4.24 %)		 n/a 40.90
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 541
(100.00 %)		 620,188
(5.00 %)		 800,411
(11.19 %)		 5,338,766
(42.25 %)		 101,603
(5.32 %)
621 western terrestrial garter snake (alternate hap 2019)
GCA_009769695.1		 n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 91,606
(2.53 %)
622 western terrestrial garter snake (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769535.1		 n/a 13,074
(1.13 %)		 18,806
(1.93 %)		 n/a 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,274,580
(7.75 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,395,695
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
623 western terrestrial garter snake (primary hap 2019 refseq)
GCF_009769535.1		 33,492
(3.42 %)		 13,074
(1.13 %)		 18,807
(1.93 %)		 31,660
(2.61 %)		 40.95
(97.72 %)		 1,518
(2.28 %)		 365
(100.00 %)		 1,271,255
(7.73 %)		 979,057
(4.48 %)		 8,396,200
(42.63 %)		 81,829
(2.47 %)
624 whale shark (14 2022 Squalomix)
GCF_021869965.1		 42,052
(2.43 %)		 12,059
(0.52 %)		 18,460
(1.22 %)		 38,963
(1.77 %)		 41.51
(91.61 %)		 95,208
(8.40 %)		 16,684
(100.00 %)		 402,747
(0.97 %)		 389,119
(1.49 %)		 15,298,245
(34.14 %)		 21,050
(0.30 %)
625 whale shark (Ralph 2017 Emory U)
GCF_001642345.1		 31,857
(1.52 %)		 11,884
(0.43 %)		 28,482
(1.15 %)		 n/a 41.78
(100.00 %)		 900,650
(0.03 %)		 57,334
(100.00 %)		 413,201
(1.16 %)		 426,542
(2.75 %)		 16,418,143
(38.85 %)		 35,192
(0.95 %)
626 white-bellied softnose skate (Sanriku21f 2025)
GCF_053455715.1		 41,159
(3.03 %)		 11,907
(0.66 %)		 24,004
(1.82 %)		 n/a 44.94
(99.88 %)		 5,336
(0.12 %)		 3,942
(100.00 %)		 9,274,458
(62.02 %)		 1,451,144
(6.73 %)		 8,696,026
(55.50 %)		 191,431
(5.50 %)
627 whitespotted bambooshark
GCF_004010195.1		 54,886
(2.03 %)		 12,065
(0.44 %)		 19,805
(1.08 %)		 n/a 42.06
(94.27 %)		 156,554
(5.74 %)		 101,977
(100.00 %)		 559,291
(0.96 %)		 641,094
(3.66 %)		 19,566,199
(38.21 %)		 28,353
(0.49 %)
628 whitespotted bambooshark (BGI_BamShark_2017 2019)
GCA_004010195.1		 n/a 12,118
(0.41 %)		 20,659
(1.02 %)		 n/a 42.30
(94.58 %)		 159,245
(5.41 %)		 601,049
(100.00 %)		 577,652
(1.03 %)		 935,689
(4.73 %)		 21,034,123
(39.29 %)		 37,965
(0.55 %)
629 whitespotted bambooshark (Xiang-an2024)
GCF_037043375.1		 63,538
(1.92 %)		 12,648
(0.33 %)		 20,407
(0.93 %)		 n/a 43.84
(102.89 %)		 2,116
(0.02 %)		 247
(100.00 %)		 10,210,772
(68.41 %)		 1,553,859
(14.40 %)		 23,687,273
(50.26 %)		 67,717
(1.43 %)
630 whitespotted conger (HY 2025)
GCA_047653785.1		 n/a 17,263
(2.02 %)		 34,073
(5.20 %)		 n/a 43.81
(102.82 %)		 234
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 2,441,544
(36.20 %)		 938,430
(10.61 %)		 5,763,134
(33.42 %)		 114,088
(5.26 %)
631 wood frog (aRanSyl1 2023)
GCA_028564925.1		 n/a 14,532
(0.37 %)		 43,393
(1.52 %)		 n/a 43.63
(100.76 %)		 13,423
(0.12 %)		 4,861
(100.00 %)		 13,526,606
(71.82 %)		 4,240,726
(11.36 %)		 23,695,641
(55.29 %)		 565,695
(4.80 %)
632 Wuis rock agama (Bomi SW-2024a 2024)
GCA_040285375.1		 n/a 14,003
(1.17 %)		 18,961
(1.97 %)		 n/a 42.56
(102.85 %)		 52
(0.00 %)		 70
(100.00 %)		 4,423,302
(44.26 %)		 655,782
(3.52 %)		 8,674,123
(34.69 %)		 53,208
(1.89 %)
633 yellow-bellied toad (maternal hap 2024)
GCA_964205305.1		 n/a 14,756
(0.22 %)		 45,590
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 18,937,194
(70.69 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 30,457,322
(66.19 %)		 412,512
(1.53 %)
634 yellow-bellied toad (paternal hap 2024)
GCA_964205295.1		 n/a 15,637
(0.22 %)		 46,444
(0.92 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 6,671
(0.01 %)		 4,887
(100.00 %)		 19,544,300
(70.77 %)		 7,435,469
(14.36 %)		 31,317,575
(66.35 %)		 423,705
(1.55 %)
635 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2025)
GCA_050000025.1		 n/a 14,891
(1.27 %)		 19,639
(1.89 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 n/a 624
(100.00 %)		 2,747,806
(34.14 %)		 168,104
(0.62 %)		 10,457,354
(26.26 %)		 47,683
(1.86 %)
636 yellow-spotted Amazon River turtle (alternate hap 2026)
GCA_050000025.2		 n/a 14,811
(0.94 %)		 30,371
(2.41 %)		 n/a 43.83
(100.00 %)		 n/a 2,436
(100.00 %)		 4,676,532
(48.44 %)		 412,438
(1.17 %)		 12,237,450
(31.63 %)		 48,675
(1.65 %)
637 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2025)
GCA_050000005.1		 n/a 14,852
(1.27 %)		 19,245
(1.84 %)		 n/a 42.94
(99.98 %)		 114
(0.02 %)		 73
(99.99 %)		 2,745,424
(34.17 %)		 167,125
(0.63 %)		 10,246,975
(25.86 %)		 47,799
(1.87 %)
638 yellow-spotted Amazon River turtle (primary hap 2026)
GCA_050000005.2		 n/a 14,683
(0.95 %)		 17,589
(1.40 %)		 n/a 43.85
(100.00 %)		 214
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,687,675
(48.54 %)		 412,242
(1.19 %)		 12,305,782
(31.82 %)		 48,972
(1.67 %)
639 yellowpond turtle (Southern MM-2020 2021)
GCF_020497125.1		 65,539
(3.36 %)		 15,560
(0.99 %)		 21,233
(1.66 %)		 n/a 45.17
(96.24 %)		 1,041
(3.76 %)		 595
(100.00 %)		 1,904,996
(14.25 %)		 468,779
(2.21 %)		 11,403,005
(33.86 %)		 135,646
(3.23 %)
640 zebra shark (6-17 2022 Squalomix)
GCF_022316705.1		 48,447
(2.64 %)		 11,974
(0.57 %)		 15,459
(1.26 %)		 n/a 41.78
(93.81 %)		 87,372
(6.20 %)		 1,266
(100.00 %)		 392,676
(0.96 %)		 348,115
(1.22 %)		 15,176,805
(32.93 %)		 20,647
(0.38 %)
641 zebra shark (hap1 2023 refseq)
GCF_030684315.1		 58,105
(2.61 %)		 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
642 zebra shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 48,378
(1.60 %)
643 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 genbank)
GCA_051348905.1		 n/a 13,951
(0.34 %)		 41,627
(1.23 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 10,342,480
(47.98 %)		 3,714,881
(17.24 %)		 16,808,875
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
644 Zimmermann's poison frog (hap1 2025 refseq)
GCF_051348905.1		 63,511
(1.45 %)		 13,949
(0.34 %)		 41,407
(1.21 %)		 n/a 44.89
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 286
(100.00 %)		 10,342,474
(47.98 %)		 3,714,877
(17.24 %)		 16,808,822
(70.04 %)		 639,443
(7.04 %)
645 Zimmermann's poison frog (hap2 2025)
GCA_051348885.1		 n/a 14,010
(0.34 %)		 42,101
(1.22 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 227
(0.00 %)		 275
(100.00 %)		 10,423,157
(48.22 %)		 3,754,386
(17.74 %)		 16,835,345
(70.24 %)		 658,843
(7.16 %)
TOTALS:total assembly count 645

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 631 assemblies assembly stats track stats
Mammals 1014 assemblies assembly stats track stats
Birds 693 assemblies assembly stats track stats
Fishes 933 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 645 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 2034 assemblies assembly stats track stats
Plants 602 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4138 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15880 assemblies assembly stats track stats
Archaea 3178 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 24177 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 691 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats