Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1		 n/a 21,507
(2.72 %)		 60,050
(11.57 %)		 n/a 35.92
(99.97 %)		 2,344
(0.03 %)		 1,735
(100.00 %)		 430,950
(2.82 %)		 273,041
(3.10 %)		 4,895,011
(32.98 %)		 29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1		 71,407
(11.93 %)		 23,883
(3.45 %)		 59,407
(13.07 %)		 n/a 35.65
(99.64 %)		 710
(0.36 %)		 88
(100.00 %)		 430,287
(3.04 %)		 350,721
(4.29 %)		 3,875,064
(36.80 %)		 27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1		 40,475
(10.62 %)		 16,697
(3.71 %)		 47,542
(15.07 %)		 n/a 34.07
(96.37 %)		 21,264
(3.63 %)		 58,639
(96.37 %)		 257,290
(4.08 %)		 239,596
(6.43 %)		 2,925,469
(36.04 %)		 24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1		 50,883
(11.85 %)		 16,661
(3.75 %)		 45,945
(15.40 %)		 n/a 33.63
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 263,673
(3.52 %)		 264,113
(5.18 %)		 2,808,981
(37.65 %)		 20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1		 54,359
(4.64 %)		 16,693
(1.34 %)		 75,114
(9.09 %)		 n/a 37.42
(99.88 %)		 15,111
(0.12 %)		 14,905
(100.00 %)		 668,488
(2.42 %)		 511,720
(3.29 %)		 8,110,750
(42.79 %)		 50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1		 51,575
(5.06 %)		 16,948
(1.48 %)		 76,464
(9.29 %)		 n/a 37.21
(68.90 %)		 166,490
(31.14 %)		 202,468
(68.86 %)		 580,361
(3.63 %)		 445,124
(2.25 %)		 5,831,606
(30.77 %)		 75,576
(3.67 %)
7 African rice (2021)
GCF_000147395.1		 43,755
(15.95 %)		 16,224
(4.82 %)		 51,031
(25.64 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 178,763
(2.60 %)		 125,689
(4.18 %)		 1,761,585
(30.96 %)		 60,891
(21.37 %)
8 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1		 62,791
(10.08 %)		 25,423
(3.34 %)		 69,507
(14.55 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,087
(100.00 %)		 367,402
(2.31 %)		 175,862
(2.27 %)		 4,241,058
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
9 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2		 62,791
(10.08 %)		 25,443
(3.35 %)		 69,492
(14.56 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,085
(100.00 %)		 366,178
(2.25 %)		 175,852
(2.27 %)		 4,240,382
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
10 almond
GCF_902201215.1		 37,363
(19.64 %)		 14,509
(6.35 %)		 33,193
(24.70 %)		 n/a 37.65
(98.29 %)		 6,531
(1.72 %)		 1,700
(99.96 %)		 137,974
(2.59 %)		 100,386
(3.92 %)		 1,251,126
(26.07 %)		 10,893
(2.94 %)
11 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.1		 47,801
(11.07 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
12 annual mercury (primary hap 2022)
GCF_937616625.2		 44,356
(10.99 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
13 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1		 73,172
(3.41 %)		 26,626
(1.10 %)		 228,260
(15.00 %)		 n/a 44.76
(99.87 %)		 31,919
(0.13 %)		 1,764
(100.00 %)		 639,429
(1.31 %)		 739,566
(3.57 %)		 6,976,583
(59.37 %)		 560,429
(28.70 %)
14 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1		 64,918
(11.39 %)		 22,530
(3.52 %)		 67,146
(16.22 %)		 n/a 38.04
(88.96 %)		 7,264
(11.05 %)		 807
(100.00 %)		 692,611
(50.77 %)		 322,556
(4.41 %)		 3,055,836
(35.69 %)		 25,923
(1.76 %)
15 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1		 n/a 16,583
(4.58 %)		 55,248
(25.46 %)		 n/a 43.36
(99.98 %)		 696
(0.02 %)		 615
(100.00 %)		 495,126
(50.28 %)		 124,567
(3.20 %)		 1,922,072
(32.59 %)		 65,220
(23.87 %)
16 Barbados nut
GCF_014843425.1		 33,622
(13.80 %)		 12,687
(4.63 %)		 26,511
(14.56 %)		 n/a 33.40
(99.60 %)		 2,151
(0.40 %)		 1,232
(100.00 %)		 281,490
(24.82 %)		 186,260
(5.65 %)		 2,028,357
(33.33 %)		 8,868
(1.38 %)
17 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1		 50,905
(14.29 %)		 16,712
(3.68 %)		 41,041
(14.51 %)		 n/a 33.43
(99.87 %)		 22
(0.13 %)		 42
(100.00 %)		 393,909
(27.89 %)		 175,427
(3.92 %)		 2,532,494
(37.64 %)		 3,384
(0.27 %)
18 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3		 48,865
(15.69 %)		 16,549
(3.99 %)		 40,316
(15.41 %)		 n/a 33.14
(94.48 %)		 8,785
(5.53 %)		 8,027
(94.47 %)		 366,709
(22.34 %)		 146,748
(2.80 %)		 2,549,499
(32.46 %)		 3,695
(0.65 %)
19 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1		 n/a 16,672
(3.96 %)		 40,032
(15.19 %)		 n/a 33.05
(99.32 %)		 107
(0.68 %)		 909
(100.00 %)		 381,065
(23.82 %)		 162,402
(3.97 %)		 2,490,028
(35.39 %)		 3,335
(0.34 %)
20 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1		 n/a 15,063
(1.43 %)		 65,125
(11.47 %)		 n/a 40.34
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 735,552
(11.30 %)		 567,295
(6.87 %)		 4,176,675
(45.56 %)		 66,834
(4.90 %)
21 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1		 n/a 15,223
(1.43 %)		 65,769
(11.33 %)		 n/a 40.37
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 303
(100.00 %)		 744,623
(11.37 %)		 571,691
(7.15 %)		 4,217,655
(45.87 %)		 68,566
(4.96 %)
22 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1		 47,718
(9.45 %)		 11,911
(2.04 %)		 50,202
(16.78 %)		 n/a 35.86
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 42
(100.00 %)		 294,768
(3.41 %)		 341,699
(6.22 %)		 2,932,896
(35.20 %)		 25,364
(1.79 %)
23 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1		 45,481
(9.22 %)		 11,850
(2.05 %)		 49,071
(15.89 %)		 n/a 35.85
(94.03 %)		 3,200
(5.97 %)		 20
(100.00 %)		 290,870
(3.40 %)		 336,343
(5.76 %)		 2,901,079
(33.21 %)		 25,108
(1.67 %)
24 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1		 70,848
(2.17 %)		 15,922
(0.50 %)		 69,601
(2.75 %)		 n/a 34.91
(97.27 %)		 52,577
(2.73 %)		 81,202
(100.00 %)		 1,192,132
(1.94 %)		 1,097,384
(4.12 %)		 23,393,622
(47.64 %)		 19,517
(0.21 %)
25 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1		 n/a 13,887
(2.34 %)		 44,507
(14.12 %)		 n/a 37.97
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 2,350
(100.00 %)		 250,361
(2.10 %)		 231,118
(13.56 %)		 2,049,366
(44.58 %)		 22,527
(6.34 %)
26 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2		 n/a 15,102
(2.62 %)		 47,553
(15.64 %)		 n/a 38.11
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 272
(100.00 %)		 257,066
(2.22 %)		 226,514
(14.63 %)		 2,470,334
(38.37 %)		 21,415
(5.59 %)
27 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1		 57,539
(11.82 %)		 16,919
(2.98 %)		 64,687
(19.59 %)		 n/a 38.05
(99.97 %)		 1,625
(0.04 %)		 65
(100.00 %)		 236,645
(2.13 %)		 205,150
(5.19 %)		 2,202,942
(41.60 %)		 32,283
(3.44 %)
28 bitter melon
GCF_001995035.1		 31,725
(13.80 %)		 12,858
(4.62 %)		 30,539
(16.85 %)		 n/a 34.58
(92.32 %)		 109,310
(7.74 %)		 1,052
(100.00 %)		 162,837
(2.82 %)		 89,571
(2.03 %)		 1,951,167
(30.96 %)		 14,100
(2.00 %)
29 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1		 n/a 20,077
(4.66 %)		 43,061
(17.16 %)		 n/a 34.80
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 338
(100.00 %)		 267,110
(2.88 %)		 173,502
(6.32 %)		 2,366,759
(39.61 %)		 5,093
(4.11 %)
30 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1		 n/a 19,804
(4.58 %)		 42,642
(17.03 %)		 n/a 34.85
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 132
(100.00 %)		 265,925
(2.85 %)		 174,688
(6.70 %)		 2,359,101
(40.07 %)		 4,963
(4.10 %)
31 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5		 59,542
(15.92 %)		 19,969
(4.99 %)		 41,581
(16.22 %)		 n/a 33.75
(99.85 %)		 59
(0.15 %)		 106
(99.85 %)		 257,833
(2.91 %)		 156,371
(4.50 %)		 2,423,627
(36.28 %)		 3,761
(0.66 %)
32 black tea
GCF_004153795.1		 101,253
(3.17 %)		 20,982
(0.66 %)		 156,999
(7.69 %)		 n/a 37.85
(92.12 %)		 79,329
(7.89 %)		 14,028
(100.00 %)		 1,926,995
(3.23 %)		 2,024,420
(8.06 %)		 17,959,098
(50.75 %)		 181,027
(2.79 %)
33 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2		 46,173
(12.87 %)		 15,187
(3.49 %)		 50,585
(20.61 %)		 n/a 40.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 72
(100.00 %)		 494,434
(48.54 %)		 220,571
(4.98 %)		 1,866,530
(29.09 %)		 59,325
(10.76 %)
34 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3		 n/a 46,431
(0.31 %)		 805,204
(7.93 %)		 n/a 46.09
(99.87 %)		 211,982
(0.14 %)		 70,316
(100.00 %)		 9,191,325
(44.14 %)		 5,086,953
(4.53 %)		 282,298
(99.86 %)		 3,241,124
(28.06 %)
35 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1		 221,449
(1.62 %)		 n/a 763,380
(8.08 %)		 n/a 46.14
(98.27 %)		 214,799
(1.73 %)		 91,589
(100.00 %)		 8,660,189
(44.94 %)		 4,402,049
(3.94 %)		 306,386
(98.27 %)		 3,040,030
(27.48 %)
36 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1		 n/a n/a 751,576
(8.03 %)		 n/a 46.05
(98.12 %)		 693,028
(1.90 %)		 693,050
(98.10 %)		 8,420,935
(44.23 %)		 4,115,828
(3.69 %)		 693,050
(98.10 %)		 3,076,631
(26.41 %)
37 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1		 n/a n/a 773,766
(8.20 %)		 n/a 46.05
(100.00 %)		 1,407
(0.00 %)		 3,795
(100.00 %)		 8,703,192
(44.57 %)		 4,569,103
(5.20 %)		 5,202
(100.00 %)		 3,001,896
(28.00 %)
38 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1		 n/a 47,400
(0.34 %)		 778,134
(8.33 %)		 n/a 46.11
(99.87 %)		 7,376
(0.13 %)		 7,398
(99.87 %)		 14,835,099
(85.31 %)		 4,570,540
(5.40 %)		 7,395
(99.87 %)		 2,994,427
(28.25 %)
39 cacao
GCF_000208745.1		 34,727
(13.67 %)		 14,294
(4.65 %)		 29,216
(14.38 %)		 n/a 34.09
(94.31 %)		 11,787
(5.70 %)		 431
(100.00 %)		 206,049
(15.64 %)		 99,229
(2.66 %)		 1,933,579
(33.24 %)		 2,964
(0.34 %)
40 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1		 n/a 18,729
(3.22 %)		 57,374
(16.70 %)		 n/a 36.81
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 915
(100.00 %)		 421,731
(3.42 %)		 300,957
(5.54 %)		 2,794,242
(34.11 %)		 25,348
(3.39 %)
41 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1		 n/a 18,579
(3.26 %)		 56,295
(16.71 %)		 n/a 36.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 138
(100.00 %)		 414,129
(3.48 %)		 293,951
(5.95 %)		 3,055,420
(34.96 %)		 24,749
(4.05 %)
42 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1		 43,175
(7.78 %)		 16,377
(2.29 %)		 43,559
(11.38 %)		 n/a 36.31
(100.00 %)		 175
(0.00 %)		 706
(100.00 %)		 341,665
(12.46 %)		 223,217
(36.36 %)		 2,388,236
(58.00 %)		 26,535
(3.98 %)
43 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1		 n/a 16,153
(1.86 %)		 68,653
(14.03 %)		 n/a 35.79
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 783,798
(4.17 %)		 456,025
(10.87 %)		 4,951,918
(40.76 %)		 21,783
(2.16 %)
44 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1		 n/a 15,836
(1.90 %)		 66,803
(13.99 %)		 n/a 35.77
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 762,029
(4.24 %)		 448,099
(10.97 %)		 4,784,968
(41.07 %)		 20,384
(2.28 %)
45 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1		 n/a 18,838
(1.94 %)		 71,211
(13.84 %)		 n/a 33.78
(99.91 %)		 8,772
(0.10 %)		 147
(100.00 %)		 643,488
(3.49 %)		 361,843
(3.63 %)		 4,074,440
(56.52 %)		 27,745
(1.31 %)
46 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1		 n/a 10,725
(1.71 %)		 41,537
(11.41 %)		 n/a 33.68
(100.00 %)		 n/a 11,110
(100.00 %)		 396,112
(4.11 %)		 221,932
(3.23 %)		 2,389,229
(59.21 %)		 17,045
(1.23 %)
47 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2		 39,696
(6.07 %)		 13,883
(1.80 %)		 50,556
(11.19 %)		 n/a 33.51
(84.07 %)		 843
(15.93 %)		 1,052
(84.07 %)		 496,648
(3.63 %)		 258,281
(2.28 %)		 3,594,433
(47.71 %)		 22,750
(1.69 %)
48 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2		 n/a 24,975
(1.79 %)		 113,252
(15.69 %)		 n/a 34.00
(100.00 %)		 n/a 3,372
(100.00 %)		 936,351
(4.13 %)		 520,230
(3.65 %)		 5,183,602
(58.66 %)		 47,327
(1.58 %)
49 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1		 n/a 15,253
(1.67 %)		 62,228
(12.57 %)		 n/a 34.08
(100.00 %)		 n/a 1,599
(100.00 %)		 595,917
(3.95 %)		 335,791
(3.38 %)		 3,478,519
(61.18 %)		 31,738
(1.57 %)
50 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1		 n/a 15,334
(1.80 %)		 60,140
(12.83 %)		 n/a 33.79
(99.92 %)		 2,496
(0.09 %)		 483
(100.00 %)		 567,458
(3.73 %)		 320,455
(3.12 %)		 3,403,771
(58.38 %)		 27,791
(1.48 %)
51 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1		 57,769
(2.07 %)		 16,114
(0.55 %)		 62,579
(2.93 %)		 n/a 34.94
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,799
(96.77 %)		 968,939
(3.15 %)		 948,741
(4.39 %)		 21,535,213
(46.15 %)		 16,685
(0.21 %)
52 carrot
GCF_001625215.1		 51,773
(15.95 %)		 16,649
(3.96 %)		 50,187
(20.50 %)		 n/a 34.79
(91.77 %)		 26,112
(8.24 %)		 4,826
(100.00 %)		 179,630
(2.41 %)		 166,060
(4.97 %)		 1,981,148
(31.51 %)		 8,564
(0.85 %)
53 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2		 60,116
(15.29 %)		 16,679
(3.49 %)		 51,607
(18.82 %)		 n/a 34.97
(99.99 %)		 554
(0.01 %)		 11
(100.00 %)		 195,035
(2.33 %)		 186,941
(8.11 %)		 2,018,050
(39.61 %)		 10,319
(1.14 %)
54 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1		 n/a 27,737
(2.70 %)		 78,774
(11.79 %)		 n/a 37.13
(76.51 %)		 36,478
(23.50 %)		 4,440
(100.00 %)		 584,617
(3.41 %)		 554,162
(3.52 %)		 4,126,060
(43.14 %)		 77,570
(1.78 %)
55 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2		 56,386
(9.38 %)		 18,790
(2.86 %)		 49,944
(11.73 %)		 n/a 37.52
(99.61 %)		 672
(0.39 %)		 758
(99.61 %)		 377,964
(3.52 %)		 356,023
(4.79 %)		 2,560,255
(56.85 %)		 52,506
(2.50 %)
56 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1		 33,377
(11.52 %)		 13,874
(4.00 %)		 33,656
(13.67 %)		 n/a 33.84
(96.11 %)		 23,313
(3.90 %)		 49,406
(96.10 %)		 207,850
(3.52 %)		 166,467
(10.85 %)		 1,676,921
(43.19 %)		 12,838
(2.54 %)
57 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1		 39,358
(13.36 %)		 13,841
(4.31 %)		 29,805
(14.24 %)		 n/a 33.03
(99.95 %)		 331
(0.05 %)		 140
(100.00 %)		 205,974
(3.02 %)		 128,354
(6.37 %)		 1,998,066
(39.24 %)		 7,216
(0.99 %)
58 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1		 n/a 3
(0.11 %)		 117
(7.42 %)		 n/a 39.35
(99.99 %)		 4
(0.01 %)		 35
(100.00 %)		 1,139
(3.04 %)		 1,677
(4.92 %)		 11,074
(10.60 %)		 76
(1.07 %)
59 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1		 n/a 6,487
(0.16 %)		 114,999
(4.12 %)		 n/a 37.82
(62.87 %)		 490,371
(37.15 %)		 1,116,784
(62.85 %)		 692,892
(1.67 %)		 790,165
(1.22 %)		 18,073,193
(31.20 %)		 24,414
(0.46 %)
60 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1		 53,262
(17.46 %)		 17,642
(4.97 %)		 49,474
(23.85 %)		 n/a 36.14
(99.81 %)		 3,756
(0.19 %)		 1,556
(100.00 %)		 156,083
(2.30 %)		 128,904
(3.10 %)		 2,112,137
(31.93 %)		 31,157
(5.92 %)
61 chickpea
GCF_000331145.1		 41,971
(9.82 %)		 15,685
(3.16 %)		 30,411
(8.82 %)		 n/a 31.04
(90.95 %)		 31,897
(9.07 %)		 39,024
(90.93 %)		 339,564
(10.51 %)		 318,439
(11.48 %)		 2,929,750
(43.82 %)		 3,488
(0.28 %)
62 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2		 66,337
(12.31 %)		 15,432
(2.83 %)		 67,569
(21.71 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 53
(100.00 %)		 275,878
(2.26 %)		 229,333
(3.98 %)		 2,244,200
(35.17 %)		 37,317
(4.17 %)
63 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1		 n/a 23,898
(0.89 %)		 138,156
(8.52 %)		 n/a 40.10
(96.58 %)		 25,154
(3.42 %)		 35,781
(96.58 %)		 829,613
(1.78 %)		 1,793,985
(6.94 %)		 8,707,237
(62.53 %)		 317,707
(8.50 %)
64 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1		 n/a 13,666
(0.97 %)		 71,763
(9.04 %)		 n/a 35.33
(99.97 %)		 1,170
(0.03 %)		 1,621
(100.00 %)		 635,445
(2.92 %)		 599,600
(4.44 %)		 8,101,700
(44.90 %)		 75,475
(3.56 %)
65 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1		 54,029
(12.78 %)		 22,400
(4.38 %)		 57,140
(17.42 %)		 n/a 37.29
(97.86 %)		 24,384
(2.15 %)		 26,566
(97.85 %)		 368,808
(18.26 %)		 218,013
(4.36 %)		 2,456,496
(34.15 %)		 18,367
(1.88 %)
66 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1		 62,514
(13.83 %)		 22,289
(4.29 %)		 57,502
(17.16 %)		 n/a 37.35
(100.00 %)		 n/a 452
(100.00 %)		 290,077
(2.40 %)		 209,363
(3.56 %)		 2,519,627
(35.77 %)		 19,299
(1.84 %)
67 clementine
GCF_000493195.1		 36,454
(14.29 %)		 14,126
(4.66 %)		 32,820
(18.34 %)		 n/a 34.96
(97.94 %)		 7,564
(2.07 %)		 8,962
(97.93 %)		 178,443
(2.76 %)		 104,853
(5.57 %)		 1,933,079
(33.91 %)		 7,930
(3.80 %)
68 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1		 44,646
(5.40 %)		 15,784
(1.70 %)		 48,875
(7.66 %)		 n/a 35.83
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 105
(100.00 %)		 347,467
(1.98 %)		 290,488
(4.50 %)		 6,293,084
(43.53 %)		 8,929
(0.83 %)
69 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4		 49,382
(28.03 %)		 11,312
(4.28 %)		 36,277
(36.82 %)		 n/a 45.22
(98.15 %)		 4,395
(1.86 %)		 5,152
(98.14 %)		 138,958
(36.90 %)		 77,054
(2.71 %)		 802,227
(32.19 %)		 34,479
(27.80 %)
70 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1		 n/a 6,316
(4.02 %)		 55,013
(41.57 %)		 n/a 44.70
(99.81 %)		 351
(0.00 %)		 106,265
(100.00 %)		 29,218
(1.24 %)		 29,377
(1.67 %)		 480,195
(13.66 %)		 19,392
(13.60 %)
71 coffee C.arabica
GCF_003713225.1		 80,738
(8.03 %)		 23,574
(2.02 %)		 85,662
(13.32 %)		 n/a 36.94
(99.79 %)		 691
(0.21 %)		 2,833
(100.00 %)		 501,414
(2.11 %)		 386,209
(3.95 %)		 5,652,743
(41.66 %)		 36,398
(1.62 %)
72 coffee C.eugenioides
GCF_003713205.1		 43,829
(7.69 %)		 14,911
(2.02 %)		 57,408
(14.42 %)		 n/a 36.89
(97.92 %)		 3,482
(2.08 %)		 3,530
(100.00 %)		 312,360
(2.09 %)		 234,658
(3.24 %)		 3,464,594
(38.91 %)		 21,553
(1.54 %)
73 common bean
GCF_000499845.1		 32,720
(9.56 %)		 16,474
(3.53 %)		 45,055
(14.46 %)		 n/a 34.96
(90.70 %)		 40,860
(9.33 %)		 41,568
(90.67 %)		 233,709
(2.97 %)		 208,045
(3.61 %)		 2,886,693
(37.28 %)		 38,054
(5.05 %)
74 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1		 n/a 14,992
(4.28 %)		 36,350
(16.84 %)		 n/a 34.41
(99.99 %)		 394
(0.01 %)		 905
(99.99 %)		 475,247
(5.76 %)		 230,646
(4.36 %)		 2,425,030
(37.74 %)		 18,611
(3.41 %)
75 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1		 49,622
(12.72 %)		 14,929
(3.58 %)		 32,981
(12.20 %)		 n/a 33.07
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 538
(100.00 %)		 525,520
(5.43 %)		 225,151
(3.91 %)		 2,463,587
(42.86 %)		 13,018
(1.79 %)
76 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1		 49,976
(13.24 %)		 16,949
(3.79 %)		 38,488
(13.47 %)		 n/a 33.40
(95.35 %)		 24,158
(4.67 %)		 28,947
(95.33 %)		 525,525
(5.37 %)		 246,475
(5.25 %)		 2,603,240
(38.46 %)		 13,597
(2.11 %)
77 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1		 51,464
(13.54 %)		 14,443
(3.56 %)		 31,633
(12.06 %)		 n/a 33.20
(100.00 %)		 n/a 14
(100.00 %)		 516,010
(5.54 %)		 234,395
(5.05 %)		 2,319,259
(43.64 %)		 12,926
(2.66 %)
78 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1		 65,051
(8.85 %)		 26,142
(3.49 %)		 114,639
(23.87 %)		 n/a 44.17
(100.00 %)		 59
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 243,799
(1.41 %)		 237,530
(2.79 %)		 4,477,357
(31.45 %)		 154,087
(19.32 %)
79 common sunflower
GCF_002127325.2		 133,319
(3.74 %)		 19,514
(0.59 %)		 166,187
(9.16 %)		 n/a 38.59
(97.94 %)		 2,384
(2.06 %)		 334
(100.00 %)		 1,263,836
(2.20 %)		 1,549,598
(4.15 %)		 12,728,097
(58.39 %)		 170,287
(2.39 %)
80 common tobacco
GCF_000715135.1		 100,805
(3.09 %)		 29,968
(0.80 %)		 184,998
(7.05 %)		 n/a 38.95
(97.11 %)		 292,325
(2.90 %)		 292,601
(97.11 %)		 1,134,202
(3.09 %)		 1,268,208
(4.45 %)		 24,013,710
(52.08 %)		 204,914
(1.84 %)
81 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2		 53,587
(7.04 %)		 17,804
(1.85 %)		 77,741
(13.65 %)		 n/a 35.35
(97.95 %)		 25,649
(2.05 %)		 22,642
(100.00 %)		 860,049
(3.78 %)		 485,854
(6.14 %)		 5,989,180
(36.35 %)		 20,674
(1.12 %)
82 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3		 56,406
(8.63 %)		 16,303
(2.05 %)		 63,990
(13.73 %)		 n/a 34.91
(95.70 %)		 26,066
(4.30 %)		 28,407
(95.70 %)		 743,470
(3.99 %)		 393,077
(5.53 %)		 4,897,193
(34.87 %)		 16,140
(0.90 %)
83 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1		 112,410
(5.51 %)		 35,047
(1.61 %)		 101,814
(6.75 %)		 n/a 34.45
(97.16 %)		 48,742
(2.84 %)		 57,884
(97.16 %)		 829,774
(2.69 %)		 808,839
(3.64 %)		 12,556,104
(52.01 %)		 31,946
(0.61 %)
84 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1		 154,180
(6.02 %)		 37,839
(1.61 %)		 107,764
(6.56 %)		 n/a 34.36
(99.87 %)		 5,708
(0.13 %)		 6,735
(99.87 %)		 996,701
(2.36 %)		 903,817
(3.56 %)		 13,123,355
(54.75 %)		 35,220
(0.59 %)
85 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1		 72,590
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 86,941
(18.36 %)		 n/a 33.22
(98.25 %)		 19,717
(1.76 %)		 20,751
(98.24 %)		 367,610
(3.53 %)		 300,200
(3.32 %)		 5,199,574
(40.83 %)		 10,926
(0.55 %)
86 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2		 48,519
(10.54 %)		 16,925
(3.30 %)		 44,689
(13.01 %)		 n/a 32.95
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 676
(100.00 %)		 344,688
(3.92 %)		 283,941
(8.14 %)		 3,091,888
(41.66 %)		 24,507
(2.34 %)
87 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1		 49,636
(19.79 %)		 18,863
(6.83 %)		 34,588
(19.24 %)		 n/a 36.43
(97.43 %)		 13,813
(2.58 %)		 3,500
(100.00 %)		 181,838
(3.12 %)		 140,936
(7.42 %)		 1,550,544
(33.30 %)		 13,714
(2.69 %)
88 cucumber
GCF_000004075.3		 37,079
(18.45 %)		 13,349
(5.61 %)		 23,889
(15.73 %)		 n/a 32.84
(99.98 %)		 89
(0.02 %)		 88
(100.00 %)		 158,454
(3.72 %)		 77,247
(3.20 %)		 1,739,467
(33.72 %)		 5,730
(1.35 %)
89 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1		 n/a 14,128
(1.63 %)		 42,460
(7.33 %)		 n/a 30.78
(99.98 %)		 2,018
(0.02 %)		 668
(100.00 %)		 377,357
(3.69 %)		 183,159
(2.82 %)		 5,560,199
(36.58 %)		 30,878
(2.75 %)
90 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1		 n/a 13,933
(1.63 %)		 40,035
(6.93 %)		 n/a 30.80
(99.98 %)		 1,977
(0.02 %)		 667
(100.00 %)		 373,612
(3.67 %)		 181,531
(2.84 %)		 5,483,268
(36.45 %)		 30,829
(2.75 %)
91 damask rose (2016)
GCA_001662545.1		 n/a 16,060
(1.87 %)		 117,610
(18.87 %)		 n/a 38.73
(97.06 %)		 101,982
(2.91 %)		 409,854
(97.09 %)		 329,911
(1.95 %)		 258,478
(2.82 %)		 3,747,902
(31.42 %)		 48,987
(3.05 %)
92 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1		 61,678
(8.40 %)		 18,582
(2.20 %)		 70,121
(14.29 %)		 n/a 40.29
(100.00 %)		 317
(0.00 %)		 2,391
(100.00 %)		 431,923
(8.92 %)		 371,389
(4.19 %)		 2,721,501
(44.16 %)		 89,481
(12.47 %)
93 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1		 48,949
(10.55 %)		 16,697
(2.99 %)		 64,523
(16.24 %)		 n/a 39.33
(91.22 %)		 64,723
(8.79 %)		 143,382
(91.21 %)		 284,003
(7.58 %)		 185,641
(2.23 %)		 2,574,645
(27.52 %)		 62,332
(7.21 %)
94 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1		 48,204
(8.04 %)		 15,110
(2.28 %)		 57,536
(14.48 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 606
(0.01 %)		 43
(100.00 %)		 445,970
(3.39 %)		 319,468
(5.39 %)		 3,687,072
(36.31 %)		 41,402
(3.02 %)
95 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1		 193,799
(12.81 %)		 52,060
(3.07 %)		 144,859
(15.37 %)		 n/a 39.78
(99.99 %)		 219
(0.01 %)		 1,085
(100.00 %)		 713,274
(2.40 %)		 840,280
(6.39 %)		 4,419,734
(51.60 %)		 203,906
(13.78 %)
96 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1		 63,294
(1.67 %)		 17,849
(0.43 %)		 260,921
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 291
(100.00 %)		 2,720,197
(55.13 %)		 1,726,335
(5.40 %)		 14,010,390
(72.58 %)		 732,834
(17.24 %)
97 durian
GCF_002303985.1		 68,467
(10.35 %)		 24,627
(3.34 %)		 48,130
(9.41 %)		 n/a 32.64
(99.58 %)		 3,044
(0.43 %)		 677
(100.00 %)		 490,482
(3.80 %)		 509,842
(12.92 %)		 4,397,155
(48.22 %)		 56,957
(6.23 %)
98 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1		 n/a 32,523
(0.34 %)		 530,488
(8.17 %)		 n/a 46.01
(98.73 %)		 330,230
(1.28 %)		 330,244
(98.72 %)		 2,723,974
(3.46 %)		 2,746,444
(3.02 %)		 330,244
(98.72 %)		 2,108,395
(25.96 %)
99 eggplant (2014)
GCA_000787875.1		 n/a 15,481
(1.92 %)		 48,974
(7.98 %)		 n/a 35.72
(95.30 %)		 118,249
(4.75 %)		 143,048
(95.25 %)		 317,711
(2.21 %)		 307,772
(4.55 %)		 6,006,653
(38.61 %)		 7,570
(0.50 %)
100 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1		 69,123
(8.58 %)		 15,792
(1.92 %)		 66,872
(14.31 %)		 n/a 35.68
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 773,652
(4.18 %)		 429,695
(8.87 %)		 4,823,216
(39.65 %)		 21,654
(2.15 %)
101 English walnut
GCF_001411555.2		 52,962
(10.18 %)		 18,927
(3.19 %)		 60,210
(17.37 %)		 n/a 36.21
(99.89 %)		 1,051
(0.11 %)		 24,757
(100.00 %)		 434,989
(3.86 %)		 303,673
(3.70 %)		 3,318,114
(33.94 %)		 24,028
(1.83 %)
102 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1		 n/a 12,903
(3.20 %)		 33,445
(14.99 %)		 n/a 33.08
(99.96 %)		 983
(0.04 %)		 625
(100.00 %)		 891,822
(54.95 %)		 181,416
(3.89 %)		 2,376,097
(36.79 %)		 4,821
(0.53 %)
103 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1		 42,218
(10.92 %)		 14,784
(3.18 %)		 46,293
(16.46 %)		 n/a 36.73
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 433,802
(3.92 %)		 270,411
(4.15 %)		 2,634,547
(36.26 %)		 29,535
(3.72 %)
104 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1		 47,822
(7.37 %)		 14,132
(1.76 %)		 52,606
(11.89 %)		 n/a 34.09
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 490,095
(3.26 %)		 291,432
(3.68 %)		 3,197,241
(60.23 %)		 29,385
(2.13 %)
105 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1		 54,052
(4.78 %)		 14,372
(1.33 %)		 80,776
(14.35 %)		 n/a 36.88
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 496,928
(2.45 %)		 491,703
(4.75 %)		 4,850,176
(50.53 %)		 57,897
(3.26 %)
106 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1		 45,049
(8.43 %)		 18,010
(3.03 %)		 54,840
(15.32 %)		 n/a 35.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 5,089
(100.00 %)		 397,210
(3.11 %)		 254,173
(4.10 %)		 3,228,435
(42.44 %)		 15,343
(0.97 %)
107 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1		 n/a 27,772
(0.99 %)		 128,971
(6.28 %)		 n/a 37.84
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 667
(100.00 %)		 4,744,181
(80.09 %)		 1,261,453
(5.53 %)		 18,063,531
(49.81 %)		 86,419
(1.62 %)
108 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1		 55,369
(16.07 %)		 19,591
(4.65 %)		 41,748
(16.14 %)		 n/a 34.95
(99.99 %)		 277
(0.01 %)		 21
(100.00 %)		 256,070
(2.83 %)		 178,940
(8.44 %)		 2,317,187
(40.87 %)		 3,317
(6.62 %)
109 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2		 48,620
(10.29 %)		 16,779
(3.20 %)		 47,438
(13.87 %)		 n/a 35.62
(98.95 %)		 566
(1.05 %)		 1,034
(98.95 %)		 245,672
(2.41 %)		 239,601
(4.78 %)		 2,887,505
(44.41 %)		 44,689
(7.20 %)
110 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1		 62,563
(15.19 %)		 15,236
(3.45 %)		 60,387
(23.53 %)		 n/a 39.30
(99.95 %)		 1,014
(0.05 %)		 77
(100.00 %)		 226,730
(2.23 %)		 196,099
(4.12 %)		 1,632,269
(33.79 %)		 38,448
(5.69 %)
111 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2		 56,366
(12.92 %)		 20,853
(4.29 %)		 41,483
(12.40 %)		 n/a 32.05
(95.31 %)		 22,764
(4.70 %)		 32,266
(95.30 %)		 357,310
(3.64 %)		 246,638
(4.06 %)		 2,660,781
(43.22 %)		 2,691
(0.38 %)
112 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2		 77,682
(12.36 %)		 22,539
(3.42 %)		 67,761
(16.26 %)		 n/a 38.07
(99.99 %)		 101
(0.01 %)		 34
(100.00 %)		 309,302
(2.18 %)		 331,724
(5.06 %)		 2,996,468
(41.19 %)		 25,597
(2.08 %)
113 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1		 39,127
(13.03 %)		 15,600
(4.11 %)		 42,096
(18.23 %)		 n/a 35.90
(99.54 %)		 14,532
(0.48 %)		 12
(100.00 %)		 358,479
(3.69 %)		 179,807
(3.40 %)		 2,234,313
(32.05 %)		 12,963
(1.47 %)
114 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1		 72,613
(2.92 %)		 14,868
(0.56 %)		 135,918
(7.87 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 129
(0.00 %)		 319
(100.00 %)		 1,077,704
(2.26 %)		 853,368
(5.27 %)		 13,477,464
(61.64 %)		 152,063
(4.18 %)
115 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1		 n/a 17,158
(0.86 %)		 191,202
(13.47 %)		 n/a 38.57
(86.69 %)		 530,762
(13.34 %)		 292,698
(86.67 %)		 770,031
(2.12 %)		 637,135
(3.75 %)		 13,484,203
(41.57 %)		 81,500
(2.36 %)
116 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1		 n/a 12,110
(0.01 %)		 960,545
(1.07 %)		 n/a 31.25
(100.00 %)		 6,368
(0.00 %)		 5,951
(100.00 %)		 61,111,090
(11.87 %)		 29,667,857
(2.75 %)		 11,464
(100.00 %)		 1,680,995
(2.36 %)
117 false flax
GCF_000633955.1		 123,030
(22.63 %)		 61,894
(13.77 %)		 113,219
(31.09 %)		 n/a 36.55
(92.99 %)		 74,428
(7.02 %)		 37,780
(99.99 %)		 346,267
(2.46 %)		 233,837
(5.56 %)		 3,452,066
(27.34 %)		 32,235
(2.62 %)
118 field mustard
GCF_000309985.2		 73,446
(34.56 %)		 30,193
(10.12 %)		 57,010
(25.57 %)		 n/a 36.83
(99.39 %)		 408
(0.61 %)		 1,100
(100.00 %)		 261,522
(15.13 %)		 196,553
(8.43 %)		 1,533,242
(38.01 %)		 24,895
(5.44 %)
119 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1		 n/a 30,000
(2.41 %)		 346,692
(27.97 %)		 n/a 45.34
(98.74 %)		 507,646
(1.30 %)		 1,033,269
(98.70 %)		 323,234
(1.19 %)		 394,943
(6.28 %)		 6,129,348
(33.00 %)		 325,103
(21.18 %)
120 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1		 63,465
(6.03 %)		 17,263
(1.31 %)		 78,564
(9.37 %)		 n/a 35.95
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 459
(100.00 %)		 982,341
(3.33 %)		 719,891
(7.87 %)		 6,810,592
(50.46 %)		 27,883
(2.10 %)
121 foxtail millet
GCF_000263155.2		 40,951
(13.47 %)		 17,758
(5.07 %)		 60,598
(30.59 %)		 n/a 46.14
(98.82 %)		 6,442
(1.19 %)		 6,779
(98.81 %)		 115,365
(1.46 %)		 116,980
(2.45 %)		 1,691,260
(29.31 %)		 78,297
(28.27 %)
122 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1		 45,159
(4.02 %)		 13,440
(1.02 %)		 85,207
(11.07 %)		 n/a 39.02
(97.02 %)		 47,391
(2.99 %)		 56,182
(97.01 %)		 427,496
(2.02 %)		 885,946
(8.32 %)		 6,075,356
(46.49 %)		 111,109
(6.80 %)
123 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4		 69,048
(2.69 %)		 16,407
(0.56 %)		 105,654
(5.75 %)		 n/a 37.92
(99.95 %)		 384
(0.05 %)		 93
(100.00 %)		 1,192,578
(2.37 %)		 1,282,344
(4.72 %)		 12,843,881
(61.50 %)		 160,781
(2.86 %)
124 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1		 74,264
(1.88 %)		 17,744
(0.43 %)		 129,692
(4.97 %)		 n/a 37.94
(99.73 %)		 826
(0.27 %)		 1,566
(100.00 %)		 1,517,586
(2.16 %)		 1,541,702
(5.89 %)		 13,206,825
(66.95 %)		 105,766
(0.97 %)
125 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1		 43,473
(2.84 %)		 13,544
(0.88 %)		 64,877
(5.24 %)		 n/a 36.06
(100.00 %)		 596
(0.00 %)		 510
(100.00 %)		 1,556,970
(22.50 %)		 788,188
(5.25 %)		 10,081,845
(53.72 %)		 41,032
(1.09 %)
126 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1		 59,652
(8.73 %)		 18,917
(2.55 %)		 47,052
(9.22 %)		 n/a 32.09
(99.98 %)		 1,693
(0.02 %)		 2,266
(100.00 %)		 452,206
(3.00 %)		 195,931
(2.27 %)		 4,921,469
(39.63 %)		 9,731
(0.69 %)
127 ginger
GCF_018446385.1		 127,579
(4.07 %)		 33,995
(0.96 %)		 186,756
(7.79 %)		 n/a 39.16
(100.00 %)		 901
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,187,168
(2.18 %)		 2,088,683
(6.47 %)		 12,917,773
(61.42 %)		 398,512
(10.38 %)
128 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2		 42,106
(6.72 %)		 15,819
(2.23 %)		 49,753
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,402
(9.76 %)		 13,479
(99.93 %)		 394,793
(2.75 %)		 364,336
(3.37 %)		 4,190,750
(39.49 %)		 12,198
(0.64 %)
129 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1		 87,385
(2.18 %)		 17,963
(0.44 %)		 263,708
(10.29 %)		 n/a 46.32
(97.73 %)		 107,163
(2.27 %)		 109,126
(100.00 %)		 1,490,873
(15.60 %)		 1,415,562
(5.65 %)		 12,540,551
(71.59 %)		 881,849
(29.81 %)
130 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1		 69,195
(1.77 %)		 18,614
(0.43 %)		 300,274
(11.28 %)		 n/a 46.38
(100.00 %)		 n/a 68,537
(100.00 %)		 1,555,328
(15.65 %)		 1,485,488
(4.71 %)		 13,133,338
(73.17 %)		 928,327
(30.84 %)
131 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1		 69,722
(4.35 %)		 17,353
(1.01 %)		 81,347
(7.68 %)		 n/a 38.10
(99.95 %)		 1,565
(0.05 %)		 166
(100.00 %)		 816,909
(2.29 %)		 708,412
(4.09 %)		 8,106,901
(53.67 %)		 66,433
(1.82 %)
132 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1		 n/a 21,161
(2.89 %)		 55,843
(11.78 %)		 n/a 35.63
(99.99 %)		 646
(0.01 %)		 2,366
(99.99 %)		 423,518
(2.92 %)		 293,299
(3.76 %)		 4,466,312
(33.71 %)		 25,250
(1.74 %)
133 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1		 n/a 22,332
(3.88 %)		 51,709
(13.62 %)		 n/a 35.31
(96.44 %)		 25,521
(3.57 %)		 1,234
(100.00 %)		 347,035
(2.87 %)		 241,862
(4.11 %)		 3,578,217
(30.95 %)		 19,259
(1.41 %)
134 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1		 n/a 10,023
(7.00 %)		 16,353
(26.89 %)		 n/a 42.30
(92.78 %)		 89,257
(7.32 %)		 89,277
(92.68 %)		 80,787
(2.86 %)		 45,432
(1.93 %)		 786,155
(19.70 %)		 19,057
(20.99 %)
135 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4		 10,237
(66.85 %)		 988
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 37,284
(8.77 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 43
(99.34 %)
136 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1		 n/a 2,016
(0.62 %)		 31,585
(41.01 %)		 n/a 57.91
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,614
(100.00 %)		 183,076
(3.30 %)		 101,860
(5.85 %)		 972,524
(32.54 %)		 4,760
(98.23 %)
137 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1		 n/a 1,365
(1.08 %)		 11,070
(58.24 %)		 n/a 55.95
(98.44 %)		 780
(1.56 %)		 597
(100.00 %)		 25,537
(1.66 %)		 27,257
(3.92 %)		 365,387
(19.48 %)		 3,732
(86.39 %)
138 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1		 7,014
(37.71 %)		 966
(2.72 %)		 2,947
(70.38 %)		 n/a 63.54
(95.35 %)		 1,012
(4.66 %)		 1,386
(95.34 %)		 8,655
(1.88 %)		 3,803
(1.89 %)		 147,537
(20.31 %)		 604
(53.91 %)
139 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1		 7,852
(82.09 %)		 1,231
(6.04 %)		 4,460
(76.24 %)		 n/a 48.02
(99.76 %)		 20
(0.24 %)		 21
(100.00 %)		 17,900
(4.88 %)		 5,674
(1.75 %)		 113,699
(21.91 %)		 7
(0.01 %)
140 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1		 n/a 1,057
(0.55 %)		 9,735
(58.02 %)		 n/a 64.03
(100.00 %)		 n/a 17
(100.00 %)		 166,909
(9.00 %)		 120,034
(10.13 %)		 750,946
(37.60 %)		 166
(99.31 %)
141 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2		 19,527
(53.99 %)		 990
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 174,119
(17.13 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 92
(46.06 %)
142 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1		 9,839
(29.70 %)		 1,307
(1.78 %)		 8,108
(53.71 %)		 n/a 52.94
(100.00 %)		 n/a 29
(100.00 %)		 8,446
(0.85 %)		 5,471
(0.85 %)		 265,761
(14.34 %)		 11,329
(19.64 %)
143 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1		 9,780
(32.79 %)		 744
(1.00 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 64,770
(8.22 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 756
(45.48 %)
144 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1		 n/a 2,471
(1.78 %)		 14,771
(54.27 %)		 n/a 52.42
(98.98 %)		 2,081
(1.02 %)		 3,731
(98.98 %)		 10,051
(0.46 %)		 14,278
(1.14 %)		 388,120
(8.55 %)		 8,698
(83.31 %)
145 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2		 n/a 1,301
(4.51 %)		 5,667
(86.20 %)		 n/a 63.82
(100.00 %)		 n/a 19
(100.00 %)		 14,619
(3.58 %)		 8,937
(2.75 %)		 178,499
(27.69 %)		 10
(25.23 %)
146 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1		 16,734
(25.96 %)		 666
(0.47 %)		 12,122
(60.02 %)		 n/a 64.75
(96.59 %)		 5,358
(3.43 %)		 12,077
(96.57 %)		 73,343
(6.73 %)		 43,518
(3.04 %)		 568,630
(31.80 %)		 7,776
(96.69 %)
147 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2		 10,242
(66.86 %)		 990
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 36,818
(8.73 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 32
(47.70 %)
148 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1		 7,603
(72.01 %)		 1,064
(6.25 %)		 3,493
(72.08 %)		 n/a 60.44
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 11,026
(5.45 %)		 11,732
(3.90 %)		 107,661
(34.88 %)		 12
(61.27 %)
149 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3		 7,766
(82.33 %)		 1,131
(6.60 %)		 3,714
(76.22 %)		 n/a 59.21
(99.94 %)		 477
(0.07 %)		 22
(100.00 %)		 8,503
(3.84 %)		 4,946
(2.16 %)		 102,428
(27.87 %)		 16
(57.14 %)
150 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1		 14,436
(21.51 %)		 1,411
(0.77 %)		 13,095
(47.93 %)		 n/a 55.97
(91.15 %)		 12,014
(8.87 %)		 11,352
(91.13 %)		 175,729
(14.69 %)		 105,113
(5.10 %)		 667,226
(23.91 %)		 4,325
(42.65 %)
151 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1		 46,021
(16.54 %)		 14,632
(4.66 %)		 34,242
(19.36 %)		 n/a 33.53
(100.00 %)		 n/a 271
(100.00 %)		 293,800
(4.64 %)		 151,157
(7.38 %)		 1,732,880
(41.88 %)		 21,835
(6.05 %)
152 green foxtail
GCF_005286985.1		 47,022
(14.66 %)		 17,750
(5.12 %)		 60,106
(30.88 %)		 n/a 46.17
(99.85 %)		 61
(0.15 %)		 76
(99.85 %)		 116,493
(1.51 %)		 120,039
(2.72 %)		 1,676,017
(29.11 %)		 75,497
(29.44 %)
153 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1		 n/a 18,040
(5.19 %)		 61,671
(31.38 %)		 n/a 45.99
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 105,738
(1.38 %)		 87,424
(2.22 %)		 1,777,815
(26.85 %)		 74,932
(30.30 %)
154 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2		 n/a 11,944
(2.63 %)		 37,372
(13.64 %)		 n/a 35.58
(88.95 %)		 1,032,823
(11.31 %)		 21
(100.00 %)		 293,868
(3.21 %)		 174,614
(3.18 %)		 2,690,184
(32.53 %)		 15,323
(1.42 %)
155 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2		 n/a 16,562
(0.53 %)		 72,911
(2.91 %)		 n/a 34.88
(98.35 %)		 196,261
(1.66 %)		 87,978
(100.00 %)		 1,136,015
(1.95 %)		 1,019,921
(4.33 %)		 22,445,162
(47.06 %)		 20,737
(0.24 %)
156 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1		 88,183
(5.03 %)		 22,129
(1.02 %)		 118,243
(9.15 %)		 n/a 35.63
(99.98 %)		 3,486
(0.02 %)		 1,888
(100.00 %)		 1,001,308
(2.63 %)		 1,132,664
(5.72 %)		 8,340,755
(56.16 %)		 43,665
(1.21 %)
157 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1		 43,787
(9.63 %)		 17,635
(3.85 %)		 66,270
(23.98 %)		 n/a 46.87
(98.63 %)		 736
(1.37 %)		 1,027
(98.63 %)		 157,811
(1.55 %)		 119,571
(2.57 %)		 2,107,254
(45.30 %)		 102,278
(32.16 %)
158 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1		 40,307
(7.38 %)		 16,711
(2.29 %)		 50,292
(11.24 %)		 n/a 32.12
(99.95 %)		 858
(0.05 %)		 1,115
(100.00 %)		 439,789
(3.56 %)		 574,639
(8.97 %)		 4,147,814
(47.01 %)		 16,291
(1.13 %)
159 horseweed
GCF_010389155.1		 39,621
(11.54 %)		 14,718
(3.15 %)		 42,194
(16.23 %)		 n/a 34.08
(99.99 %)		 502
(0.01 %)		 357
(100.00 %)		 267,124
(2.84 %)		 155,729
(2.71 %)		 2,475,353
(36.48 %)		 5,205
(0.40 %)
160 Indian licorice
GCF_003935025.1		 44,610
(13.60 %)		 17,108
(4.95 %)		 34,097
(14.33 %)		 n/a 31.84
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 217,674
(3.40 %)		 106,243
(4.04 %)		 2,232,509
(38.91 %)		 5,438
(1.06 %)
161 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1		 n/a 16,184
(2.02 %)		 66,215
(14.16 %)		 n/a 35.37
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 689
(100.00 %)		 739,891
(4.58 %)		 435,389
(7.62 %)		 4,843,419
(38.03 %)		 13,298
(2.56 %)
162 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1		 n/a 15,832
(2.09 %)		 63,488
(14.36 %)		 n/a 35.19
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 358
(100.00 %)		 703,028
(4.29 %)		 399,798
(6.48 %)		 4,662,881
(36.96 %)		 12,534
(1.92 %)
163 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1		 n/a 15,893
(1.97 %)		 68,998
(15.27 %)		 n/a 35.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 156
(100.00 %)		 746,424
(4.43 %)		 451,117
(7.39 %)		 4,820,434
(38.55 %)		 20,367
(2.62 %)
164 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1		 n/a 15,880
(1.95 %)		 69,093
(15.25 %)		 n/a 35.97
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 274
(100.00 %)		 751,691
(4.60 %)		 457,914
(7.61 %)		 4,850,082
(38.95 %)		 20,561
(3.01 %)
165 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1		 50,504
(10.14 %)		 18,451
(3.41 %)		 55,094
(16.89 %)		 n/a 36.30
(99.18 %)		 54
(0.82 %)		 154
(100.00 %)		 411,290
(3.65 %)		 260,413
(3.49 %)		 3,023,907
(31.93 %)		 23,270
(1.88 %)
166 Japanese apricot
GCF_000346735.1		 32,312
(19.60 %)		 14,463
(6.46 %)		 33,049
(23.94 %)		 n/a 37.45
(92.82 %)		 15,597
(7.20 %)		 23,761
(92.80 %)		 118,757
(2.25 %)		 84,983
(4.53 %)		 1,374,244
(23.24 %)		 7,808
(1.87 %)
167 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1		 80,727
(1.01 %)		 14,175
(0.13 %)		 225,166
(3.69 %)		 n/a 36.42
(99.98 %)		 3,031
(0.02 %)		 2,699
(100.00 %)		 2,873,672
(2.01 %)		 4,198,037
(4.24 %)		 5,730
(99.98 %)		 71,102
(1.16 %)
168 Japanese morning glory
GCF_001879475.1		 58,978
(8.37 %)		 16,977
(2.14 %)		 77,626
(18.21 %)		 n/a 37.61
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 3,418
(100.00 %)		 641,896
(6.26 %)		 639,051
(8.97 %)		 3,622,236
(46.63 %)		 77,860
(10.47 %)
169 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1		 55,725
(16.73 %)		 16,338
(4.37 %)		 54,077
(25.00 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 196,712
(2.76 %)		 141,936
(4.82 %)		 1,727,479
(35.05 %)		 63,894
(25.90 %)
170 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1		 n/a 16,562
(4.59 %)		 53,878
(24.77 %)		 n/a 43.61
(98.95 %)		 474
(1.05 %)		 476
(98.95 %)		 494,831
(50.75 %)		 141,079
(3.52 %)		 1,728,936
(33.69 %)		 64,216
(25.20 %)
171 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1		 53,556
(17.24 %)		 16,804
(4.69 %)		 53,712
(24.95 %)		 n/a 43.57
(99.97 %)		 925
(0.03 %)		 58
(100.00 %)		 402,182
(39.07 %)		 138,035
(3.47 %)		 1,719,939
(33.46 %)		 63,485
(25.25 %)
172 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1		 44,669
(10.38 %)		 13,649
(2.41 %)		 38,664
(12.08 %)		 n/a 31.93
(99.74 %)		 2,496
(0.26 %)		 49
(100.00 %)		 270,085
(9.40 %)		 247,307
(22.95 %)		 2,428,999
(49.81 %)		 5,914
(1.27 %)
173 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1		 n/a 21,051
(6.88 %)		 57,023
(32.54 %)		 n/a 44.09
(96.75 %)		 14,848
(3.26 %)		 26,634
(96.74 %)		 101,349
(1.46 %)		 71,657
(2.17 %)		 1,693,252
(21.97 %)		 60,198
(24.06 %)
174 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1		 n/a 15,031
(1.06 %)		 140,751
(10.18 %)		 n/a 36.82
(99.85 %)		 n/a 876,110
(100.00 %)		 505,796
(3.85 %)		 318,171
(2.09 %)		 9,808,138
(33.85 %)		 30,057
(0.85 %)
175 lyrate rockcress
GCF_000004255.2		 44,525
(28.52 %)		 25,416
(19.36 %)		 34,938
(31.66 %)		 n/a 36.08
(88.90 %)		 2,950
(11.10 %)		 3,646
(88.90 %)		 141,441
(20.58 %)		 72,583
(3.25 %)		 1,012,438
(24.68 %)		 8,053
(2.48 %)
176 macadamia nut
GCF_013358625.1		 58,226
(8.43 %)		 16,723
(2.11 %)		 62,465
(13.23 %)		 n/a 39.13
(98.51 %)		 22,059
(1.50 %)		 2,644
(100.00 %)		 463,575
(3.09 %)		 304,057
(3.39 %)		 4,183,445
(34.36 %)		 18,956
(1.40 %)
177 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1		 n/a 13,013
(2.26 %)		 38,671
(8.42 %)		 n/a 33.59
(99.19 %)		 123,798
(0.85 %)		 203,100
(99.15 %)		 329,865
(3.57 %)		 244,018
(4.63 %)		 3,737,818
(40.09 %)		 4,827
(0.29 %)
178 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1		 69,307
(3.21 %)		 14,466
(0.72 %)		 84,219
(6.52 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 1,415,484
(14.07 %)		 1,154,832
(6.29 %)		 10,231,412
(50.86 %)		 107,342
(2.63 %)
179 maize
GCF_902167145.1		 76,921
(3.66 %)		 23,553
(1.55 %)		 154,773
(10.70 %)		 n/a 46.77
(99.83 %)		 708
(0.17 %)		 697
(100.00 %)		 1,340,549
(78.65 %)		 843,168
(5.20 %)		 5,886,498
(69.23 %)		 372,641
(31.10 %)
180 maize (2020)
GCA_905067065.1		 n/a 23,433
(1.61 %)		 150,853
(10.66 %)		 n/a 46.83
(98.14 %)		 56,163
(1.87 %)		 56,173
(98.13 %)		 581,502
(1.40 %)		 753,129
(3.49 %)		 5,867,216
(67.88 %)		 377,414
(31.33 %)
181 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1		 n/a 23,680
(1.58 %)		 153,453
(10.69 %)		 n/a 46.83
(99.71 %)		 1,223
(0.29 %)		 697
(100.00 %)		 593,292
(1.41 %)		 805,647
(4.47 %)		 5,887,178
(69.17 %)		 370,755
(32.34 %)
182 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1		 n/a 23,864
(1.57 %)		 154,358
(10.67 %)		 n/a 46.77
(99.88 %)		 551
(0.12 %)		 777
(100.00 %)		 1,341,834
(78.70 %)		 834,042
(5.01 %)		 5,916,520
(69.26 %)		 372,114
(32.08 %)
183 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2		 34,262
(16.98 %)		 15,545
(6.13 %)		 36,746
(24.10 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 74
(100.00 %)		 140,519
(2.59 %)		 67,337
(3.89 %)		 1,493,779
(29.32 %)		 41,044
(18.43 %)
184 mango
GCF_011075055.1		 60,349
(16.06 %)		 20,653
(5.13 %)		 40,887
(15.20 %)		 n/a 32.71
(99.98 %)		 169
(0.02 %)		 250
(100.00 %)		 213,445
(3.09 %)		 125,929
(3.29 %)		 2,447,401
(32.63 %)		 7,059
(0.98 %)
185 monocots
GCF_002575655.2		 84,263
(2.17 %)		 17,888
(0.44 %)		 263,541
(10.26 %)		 n/a 46.33
(97.97 %)		 69,858
(2.04 %)		 109,197
(100.00 %)		 1,492,485
(15.65 %)		 1,422,870
(5.39 %)		 12,521,384
(71.80 %)		 881,939
(30.07 %)
186 mosses
GCF_000002425.4		 55,129
(11.87 %)		 8,425
(1.46 %)		 30,452
(12.55 %)		 n/a 33.69
(98.74 %)		 2,645
(1.27 %)		 359
(100.00 %)		 454,786
(48.35 %)		 241,826
(2.56 %)		 2,413,326
(52.52 %)		 22,664
(3.06 %)
187 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1		 29,893
(12.15 %)		 14,092
(4.40 %)		 37,376
(17.73 %)		 n/a 34.86
(94.92 %)		 15,541
(5.08 %)		 46,842
(94.92 %)		 317,532
(5.00 %)		 190,192
(6.25 %)		 2,095,631
(34.49 %)		 20,490
(3.43 %)
188 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1		 47,653
(11.89 %)		 16,644
(3.87 %)		 43,967
(14.67 %)		 n/a 33.18
(92.80 %)		 96,870
(7.24 %)		 2,465
(100.00 %)		 264,597
(3.31 %)		 198,963
(3.34 %)		 2,842,720
(34.86 %)		 13,975
(1.49 %)
189 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1		 46,975
(10.56 %)		 13,502
(2.95 %)		 32,332
(13.20 %)		 n/a 36.06
(99.99 %)		 239
(0.01 %)		 1,310
(100.00 %)		 282,171
(3.23 %)		 229,959
(11.70 %)		 2,016,709
(43.94 %)		 18,232
(10.96 %)
190 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1		 35,384
(11.55 %)		 13,191
(3.74 %)		 28,295
(11.09 %)		 n/a 33.23
(89.51 %)		 29,172
(10.51 %)		 60,751
(89.49 %)		 239,295
(7.85 %)		 172,598
(3.17 %)		 2,304,858
(33.21 %)		 12,855
(1.38 %)
191 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1		 57,263
(9.83 %)		 22,097
(3.53 %)		 51,774
(13.22 %)		 n/a 33.46
(99.34 %)		 44,657
(0.68 %)		 55,107
(99.32 %)		 280,867
(4.25 %)		 210,750
(5.67 %)		 3,920,315
(38.10 %)		 6,462
(0.46 %)
192 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1		 44,477
(5.41 %)		 16,928
(1.94 %)		 77,682
(16.06 %)		 n/a 40.12
(100.00 %)		 2,037
(0.00 %)		 1,289
(100.00 %)		 437,997
(2.33 %)		 266,149
(5.08 %)		 4,764,252
(34.25 %)		 20,667
(1.81 %)
193 opium poppy
GCF_003573695.1		 127,893
(4.57 %)		 25,532
(0.85 %)		 162,032
(9.31 %)		 n/a 37.28
(99.80 %)		 31,183
(0.20 %)		 34,381
(100.00 %)		 819,294
(1.49 %)		 1,050,181
(6.80 %)		 10,625,631
(55.85 %)		 67,521
(1.21 %)
194 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2		 39,386
(3.85 %)		 12,208
(0.99 %)		 72,906
(8.22 %)		 n/a 34.70
(96.03 %)		 25,751
(3.92 %)		 311,841
(96.08 %)		 506,361
(2.45 %)		 413,770
(3.23 %)		 8,074,114
(39.07 %)		 56,900
(2.34 %)
195 orchid P.equestris
GCF_001263595.1		 32,146
(3.36 %)		 11,541
(1.01 %)		 54,049
(6.11 %)		 n/a 34.46
(92.46 %)		 98,814
(7.56 %)		 188,398
(92.44 %)		 487,071
(2.96 %)		 511,903
(4.00 %)		 7,060,408
(42.20 %)		 31,179
(1.22 %)
196 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1		 120,534
(4.81 %)		 39,902
(1.95 %)		 276,967
(16.36 %)		 n/a 45.32
(99.56 %)		 4,932
(0.44 %)		 2,420
(100.00 %)		 764,083
(1.38 %)		 810,723
(3.95 %)		 11,118,925
(53.40 %)		 520,091
(23.03 %)
197 papaya
GCF_000150535.2		 29,883
(11.99 %)		 12,860
(4.47 %)		 24,403
(11.58 %)		 n/a 35.31
(73.55 %)		 29,719
(26.47 %)		 47,485
(73.53 %)		 260,082
(34.69 %)		 101,644
(3.59 %)		 1,640,647
(28.88 %)		 21,200
(2.95 %)
198 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1		 n/a 43,905
(2.21 %)		 174,920
(14.40 %)		 n/a 35.02
(93.97 %)		 170,266
(6.06 %)		 211,964
(93.94 %)		 1,021,699
(2.86 %)		 1,125,321
(8.02 %)		 9,388,626
(47.60 %)		 102,661
(4.26 %)
199 peach
GCF_000346465.2		 36,201
(20.87 %)		 14,368
(6.26 %)		 32,245
(24.09 %)		 n/a 37.51
(98.79 %)		 2,368
(1.22 %)		 2,531
(98.78 %)		 150,957
(10.06 %)		 96,381
(5.52 %)		 1,221,263
(28.72 %)		 7,885
(2.07 %)
200 peanut
GCF_003086295.2		 155,835
(5.15 %)		 31,810
(1.19 %)		 160,574
(8.81 %)		 n/a 36.33
(99.85 %)		 3,655
(0.15 %)		 385
(100.00 %)		 1,684,814
(3.52 %)		 1,488,297
(4.81 %)		 11,059,688
(62.32 %)		 140,570
(2.45 %)
201 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1		 n/a 31,065
(1.17 %)		 158,578
(8.79 %)		 n/a 36.33
(98.97 %)		 32,692
(1.04 %)		 29
(100.00 %)		 1,735,218
(3.66 %)		 1,490,806
(4.26 %)		 11,072,983
(61.75 %)		 138,890
(2.46 %)
202 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1		 48,939
(13.04 %)		 22,082
(4.44 %)		 56,235
(17.69 %)		 n/a 37.45
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 176
(99.99 %)		 289,539
(2.54 %)		 223,443
(3.84 %)		 2,308,351
(35.91 %)		 19,559
(2.15 %)
203 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2		 n/a 17,949
(1.26 %)		 134,829
(14.30 %)		 n/a 47.95
(86.95 %)		 156,852
(13.08 %)		 52,033
(100.00 %)		 380,858
(1.16 %)		 466,997
(2.83 %)		 5,117,134
(56.89 %)		 380,989
(29.47 %)
204 pecan
GCF_018687715.1		 71,340
(9.93 %)		 18,671
(2.67 %)		 60,632
(15.16 %)		 n/a 36.30
(99.97 %)		 22
(0.03 %)		 39
(99.97 %)		 473,853
(3.66 %)		 367,846
(6.75 %)		 3,301,121
(39.03 %)		 27,274
(2.22 %)
205 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1		 89,789
(3.75 %)		 17,693
(0.79 %)		 174,787
(12.15 %)		 n/a 44.32
(100.00 %)		 238
(0.00 %)		 1,677
(100.00 %)		 605,852
(1.36 %)		 760,915
(5.68 %)		 5,216,229
(69.24 %)		 542,998
(24.23 %)
206 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2		 72,518
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 52,295
(10.15 %)		 n/a 33.21
(98.25 %)		 19,685
(1.76 %)		 20,680
(98.24 %)		 404,885
(2.81 %)		 300,062
(3.31 %)		 5,198,170
(40.84 %)		 10,912
(0.59 %)
207 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1		 63,476
(8.67 %)		 20,265
(2.62 %)		 51,815
(10.02 %)		 n/a 33.24
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 405,385
(2.83 %)		 306,302
(3.81 %)		 5,192,105
(41.79 %)		 10,481
(0.65 %)
208 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1		 n/a 15,868
(1.22 %)		 104,104
(13.39 %)		 n/a 36.03
(91.65 %)		 318,321
(8.39 %)		 328,880
(91.61 %)		 810,727
(3.49 %)		 710,744
(4.84 %)		 7,339,863
(41.43 %)		 104,967
(3.98 %)
209 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2		 46,412
(9.42 %)		 17,396
(3.13 %)		 49,710
(12.66 %)		 n/a 32.76
(94.18 %)		 36,323
(5.83 %)		 67,834
(94.17 %)		 395,663
(3.40 %)		 306,602
(4.71 %)		 3,749,364
(39.19 %)		 26,504
(2.90 %)
210 pineapple
GCF_001540865.1		 43,024
(11.65 %)		 13,649
(3.36 %)		 38,917
(14.95 %)		 n/a 38.34
(98.23 %)		 25,542
(1.78 %)		 3,129
(100.00 %)		 352,802
(7.31 %)		 274,578
(4.75 %)		 2,360,455
(38.94 %)		 56,724
(11.73 %)
211 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1		 37,318
(33.25 %)		 22,836
(23.08 %)		 26,822
(33.93 %)		 n/a 35.63
(97.53 %)		 6,294
(2.49 %)		 7,067
(97.51 %)		 74,470
(2.42 %)		 42,509
(3.39 %)		 814,442
(24.99 %)		 5,817
(2.14 %)
212 pistachio
GCF_008641045.1		 47,948
(7.92 %)		 18,462
(2.58 %)		 62,898
(14.05 %)		 n/a 35.95
(99.84 %)		 16,367
(0.16 %)		 1,865
(100.00 %)		 363,793
(2.43 %)		 253,408
(4.08 %)		 4,200,417
(36.34 %)		 22,340
(1.78 %)
213 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2		 41,101
(10.95 %)		 11,576
(2.50 %)		 38,220
(15.70 %)		 n/a 38.61
(99.84 %)		 626
(0.16 %)		 1,409
(99.84 %)		 236,190
(2.95 %)		 153,746
(4.02 %)		 2,151,579
(26.72 %)		 24,561
(4.48 %)
214 pomegranate
GCF_007655135.1		 43,277
(14.87 %)		 14,635
(4.26 %)		 39,381
(19.97 %)		 n/a 40.38
(99.99 %)		 188
(0.01 %)		 474
(100.00 %)		 173,182
(2.28 %)		 174,872
(6.81 %)		 1,640,973
(32.89 %)		 26,506
(9.18 %)
215 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1		 43,670
(6.66 %)		 16,547
(2.25 %)		 54,186
(11.30 %)		 n/a 34.71
(88.41 %)		 37,060
(11.60 %)		 17,084
(100.00 %)		 321,938
(2.14 %)		 250,793
(4.04 %)		 5,136,691
(33.92 %)		 8,536
(0.30 %)
216 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1		 n/a 16,861
(1.98 %)		 58,882
(12.19 %)		 n/a 35.40
(99.95 %)		 4,397
(0.05 %)		 3,012
(100.00 %)		 774,417
(46.83 %)		 392,378
(8.45 %)		 5,068,449
(42.72 %)		 14,548
(1.32 %)
217 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1		 n/a 17,614
(2.86 %)		 45,684
(10.75 %)		 n/a 34.49
(83.57 %)		 10,041,161
(17.84 %)		 12
(100.00 %)		 606,573
(40.80 %)		 168,871
(2.58 %)		 5,508,800
(26.36 %)		 5,550
(0.22 %)
218 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1		 43,155
(20.86 %)		 16,423
(2.55 %)		 50,333
(11.79 %)		 n/a 34.83
(93.98 %)		 45,215
(6.04 %)		 60,069
(93.96 %)		 662,626
(43.42 %)		 212,315
(4.38 %)		 4,691,843
(34.91 %)		 9,851
(0.45 %)
219 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1		 n/a 16,415
(2.15 %)		 54,766
(12.48 %)		 n/a 35.21
(99.98 %)		 1,476
(0.02 %)		 25
(100.00 %)		 329,233
(2.28 %)		 285,101
(5.66 %)		 4,832,189
(40.28 %)		 12,944
(0.99 %)
220 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1		 n/a 16,694
(2.26 %)		 53,990
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,499
(0.02 %)		 28
(100.00 %)		 323,447
(2.25 %)		 283,098
(5.39 %)		 4,727,964
(39.87 %)		 12,316
(1.34 %)
221 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1		 n/a 16,713
(2.23 %)		 54,380
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,299
(0.02 %)		 27
(100.00 %)		 329,807
(2.31 %)		 282,372
(6.11 %)		 4,718,807
(40.25 %)		 11,812
(1.00 %)
222 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1		 n/a 16,640
(2.18 %)		 54,937
(12.38 %)		 n/a 35.18
(99.98 %)		 1,383
(0.02 %)		 26
(100.00 %)		 329,665
(2.30 %)		 285,993
(6.03 %)		 4,858,802
(40.32 %)		 12,792
(1.32 %)
223 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1		 n/a 16,312
(2.05 %)		 54,438
(12.18 %)		 n/a 35.23
(99.95 %)		 4,448
(0.05 %)		 12
(100.00 %)		 730,464
(46.17 %)		 338,389
(7.95 %)		 4,903,557
(41.90 %)		 12,226
(0.72 %)
224 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1		 35,762
(6.74 %)		 16,408
(2.54 %)		 48,924
(11.75 %)		 n/a 34.59
(99.55 %)		 1,612
(0.45 %)		 1,332
(100.00 %)		 297,683
(2.31 %)		 234,616
(4.68 %)		 4,308,149
(38.02 %)		 8,192
(0.47 %)
225 quinoa
GCF_001683475.1		 74,918
(7.49 %)		 22,914
(1.61 %)		 105,619
(12.97 %)		 n/a 36.87
(99.16 %)		 725
(0.84 %)		 3,487
(100.00 %)		 810,277
(3.58 %)		 762,903
(10.88 %)		 6,551,884
(49.49 %)		 93,630
(2.98 %)
226 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2		 80,563
(20.51 %)		 36,039
(9.58 %)		 74,081
(26.98 %)		 n/a 36.00
(99.94 %)		 2,853
(0.06 %)		 6,424
(100.00 %)		 224,524
(2.48 %)		 193,525
(5.49 %)		 2,234,480
(35.04 %)		 25,972
(4.13 %)
227 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1		 152,583
(19.25 %)		 57,668
(6.87 %)		 143,092
(23.51 %)		 n/a 37.13
(99.99 %)		 840
(0.01 %)		 3,167
(100.00 %)		 470,302
(2.29 %)		 578,281
(9.24 %)		 4,662,467
(42.41 %)		 64,287
(5.62 %)
228 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2		 144,997
(17.51 %)		 59,743
(7.71 %)		 146,391
(26.97 %)		 n/a 36.47
(92.96 %)		 32,639
(7.05 %)		 34,110
(92.95 %)		 449,257
(2.67 %)		 441,269
(5.84 %)		 4,867,601
(32.91 %)		 60,082
(3.53 %)
229 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1		 63,238
(17.01 %)		 17,857
(4.13 %)		 43,079
(17.27 %)		 n/a 33.71
(99.97 %)		 231
(0.03 %)		 90
(100.00 %)		 241,481
(2.65 %)		 187,674
(4.85 %)		 2,251,582
(37.03 %)		 6,474
(1.93 %)
230 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1		 62,516
(12.25 %)		 15,176
(2.61 %)		 67,175
(21.50 %)		 n/a 37.47
(99.58 %)		 695
(0.42 %)		 173
(100.00 %)		 377,231
(3.52 %)		 364,027
(5.05 %)		 2,679,528
(42.07 %)		 64,243
(6.17 %)
231 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2		 71,107
(1.58 %)		 18,911
(0.39 %)		 321,741
(10.16 %)		 n/a 45.91
(99.38 %)		 33,814
(0.62 %)		 10,205
(100.00 %)		 1,208,165
(1.25 %)		 1,319,817
(2.96 %)		 15,480,313
(71.93 %)		 975,234
(26.52 %)
232 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1		 62,168
(11.90 %)		 15,363
(2.73 %)		 54,203
(18.86 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 253,965
(2.10 %)		 235,379
(9.36 %)		 2,668,584
(34.08 %)		 31,789
(3.72 %)
233 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1		 38,736
(11.89 %)		 16,669
(4.18 %)		 43,369
(14.64 %)		 n/a 32.90
(93.47 %)		 20,717
(6.53 %)		 15,445
(100.00 %)		 233,635
(3.33 %)		 204,141
(4.85 %)		 2,682,022
(32.58 %)		 16,828
(2.07 %)
234 riverbank grape
GCF_004353265.1		 44,851
(10.22 %)		 15,302
(3.01 %)		 46,011
(14.96 %)		 n/a 34.32
(98.79 %)		 1,095
(1.21 %)		 175
(100.00 %)		 339,984
(3.03 %)		 233,259
(4.71 %)		 2,925,914
(35.27 %)		 11,055
(0.93 %)
235 rose gum (2021)
GCF_016545825.1		 54,676
(10.44 %)		 16,291
(2.42 %)		 69,492
(17.92 %)		 n/a 39.39
(99.97 %)		 1,712
(0.03 %)		 37
(100.00 %)		 358,171
(2.83 %)		 259,031
(3.65 %)		 3,353,128
(29.52 %)		 78,731
(7.66 %)
236 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1		 65,107
(11.08 %)		 16,389
(2.33 %)		 74,557
(18.16 %)		 n/a 39.28
(92.69 %)		 27,773
(7.32 %)		 32,724
(92.68 %)		 357,835
(2.50 %)		 266,806
(3.22 %)		 3,496,176
(27.34 %)		 79,393
(6.54 %)
237 rose of Sharon
GCF_006381635.1		 91,942
(5.18 %)		 44,363
(2.23 %)		 136,768
(10.14 %)		 n/a 34.23
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,789
(100.00 %)		 889,945
(2.72 %)		 968,890
(4.91 %)		 9,836,479
(51.73 %)		 42,560
(0.89 %)
238 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1		 71,175
(4.21 %)		 22,208
(1.24 %)		 63,302
(5.13 %)		 n/a 34.70
(91.68 %)		 1,428
(8.32 %)		 755
(100.00 %)		 1,078,590
(2.96 %)		 730,314
(3.70 %)		 6,031,831
(65.59 %)		 24,263
(0.70 %)
239 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1		 66,125
(5.23 %)		 22,033
(1.63 %)		 59,727
(6.42 %)		 n/a 34.84
(94.20 %)		 40,863
(5.81 %)		 7,453
(100.00 %)		 827,088
(3.02 %)		 565,394
(5.23 %)		 5,065,470
(61.59 %)		 13,573
(0.45 %)
240 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1		 94,413
(12.61 %)		 31,218
(3.57 %)		 108,219
(21.49 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,178
(100.00 %)		 360,314
(2.17 %)		 419,051
(4.85 %)		 3,875,932
(41.07 %)		 105,227
(10.14 %)
241 sacred lotus
GCF_000365185.1		 43,140
(7.01 %)		 15,920
(2.13 %)		 61,231
(13.11 %)		 n/a 38.30
(87.98 %)		 175,846
(12.06 %)		 58,428
(87.96 %)		 408,351
(2.83 %)		 275,384
(2.52 %)		 4,643,876
(30.20 %)		 40,599
(2.68 %)
242 saltwater cress
GCF_000478725.1		 38,705
(18.07 %)		 21,851
(11.68 %)		 39,487
(28.65 %)		 n/a 37.71
(98.09 %)		 3,020
(1.92 %)		 3,658
(98.08 %)		 102,162
(1.93 %)		 70,755
(3.25 %)		 1,162,538
(32.09 %)		 15,272
(3.87 %)
243 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1		 n/a 14,138
(0.74 %)		 125,370
(12.27 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 581
(100.00 %)		 655,331
(1.73 %)		 500,899
(4.88 %)		 7,172,490
(54.24 %)		 140,800
(5.87 %)
244 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1		 n/a 15,588
(0.93 %)		 117,831
(12.94 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 597,532
(1.81 %)		 430,194
(3.80 %)		 6,075,115
(49.91 %)		 129,512
(5.41 %)
245 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2		 94,251
(12.60 %)		 31,266
(3.58 %)		 108,141
(21.47 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,162
(100.00 %)		 357,482
(2.10 %)		 419,009
(4.86 %)		 3,874,047
(41.08 %)		 105,216
(10.11 %)
246 scented satinash
GCF_900635055.1		 42,531
(12.21 %)		 15,353
(3.67 %)		 53,811
(20.61 %)		 n/a 40.64
(89.65 %)		 11,862
(10.35 %)		 19,039
(100.00 %)		 179,421
(2.10 %)		 174,902
(3.34 %)		 1,785,894
(25.35 %)		 55,685
(7.69 %)
247 sesame
GCF_000512975.1		 38,693
(16.95 %)		 15,555
(5.41 %)		 35,316
(19.66 %)		 n/a 35.00
(98.34 %)		 9,940
(1.66 %)		 26,176
(98.34 %)		 161,123
(2.85 %)		 79,750
(3.97 %)		 1,807,029
(31.02 %)		 9,873
(1.80 %)
248 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1		 n/a 16,242
(4.30 %)		 39,583
(17.06 %)		 n/a 35.22
(98.66 %)		 2,946
(1.35 %)		 1,451
(100.00 %)		 253,228
(3.98 %)		 186,657
(9.89 %)		 1,792,662
(45.14 %)		 19,928
(3.29 %)
249 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1		 46,475
(12.62 %)		 17,469
(4.11 %)		 51,531
(21.75 %)		 n/a 40.30
(93.72 %)		 7,529
(6.28 %)		 15,781
(100.00 %)		 194,855
(2.07 %)		 116,828
(2.25 %)		 1,801,472
(25.38 %)		 44,191
(5.74 %)
250 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1		 43,419
(12.78 %)		 14,758
(4.01 %)		 41,180
(19.74 %)		 n/a 40.38
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 160,749
(1.91 %)		 114,741
(3.07 %)		 1,619,569
(28.25 %)		 43,290
(7.15 %)
251 silver poplar
GCF_005239225.1		 53,068
(14.65 %)		 20,299
(4.74 %)		 44,556
(16.36 %)		 n/a 33.75
(100.00 %)		 n/a 1,287
(100.00 %)		 309,097
(3.34 %)		 175,288
(4.77 %)		 2,457,634
(38.38 %)		 4,613
(0.67 %)
252 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1		 28,735
(15.21 %)		 13,143
(5.29 %)		 32,007
(22.39 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 89,958
(1.86 %)		 351,649
(15.29 %)		 884,646
(35.58 %)		 14,711
(4.52 %)
253 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3		 48,290
(8.57 %)		 17,901
(3.45 %)		 73,969
(19.64 %)		 n/a 43.88
(95.30 %)		 3,906
(4.70 %)		 4,775
(95.30 %)		 556,607
(65.39 %)		 177,271
(4.54 %)		 2,371,199
(48.20 %)		 110,115
(18.82 %)
254 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1		 n/a 18,138
(3.63 %)		 75,180
(20.67 %)		 n/a 43.67
(97.96 %)		 2,108
(2.04 %)		 308
(100.00 %)		 559,950
(63.17 %)		 156,952
(3.01 %)		 2,481,716
(46.70 %)		 109,923
(19.06 %)
255 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6		 88,003
(9.85 %)		 27,705
(3.08 %)		 77,033
(11.88 %)		 n/a 34.74
(97.36 %)		 8,918
(2.65 %)		 9,199
(97.35 %)		 848,398
(38.02 %)		 434,042
(5.29 %)		 5,346,884
(45.07 %)		 35,893
(1.55 %)
256 spider flower
GCF_000463585.1		 45,524
(22.00 %)		 21,103
(10.40 %)		 38,184
(27.17 %)		 n/a 39.40
(87.71 %)		 24,824
(12.32 %)		 37,073
(87.68 %)		 144,827
(3.22 %)		 103,970
(4.10 %)		 1,118,840
(31.64 %)		 29,313
(6.47 %)
257 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1		 41,494
(5.76 %)		 12,540
(1.38 %)		 68,522
(12.26 %)		 n/a 37.82
(95.53 %)		 137,086
(4.48 %)		 78,263
(100.00 %)		 374,336
(2.48 %)		 670,331
(6.78 %)		 3,213,561
(52.82 %)		 89,520
(4.54 %)
258 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1		 58,405
(7.11 %)		 12,431
(1.27 %)		 61,084
(11.35 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 246
(100.00 %)		 378,521
(2.27 %)		 722,814
(6.29 %)		 2,950,586
(58.17 %)		 92,256
(5.21 %)
259 spotted monkey flower
GCF_000504015.1		 34,441
(15.56 %)		 14,508
(4.41 %)		 34,904
(18.83 %)		 n/a 35.50
(93.50 %)		 15,528
(6.52 %)		 17,740
(93.48 %)		 227,143
(4.28 %)		 204,234
(11.85 %)		 1,776,879
(40.60 %)		 21,718
(3.89 %)
260 stiff brome
GCF_000005505.3		 47,531
(20.35 %)		 15,530
(6.01 %)		 45,735
(34.29 %)		 n/a 46.40
(99.84 %)		 27
(0.16 %)		 36
(99.84 %)		 108,976
(17.41 %)		 54,391
(1.94 %)		 1,197,052
(21.34 %)		 48,209
(34.43 %)
261 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1		 n/a 15,045
(1.35 %)		 164,045
(15.16 %)		 n/a 38.82
(94.24 %)		 89,898
(5.63 %)		 714,282
(94.37 %)		 278,640
(1.91 %)		 388,660
(6.94 %)		 3,639,568
(28.92 %)		 64,180
(3.80 %)
262 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1		 n/a 18,847
(4.51 %)		 76,529
(27.07 %)		 n/a 45.11
(99.96 %)		 1,423
(0.03 %)		 7,128
(99.97 %)		 258,594
(29.31 %)		 144,716
(2.51 %)		 1,976,510
(35.41 %)		 113,324
(26.96 %)
263 sweet cherry
GCF_002207925.1		 39,968
(19.06 %)		 15,007
(5.83 %)		 38,107
(23.61 %)		 n/a 37.72
(90.64 %)		 22,628
(9.39 %)		 10,148
(100.00 %)		 136,700
(2.47 %)		 104,376
(7.20 %)		 1,484,591
(25.20 %)		 9,956
(2.27 %)
264 sweet orange
GCF_000317415.1		 46,820
(15.94 %)		 14,390
(4.63 %)		 34,480
(18.04 %)		 n/a 34.07
(91.90 %)		 12,539
(8.11 %)		 17,383
(91.89 %)		 185,212
(2.95 %)		 104,182
(4.92 %)		 2,119,183
(29.53 %)		 6,540
(0.93 %)
265 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2		 n/a 23,319
(2.45 %)		 98,107
(18.19 %)		 n/a 35.14
(88.01 %)		 171,925
(12.06 %)		 28,461
(100.00 %)		 579,745
(3.87 %)		 473,175
(3.79 %)		 4,850,126
(32.44 %)		 52,715
(3.15 %)
266 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1		 n/a 22,279
(1.15 %)		 121,694
(10.54 %)		 n/a 35.34
(91.81 %)		 275,710
(8.22 %)		 314,564
(91.78 %)		 856,470
(2.64 %)		 970,252
(5.69 %)		 7,570,175
(42.39 %)		 29,072
(0.54 %)
267 switchgrass
GCF_016808335.1		 114,876
(10.54 %)		 31,534
(3.21 %)		 152,844
(27.54 %)		 n/a 46.79
(99.59 %)		 464
(0.41 %)		 1,091
(99.59 %)		 395,905
(1.77 %)		 323,173
(5.10 %)		 4,922,182
(39.47 %)		 213,249
(32.45 %)
268 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1		 n/a 15,605
(2.84 %)		 50,437
(14.57 %)		 n/a 38.53
(96.71 %)		 2,456
(3.29 %)		 7,020
(100.00 %)		 257,784
(2.74 %)		 211,756
(3.88 %)		 2,209,417
(41.80 %)		 54,125
(5.80 %)
269 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4		 53,928
(40.16 %)		 26,582
(34.47 %)		 11,416
(18.70 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 68,517
(16.50 %)		 27,064
(2.77 %)		 749,005
(22.64 %)		 4,601
(1.63 %)
270 thunder duke vine
GCF_013401445.1		 56,436
(17.59 %)		 20,174
(5.61 %)		 42,326
(19.85 %)		 n/a 37.58
(99.96 %)		 146
(0.04 %)		 321
(100.00 %)		 125,395
(2.23 %)		 102,179
(22.89 %)		 1,226,273
(38.50 %)		 6,893
(1.71 %)
271 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1		 50,668
(2.79 %)		 17,479
(0.82 %)		 117,543
(8.63 %)		 n/a 40.23
(88.38 %)		 119,817
(11.63 %)		 37,194
(100.00 %)		 622,838
(1.51 %)		 788,520
(3.46 %)		 11,822,060
(48.66 %)		 174,838
(3.17 %)
272 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2		 66,966
(3.67 %)		 17,141
(1.02 %)		 81,513
(6.82 %)		 n/a 38.89
(97.29 %)		 213,074
(2.72 %)		 215,609
(97.29 %)		 486,556
(1.53 %)		 669,040
(5.52 %)		 10,446,746
(53.83 %)		 118,807
(2.33 %)
273 tomato (2024)
GCF_036512215.1		 59,947
(8.20 %)		 15,474
(1.94 %)		 40,638
(7.50 %)		 n/a 35.17
(99.99 %)		 166
(0.01 %)		 14
(100.00 %)		 333,077
(2.31 %)		 259,232
(7.09 %)		 5,402,596
(43.04 %)		 31,740
(4.85 %)
274 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5		 45,847
(6.92 %)		 15,425
(2.15 %)		 38,319
(7.54 %)		 n/a 34.12
(90.19 %)		 19,539
(9.82 %)		 3,066
(100.00 %)		 311,852
(2.14 %)		 229,773
(3.18 %)		 5,390,626
(35.26 %)		 25,196
(1.27 %)
275 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1		 n/a 22,795
(3.47 %)		 67,418
(16.40 %)		 n/a 38.17
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 347,375
(3.07 %)		 304,988
(3.96 %)		 3,119,641
(40.22 %)		 30,300
(3.29 %)
276 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1		 n/a 22,897
(3.50 %)		 67,595
(16.43 %)		 n/a 38.12
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 118
(100.00 %)		 344,928
(2.90 %)		 299,566
(3.87 %)		 3,139,734
(39.86 %)		 30,533
(2.95 %)
277 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1		 69,030
(4.11 %)		 20,169
(1.21 %)		 55,515
(4.75 %)		 n/a 35.17
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 948
(100.00 %)		 618,195
(1.97 %)		 622,748
(3.28 %)		 8,002,633
(61.80 %)		 27,646
(0.67 %)
278 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1		 53,446
(3.92 %)		 20,707
(1.29 %)		 56,318
(5.01 %)		 n/a 35.03
(92.12 %)		 45,768
(7.88 %)		 121,185
(92.12 %)		 618,119
(2.07 %)		 589,954
(3.54 %)		 8,098,351
(55.57 %)		 28,949
(0.57 %)
279 trilobed morning glory
GCF_003576645.1		 49,472
(13.00 %)		 16,803
(3.58 %)		 50,448
(18.68 %)		 n/a 35.68
(94.76 %)		 31,256
(5.25 %)		 17
(100.00 %)		 333,211
(3.67 %)		 335,317
(10.66 %)		 2,341,085
(36.54 %)		 27,290
(3.24 %)
280 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2		 49,094
(16.30 %)		 14,451
(4.70 %)		 33,670
(18.59 %)		 n/a 34.22
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 184,421
(2.80 %)		 106,732
(3.28 %)		 1,996,057
(33.86 %)		 6,824
(1.28 %)
281 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2		 63,531
(8.16 %)		 16,883
(1.90 %)		 72,901
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,673
(0.23 %)		 2,002
(100.00 %)		 800,288
(3.71 %)		 460,119
(7.41 %)		 5,438,715
(37.84 %)		 19,628
(1.10 %)
282 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1		 n/a 13,357
(3.39 %)		 37,446
(17.24 %)		 n/a 37.56
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 244,573
(10.74 %)		 180,141
(13.98 %)		 1,184,686
(42.28 %)		 6,470
(2.86 %)
283 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1		 n/a 13,575
(3.44 %)		 38,113
(17.59 %)		 n/a 37.58
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 463
(100.00 %)		 245,892
(11.25 %)		 158,855
(13.35 %)		 1,221,056
(41.58 %)		 6,436
(2.63 %)
284 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2		 48,839
(21.95 %)		 19,452
(7.44 %)		 35,987
(20.77 %)		 n/a 36.49
(94.38 %)		 49,199
(5.63 %)		 24,194
(100.00 %)		 181,473
(3.18 %)		 143,114
(7.42 %)		 1,614,901
(29.14 %)		 13,094
(2.48 %)
285 wax gourd
GCF_009727055.1		 40,406
(4.66 %)		 13,481
(1.43 %)		 43,071
(6.68 %)		 n/a 34.85
(98.39 %)		 24,524
(1.62 %)		 1,791
(100.00 %)		 481,638
(2.55 %)		 364,998
(3.11 %)		 6,236,506
(49.68 %)		 21,741
(0.93 %)
286 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1		 n/a 22,395
(3.96 %)		 101,555
(33.88 %)		 n/a 45.70
(99.78 %)		 2,245
(0.22 %)		 1,143
(100.00 %)		 206,645
(1.57 %)		 174,457
(2.79 %)		 2,244,665
(26.11 %)		 117,743
(29.88 %)
287 white fonio (2020)
GCA_902806635.1		 n/a 33,011
(5.39 %)		 109,615
(30.77 %)		 n/a 45.47
(97.23 %)		 29,136
(2.79 %)		 29,155
(97.21 %)		 215,374
(1.42 %)		 159,137
(1.91 %)		 2,776,488
(28.15 %)		 136,308
(27.74 %)
288 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1		 n/a 21,959
(3.77 %)		 51,652
(20.18 %)		 n/a 36.92
(99.73 %)		 1,764
(0.27 %)		 3,171
(99.97 %)		 215,169
(3.21 %)		 247,660
(10.71 %)		 2,556,478
(43.72 %)		 14,520
(10.46 %)
289 white yam
GCF_009730915.1		 43,902
(7.41 %)		 13,647
(2.09 %)		 49,877
(12.79 %)		 n/a 36.25
(99.19 %)		 4,760
(0.81 %)		 2,254
(100.00 %)		 391,299
(3.19 %)		 258,918
(3.96 %)		 3,588,023
(40.59 %)		 28,929
(2.37 %)
290 wild cabbage
GCF_000695525.1		 66,717
(15.60 %)		 31,142
(8.08 %)		 103,348
(35.10 %)		 n/a 36.11
(91.23 %)		 52,140
(8.80 %)		 33,760
(99.98 %)		 197,515
(3.12 %)		 214,463
(4.43 %)		 2,535,207
(31.20 %)		 29,995
(2.99 %)
291 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2		 n/a 31,163
(6.66 %)		 79,290
(25.04 %)		 n/a 36.57
(98.21 %)		 135
(1.79 %)		 140
(100.00 %)		 273,972
(2.76 %)		 284,806
(6.41 %)		 2,750,803
(38.77 %)		 33,071
(3.37 %)
292 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1		 29,804
(16.68 %)		 13,252
(5.90 %)		 22,247
(14.89 %)		 n/a 32.94
(94.65 %)		 119,056
(5.55 %)		 6,074
(100.00 %)		 107,979
(2.19 %)		 67,029
(6.76 %)		 1,525,353
(32.45 %)		 2,481
(0.48 %)
293 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2		 131,285
(1.34 %)		 n/a 567,570
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,589
(3.31 %)		 148,296
(100.00 %)		 2,573,102
(1.23 %)		 2,990,888
(3.37 %)		 492,885
(96.69 %)		 2,220,880
(25.34 %)
294 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2		 53,171
(14.87 %)		 18,878
(4.31 %)		 45,554
(18.36 %)		 n/a 38.87
(82.70 %)		 22,178
(17.31 %)		 24,423
(82.71 %)		 214,040
(7.81 %)		 136,453
(2.42 %)		 1,656,678
(31.15 %)		 53,687
(8.28 %)
295 wild olive
GCF_002742605.1		 67,081
(6.69 %)		 19,793
(1.69 %)		 68,749
(9.17 %)		 n/a 35.40
(90.41 %)		 47,638
(9.59 %)		 41,226
(100.00 %)		 425,922
(1.79 %)		 378,656
(18.98 %)		 5,982,070
(40.81 %)		 12,534
(0.42 %)
296 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3		 57,082
(6.20 %)		 17,102
(1.68 %)		 76,760
(11.48 %)		 n/a 35.80
(88.03 %)		 135,554
(12.02 %)		 1,589
(100.00 %)		 596,136
(3.37 %)		 499,251
(3.39 %)		 5,279,103
(45.94 %)		 48,556
(1.91 %)
297 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2		 78,441
(5.58 %)		 16,952
(1.26 %)		 89,380
(9.95 %)		 n/a 36.84
(92.91 %)		 122,617
(7.13 %)		 997
(99.67 %)		 777,978
(3.35 %)		 619,944
(3.82 %)		 5,823,472
(53.61 %)		 79,537
(2.58 %)
298 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1		 67,384
(5.06 %)		 16,850
(1.28 %)		 83,780
(9.77 %)		 n/a 36.78
(93.48 %)		 14,157
(6.52 %)		 30
(100.00 %)		 767,054
(3.15 %)		 754,355
(3.89 %)		 5,146,558
(56.74 %)		 71,885
(2.45 %)
299 wild soybean
GCF_004193775.1		 81,537
(9.20 %)		 27,977
(2.99 %)		 78,144
(11.64 %)		 n/a 34.88
(97.58 %)		 752
(2.42 %)		 1,120
(100.00 %)		 551,217
(2.79 %)		 450,287
(6.65 %)		 5,379,409
(46.22 %)		 37,183
(1.52 %)
300 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1		 36,435
(23.91 %)		 13,996
(6.63 %)		 46,505
(35.89 %)		 n/a 38.40
(94.27 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,460
(94.25 %)		 71,057
(1.51 %)		 74,581
(2.78 %)		 1,034,180
(21.44 %)		 14,806
(3.21 %)
301 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1		 n/a 67,698
(2.77 %)		 385,590
(22.40 %)		 n/a 44.92
(99.75 %)		 76,230
(0.26 %)		 15,303
(100.00 %)		 1,015,234
(1.60 %)		 910,932
(3.64 %)		 10,425,387
(46.78 %)		 637,314
(24.52 %)
302 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1		 46,114
(5.99 %)		 15,458
(1.87 %)		 42,907
(7.63 %)		 n/a 34.50
(92.34 %)		 41,684
(7.67 %)		 41,696
(92.33 %)		 363,460
(2.48 %)		 271,129
(4.15 %)		 6,330,153
(36.93 %)		 19,639
(1.20 %)
303 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1		 n/a 17,733
(2.85 %)		 55,354
(14.76 %)		 n/a 34.32
(99.33 %)		 780
(0.67 %)		 683
(100.00 %)		 586,981
(35.31 %)		 275,412
(4.57 %)		 3,561,395
(35.28 %)		 14,172
(0.96 %)
304 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1		 n/a 14,109
(3.33 %)		 40,033
(15.32 %)		 n/a 34.56
(97.67 %)		 9,429
(2.34 %)		 21
(100.00 %)		 410,680
(35.69 %)		 189,467
(4.45 %)		 2,405,053
(34.36 %)		 10,620
(1.04 %)
305 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1		 46,287
(10.68 %)		 14,823
(2.93 %)		 44,674
(15.11 %)		 n/a 35.08
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 310,377
(2.83 %)		 242,451
(9.17 %)		 2,706,407
(38.52 %)		 11,751
(1.05 %)
306 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3		 46,797
(11.01 %)		 14,907
(3.07 %)		 44,949
(15.02 %)		 n/a 34.56
(96.91 %)		 13,440
(3.10 %)		 14,644
(96.90 %)		 462,807
(35.59 %)		 222,647
(4.83 %)		 2,745,513
(34.80 %)		 11,591
(1.00 %)
307 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1		 n/a 22,511
(18.61 %)		 30,519
(28.94 %)		 n/a 35.60
(90.69 %)		 22,839
(9.35 %)		 30,649
(90.65 %)		 86,568
(2.39 %)		 44,616
(2.78 %)		 1,035,105
(23.86 %)		 6,701
(1.74 %)
308 winter squash
GCF_002738345.1		 49,714
(19.34 %)		 18,860
(6.74 %)		 33,884
(18.55 %)		 n/a 36.33
(97.81 %)		 17,224
(2.20 %)		 8,299
(100.00 %)		 169,605
(3.09 %)		 134,380
(10.82 %)		 1,493,623
(35.66 %)		 12,619
(2.64 %)
309 wood tobacco
GCF_000393655.1		 58,358
(2.93 %)		 17,332
(0.82 %)		 111,663
(7.17 %)		 n/a 39.09
(92.17 %)		 338,901
(7.84 %)		 392,998
(92.16 %)		 598,929
(1.44 %)		 776,240
(4.57 %)		 13,228,149
(49.11 %)		 100,864
(1.49 %)
310 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1		 n/a 56,069
(8.51 %)		 138,660
(27.88 %)		 n/a 36.22
(79.66 %)		 22,714
(20.35 %)		 9,746
(100.00 %)		 367,321
(2.38 %)		 303,381
(3.03 %)		 4,551,648
(26.34 %)		 50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 310

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Primates 221 assemblies assembly stats track stats
Mammals 651 assemblies assembly stats track stats
Birds 419 assemblies assembly stats track stats
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other vertebrates 296 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1130 assemblies assembly stats track stats
Plants 310 assemblies assembly stats track stats
Fungi 920 assemblies assembly stats track stats
Viruses 291 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 112 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 541 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1159 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 778 assemblies assembly stats track stats