Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
39,239
(0.49 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1
57,514
(54.61 %)
14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
94,745
(2.70 %)
3 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,172
(3.82 %)
23,424
(1.78 %)
27,990
(2.23 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
1,726,079
(12.81 %)
680,428
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
85,680
(0.94 %)
4 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1
45,963
(36.56 %)
20,933
(2.00 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,083
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
5 African malaria mosquito (PEST 2006)
GCA_000005575.1
n/a 5,478
(2.34 %)
30,482
(13.88 %)
n/a 44.27
(95.26 %)
8,735
(4.75 %)
8,115
(99.79 %)
241,805
(14.48 %)
72,702
(2.39 %)
1,434,880
(21.28 %)
25,507
(8.25 %)
6 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
46,043
(34.84 %)
19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
7 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
23,832
(3.81 %)
8 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
31,905
(1.94 %)
41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
53,956
(1.50 %)
9 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,014
(3.56 %)
18,437
(1.94 %)
18,446
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,150,224
(36.21 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
54,502
(1.38 %)
10 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
20,139
(1.58 %)
18,286
(1.41 %)
n/a 39.80
(96.07 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
n/a 747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
30,224
(0.63 %)
11 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
50,852
(2.67 %)
12 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1
60,799
(51.66 %)
14,382
(0.98 %)
18,601
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
161
(0.70 %)
194
(100.00 %)
3,322,619
(43.19 %)
478,206
(1.77 %)
12,316,391
(32.01 %)
49,792
(2.45 %)
13 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
24,558
(0.63 %)
14 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
38,686
(33.79 %)
20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
90,767
(1.29 %)
15 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
26,240
(36.96 %)
17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
44,651
(1.14 %)
16 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1
n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
44,261
(5.21 %)
17 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
24,453
(8.50 %)
38.47
(99.52 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
50,987
(4.44 %)
18 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
33,668
(37.51 %)
18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
19 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2
n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
20 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1
16,082
(8.44 %)
4,038
(1.42 %)
32,856
(9.80 %)
n/a 34.73
(95.75 %)
10,626
(4.26 %)
26,005
(95.74 %)
203,498
(3.41 %)
100,483
(2.15 %)
2,221,362
(35.19 %)
18,108
(3.49 %)
21 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
17,048
(6.08 %)
22 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
23,814
(3.66 %)
23 apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank)
GCA_004936735.2
n/a 426
(3.03 %)
203
(12.39 %)
n/a 32.03
(100.00 %)
10
(0.00 %)
50
(100.00 %)
3,358
(1.88 %)
1,257
(0.81 %)
67,711
(20.74 %)
4
(0.02 %)
24 apicomplexans E.tenella (Houghton 2013)
GCA_000499545.1
n/a 326
(0.37 %)
1,632
(4.94 %)
n/a 51.33
(98.72 %)
8,063
(1.32 %)
12,727
(98.68 %)
127,265
(17.42 %)
148,397
(16.77 %)
326,694
(37.33 %)
12,417
(22.22 %)
25 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1
n/a 22,542
(3.52 %)
67,060
(16.20 %)
n/a 38.04
(88.95 %)
7,175
(11.05 %)
806
(100.00 %)
692,611
(50.80 %)
322,540
(4.42 %)
3,033,193
(35.58 %)
25,871
(1.75 %)
26 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
48,638
(1.17 %)
27 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
35,342
(1.47 %)
41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
64,716
(1.93 %)
28 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,390
(48.16 %)
1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
2,846
(42.44 %)
29 ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank)
GCA_000149205.2
n/a 1,524
(3.90 %)
5,275
(23.90 %)
n/a 50.30
(99.43 %)
158
(0.58 %)
249
(99.42 %)
5,218
(3.22 %)
2,452
(0.41 %)
51,693
(4.64 %)
1,128
(90.37 %)
30 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3
10,608
(51.05 %)
1,481
(3.36 %)
5,692
(22.11 %)
n/a 50.35
(99.87 %)
662
(0.13 %)
469
(99.87 %)
9,986
(1.32 %)
2,619
(0.36 %)
106,480
(7.71 %)
5,568
(53.86 %)
31 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1
11,257
(41.02 %)
1,596
(2.91 %)
8,283
(26.43 %)
n/a 49.20
(100.00 %)
n/a 34
(100.00 %)
14,775
(2.01 %)
16,031
(2.34 %)
103,256
(17.19 %)
805
(44.28 %)
32 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2
n/a 1,516
(1.76 %)
5,714
(11.07 %)
n/a 37.07
(99.50 %)
566
(0.51 %)
593
(99.49 %)
38,696
(2.74 %)
27,571
(2.05 %)
270,617
(48.64 %)
8,002
(10.69 %)
33 ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank)
GCA_000003855.2
n/a 1,518
(1.57 %)
5,702
(9.73 %)
n/a 35.75
(98.67 %)
1,691
(1.34 %)
1,794
(98.66 %)
42,930
(2.67 %)
27,826
(1.78 %)
328,698
(50.87 %)
7,943
(9.35 %)
34 ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban)
GCA_000151335.1
n/a 1,479
(4.26 %)
5,283
(25.22 %)
n/a 46.59
(100.00 %)
33
(0.00 %)
88
(100.00 %)
10,463
(5.97 %)
5,206
(0.91 %)
74,027
(11.89 %)
4,784
(34.49 %)
35 ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank)
GCA_000271745.2
n/a 1,503
(2.37 %)
11,741
(30.20 %)
n/a 47.63
(98.55 %)
377
(1.46 %)
545
(98.54 %)
8,453
(2.23 %)
3,560
(0.37 %)
129,150
(7.65 %)
14,398
(29.11 %)
36 ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank)
GCA_000184105.1
n/a 1,446
(3.95 %)
5,635
(25.84 %)
n/a 50.12
(92.42 %)
2,066
(7.59 %)
3,579
(92.41 %)
11,499
(5.71 %)
11,754
(2.10 %)
87,648
(13.51 %)
4,483
(54.70 %)
37 ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank)
GCA_000315645.2
n/a 1,461
(4.51 %)
5,599
(29.85 %)
n/a 48.91
(95.53 %)
516
(4.48 %)
562
(95.52 %)
3,575
(0.59 %)
2,210
(0.38 %)
66,810
(6.03 %)
7,344
(38.10 %)
38 ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank)
GCA_004337985.1
n/a 1,482
(2.32 %)
7,302
(20.85 %)
n/a 47.48
(99.41 %)
1,281
(0.60 %)
108
(100.00 %)
24,268
(1.88 %)
11,049
(1.23 %)
163,225
(20.20 %)
764
(17.56 %)
39 ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank)
GCA_000226395.1
n/a 1,550
(3.72 %)
7,756
(30.06 %)
n/a 48.96
(99.94 %)
775
(0.06 %)
49
(100.00 %)
5,678
(0.78 %)
4,560
(0.81 %)
73,645
(5.86 %)
7,807
(50.55 %)
40 ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank)
GCA_000968595.1
n/a 1,499
(4.04 %)
3,608
(17.47 %)
n/a 50.55
(99.99 %)
76
(0.00 %)
938
(100.00 %)
12,877
(1.80 %)
4,459
(0.56 %)
116,737
(10.53 %)
2,561
(81.62 %)
41 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2
9,903
(39.44 %)
1,311
(2.58 %)
4,612
(17.66 %)
n/a 52.11
(99.64 %)
978
(0.36 %)
1,583
(100.00 %)
16,540
(1.85 %)
7,316
(0.76 %)
171,684
(11.10 %)
1,770
(49.40 %)
42 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1
10,279
(51.22 %)
1,134
(2.55 %)
2,026
(10.60 %)
n/a 54.96
(100.00 %)
57
(0.00 %)
73
(100.00 %)
15,846
(2.28 %)
8,000
(0.94 %)
169,678
(13.75 %)
22
(99.61 %)
43 ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank)
GCA_000001985.1
n/a 1,532
(4.18 %)
7,679
(34.14 %)
n/a 46.67
(99.38 %)
137
(0.62 %)
589
(99.38 %)
6,404
(1.04 %)
2,594
(0.58 %)
61,594
(6.70 %)
5,746
(15.84 %)
44 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1
10,941
(44.32 %)
1,451
(2.81 %)
6,906
(25.36 %)
n/a 52.14
(99.98 %)
3
(0.02 %)
24
(99.98 %)
8,941
(1.69 %)
8,367
(1.51 %)
99,818
(11.14 %)
27
(96.31 %)
45 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1
25,279
(7.94 %)
4,931
(1.05 %)
28,608
(7.16 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
34,722
(0.01 %)
7,722
(100.00 %)
146,974
(1.35 %)
89,987
(2.68 %)
2,666,250
(38.74 %)
39,696
(5.22 %)
46 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2
25,169
(7.95 %)
4,867
(1.05 %)
28,255
(7.08 %)
n/a 37.49
(100.00 %)
34,702
(0.01 %)
6,269
(100.00 %)
150,783
(1.53 %)
89,885
(2.69 %)
2,627,296
(38.56 %)
39,511
(5.22 %)
47 Asian swallowtail (v1 2015)
GCF_000836235.1
22,417
(13.18 %)
5,290
(2.15 %)
13,925
(7.00 %)
n/a 33.81
(97.56 %)
5,205
(2.44 %)
10,777
(97.56 %)
122,491
(2.29 %)
27,169
(0.71 %)
2,130,840
(38.92 %)
11,899
(2.85 %)
48 Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank)
GCA_001876365.2
n/a 10,893
(0.53 %)
128,502
(8.33 %)
n/a 40.42
(100.00 %)
n/a 2,434
(100.00 %)
605,350
(2.88 %)
921,761
(7.40 %)
11,169,474
(57.07 %)
220,674
(10.38 %)
49 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank
GCA_006496715.1
n/a 10,347
(0.43 %)
138,311
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
3,359
(0.07 %)
2,196
(100.00 %)
691,302
(2.69 %)
1,084,185
(7.47 %)
12,619,495
(57.66 %)
250,421
(10.15 %)
50 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq)
GCF_006496715.1
49,254
(2.57 %)
10,500
(0.44 %)
138,307
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
3,359
(0.07 %)
2,197
(100.00 %)
6,821,491
(69.74 %)
1,084,205
(7.47 %)
12,619,646
(57.66 %)
250,420
(10.13 %)
51 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1
n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
39,691
(1.17 %)
52 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
48,976
(40.12 %)
18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
53 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1
52,117
(66.34 %)
14,960
(3.20 %)
45,365
(7.48 %)
69,625
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,421
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
54 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
15,249
(2.65 %)
25,664
(6.68 %)
n/a 44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,175,759
(12.03 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
33,465
(1.97 %)
55 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
56 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
60,922
(45.62 %)
12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
105,821
(2.42 %)
57 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,472
(14.88 %)
2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
509
(0.15 %)
58 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
52,178
(47.52 %)
18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
49,789
(1.25 %)
59 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1
n/a 13,319
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
219
(0.59 %)
453
(100.00 %)
700,173
(13.18 %)
457,546
(13.85 %)
4,523,003
(31.73 %)
42,686
(7.00 %)
60 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1
42,399
(57.52 %)
15,312
(3.18 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
811,892
(18.19 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
61 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
26,976
(3.04 %)
41.55
(99.23 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
47,061
(3.25 %)
62 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
11,133
(1.44 %)
21,138
(1.69 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
413,761
(3.90 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
10,575
(0.29 %)
63 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
64 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
65 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,548
(2.85 %)
66 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
16,166
(3.05 %)
25,084
(6.20 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
465,997
(3.11 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
16,276
(1.04 %)
67 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1
10,448
(49.20 %)
1,066
(2.53 %)
5,238
(16.95 %)
n/a 46.48
(99.32 %)
225
(0.68 %)
254
(99.32 %)
4,921
(0.90 %)
2,352
(0.47 %)
62,603
(9.90 %)
5,244
(15.19 %)
68 basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank)
GCA_000182895.1
n/a 1,050
(2.04 %)
3,917
(10.89 %)
n/a 51.64
(100.00 %)
33
(0.00 %)
68
(100.00 %)
n/a 3,805
(0.81 %)
107,373
(7.81 %)
81
(99.54 %)
69 basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank)
GCA_001720195.2
n/a 921
(4.16 %)
4,119
(24.79 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
n/a 8
(100.00 %)
2,424
(0.66 %)
1,011
(0.30 %)
56,356
(7.99 %)
1,869
(7.30 %)
70 basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank)
GCA_000091045.1
n/a 957
(3.66 %)
3,784
(19.12 %)
n/a 48.54
(99.99 %)
85
(0.01 %)
99
(99.99 %)
4,944
(5.25 %)
1,808
(0.52 %)
68,717
(8.41 %)
5,128
(28.73 %)
71 basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank)
GCA_000512585.3
n/a 918
(2.66 %)
4,907
(18.38 %)
n/a 47.29
(100.00 %)
n/a 8
(100.00 %)
7,245
(1.32 %)
2,141
(0.47 %)
97,927
(9.78 %)
4,995
(11.17 %)
72 basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016)
GCF_000512585.1
9,187
(54.88 %)
867
(2.56 %)
4,441
(17.03 %)
n/a 47.25
(99.94 %)
30
(0.06 %)
42
(99.94 %)
7,231
(1.31 %)
1,919
(0.32 %)
110,288
(10.48 %)
4,972
(10.95 %)
73 basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank)
GCA_000512565.3
n/a 910
(2.69 %)
4,861
(19.78 %)
n/a 48.39
(100.00 %)
n/a 11
(100.00 %)
7,778
(1.42 %)
2,452
(0.43 %)
86,630
(7.97 %)
3,644
(14.24 %)
74 basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016)
GCF_000512565.1
8,645
(55.47 %)
908
(2.72 %)
4,862
(19.87 %)
n/a 48.38
(99.98 %)
56
(0.02 %)
69
(99.98 %)
7,816
(1.43 %)
2,425
(0.42 %)
85,868
(7.91 %)
3,698
(15.12 %)
75 basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq)
GCF_000507465.1
8,472
(55.96 %)
884
(2.79 %)
5,418
(21.48 %)
n/a 44.88
(99.73 %)
43
(0.27 %)
105
(99.73 %)
6,509
(1.21 %)
1,529
(0.25 %)
101,733
(9.98 %)
2,326
(4.59 %)
76 basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank)
GCA_000507465.4
n/a 886
(2.74 %)
5,392
(21.25 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
n/a 4
(100.00 %)
6,585
(1.21 %)
1,546
(0.27 %)
104,495
(10.38 %)
2,335
(5.10 %)
77 basidiomycetes K.pini (v1 CBS 10737 2016)
GCF_000512605.1
7,854
(58.26 %)
816
(2.92 %)
5,392
(23.35 %)
n/a 40.23
(99.94 %)
24
(0.06 %)
42
(99.94 %)
6,502
(1.34 %)
1,847
(0.36 %)
99,393
(12.25 %)
1,191
(2.91 %)
78 basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019)
GCF_008629635.1
7,454
(55.86 %)
893
(2.94 %)
3,348
(15.13 %)
n/a 49.82
(99.99 %)
11
(0.01 %)
132
(100.00 %)
5,510
(1.13 %)
1,598
(0.33 %)
81,983
(9.00 %)
512
(39.06 %)
79 basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007)
GCF_000181695.1
4,286
(69.39 %)
1,060
(8.79 %)
2,585
(44.95 %)
n/a 52.06
(100.00 %)
22
(0.00 %)
89
(100.00 %)
1,777
(0.93 %)
720
(0.48 %)
22,182
(4.73 %)
124
(60.74 %)
80 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
38
(40.33 %)
81 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1
25,020
(17.94 %)
4,205
(2.34 %)
27,352
(12.83 %)
n/a 41.09
(91.93 %)
19,248
(8.05 %)
50,565
(100.00 %)
57,833
(1.39 %)
27,440
(2.49 %)
1,173,760
(18.39 %)
10,942
(2.61 %)
82 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1
16,406
(4.01 %)
4,087
(0.75 %)
46,846
(6.53 %)
16,764
(4.04 %)
40.92
(95.72 %)
25,039
(4.23 %)
212,650
(95.77 %)
641,987
(7.51 %)
360,406
(11.43 %)
3,411,951
(46.01 %)
40,540
(3.99 %)
83 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,939
(8.78 %)
12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
32,547
(2.39 %)
84 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1
n/a 14,732
(1.14 %)
18,988
(1.77 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
57
(0.00 %)
129
(100.00 %)
1,130,950
(11.22 %)
213,212
(1.80 %)
11,049,280
(26.48 %)
53,923
(2.09 %)
85 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
59,279
(1.53 %)
86 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCA_000837645.1
n/a n/a n/a n/a 40.76
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(4.54 %)
15
(4.33 %)
0
(0.00 %)
87 bighorn sheep (v1 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.1
75,387
(2.66 %)
18,667
(1.37 %)
20,248
(1.35 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
3
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,081,260
(20.10 %)
796,298
(12.14 %)
12,235,764
(46.75 %)
50,538
(11.18 %)
88 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4
59,637
(15.47 %)
20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
4,559
(0.56 %)
89 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank)
GCA_022577435.1
n/a 14,991
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,017,149
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,526
(28.91 %)
48,360
(4.43 %)
90 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1
56,255
(36.51 %)
18,774
(1.38 %)
22,346
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
215
(0.05 %)
1,075
(100.00 %)
4,200,385
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,639
(40.14 %)
43,525
(1.14 %)
91 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
59,197
(39.21 %)
21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
92 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
21,256
(1.89 %)
23,679
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,602,009
(50.58 %)
991,745
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
93 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
31,476
(5.07 %)
41.95
(100.00 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
31,750
(3.32 %)
94 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1
35,923
(2.41 %)
3,903
(0.15 %)
39,667
(2.27 %)
40,959
(2.59 %)
36.64
(83.75 %)
1,158,725
(16.44 %)
26,876
(100.00 %)
5,488,723
(29.98 %)
7,028,944
(21.91 %)
10,445,796
(49.62 %)
178,205
(3.43 %)
95 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1
51,115
(48.16 %)
13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
45,318
(4.71 %)
96 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
138,831
(8.38 %)
97 black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank)
GCA_000208615.1
n/a 3,432
(0.19 %)
108,471
(5.13 %)
n/a 45.22
(78.65 %)
201,145
(21.35 %)
570,637
(78.65 %)
656,957
(3.38 %)
365,918
(1.61 %)
8,574,437
(27.02 %)
345,141
(14.15 %)
98 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1
n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
26,838
(2.34 %)
99 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1
47,540
(38.02 %)
19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
70,851
(1.80 %)
100 bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq)
GCF_000457365.1
42,229
(5.95 %)
3,558
(0.29 %)
24,115
(2.96 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,921
(1.91 %)
408,322
(98.09 %)
629,362
(4.20 %)
749,383
(9.40 %)
6,932,184
(43.02 %)
16,970
(0.64 %)
101 bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank)
GCA_000457365.2
n/a 3,378
(0.29 %)
23,684
(2.94 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,903
(1.91 %)
406,924
(98.09 %)
587,583
(3.57 %)
749,212
(9.41 %)
6,921,847
(43.04 %)
16,561
(0.63 %)
102 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2
n/a 19,164
(1.81 %)
20,546
(1.41 %)
34,210
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,202
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
67,189
(1.73 %)
103 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1
47,312
(59.52 %)
14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
104 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
105 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
46,441
(1.87 %)
40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
37,273
(1.03 %)
106 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
32,474
(0.75 %)
107 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1
n/a 19,820
(1.76 %)
20,399
(1.15 %)
n/a 40.98
(99.88 %)
36
(0.12 %)
251
(99.88 %)
5,232,617
(54.01 %)
1,003,539
(10.19 %)
14,858,575
(42.10 %)
42,467
(1.24 %)
108 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
52,294
(2.02 %)
109 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1
n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
63,992
(1.47 %)
110 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1
n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
46,301
(2.99 %)
111 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1
n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
89,940
(1.88 %)
112 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1
38,099
(52.40 %)
14,028
(1.05 %)
19,927
(1.81 %)
n/a 41.14
(98.37 %)
114,440
(1.64 %)
3,738
(100.00 %)
1,376,455
(6.78 %)
1,094,843
(5.18 %)
9,127,396
(44.98 %)
46,291
(1.18 %)
113 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
23,611
(63.03 %)
4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
35,431
(4.56 %)
114 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
54,006
(3.19 %)
18,811
(1.78 %)
21,058
(1.52 %)
39,408
(1.98 %)
41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,283,780
(41.29 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
62,126
(1.80 %)
115 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1
60,162
(4.01 %)
18,920
(1.66 %)
21,641
(1.49 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
215
(0.00 %)
902
(100.00 %)
4,166,472
(34.00 %)
659,124
(5.14 %)
13,282,996
(33.88 %)
68,113
(2.27 %)
116 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,619
(2.36 %)
3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
45,849
(2.46 %)
46.86
(99.96 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
13,204
(0.97 %)
117 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
26,137
(3.13 %)
42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
28,576
(2.39 %)
118 brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1
36,936
(60.13 %)
4,416
(0.37 %)
22,354
(3.57 %)
37,534
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
4,529
(0.04 %)
7,093
(100.00 %)
597,351
(3.69 %)
564,076
(6.64 %)
6,601,703
(47.48 %)
39,697
(1.55 %)
119 brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq)
GCF_014356525.1
36,949
(4.89 %)
4,427
(0.37 %)
22,417
(3.57 %)
37,573
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
4,529
(0.04 %)
7,094
(100.00 %)
597,178
(3.69 %)
564,092
(6.64 %)
6,601,918
(47.49 %)
39,697
(1.55 %)
120 budding yeast C.auris (6684 2015 genbank)
GCA_001189475.1
n/a 1,948
(12.61 %)
4,664
(59.90 %)
n/a 45.12
(98.69 %)
689
(1.33 %)
99
(100.00 %)
3,478
(1.23 %)
2,281
(0.83 %)
48,703
(8.19 %)
1,579
(6.36 %)
121 budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank)
GCA_002775015.1
n/a 2,030
(12.92 %)
4,702
(58.30 %)
n/a 45.32
(100.00 %)
3
(0.00 %)
20
(100.00 %)
3,464
(2.27 %)
2,436
(0.80 %)
28,524
(6.96 %)
1,757
(7.37 %)
122 budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank)
GCA_000003835.1
n/a 1,956
(12.86 %)
4,335
(54.85 %)
n/a 44.50
(99.71 %)
79
(0.29 %)
88
(99.71 %)
2,272
(1.18 %)
4,036
(1.77 %)
48,188
(8.66 %)
1,474
(15.82 %)
123 budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022)
GCF_023343755.1
4,892
(62.35 %)
1,845
(11.42 %)
4,476
(56.70 %)
n/a 37.84
(99.95 %)
167
(0.05 %)
148
(100.00 %)
14,118
(4.93 %)
19,713
(8.99 %)
82,014
(21.64 %)
201
(0.52 %)
124 budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank)
GCA_001417885.1
n/a 3,349
(28.79 %)
4,665
(66.28 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
n/a 9
(100.00 %)
7,406
(3.43 %)
3,781
(1.46 %)
51,732
(11.80 %)
742
(4.91 %)
125 budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank)
GCA_000149685.1
n/a 1,905
(9.82 %)
5,004
(52.37 %)
n/a 36.94
(99.45 %)
117
(0.56 %)
145
(99.44 %)
30,880
(10.91 %)
18,155
(4.10 %)
100,210
(23.18 %)
22
(0.04 %)
126 budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank)
GCA_000002545.2
n/a 3,553
(27.93 %)
4,799
(61.37 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
3
(0.00 %)
16
(100.00 %)
3,047
(1.32 %)
2,546
(1.58 %)
59,567
(11.20 %)
635
(3.11 %)
127 budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank)
GCA_000002525.1
n/a 1,755
(6.59 %)
4,802
(37.76 %)
n/a 49.05
(99.99 %)
28
(0.01 %)
34
(99.99 %)
7,553
(2.98 %)
9,578
(2.12 %)
81,595
(9.59 %)
6,216
(33.42 %)
128 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1
32,026
(47.01 %)
13,250
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,059
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
129 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
25,882
(55.17 %)
4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
47,660
(8.03 %)
35.73
(100.00 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
43,150
(4.96 %)
130 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
42,925
(13.84 %)
33.95
(100.00 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
11,070
(2.07 %)
131 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
21,844
(65.09 %)
4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
30,285
(15.57 %)
33.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
6,783
(2.24 %)
132 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1
n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
34,926
(2.94 %)
133 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
62,245
(1.50 %)
134 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1
n/a 21,020
(1.79 %)
20,045
(1.39 %)
45,176
(2.15 %)
41.40
(99.28 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,949
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
51,989
(1.50 %)
135 California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015)
GCF_001194135.1
26,135
(1.83 %)
3,125
(0.12 %)
17,875
(1.29 %)
27,144
(1.85 %)
36.03
(84.95 %)
548,450
(15.13 %)
700,124
(84.87 %)
3,498,348
(13.19 %)
3,005,729
(6.50 %)
13,687,022
(41.09 %)
22,984
(0.34 %)
136 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
18,283
(1.66 %)
19,326
(1.35 %)
38,985
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
5,016,399
(43.75 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
66,822
(2.52 %)
137 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
25,319
(0.31 %)
138 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1
n/a 16,133
(0.56 %)
62,445
(2.92 %)
n/a 34.93
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,797
(96.77 %)
1,171,727
(3.54 %)
948,641
(4.39 %)
21,533,236
(46.16 %)
16,621
(0.21 %)
139 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1
n/a 11,967
(0.44 %)
20,851
(1.23 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
1,443
(0.01 %)
596
(100.00 %)
4,902,656
(34.96 %)
1,040,893
(17.82 %)
16,403,253
(54.79 %)
113,936
(1.69 %)
140 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
11,303
(1.45 %)
24,758
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
405,042
(5.66 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
11,477
(0.36 %)
141 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
30,963
(1.41 %)
142 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
43,324
(1.28 %)
143 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
19,669
(1.56 %)
21,999
(1.33 %)
n/a 41.93
(100.00 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,643,592
(49.67 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
44,357
(1.24 %)
144 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2
76,293
(2.98 %)
19,325
(1.49 %)
21,665
(1.32 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
386
(0.00 %)
1,957
(100.00 %)
3,550,686
(24.18 %)
544,595
(2.90 %)
13,050,221
(41.81 %)
44,208
(1.24 %)
145 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
173,264
(3.70 %)
146 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1
40,788
(61.50 %)
14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
147 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,933
(9.58 %)
15,712
(2.71 %)
25,639
(5.25 %)
n/a 39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
871,222
(5.75 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
31,438
(1.87 %)
148 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
32,840
(1.87 %)
149 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
57,657
(1.31 %)
150 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1
n/a 15,255
(2.94 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
49
(0.00 %)
37
(100.00 %)
465,710
(3.82 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,999
(23.28 %)
30,971
(2.02 %)
151 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
12,065
(1.82 %)
10,050
(2.07 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
453,775
(7.30 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
12,486
(0.42 %)
152 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3
n/a 20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
45,870
(0.97 %)
153 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1
n/a 20,001
(1.79 %)
21,230
(1.19 %)
n/a 40.62
(99.78 %)
22
(0.22 %)
141
(99.78 %)
5,092,768
(48.83 %)
946,933
(11.75 %)
14,844,947
(42.39 %)
47,662
(1.21 %)
154 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
61,901
(2.29 %)
155 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
37,317
(4.18 %)
156 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
19,755
(1.76 %)
20,017
(1.50 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,544,603
(29.89 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
19,343
(0.58 %)
157 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1
92,370
(51.48 %)
27,141
(1.63 %)
113,328
(4.52 %)
157,545
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,333
(0.01 %)
9,977
(99.99 %)
4,892,399
(55.31 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,870
(54.55 %)
62,726
(1.40 %)
158 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1
34,390
(49.60 %)
15,350
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
1,572
(0.08 %)
361
(100.00 %)
1,669,327
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,422
(32.38 %)
16,290
(0.85 %)
159 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
12,140
(1.50 %)
25,641
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
560,317
(7.62 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
8,105
(0.24 %)
160 chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011)
GCF_000203795.1
8,677
(50.60 %)
1,251
(4.00 %)
7,681
(34.45 %)
n/a 39.25
(99.25 %)
383
(0.76 %)
510
(99.24 %)
2,585
(1.13 %)
3,424
(1.20 %)
81,225
(12.02 %)
161
(0.21 %)
161 ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012)
GCA_000295675.1
n/a 1,065
(1.03 %)
1,781
(1.87 %)
n/a 31.32
(99.93 %)
1,347
(0.00 %)
23,709
(100.00 %)
29,228
(1.96 %)
22,291
(1.48 %)
550,667
(25.14 %)
20
(0.01 %)
162 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
15,237
(3.47 %)
22,710
(7.34 %)
37,043
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
329,586
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
10,698
(0.86 %)
163 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2
42,746
(63.74 %)
15,239
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,479
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
164 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2
42,746
(13.53 %)
15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
324,324
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
165 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1
81,219
(51.66 %)
18,516
(1.55 %)
20,363
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
181
(0.06 %)
34
(100.00 %)
4,798,634
(33.91 %)
992,669
(2.08 %)
13,618,933
(34.42 %)
67,831
(2.45 %)
166 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
23,070
(64.23 %)
4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
34,699
(13.48 %)
33.59
(100.00 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
15,663
(2.98 %)
167 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1
64,032
(4.29 %)
24,727
(1.43 %)
46,926
(3.38 %)
n/a 43.33
(95.39 %)
265,291
(4.63 %)
22,810
(99.99 %)
1,185,308
(5.22 %)
2,455,045
(15.99 %)
11,710,855
(46.53 %)
72,061
(1.46 %)
168 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1
67,207
(45.84 %)
18,772
(1.77 %)
20,527
(1.42 %)
35,815
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,521
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
169 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
45,962
(43.27 %)
17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
170 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1
37,661
(35.20 %)
18,681
(0.81 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,697
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
171 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,427
(5.81 %)
27,632
(2.17 %)
59,950
(5.28 %)
n/a 37.00
(97.48 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,460,282
(5.17 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
48,702
(1.38 %)
172 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1
50,206
(57.28 %)
13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
25,267
(1.71 %)
173 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
12,599
(1.80 %)
12,623
(2.28 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
418,870
(8.06 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
18,002
(0.74 %)
174 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
10,480
(0.23 %)
175 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3
37,121
(48.05 %)
3,276
(0.22 %)
9,098
(1.38 %)
38,273
(4.24 %)
29.40
(98.45 %)
124,228
(1.55 %)
84,235
(98.46 %)
637,694
(2.45 %)
527,781
(4.43 %)
11,553,196
(51.16 %)
11,998
(0.33 %)
176 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1
41,888
(9.21 %)
3,611
(0.43 %)
13,244
(4.58 %)
44,721
(6.30 %)
36.11
(100.00 %)
75
(0.00 %)
13
(100.00 %)
239,042
(1.40 %)
359,961
(7.89 %)
4,399,053
(45.69 %)
33,411
(1.94 %)
177 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1
55,359
(63.58 %)
14,846
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
373
(0.01 %)
243
(100.00 %)
1,149,249
(19.12 %)
342,239
(9.71 %)
3,906,839
(32.84 %)
27,772
(2.71 %)
178 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1
39,986
(53.94 %)
12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
179 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
58,054
(45.51 %)
18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
70,700
(2.48 %)
180 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1
58,054
(3.40 %)
18,280
(1.71 %)
19,515
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
611
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,761,826
(28.38 %)
427,942
(3.89 %)
11,250,529
(32.57 %)
70,701
(2.48 %)
181 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
51,833
(1.38 %)
182 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
51,034
(3.23 %)
18,506
(1.88 %)
18,166
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,861,697
(29.93 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
51,834
(1.38 %)
183 common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.1
n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
61,931
(2.30 %)
184 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2
n/a 18,311
(1.71 %)
19,456
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
615
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,767,071
(28.35 %)
431,575
(3.90 %)
11,286,853
(32.63 %)
71,506
(2.50 %)
185 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
29,369
(33.72 %)
19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
56,694
(1.59 %)
186 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
21,505
(3.50 %)
187 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1
n/a n/a 54,346
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
18,782,633
(75.22 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
990,274
(4.84 %)
188 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1
21,972
(59.55 %)
4,839
(1.54 %)
21,045
(8.01 %)
n/a 36.13
(89.02 %)
26,910
(11.01 %)
24,551
(88.99 %)
115,046
(2.97 %)
31,900
(0.85 %)
2,230,382
(25.45 %)
15,851
(2.18 %)
189 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,679
(10.56 %)
16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
54,348
(11.30 %)
32.98
(99.48 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
24,513
(2.40 %)
190 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
76,183
(45.03 %)
20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
191 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
20,209
(1.91 %)
51,427
(6.84 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,251,819
(50.85 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
192 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1
90,094
(55.93 %)
29,389
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
832
(0.01 %)
278
(100.00 %)
3,481,389
(45.81 %)
802,775
(6.54 %)
8,190,816
(44.41 %)
83,696
(3.82 %)
193 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1
22,902
(28.68 %)
3,621
(2.94 %)
11,430
(17.96 %)
n/a 40.34
(99.47 %)
2
(0.53 %)
227
(100.00 %)
81,008
(2.67 %)
29,625
(4.98 %)
609,395
(25.66 %)
6,559
(5.05 %)
194 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1
n/a 3,519
(2.64 %)
12,174
(17.22 %)
n/a 40.54
(93.29 %)
13,228
(6.75 %)
4,192
(100.00 %)
63,254
(2.07 %)
22,325
(1.44 %)
728,942
(20.81 %)
8,375
(4.98 %)
195 crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020)
GCF_011947565.2
30,025
(5.21 %)
3,968
(0.39 %)
56,084
(8.02 %)
32,834
(5.48 %)
52.34
(98.93 %)
10,786
(1.08 %)
1,254
(100.00 %)
361,409
(3.23 %)
533,046
(8.92 %)
3,456,307
(19.29 %)
6,722
(54.88 %)
196 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2
n/a 15,131
(1.68 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
409
(0.54 %)
73
(100.00 %)
2,175,293
(47.80 %)
176,956
(1.87 %)
6,142,692
(38.35 %)
32,973
(1.28 %)
197 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1
64,558
(45.64 %)
19,142
(1.72 %)
22,139
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
1,099
(0.01 %)
122
(100.00 %)
3,040,239
(24.03 %)
796,913
(6.38 %)
10,478,261
(38.84 %)
64,921
(2.50 %)
198 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
48,152
(35.39 %)
22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
199 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
16,556
(3.78 %)
37,861
(8.42 %)
72,719
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
200 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1
50,318
(52.07 %)
15,109
(1.08 %)
19,281
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
110,838
(2.71 %)
201 diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008)
GCF_000002435.1
6,502
(71.82 %)
251
(1.29 %)
2,079
(62.62 %)
n/a 49.25
(99.82 %)
242
(0.19 %)
306
(99.81 %)
697
(1.34 %)
335
(0.65 %)
20,634
(5.24 %)
2,275
(23.86 %)
202 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
62,881
(2.13 %)
203 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
18,440
(1.59 %)
19,474
(1.48 %)
n/a 41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
n/a 606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
53,376
(1.90 %)
204 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
44,762
(33.07 %)
18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
37,092
(0.85 %)
205 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
44,022
(10.06 %)
206 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1
63,294
(3.74 %)
18,050
(0.43 %)
260,902
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
290
(100.00 %)
1,274,894
(2.42 %)
1,726,303
(5.40 %)
14,010,542
(72.58 %)
732,828
(17.24 %)
207 downy mildews (GKB4 2021 genbank)
GCA_018691715.1
n/a 1,641
(1.07 %)
33,976
(44.50 %)
n/a 54.16
(99.69 %)
80
(0.31 %)
133
(100.00 %)
18,997
(0.80 %)
16,094
(2.84 %)
200,994
(27.68 %)
232
(99.71 %)
208 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1
25,483
(48.39 %)
12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
209 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
11,864
(1.67 %)
11,795
(1.99 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
842,281
(18.63 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
17,379
(0.69 %)
210 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
1
(99.99 %)
211 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
24,567
(4.41 %)
212 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1
n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
101,394
(4.09 %)
41.76
(90.89 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
16,695
(0.43 %)
213 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1
57,615
(9.59 %)
15,348
(2.22 %)
28,518
(6.29 %)
42,170
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
527,486
(5.98 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
214 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
81,930
(5.75 %)
215 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1
65,163
(51.34 %)
17,637
(2.08 %)
22,318
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
30
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,415
(1.02 %)
12,031,652
(26.52 %)
53,604
(6.69 %)
216 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(4.95 %)
11,306
(1.54 %)
18,189
(3.03 %)
n/a 42.34
(96.16 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,405,480
(27.29 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
35,561
(2.16 %)
217 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1
n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
33,433
(3.99 %)
42.41
(100.00 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
41,784
(5.52 %)
218 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1
43,156
(39.58 %)
12,439
(0.39 %)
19,520
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
3,716
(1.95 %)
1,963
(100.00 %)
9,211,963
(69.93 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,613
(43.88 %)
41,682
(1.08 %)
219 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
117,743
(2.02 %)
220 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
2,781
(0.47 %)
221 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,138
(2.48 %)
19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
222 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1
n/a 21,298
(1.58 %)
21,024
(1.36 %)
36,645
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,964
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
223 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
34,561
(2.01 %)
42.15
(99.74 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
224 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1
54,631
(54.17 %)
17,073
(1.89 %)
34,794
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,009
(0.02 %)
394
(100.00 %)
761,527
(5.99 %)
913,328
(13.25 %)
5,768,003
(35.48 %)
120,990
(6.12 %)
225 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1
n/a 17,048
(2.22 %)
34,271
(5.56 %)
n/a 43.64
(99.61 %)
640
(0.40 %)
53
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,520
(8.15 %)
5,700,818
(27.40 %)
130,345
(8.19 %)
226 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1
69,556
(45.15 %)
18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
39
(0.00 %)
26
(100.00 %)
4,237,797
(30.90 %)
792,898
(2.69 %)
13,417,248
(36.59 %)
67,133
(2.54 %)
227 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
22,557
(62.12 %)
4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
26,251
(7.81 %)
33.70
(100.00 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
24,620
(4.88 %)
228 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1
46,467
(52.27 %)
14,820
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
1,072
(0.03 %)
356
(100.00 %)
476,317
(3.63 %)
520,730
(13.27 %)
3,283,400
(33.55 %)
47,051
(4.45 %)
229 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1
47,025
(39.90 %)
20,576
(1.75 %)
21,171
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
197
(0.00 %)
161
(100.00 %)
3,580,811
(22.71 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,125
(34.97 %)
20,725
(0.63 %)
230 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1
n/a 11,276
(1.79 %)
21,238
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,567
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
29,648
(2.35 %)
231 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1
n/a 12,415
(1.77 %)
23,484
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,737
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
34,729
(2.65 %)
232 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1
54,113
(34.13 %)
19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
4,863,656
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
233 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
32,738
(63.63 %)
5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
30,753
(4.27 %)
234 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
30,753
(4.27 %)
235 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1
n/a 15,456
(0.21 %)
47,501
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
7,009
(1.99 %)
2,468
(100.00 %)
20,643,710
(70.75 %)
7,150,262
(12.27 %)
9,477
(98.01 %)
365,066
(1.20 %)
236 fission yeast (v1 972h- 2007 refseq)
GCF_000002945.1
6,744
(82.69 %)
5,085
(73.29 %)
3,403
(39.29 %)
n/a 36.05
(100.00 %)
6
(0.00 %)
4
(100.00 %)
3,336
(2.63 %)
1,034
(0.58 %)
80,458
(16.22 %)
105
(0.31 %)
237 fission yeast (v2 972h- 2019 genbank)
GCA_000002945.3
n/a 5,084
(73.46 %)
3,394
(39.28 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
6
(0.00 %)
9
(100.00 %)
3,053
(1.03 %)
1,034
(0.58 %)
79,714
(16.06 %)
105
(0.31 %)
238 flatworm S.haematobium (v2 2020)
GCF_000699445.2
8,934
(5.16 %)
1,548
(0.29 %)
4,070
(2.36 %)
8,934
(5.16 %)
34.53
(99.76 %)
15,128
(0.26 %)
666
(100.00 %)
124,259
(1.58 %)
35,312
(1.17 %)
2,638,150
(34.10 %)
3,957
(0.38 %)
239 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2
n/a 15,436
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
240 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
39,651
(35.92 %)
18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
32,831
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
27,461
(0.64 %)
241 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1
24,196
(18.66 %)
10,065
(8.48 %)
14,473
(13.61 %)
n/a 38.15
(100.00 %)
7
(0.00 %)
11
(100.00 %)
298,709
(14.86 %)
80,048
(3.56 %)
1,317,733
(33.56 %)
18,849
(8.62 %)
242 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
27,794
(16.15 %)
243 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
30,130
(16.11 %)
244 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1
21,759
(15.21 %)
12,488
(9.92 %)
21,269
(14.06 %)
n/a 39.11
(100.00 %)
n/a 1,356
(100.00 %)
314,594
(25.90 %)
82,446
(12.33 %)
1,113,448
(37.00 %)
27,493
(12.03 %)
245 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,595
(26.45 %)
13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
27,530
(17.02 %)
246 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,444
(4.10 %)
13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
31,387
(14.91 %)
247 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,938
(24.60 %)
13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
28,204
(16.22 %)
248 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1
54,713
(61.19 %)
14,267
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,113
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
249 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1
54,713
(1.72 %)
14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
250 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
18,884
(1.76 %)
18,919
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,236,423
(40.48 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
53,465
(1.34 %)
251 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
59,340
(1.50 %)
252 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2
n/a 20,381
(1.71 %)
21,979
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,287
(100.00 %)
4,484,597
(41.53 %)
618,595
(2.00 %)
14,236,406
(30.39 %)
59,945
(1.50 %)
253 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
59,946
(1.50 %)
254 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1
59,027
(10.96 %)
15,412
(2.36 %)
31,802
(6.47 %)
73,197
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
531,360
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
255 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
17,520
(43.15 %)
4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
35,235
(7.97 %)
34.09
(100.00 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
30,200
(4.54 %)
256 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
12,198
(0.64 %)
257 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
0
(0.00 %)
19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
125,682
(4.01 %)
258 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
19,857
(1.43 %)
22,880
(1.27 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,578,287
(50.22 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,440
(44.85 %)
125,682
(4.02 %)
259 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
13,226
(1.87 %)
23,033
(2.15 %)
25,921
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
519,341
(5.86 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
37,343
(3.12 %)
260 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1
n/a 9,334
(1.82 %)
17,594
(2.12 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,284
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
28,919
(3.52 %)
261 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
0
(0.00 %)
18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
262 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
79,387
(1.14 %)
263 grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank)
GCA_025091365.1
n/a 2,982
(0.90 %)
5,710
(2.77 %)
n/a 27.24
(97.73 %)
41,970
(2.29 %)
8,544
(100.00 %)
195,538
(3.32 %)
65,664
(2.79 %)
2,529,566
(54.06 %)
4,357
(1.18 %)
264 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
74,772
(2.61 %)
265 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1
73,383
(42.66 %)
16,638
(0.72 %)
16,171
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
5,562,366
(25.40 %)
1,096,625
(2.60 %)
22,322,798
(43.37 %)
28,894
(0.57 %)
266 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1
n/a 18,022
(1.56 %)
20,018
(1.52 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
71,574
(2.28 %)
267 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
50,937
(43.78 %)
19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
41,741
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
268 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,937
(3.26 %)
18,992
(2.00 %)
19,880
(1.66 %)
41,778
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,285,971
(33.14 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
269 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
32,047
(1.05 %)
270 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2
53,353
(46.77 %)
18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,020
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
271 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,300,836
(34.99 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
272 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
80,955
(2.31 %)
273 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1
n/a 13,467
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,340
(13.40 %)
274 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1
n/a 18,322
(1.40 %)
21,049
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
468
(1.27 %)
359
(99.59 %)
4,247,148
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,194
(43.30 %)
101,620
(2.01 %)
275 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2
20,814
(51.89 %)
4,346
(0.99 %)
12,930
(3.50 %)
21,226
(7.60 %)
33.06
(99.10 %)
27,314
(0.92 %)
13,303
(100.00 %)
270,925
(3.18 %)
86,050
(1.20 %)
3,416,162
(48.29 %)
11,043
(1.07 %)
276 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1
14,484
(22.24 %)
987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3,154
(63.45 %)
277 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3
n/a 988
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
171,684
(17.03 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
106
(99.48 %)
278 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1
9,780
(62.01 %)
743
(1.01 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
65,787
(8.35 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
776
(95.90 %)
279 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
76,037
(46.89 %)
20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
50,033
(1.04 %)
280 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,786
(2.57 %)
14,548
(1.02 %)
15,297
(1.46 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,615,553
(13.87 %)
317,600
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
36,782
(0.70 %)
281 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,917
(3.63 %)
14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
49,035
(1.44 %)
282 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1
n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
80,965
(1.65 %)
283 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1
51,641
(50.37 %)
13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
60,606
(5.66 %)
284 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1
51,593
(54.67 %)
12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
46,108
(3.49 %)
285 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
0
(0.00 %)
19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
33,375
(1.66 %)
41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
50,379
(1.45 %)
286 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
19,404
(1.74 %)
20,264
(1.41 %)
33,412
(1.67 %)
41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,547,865
(43.29 %)
573,335
(1.09 %)
13,374,928
(33.10 %)
50,380
(1.45 %)
287 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1
64,153
(41.00 %)
20,337
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
226
(0.00 %)
356
(100.00 %)
3,783,435
(35.17 %)
567,796
(3.38 %)
13,462,481
(35.48 %)
48,365
(1.91 %)
288 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
59,262
(1.70 %)
289 honeybee mite (v1 2017)
GCF_002443255.1
35,654
(12.86 %)
2,741
(0.61 %)
28,868
(8.05 %)
n/a 40.92
(99.93 %)
3,073
(0.07 %)
1,426
(100.00 %)
117,879
(1.26 %)
43,685
(1.30 %)
1,858,762
(15.09 %)
31,400
(5.04 %)
290 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
12,943
(0.48 %)
291 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5
42,799
(57.51 %)
11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
292 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
45,521
(1.52 %)
293 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1
n/a 14,058
(0.89 %)
31,050
(2.69 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
235,277
(5.56 %)
294 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1
43,228
(49.63 %)
12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
30,897
(2.53 %)
295 house fly (aabys 2013 genbank)
GCA_000371365.1
n/a 7,825
(1.36 %)
12,819
(3.07 %)
n/a 35.11
(92.22 %)
102,610
(7.82 %)
104,053
(92.18 %)
415,874
(2.30 %)
376,409
(8.80 %)
4,931,104
(52.61 %)
7,139
(0.35 %)
296 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1
n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
102,168
(4.09 %)
41.70
(86.82 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
16,745
(0.41 %)
297 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1
n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
102,254
(4.12 %)
41.70
(89.34 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
16,590
(0.42 %)
298 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1
n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
102,138
(4.14 %)
41.74
(88.91 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
16,788
(0.42 %)
299 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1
n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
101,710
(4.15 %)
41.74
(85.90 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
16,675
(0.41 %)
300 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1
n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
101,632
(4.14 %)
41.78
(79.43 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
16,809
(0.38 %)
301 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1
n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
101,908
(4.18 %)
41.80
(88.67 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
16,544
(0.42 %)
302 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1
n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
101,520
(4.15 %)
41.75
(89.39 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
16,625
(0.42 %)
303 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26
123,667
(4.49 %)
24,134
(2.09 %)
22,855
(1.67 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,554,281
(45.50 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
25,014
(0.54 %)
304 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1
n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
101,892
(4.18 %)
41.78
(84.14 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
16,668
(0.40 %)
305 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1
n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
101,562
(4.18 %)
42.00
(77.13 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
18,188
(0.42 %)
306 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1
n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
103,134
(4.18 %)
41.74
(86.47 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
16,857
(0.41 %)
307 human (GRCh38.p13 2019)
GCF_000001405.39
172,809
(4.43 %)
23,121
(1.97 %)
27,697
(1.78 %)
n/a 41.04
(95.07 %)
1,268
(4.93 %)
46,029
(95.07 %)
5,859,855
(52.78 %)
1,037,733
(4.60 %)
16,933,424
(36.88 %)
56,646
(1.06 %)
308 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40
188,352
(5.12 %)
23,474
(1.98 %)
28,557
(1.86 %)
n/a 41.05
(95.10 %)
1,270
(4.90 %)
46,502
(95.10 %)
5,910,293
(52.77 %)
1,047,827
(4.59 %)
17,068,934
(36.82 %)
57,427
(1.07 %)
309 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,435,410
(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
53,581
(1.32 %)
310 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
53,511
(1.32 %)
311 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
1,094,036
(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
52,653
(1.34 %)
312 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
15,122,569
(41.27 %)
52,546
(1.35 %)
313 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2
n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
3
(13.72 %)
314 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4
108,944
(51.73 %)
20,844
(1.79 %)
21,287
(1.16 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
n/a 25
(100.00 %)
5,591,082
(54.45 %)
1,155,353
(8.89 %)
16,163,340
(41.63 %)
52,408
(1.38 %)
315 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
18,566
(1.67 %)
20,793
(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
48,076
(2.80 %)
316 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2
46,746
(2.60 %)
18,453
(1.69 %)
20,410
(1.59 %)
n/a 41.90
(99.98 %)
3,639
(0.02 %)
3,202
(100.00 %)
2,637,156
(23.36 %)
497,087
(1.30 %)
10,984,260
(32.64 %)
47,552
(2.89 %)
317 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
15,337
(3.60 %)
23,988
(7.92 %)
60,224
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
346,406
(3.02 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
17,930
(1.47 %)
318 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
14,561
(2.50 %)
31,867
(6.43 %)
n/a 39.04
(94.73 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
319,637
(2.20 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
40,721
(2.36 %)
319 Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023)
GCF_027563975.1
28,377
(14.36 %)
4,799
(1.56 %)
15,737
(7.20 %)
n/a 35.38
(100.00 %)
26
(0.00 %)
46
(100.00 %)
136,242
(3.33 %)
48,275
(1.61 %)
2,518,372
(36.69 %)
14,106
(2.86 %)
320 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
35,477
(1.51 %)
42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
81,685
(1.86 %)
321 Japanese quail
GCF_001577835.1
47,008
(7.38 %)
12,864
(2.55 %)
36,126
(11.03 %)
n/a 41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
466,141
(6.58 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
322 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1
n/a 14,672
(0.28 %)
30,181
(0.79 %)
n/a 47.02
(99.98 %)
5,985
(0.02 %)
4,317
(100.00 %)
1,167,498
(3.08 %)
2,399,496
(18.16 %)
10,302
(99.98 %)
503,637
(6.56 %)
323 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
6,204
(9.08 %)
324 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
13,114
(1.92 %)
17,732
(2.50 %)
29,004
(4.44 %)
41.97
(97.63 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
548,758
(10.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
22,279
(1.75 %)
325 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2
49,757
(54.33 %)
13,112
(1.92 %)
17,637
(2.48 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,072
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
22,278
(1.77 %)
326 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1
55,723
(2.15 %)
17,500
(0.86 %)
16,193
(0.94 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,814,631
(41.58 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
15,957
(0.35 %)
327 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1
29,504
(53.56 %)
14,221
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,384
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,338
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
328 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,421
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
329 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1
48,561
(51.20 %)
12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
32,398
(2.65 %)
330 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
24,631
(60.59 %)
4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
30,394
(12.69 %)
34.13
(100.00 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
8,442
(2.49 %)
331 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1
n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
138,732
(1.75 %)
332 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1
n/a 14,572
(1.03 %)
16,165
(1.42 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,923
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
35,505
(1.37 %)
333 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1
n/a 10,857
(1.01 %)
15,585
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,219
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
25,155
(1.42 %)
334 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
35,485
(1.36 %)
335 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2
n/a 591
(1.09 %)
4,193
(46.51 %)
n/a 59.58
(99.94 %)
454
(0.06 %)
76
(100.00 %)
24,390
(4.61 %)
4,228
(1.93 %)
243,087
(20.97 %)
92
(99.40 %)
336 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2
n/a 626
(1.15 %)
4,290
(46.53 %)
n/a 59.72
(100.00 %)
7
(0.00 %)
43
(100.00 %)
33,021
(5.20 %)
8,477
(2.43 %)
238,932
(20.91 %)
41
(99.80 %)
337 Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank)
GCA_017916325.1
n/a 619
(1.14 %)
3,882
(44.58 %)
n/a 59.85
(100.00 %)
5
(0.00 %)
42
(100.00 %)
20,726
(2.91 %)
2,267
(2.64 %)
232,973
(20.45 %)
44
(99.29 %)
338 Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank)
GCA_017916335.1
n/a 643
(1.12 %)
4,666
(45.26 %)
n/a 59.72
(99.99 %)
11
(0.00 %)
98
(100.00 %)
22,632
(2.47 %)
4,241
(2.74 %)
231,120
(20.18 %)
100
(99.82 %)
339 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
73,266
(49.50 %)
18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
77,000
(2.45 %)
340 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
25,978
(33.60 %)
19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
341 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
342 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1
39,024
(47.65 %)
13,358
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
128
(0.11 %)
179
(100.00 %)
674,141
(6.73 %)
329,122
(5.34 %)
6,820,211
(22.78 %)
45,073
(5.83 %)
343 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1
n/a 18,322
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
573
(0.76 %)
345
(99.51 %)
4,224,340
(28.69 %)
1,030,574
(2.60 %)
12,591,928
(42.30 %)
98,189
(2.06 %)
344 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1
53,323
(53.05 %)
15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
166,630
(4.38 %)
345 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
117,678
(2.02 %)
346 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,708
(2.94 %)
16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
117,703
(2.02 %)
347 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1
40,255
(11.91 %)
14,975
(3.53 %)
22,304
(7.09 %)
56,266
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
448,828
(3.61 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
348 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
15,922
(1.43 %)
349 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1
41,612
(58.17 %)
14,748
(3.32 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,416
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
53,323
(5.09 %)
350 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
55,061
(41.68 %)
21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
36,070
(0.90 %)
351 malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank)
GCA_000002765.3
n/a n/a n/a n/a 19.34
(100.00 %)
n/a 16
(100.00 %)
79,857
(19.18 %)
78,154
(15.50 %)
186,960
(66.90 %)
22
(0.04 %)
352 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
48,578
(30.31 %)
19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
41,235
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
353 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
42,077
(12.05 %)
354 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,306
(11.02 %)
14,510
(2.84 %)
29,750
(6.81 %)
n/a 40.03
(94.35 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,930
(2.32 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
39,557
(2.69 %)
355 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
29,488
(69.09 %)
4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
27,763
(8.31 %)
36.96
(100.00 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
24,873
(3.15 %)
356 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1
n/a 19,020
(1.63 %)
19,812
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,552,310
(40.02 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,849
(2.13 %)
357 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
76,740
(2.37 %)
358 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
15,259
(2.01 %)
359 microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank)
GCA_000209485.1
n/a 238
(3.03 %)
394
(8.09 %)
n/a 33.70
(99.89 %)
437
(0.04 %)
1,743
(99.97 %)
1,511
(2.99 %)
268
(0.36 %)
31,900
(26.59 %)
373
(7.62 %)
360 microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002)
GCF_000091225.1
1,996
(85.79 %)
1,569
(68.26 %)
596
(33.73 %)
n/a 47.31
(99.97 %)
4
(0.03 %)
15
(99.97 %)
257
(0.70 %)
199
(0.40 %)
10,819
(8.68 %)
126
(3.52 %)
361 microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank)
GCA_000182985.1
n/a 348
(2.68 %)
284
(3.31 %)
n/a 25.26
(99.86 %)
n/a 5,465
(100.00 %)
3,179
(1.99 %)
1,572
(1.39 %)
85,189
(41.34 %)
4
(0.02 %)
362 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
42,553
(41.45 %)
19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
363 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1
61,711
(41.50 %)
19,544
(1.49 %)
21,502
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
1,375
(100.00 %)
4,006,932
(35.92 %)
1,058,106
(12.08 %)
12,708,154
(42.66 %)
72,756
(1.59 %)
364 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1
35,332
(12.83 %)
2,750
(0.61 %)
29,731
(8.07 %)
n/a 40.94
(99.89 %)
3,360
(0.11 %)
8,241
(99.89 %)
115,140
(1.18 %)
39,880
(0.71 %)
1,832,298
(14.55 %)
31,479
(5.12 %)
365 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
40,982
(1.78 %)
41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
24,829
(0.69 %)
366 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1
47,034
(41.56 %)
18,428
(0.81 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
18
(100.00 %)
7,426,369
(29.77 %)
1,249,638
(2.12 %)
21,135,395
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
367 moth C.splendana (v1 2021 genbank)
GCA_910591565.1
n/a 4,930
(0.75 %)
38,413
(8.53 %)
35,924
(4.55 %)
38.08
(99.99 %)
150
(0.01 %)
112
(100.00 %)
261,421
(1.99 %)
175,466
(5.62 %)
3,107,482
(46.30 %)
58,547
(5.75 %)
368 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
34,396
(3.66 %)
369 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2
n/a 16,645
(3.88 %)
43,866
(14.64 %)
n/a 33.16
(92.79 %)
96,870
(7.25 %)
2,463
(100.00 %)
265,072
(3.32 %)
198,918
(3.34 %)
2,840,410
(34.89 %)
13,926
(1.48 %)
370 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1
n/a 10,083
(1.97 %)
18,350
(2.23 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,827
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
25,670
(3.87 %)
371 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1
n/a 12,973
(1.97 %)
22,300
(2.18 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,720
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
31,271
(3.60 %)
372 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
74,574
(44.06 %)
21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
373 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
63,033
(1.47 %)
374 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1
31,033
(46.15 %)
12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
31,693
(3.88 %)
375 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
4,887
(1.65 %)
376 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,251
(5.66 %)
10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
17,009
(0.90 %)
377 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
140,990
(2.86 %)
378 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
379 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,144
(1.87 %)
21,316
(1.15 %)
25,308
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,328,146
(49.10 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
380 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
93,862
(1.92 %)
381 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
382 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1
28,512
(7.14 %)
5,830
(1.09 %)
39,806
(8.27 %)
n/a 36.76
(100.00 %)
n/a 1,714
(100.00 %)
222,294
(5.58 %)
187,561
(9.87 %)
3,009,613
(56.49 %)
63,009
(9.78 %)
383 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1
63,720
(60.35 %)
16,616
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,918
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,521
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
384 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
65,761
(1.00 %)
385 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
97,432
(43.01 %)
21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
386 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
387 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
20,317
(1.83 %)
21,239
(1.18 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,525,293
(52.79 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
388 oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank)
GCA_015104395.1
n/a 1,945
(0.08 %)
23,579
(1.88 %)
n/a 36.81
(99.60 %)
16,132
(0.41 %)
16,156
(99.59 %)
2,706,474
(10.11 %)
2,525,264
(12.75 %)
9,704,257
(48.31 %)
77,313
(3.01 %)
389 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
20,948
(56.23 %)
4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
29,018
(10.11 %)
33.42
(99.99 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
13,547
(2.72 %)
390 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
18,185
(1.70 %)
20,184
(1.64 %)
41,094
(3.29 %)
42.38
(98.92 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,072,951
(30.02 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
64,081
(4.30 %)
391 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
16,332
(2.13 %)
392 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1
49,100
(50.44 %)
13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
586,316
(11.83 %)
335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
393 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1
n/a 20,768
(1.76 %)
21,550
(1.18 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
260
(0.00 %)
362
(100.00 %)
5,387,919
(53.48 %)
1,027,640
(9.31 %)
15,407,988
(41.73 %)
99,854
(1.52 %)
394 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
48,654
(8.33 %)
32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
26,578
(2.89 %)
395 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
15,677
(2.23 %)
29,967
(5.65 %)
62,989
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
591,660
(5.05 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
39,545
(1.93 %)
396 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
94,468
(9.28 %)
397 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1
56,708
(3.09 %)
14,805
(1.26 %)
18,918
(1.63 %)
42,516
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,099,803
(51.62 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
87,829
(7.91 %)
398 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3
n/a 14,805
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,303
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
87,861
(7.92 %)
399 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
35,751
(39.94 %)
18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
54,906
(1.17 %)
400 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1
45,404
(55.83 %)
14,654
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,131
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
401 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
61,057
(1.17 %)
402 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
45,076
(35.88 %)
19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
403 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
25,575
(34.74 %)
17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
404 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
59,332
(37.06 %)
19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
43,049
(0.71 %)
405 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1
84,858
(3.73 %)
20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
5,487,575
(50.65 %)
1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
53,329
(1.37 %)
406 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1
56,261
(41.31 %)
18,495
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
143
(0.19 %)
580
(100.00 %)
3,817,653
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,926
(39.96 %)
101,353
(2.90 %)
407 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2
n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
113,370
(2.46 %)
408 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
110,338
(2.33 %)
409 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1
69,943
(20.66 %)
33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
23,381
(2.80 %)
410 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
32,725
(10.42 %)
32.84
(100.00 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
10,747
(2.25 %)
411 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
10,712
(6.90 %)
412 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
12,046
(1.50 %)
25,077
(1.98 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
401,465
(6.41 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
30,183
(1.07 %)
413 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
12,016
(1.53 %)
23,985
(1.93 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
322,026
(4.02 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
18,873
(0.62 %)
414 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
38,306
(3.37 %)
415 reedfish (2019)
GCF_900747795.1
40,545
(1.73 %)
13,154
(0.46 %)
24,028
(1.29 %)
34,856
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,834,613
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
88,254
(1.06 %)
416 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
98,572
(1.29 %)
417 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
73,126
(1.69 %)
418 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
12,054
(1.65 %)
23,851
(2.04 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
392,481
(7.69 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
7,602
(0.24 %)
419 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
65,909
(1.91 %)
41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
59,440
(1.72 %)
420 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
421 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1
102,772
(6.02 %)
27,413
(1.62 %)
51,424
(4.17 %)
121,979
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,438,988
(5.72 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
422 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1
51,619
(61.28 %)
12,831
(2.31 %)
n/a n/a 41.57
(99.99 %)
210
(0.01 %)
164
(100.00 %)
667,924
(11.59 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,274
(21.73 %)
21,346
(2.37 %)
423 rose-grain aphid (CAU 2021 genbank)
GCA_019925205.1
n/a 4,332
(0.82 %)
15,532
(3.91 %)
n/a 30.24
(99.98 %)
240
(0.02 %)
67
(100.00 %)
481,097
(4.72 %)
135,266
(7.01 %)
4,093,473
(52.65 %)
12,709
(2.68 %)
424 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1
n/a 14,592
(2.84 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
87
(0.00 %)
442
(100.00 %)
1,764,545
(30.13 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,092
(24.53 %)
19,771
(1.39 %)
425 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1
n/a 13,327
(0.96 %)
20,347
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
1,983,903
(10.40 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,707
(53.44 %)
130,852
(4.47 %)
426 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
53,779
(39.43 %)
21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
427 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
428 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
46,746
(40.70 %)
18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
66,179
(3.91 %)
429 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1
50,290
(50.75 %)
12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
548,087
(7.21 %)
201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
430 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
647
(0.04 %)
431 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1
27,528
(42.80 %)
12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
35,549
(5.05 %)
432 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1
108,406
(45.40 %)
13,961
(0.46 %)
36,603
(1.55 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
2,297
(0.01 %)
3,475
(100.00 %)
1,903,658
(2.85 %)
2,970,695
(16.56 %)
15,354,615
(64.31 %)
652,708
(8.36 %)
433 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2
n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.24 %)
1
(0.11 %)
33
(1.38 %)
1
(0.73 %)
434 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1
29,778
(59.32 %)
3,020
(1.06 %)
13,146
(12.99 %)
30,497
(24.04 %)
36.33
(82.34 %)
637,478
(17.95 %)
4,312
(100.00 %)
74,671
(1.98 %)
63,328
(2.24 %)
1,417,036
(20.33 %)
2,099
(0.38 %)
435 sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020)
GCA_010993605.1
n/a 8,130
(0.73 %)
36,343
(4.06 %)
n/a 48.31
(98.62 %)
930
(1.38 %)
1,433
(100.00 %)
3,309,659
(59.73 %)
1,194,161
(21.47 %)
5,320,564
(50.50 %)
178,590
(35.88 %)
436 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,142
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
437 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1
23,426
(13.46 %)
2,741
(0.95 %)
3,156
(4.19 %)
n/a 32.82
(91.54 %)
11,185
(8.47 %)
12,292
(91.53 %)
572,062
(30.90 %)
474,390
(10.49 %)
1,741,644
(44.75 %)
3,489
(0.51 %)
438 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
95,573
(1.75 %)
439 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2
105,360
(44.53 %)
20,433
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
1
(0.03 %)
26
(100.00 %)
5,354,441
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,483
(46.01 %)
92,243
(1.42 %)
440 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2
105,373
(3.05 %)
20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
92,243
(1.42 %)
441 Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
14,745
(4.21 %)
34,348
(10.09 %)
62,673
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
252,955
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
442 Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
443 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
67,835
(1.30 %)
444 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2
63,475
(2.65 %)
20,581
(1.94 %)
21,181
(1.20 %)
41,252
(1.46 %)
41.02
(97.81 %)
25,106
(2.19 %)
18,395
(100.00 %)
5,332,131
(51.09 %)
857,562
(2.26 %)
15,565,289
(36.84 %)
80,124
(1.26 %)
445 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1
n/a 26,771
(1.11 %)
44,247
(1.00 %)
n/a 40.68
(99.86 %)
9,648
(0.03 %)
1,946,791
(99.97 %)
6,230,312
(41.68 %)
688,924
(1.23 %)
16,892,392
(43.00 %)
39,326
(0.65 %)
446 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1
67,213
(41.75 %)
22,195
(1.49 %)
21,341
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
218
(0.14 %)
85
(100.00 %)
4,625,875
(39.88 %)
579,984
(1.59 %)
14,405,402
(40.78 %)
38,257
(0.77 %)
447 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
39,994
(0.70 %)
448 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,762
(1.62 %)
12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
456,658
(8.18 %)
449 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
143,632
(7.43 %)
450 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1
n/a 11,828
(0.66 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,021
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
45,398
(1.34 %)
451 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
60,636
(4.05 %)
452 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
24,114
(1.71 %)
51,371
(4.08 %)
102,891
(5.24 %)
43.39
(96.16 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,300,179
(8.96 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
64,215
(1.55 %)
453 South Georgia icefish (v1 primary hap 2020)
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
88,984
(4.31 %)
454 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1
58,416
(66.24 %)
15,695
(2.61 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
95
(0.00 %)
58
(100.00 %)
1,591,314
(33.50 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,850
(26.85 %)
14,097
(0.88 %)
455 southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank)
GCA_013339725.1
n/a 3,698
(0.12 %)
117,910
(5.00 %)
35,315
(1.88 %)
45.79
(99.99 %)
1,576
(0.01 %)
7,048
(100.00 %)
770,997
(2.03 %)
680,149
(3.55 %)
10,994,272
(39.37 %)
304,620
(17.03 %)
456 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
21,801
(0.44 %)
457 southern house mosquito (JHB 2007 genbank)
GCA_000209185.1
n/a 5,905
(1.14 %)
41,195
(8.84 %)
n/a 37.42
(93.28 %)
45,500
(6.75 %)
48,671
(93.25 %)
738,398
(35.22 %)
171,041
(5.71 %)
3,037,349
(50.41 %)
65,784
(9.49 %)
458 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
80,897
(1.09 %)
459 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
55,674
(0.90 %)
460 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
37,037
(37.57 %)
18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
461 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
35,897
(1.56 %)
462 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
35,897
(1.47 %)
463 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
21,720
(55.73 %)
4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
28,108
(2.75 %)
464 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2
60,921
(2.59 %)
19,527
(1.73 %)
25,114
(1.51 %)
n/a 41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,365,057
(42.78 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
94,152
(2.52 %)
465 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
668
(0.62 %)
466 stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank)
GCA_001015335.1
n/a 7,737
(1.16 %)
11,972
(2.65 %)
n/a 38.85
(84.55 %)
129,113
(15.50 %)
125,702
(84.50 %)
310,342
(1.75 %)
391,619
(8.42 %)
5,616,633
(48.71 %)
38,246
(1.55 %)
467 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.1
n/a 22,306
(1.80 %)
33,366
(4.09 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,738
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
51,356
(1.84 %)
468 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2
n/a 25,364
(1.76 %)
40,452
(4.10 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
64,522
(2.85 %)
469 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1
n/a 22,718
(1.81 %)
34,093
(4.15 %)
57,768
(4.88 %)
39.60
(100.00 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,503
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
52,560
(1.82 %)
470 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1
73,251
(5.76 %)
24,411
(1.72 %)
39,637
(3.96 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
6,283
(0.07 %)
3,404
(100.00 %)
1,269,345
(3.50 %)
1,095,665
(6.81 %)
10,007,602
(39.30 %)
60,475
(1.95 %)
471 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1
36,135
(16.45 %)
3,324
(0.70 %)
20,909
(10.93 %)
38,198
(17.00 %)
38.54
(89.50 %)
49,077
(10.54 %)
5,688
(100.00 %)
111,077
(1.70 %)
108,732
(2.95 %)
2,009,396
(21.40 %)
6,012
(0.58 %)
472 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1
53,859
(65.52 %)
16,035
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
236
(0.51 %)
59
(100.00 %)
1,870,238
(37.80 %)
605,571
(6.82 %)
5,059,499
(32.43 %)
17,919
(1.29 %)
473 sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank)
GCA_020800215.1
n/a 1,461
(1.76 %)
22,413
(61.13 %)
n/a 54.37
(99.66 %)
50
(0.34 %)
28
(100.00 %)
8,935
(0.72 %)
9,528
(3.65 %)
117,380
(14.16 %)
34
(99.96 %)
474 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
47,806
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
39,481
(0.87 %)
475 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
55,799
(2.08 %)
476 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1
n/a 13,403
(1.85 %)
27,456
(2.48 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,374
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
477 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
13,016
(1.88 %)
24,787
(2.41 %)
30,064
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
483,978
(5.85 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
478 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1
29,544
(46.92 %)
12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
32,064
(3.27 %)
479 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
16,112
(0.84 %)
16,152
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,766,259
(42.85 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
23,155
(0.38 %)
480 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3
54,010
(40.19 %)
26,552
(34.12 %)
25,867
(35.78 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
67,353
(16.32 %)
27,063
(2.77 %)
749,020
(22.64 %)
4,599
(1.63 %)
481 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
19,165
(1.70 %)
18,102
(1.44 %)
n/a 39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,378,557
(36.61 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
28,321
(0.64 %)
482 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
11,433
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
865,711
(2.57 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
483 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1
45,969
(46.35 %)
11,434
(0.60 %)
26,342
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,598
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
484 tick D.silvarum (v1 2020)
GCF_013339745.1
36,084
(1.94 %)
4,032
(0.13 %)
128,567
(5.82 %)
43,960
(2.05 %)
46.91
(99.95 %)
13,519
(0.05 %)
1,665
(100.00 %)
1,116,542
(2.95 %)
642,860
(3.16 %)
10,429,455
(39.18 %)
37,849
(2.30 %)
485 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1
23,429
(54.20 %)
3,517
(1.61 %)
18,910
(15.71 %)
n/a 42.18
(97.94 %)
14,007
(2.09 %)
459
(100.00 %)
52,042
(1.17 %)
27,065
(1.23 %)
928,666
(18.11 %)
15,823
(5.51 %)
486 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
13,817
(3.76 %)
32,943
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
359,724
(3.91 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
61,685
(7.72 %)
487 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,015
(6.94 %)
15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
25,279
(1.28 %)
488 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
27,070
(2.09 %)
489 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
28,386
(2.18 %)
490 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 genbank)
GCA_023055355.1
n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
33,378
(2.70 %)
491 Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank)
GCA_001457755.2
n/a 576
(1.36 %)
2,999
(35.93 %)
n/a 45.94
(99.65 %)
6,447
(0.44 %)
2,026
(100.00 %)
16,807
(2.60 %)
3,925
(0.79 %)
141,656
(16.64 %)
4,877
(34.82 %)
492 Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank)
GCA_022059095.1
n/a 742
(1.83 %)
848
(40.20 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
n/a 64
(100.00 %)
39,141
(7.68 %)
14,366
(6.71 %)
131,898
(25.19 %)
4,119
(14.82 %)
493 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1
24,334
(8.13 %)
7,223
(2.32 %)
6,632
(3.62 %)
n/a 33.80
(97.46 %)
9,688
(2.55 %)
7,986
(100.00 %)
418,532
(4.76 %)
185,734
(2.26 %)
3,090,742
(35.34 %)
3,487
(0.58 %)
494 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1
56,617
(1.50 %)
14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
602,912
(6.66 %)
495 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
63,965
(1.04 %)
496 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
71,084
(1.08 %)
497 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
21,804
(1.85 %)
23,385
(1.18 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,700,226
(51.61 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
71,078
(1.08 %)
498 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4
63,704
(2.55 %)
21,347
(1.86 %)
23,056
(1.19 %)
n/a 40.84
(97.07 %)
57,757
(2.93 %)
34,372
(100.00 %)
5,504,117
(51.70 %)
961,351
(2.75 %)
16,208,033
(37.10 %)
71,046
(1.10 %)
499 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
54,667
(35.81 %)
19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
500 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
19,635
(1.10 %)
501 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
13,323
(2.49 %)
502 velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020)
GCF_010614865.1
34,675
(2.01 %)
3,329
(0.10 %)
24,015
(1.20 %)
n/a 33.26
(100.00 %)
7
(0.00 %)
16,531
(100.00 %)
1,258,301
(2.08 %)
828,332
(2.42 %)
17,994,342
(48.98 %)
63,015
(0.95 %)
503 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1
13,201
(7.14 %)
3,474
(1.25 %)
15,142
(4.89 %)
n/a 30.36
(99.55 %)
7,471
(0.46 %)
9,928
(99.54 %)
340,841
(7.52 %)
251,386
(3.99 %)
2,448,273
(49.27 %)
16,346
(4.08 %)
504 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
93,080
(1.71 %)
505 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
48,251
(30.18 %)
21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
506 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
29,923
(35.25 %)
18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
507 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
61,103
(44.10 %)
18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
32,667
(0.90 %)
508 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1
n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
100,622
(4.22 %)
41.80
(84.36 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
16,556
(0.40 %)
509 western flower thrips (v2 FOCC.00 2017)
GCF_000697945.2
24,277
(14.78 %)
4,066
(1.46 %)
26,743
(11.40 %)
n/a 51.10
(94.72 %)
60,375
(5.31 %)
34,226
(94.71 %)
275,482
(4.88 %)
167,812
(3.67 %)
1,832,537
(24.44 %)
26,406
(36.85 %)
510 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
53,557
(1.01 %)
511 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
76,432
(1.35 %)
512 western lowland gorilla (v2 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.2
98,415
(41.67 %)
21,010
(1.59 %)
50,696
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
2
(0.06 %)
25
(100.00 %)
5,456,267
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,191
(47.77 %)
69,745
(1.19 %)
513 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
104,231
(1.84 %)
514 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4
64,798
(3.75 %)
15,669
(1.09 %)
21,663
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
260,698
(87.52 %)
3,780,252
(41.81 %)
316,422
(0.93 %)
11,852,305
(27.59 %)
103,899
(1.75 %)
515 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
2,003
(54.71 %)
516 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1
n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
100,839
(4.01 %)
41.65
(89.10 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
16,888
(0.42 %)
517 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
7,519
(2.78 %)
518 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
22,185
(2.62 %)
519 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
59,982
(41.87 %)
18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
68,551
(3.58 %)
520 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
20,406
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
39,081
(1.88 %)
42.23
(100.00 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
5,064,597
(30.73 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
23,475
(0.69 %)
521 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
57,774
(39.81 %)
20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
40,950
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
522 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1
n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
54,851
(4.05 %)
523 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
21,699
(1.91 %)
20,910
(1.24 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,120,629
(48.95 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
35,805
(0.79 %)
524 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
34,994
(0.85 %)
525 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a 21,729
(1.89 %)
21,502
(1.30 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,418
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
36,656
(0.90 %)
526 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1
n/a 20,939
(1.94 %)
20,416
(1.31 %)
n/a 41.04
(99.58 %)
788
(0.42 %)
336
(100.00 %)
4,869,007
(49.39 %)
746,577
(2.68 %)
14,347,286
(37.59 %)
35,222
(0.94 %)
527 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2
n/a 21,801
(1.88 %)
21,501
(1.28 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
1,165
(0.48 %)
1,234
(100.00 %)
5,036,594
(47.71 %)
842,846
(3.25 %)
15,161,577
(38.08 %)
37,603
(0.93 %)
528 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1
55,408
(53.40 %)
13,572
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
262
(0.37 %)
929
(100.00 %)
616,295
(10.57 %)
211,557
(2.90 %)
6,785,134
(22.11 %)
42,795
(4.66 %)
529 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
45,436
(1.02 %)
530 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
2,220,897
(25.33 %)
531 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
48,008
(1.88 %)
532 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1
n/a 14,001
(6.64 %)
34,562
(26.90 %)
n/a 38.40
(94.26 %)
16,253
(5.76 %)
16,459
(94.24 %)
152,427
(20.00 %)
74,539
(2.79 %)
1,032,592
(21.43 %)
14,802
(3.20 %)
533 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
12,950
(1.89 %)
19,252
(2.57 %)
24,522
(2.44 %)
42.30
(100.00 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
500,823
(7.17 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
28,268
(2.21 %)
534 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1
n/a 20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
45,153
(1.99 %)
40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
34,151
(0.87 %)
535 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1
62,044
(2.80 %)
19,783
(1.48 %)
21,060
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
46
(0.00 %)
3,381
(100.00 %)
3,884,968
(28.12 %)
912,591
(2.73 %)
14,538,767
(35.15 %)
36,919
(1.02 %)
536 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1
n/a 13,052
(1.78 %)
24,950
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
1,695
(100.00 %)
444,866
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,498
(25.82 %)
37,210
(3.14 %)
537 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
18,639
(1.72 %)
19,645
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
n/a 540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
59,052
(1.48 %)
538 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1
43,299
(41.33 %)
18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
59,052
(1.48 %)
539 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
27,063
(35.76 %)
19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
540 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,063
(1.65 %)
19,227
(1.75 %)
27,468
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,193,317
(43.38 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
541 yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank)
GCA_002204515.1
n/a 8,814
(0.51 %)
152,909
(17.36 %)
n/a 38.16
(100.00 %)
229
(0.00 %)
6,534
(100.00 %)
2,912,289
(46.74 %)
533,475
(4.34 %)
10,210,670
(53.65 %)
132,732
(6.12 %)
542 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
43,878
(1.99 %)
39.89
(97.96 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
34,125
(0.91 %)
543 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
19,845
(1.63 %)
21,262
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,683,625
(34.38 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
34,127
(0.91 %)
544 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1
n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
1,269,774
(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
28,121
(0.66 %)
545 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
11,775
(1.55 %)
23,935
(1.90 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
384,032
(4.45 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
15,660
(0.55 %)
546 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1
41,168
(9.96 %)
15,861
(2.76 %)
30,671
(6.00 %)
n/a 40.75
(97.79 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
614,513
(4.16 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
18,054
(0.96 %)
547 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 genbank)
GCA_028538775.1
n/a 18,587
(1.82 %)
21,049
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
685
(100.00 %)
2,890,086
(24.28 %)
719,555
(4.26 %)
10,089,514
(36.35 %)
60,975
(2.61 %)
548 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
13,211
(2.02 %)
17,812
(2.70 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.58 %)
549 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2
n/a 13,212
(2.02 %)
25,117
(2.57 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.58 %)
550 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1
n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
45,284
(1.67 %)
551 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
552 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
15,028
(3.35 %)
21,782
(6.89 %)
36,982
(11.22 %)
40.66
(97.63 %)
235
(2.37 %)
126
(100.00 %)
348,517
(2.87 %)
157,776
(2.00 %)
3,182,742
(23.42 %)
12,824
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 552

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 221 assemblies assembly stats track stats
Mammals 658 assemblies assembly stats track stats
Birds 424 assemblies assembly stats track stats
Fishes 453 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 302 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1151 assemblies assembly stats track stats
Plants 310 assemblies assembly stats track stats
Fungi 920 assemblies assembly stats track stats
Viruses 291 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 113 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 551 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1186 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 778 assemblies assembly stats track stats