Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1
n/a 21,507
(2.72 %)
60,050
(11.57 %)
n/a 35.92
(99.97 %)
2,344
(0.03 %)
1,735
(100.00 %)
430,950
(2.82 %)
273,041
(3.10 %)
4,895,011
(32.98 %)
29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,489
(11.95 %)
23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,474
(10.62 %)
16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,989
(11.87 %)
16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
75,576
(3.67 %)
7 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2
61,514
(3.59 %)
17,694
(0.94 %)
82,131
(6.45 %)
n/a 38.54
(93.07 %)
37,524
(6.94 %)
30
(100.00 %)
930,885
(3.15 %)
928,025
(5.06 %)
6,719,901
(56.47 %)
104,550
(9.50 %)
8 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,826
(15.96 %)
16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
60,891
(21.37 %)
9 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
10 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2
62,791
(10.08 %)
25,443
(3.35 %)
69,492
(14.56 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,085
(100.00 %)
366,178
(2.25 %)
175,852
(2.27 %)
4,240,382
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
11 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
10,893
(2.94 %)
12 annual mercury (v1 primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
13 annual mercury (v2 primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
14 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
560,429
(28.70 %)
15 ant C.braunii (S276 2018)
GCA_003427395.1
n/a 3,649
(0.20 %)
126,898
(19.85 %)
n/a 48.33
(81.70 %)
641,791
(18.38 %)
653,445
(81.62 %)
1,577,107
(5.98 %)
1,434,259
(6.24 %)
8,533,748
(36.35 %)
278,266
(17.95 %)
16 ant C.sp. (NIES-68 2022)
GCA_027943385.1
n/a 3,655
(0.79 %)
32,911
(30.45 %)
n/a 55.81
(100.00 %)
n/a 2,529
(100.00 %)
255,839
(6.03 %)
392,694
(15.77 %)
1,480,495
(52.16 %)
23,662
(78.57 %)
17 ant L.chinense (Lushan-1 2018)
GCA_003013855.2
n/a 15,545
(0.82 %)
85,577
(6.98 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
473
(0.00 %)
4,183
(100.00 %)
860,506
(2.32 %)
825,722
(4.56 %)
8,205,488
(53.73 %)
153,728
(4.12 %)
18 ant M.endlicherianum (SAG 12.97 2019)
GCA_009602735.1
n/a 2,806
(1.27 %)
21,989
(34.80 %)
n/a 51.93
(90.29 %)
24,291
(9.73 %)
38,152
(90.27 %)
147,548
(5.58 %)
92,866
(3.14 %)
715,552
(34.44 %)
34,833
(26.81 %)
19 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,916
(11.38 %)
22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
25,923
(1.76 %)
20 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1
n/a 16,583
(4.58 %)
55,248
(25.46 %)
n/a 43.36
(99.98 %)
696
(0.02 %)
615
(100.00 %)
495,126
(50.28 %)
124,567
(3.20 %)
1,922,072
(32.59 %)
65,220
(23.87 %)
21 Australian wild rice (MA-2024b 2025)
GCA_047496205.1
n/a 16,434
(4.16 %)
55,282
(23.68 %)
n/a 43.56
(100.00 %)
4
(0.00 %)
16
(100.00 %)
602,996
(48.61 %)
170,830
(6.54 %)
1,845,923
(37.36 %)
69,474
(22.48 %)
22 avocado (Hass MH2022 2023)
GCA_029852735.1
n/a 15,968
(1.61 %)
64,612
(11.72 %)
n/a 39.99
(100.00 %)
36
(0.00 %)
482
(100.00 %)
1,348,599
(20.35 %)
427,369
(10.49 %)
4,298,119
(41.03 %)
54,543
(5.58 %)
23 Bahia grass (Cayasta R1 2024)
GCA_036689595.1
n/a 17,830
(3.66 %)
74,926
(26.22 %)
n/a 45.79
(99.95 %)
2,801
(0.05 %)
2,811
(99.95 %)
643,354
(26.01 %)
146,179
(4.41 %)
2,284,294
(38.05 %)
110,855
(27.67 %)
24 Balbis banana (DH-PKW 2019)
GCA_004837865.1
n/a 18,974
(3.45 %)
47,957
(15.55 %)
n/a 38.02
(99.72 %)
1,197
(0.27 %)
2,590
(100.00 %)
208,141
(3.88 %)
197,690
(7.95 %)
2,068,575
(42.39 %)
52,850
(9.12 %)
25 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
8,868
(1.38 %)
26 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,906
(14.28 %)
16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
3,384
(0.27 %)
27 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
3,695
(0.65 %)
28 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
3,335
(0.34 %)
29 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
66,834
(4.90 %)
30 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
68,566
(4.96 %)
31 beefsteak plant (Hoko-3 primary hap 2022)
GCA_026008535.1
n/a 28,039
(2.07 %)
120,338
(15.60 %)
n/a 35.28
(100.00 %)
23
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,012,805
(68.74 %)
678,680
(5.87 %)
8,191,868
(44.06 %)
65,395
(2.45 %)
32 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,727
(9.45 %)
11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
25,364
(1.79 %)
33 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,490
(9.22 %)
11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
25,108
(1.67 %)
34 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
19,517
(0.21 %)
35 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
22,527
(6.34 %)
36 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
21,415
(5.59 %)
37 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
32,283
(3.44 %)
38 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
14,100
(2.00 %)
39 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
5,093
(4.11 %)
40 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
4,963
(4.10 %)
41 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,638
(15.94 %)
19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
3,761
(0.66 %)
42 black gram (Urdbean 2024)
GCA_036885675.1
n/a 16,158
(3.35 %)
47,346
(15.05 %)
n/a 33.60
(99.97 %)
282
(0.03 %)
13
(100.00 %)
832,234
(57.53 %)
240,933
(5.84 %)
2,976,104
(38.95 %)
16,895
(2.01 %)
43 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
181,027
(2.79 %)
44 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
59,325
(10.76 %)
45 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3
n/a 46,431
(0.31 %)
805,204
(7.93 %)
n/a 46.09
(99.87 %)
211,982
(0.14 %)
70,316
(100.00 %)
9,191,325
(44.14 %)
5,086,953
(4.53 %)
282,298
(99.86 %)
3,241,124
(28.06 %)
46 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,450
(1.62 %)
n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
3,040,030
(27.48 %)
47 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1
n/a n/a 751,576
(8.03 %)
n/a 46.05
(98.12 %)
693,028
(1.90 %)
693,050
(98.10 %)
8,420,935
(44.23 %)
4,115,828
(3.69 %)
693,050
(98.10 %)
3,076,631
(26.41 %)
48 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
3,001,896
(28.00 %)
49 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1
n/a 47,400
(0.34 %)
778,134
(8.33 %)
n/a 46.11
(99.87 %)
7,376
(0.13 %)
7,398
(99.87 %)
14,835,099
(85.31 %)
4,570,540
(5.40 %)
7,395
(99.87 %)
2,994,427
(28.25 %)
50 brown mustard (Varuna 2020)
GCA_015484525.1
n/a 50,825
(7.02 %)
128,133
(24.54 %)
n/a 37.47
(96.71 %)
3,070
(3.29 %)
720
(100.00 %)
905,496
(54.34 %)
440,139
(7.46 %)
4,073,637
(39.30 %)
54,083
(6.71 %)
51 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1
79,194
(1.39 %)
19,567
(0.31 %)
119,910
(3.26 %)
n/a 33.70
(100.00 %)
1
(0.00 %)
549
(100.00 %)
3,727,770
(5.18 %)
3,762,751
(4.98 %)
10,213,591
(82.37 %)
54,254
(0.38 %)
52 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
2,964
(0.34 %)
53 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
25,348
(3.39 %)
54 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
24,749
(4.05 %)
55 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1
43,175
(7.78 %)
16,377
(2.29 %)
43,559
(11.38 %)
n/a 36.31
(100.00 %)
175
(0.00 %)
706
(100.00 %)
341,665
(12.46 %)
223,217
(36.36 %)
2,388,236
(58.00 %)
26,535
(3.98 %)
56 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
21,783
(2.16 %)
57 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
20,384
(2.28 %)
58 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1
n/a 18,838
(1.94 %)
71,211
(13.84 %)
n/a 33.78
(99.91 %)
8,772
(0.10 %)
147
(100.00 %)
643,488
(3.49 %)
361,843
(3.63 %)
4,074,440
(56.52 %)
27,745
(1.31 %)
59 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
17,045
(1.23 %)
60 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
22,750
(1.69 %)
61 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
47,327
(1.58 %)
62 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1
n/a 15,253
(1.67 %)
62,228
(12.57 %)
n/a 34.08
(100.00 %)
n/a 1,599
(100.00 %)
595,917
(3.95 %)
335,791
(3.38 %)
3,478,519
(61.18 %)
31,738
(1.57 %)
63 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1
n/a 15,334
(1.80 %)
60,140
(12.83 %)
n/a 33.79
(99.92 %)
2,496
(0.09 %)
483
(100.00 %)
567,458
(3.73 %)
320,455
(3.12 %)
3,403,771
(58.38 %)
27,791
(1.48 %)
64 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
16,685
(0.21 %)
65 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
8,564
(0.85 %)
66 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2
60,116
(15.29 %)
16,679
(3.49 %)
51,607
(18.82 %)
n/a 34.97
(99.99 %)
554
(0.01 %)
11
(100.00 %)
195,035
(2.33 %)
186,941
(8.11 %)
2,018,050
(39.61 %)
10,319
(1.14 %)
67 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1
n/a 27,737
(2.70 %)
78,774
(11.79 %)
n/a 37.13
(76.51 %)
36,478
(23.50 %)
4,440
(100.00 %)
584,617
(3.41 %)
554,162
(3.52 %)
4,126,060
(43.14 %)
77,570
(1.78 %)
68 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
52,506
(2.50 %)
69 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
12,838
(2.54 %)
70 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCA_019578655.1
n/a 13,864
(4.31 %)
29,909
(14.27 %)
n/a 33.05
(99.95 %)
331
(0.05 %)
146
(100.00 %)
328,084
(38.04 %)
128,377
(6.36 %)
1,992,583
(39.20 %)
7,290
(1.00 %)
71 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
7,216
(0.99 %)
72 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1
89,565
(2.38 %)
17,560
(0.48 %)
115,390
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
4,633
(0.27 %)
4,854
(100.00 %)
1,247,170
(1.97 %)
1,423,285
(4.75 %)
11,041,078
(71.09 %)
31,562
(0.31 %)
73 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1
n/a 3
(0.11 %)
117
(7.42 %)
n/a 39.35
(99.99 %)
4
(0.01 %)
35
(100.00 %)
1,139
(3.04 %)
1,677
(4.92 %)
11,074
(10.60 %)
76
(1.07 %)
74 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1
n/a 6,487
(0.16 %)
114,999
(4.12 %)
n/a 37.82
(62.87 %)
490,371
(37.15 %)
1,116,784
(62.85 %)
692,892
(1.67 %)
790,165
(1.22 %)
18,073,193
(31.20 %)
24,414
(0.46 %)
75 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
31,157
(5.92 %)
76 chickpea
GCF_000331145.1
42,036
(9.83 %)
15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
3,488
(0.28 %)
77 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2
42,320
(9.82 %)
15,593
(3.16 %)
30,475
(8.82 %)
n/a 31.03
(91.05 %)
33,507
(8.98 %)
6,446
(100.00 %)
308,190
(3.39 %)
318,609
(11.50 %)
2,922,065
(43.86 %)
3,472
(0.28 %)
78 chicory (Punajuju 2022)
GCA_023525715.1
n/a 16,855
(1.17 %)
92,310
(11.34 %)
n/a 35.50
(99.99 %)
510
(0.01 %)
208
(100.00 %)
1,976,706
(34.89 %)
781,413
(8.81 %)
6,080,413
(49.06 %)
51,571
(2.99 %)
79 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
37,317
(4.17 %)
80 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
317,707
(8.50 %)
81 Chinese licorice (Kyoto 2023)
GCA_030159175.1
n/a 16,920
(3.67 %)
44,776
(19.51 %)
n/a 37.70
(100.00 %)
20
(0.00 %)
89
(100.00 %)
593,642
(17.68 %)
219,391
(21.45 %)
2,088,553
(50.28 %)
15,616
(4.58 %)
82 Chinese licorice (manju 2023)
GCA_027886165.1
n/a 16,877
(4.02 %)
43,800
(15.68 %)
n/a 35.67
(99.96 %)
1,409
(0.03 %)
6,467
(100.00 %)
582,162
(19.03 %)
193,998
(5.82 %)
2,492,820
(41.31 %)
18,054
(4.04 %)
83 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1
n/a 13,666
(0.97 %)
71,763
(9.04 %)
n/a 35.33
(99.97 %)
1,170
(0.03 %)
1,621
(100.00 %)
635,445
(2.92 %)
599,600
(4.44 %)
8,101,700
(44.90 %)
75,475
(3.56 %)
84 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
18,367
(1.88 %)
85 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
19,299
(1.84 %)
86 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
7,930
(3.80 %)
87 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
8,929
(0.83 %)
88 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
34,479
(27.80 %)
89 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
19,392
(13.60 %)
90 coffee (Caturra red CCC135-36 2018)
GCA_003713225.1
n/a 23,597
(2.02 %)
86,132
(13.38 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
690
(0.21 %)
2,832
(100.00 %)
502,137
(2.12 %)
386,196
(3.95 %)
5,651,566
(41.67 %)
36,395
(1.62 %)
91 coffee (Red Bourbon ID1545 2023)
GCA_030873655.1
n/a 25,435
(1.84 %)
94,196
(12.02 %)
n/a 37.21
(99.99 %)
197
(0.01 %)
1,794
(100.00 %)
1,591,482
(68.40 %)
423,470
(5.23 %)
6,621,994
(45.23 %)
49,710
(2.01 %)
92 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1
80,737
(8.03 %)
23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
36,398
(1.62 %)
93 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1
119,626
(9.97 %)
25,877
(2.06 %)
97,184
(14.13 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
107
(0.00 %)
134
(100.00 %)
542,076
(2.06 %)
445,020
(5.76 %)
5,654,970
(44.41 %)
38,607
(3.43 %)
94 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
21,553
(1.54 %)
95 Commerson's wild potato (CGN18024_1 2023)
GCA_029007595.1
n/a 16,068
(2.21 %)
50,780
(10.49 %)
n/a 34.48
(99.99 %)
1
(0.01 %)
639
(100.00 %)
1,250,333
(70.08 %)
249,197
(3.97 %)
5,014,592
(38.92 %)
6,970
(0.46 %)
96 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
38,054
(5.05 %)
97 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1
37,046
(18.67 %)
14,152
(6.13 %)
28,640
(19.48 %)
n/a 37.74
(99.99 %)
66
(0.01 %)
76
(100.00 %)
129,836
(2.97 %)
80,188
(2.65 %)
1,248,248
(29.88 %)
22,935
(5.83 %)
98 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1
n/a 14,992
(4.28 %)
36,350
(16.84 %)
n/a 34.41
(99.99 %)
394
(0.01 %)
905
(99.99 %)
475,247
(5.76 %)
230,646
(4.36 %)
2,425,030
(37.74 %)
18,611
(3.41 %)
99 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
13,018
(1.79 %)
100 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
13,597
(2.11 %)
101 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1
51,464
(13.54 %)
14,443
(3.56 %)
31,633
(12.06 %)
n/a 33.20
(100.00 %)
n/a 14
(100.00 %)
516,010
(5.54 %)
234,395
(5.05 %)
2,319,259
(43.64 %)
12,926
(2.66 %)
102 common jujube (Junzao 2020)
GCA_001835785.2
n/a 14,443
(3.88 %)
30,773
(12.63 %)
n/a 32.95
(99.91 %)
222
(0.09 %)
155
(100.00 %)
478,087
(5.53 %)
206,042
(4.15 %)
2,222,289
(41.43 %)
11,860
(1.82 %)
103 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1
65,051
(8.85 %)
26,142
(3.49 %)
114,639
(23.87 %)
n/a 44.17
(100.00 %)
59
(0.00 %)
37
(100.00 %)
243,799
(1.41 %)
237,530
(2.79 %)
4,477,357
(31.45 %)
154,087
(19.32 %)
104 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
170,287
(2.39 %)
105 common tobacco (Basma Xanthi 2014)
GCA_000715095.1
n/a 29,103
(0.75 %)
200,375
(6.85 %)
n/a 38.98
(95.11 %)
468,375
(4.88 %)
1,111,920
(95.12 %)
1,199,550
(3.27 %)
1,359,905
(4.81 %)
24,590,709
(50.95 %)
205,873
(1.79 %)
106 common tobacco (K326 2023)
GCA_000715075.2
n/a 31,039
(0.78 %)
176,804
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
710
(0.00 %)
699
(100.00 %)
4,626,207
(84.12 %)
1,502,920
(6.71 %)
24,314,611
(56.69 %)
225,794
(1.93 %)
107 common tobacco (K326 2023)
GCF_000715075.1
116,106
(3.08 %)
31,018
(0.77 %)
176,913
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
712
(0.00 %)
701
(100.00 %)
1,205,229
(1.45 %)
1,502,955
(6.71 %)
24,316,152
(56.68 %)
225,863
(1.93 %)
108 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1
100,875
(3.08 %)
29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
204,914
(1.84 %)
109 common vetch (South Australia 2022)
GCA_021764765.1
n/a 17,420
(0.99 %)
77,140
(6.43 %)
n/a 35.62
(99.97 %)
5,823
(0.04 %)
18
(100.00 %)
708,538
(2.24 %)
719,430
(5.37 %)
8,370,861
(57.87 %)
32,513
(0.96 %)
110 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
20,674
(1.12 %)
111 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3
56,406
(8.63 %)
16,303
(2.05 %)
63,990
(13.73 %)
n/a 34.91
(95.70 %)
26,066
(4.30 %)
28,407
(95.70 %)
743,470
(3.99 %)
393,077
(5.53 %)
4,897,193
(34.87 %)
16,140
(0.90 %)
112 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
31,946
(0.61 %)
113 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,134
(6.02 %)
37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
35,220
(0.59 %)
114 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
10,926
(0.55 %)
115 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,588
(10.55 %)
16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
24,507
(2.34 %)
116 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
13,714
(2.69 %)
117 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
5,730
(1.35 %)
118 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1
n/a 14,128
(1.63 %)
42,460
(7.33 %)
n/a 30.78
(99.98 %)
2,018
(0.02 %)
668
(100.00 %)
377,357
(3.69 %)
183,159
(2.82 %)
5,560,199
(36.58 %)
30,878
(2.75 %)
119 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1
n/a 13,933
(1.63 %)
40,035
(6.93 %)
n/a 30.80
(99.98 %)
1,977
(0.02 %)
667
(100.00 %)
373,612
(3.67 %)
181,531
(2.84 %)
5,483,268
(36.45 %)
30,829
(2.75 %)
120 currant tomato (LA2093 2020)
GCA_014964335.1
n/a 15,541
(2.01 %)
39,725
(7.40 %)
n/a 34.48
(99.94 %)
373
(0.06 %)
127
(100.00 %)
369,651
(3.79 %)
256,146
(4.80 %)
5,523,685
(41.09 %)
32,203
(2.29 %)
121 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
48,987
(3.05 %)
122 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
89,481
(12.47 %)
123 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
62,332
(7.21 %)
124 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,290
(8.05 %)
15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
41,402
(3.02 %)
125 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1
193,799
(12.81 %)
52,060
(3.07 %)
144,859
(15.37 %)
n/a 39.78
(99.99 %)
219
(0.01 %)
1,085
(100.00 %)
713,274
(2.40 %)
840,280
(6.39 %)
4,419,734
(51.60 %)
203,906
(13.78 %)
126 domesticated barley (Golden Promise 2019)
GCA_902500625.1
n/a 17,386
(0.43 %)
252,520
(9.04 %)
n/a 44.38
(97.83 %)
621,008
(2.23 %)
8
(100.00 %)
3,098,901
(53.34 %)
2,055,561
(5.88 %)
14,404,046
(70.52 %)
706,795
(16.04 %)
127 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,364
(1.67 %)
17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
732,834
(17.24 %)
128 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
56,957
(6.23 %)
129 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1
n/a 32,523
(0.34 %)
530,488
(8.17 %)
n/a 46.01
(98.73 %)
330,230
(1.28 %)
330,244
(98.72 %)
2,723,974
(3.46 %)
2,746,444
(3.02 %)
330,244
(98.72 %)
2,108,395
(25.96 %)
130 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
7,570
(0.50 %)
131 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1
n/a 34,754
(1.95 %)
231,748
(22.13 %)
n/a 46.97
(99.99 %)
1,574
(0.01 %)
1,588
(99.99 %)
587,262
(1.41 %)
551,392
(2.62 %)
9,678,348
(46.32 %)
398,884
(36.81 %)
132 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1
n/a 57,092
(4.66 %)
139,785
(17.31 %)
n/a 33.78
(99.95 %)
104
(0.05 %)
182
(99.95 %)
665,897
(3.33 %)
561,368
(7.98 %)
6,809,885
(45.67 %)
31,360
(1.27 %)
133 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,211
(8.60 %)
15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
21,654
(2.15 %)
134 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
24,028
(1.83 %)
135 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1
n/a 12,903
(3.20 %)
33,445
(14.99 %)
n/a 33.08
(99.96 %)
983
(0.04 %)
625
(100.00 %)
891,822
(54.95 %)
181,416
(3.89 %)
2,376,097
(36.79 %)
4,821
(0.53 %)
136 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1
42,218
(10.92 %)
14,784
(3.18 %)
46,293
(16.46 %)
n/a 36.73
(100.00 %)
96
(0.00 %)
15
(100.00 %)
433,802
(3.92 %)
270,411
(4.15 %)
2,634,547
(36.26 %)
29,535
(3.72 %)
137 eudicot A.graveolens (Ventura 2020)
GCA_009905375.1
n/a 17,520
(0.48 %)
115,295
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
4,633
(0.27 %)
4,852
(100.00 %)
1,247,334
(1.96 %)
1,423,238
(4.75 %)
11,040,179
(71.10 %)
31,499
(0.31 %)
138 eudicot C.lanceoleosa (SQ_2022a 2022)
GCA_025200525.1
n/a 21,858
(0.67 %)
153,069
(7.18 %)
n/a 37.63
(99.99 %)
2,949
(0.01 %)
790
(100.00 %)
4,031,259
(23.47 %)
2,174,993
(6.70 %)
18,920,250
(54.60 %)
200,005
(3.83 %)
139 eudicot C.lavandulifolium (G1 2022)
GCA_022545495.1
n/a 18,954
(0.61 %)
117,628
(6.04 %)
n/a 36.02
(99.96 %)
10,291
(0.04 %)
178
(100.00 %)
2,596,263
(19.70 %)
1,222,904
(3.44 %)
12,327,164
(55.80 %)
67,370
(0.88 %)
140 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1
47,822
(7.37 %)
14,132
(1.76 %)
52,606
(11.89 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
53
(0.00 %)
18
(100.00 %)
490,095
(3.26 %)
291,432
(3.68 %)
3,197,241
(60.23 %)
29,385
(2.13 %)
141 eudicot C.seticuspe (Gojo-0 2021)
GCA_019973895.1
n/a 17,958
(0.52 %)
141,880
(7.25 %)
n/a 36.23
(98.03 %)
37,176
(1.97 %)
45,671
(98.03 %)
3,118,877
(21.04 %)
1,512,311
(3.93 %)
10,481,296
(59.70 %)
63,123
(0.67 %)
142 eudicot D.spatulata (IRGN DVMQU6P362 2024)
GCA_035668315.1
n/a 16,707
(3.49 %)
62,287
(20.90 %)
n/a 37.76
(99.96 %)
1,083
(0.03 %)
24,058
(99.97 %)
274,473
(12.37 %)
110,623
(2.62 %)
2,103,310
(28.32 %)
22,076
(2.40 %)
143 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1
54,052
(4.78 %)
14,372
(1.33 %)
80,776
(14.35 %)
n/a 36.88
(100.00 %)
24
(0.00 %)
57
(100.00 %)
496,928
(2.45 %)
491,703
(4.75 %)
4,850,176
(50.53 %)
57,897
(3.26 %)
144 eudicot E.russellianum (2023)
GCA_036186865.1
n/a 18,823
(1.28 %)
96,845
(13.58 %)
n/a 37.91
(99.98 %)
26,521
(0.02 %)
100
(100.00 %)
1,526,493
(77.75 %)
539,134
(3.70 %)
6,307,362
(47.97 %)
31,022
(0.81 %)
145 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1
45,049
(8.43 %)
18,010
(3.03 %)
54,840
(15.32 %)
n/a 35.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
5,089
(100.00 %)
397,210
(3.11 %)
254,173
(4.10 %)
3,228,435
(42.44 %)
15,343
(0.97 %)
146 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1
51,602
(5.64 %)
14,506
(1.52 %)
55,054
(9.40 %)
n/a 37.18
(100.00 %)
411
(0.00 %)
133
(100.00 %)
397,610
(2.13 %)
326,774
(3.20 %)
4,120,854
(57.35 %)
63,233
(2.52 %)
147 eudicot M.micrantha (NLD-2019 2019)
GCA_009363875.1
n/a 19,940
(1.00 %)
96,066
(8.14 %)
n/a 36.20
(99.99 %)
1,599
(0.01 %)
2,815
(100.00 %)
908,702
(2.54 %)
980,385
(4.65 %)
9,286,677
(54.99 %)
89,410
(1.77 %)
148 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1
n/a 27,772
(0.99 %)
128,971
(6.28 %)
n/a 37.84
(100.00 %)
4
(0.00 %)
667
(100.00 %)
4,744,181
(80.09 %)
1,261,453
(5.53 %)
18,063,531
(49.81 %)
86,419
(1.62 %)
149 eudicot N.caerulescens (Cira 2024)
GCA_046127275.1
n/a 20,205
(8.11 %)
49,304
(30.44 %)
n/a 39.42
(99.99 %)
41
(0.01 %)
1,181
(100.00 %)
413,962
(43.41 %)
125,005
(11.92 %)
1,047,909
(36.93 %)
24,840
(5.52 %)
150 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1
61,645
(7.70 %)
19,490
(2.24 %)
62,769
(12.34 %)
n/a 37.11
(99.83 %)
1,024
(0.17 %)
1,225
(100.00 %)
314,817
(1.84 %)
291,276
(6.35 %)
3,964,714
(53.25 %)
61,424
(2.69 %)
151 eudicot P.frutescens var. frutescens (PF040 2021)
GCA_019511825.2
n/a 28,418
(2.15 %)
120,101
(15.79 %)
n/a 35.13
(99.99 %)
763
(0.01 %)
1,465
(100.00 %)
1,497,762
(21.02 %)
662,726
(4.46 %)
8,218,287
(43.32 %)
65,299
(2.16 %)
152 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1
55,830
(12.29 %)
19,054
(3.86 %)
48,657
(15.27 %)
n/a 35.65
(97.46 %)
31,613
(2.54 %)
21,121
(100.00 %)
195,798
(1.99 %)
128,140
(2.47 %)
2,568,483
(41.18 %)
16,399
(1.28 %)
153 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1
55,369
(16.07 %)
19,591
(4.65 %)
41,748
(16.14 %)
n/a 34.95
(99.99 %)
277
(0.01 %)
21
(100.00 %)
256,070
(2.83 %)
178,940
(8.44 %)
2,317,187
(40.87 %)
3,317
(6.62 %)
154 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2
48,620
(10.29 %)
16,779
(3.20 %)
47,438
(13.87 %)
n/a 35.62
(98.95 %)
566
(1.05 %)
1,034
(98.95 %)
245,672
(2.41 %)
239,601
(4.78 %)
2,887,505
(44.41 %)
44,689
(7.20 %)
155 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1
62,563
(15.19 %)
15,236
(3.45 %)
60,387
(23.53 %)
n/a 39.30
(99.95 %)
1,014
(0.05 %)
77
(100.00 %)
226,730
(2.23 %)
196,099
(4.12 %)
1,632,269
(33.79 %)
38,448
(5.69 %)
156 eudicot S.americanum (SP2273 SP2273 2023)
GCA_030463325.1
n/a 15,767
(1.56 %)
57,615
(9.26 %)
n/a 36.15
(100.00 %)
214
(0.00 %)
90
(100.00 %)
2,179,570
(59.21 %)
301,263
(3.51 %)
5,651,338
(51.90 %)
28,868
(1.00 %)
157 eudicot S.americanum (SP2275 SP2275 2023)
GCA_030463385.1
n/a 15,677
(1.56 %)
57,771
(9.32 %)
n/a 36.18
(100.00 %)
n/a 540
(100.00 %)
2,161,174
(59.26 %)
298,020
(3.34 %)
5,624,901
(52.02 %)
29,520
(1.04 %)
158 eudicot S.miltiorrhiza (Shanhuang shh 2023)
GCA_028751815.1
n/a 15,144
(2.60 %)
67,052
(21.48 %)
n/a 37.46
(99.58 %)
695
(0.42 %)
171
(100.00 %)
614,263
(17.32 %)
364,006
(5.05 %)
2,679,398
(42.13 %)
64,170
(6.16 %)
159 eudicot T.arvense (2022)
GCA_911865555.2
n/a 23,487
(5.55 %)
54,244
(16.93 %)
n/a 38.39
(100.00 %)
24
(0.00 %)
964
(100.00 %)
204,363
(1.86 %)
150,149
(5.58 %)
2,245,900
(50.03 %)
35,971
(3.77 %)
160 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1
n/a 29,137
(2.81 %)
89,605
(14.72 %)
n/a 35.15
(99.99 %)
102
(0.01 %)
596
(99.99 %)
664,293
(2.97 %)
503,960
(9.26 %)
5,715,446
(39.21 %)
22,264
(1.77 %)
161 eudicot V.rotundifolia (Noble 2022)
GCA_022557335.1
n/a 13,992
(3.39 %)
38,479
(14.93 %)
n/a 33.54
(99.82 %)
17,084
(0.19 %)
17,104
(99.81 %)
696,697
(51.55 %)
178,090
(4.22 %)
2,480,890
(32.65 %)
6,497
(0.70 %)
162 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
2,691
(0.38 %)
163 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1
49,645
(7.87 %)
15,653
(2.10 %)
61,041
(13.43 %)
n/a 35.42
(100.00 %)
65
(0.00 %)
13
(100.00 %)
595,120
(3.41 %)
355,816
(4.98 %)
4,680,964
(38.07 %)
20,075
(1.41 %)
164 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,800
(12.38 %)
22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
25,597
(2.08 %)
165 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1
39,203
(13.04 %)
15,600
(4.11 %)
42,096
(18.23 %)
n/a 35.90
(99.54 %)
14,532
(0.48 %)
12
(100.00 %)
358,479
(3.69 %)
179,807
(3.40 %)
2,234,313
(32.05 %)
12,963
(1.47 %)
166 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1
72,613
(2.92 %)
14,868
(0.56 %)
135,918
(7.87 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
129
(0.00 %)
319
(100.00 %)
1,077,704
(2.26 %)
853,368
(5.27 %)
13,477,464
(61.64 %)
152,063
(4.18 %)
167 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
81,500
(2.36 %)
168 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1
n/a 12,110
(0.01 %)
960,545
(1.07 %)
n/a 31.25
(100.00 %)
6,368
(0.00 %)
5,951
(100.00 %)
61,111,090
(11.87 %)
29,667,857
(2.75 %)
11,464
(100.00 %)
1,680,995
(2.36 %)
169 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
32,235
(2.62 %)
170 fava bean (2023)
GCA_948472305.1
n/a 18,459
(0.14 %)
221,591
(2.78 %)
n/a 37.44
(100.00 %)
5,330
(0.00 %)
3,992
(100.00 %)
4,140,168
(2.97 %)
4,673,353
(13.95 %)
36,694,276
(79.21 %)
59,853
(0.73 %)
171 Fendler's bladderpod (2019)
GCA_900406525.1
n/a 29,791
(9.22 %)
82,813
(26.56 %)
n/a 34.83
(99.51 %)
109,570
(0.49 %)
209,502
(99.51 %)
193,365
(2.63 %)
165,270
(4.54 %)
2,180,278
(29.35 %)
8,339
(0.91 %)
172 Fendler's bladderpod (WCL-YS1 PI 610492 2024)
GCA_036630335.1
n/a 23,679
(9.84 %)
43,179
(26.89 %)
n/a 34.92
(96.38 %)
98,816
(3.75 %)
9,891
(100.00 %)
373,519
(23.21 %)
328,539
(16.37 %)
1,720,493
(26.70 %)
5,729
(0.77 %)
173 field dodder (2020)
GCA_900332095.2
n/a 20,063
(4.21 %)
57,416
(19.19 %)
n/a 35.99
(94.55 %)
29,211
(5.47 %)
36,112
(94.53 %)
448,370
(12.07 %)
208,393
(3.46 %)
2,648,975
(35.75 %)
35,117
(3.87 %)
174 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2
73,442
(34.55 %)
30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
24,895
(5.44 %)
175 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1
n/a 22,245
(5.38 %)
51,310
(16.10 %)
n/a 39.02
(99.92 %)
1,923
(0.08 %)
2,298
(100.00 %)
172,036
(1.52 %)
129,452
(6.55 %)
2,388,667
(53.91 %)
37,074
(4.98 %)
176 finger millet (KNE 796-S 2023)
GCA_032690845.1
n/a 31,097
(3.07 %)
140,467
(22.19 %)
n/a 43.87
(99.87 %)
142
(0.13 %)
674
(99.87 %)
1,168,206
(39.18 %)
229,202
(4.14 %)
4,910,934
(41.23 %)
205,561
(17.19 %)
177 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
325,103
(21.18 %)
178 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
27,883
(2.10 %)
179 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
78,297
(28.27 %)
180 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1
n/a 13,889
(0.88 %)
71,188
(7.43 %)
n/a 35.53
(99.95 %)
1,481
(0.05 %)
822
(100.00 %)
671,921
(2.91 %)
624,024
(4.46 %)
7,792,634
(47.85 %)
76,668
(3.16 %)
181 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
111,109
(6.80 %)
182 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4
69,048
(2.69 %)
16,407
(0.56 %)
105,654
(5.75 %)
n/a 37.92
(99.95 %)
384
(0.05 %)
93
(100.00 %)
1,192,578
(2.37 %)
1,282,344
(4.72 %)
12,843,881
(61.50 %)
160,781
(2.86 %)
183 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
105,766
(0.97 %)
184 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
41,032
(1.09 %)
185 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
9,731
(0.69 %)
186 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
398,512
(10.38 %)
187 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
12,198
(0.64 %)
188 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
881,849
(29.81 %)
189 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
928,327
(30.84 %)
190 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3
93,689
(2.58 %)
18,524
(0.46 %)
261,939
(10.44 %)
n/a 46.35
(99.97 %)
347
(0.03 %)
1,115
(100.00 %)
1,094,634
(1.42 %)
1,403,604
(6.42 %)
12,367,986
(72.90 %)
849,453
(31.38 %)
191 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,808
(4.35 %)
17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
66,433
(1.82 %)
192 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1
n/a 21,161
(2.89 %)
55,843
(11.78 %)
n/a 35.63
(99.99 %)
646
(0.01 %)
2,366
(99.99 %)
423,518
(2.92 %)
293,299
(3.76 %)
4,466,312
(33.71 %)
25,250
(1.74 %)
193 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
19,259
(1.41 %)
194 grain amaranth (AhG2s 2020)
GCA_000753965.2
n/a 13,698
(3.27 %)
34,546
(14.58 %)
n/a 32.99
(90.06 %)
7,031
(9.94 %)
1,567
(100.00 %)
217,772
(3.32 %)
181,251
(3.71 %)
2,391,775
(32.66 %)
4,425
(0.40 %)
195 great duckweed (2018)
GCA_900492545.1
n/a 10,264
(6.56 %)
16,841
(26.52 %)
n/a 42.27
(99.98 %)
84
(0.02 %)
20
(100.00 %)
96,389
(3.49 %)
54,278
(2.54 %)
843,136
(22.61 %)
18,978
(24.35 %)
196 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
19,057
(20.99 %)
197 green algae (1602 2018)
GCA_002245835.2
n/a 770
(0.70 %)
5,466
(68.75 %)
n/a 63.95
(100.00 %)
n/a 159
(100.00 %)
62,109
(5.65 %)
29,993
(4.25 %)
581,123
(37.15 %)
127
(97.30 %)
198 green algae (18125 2025)
GCA_048595725.1
n/a 865
(2.16 %)
3,109
(76.75 %)
n/a 67.78
(100.00 %)
n/a 55
(100.00 %)
35,578
(6.99 %)
19,197
(3.61 %)
216,318
(31.95 %)
54
(99.88 %)
199 green algae (211/11P 2022)
GCA_023343905.1
n/a 1,009
(1.60 %)
4,892
(65.40 %)
n/a 61.60
(98.43 %)
12
(1.57 %)
57
(98.43 %)
48,271
(5.94 %)
22,435
(3.81 %)
358,729
(31.71 %)
405
(96.46 %)
200 green algae (ATCC 16529 2021)
GCA_016906385.1
n/a 748
(2.62 %)
2,222
(71.29 %)
n/a 64.15
(97.91 %)
6,559
(2.25 %)
19
(100.00 %)
268
(0.10 %)
2,320
(1.18 %)
110,762
(22.64 %)
29
(99.25 %)
201 green algae (CCAP 19/42 2023)
GCA_031753455.1
n/a 1,362
(0.45 %)
15,767
(32.44 %)
n/a 49.19
(100.00 %)
n/a 300
(100.00 %)
442,436
(43.24 %)
171,808
(11.44 %)
978,912
(31.81 %)
10,820
(2.10 %)
202 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4
10,237
(66.85 %)
988
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
37,284
(8.77 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
43
(99.34 %)
203 green algae (HMC1 2018)
GCA_003255715.1
n/a 1,000
(1.89 %)
7,921
(69.96 %)
n/a 62.97
(97.56 %)
2,472
(2.45 %)
3,774
(100.00 %)
10,519
(1.96 %)
4,558
(1.31 %)
172,635
(22.08 %)
3,978
(96.84 %)
204 green algae (JCM 15793 2018)
GCA_002897115.2
n/a 1,087
(3.87 %)
3,215
(73.44 %)
n/a 61.27
(98.39 %)
10,986
(1.68 %)
46
(100.00 %)
8,982
(1.85 %)
3,745
(0.85 %)
119,487
(14.35 %)
79
(99.57 %)
205 green algae (JCM 9641 2017)
GCA_002794665.1
n/a 928
(3.73 %)
2,196
(76.87 %)
n/a 73.37
(97.42 %)
12,055
(2.67 %)
27
(100.00 %)
15,929
(5.38 %)
7,990
(2.29 %)
164,687
(38.62 %)
30
(99.90 %)
206 green algae (KO-2023 2023)
GCA_030272585.1
n/a 1,751
(1.39 %)
15,265
(40.46 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
60,131
(4.76 %)
34,318
(3.34 %)
393,810
(24.33 %)
19,071
(23.42 %)
207 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1
n/a 2,016
(0.62 %)
31,585
(41.01 %)
n/a 57.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,614
(100.00 %)
183,076
(3.30 %)
101,860
(5.85 %)
972,524
(32.54 %)
4,760
(98.23 %)
208 green algae (RCC4221 2014)
GCA_000214015.2
n/a 1,108
(6.57 %)
3,692
(76.52 %)
n/a 59.39
(99.94 %)
477
(0.07 %)
20
(100.00 %)
8,604
(3.92 %)
4,944
(2.18 %)
102,578
(28.06 %)
20
(99.94 %)
209 green algae (SAG 2063 2018)
GCA_003613005.1
n/a 869
(2.13 %)
9,821
(78.63 %)
n/a 67.62
(98.00 %)
579
(1.95 %)
7,535
(98.05 %)
35,537
(6.91 %)
19,692
(3.56 %)
218,412
(30.60 %)
6,958
(98.59 %)
210 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1
n/a 1,365
(1.08 %)
11,070
(58.24 %)
n/a 55.95
(98.44 %)
780
(1.56 %)
597
(100.00 %)
25,537
(1.66 %)
27,257
(3.92 %)
365,387
(19.48 %)
3,732
(86.39 %)
211 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
604
(53.91 %)
212 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,904
(82.34 %)
1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
7
(0.01 %)
213 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
166
(99.31 %)
214 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
92
(46.06 %)
215 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
11,329
(19.64 %)
216 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
756
(45.48 %)
217 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
8,698
(83.31 %)
218 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
10,137
(72.46 %)
1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
10
(25.23 %)
219 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
7,776
(96.69 %)
220 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
32
(47.70 %)
221 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
12
(61.27 %)
222 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
16
(57.14 %)
223 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,333
(21.46 %)
1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
4,325
(42.65 %)
224 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,094
(16.56 %)
14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
21,835
(6.05 %)
225 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
75,497
(29.44 %)
226 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2
43,377
(14.56 %)
17,909
(5.15 %)
60,312
(30.80 %)
n/a 46.17
(99.96 %)
14
(0.04 %)
40
(99.96 %)
117,054
(1.49 %)
121,212
(2.84 %)
1,685,787
(29.32 %)
75,777
(29.49 %)
227 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1
n/a 18,040
(5.19 %)
61,671
(31.38 %)
n/a 45.99
(100.00 %)
54
(0.00 %)
63
(100.00 %)
105,738
(1.38 %)
87,424
(2.22 %)
1,777,815
(26.85 %)
74,932
(30.30 %)
228 guar (PI 68867901 SD 2022)
GCA_026586085.1
n/a 16,149
(3.62 %)
40,368
(13.76 %)
n/a 32.74
(100.00 %)
n/a 627
(100.00 %)
724,179
(25.31 %)
196,353
(10.67 %)
2,757,251
(41.21 %)
9,690
(0.94 %)
229 guar (short-day 2024)
GCA_037177725.1
n/a 16,198
(3.33 %)
43,918
(13.95 %)
n/a 33.41
(100.00 %)
24
(0.00 %)
237
(100.00 %)
813,394
(29.89 %)
243,439
(13.12 %)
2,549,208
(42.63 %)
10,217
(1.78 %)
230 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
15,323
(1.42 %)
231 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2
n/a 16,562
(0.53 %)
72,911
(2.91 %)
n/a 34.88
(98.35 %)
196,261
(1.66 %)
87,978
(100.00 %)
1,136,015
(1.95 %)
1,019,921
(4.33 %)
22,445,162
(47.06 %)
20,737
(0.24 %)
232 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
43,665
(1.21 %)
233 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
102,278
(32.16 %)
234 Hawaiian beggarticks (Kalapana, Puna primary hap 2024)
GCF_021521415.1
100,198
(3.70 %)
41,058
(1.06 %)
207,532
(8.30 %)
n/a 37.08
(100.00 %)
n/a 15,833
(100.00 %)
2,024,684
(2.90 %)
1,837,742
(5.29 %)
17,556,257
(56.19 %)
201,310
(3.34 %)
235 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,392
(7.39 %)
16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
16,291
(1.13 %)
236 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1
n/a 11,782
(0.08 %)
129,658
(1.42 %)
n/a 36.91
(99.99 %)
11,130
(0.01 %)
150
(100.00 %)
2,861,102
(1.57 %)
2,476,232
(2.57 %)
65,436,741
(53.97 %)
157,149
(0.72 %)
237 horseweed
GCF_010389155.1
39,622
(11.54 %)
14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
5,205
(0.40 %)
238 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
5,438
(1.06 %)
239 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
13,298
(2.56 %)
240 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
12,534
(1.92 %)
241 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
20,367
(2.62 %)
242 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
20,561
(3.01 %)
243 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
23,270
(1.88 %)
244 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
7,808
(1.87 %)
245 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1
80,727
(1.01 %)
14,175
(0.13 %)
225,166
(3.69 %)
n/a 36.42
(99.98 %)
3,031
(0.02 %)
2,699
(100.00 %)
2,873,672
(2.01 %)
4,198,037
(4.24 %)
5,730
(99.98 %)
71,102
(1.16 %)
246 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,979
(8.37 %)
16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
77,860
(10.47 %)
247 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1
55,725
(16.73 %)
16,338
(4.37 %)
54,077
(25.00 %)
n/a 43.72
(100.00 %)
4
(0.00 %)
15
(100.00 %)
196,712
(2.76 %)
141,936
(4.82 %)
1,727,479
(35.05 %)
63,894
(25.90 %)
248 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1
n/a 16,562
(4.59 %)
53,878
(24.77 %)
n/a 43.61
(98.95 %)
474
(1.05 %)
476
(98.95 %)
494,831
(50.75 %)
141,079
(3.52 %)
1,728,936
(33.69 %)
64,216
(25.20 %)
249 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1
53,454
(17.22 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
63,485
(25.25 %)
250 jewel orchid monocots (Aro_GA 2025)
GCA_051820535.1
n/a 41,719
(0.73 %)
293,147
(8.18 %)
n/a 39.10
(100.00 %)
283
(0.00 %)
3,452
(100.00 %)
3,539,676
(12.83 %)
1,885,641
(6.09 %)
19,476,248
(61.01 %)
583,795
(7.68 %)
251 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,756
(10.39 %)
13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
5,914
(1.27 %)
252 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
60,198
(24.06 %)
253 lamb's quarters (primary hap 2023)
GCA_948465745.1
n/a 32,598
(1.94 %)
125,993
(12.58 %)
n/a 36.17
(100.00 %)
67
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,407,940
(63.57 %)
996,815
(6.91 %)
7,383,118
(51.29 %)
84,154
(2.40 %)
254 large cranberry (Ben Lear CNJ99-125-1 inbred clone 2014)
GCA_000775335.2
n/a 14,225
(2.70 %)
66,262
(14.87 %)
n/a 37.74
(99.90 %)
1,390
(0.01 %)
201,496
(99.99 %)
201,938
(1.93 %)
136,145
(2.39 %)
2,755,676
(26.83 %)
12,815
(1.29 %)
255 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1
n/a 27,668
(4.03 %)
72,915
(18.34 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
136
(0.01 %)
624
(99.99 %)
382,061
(2.62 %)
254,813
(8.31 %)
3,593,274
(41.24 %)
14,758
(7.59 %)
256 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
30,057
(0.85 %)
257 liverwort (2024)
GCA_039105155.1
n/a 5,119
(1.70 %)
26,429
(24.22 %)
n/a 43.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
12
(100.00 %)
178,255
(36.35 %)
53,790
(2.08 %)
834,624
(30.68 %)
25,774
(29.87 %)
258 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3
n/a 16,254
(4.30 %)
54,135
(24.00 %)
n/a 43.62
(100.00 %)
n/a 13
(100.00 %)
204,282
(2.82 %)
143,681
(3.92 %)
1,729,033
(36.62 %)
65,538
(25.47 %)
259 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,526
(28.52 %)
25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
8,053
(2.48 %)
260 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
18,956
(1.40 %)
261 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
4,827
(0.29 %)
262 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot FGT_2020_1 2023)
GCA_028651295.1
n/a 12,929
(2.13 %)
34,499
(7.89 %)
n/a 33.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
174
(100.00 %)
560,407
(20.53 %)
306,275
(8.15 %)
3,716,838
(44.45 %)
6,827
(0.40 %)
263 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
107,342
(2.63 %)
264 maize
GCF_902167145.1
76,701
(3.66 %)
23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
372,641
(31.10 %)
265 maize (2020)
GCA_905067065.1
n/a 23,433
(1.61 %)
150,853
(10.66 %)
n/a 46.83
(98.14 %)
56,163
(1.87 %)
56,173
(98.13 %)
581,502
(1.40 %)
753,129
(3.49 %)
5,867,216
(67.88 %)
377,414
(31.33 %)
266 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1
n/a 23,680
(1.58 %)
153,453
(10.69 %)
n/a 46.83
(99.71 %)
1,223
(0.29 %)
697
(100.00 %)
593,292
(1.41 %)
805,647
(4.47 %)
5,887,178
(69.17 %)
370,755
(32.34 %)
267 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6
n/a 23,511
(1.62 %)
151,975
(10.84 %)
n/a 46.87
(98.56 %)
2,523
(1.44 %)
3,128
(98.56 %)
1,308,956
(78.59 %)
771,560
(3.39 %)
5,850,966
(67.94 %)
367,973
(32.21 %)
268 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1
n/a 23,864
(1.57 %)
154,358
(10.67 %)
n/a 46.77
(99.88 %)
551
(0.12 %)
777
(100.00 %)
1,341,834
(78.70 %)
834,042
(5.01 %)
5,916,520
(69.26 %)
372,114
(32.08 %)
269 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
41,044
(18.43 %)
270 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
7,059
(0.98 %)
271 Tausch's goatgrass monocots
GCF_002575655.2
84,334
(2.18 %)
17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
881,939
(30.07 %)
272 bulbous barley monocots (2017)
GCA_900070015.1
n/a 13,790
(0.81 %)
584,401
(17.92 %)
n/a 44.69
(99.26 %)
714,678
(0.49 %)
3,598,227
(99.51 %)
405,591
(2.31 %)
383,580
(1.94 %)
9,713,864
(28.00 %)
392,202
(11.97 %)
273 pearl millet monocots (2023)
GCA_947561735.1
n/a 17,702
(1.12 %)
131,056
(12.62 %)
n/a 49.54
(99.71 %)
154
(0.29 %)
161
(99.71 %)
2,363,767
(55.11 %)
562,150
(3.01 %)
6,046,063
(67.25 %)
78,069
(17.77 %)
274 least duckweed monocots (lm5633 2022)
GCA_024174645.1
n/a 10,209
(2.40 %)
33,920
(14.90 %)
n/a 39.23
(99.63 %)
2,722
(0.38 %)
2,381
(100.00 %)
339,295
(20.82 %)
149,186
(3.14 %)
1,958,662
(44.97 %)
37,690
(12.52 %)
275 coastal wild rice monocots (Oco-Bangladesh 2023)
GCA_030770085.1
n/a 22,601
(4.02 %)
78,799
(21.93 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
13
(0.00 %)
450
(100.00 %)
708,554
(36.63 %)
97,691
(2.08 %)
2,711,269
(26.55 %)
87,312
(19.47 %)
276 mosses
GCF_000002425.4
55,044
(11.86 %)
8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
22,664
(3.06 %)
277 mosses (Gransden 2004 2024)
GCA_000002425.3
n/a 8,471
(1.47 %)
30,401
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
1,792
(0.96 %)
357
(100.00 %)
296,167
(2.79 %)
242,589
(2.68 %)
2,405,125
(52.64 %)
22,652
(3.11 %)
278 mosses (MN 2022)
GCA_021442195.1
n/a 8,227
(1.65 %)
29,076
(15.54 %)
n/a 36.47
(99.90 %)
38
(0.10 %)
74
(99.90 %)
202,616
(2.17 %)
147,367
(3.31 %)
2,577,180
(28.93 %)
12,940
(1.51 %)
279 mosses (SZ-1 2022)
GCA_026122775.1
n/a 8,528
(1.45 %)
30,650
(12.43 %)
n/a 33.77
(100.00 %)
29
(0.00 %)
26
(100.00 %)
300,802
(2.82 %)
246,537
(2.86 %)
2,464,328
(53.57 %)
23,310
(3.24 %)
280 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
20,490
(3.43 %)
281 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
13,975
(1.49 %)
282 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
47,062
(10.58 %)
13,502
(2.95 %)
32,332
(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
239
(0.01 %)
1,310
(100.00 %)
282,171
(3.23 %)
229,959
(11.70 %)
2,016,709
(43.94 %)
18,232
(10.96 %)
283 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
12,855
(1.38 %)
284 Nalta jute (JRO-524 2017)
GCA_002141455.1
n/a 15,450
(3.86 %)
57,930
(23.73 %)
n/a 36.82
(99.97 %)
n/a 52,373
(100.00 %)
189,007
(2.22 %)
129,697
(4.38 %)
1,872,307
(38.03 %)
11,963
(5.74 %)
285 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1
35,080
(19.76 %)
14,109
(6.33 %)
27,978
(20.09 %)
n/a 37.69
(100.00 %)
n/a 15
(100.00 %)
124,433
(3.10 %)
69,868
(2.56 %)
1,208,522
(27.94 %)
21,007
(5.28 %)
286 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
6,462
(0.46 %)
287 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
20,667
(1.81 %)
288 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
67,521
(1.21 %)
289 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
56,900
(2.34 %)
290 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
31,179
(1.22 %)
291 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1
120,534
(4.81 %)
39,902
(1.95 %)
276,967
(16.36 %)
n/a 45.32
(99.56 %)
4,932
(0.44 %)
2,420
(100.00 %)
764,083
(1.38 %)
810,723
(3.95 %)
11,118,925
(53.40 %)
520,091
(23.03 %)
292 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
21,200
(2.95 %)
293 papaya (Sunset 2022)
GCA_022788785.1
n/a 13,725
(4.02 %)
25,348
(10.65 %)
n/a 36.01
(99.88 %)
337
(0.12 %)
67
(100.00 %)
385,123
(61.33 %)
131,783
(9.99 %)
2,029,883
(43.40 %)
25,597
(4.44 %)
294 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1
n/a 43,905
(2.21 %)
174,920
(14.40 %)
n/a 35.02
(93.97 %)
170,266
(6.06 %)
211,964
(93.94 %)
1,021,699
(2.86 %)
1,125,321
(8.02 %)
9,388,626
(47.60 %)
102,661
(4.26 %)
295 patchouli (shipai S1-5 2022)
GCA_023678885.1
n/a 47,432
(2.32 %)
168,583
(12.17 %)
n/a 34.43
(99.98 %)
764
(0.02 %)
966
(100.00 %)
2,043,616
(19.48 %)
1,147,892
(9.18 %)
9,501,180
(53.37 %)
110,140
(2.86 %)
296 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
7,885
(2.07 %)
297 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
140,570
(2.45 %)
298 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1
n/a 31,065
(1.17 %)
158,578
(8.79 %)
n/a 36.33
(98.97 %)
32,692
(1.04 %)
29
(100.00 %)
1,735,218
(3.66 %)
1,490,806
(4.26 %)
11,072,983
(61.75 %)
138,890
(2.46 %)
299 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3
173,169
(5.54 %)
31,897
(1.19 %)
160,532
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,697
(0.15 %)
443
(100.00 %)
1,676,149
(3.49 %)
1,489,126
(4.81 %)
11,105,477
(62.30 %)
140,609
(2.45 %)
300 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1
48,939
(13.04 %)
22,082
(4.44 %)
56,235
(17.69 %)
n/a 37.45
(99.99 %)
145
(0.01 %)
176
(99.99 %)
289,539
(2.54 %)
223,443
(3.84 %)
2,308,351
(35.91 %)
19,559
(2.15 %)
301 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
380,989
(29.47 %)
302 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
27,274
(2.22 %)
303 pepperwort (EHA205 2019)
GCA_009757365.2
n/a 19,770
(7.79 %)
48,832
(21.86 %)
n/a 34.40
(96.79 %)
105,378
(3.36 %)
146,054
(96.64 %)
298,974
(31.14 %)
68,767
(2.63 %)
1,422,489
(26.49 %)
6,844
(1.17 %)
304 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
542,998
(24.23 %)
305 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2
81,335
(3.75 %)
17,678
(0.79 %)
172,584
(12.06 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
61
(0.00 %)
105
(100.00 %)
610,404
(1.37 %)
758,029
(5.51 %)
5,039,192
(69.30 %)
542,208
(23.92 %)
306 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
10,912
(0.59 %)
307 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,582
(8.69 %)
20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
10,481
(0.65 %)
308 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1
n/a 15,868
(1.22 %)
104,104
(13.39 %)
n/a 36.03
(91.65 %)
318,321
(8.39 %)
328,880
(91.61 %)
810,727
(3.49 %)
710,744
(4.84 %)
7,339,863
(41.43 %)
104,967
(3.98 %)
309 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
26,504
(2.90 %)
310 pineapple
GCF_001540865.1
43,025
(11.65 %)
13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
56,724
(11.73 %)
311 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
5,817
(2.14 %)
312 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
22,340
(1.78 %)
313 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,223
(10.98 %)
11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
24,561
(4.48 %)
314 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
26,506
(9.18 %)
315 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,754
(6.67 %)
16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
8,536
(0.30 %)
316 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
14,548
(1.32 %)
317 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
5,550
(0.22 %)
318 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,158
(7.63 %)
16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
9,851
(0.45 %)
319 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
12,944
(0.99 %)
320 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
12,316
(1.34 %)
321 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
11,812
(1.00 %)
322 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
12,792
(1.32 %)
323 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
12,226
(0.72 %)
324 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,846
(6.75 %)
16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
8,192
(0.47 %)
325 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1
69,821
(7.75 %)
19,604
(2.27 %)
61,800
(12.08 %)
n/a 36.89
(99.89 %)
1,710
(0.11 %)
541
(100.00 %)
310,321
(1.81 %)
229,404
(3.84 %)
4,409,199
(51.65 %)
40,094
(1.87 %)
326 proso millet (2018)
GCA_003046395.2
n/a 31,203
(4.33 %)
106,251
(25.92 %)
n/a 46.82
(98.02 %)
4,232
(1.98 %)
1,306
(100.00 %)
252,710
(1.48 %)
176,920
(3.16 %)
3,051,223
(41.53 %)
159,364
(32.38 %)
327 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
93,630
(2.98 %)
328 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,681
(20.53 %)
36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
25,972
(4.13 %)
329 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,744
(19.27 %)
57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
64,287
(5.62 %)
330 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,991
(17.51 %)
59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
60,082
(3.53 %)
331 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
6,474
(1.93 %)
332 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,715
(12.27 %)
15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
64,243
(6.17 %)
333 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,160
(1.59 %)
18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
975,234
(26.52 %)
334 redroot sage (bh2-7 2020)
GCA_016432925.1
n/a 15,208
(2.55 %)
68,573
(21.07 %)
n/a 37.68
(99.37 %)
2,815
(0.63 %)
1,118
(100.00 %)
628,541
(17.44 %)
380,078
(5.18 %)
2,710,697
(43.28 %)
66,987
(6.29 %)
335 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
31,789
(3.72 %)
336 rice bean (VRB3 2023)
GCA_029865625.1
n/a 18,823
(3.07 %)
63,430
(18.52 %)
n/a 34.56
(96.54 %)
4,440
(3.46 %)
232
(100.00 %)
1,016,591
(59.80 %)
384,326
(8.33 %)
3,318,479
(40.76 %)
30,562
(3.41 %)
337 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
16,828
(2.07 %)
338 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
11,055
(0.93 %)
339 robusta coffee (DH200=94 2014)
GCA_900059795.1
n/a 13,770
(2.74 %)
46,992
(16.51 %)
n/a 36.65
(82.89 %)
12,714
(17.11 %)
25,216
(82.89 %)
219,723
(2.15 %)
140,449
(2.62 %)
2,590,105
(28.19 %)
12,700
(1.66 %)
340 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
78,731
(7.66 %)
341 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
79,393
(6.54 %)
342 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
42,560
(0.89 %)
343 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,258
(4.21 %)
22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
24,263
(0.70 %)
344 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,124
(5.23 %)
22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
13,573
(0.45 %)
345 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,414
(12.61 %)
31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
105,227
(10.14 %)
346 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
40,599
(2.68 %)
347 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
15,272
(3.87 %)
348 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
140,800
(5.87 %)
349 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
129,512
(5.41 %)
350 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
105,216
(10.11 %)
351 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
55,685
(7.69 %)
352 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
9,873
(1.80 %)
353 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1
n/a 16,242
(4.30 %)
39,583
(17.06 %)
n/a 35.22
(98.66 %)
2,946
(1.35 %)
1,451
(100.00 %)
253,228
(3.98 %)
186,657
(9.89 %)
1,792,662
(45.14 %)
19,928
(3.29 %)
354 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
44,191
(5.74 %)
355 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
43,290
(7.15 %)
356 silver poplar
GCF_005239225.1
53,066
(14.64 %)
20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
4,613
(0.67 %)
357 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,734
(15.21 %)
13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
14,711
(4.52 %)
358 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
110,115
(18.82 %)
359 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
109,923
(19.06 %)
360 soybean (EMBRAPA BRS 537 2021)
GCA_012273815.2
n/a 27,746
(3.01 %)
77,617
(11.66 %)
n/a 34.80
(97.95 %)
340
(2.05 %)
95
(100.00 %)
1,182,211
(56.35 %)
444,701
(6.81 %)
5,365,860
(45.98 %)
35,684
(1.48 %)
361 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,006
(9.87 %)
27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
35,893
(1.55 %)
362 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1
n/a 27,960
(2.93 %)
77,762
(11.36 %)
n/a 35.02
(100.00 %)
n/a 20
(100.00 %)
549,577
(2.73 %)
453,208
(9.60 %)
5,325,393
(48.31 %)
36,641
(1.53 %)
363 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
29,313
(6.47 %)
364 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,411
(5.75 %)
12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
89,520
(4.54 %)
365 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,433
(7.11 %)
12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
92,256
(5.21 %)
366 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
21,718
(3.89 %)
367 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5
52,765
(10.63 %)
8,496
(1.48 %)
30,423
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
1,794
(0.96 %)
359
(100.00 %)
293,130
(2.79 %)
242,633
(2.68 %)
2,405,680
(52.61 %)
22,672
(3.11 %)
368 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
48,209
(34.43 %)
369 strawberry (Benihoppe 2023)
GCA_034370585.1
n/a 45,858
(5.68 %)
123,100
(24.81 %)
n/a 39.34
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
934,221
(35.80 %)
376,936
(6.46 %)
3,304,328
(31.01 %)
69,530
(5.73 %)
370 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
64,180
(3.80 %)
371 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1
n/a 18,847
(4.51 %)
76,529
(27.07 %)
n/a 45.11
(99.96 %)
1,423
(0.03 %)
7,128
(99.97 %)
258,594
(29.31 %)
144,716
(2.51 %)
1,976,510
(35.41 %)
113,324
(26.96 %)
372 sugarcane (CC_01_1940 2021)
GCA_020102875.1
n/a 25,299
(3.45 %)
146,261
(29.51 %)
n/a 45.01
(99.92 %)
7,046
(0.08 %)
35,074
(100.00 %)
302,307
(1.66 %)
272,248
(3.71 %)
4,068,281
(29.60 %)
204,656
(25.44 %)
373 sugarcane (SP80-3280 WGSA1 2019)
GCA_008692665.1
n/a 78,903
(2.31 %)
756,432
(27.56 %)
n/a 43.71
(99.98 %)
36
(0.00 %)
398,389
(100.00 %)
1,981,854
(25.32 %)
926,250
(3.55 %)
15,903,748
(41.06 %)
829,054
(16.97 %)
374 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
9,956
(2.27 %)
375 sweet cherry (Tieton 2020)
GCA_014155035.1
n/a 15,140
(4.31 %)
39,977
(20.09 %)
n/a 38.44
(99.98 %)
2,194
(0.02 %)
61
(100.00 %)
189,726
(2.51 %)
150,018
(21.96 %)
1,231,274
(44.86 %)
12,897
(3.14 %)
376 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
6,540
(0.93 %)
377 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
52,715
(3.15 %)
378 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1
n/a 22,279
(1.15 %)
121,694
(10.54 %)
n/a 35.34
(91.81 %)
275,710
(8.22 %)
314,564
(91.78 %)
856,470
(2.64 %)
970,252
(5.69 %)
7,570,175
(42.39 %)
29,072
(0.54 %)
379 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
213,249
(32.45 %)
380 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
54,125
(5.80 %)
381 Tasmanian pepperberry (RefF3 2024)
GCF_043159265.1
65,925
(7.32 %)
16,247
(1.53 %)
76,786
(13.23 %)
n/a 39.37
(100.00 %)
n/a 1,338
(100.00 %)
1,968,661
(26.22 %)
626,214
(13.70 %)
4,298,324
(45.52 %)
32,932
(4.92 %)
382 thale cress (Landsberg erecta 2016)
GCA_001651475.1
n/a 26,053
(33.97 %)
25,713
(36.19 %)
n/a 36.01
(98.51 %)
3,479
(1.50 %)
30
(100.00 %)
65,429
(14.19 %)
24,979
(1.85 %)
739,651
(21.49 %)
4,443
(1.81 %)
383 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,852
(40.10 %)
26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
4,601
(1.63 %)
384 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
6,893
(1.71 %)
385 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
174,838
(3.17 %)
386 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
118,807
(2.33 %)
387 tomato (2024)
GCF_036512215.1
59,947
(8.20 %)
15,474
(1.94 %)
40,638
(7.50 %)
n/a 35.17
(99.99 %)
166
(0.01 %)
14
(100.00 %)
333,077
(2.31 %)
259,232
(7.09 %)
5,402,596
(43.04 %)
31,740
(4.85 %)
388 tomato (Micro-Tom 2020)
GCA_012431665.1
n/a 15,607
(2.04 %)
39,981
(7.57 %)
n/a 34.32
(97.69 %)
1,323
(2.31 %)
391
(100.00 %)
433,628
(20.28 %)
248,928
(3.94 %)
5,440,564
(39.72 %)
31,891
(1.72 %)
389 tomato (Micro-Tom S9 2023)
GCA_030162295.1
n/a 15,496
(2.07 %)
38,799
(7.36 %)
n/a 34.40
(98.25 %)
32,234
(1.76 %)
165
(100.00 %)
1,028,324
(71.24 %)
249,749
(4.56 %)
5,384,286
(39.87 %)
27,343
(1.53 %)
390 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,958
(6.93 %)
15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
25,196
(1.27 %)
391 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
30,300
(3.29 %)
392 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
30,533
(2.95 %)
393 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,134
(4.11 %)
20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
27,646
(0.67 %)
394 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
28,949
(0.57 %)
395 trifoliate orange (ZK8 2021)
GCA_018350135.1
n/a 14,955
(4.81 %)
32,433
(16.97 %)
n/a 34.13
(99.99 %)
222
(0.01 %)
707
(99.99 %)
181,106
(2.67 %)
98,804
(3.46 %)
2,031,768
(34.51 %)
6,294
(1.72 %)
396 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
27,290
(3.24 %)
397 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1
40,834
(13.17 %)
18,067
(4.25 %)
53,196
(20.85 %)
n/a 37.76
(99.88 %)
4,668
(0.12 %)
7,139
(100.00 %)
169,406
(2.24 %)
191,181
(4.26 %)
2,052,731
(28.24 %)
50,044
(9.42 %)
398 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,199
(16.33 %)
14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
6,824
(1.28 %)
399 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
19,628
(1.10 %)
400 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
6,470
(2.86 %)
401 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
6,436
(2.63 %)
402 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
13,094
(2.48 %)
403 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1
n/a 19,879
(3.81 %)
38,349
(12.06 %)
n/a 38.10
(100.00 %)
216
(0.00 %)
32
(100.00 %)
116,633
(1.34 %)
123,546
(2.75 %)
2,308,826
(51.78 %)
20,598
(2.37 %)
404 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2
n/a 13,387
(3.57 %)
27,414
(10.73 %)
n/a 33.57
(98.45 %)
245
(1.55 %)
113
(100.00 %)
292,830
(3.56 %)
169,773
(2.91 %)
2,260,362
(43.24 %)
14,898
(1.47 %)
405 watermelon (Charleston Gray 2019)
GCA_004801215.2
n/a 13,662
(3.47 %)
28,811
(10.60 %)
n/a 33.52
(94.83 %)
19,579
(5.18 %)
6,794
(100.00 %)
314,974
(3.65 %)
193,157
(4.04 %)
2,390,687
(41.95 %)
15,527
(1.38 %)
406 watermelon (Kordofan 2021)
GCA_018142915.1
n/a 13,494
(3.54 %)
27,976
(10.71 %)
n/a 33.60
(100.00 %)
47
(0.00 %)
33
(100.00 %)
780,860
(60.44 %)
173,577
(3.01 %)
2,295,095
(44.07 %)
15,356
(1.51 %)
407 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
21,741
(0.93 %)
408 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1
n/a 22,395
(3.96 %)
101,555
(33.88 %)
n/a 45.70
(99.78 %)
2,245
(0.22 %)
1,143
(100.00 %)
206,645
(1.57 %)
174,457
(2.79 %)
2,244,665
(26.11 %)
117,743
(29.88 %)
409 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1
89,156
(3.16 %)
15,292
(0.51 %)
135,024
(8.39 %)
n/a 38.77
(98.57 %)
827
(1.43 %)
720
(100.00 %)
1,158,845
(2.32 %)
1,353,517
(6.28 %)
10,836,475
(64.19 %)
161,610
(4.19 %)
410 white fonio (2020)
GCA_902806635.1
n/a 33,011
(5.39 %)
109,615
(30.77 %)
n/a 45.47
(97.23 %)
29,136
(2.79 %)
29,155
(97.21 %)
215,374
(1.42 %)
159,137
(1.91 %)
2,776,488
(28.15 %)
136,308
(27.74 %)
411 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1
n/a 21,959
(3.77 %)
51,652
(20.18 %)
n/a 36.92
(99.73 %)
1,764
(0.27 %)
3,171
(99.97 %)
215,169
(3.21 %)
247,660
(10.71 %)
2,556,478
(43.72 %)
14,520
(10.46 %)
412 white poplar (2024)
GCF_005239225.2
53,525
(15.07 %)
20,195
(4.72 %)
44,116
(16.35 %)
n/a 33.73
(99.86 %)
1,182
(0.14 %)
97
(100.00 %)
307,548
(3.27 %)
174,946
(4.79 %)
2,453,000
(38.39 %)
4,493
(0.61 %)
413 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1
n/a 19,540
(4.79 %)
41,183
(15.85 %)
n/a 34.67
(100.00 %)
2
(0.00 %)
21
(100.00 %)
265,758
(2.98 %)
150,154
(12.12 %)
2,138,699
(41.34 %)
3,578
(0.99 %)
414 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1
n/a 19,599
(4.60 %)
42,133
(16.21 %)
n/a 35.05
(100.00 %)
n/a 27
(100.00 %)
268,999
(2.93 %)
165,404
(12.23 %)
2,153,763
(42.62 %)
5,857
(2.24 %)
415 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
28,929
(2.37 %)
416 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,716
(15.60 %)
31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
29,995
(2.99 %)
417 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2
n/a 31,163
(6.66 %)
79,290
(25.04 %)
n/a 36.57
(98.21 %)
135
(1.79 %)
140
(100.00 %)
273,972
(2.76 %)
284,806
(6.41 %)
2,750,803
(38.77 %)
33,071
(3.37 %)
418 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
2,481
(0.48 %)
419 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
492,885
(96.69 %)
2,220,880
(25.34 %)
420 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
53,687
(8.28 %)
421 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
12,534
(0.42 %)
422 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
57,163
(6.21 %)
17,102
(1.68 %)
76,760
(11.48 %)
n/a 35.80
(88.03 %)
135,554
(12.02 %)
1,589
(100.00 %)
596,136
(3.37 %)
499,251
(3.39 %)
5,279,103
(45.94 %)
48,556
(1.91 %)
423 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
79,537
(2.58 %)
424 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
67,384
(5.06 %)
16,850
(1.28 %)
83,780
(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
14,157
(6.52 %)
30
(100.00 %)
767,054
(3.15 %)
754,355
(3.89 %)
5,146,558
(56.74 %)
71,885
(2.45 %)
425 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
37,183
(1.52 %)
426 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
25,210
(19.38 %)
13,996
(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
14,806
(3.21 %)
427 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1
n/a 67,698
(2.77 %)
385,590
(22.40 %)
n/a 44.92
(99.75 %)
76,230
(0.26 %)
15,303
(100.00 %)
1,015,234
(1.60 %)
910,932
(3.64 %)
10,425,387
(46.78 %)
637,314
(24.52 %)
428 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
19,639
(1.20 %)
429 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1
n/a 17,733
(2.85 %)
55,354
(14.76 %)
n/a 34.32
(99.33 %)
780
(0.67 %)
683
(100.00 %)
586,981
(35.31 %)
275,412
(4.57 %)
3,561,395
(35.28 %)
14,172
(0.96 %)
430 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
n/a 14,109
(3.33 %)
40,033
(15.32 %)
n/a 34.56
(97.67 %)
9,429
(2.34 %)
21
(100.00 %)
410,680
(35.69 %)
189,467
(4.45 %)
2,405,053
(34.36 %)
10,620
(1.04 %)
431 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1
46,430
(10.71 %)
14,823
(2.93 %)
44,674
(15.11 %)
n/a 35.08
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
310,377
(2.83 %)
242,451
(9.17 %)
2,706,407
(38.52 %)
11,751
(1.05 %)
432 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
11,591
(1.00 %)
433 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a 22,511
(18.61 %)
30,519
(28.94 %)
n/a 35.60
(90.69 %)
22,839
(9.35 %)
30,649
(90.65 %)
86,568
(2.39 %)
44,616
(2.78 %)
1,035,105
(23.86 %)
6,701
(1.74 %)
434 winter squash
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
12,619
(2.64 %)
435 wood tobacco
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
17,332
(0.82 %)
111,663
(7.17 %)
n/a 39.09
(92.17 %)
338,901
(7.84 %)
392,998
(92.16 %)
598,929
(1.44 %)
776,240
(4.57 %)
13,228,149
(49.11 %)
100,864
(1.49 %)
436 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
n/a 56,069
(8.51 %)
138,660
(27.88 %)
n/a 36.22
(79.66 %)
22,714
(20.35 %)
9,746
(100.00 %)
367,321
(2.38 %)
303,381
(3.03 %)
4,551,648
(26.34 %)
50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 436

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 602 assemblies assembly stats track stats
Mammals 715 assemblies assembly stats track stats
Birds 453 assemblies assembly stats track stats
Fishes 519 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 347 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1542 assemblies assembly stats track stats
Plants 436 assemblies assembly stats track stats
Fungi 3995 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15005 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2663 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21837 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5058 assemblies assembly stats track stats