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Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.
count | common name link to genome browser |
ncbiRefSeq | xenoRefGene | augustus genes |
Ensembl genes |
gc5 base | gaps | assembly sequences |
Repeat Masker |
TRF simpleRepeat |
window Masker |
cpg islands |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | Abyssinian ground-hornbill (2019) GCA_009769605.1 |
n/a | 12,926 (1.90 %) |
23,453 (2.26 %) |
n/a | 43.30 (99.29 %) |
204 (0.71 %) |
112 (100.00 %) |
401,839 (5.61 %) |
145,540 (0.78 %) |
6,556,090 (19.22 %) |
40,986 (3.65 %) |
2 | Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019) GCA_009769595.1 |
n/a | 11,948 (1.86 %) |
22,509 (2.24 %) |
n/a | 43.51 (100.00 %) |
n/a | 3,527 (100.00 %) |
361,147 (5.36 %) |
125,372 (0.75 %) |
5,917,083 (18.51 %) |
38,787 (3.82 %) |
3 | acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022) GCA_026170555.1 |
n/a | 12,415 (1.42 %) |
23,266 (1.78 %) |
n/a | 46.76 (99.99 %) |
1,555 (0.01 %) |
2,294 (100.00 %) |
1,077,039 (17.72 %) |
548,450 (13.79 %) |
4,965,697 (43.00 %) |
29,460 (3.04 %) |
4 | acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022) GCA_026170545.1 |
n/a | 11,832 (1.45 %) |
22,508 (1.87 %) |
n/a | 46.81 (99.99 %) |
1,317 (0.01 %) |
4,491 (99.99 %) |
980,493 (17.23 %) |
496,946 (14.39 %) |
5,155,337 (42.38 %) |
28,236 (3.22 %) |
5 | acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022) GCF_026170545.1 |
41,049 (4.47 %) |
11,830 (1.45 %) |
22,522 (1.87 %) |
n/a | 46.81 (99.99 %) |
1,317 (0.01 %) |
4,489 (99.99 %) |
980,471 (17.23 %) |
496,933 (14.40 %) |
5,155,020 (42.38 %) |
28,236 (3.22 %) |
6 | Adelie penguin GCF_000699105.1 |
17,638 (3.05 %) |
11,763 (1.71 %) |
10,671 (1.99 %) |
n/a | 41.51 (95.58 %) |
95,110 (4.45 %) |
114,374 (95.55 %) |
360,323 (4.64 %) |
126,490 (0.70 %) |
6,900,013 (18.31 %) |
27,176 (0.96 %) |
7 | African ostrich GCF_000698965.1 |
29,026 (4.42 %) |
12,011 (1.64 %) |
17,852 (1.82 %) |
34,707 (3.37 %) |
41.05 (96.74 %) |
72,649 (3.29 %) |
79,564 (96.71 %) |
321,765 (3.17 %) |
152,444 (0.82 %) |
7,196,207 (17.79 %) |
33,542 (1.33 %) |
8 | African ostrich (bStrCam1hap1 2024) GCF_040807025.1 |
70,988 (5.69 %) |
14,024 (1.60 %) |
24,944 (1.95 %) |
n/a | 44.34 (100.00 %) |
116 (0.00 %) |
262 (100.00 %) |
710,321 (8.33 %) |
473,161 (7.22 %) |
5,692,215 (24.23 %) |
46,493 (8.90 %) |
9 | African ostrich (bStrCam1hap2 2024) GCA_040807015.1 |
n/a | 13,036 (1.56 %) |
32,740 (2.89 %) |
n/a | 45.71 (100.00 %) |
82 (0.00 %) |
250 (100.00 %) |
651,979 (9.34 %) |
459,653 (10.08 %) |
4,547,348 (28.27 %) |
49,261 (10.50 %) |
10 | American crow GCF_000691975.1 |
36,379 (6.32 %) |
12,151 (1.86 %) |
11,346 (2.24 %) |
n/a | 41.85 (96.40 %) |
79,099 (3.62 %) |
89,646 (96.38 %) |
416,990 (6.08 %) |
224,964 (1.60 %) |
6,343,680 (18.42 %) |
20,148 (0.77 %) |
11 | American flamingo (2019) GCA_009819775.1 |
n/a | 13,100 (1.79 %) |
23,372 (2.04 %) |
n/a | 43.27 (99.31 %) |
280 (0.69 %) |
90 (100.00 %) |
538,004 (7.73 %) |
183,346 (0.79 %) |
7,056,270 (20.92 %) |
52,012 (5.96 %) |
12 | American flamingo (alternate hap 2019) GCA_009819805.1 |
n/a | 12,384 (1.73 %) |
23,611 (2.05 %) |
n/a | 43.35 (100.00 %) |
n/a | 3,529 (100.00 %) |
496,877 (7.22 %) |
162,522 (0.74 %) |
6,684,675 (20.14 %) |
51,895 (5.89 %) |
13 | Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018) GCA_003957575.1 |
n/a | 11,084 (1.90 %) |
19,321 (2.14 %) |
n/a | 41.32 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
3,803 (100.00 %) |
475,493 (7.41 %) |
223,791 (1.37 %) |
5,585,250 (20.30 %) |
14,903 (1.46 %) |
14 | Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq) GCF_003957555.1 |
31,091 (4.24 %) |
12,257 (1.95 %) |
14,633 (2.35 %) |
n/a | 41.49 (98.48 %) |
429 (1.52 %) |
159 (100.00 %) |
535,315 (7.95 %) |
262,055 (1.51 %) |
6,092,276 (20.84 %) |
17,130 (1.48 %) |
15 | bald eagle GCF_000737465.1 |
26,869 (3.49 %) |
13,007 (1.88 %) |
15,874 (2.35 %) |
n/a | 41.68 (98.38 %) |
30,862 (1.63 %) |
31,786 (98.37 %) |
355,319 (3.99 %) |
119,526 (0.44 %) |
6,923,742 (18.48 %) |
33,353 (1.97 %) |
16 | band-tailed pigeon (hap2 2024 genbank) GCA_036971685.1 |
n/a | 13,319 (1.60 %) |
25,993 (2.05 %) |
n/a | 43.83 (99.41 %) |
219 (0.59 %) |
453 (100.00 %) |
700,173 (13.18 %) |
457,546 (13.85 %) |
4,523,003 (31.73 %) |
42,686 (7.00 %) |
17 | band-tailed pigeon (hap2 2024 refseq) GCF_036971685.1 |
36,326 (4.04 %) |
13,317 (1.60 %) |
25,993 (2.05 %) |
n/a | 43.83 (99.41 %) |
219 (0.59 %) |
452 (100.00 %) |
700,166 (13.18 %) |
457,543 (13.85 %) |
4,522,973 (31.73 %) |
42,686 (7.00 %) |
18 | bar-tailed trogon GCF_000703405.1 |
15,393 (2.18 %) |
11,432 (1.52 %) |
23,733 (1.98 %) |
n/a | 41.38 (99.58 %) |
50,921 (0.42 %) |
105,649 (99.58 %) |
386,871 (6.20 %) |
142,825 (0.82 %) |
6,474,942 (19.87 %) |
18,662 (0.63 %) |
19 | barn owl (U. Lausanne 2021) GCF_018691265.1 |
46,583 (5.22 %) |
13,036 (1.82 %) |
22,849 (2.14 %) |
n/a | 41.65 (95.89 %) |
259 (4.11 %) |
70 (100.00 %) |
610,994 (5.59 %) |
254,870 (1.12 %) |
7,109,716 (19.00 %) |
38,384 (2.94 %) |
20 | Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021) GCA_015227815.3 |
n/a | 11,132 (1.94 %) |
20,993 (2.40 %) |
n/a | 42.41 (100.00 %) |
6 (0.00 %) |
2,476 (100.00 %) |
550,072 (10.78 %) |
282,378 (2.00 %) |
5,634,117 (20.43 %) |
30,305 (2.79 %) |
21 | Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 refseq) GCF_015227805.2 |
41,925 (5.13 %) |
12,395 (1.89 %) |
23,302 (2.31 %) |
n/a | 42.54 (97.69 %) |
1,102 (2.31 %) |
617 (100.00 %) |
664,757 (13.92 %) |
364,636 (2.27 %) |
6,198,840 (21.01 %) |
36,548 (2.85 %) |
22 | Bengalese finch GCF_005870125.1 |
32,857 (5.06 %) |
12,604 (1.98 %) |
23,707 (2.41 %) |
n/a | 41.59 (97.06 %) |
37,862 (2.95 %) |
2,015 (100.00 %) |
507,898 (7.97 %) |
424,913 (2.80 %) |
6,456,852 (20.03 %) |
29,692 (2.46 %) |
23 | bird A.albertisi (hap1 2024) GCA_039906565.1 |
n/a | 13,007 (1.87 %) |
23,375 (2.27 %) |
n/a | 42.52 (99.99 %) |
439 (0.01 %) |
592 (100.00 %) |
467,217 (6.83 %) |
273,604 (2.43 %) |
6,154,114 (21.83 %) |
23,203 (2.12 %) |
24 | bird A.albertisi (hap2 2024) GCA_039906465.1 |
n/a | 12,101 (1.93 %) |
21,258 (2.30 %) |
n/a | 42.52 (99.99 %) |
344 (0.01 %) |
525 (100.00 %) |
412,944 (6.30 %) |
232,333 (2.21 %) |
5,715,517 (21.35 %) |
20,873 (2.13 %) |
25 | bird A.imberbis (Cuckoo-Finch-1a 21T00152 2023) GCF_031753505.1 |
53,868 (5.67 %) |
12,992 (1.79 %) |
25,575 (2.33 %) |
n/a | 43.43 (99.99 %) |
431 (0.01 %) |
1,370 (100.00 %) |
437,810 (3.71 %) |
484,607 (8.45 %) |
5,614,533 (25.04 %) |
45,374 (4.99 %) |
26 | bird E.chinensis (hap1 2024) GCA_039878515.1 |
n/a | 12,607 (2.39 %) |
22,429 (2.59 %) |
n/a | 41.57 (99.99 %) |
331 (0.01 %) |
425 (100.00 %) |
521,486 (5.26 %) |
266,418 (2.40 %) |
5,305,054 (20.63 %) |
19,590 (2.16 %) |
27 | bird E.chinensis (hap2 2024) GCA_039878825.1 |
n/a | 12,731 (2.42 %) |
22,580 (2.63 %) |
n/a | 41.64 (99.99 %) |
330 (0.01 %) |
191 (100.00 %) |
520,888 (5.33 %) |
274,030 (2.07 %) |
5,360,112 (20.48 %) |
19,673 (2.18 %) |
28 | bird N.grandis (bNycGra1 primary hap 2020) GCF_013368605.1 |
33,115 (3.89 %) |
13,120 (1.77 %) |
23,657 (2.10 %) |
n/a | 42.67 (99.51 %) |
243 (0.49 %) |
190 (100.00 %) |
610,506 (15.46 %) |
210,373 (1.13 %) |
6,501,918 (23.95 %) |
35,788 (2.78 %) |
29 | bird P.flaviventris (CSIRO_AGI_PZ_B2104156 2023) GCF_033815535.1 |
46,130 (4.40 %) |
13,292 (1.73 %) |
24,384 (2.16 %) |
n/a | 43.01 (100.00 %) |
n/a | 993 (100.00 %) |
514,287 (6.54 %) |
355,123 (8.64 %) |
5,531,059 (27.22 %) |
28,362 (1.86 %) |
30 | bird P.pipra (hap1 2024) GCF_036250125.1 |
55,558 (6.99 %) |
12,807 (1.82 %) |
23,359 (2.28 %) |
n/a | 42.66 (99.99 %) |
323 (0.01 %) |
696 (100.00 %) |
429,643 (4.10 %) |
293,428 (3.59 %) |
6,059,402 (21.89 %) |
29,574 (2.42 %) |
31 | bird Z.leucophrys gambelii (GWCS_2022_RI 2023) GCF_028769735.1 |
42,284 (5.19 %) |
12,694 (1.84 %) |
25,490 (2.39 %) |
n/a | 42.81 (100.00 %) |
339 (0.00 %) |
3,792 (100.00 %) |
398,368 (3.10 %) |
569,232 (5.31 %) |
6,675,899 (23.29 %) |
31,995 (2.37 %) |
32 | black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022) GCF_013377495.2 |
41,421 (4.72 %) |
13,027 (1.98 %) |
22,616 (2.25 %) |
n/a | 41.96 (99.99 %) |
130 (0.01 %) |
568 (100.00 %) |
636,501 (5.67 %) |
297,964 (1.45 %) |
6,820,083 (21.47 %) |
31,725 (3.49 %) |
33 | black-capped chickadee (hap1 2023) GCF_030490865.1 |
44,388 (4.96 %) |
13,738 (1.81 %) |
26,691 (2.34 %) |
n/a | 42.41 (99.92 %) |
404 (0.08 %) |
307 (100.00 %) |
730,165 (12.91 %) |
566,529 (6.51 %) |
6,499,984 (24.36 %) |
42,650 (2.59 %) |
34 | black-capped chickadee (hap2 2023) GCA_030490855.1 |
n/a | 11,495 (1.90 %) |
22,202 (2.49 %) |
n/a | 42.77 (99.94 %) |
240 (0.06 %) |
157 (100.00 %) |
560,436 (11.20 %) |
441,102 (7.11 %) |
5,126,888 (23.42 %) |
35,457 (2.90 %) |
35 | black-headed gull (Kunming 2023) GCA_030820635.1 |
n/a | 12,902 (1.75 %) |
23,180 (2.09 %) |
n/a | 43.21 (100.00 %) |
149 (0.00 %) |
297 (100.00 %) |
498,044 (5.37 %) |
199,557 (4.44 %) |
6,843,616 (23.12 %) |
42,444 (3.62 %) |
36 | black-headed gull (primary hap 2024) GCA_963924245.1 |
n/a | 13,244 (1.58 %) |
25,111 (1.96 %) |
n/a | 44.66 (99.99 %) |
462 (0.01 %) |
729 (100.00 %) |
516,350 (4.84 %) |
268,175 (14.83 %) |
5,880,256 (31.31 %) |
45,313 (4.92 %) |
37 | black-headed gull (primary hap 2024) GCF_963924245.1 |
46,133 (4.67 %) |
13,243 (1.58 %) |
24,048 (1.89 %) |
n/a | 44.66 (99.99 %) |
462 (0.01 %) |
728 (100.00 %) |
516,346 (4.84 %) |
268,169 (14.83 %) |
5,880,218 (31.31 %) |
45,313 (4.92 %) |
38 | black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq) GCF_028500815.1 |
51,115 (5.11 %) |
13,211 (1.67 %) |
24,108 (1.99 %) |
n/a | 44.40 (99.94 %) |
283 (0.06 %) |
716 (100.00 %) |
521,275 (5.36 %) |
236,727 (8.62 %) |
5,684,588 (26.70 %) |
45,318 (4.71 %) |
39 | black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023) GCA_028501385.1 |
n/a | 12,650 (1.68 %) |
22,959 (2.02 %) |
n/a | 44.62 (99.95 %) |
223 (0.05 %) |
733 (100.00 %) |
483,413 (5.25 %) |
221,284 (9.35 %) |
6,264,499 (27.26 %) |
42,776 (4.88 %) |
40 | black-throated flowerpiercer GCA_019023105.1 |
n/a | 12,249 (1.86 %) |
23,692 (2.34 %) |
n/a | 42.36 (99.99 %) |
970 (0.01 %) |
600 (100.00 %) |
491,914 (6.04 %) |
365,884 (2.89 %) |
6,453,998 (20.73 %) |
30,076 (2.44 %) |
41 | blackcap (alternate hap 2019) GCA_009819715.1 |
n/a | 11,586 (1.87 %) |
22,618 (2.41 %) |
n/a | 42.17 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
3,566 (100.00 %) |
473,456 (5.97 %) |
308,518 (2.29 %) |
5,987,640 (19.64 %) |
25,451 (2.38 %) |
42 | blackcap (primary hap 2019 refseq) GCF_009819655.1 |
31,610 (4.74 %) |
12,379 (1.92 %) |
22,970 (2.37 %) |
n/a | 42.00 (98.88 %) |
413 (1.12 %) |
190 (100.00 %) |
582,016 (10.36 %) |
330,354 (2.12 %) |
6,410,626 (19.76 %) |
26,838 (2.34 %) |
43 | blue tit GCF_002901205.1 |
42,986 (5.81 %) |
12,162 (1.76 %) |
16,442 (2.29 %) |
n/a | 41.18 (92.58 %) |
24,797 (7.42 %) |
29,297 (100.00 %) |
486,455 (6.02 %) |
423,142 (2.68 %) |
6,777,615 (18.84 %) |
26,565 (0.98 %) |
44 | blue-and-yellow macaw (hap1 2023) GCA_028858755.1 |
n/a | 12,919 (1.77 %) |
22,770 (2.15 %) |
n/a | 42.69 (99.92 %) |
107 (0.08 %) |
246 (100.00 %) |
711,670 (17.55 %) |
242,430 (5.04 %) |
5,545,074 (24.84 %) |
25,153 (2.06 %) |
45 | blue-and-yellow macaw (hap2 2023) GCA_028858555.1 |
n/a | 13,216 (1.69 %) |
23,855 (2.07 %) |
n/a | 43.30 (99.92 %) |
130 (0.08 %) |
274 (100.00 %) |
746,174 (21.96 %) |
291,116 (9.91 %) |
5,424,976 (28.69 %) |
26,750 (2.02 %) |
46 | blue-crowned manakin GCF_001604755.1 |
42,586 (5.25 %) |
12,442 (1.93 %) |
16,972 (2.49 %) |
n/a | 41.74 (97.93 %) |
22,456 (2.07 %) |
23,501 (97.93 %) |
470,567 (6.92 %) |
226,975 (1.27 %) |
6,395,476 (19.17 %) |
24,084 (1.85 %) |
47 | blue-fronted amazon (AMXYW 2021) GCA_017639355.1 |
n/a | 12,250 (1.92 %) |
19,607 (2.10 %) |
n/a | 41.72 (93.42 %) |
3,560,856 (6.92 %) |
1,498 (100.00 %) |
559,187 (10.05 %) |
144,509 (0.66 %) |
5,883,053 (17.90 %) |
18,581 (1.17 %) |
48 | blue-fronted amazon (FVVF132 2015) GCA_001420675.1 |
n/a | 12,339 (1.91 %) |
20,350 (2.13 %) |
n/a | 41.72 (93.49 %) |
3,559,082 (6.85 %) |
3,232 (100.00 %) |
501,831 (8.21 %) |
144,313 (0.66 %) |
5,882,906 (17.92 %) |
18,584 (1.17 %) |
49 | Bourke's parrot (Australia Nb327-2 2023) GCF_033783945.1 |
43,924 (4.72 %) |
13,092 (1.91 %) |
23,195 (2.31 %) |
n/a | 41.98 (100.00 %) |
37 (0.00 %) |
1,864 (100.00 %) |
469,079 (6.31 %) |
205,954 (1.49 %) |
5,911,944 (20.89 %) |
22,555 (1.70 %) |
50 | Brazilian merganser (hap1 2024) GCA_036873955.1 |
n/a | 13,202 (1.80 %) |
24,416 (2.14 %) |
n/a | 42.42 (100.00 %) |
327 (0.00 %) |
569 (100.00 %) |
832,469 (7.06 %) |
531,644 (7.37 %) |
6,294,434 (28.49 %) |
34,786 (3.61 %) |
51 | Brazilian merganser (hap2 2024) GCA_036850655.1 |
n/a | 12,578 (1.76 %) |
23,066 (2.06 %) |
n/a | 42.87 (100.00 %) |
244 (0.00 %) |
720 (100.00 %) |
773,452 (7.75 %) |
522,491 (10.88 %) |
5,592,104 (31.80 %) |
33,981 (4.60 %) |
52 | bronzed cowbird (106 2024) GCF_037042795.1 |
30,276 (4.54 %) |
12,775 (1.77 %) |
24,737 (2.30 %) |
n/a | 42.93 (100.00 %) |
67 (0.00 %) |
528 (100.00 %) |
410,661 (3.03 %) |
498,610 (9.50 %) |
6,332,690 (26.06 %) |
33,278 (2.51 %) |
53 | brown eared-pheasant GCA_019593555.1 |
n/a | 13,027 (2.37 %) |
22,748 (2.48 %) |
n/a | 41.03 (98.67 %) |
114,232 (1.35 %) |
2,408 (100.00 %) |
523,649 (0.00 %) |
228,783 (1.17 %) |
6,134,418 (20.24 %) |
19,702 (2.00 %) |
54 | brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022) GCF_012460135.2 |
31,871 (5.31 %) |
12,561 (1.89 %) |
24,218 (2.41 %) |
n/a | 42.40 (99.99 %) |
318 (0.01 %) |
692 (99.99 %) |
598,355 (12.36 %) |
420,712 (3.73 %) |
6,496,704 (21.26 %) |
28,568 (2.41 %) |
55 | brown kiwi GCF_001039765.1 |
26,121 (3.23 %) |
12,909 (1.54 %) |
23,267 (1.91 %) |
n/a | 41.28 (86.08 %) |
368,297 (13.97 %) |
24,718 (100.00 %) |
367,446 (2.94 %) |
316,602 (7.36 %) |
7,164,456 (14.67 %) |
59,756 (2.40 %) |
56 | brown roatelo GCF_000695765.1 |
16,756 (2.26 %) |
12,208 (1.55 %) |
27,079 (2.12 %) |
n/a | 41.32 (99.66 %) |
51,602 (0.35 %) |
119,122 (99.65 %) |
345,102 (5.17 %) |
194,444 (1.21 %) |
6,441,258 (19.39 %) |
19,018 (0.67 %) |
57 | budgerigar (maternal 2020) GCA_012275265.1 |
n/a | 12,659 (1.89 %) |
22,063 (2.28 %) |
n/a | 41.89 (94.20 %) |
388 (5.80 %) |
930 (100.00 %) |
504,677 (9.95 %) |
268,616 (3.12 %) |
5,481,198 (20.78 %) |
20,278 (1.55 %) |
58 | budgerigar (maternal Z 2020 refseq) GCF_012275295.1 |
32,026 (4.32 %) |
13,239 (1.87 %) |
23,063 (2.25 %) |
26,324 (3.11 %) |
41.80 (99.72 %) |
284 (0.28 %) |
864 (100.00 %) |
538,374 (10.19 %) |
279,504 (3.12 %) |
5,874,531 (22.08 %) |
21,155 (1.61 %) |
59 | budgerigar (paternal 2020) GCA_012275275.1 |
n/a | 13,127 (1.94 %) |
22,492 (2.30 %) |
n/a | 41.84 (98.98 %) |
737 (1.02 %) |
330 (100.00 %) |
505,478 (9.66 %) |
231,633 (2.15 %) |
5,778,405 (20.30 %) |
20,205 (1.61 %) |
60 | budgerigar (v6.3 2021 WashU) GCF_000238935.1 |
25,525 (4.05 %) |
12,188 (1.82 %) |
15,819 (2.26 %) |
n/a | 41.25 (97.26 %) |
51,022 (2.75 %) |
70,863 (97.25 %) |
465,974 (9.37 %) |
127,353 (0.54 %) |
5,864,264 (19.05 %) |
15,886 (0.88 %) |
61 | burrowing owl GCF_003259725.1 |
30,559 (4.30 %) |
11,741 (1.72 %) |
10,976 (2.04 %) |
n/a | 40.92 (98.92 %) |
33,737 (1.09 %) |
445 (100.00 %) |
492,320 (6.21 %) |
182,281 (0.73 %) |
6,811,984 (19.35 %) |
22,840 (1.08 %) |
62 | California black rail (168171201 alternate hap 2022) GCA_022605925.1 |
n/a | 11,551 (1.57 %) |
22,390 (2.09 %) |
n/a | 44.21 (99.99 %) |
1,672 (0.01 %) |
3,563 (100.00 %) |
465,417 (6.39 %) |
218,050 (11.40 %) |
4,588,632 (30.42 %) |
22,622 (2.16 %) |
63 | California black rail (168171201 primary hap 2022) GCA_022605575.1 |
n/a | 12,725 (1.54 %) |
24,572 (2.13 %) |
n/a | 43.81 (100.00 %) |
319 (0.00 %) |
964 (100.00 %) |
522,782 (6.36 %) |
226,563 (14.09 %) |
5,497,483 (32.27 %) |
24,529 (1.77 %) |
64 | California condor (v2 813 2022 refseq) GCF_018139145.2 |
27,527 (3.38 %) |
12,653 (1.75 %) |
21,924 (1.97 %) |
n/a | 42.16 (99.97 %) |
632 (0.03 %) |
542 (100.00 %) |
434,141 (3.82 %) |
177,389 (0.88 %) |
7,171,770 (20.32 %) |
34,918 (3.00 %) |
65 | California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022) GCA_023055725.1 |
n/a | 12,948 (1.71 %) |
24,838 (2.01 %) |
n/a | 43.36 (100.00 %) |
248 (0.00 %) |
1,601 (100.00 %) |
1,359,516 (35.69 %) |
599,039 (11.78 %) |
3,454,101 (36.94 %) |
36,496 (2.55 %) |
66 | California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022) GCA_023055505.1 |
n/a | 12,718 (2.12 %) |
23,363 (2.40 %) |
n/a | 42.23 (100.00 %) |
287 (0.00 %) |
608 (100.00 %) |
881,563 (19.85 %) |
308,707 (5.50 %) |
5,409,060 (25.34 %) |
25,268 (2.42 %) |
67 | California towhee (CALT 2023) GCF_028551555.1 |
28,823 (3.21 %) |
12,791 (1.50 %) |
26,511 (2.06 %) |
n/a | 44.24 (100.00 %) |
n/a | 627 (100.00 %) |
473,712 (3.18 %) |
586,987 (10.80 %) |
4,965,312 (32.86 %) |
48,369 (2.73 %) |
68 | Canada goose (SJ_97 2019) GCA_006130075.1 |
n/a | 13,061 (1.95 %) |
24,149 (2.23 %) |
n/a | 42.13 (98.37 %) |
15,389 (1.64 %) |
28,876 (98.36 %) |
715,113 (7.61 %) |
319,386 (1.67 %) |
6,810,836 (21.27 %) |
40,389 (4.15 %) |
69 | carmine bee-eater (2019) GCA_009819595.1 |
n/a | 12,740 (1.82 %) |
28,031 (2.77 %) |
n/a | 42.88 (99.47 %) |
269 (0.53 %) |
109 (100.00 %) |
556,926 (7.87 %) |
213,180 (1.09 %) |
6,641,077 (21.58 %) |
30,881 (2.41 %) |
70 | carmine bee-eater alternate hap pseudohaplotype 2019) GCA_009819585.1 |
n/a | 12,381 (1.76 %) |
28,865 (2.78 %) |
n/a | 43.05 (100.00 %) |
n/a | 3,296 (100.00 %) |
542,765 (7.77 %) |
204,389 (1.06 %) |
6,415,832 (21.53 %) |
31,638 (2.54 %) |
71 | chaffinch (primary hap 2023) GCA_963513975.1 |
n/a | 12,708 (1.72 %) |
24,978 (2.26 %) |
n/a | 44.06 (99.99 %) |
573 (0.01 %) |
467 (100.00 %) |
495,590 (3.15 %) |
493,628 (13.34 %) |
6,163,336 (28.37 %) |
39,042 (6.25 %) |
72 | chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022) GCA_027408205.1 |
n/a | 11,740 (2.36 %) |
21,473 (2.56 %) |
n/a | 42.25 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
2,263 (100.00 %) |
551,116 (10.78 %) |
241,638 (4.43 %) |
4,973,260 (21.77 %) |
21,151 (2.71 %) |
73 | chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022) GCA_027408225.1 |
n/a | 13,037 (2.20 %) |
23,550 (2.37 %) |
n/a | 42.31 (99.81 %) |
460 (0.19 %) |
252 (100.00 %) |
681,166 (12.04 %) |
381,093 (7.09 %) |
5,610,806 (24.65 %) |
25,664 (2.75 %) |
74 | chicken (GRCg6a 2018) GCF_000002315.6 |
62,183 (8.40 %) |
13,099 (2.32 %) |
18,797 (2.76 %) |
73,407 (9.29 %) |
42.23 (99.08 %) |
952 (0.92 %) |
2,380 (99.08 %) |
684,052 (12.74 %) |
307,144 (2.92 %) |
5,863,131 (21.16 %) |
24,405 (2.72 %) |
75 | chicken (Huxu 2023) GCA_024206055.2 |
n/a | 13,405 (2.26 %) |
24,435 (2.45 %) |
n/a | 42.64 (100.00 %) |
14 (0.00 %) |
41 (100.00 %) |
704,190 (12.54 %) |
502,701 (5.74 %) |
5,731,097 (23.50 %) |
27,781 (2.90 %) |
76 | chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022) GCA_027408255.1 |
n/a | 11,339 (2.33 %) |
20,588 (2.51 %) |
n/a | 42.16 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,684 (100.00 %) |
537,847 (10.84 %) |
217,964 (3.81 %) |
4,879,985 (21.43 %) |
19,653 (2.66 %) |
77 | chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023) GCA_027557775.1 |
n/a | 12,855 (2.22 %) |
23,147 (2.37 %) |
n/a | 42.15 (99.74 %) |
566 (0.26 %) |
246 (100.00 %) |
672,973 (12.00 %) |
342,156 (6.53 %) |
5,690,712 (23.98 %) |
24,413 (2.63 %) |
78 | chicken white leghorn layer X broiler (broiler haplotype 2021 v2 2021) GCF_016699485.2 |
74,716 (9.14 %) |
13,128 (2.33 %) |
23,484 (2.48 %) |
72,013 (9.34 %) |
42.20 (99.68 %) |
463 (0.32 %) |
677 (99.68 %) |
697,827 (12.53 %) |
290,892 (2.63 %) |
5,887,021 (21.30 %) |
24,469 (2.59 %) |
79 | chicken white leghorn layer X broiler (leghorn haplotype v2 2021) GCF_016700215.2 |
83,834 (10.16 %) |
13,005 (2.32 %) |
23,329 (2.48 %) |
72,360 (9.39 %) |
42.16 (99.57 %) |
409 (0.43 %) |
685 (99.57 %) |
536,869 (6.00 %) |
268,230 (2.28 %) |
5,845,184 (20.93 %) |
24,409 (2.60 %) |
80 | Chilean tinamou GCF_003342845.1 |
24,894 (4.16 %) |
12,545 (2.09 %) |
18,167 (2.87 %) |
n/a | 42.04 (98.74 %) |
1,226,739 (1.39 %) |
2,217 (100.00 %) |
496,518 (5.43 %) |
290,573 (1.50 %) |
5,870,743 (19.53 %) |
44,640 (5.21 %) |
81 | chimney swift (M959 v1.1 2014) GCF_000747805.2 |
15,969 (2.53 %) |
12,045 (1.82 %) |
18,580 (2.07 %) |
n/a | 41.40 (96.00 %) |
65,471 (4.02 %) |
84,174 (95.98 %) |
469,979 (5.99 %) |
194,781 (2.21 %) |
6,361,618 (19.70 %) |
12,438 (0.41 %) |
82 | chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014) GCF_000700745.2 |
17,193 (2.21 %) |
12,092 (1.49 %) |
28,685 (1.89 %) |
n/a | 40.76 (99.62 %) |
56,333 (0.39 %) |
125,214 (99.61 %) |
516,189 (5.36 %) |
202,882 (1.12 %) |
6,588,198 (20.47 %) |
8,029 (0.24 %) |
83 | collared flycatcher GCF_000247815.1 |
28,360 (4.07 %) |
12,200 (1.78 %) |
14,028 (2.24 %) |
33,113 (3.87 %) |
44.22 (98.57 %) |
11,403 (1.43 %) |
30,843 (98.57 %) |
559,053 (7.88 %) |
597,207 (11.39 %) |
6,656,400 (23.61 %) |
29,879 (1.50 %) |
84 | common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024) GCA_964188355.1 |
n/a | 13,512 (1.75 %) |
24,417 (2.13 %) |
n/a | 43.17 (99.99 %) |
471 (0.01 %) |
546 (100.00 %) |
439,018 (4.62 %) |
244,865 (6.73 %) |
6,778,625 (23.94 %) |
43,400 (4.80 %) |
85 | common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024) GCA_964188375.1 |
n/a | 13,593 (1.72 %) |
24,541 (2.09 %) |
n/a | 43.49 (99.99 %) |
471 (0.01 %) |
929 (99.99 %) |
439,011 (4.19 %) |
247,629 (8.40 %) |
6,711,875 (25.06 %) |
49,141 (4.61 %) |
86 | common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019) GCF_007115625.1 |
32,985 (4.99 %) |
12,248 (1.89 %) |
15,910 (2.38 %) |
n/a | 42.17 (98.21 %) |
47,138 (1.81 %) |
3,536 (100.00 %) |
477,249 (6.30 %) |
313,951 (2.10 %) |
6,525,604 (19.58 %) |
25,722 (1.90 %) |
87 | common canary (serCan28SL12 2022) GCF_022539315.1 |
41,390 (5.57 %) |
12,314 (1.93 %) |
23,133 (2.37 %) |
n/a | 42.36 (99.95 %) |
1,055 (0.05 %) |
685 (100.00 %) |
553,077 (10.89 %) |
322,311 (2.75 %) |
6,543,183 (20.47 %) |
26,268 (2.31 %) |
88 | common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021) GCA_017976305.1 |
n/a | 12,464 (1.91 %) |
24,623 (2.50 %) |
n/a | 42.28 (100.00 %) |
8 (0.00 %) |
1,004 (100.00 %) |
505,582 (10.93 %) |
292,484 (2.48 %) |
6,061,828 (21.38 %) |
24,010 (1.80 %) |
89 | common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq) GCF_017976375.1 |
50,206 (6.30 %) |
13,190 (1.85 %) |
24,284 (2.29 %) |
n/a | 42.18 (99.58 %) |
296 (0.42 %) |
150 (100.00 %) |
566,161 (11.56 %) |
310,430 (2.36 %) |
6,712,791 (21.76 %) |
25,268 (1.73 %) |
90 | common goldeneye (primary hap 2024) GCA_964059595.1 |
n/a | 13,374 (1.90 %) |
24,308 (2.28 %) |
n/a | 42.07 (99.99 %) |
454 (0.01 %) |
544 (100.00 %) |
751,865 (6.78 %) |
400,294 (3.80 %) |
6,184,781 (24.97 %) |
35,712 (2.66 %) |
91 | common mallard (Pekin duck 2017) GCA_002743455.1 |
n/a | 12,871 (1.94 %) |
25,038 (2.26 %) |
n/a | 41.42 (95.05 %) |
25,623 (4.96 %) |
21,442 (100.00 %) |
760,634 (7.52 %) |
360,866 (1.37 %) |
6,710,465 (20.25 %) |
32,823 (2.15 %) |
92 | common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024) GCA_964237585.1 |
n/a | 12,976 (1.68 %) |
23,758 (2.12 %) |
n/a | 44.70 (99.99 %) |
603 (0.01 %) |
845 (100.00 %) |
499,923 (5.57 %) |
250,214 (7.38 %) |
6,350,978 (25.68 %) |
27,790 (2.32 %) |
93 | common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024) GCA_964237395.1 |
n/a | 12,745 (1.75 %) |
23,052 (2.18 %) |
n/a | 43.90 (99.99 %) |
536 (0.01 %) |
931 (99.99 %) |
483,812 (5.59 %) |
210,131 (3.30 %) |
6,332,994 (22.33 %) |
26,285 (2.20 %) |
94 | common myna (bArcTri1 alternate hap 2023) GCA_027559525.1 |
n/a | 10,692 (1.77 %) |
20,925 (2.29 %) |
n/a | 42.15 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,221 (100.00 %) |
328,602 (4.16 %) |
604,057 (8.02 %) |
5,233,128 (25.06 %) |
25,210 (3.70 %) |
95 | common myna (bArcTri1 primary hap 2023) GCA_027559615.1 |
n/a | 12,560 (1.73 %) |
23,740 (2.16 %) |
n/a | 42.32 (99.80 %) |
435 (0.20 %) |
455 (100.00 %) |
395,254 (5.40 %) |
937,774 (11.00 %) |
6,145,808 (28.07 %) |
32,293 (3.87 %) |
96 | common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024) GCA_964211825.1 |
n/a | 13,505 (1.83 %) |
24,961 (2.21 %) |
n/a | 42.19 (99.99 %) |
474 (0.01 %) |
870 (100.00 %) |
833,892 (8.17 %) |
576,230 (8.04 %) |
6,149,355 (27.84 %) |
34,089 (2.69 %) |
97 | common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024) GCA_964211795.1 |
n/a | 12,828 (1.96 %) |
23,534 (2.35 %) |
n/a | 42.18 (99.99 %) |
405 (0.01 %) |
767 (99.99 %) |
725,169 (7.34 %) |
472,156 (5.81 %) |
5,786,296 (25.35 %) |
30,917 (2.80 %) |
98 | common starling GCF_001447265.1 |
28,711 (4.57 %) |
12,585 (2.01 %) |
17,785 (2.59 %) |
n/a | 41.49 (97.70 %) |
23,392 (2.31 %) |
22,666 (97.69 %) |
427,543 (5.30 %) |
310,445 (1.74 %) |
6,482,337 (19.49 %) |
23,883 (1.99 %) |
99 | common swift (bApuApu2 alternate hap 2021) GCA_020740585.1 |
n/a | 11,653 (1.89 %) |
19,731 (2.20 %) |
n/a | 42.01 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
1,697 (100.00 %) |
443,384 (6.09 %) |
185,968 (1.18 %) |
5,916,553 (20.88 %) |
18,864 (1.75 %) |
100 | common swift (bApuApu2 primary hap 2021 refseq) GCF_020740795.1 |
39,986 (4.95 %) |
12,292 (1.88 %) |
20,379 (2.16 %) |
n/a | 41.95 (99.84 %) |
256 (0.16 %) |
110 (100.00 %) |
499,695 (6.70 %) |
199,749 (1.12 %) |
6,354,003 (21.19 %) |
20,393 (1.74 %) |
101 | common tern (2019) GCA_009819605.1 |
n/a | 13,103 (1.81 %) |
24,044 (2.16 %) |
n/a | 43.03 (99.16 %) |
205 (0.84 %) |
123 (100.00 %) |
570,312 (7.91 %) |
216,895 (1.04 %) |
7,043,151 (20.98 %) |
45,694 (3.73 %) |
102 | common tern (alternate hap 2019) GCA_009819645.1 |
n/a | 12,773 (1.79 %) |
24,751 (2.23 %) |
n/a | 43.24 (100.00 %) |
n/a | 2,235 (100.00 %) |
549,460 (7.58 %) |
204,051 (1.02 %) |
6,880,566 (20.70 %) |
47,352 (3.95 %) |
103 | common yellowthroat (2019) GCA_009764595.1 |
n/a | 11,741 (1.82 %) |
22,382 (2.29 %) |
n/a | 42.01 (98.73 %) |
1,479 (1.27 %) |
278 (100.00 %) |
476,049 (6.38 %) |
367,108 (3.16 %) |
6,576,957 (20.43 %) |
25,004 (2.02 %) |
104 | common yellowthroat (alternate hap 2019) GCA_009764545.1 |
n/a | 10,611 (1.77 %) |
21,125 (2.21 %) |
n/a | 41.77 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
4,976 (100.00 %) |
422,889 (5.99 %) |
294,928 (2.71 %) |
5,928,421 (19.76 %) |
21,397 (1.91 %) |
105 | Cory's shearwater (bCalBor7.hap1.1 2024) GCA_964195595.1 |
n/a | 13,703 (1.71 %) |
26,310 (2.10 %) |
n/a | 43.29 (99.99 %) |
525 (0.01 %) |
414 (100.00 %) |
479,045 (5.03 %) |
336,466 (4.95 %) |
5,910,298 (24.89 %) |
48,046 (4.19 %) |
106 | Cory's shearwater (bCalBor7.hap2.1 2024) GCA_964196065.1 |
n/a | 12,750 (1.85 %) |
23,191 (2.16 %) |
n/a | 43.03 (99.99 %) |
477 (0.01 %) |
726 (99.99 %) |
403,846 (4.59 %) |
252,125 (3.30 %) |
6,206,493 (22.07 %) |
41,821 (4.50 %) |
107 | crested ibis (BGI_Y956 2014) GCF_000708225.1 |
17,134 (2.52 %) |
12,801 (1.77 %) |
14,062 (2.19 %) |
n/a | 41.83 (97.20 %) |
70,475 (2.81 %) |
130,030 (97.19 %) |
395,055 (4.53 %) |
182,744 (0.97 %) |
7,244,849 (18.69 %) |
39,156 (2.06 %) |
108 | cuckoo roller (BGI_N330 2014) GCF_000691785.1 |
16,484 (2.21 %) |
12,195 (1.53 %) |
24,940 (1.96 %) |
n/a | 41.82 (99.74 %) |
56,010 (0.27 %) |
113,170 (99.73 %) |
349,912 (4.65 %) |
131,678 (0.66 %) |
6,778,773 (18.46 %) |
35,090 (1.44 %) |
109 | cuckoo roller (hap1 2023) GCA_034619455.1 |
n/a | 13,157 (1.67 %) |
30,413 (2.59 %) |
n/a | 43.53 (100.00 %) |
290 (0.00 %) |
353 (100.00 %) |
609,076 (8.83 %) |
331,584 (6.01 %) |
5,966,458 (23.99 %) |
45,694 (7.05 %) |
110 | cuckoo roller (hap2 2023) GCA_034619465.1 |
n/a | 13,044 (1.66 %) |
30,275 (2.65 %) |
n/a | 43.69 (100.00 %) |
271 (0.00 %) |
295 (100.00 %) |
603,184 (8.76 %) |
324,082 (7.37 %) |
6,147,876 (25.10 %) |
44,051 (8.95 %) |
111 | Dalmatian pelican (alternate hap 2023) GCA_030449815.1 |
n/a | 12,766 (1.68 %) |
26,055 (2.18 %) |
n/a | 43.44 (100.00 %) |
n/a | 7,284 (100.00 %) |
607,561 (13.23 %) |
239,649 (4.41 %) |
6,086,519 (23.21 %) |
38,398 (5.49 %) |
112 | Dalmatian pelican (BGI_N334 2014) GCF_000687375.1 |
16,438 (2.13 %) |
11,927 (1.44 %) |
25,409 (1.84 %) |
n/a | 41.39 (99.65 %) |
57,580 (0.36 %) |
121,562 (99.64 %) |
394,453 (5.19 %) |
159,315 (0.83 %) |
6,832,864 (19.52 %) |
25,648 (0.91 %) |
113 | Dalmatian pelican (primary hap 2023) GCA_030463565.1 |
n/a | 13,457 (1.72 %) |
25,299 (2.10 %) |
n/a | 43.41 (99.99 %) |
390 (0.01 %) |
311 (100.00 %) |
660,747 (14.47 %) |
294,268 (5.22 %) |
6,840,996 (24.63 %) |
39,705 (5.14 %) |
114 | Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024) GCA_964211835.1 |
n/a | 13,401 (1.75 %) |
24,999 (2.15 %) |
n/a | 43.53 (99.99 %) |
930 (0.01 %) |
819 (100.00 %) |
685,992 (5.59 %) |
452,303 (8.91 %) |
5,976,185 (28.48 %) |
43,672 (4.38 %) |
115 | Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024) GCA_964211785.1 |
n/a | 12,473 (1.84 %) |
22,849 (2.21 %) |
n/a | 43.41 (99.99 %) |
754 (0.01 %) |
1,135 (99.99 %) |
594,136 (5.06 %) |
375,813 (7.54 %) |
5,497,978 (26.76 %) |
39,164 (4.55 %) |
116 | Downy woodpecker (alternate hap 2020) GCA_014839825.1 |
n/a | 11,732 (1.74 %) |
22,080 (2.25 %) |
n/a | 45.44 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
1,342 (100.00 %) |
921,959 (20.95 %) |
334,804 (3.26 %) |
5,352,773 (31.27 %) |
24,105 (1.81 %) |
117 | Downy woodpecker (primary hap 2020) GCF_014839835.1 |
25,483 (3.24 %) |
12,410 (1.70 %) |
22,416 (2.11 %) |
n/a | 45.31 (99.66 %) |
187 (0.34 %) |
180 (100.00 %) |
1,259,627 (26.52 %) |
378,533 (3.38 %) |
5,846,661 (32.04 %) |
26,005 (1.75 %) |
118 | East African grey crowned-crane GCF_000709895.1 |
16,274 (2.23 %) |
12,032 (1.55 %) |
26,131 (1.84 %) |
n/a | 41.21 (99.65 %) |
58,359 (0.36 %) |
111,850 (99.64 %) |
374,845 (4.51 %) |
130,655 (0.66 %) |
6,753,184 (18.86 %) |
26,202 (0.96 %) |
119 | East African grey crowned-crane (alternate hap 2020) GCA_011004865.1 |
n/a | 11,799 (1.88 %) |
22,122 (2.30 %) |
n/a | 42.41 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
971 (100.00 %) |
457,930 (6.40 %) |
150,544 (0.85 %) |
6,074,490 (20.16 %) |
33,323 (3.81 %) |
120 | East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020) GCA_011004875.1 |
n/a | 13,276 (1.84 %) |
25,393 (2.30 %) |
n/a | 42.38 (99.61 %) |
144 (0.39 %) |
105 (100.00 %) |
548,862 (7.06 %) |
187,966 (0.97 %) |
7,004,597 (21.19 %) |
36,626 (3.69 %) |
121 | Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023) GCF_029582105.1 |
38,171 (5.79 %) |
12,559 (1.96 %) |
23,642 (2.48 %) |
n/a | 42.01 (99.99 %) |
582 (0.01 %) |
587 (100.00 %) |
599,051 (9.46 %) |
453,954 (3.77 %) |
6,287,657 (20.75 %) |
27,831 (2.52 %) |
122 | emperor penguin GCF_000699145.1 |
20,055 (3.28 %) |
12,513 (1.77 %) |
11,986 (2.13 %) |
n/a | 41.62 (94.30 %) |
72,501 (5.72 %) |
83,173 (94.28 %) |
478,239 (5.68 %) |
200,181 (2.24 %) |
7,154,684 (17.95 %) |
31,615 (1.38 %) |
123 | emu (2018) GCF_003342905.1 |
36,047 (5.11 %) |
12,857 (1.77 %) |
17,727 (2.32 %) |
n/a | 41.63 (99.02 %) |
1,408,082 (1.11 %) |
2,778 (100.00 %) |
440,224 (4.29 %) |
175,539 (0.70 %) |
7,218,815 (17.59 %) |
43,752 (4.64 %) |
124 | emu (hap1 2024) GCF_036370855.1 |
54,479 (5.65 %) |
13,972 (1.59 %) |
25,695 (1.97 %) |
n/a | 43.79 (100.00 %) |
129 (0.00 %) |
271 (100.00 %) |
713,839 (12.11 %) |
418,774 (7.08 %) |
5,668,105 (24.04 %) |
51,137 (7.32 %) |
125 | emu (hap2 2024) GCA_036417515.1 |
n/a | 12,839 (1.57 %) |
24,113 (1.98 %) |
n/a | 44.40 (100.00 %) |
101 (0.00 %) |
242 (100.00 %) |
657,460 (14.23 %) |
397,600 (8.84 %) |
4,824,789 (26.94 %) |
48,081 (7.49 %) |
126 | emu (v2 ZJU1.0 2023) GCA_016128335.2 |
n/a | 13,213 (1.74 %) |
24,562 (2.10 %) |
n/a | 42.41 (99.99 %) |
539 (0.01 %) |
767 (100.00 %) |
567,285 (7.79 %) |
258,030 (2.59 %) |
7,108,005 (19.16 %) |
41,752 (6.24 %) |
127 | Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024) GCA_964273445.1 |
n/a | 13,292 (1.69 %) |
25,387 (2.13 %) |
n/a | 41.80 (99.99 %) |
696 (0.01 %) |
2,451 (100.00 %) |
489,065 (4.78 %) |
331,025 (13.58 %) |
6,196,233 (29.98 %) |
37,567 (3.51 %) |
128 | Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024) GCA_964273585.1 |
n/a | 13,051 (1.80 %) |
24,815 (2.25 %) |
n/a | 42.33 (99.99 %) |
683 (0.01 %) |
584 (100.00 %) |
482,819 (5.02 %) |
292,761 (7.61 %) |
6,282,928 (25.46 %) |
35,630 (3.58 %) |
129 | Eurasian crane (hap1 2024) GCA_964106855.1 |
n/a | 13,457 (1.70 %) |
24,519 (2.05 %) |
n/a | 44.24 (99.99 %) |
593 (0.01 %) |
754 (100.00 %) |
516,462 (4.57 %) |
262,941 (8.12 %) |
5,356,948 (26.79 %) |
48,488 (7.36 %) |
130 | Eurasian curlew (hap1 2024) GCA_964106895.1 |
n/a | 13,239 (1.66 %) |
24,512 (2.02 %) |
n/a | 43.98 (99.99 %) |
785 (0.01 %) |
1,834 (100.00 %) |
600,399 (6.45 %) |
616,756 (7.75 %) |
5,607,190 (28.35 %) |
39,863 (3.53 %) |
131 | Eurasian curlew (hap2 2024) GCA_964059295.1 |
n/a | 12,728 (1.78 %) |
23,645 (2.18 %) |
n/a | 43.53 (99.99 %) |
693 (0.01 %) |
1,504 (99.99 %) |
544,959 (6.24 %) |
393,773 (4.49 %) |
5,839,698 (24.52 %) |
35,759 (3.26 %) |
132 | Eurasian nightjar (alternate hap 2021) GCA_907165095.1 |
n/a | 12,266 (1.90 %) |
22,091 (2.30 %) |
n/a | 41.97 (100.00 %) |
25 (0.00 %) |
2,502 (100.00 %) |
458,278 (5.64 %) |
212,205 (1.54 %) |
6,032,224 (21.16 %) |
21,942 (1.89 %) |
133 | Eurasian nightjar (primary hap 2021) GCA_907165065.1 |
n/a | 13,040 (1.86 %) |
22,823 (2.21 %) |
n/a | 41.94 (100.00 %) |
153 (0.00 %) |
121 (100.00 %) |
595,803 (8.38 %) |
248,128 (1.78 %) |
6,744,611 (22.18 %) |
24,805 (1.90 %) |
134 | Eurasian tree sparrow GCF_014805655.1 |
43,477 (5.70 %) |
12,550 (1.95 %) |
24,541 (2.43 %) |
n/a | 42.02 (99.82 %) |
4,765 (0.18 %) |
18,975 (100.00 %) |
464,973 (6.08 %) |
492,684 (3.98 %) |
6,663,773 (20.49 %) |
28,741 (2.30 %) |
135 | European golden plover (bPluApr1 primary hap 2021) GCA_017639485.1 |
n/a | 12,984 (1.78 %) |
22,854 (2.04 %) |
n/a | 42.70 (99.01 %) |
268 (0.99 %) |
107 (100.00 %) |
558,587 (8.35 %) |
180,400 (0.83 %) |
7,132,381 (21.18 %) |
40,661 (3.41 %) |
136 | European robin (alternate hap 2021) GCA_903797565.2 |
n/a | 11,359 (1.98 %) |
21,437 (2.45 %) |
n/a | 41.70 (100.00 %) |
18 (0.00 %) |
3,668 (100.00 %) |
346,477 (2.88 %) |
283,542 (2.49 %) |
5,597,130 (19.71 %) |
22,977 (2.32 %) |
137 | European robin (primary hap 2021) GCA_903797595.2 |
n/a | 12,344 (1.85 %) |
23,934 (2.37 %) |
n/a | 42.10 (99.97 %) |
990 (0.03 %) |
1,119 (100.00 %) |
532,973 (5.96 %) |
401,820 (3.43 %) |
6,320,210 (21.42 %) |
30,391 (2.60 %) |
138 | European shag (alternate hap 2023) GCA_949628205.1 |
n/a | 11,681 (1.64 %) |
22,195 (2.04 %) |
n/a | 43.00 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
9,752 (100.00 %) |
363,092 (4.61 %) |
347,630 (2.63 %) |
5,664,392 (21.56 %) |
32,162 (3.60 %) |
139 | European shag (primary hap 2023) GCA_949628215.1 |
n/a | 13,203 (1.74 %) |
22,959 (2.04 %) |
n/a | 43.10 (100.00 %) |
222 (0.00 %) |
356 (100.00 %) |
436,838 (4.84 %) |
471,070 (3.20 %) |
6,601,537 (22.79 %) |
37,247 (3.95 %) |
140 | European turtle dove (v1.2 2021) GCA_901699155.2 |
n/a | 12,391 (1.76 %) |
23,333 (2.17 %) |
n/a | 41.84 (99.67 %) |
940 (0.33 %) |
311 (100.00 %) |
550,895 (7.50 %) |
227,532 (1.16 %) |
6,767,530 (21.05 %) |
34,682 (2.57 %) |
141 | European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021) GCA_901699165.2 |
n/a | 11,276 (1.79 %) |
21,210 (2.15 %) |
n/a | 41.73 (100.00 %) |
n/a | 3,334 (100.00 %) |
426,785 (4.89 %) |
182,446 (0.97 %) |
6,038,491 (20.24 %) |
29,692 (2.35 %) |
142 | Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021) GCA_017639475.1 |
n/a | 11,836 (1.83 %) |
21,119 (2.12 %) |
n/a | 42.78 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
1,147 (100.00 %) |
443,887 (6.00 %) |
149,233 (0.76 %) |
6,328,128 (20.72 %) |
37,413 (3.59 %) |
143 | garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020) GCA_014839765.1 |
n/a | 12,359 (1.95 %) |
23,228 (2.46 %) |
n/a | 41.98 (100.00 %) |
n/a | 775 (100.00 %) |
485,213 (6.08 %) |
333,505 (2.21 %) |
6,358,327 (19.87 %) |
26,594 (2.34 %) |
144 | garden warbler (bSylBor1 primary hap 2020) GCA_014839755.1 |
n/a | 12,520 (1.95 %) |
23,459 (2.46 %) |
n/a | 42.08 (99.82 %) |
134 (0.18 %) |
176 (100.00 %) |
491,810 (6.09 %) |
376,746 (2.55 %) |
6,461,292 (20.23 %) |
27,799 (2.40 %) |
145 | golden eagle (v1.4 2021) GCF_900496995.4 |
60,920 (5.98 %) |
13,334 (1.84 %) |
23,261 (2.12 %) |
n/a | 42.16 (99.58 %) |
228 (0.42 %) |
144 (100.00 %) |
544,341 (5.93 %) |
186,461 (0.80 %) |
7,090,610 (20.01 %) |
38,495 (3.10 %) |
146 | golden eagle (v1.4 alternate hap 2021) GCA_902153765.2 |
n/a | 9,172 (1.85 %) |
16,917 (2.12 %) |
n/a | 42.48 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
3,855 (100.00 %) |
377,153 (8.49 %) |
117,959 (0.78 %) |
4,418,970 (18.34 %) |
27,767 (3.57 %) |
147 | golden pheasant GCA_003413605.1 |
n/a | 12,891 (2.28 %) |
21,429 (2.37 %) |
n/a | 40.87 (97.55 %) |
51,170 (2.47 %) |
65,464 (97.53 %) |
541,931 (8.01 %) |
249,405 (2.01 %) |
6,173,989 (19.98 %) |
22,227 (1.31 %) |
148 | golden-collared manakin GCF_001715985.3 |
27,575 (4.33 %) |
11,806 (1.85 %) |
13,267 (2.32 %) |
n/a | 41.42 (97.44 %) |
20,874 (2.57 %) |
3,619 (100.00 %) |
447,084 (7.00 %) |
197,843 (1.19 %) |
6,198,932 (18.50 %) |
18,804 (1.03 %) |
149 | great cormorant (BGI_N336 2014) GCF_000708925.1 |
15,472 (2.07 %) |
11,547 (1.44 %) |
22,727 (1.73 %) |
n/a | 41.28 (99.25 %) |
98,475 (0.77 %) |
162,787 (99.23 %) |
324,530 (4.59 %) |
144,409 (1.43 %) |
6,724,538 (18.06 %) |
14,330 (0.42 %) |
150 | great cormorant (primary hap 2024) GCA_963921805.1 |
n/a | 13,434 (1.76 %) |
30,619 (3.17 %) |
n/a | 43.47 (99.99 %) |
493 (0.01 %) |
351 (100.00 %) |
556,740 (10.18 %) |
303,279 (3.45 %) |
6,599,611 (22.65 %) |
38,341 (5.45 %) |
151 | great cormorant (primary hap 2024) GCF_963921805.1 |
46,253 (5.46 %) |
13,432 (1.76 %) |
23,419 (2.08 %) |
n/a | 43.47 (99.99 %) |
493 (0.01 %) |
350 (100.00 %) |
556,733 (10.18 %) |
303,277 (3.45 %) |
6,599,550 (22.65 %) |
38,340 (5.45 %) |
152 | great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020) GCA_013368595.1 |
n/a | 11,630 (1.85 %) |
20,866 (2.20 %) |
n/a | 42.73 (100.00 %) |
14 (0.00 %) |
1,395 (100.00 %) |
421,187 (9.08 %) |
159,172 (0.96 %) |
5,602,689 (22.75 %) |
29,548 (2.77 %) |
153 | great potoo (bNycGra1 primary hap 2020) GCA_013368605.1 |
n/a | 13,116 (1.77 %) |
23,657 (2.10 %) |
n/a | 42.67 (99.51 %) |
243 (0.49 %) |
191 (100.00 %) |
514,142 (9.71 %) |
210,381 (1.13 %) |
6,501,989 (23.95 %) |
35,785 (2.69 %) |
154 | great tit GCF_001522545.3 |
46,201 (6.78 %) |
12,250 (2.00 %) |
16,577 (2.52 %) |
n/a | 41.37 (98.24 %) |
24,615 (1.76 %) |
24,044 (98.24 %) |
447,566 (5.89 %) |
249,384 (1.36 %) |
6,330,291 (19.11 %) |
23,876 (1.88 %) |
155 | greater honeyguide (239-I01 2023) GCF_027791375.1 |
20,607 (2.63 %) |
12,184 (1.76 %) |
21,560 (2.12 %) |
n/a | 43.63 (100.00 %) |
556 (0.00 %) |
1,452 (100.00 %) |
804,583 (12.49 %) |
291,451 (3.14 %) |
5,887,349 (28.34 %) |
19,623 (1.55 %) |
156 | greater prairie chicken GCA_001870855.1 |
n/a | 12,923 (2.36 %) |
24,062 (2.50 %) |
n/a | 41.23 (99.63 %) |
48,408 (0.39 %) |
60,594 (99.61 %) |
544,139 (7.50 %) |
214,682 (0.99 %) |
6,153,628 (19.86 %) |
23,154 (2.26 %) |
157 | greater rhea GCA_003343005.1 |
n/a | 12,895 (1.81 %) |
20,976 (2.06 %) |
n/a | 40.79 (98.79 %) |
2,075,293 (1.40 %) |
2,162 (100.00 %) |
509,589 (0.00 %) |
196,258 (0.73 %) |
6,982,184 (18.70 %) |
41,811 (3.95 %) |
158 | greater sage-grouse GCF_019232065.1 |
36,656 (5.50 %) |
12,419 (2.36 %) |
21,319 (2.40 %) |
n/a | 41.16 (96.34 %) |
9,894 (3.66 %) |
1,502 (100.00 %) |
574,006 (8.05 %) |
196,630 (0.72 %) |
5,996,002 (19.65 %) |
18,807 (1.81 %) |
159 | green peafowl GCA_016647715.1 |
n/a | 12,897 (2.25 %) |
23,427 (2.41 %) |
n/a | 41.73 (98.15 %) |
32,668 (1.85 %) |
2,446 (100.00 %) |
481,865 (6.04 %) |
188,685 (1.04 %) |
6,268,032 (20.57 %) |
22,330 (1.85 %) |
160 | grey parrot (MU2MI4XJKV 2020) GCA_009867235.1 |
n/a | 13,159 (1.57 %) |
41,528 (2.68 %) |
n/a | 41.82 (99.96 %) |
4,777 (0.03 %) |
54,154 (99.97 %) |
525,535 (7.07 %) |
222,932 (1.16 %) |
6,301,005 (19.38 %) |
28,978 (2.14 %) |
161 | ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023) GCF_028554395.1 |
41,746 (4.05 %) |
13,173 (1.89 %) |
24,269 (2.31 %) |
n/a | 42.24 (100.00 %) |
n/a | 8,090 (100.00 %) |
468,845 (6.23 %) |
261,918 (2.42 %) |
5,956,005 (21.98 %) |
25,573 (1.77 %) |
162 | gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020) GCA_015220155.1 |
n/a | 6,534 (1.74 %) |
12,152 (1.97 %) |
n/a | 42.70 (100.00 %) |
n/a | 8,370 (100.00 %) |
179,674 (3.19 %) |
76,165 (0.79 %) |
2,908,228 (16.85 %) |
11,838 (2.15 %) |
163 | gyrfalcon (bFalRus1 primary hap 2020) GCF_015220075.1 |
47,961 (5.90 %) |
13,016 (1.82 %) |
21,266 (2.02 %) |
n/a | 42.20 (99.55 %) |
635 (0.45 %) |
133 (100.00 %) |
484,104 (5.60 %) |
186,430 (0.85 %) |
7,162,723 (18.83 %) |
24,760 (2.03 %) |
164 | Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022) GCA_026419925.1 |
n/a | 11,838 (1.64 %) |
24,014 (2.16 %) |
n/a | 43.80 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
5,969 (100.00 %) |
405,109 (3.51 %) |
220,222 (6.17 %) |
4,708,177 (25.30 %) |
58,446 (5.44 %) |
165 | Harpy eagle (primary hap 2022 refseq) GCF_026419915.1 |
51,641 (5.08 %) |
13,412 (1.70 %) |
24,002 (2.05 %) |
n/a | 43.39 (99.80 %) |
342 (0.20 %) |
322 (100.00 %) |
456,476 (3.62 %) |
260,495 (7.70 %) |
5,658,773 (24.81 %) |
60,606 (5.66 %) |
166 | Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021) GCA_020740675.1 |
n/a | 7,477 (1.92 %) |
14,094 (2.40 %) |
n/a | 43.16 (100.00 %) |
n/a | 2,762 (100.00 %) |
296,732 (12.20 %) |
135,408 (4.08 %) |
3,123,655 (20.92 %) |
23,288 (3.74 %) |
167 | Hawaiian crow (bCorHaw1 primary hap 2021 refseq) GCF_020740725.1 |
51,593 (6.18 %) |
12,739 (1.83 %) |
23,664 (2.30 %) |
n/a | 43.30 (99.84 %) |
294 (0.16 %) |
188 (100.00 %) |
409,129 (0.00 %) |
304,680 (5.73 %) |
5,953,375 (23.59 %) |
46,118 (3.85 %) |
168 | helmeted guineafowl GCF_002078875.1 |
55,435 (7.96 %) |
12,866 (2.29 %) |
18,391 (2.68 %) |
n/a | 41.73 (98.08 %) |
15,598 (1.93 %) |
2,739 (100.00 %) |
486,655 (7.97 %) |
173,056 (0.98 %) |
6,144,176 (20.18 %) |
26,577 (2.39 %) |
169 | hoatzin (BGI_N306 2014) GCF_000692075.1 |
14,928 (2.31 %) |
11,454 (1.65 %) |
11,717 (2.07 %) |
n/a | 42.42 (94.92 %) |
99,371 (5.11 %) |
109,627 (94.89 %) |
360,821 (6.34 %) |
145,440 (1.01 %) |
6,679,356 (18.72 %) |
40,581 (1.42 %) |
170 | hoatzin (hap1 2023) GCA_030867145.1 |
n/a | 13,089 (1.50 %) |
29,621 (2.22 %) |
n/a | 45.56 (100.00 %) |
268 (0.00 %) |
683 (100.00 %) |
610,333 (22.07 %) |
252,997 (12.56 %) |
5,154,598 (31.67 %) |
58,754 (5.54 %) |
171 | hoatzin (hap2 2023) GCA_030867165.1 |
n/a | 12,349 (1.54 %) |
27,206 (2.21 %) |
n/a | 45.91 (100.00 %) |
212 (0.00 %) |
535 (100.00 %) |
529,757 (21.69 %) |
235,999 (14.32 %) |
4,845,810 (31.86 %) |
53,781 (5.77 %) |
172 | hooded crow (v6 S_Up_H32 2022) GCF_000738735.6 |
42,787 (6.57 %) |
11,856 (1.93 %) |
20,738 (2.23 %) |
n/a | 42.10 (99.68 %) |
425 (0.32 %) |
47 (100.00 %) |
458,399 (8.32 %) |
164,830 (0.93 %) |
6,148,741 (19.00 %) |
25,266 (2.09 %) |
173 | house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022) GCA_027406555.1 |
n/a | 12,027 (1.89 %) |
23,973 (2.49 %) |
n/a | 43.03 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
1,004 (100.00 %) |
385,230 (3.05 %) |
398,497 (5.70 %) |
5,772,203 (22.69 %) |
28,740 (2.98 %) |
174 | house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 refseq) GCF_027477595.1 |
43,228 (5.71 %) |
12,702 (1.83 %) |
24,568 (2.38 %) |
n/a | 42.91 (99.02 %) |
296 (0.98 %) |
184 (100.00 %) |
440,384 (3.17 %) |
463,164 (6.37 %) |
6,300,138 (23.47 %) |
30,897 (2.53 %) |
175 | house sparrow (hap1 2024) GCA_036417665.1 |
n/a | 12,831 (1.61 %) |
26,124 (2.26 %) |
n/a | 43.99 (100.00 %) |
202 (0.00 %) |
334 (100.00 %) |
647,396 (12.37 %) |
646,615 (14.14 %) |
5,906,524 (30.36 %) |
36,193 (2.91 %) |
176 | house sparrow (hap1 2024) GCF_036417665.1 |
75,216 (7.36 %) |
12,832 (1.61 %) |
26,124 (2.26 %) |
n/a | 43.99 (100.00 %) |
204 (0.00 %) |
335 (100.00 %) |
647,402 (12.37 %) |
646,615 (14.14 %) |
5,906,561 (30.36 %) |
36,193 (2.91 %) |
177 | House sparrow (hap2 2024) GCA_036417895.1 |
n/a | 12,201 (1.59 %) |
24,721 (2.19 %) |
n/a | 44.46 (100.00 %) |
182 (0.00 %) |
482 (100.00 %) |
629,688 (12.73 %) |
644,409 (14.12 %) |
5,103,050 (31.93 %) |
33,424 (2.42 %) |
178 | Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022) GCA_027474345.1 |
n/a | 11,806 (1.66 %) |
21,429 (1.97 %) |
n/a | 43.73 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
4,343 (100.00 %) |
508,803 (10.25 %) |
162,918 (5.44 %) |
6,029,969 (24.67 %) |
27,953 (3.83 %) |
179 | Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022) GCA_027474245.1 |
n/a | 13,233 (1.67 %) |
23,010 (1.93 %) |
n/a | 43.91 (99.92 %) |
253 (0.08 %) |
136 (100.00 %) |
610,144 (11.51 %) |
214,393 (5.75 %) |
6,069,916 (25.74 %) |
33,172 (3.38 %) |
180 | hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022) GCA_009936445.2 |
n/a | 12,424 (1.21 %) |
43,440 (2.06 %) |
n/a | 41.86 (99.95 %) |
1,098 (0.00 %) |
260,829 (100.00 %) |
497,886 (5.29 %) |
184,967 (0.96 %) |
6,167,538 (20.22 %) |
33,529 (1.55 %) |
181 | jackdaw GCA_013407035.1 |
n/a | 12,072 (1.93 %) |
20,925 (2.08 %) |
n/a | 42.15 (99.72 %) |
511 (0.28 %) |
41 (100.00 %) |
428,760 (6.13 %) |
173,436 (1.02 %) |
6,231,317 (19.25 %) |
26,177 (2.17 %) |
182 | Japanese quail GCF_001577835.2 |
49,210 (7.77 %) |
12,864 (2.54 %) |
22,540 (2.69 %) |
37,604 (4.36 %) |
41.28 (98.88 %) |
11,601 (1.12 %) |
9,642 (98.88 %) |
559,601 (7.91 %) |
321,128 (2.22 %) |
5,497,911 (19.81 %) |
17,977 (1.86 %) |
183 | kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023) GCA_027595965.1 |
n/a | 8,732 (1.74 %) |
16,473 (2.17 %) |
n/a | 45.10 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,819 (100.00 %) |
314,902 (10.49 %) |
133,061 (10.84 %) |
3,656,435 (25.68 %) |
32,592 (5.25 %) |
184 | kagu (bRhyJub1 primary hap 2023) GCA_027574665.1 |
n/a | 13,042 (1.63 %) |
24,142 (2.01 %) |
n/a | 45.07 (99.96 %) |
300 (0.04 %) |
148 (100.00 %) |
563,851 (12.90 %) |
270,861 (12.36 %) |
6,191,106 (28.24 %) |
54,426 (4.92 %) |
185 | kakapo (Jane alternate hap 2019) GCA_004011185.1 |
n/a | 3,256 (1.65 %) |
6,220 (1.98 %) |
n/a | 41.74 (100.00 %) |
11 (0.00 %) |
3,728 (100.00 %) |
127,817 (7.83 %) |
53,447 (1.21 %) |
1,502,789 (18.09 %) |
5,487 (1.71 %) |
186 | kakapo (Jane v2 2020 refseq) GCF_004027225.2 |
49,757 (5.76 %) |
13,110 (1.92 %) |
22,782 (2.26 %) |
n/a | 41.97 (99.08 %) |
373 (0.92 %) |
89 (100.00 %) |
507,148 (7.85 %) |
208,178 (1.08 %) |
6,258,087 (20.50 %) |
22,278 (1.77 %) |
187 | kea GCF_000696875.1 |
15,953 (2.35 %) |
11,985 (1.66 %) |
22,107 (2.01 %) |
n/a | 41.09 (99.60 %) |
51,381 (0.42 %) |
93,561 (99.58 %) |
368,226 (5.60 %) |
138,157 (0.75 %) |
5,905,331 (18.06 %) |
7,218 (0.22 %) |
188 | killdeer GCF_000708025.1 |
16,480 (2.43 %) |
12,356 (1.72 %) |
12,853 (2.15 %) |
n/a | 41.88 (97.24 %) |
63,995 (2.78 %) |
79,162 (97.22 %) |
424,095 (5.93 %) |
167,406 (0.94 %) |
7,070,701 (19.44 %) |
37,082 (1.57 %) |
189 | king vulture (hap1 2024) GCA_037962945.1 |
n/a | 13,641 (1.52 %) |
24,293 (1.78 %) |
n/a | 44.12 (100.00 %) |
154 (0.00 %) |
130 (100.00 %) |
484,661 (3.34 %) |
252,569 (16.01 %) |
5,595,734 (32.51 %) |
77,942 (3.59 %) |
190 | king vulture (hap2 2024) GCA_037950955.1 |
n/a | 12,764 (1.49 %) |
23,033 (1.77 %) |
n/a | 44.67 (100.00 %) |
128 (0.00 %) |
140 (100.00 %) |
432,536 (3.01 %) |
230,315 (20.91 %) |
4,960,923 (35.56 %) |
86,907 (3.76 %) |
191 | lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023) GCA_028017155.1 |
n/a | 10,584 (1.75 %) |
19,112 (2.09 %) |
n/a | 43.19 (100.00 %) |
n/a | 2,892 (100.00 %) |
363,564 (3.53 %) |
235,220 (7.22 %) |
5,072,834 (23.83 %) |
24,909 (2.64 %) |
192 | lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023) GCA_028022735.1 |
n/a | 13,529 (1.69 %) |
23,672 (1.98 %) |
n/a | 43.50 (99.85 %) |
259 (0.15 %) |
232 (100.00 %) |
491,653 (3.53 %) |
349,011 (9.83 %) |
5,955,030 (26.51 %) |
32,237 (2.61 %) |
193 | lance-tailed manakin (2020) GCF_009829145.1 |
46,366 (5.56 %) |
12,594 (1.91 %) |
22,763 (2.31 %) |
26,057 (3.91 %) |
41.97 (99.70 %) |
206 (0.30 %) |
93 (100.00 %) |
485,121 (7.13 %) |
247,189 (1.64 %) |
6,498,294 (20.04 %) |
25,377 (1.97 %) |
194 | lance-tailed manakin (alternate hap 2020) GCA_009829205.1 |
n/a | 12,282 (1.85 %) |
23,867 (2.36 %) |
n/a | 42.20 (100.00 %) |
n/a | 4,269 (100.00 %) |
472,384 (7.01 %) |
237,680 (1.65 %) |
6,121,661 (19.48 %) |
25,589 (2.05 %) |
195 | lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022) GCA_023634305.1 |
n/a | 12,458 (1.70 %) |
22,259 (2.05 %) |
n/a | 43.23 (100.00 %) |
n/a | 3,090 (100.00 %) |
413,301 (3.46 %) |
189,449 (5.28 %) |
5,962,597 (22.07 %) |
31,611 (2.72 %) |
196 | lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq) GCF_023638135.1 |
48,561 (5.70 %) |
12,862 (1.69 %) |
21,562 (1.92 %) |
n/a | 43.03 (99.83 %) |
158 (0.17 %) |
397 (100.00 %) |
439,975 (3.77 %) |
203,640 (6.96 %) |
6,921,438 (23.57 %) |
32,398 (2.65 %) |
197 | lesser black-backed gull (primary hap 2024) GCA_963932225.1 |
n/a | 13,333 (1.68 %) |
24,731 (2.05 %) |
n/a | 44.40 (99.99 %) |
537 (0.01 %) |
1,382 (100.00 %) |
509,160 (5.11 %) |
266,609 (9.64 %) |
6,827,304 (27.15 %) |
44,108 (6.34 %) |
198 | lesser kestrel (alternate hap 2021) GCA_017639645.1 |
n/a | 12,578 (1.83 %) |
22,257 (2.16 %) |
n/a | 42.51 (98.97 %) |
258 (1.03 %) |
551 (100.00 %) |
431,717 (3.61 %) |
201,876 (1.38 %) |
6,620,060 (19.16 %) |
27,552 (2.26 %) |
199 | lesser kestrel (v2 2021) GCF_017639655.2 |
47,420 (5.64 %) |
13,098 (1.80 %) |
22,203 (2.07 %) |
n/a | 42.30 (99.66 %) |
298 (0.34 %) |
291 (100.00 %) |
516,499 (5.58 %) |
210,234 (1.26 %) |
7,133,934 (19.19 %) |
27,558 (2.21 %) |
200 | lesser prairie-chicken (F22 2022) GCF_026119805.1 |
51,352 (6.92 %) |
12,689 (2.35 %) |
22,377 (2.51 %) |
n/a | 41.35 (100.00 %) |
58 (0.00 %) |
206 (100.00 %) |
498,179 (5.36 %) |
218,390 (1.80 %) |
6,038,211 (20.76 %) |
20,648 (2.33 %) |
201 | lesser rhea (206185 2018) GCA_003342835.1 |
n/a | 13,105 (1.81 %) |
25,654 (2.45 %) |
n/a | 40.86 (98.66 %) |
1,039,616 (1.43 %) |
3,019 (100.00 %) |
522,333 (5.61 %) |
208,867 (0.79 %) |
7,080,214 (19.15 %) |
42,016 (4.35 %) |
202 | lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023) GCA_028389885.1 |
n/a | 10,465 (1.71 %) |
19,083 (2.16 %) |
n/a | 42.10 (100.00 %) |
n/a | 910 (100.00 %) |
520,125 (6.78 %) |
251,547 (4.21 %) |
5,321,207 (21.53 %) |
34,698 (5.69 %) |
203 | lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq) GCF_028389875.1 |
39,024 (4.18 %) |
13,360 (1.72 %) |
23,870 (2.13 %) |
n/a | 42.45 (99.89 %) |
128 (0.11 %) |
180 (100.00 %) |
674,149 (6.73 %) |
329,124 (5.34 %) |
6,820,245 (22.78 %) |
45,073 (5.83 %) |
204 | little egret GCF_000687185.1 |
25,843 (3.55 %) |
12,162 (1.73 %) |
10,954 (2.03 %) |
n/a | 42.25 (95.99 %) |
88,871 (4.04 %) |
100,662 (95.96 %) |
490,997 (6.84 %) |
165,380 (1.23 %) |
6,955,585 (18.98 %) |
31,136 (1.15 %) |
205 | long-tailed duck (primary hap 2024) GCA_963989345.1 |
n/a | 13,329 (1.88 %) |
23,888 (2.25 %) |
n/a | 42.30 (99.99 %) |
544 (0.01 %) |
272 (100.00 %) |
784,647 (6.78 %) |
501,860 (7.36 %) |
6,388,957 (26.13 %) |
34,028 (3.04 %) |
206 | long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022) GCA_023637925.1 |
n/a | 12,264 (2.01 %) |
20,528 (2.37 %) |
n/a | 40.99 (100.00 %) |
n/a | 230 (100.00 %) |
498,393 (5.07 %) |
266,700 (1.49 %) |
6,131,743 (20.45 %) |
15,809 (1.43 %) |
207 | long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022) GCA_023637945.1 |
n/a | 12,328 (2.02 %) |
20,312 (2.34 %) |
n/a | 41.00 (99.63 %) |
141 (0.37 %) |
211 (99.63 %) |
497,506 (5.06 %) |
265,815 (1.51 %) |
6,045,702 (20.10 %) |
15,922 (1.43 %) |
208 | Macqueen's bustard (BGI_N324 2014) GCF_000695195.1 |
15,790 (2.21 %) |
11,632 (1.52 %) |
24,790 (1.96 %) |
n/a | 41.10 (99.68 %) |
56,130 (0.33 %) |
115,823 (99.67 %) |
391,856 (4.80 %) |
148,075 (0.90 %) |
6,682,530 (20.03 %) |
27,675 (1.15 %) |
209 | Macqueen's bustard (maternal 2024) GCA_036417535.1 |
n/a | 13,082 (1.73 %) |
27,150 (2.44 %) |
n/a | 43.25 (100.00 %) |
100 (0.00 %) |
329 (100.00 %) |
669,243 (14.71 %) |
211,387 (6.69 %) |
6,514,716 (27.07 %) |
47,331 (8.09 %) |
210 | Macqueen's bustard (paternal 2024) GCA_036418225.1 |
n/a | 11,814 (1.80 %) |
23,161 (2.38 %) |
n/a | 43.09 (100.00 %) |
84 (0.00 %) |
343 (100.00 %) |
586,864 (13.28 %) |
184,036 (5.91 %) |
5,606,205 (25.25 %) |
42,560 (7.71 %) |
211 | maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021) GCA_017639665.1 |
n/a | 10,658 (1.74 %) |
18,941 (1.98 %) |
n/a | 42.26 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
4,278 (100.00 %) |
326,479 (4.02 %) |
141,715 (0.74 %) |
5,600,372 (19.59 %) |
27,330 (3.35 %) |
212 | maguari stork (bCicMag1 primary hap 2021) GCA_017639555.1 |
n/a | 12,905 (1.81 %) |
22,204 (2.01 %) |
n/a | 42.12 (98.21 %) |
232 (1.79 %) |
153 (100.00 %) |
485,318 (6.35 %) |
184,992 (0.78 %) |
7,064,965 (19.56 %) |
31,653 (3.02 %) |
213 | mallard (CAU_Wild1.0 2019) GCA_008746955.1 |
n/a | 13,260 (1.85 %) |
25,071 (2.17 %) |
n/a | 42.41 (99.90 %) |
318 (0.10 %) |
1,665 (100.00 %) |
849,782 (8.18 %) |
438,622 (5.10 %) |
6,729,782 (25.03 %) |
34,670 (3.03 %) |
214 | mallard (hap1 2024) GCA_964188345.1 |
n/a | 13,680 (1.77 %) |
26,845 (2.33 %) |
n/a | 42.87 (99.99 %) |
571 (0.01 %) |
936 (100.00 %) |
941,876 (15.92 %) |
570,703 (9.50 %) |
6,169,980 (28.67 %) |
41,791 (3.18 %) |
215 | mallard (hap2 2024) GCA_964188335.1 |
n/a | 12,715 (1.89 %) |
24,338 (2.42 %) |
n/a | 42.70 (99.99 %) |
485 (0.01 %) |
972 (99.99 %) |
795,168 (13.44 %) |
445,147 (7.71 %) |
5,728,430 (26.21 %) |
35,679 (3.13 %) |
216 | mallard PBH1.5 GCF_003850225.1 |
54,114 (7.47 %) |
12,199 (1.86 %) |
15,363 (2.33 %) |
n/a | 41.63 (99.77 %) |
71,703 (0.26 %) |
2,150 (100.00 %) |
770,322 (8.16 %) |
357,617 (3.09 %) |
6,587,406 (21.92 %) |
29,913 (2.33 %) |
217 | mallard ZJU1.0 GCF_015476345.1 |
59,854 (7.33 %) |
12,988 (1.87 %) |
23,709 (2.20 %) |
86,787 (8.80 %) |
42.27 (99.64 %) |
905 (0.36 %) |
756 (100.00 %) |
803,558 (8.04 %) |
417,575 (5.02 %) |
6,627,843 (24.59 %) |
35,030 (3.06 %) |
218 | Mariana crow GCF_017639235.1 |
48,460 (7.00 %) |
12,506 (1.97 %) |
22,580 (2.35 %) |
n/a | 42.14 (98.94 %) |
10,579 (1.06 %) |
1,443 (100.00 %) |
434,280 (5.91 %) |
169,629 (0.82 %) |
6,323,058 (18.94 %) |
27,390 (2.04 %) |
219 | Mauritius kestrel (alternate hap 2023) GCA_963210275.1 |
n/a | 4,774 (1.89 %) |
8,695 (2.32 %) |
n/a | 43.52 (100.00 %) |
n/a | 2,259 (100.00 %) |
135,092 (3.67 %) |
112,042 (8.63 %) |
1,739,144 (22.50 %) |
12,908 (3.26 %) |
220 | Mauritius kestrel (primary hap 2023) GCA_963210335.1 |
n/a | 13,064 (1.72 %) |
22,269 (1.98 %) |
n/a | 42.67 (99.99 %) |
407 (0.01 %) |
316 (100.00 %) |
459,578 (3.87 %) |
315,686 (6.19 %) |
6,650,507 (22.84 %) |
36,076 (2.82 %) |
221 | Mauritius parakeet (alternate hap 2023) GCA_963243765.1 |
n/a | 8,873 (1.81 %) |
16,175 (2.24 %) |
n/a | 42.92 (100.00 %) |
n/a | 2,130 (100.00 %) |
331,293 (6.89 %) |
161,393 (5.94 %) |
3,516,196 (24.86 %) |
16,659 (1.74 %) |
222 | Mauritius parakeet (primary hap 2023) GCA_963264785.1 |
n/a | 13,133 (1.81 %) |
23,396 (2.19 %) |
n/a | 42.66 (99.99 %) |
358 (0.01 %) |
172 (100.00 %) |
511,156 (7.05 %) |
238,915 (5.05 %) |
5,764,523 (25.19 %) |
24,675 (1.70 %) |
223 | medium ground-finch GCF_000277835.1 |
22,226 (4.24 %) |
11,887 (1.83 %) |
11,438 (2.19 %) |
n/a | 41.61 (97.77 %) |
68,589 (2.25 %) |
95,828 (97.75 %) |
433,244 (5.91 %) |
322,831 (2.24 %) |
6,548,136 (19.49 %) |
18,135 (0.69 %) |
224 | monk parakeet GCA_017639245.1 |
n/a | 13,067 (1.85 %) |
n/a | n/a | 42.29 (99.99 %) |
352 (0.01 %) |
291 (100.00 %) |
582,436 (9.49 %) |
253,709 (2.79 %) |
5,820,920 (22.52 %) |
23,101 (1.75 %) |
225 | Montezuma quail (F1298 2024) GCF_038088225.1 |
28,327 (3.95 %) |
12,793 (2.29 %) |
22,305 (2.47 %) |
n/a | 41.36 (100.00 %) |
234 (0.00 %) |
521 (100.00 %) |
458,084 (6.03 %) |
243,493 (3.14 %) |
5,553,010 (22.13 %) |
22,147 (2.41 %) |
226 | mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021) GCA_009769485.2 |
n/a | 10,145 (1.98 %) |
18,617 (2.30 %) |
n/a | 42.21 (100.00 %) |
14 (0.00 %) |
5,640 (100.00 %) |
533,330 (9.11 %) |
213,518 (1.29 %) |
4,813,886 (20.16 %) |
25,667 (3.86 %) |
227 | mute swan (bCygOlo1 v2 primary hap 2021) GCF_009769625.2 |
59,524 (6.76 %) |
12,983 (1.98 %) |
22,400 (2.22 %) |
33,839 (5.17 %) |
41.92 (99.13 %) |
451 (0.87 %) |
171 (100.00 %) |
700,051 (7.55 %) |
301,579 (1.34 %) |
6,791,838 (21.30 %) |
31,278 (3.07 %) |
228 | Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023) GCA_027579665.1 |
n/a | 11,687 (1.78 %) |
24,169 (2.43 %) |
n/a | 43.32 (100.00 %) |
n/a | 2,834 (100.00 %) |
414,780 (3.26 %) |
491,012 (10.03 %) |
5,570,475 (26.24 %) |
29,485 (4.55 %) |
229 | Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq) GCF_027579445.1 |
31,033 (4.42 %) |
12,385 (1.72 %) |
24,339 (2.24 %) |
n/a | 43.01 (99.57 %) |
215 (0.43 %) |
77 (100.00 %) |
479,994 (3.33 %) |
443,098 (9.18 %) |
6,350,593 (25.82 %) |
31,693 (3.88 %) |
230 | New Caledonian crow (2019) GCF_009650955.1 |
50,821 (6.95 %) |
12,747 (1.94 %) |
23,372 (2.37 %) |
30,299 (3.60 %) |
42.57 (97.41 %) |
289 (2.59 %) |
105 (100.00 %) |
452,690 (6.21 %) |
231,546 (1.70 %) |
6,265,995 (19.54 %) |
31,909 (2.48 %) |
231 | New Caledonian crow (alternate hap 2019) GCA_009651025.1 |
n/a | 11,097 (1.99 %) |
20,436 (2.45 %) |
n/a | 42.67 (100.00 %) |
n/a | 894 (100.00 %) |
377,050 (6.03 %) |
178,064 (1.53 %) |
5,305,126 (19.49 %) |
26,107 (2.52 %) |
232 | Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank) GCA_036013445.1 |
n/a | 13,359 (1.72 %) |
24,921 (2.13 %) |
n/a | 44.64 (100.00 %) |
117 (0.00 %) |
807 (100.00 %) |
705,078 (18.28 %) |
342,299 (9.55 %) |
6,410,095 (28.06 %) |
38,589 (9.40 %) |
233 | Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq) GCF_036013445.1 |
34,506 (4.09 %) |
13,358 (1.72 %) |
24,851 (2.13 %) |
n/a | 44.64 (100.00 %) |
117 (0.00 %) |
806 (100.00 %) |
705,074 (18.28 %) |
342,297 (9.55 %) |
6,410,054 (28.06 %) |
38,589 (9.40 %) |
234 | Nicobar pigeon (hap2 2024) GCA_036010745.1 |
n/a | 13,270 (1.84 %) |
24,753 (2.28 %) |
n/a | 42.94 (100.00 %) |
118 (0.00 %) |
226 (100.00 %) |
675,092 (12.72 %) |
313,111 (3.64 %) |
6,547,843 (23.22 %) |
37,728 (3.88 %) |
235 | night parrot (Australia 2023) GCF_034315485.1 |
48,921 (5.26 %) |
12,986 (1.89 %) |
22,892 (2.24 %) |
n/a | 42.22 (100.00 %) |
3 (0.00 %) |
3,593 (100.00 %) |
487,881 (6.13 %) |
259,865 (3.37 %) |
5,961,641 (22.88 %) |
24,673 (1.77 %) |
236 | North Island brown kiwi (bAptMan1hap1 2024) GCF_036417845.1 |
39,806 (3.75 %) |
13,668 (1.52 %) |
25,226 (1.90 %) |
n/a | 44.01 (100.00 %) |
170 (0.00 %) |
408 (100.00 %) |
713,264 (8.42 %) |
603,930 (6.25 %) |
5,379,069 (27.65 %) |
50,913 (9.74 %) |
237 | North Island brown kiwi (hap1 2024) GCA_036417845.1 |
n/a | 13,670 (1.52 %) |
33,383 (2.64 %) |
n/a | 44.01 (100.00 %) |
170 (0.00 %) |
409 (100.00 %) |
713,271 (8.42 %) |
603,937 (6.25 %) |
5,379,113 (27.65 %) |
50,913 (9.74 %) |
238 | North Island brown kiwi (hap2 2024) GCA_036417975.1 |
n/a | 13,664 (1.44 %) |
37,696 (2.80 %) |
n/a | 44.42 (100.00 %) |
155 (0.00 %) |
349 (100.00 %) |
760,455 (8.84 %) |
626,528 (6.85 %) |
5,029,822 (30.45 %) |
54,278 (9.43 %) |
239 | northern bobwhite GCA_008692595.2 |
n/a | 12,584 (2.37 %) |
22,327 (2.53 %) |
n/a | 41.41 (99.04 %) |
33,134 (0.97 %) |
39,169 (99.03 %) |
460,369 (4.63 %) |
213,800 (1.34 %) |
5,813,961 (19.54 %) |
22,156 (2.37 %) |
240 | northern fulmar GCF_000690835.1 |
16,383 (2.20 %) |
11,965 (1.51 %) |
24,294 (1.87 %) |
n/a | 41.17 (99.50 %) |
54,825 (0.51 %) |
112,214 (99.49 %) |
330,541 (3.74 %) |
146,735 (0.83 %) |
6,838,937 (18.42 %) |
24,859 (0.79 %) |
241 | northern gannet (hap1 2023) GCA_031468805.1 |
n/a | 13,367 (1.65 %) |
24,403 (2.00 %) |
n/a | 42.94 (100.00 %) |
263 (0.00 %) |
829 (100.00 %) |
498,574 (4.51 %) |
273,984 (5.20 %) |
5,544,122 (27.29 %) |
34,879 (3.83 %) |
242 | northern gannet (hap2 2023) GCA_031468815.1 |
n/a | 13,477 (1.77 %) |
23,613 (2.08 %) |
n/a | 42.44 (100.00 %) |
248 (0.00 %) |
427 (100.00 %) |
474,930 (4.45 %) |
237,604 (2.75 %) |
5,847,260 (21.07 %) |
30,873 (3.03 %) |
243 | northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq) GCF_929443795.1 |
50,663 (4.74 %) |
13,528 (1.65 %) |
24,595 (1.99 %) |
n/a | 43.78 (100.00 %) |
183 (0.00 %) |
454 (100.00 %) |
521,768 (3.86 %) |
325,987 (9.82 %) |
5,542,269 (27.30 %) |
43,070 (4.44 %) |
244 | northern goshawk (bAccGen1 primary hap v2 2022 genbank) GCA_929443795.2 |
n/a | 13,527 (1.65 %) |
24,595 (1.99 %) |
n/a | 43.78 (100.00 %) |
183 (0.00 %) |
455 (100.00 %) |
511,000 (3.76 %) |
325,992 (9.82 %) |
5,542,342 (27.30 %) |
43,070 (4.44 %) |
245 | northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022) GCA_929447715.1 |
n/a | 12,115 (1.73 %) |
22,764 (2.15 %) |
n/a | 43.51 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
4,484 (100.00 %) |
417,395 (3.68 %) |
231,908 (7.24 %) |
5,424,533 (24.05 %) |
35,691 (4.26 %) |
246 | northern pintail (primary hap 2024) GCA_963932015.1 |
n/a | 13,218 (1.88 %) |
23,888 (2.27 %) |
n/a | 42.56 (99.99 %) |
631 (0.01 %) |
395 (100.00 %) |
734,763 (5.74 %) |
422,947 (7.08 %) |
6,491,165 (25.88 %) |
34,601 (2.98 %) |
247 | northern pintail (primary hap 2024) GCF_963932015.1 |
61,479 (7.27 %) |
13,217 (1.88 %) |
23,886 (2.27 %) |
n/a | 42.56 (99.99 %) |
631 (0.01 %) |
394 (100.00 %) |
734,760 (5.74 %) |
422,946 (7.08 %) |
6,491,116 (25.88 %) |
34,601 (2.98 %) |
248 | Obi paradise-crow (lycPyr6 2020) GCA_014706295.1 |
n/a | 12,592 (1.89 %) |
24,002 (2.35 %) |
n/a | 42.94 (99.48 %) |
1,602 (0.52 %) |
1,695 (100.00 %) |
466,546 (6.40 %) |
235,283 (1.98 %) |
6,371,421 (20.17 %) |
34,247 (3.02 %) |
249 | Okarito brown kiwi GCF_003343035.1 |
43,838 (4.59 %) |
13,232 (1.76 %) |
18,641 (2.35 %) |
n/a | 41.52 (98.49 %) |
696,987 (1.57 %) |
4,120 (100.00 %) |
482,272 (4.98 %) |
178,540 (0.70 %) |
7,407,982 (18.33 %) |
43,081 (4.88 %) |
250 | Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020) GCA_010365825.1 |
n/a | 12,953 (1.76 %) |
25,275 (2.07 %) |
24,636 (2.89 %) |
41.70 (98.42 %) |
42,691 (1.58 %) |
151,517 (98.42 %) |
494,677 (6.28 %) |
222,654 (1.07 %) |
7,211,171 (19.25 %) |
41,048 (2.24 %) |
251 | peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022) GCA_023634185.1 |
n/a | 12,529 (1.75 %) |
24,654 (2.25 %) |
n/a | 42.72 (100.00 %) |
n/a | 2,745 (100.00 %) |
517,204 (7.95 %) |
218,606 (4.15 %) |
6,216,533 (21.16 %) |
26,313 (2.41 %) |
252 | peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq) GCF_023634155.1 |
49,100 (5.64 %) |
13,021 (1.66 %) |
21,794 (1.95 %) |
n/a | 42.65 (99.69 %) |
241 (0.31 %) |
125 (100.00 %) |
586,320 (11.83 %) |
335,218 (8.05 %) |
7,038,851 (24.65 %) |
26,085 (2.25 %) |
253 | peregrine falcon (BGI 2013) GCF_000337955.1 |
37,506 (5.42 %) |
12,670 (1.80 %) |
11,311 (2.11 %) |
n/a | 41.77 (98.44 %) |
76,069 (1.58 %) |
83,081 (98.42 %) |
437,234 (5.32 %) |
170,160 (0.93 %) |
7,157,857 (18.38 %) |
22,325 (0.89 %) |
254 | pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022) GCF_024509145.1 |
41,770 (4.95 %) |
12,712 (1.86 %) |
24,157 (2.37 %) |
n/a | 42.69 (100.00 %) |
338 (0.00 %) |
484 (100.00 %) |
641,523 (14.11 %) |
414,142 (6.03 %) |
6,230,412 (23.70 %) |
49,402 (3.94 %) |
255 | pink pigeon (alternate hap 2023) GCA_963082445.1 |
n/a | 10,425 (1.96 %) |
20,219 (2.49 %) |
n/a | 42.52 (100.00 %) |
n/a | 1,277 (100.00 %) |
344,711 (4.99 %) |
225,902 (3.41 %) |
4,563,425 (21.61 %) |
28,391 (3.74 %) |
256 | pink pigeon (primary hap 2023) GCA_963082525.1 |
n/a | 13,140 (1.85 %) |
25,111 (2.31 %) |
n/a | 42.27 (99.99 %) |
509 (0.01 %) |
143 (100.00 %) |
488,313 (5.48 %) |
331,962 (3.50 %) |
6,243,204 (22.87 %) |
36,343 (3.63 %) |
257 | pink-footed goose (primary hap 2024) GCA_964034855.1 |
n/a | 13,275 (1.76 %) |
24,103 (2.11 %) |
n/a | 43.68 (99.98 %) |
1,137 (0.02 %) |
715 (100.00 %) |
792,215 (9.76 %) |
471,286 (10.34 %) |
6,448,623 (29.48 %) |
49,485 (4.41 %) |
258 | plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021) GCA_020745805.1 |
n/a | 11,774 (1.90 %) |
20,857 (2.20 %) |
n/a | 42.59 (100.00 %) |
4 (0.00 %) |
749 (100.00 %) |
356,053 (4.37 %) |
157,695 (0.93 %) |
5,995,637 (19.60 %) |
30,478 (4.03 %) |
259 | plumbeous ibis (bTheCae1 primary hap 2021) GCA_020745775.1 |
n/a | 13,028 (1.84 %) |
22,722 (2.10 %) |
n/a | 42.37 (99.81 %) |
104 (0.19 %) |
88 (100.00 %) |
488,030 (6.66 %) |
188,606 (1.01 %) |
6,982,793 (20.08 %) |
32,920 (3.37 %) |
260 | Puerto Rican parrot (LU 182127 2020) GCA_000332375.2 |
n/a | 12,000 (1.69 %) |
22,393 (2.01 %) |
n/a | 41.66 (74.61 %) |
137,572 (25.41 %) |
200,284 (74.59 %) |
536,198 (8.55 %) |
200,698 (0.96 %) |
5,147,882 (14.30 %) |
14,572 (0.41 %) |
261 | razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019) GCA_008658365.1 |
n/a | 12,787 (1.83 %) |
22,839 (2.13 %) |
n/a | 42.67 (99.70 %) |
227 (0.30 %) |
95 (100.00 %) |
543,517 (7.16 %) |
212,546 (1.12 %) |
6,930,708 (20.10 %) |
38,960 (3.02 %) |
262 | razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019) GCA_008658355.1 |
n/a | 12,937 (1.75 %) |
24,253 (2.09 %) |
n/a | 42.61 (100.00 %) |
n/a | 3,309 (100.00 %) |
562,549 (7.14 %) |
210,852 (1.04 %) |
7,264,995 (20.26 %) |
40,926 (2.91 %) |
263 | red-backed fairy wren (Western Australia 2023) GCF_030028575.1 |
29,027 (5.08 %) |
12,371 (2.00 %) |
24,297 (2.42 %) |
n/a | 41.70 (96.94 %) |
3,337,637 (3.40 %) |
10,634 (100.00 %) |
349,349 (2.76 %) |
398,866 (2.71 %) |
6,299,092 (18.40 %) |
27,078 (2.11 %) |
264 | red-billed tropicbird (maternal hap 2024) GCA_964289735.1 |
n/a | 13,231 (1.68 %) |
24,060 (2.00 %) |
n/a | 43.15 (99.98 %) |
1,269 (0.02 %) |
660 (100.00 %) |
440,963 (5.78 %) |
187,847 (3.22 %) |
6,601,610 (24.99 %) |
54,002 (5.24 %) |
265 | red-billed tropicbird (paternal hap 2024) GCA_964289755.1 |
n/a | 11,989 (1.71 %) |
21,527 (2.03 %) |
n/a | 43.19 (99.98 %) |
1,072 (0.02 %) |
1,572 (99.98 %) |
383,852 (5.39 %) |
164,123 (3.45 %) |
5,859,520 (24.45 %) |
48,825 (5.37 %) |
266 | red-crested pochard (primary hap 2024) GCA_964035555.1 |
n/a | 13,234 (1.92 %) |
23,753 (2.26 %) |
n/a | 42.08 (99.99 %) |
714 (0.01 %) |
141 (100.00 %) |
772,537 (6.34 %) |
437,831 (4.05 %) |
6,488,340 (24.52 %) |
31,577 (2.49 %) |
267 | red-crested turaco (2019) GCA_009769465.1 |
n/a | 12,744 (1.75 %) |
25,706 (2.29 %) |
n/a | 42.60 (97.89 %) |
344 (2.11 %) |
140 (100.00 %) |
551,885 (8.95 %) |
176,530 (0.80 %) |
6,805,042 (22.19 %) |
43,051 (3.40 %) |
268 | red-crested turaco (alternate hap 2019) GCA_009764505.1 |
n/a | 11,247 (1.70 %) |
23,705 (2.27 %) |
n/a | 42.64 (100.00 %) |
n/a | 3,476 (100.00 %) |
482,817 (8.51 %) |
153,169 (0.81 %) |
5,919,109 (21.87 %) |
39,766 (3.41 %) |
269 | red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020) GCA_015220175.1 |
n/a | 11,434 (1.65 %) |
21,710 (2.11 %) |
n/a | 46.12 (100.00 %) |
12 (0.00 %) |
2,748 (100.00 %) |
859,899 (15.52 %) |
319,622 (3.85 %) |
5,367,970 (34.63 %) |
23,381 (1.81 %) |
270 | red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020) GCA_015220805.1 |
n/a | 12,345 (1.60 %) |
23,206 (2.02 %) |
n/a | 45.96 (99.53 %) |
307 (0.47 %) |
253 (100.00 %) |
1,082,064 (22.90 %) |
378,866 (4.28 %) |
6,003,548 (35.88 %) |
26,519 (1.76 %) |
271 | Red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020) GCF_015220805.1 |
44,843 (4.51 %) |
12,341 (1.60 %) |
23,205 (2.02 %) |
n/a | 45.96 (99.53 %) |
307 (0.47 %) |
252 (100.00 %) |
981,758 (15.82 %) |
378,855 (4.28 %) |
6,003,474 (35.88 %) |
26,519 (1.76 %) |
272 | red-legged partridge GCA_019345075.1 |
n/a | 12,441 (2.23 %) |
20,933 (2.29 %) |
n/a | 41.44 (96.96 %) |
18,534 (3.05 %) |
29,132 (96.95 %) |
543,702 (6.02 %) |
222,583 (0.97 %) |
5,978,744 (20.17 %) |
19,970 (0.97 %) |
273 | red-legged seriema (2019) GCA_009819825.1 |
n/a | 13,229 (1.84 %) |
25,580 (2.35 %) |
n/a | 42.20 (99.59 %) |
194 (0.41 %) |
110 (100.00 %) |
483,784 (6.50 %) |
160,481 (0.73 %) |
6,960,060 (19.71 %) |
32,899 (2.77 %) |
274 | red-legged seriema (alternate hap 2019) GCA_009819485.1 |
n/a | 10,131 (1.78 %) |
19,775 (2.21 %) |
n/a | 42.28 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,840 (100.00 %) |
366,591 (6.01 %) |
117,928 (0.90 %) |
5,340,048 (18.90 %) |
26,293 (2.86 %) |
275 | red-throated loon (BGI_N328 2014) GCF_000690875.1 |
15,829 (2.14 %) |
11,589 (1.46 %) |
22,840 (1.76 %) |
n/a | 41.12 (99.40 %) |
64,882 (0.61 %) |
126,713 (99.39 %) |
293,224 (3.50 %) |
123,593 (0.80 %) |
6,849,573 (18.22 %) |
17,100 (0.51 %) |
276 | red-throated loon (hap1 2023) GCA_030936125.1 |
n/a | 13,357 (1.64 %) |
29,603 (2.35 %) |
n/a | 43.54 (100.00 %) |
260 (0.00 %) |
3,225 (100.00 %) |
549,694 (8.44 %) |
246,171 (10.46 %) |
5,258,356 (27.36 %) |
39,810 (3.37 %) |
277 | red-throated loon (hap2 2023 refseq) GCF_030936135.1 |
25,173 (3.02 %) |
13,216 (1.71 %) |
24,050 (2.10 %) |
n/a | 43.11 (100.00 %) |
249 (0.00 %) |
1,185 (100.00 %) |
544,422 (8.81 %) |
223,672 (5.77 %) |
6,669,433 (23.63 %) |
38,305 (3.37 %) |
278 | red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023) GCF_020745825.1 |
29,994 (3.93 %) |
12,687 (1.75 %) |
25,287 (2.30 %) |
n/a | 43.15 (100.00 %) |
106 (0.00 %) |
516 (100.00 %) |
785,960 (17.62 %) |
522,256 (9.27 %) |
6,371,580 (25.40 %) |
32,643 (2.66 %) |
279 | rhinoceros hornbill GCF_000710305.1 |
15,595 (2.24 %) |
11,495 (1.55 %) |
25,766 (1.88 %) |
n/a | 42.65 (98.44 %) |
118,543 (1.60 %) |
180,800 (98.40 %) |
271,331 (3.93 %) |
134,645 (1.25 %) |
6,383,631 (17.75 %) |
24,531 (0.79 %) |
280 | rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021) GCA_016880875.1 |
n/a | 9,867 (1.89 %) |
19,635 (2.52 %) |
n/a | 42.54 (100.00 %) |
20 (0.00 %) |
2,879 (100.00 %) |
394,769 (10.00 %) |
186,556 (1.91 %) |
4,428,687 (19.09 %) |
15,730 (1.88 %) |
281 | rifleman (bAcaChl1 primary hap 2021) GCA_016904835.1 |
n/a | 12,620 (1.92 %) |
24,568 (2.61 %) |
n/a | 42.41 (99.61 %) |
195 (0.39 %) |
206 (100.00 %) |
495,673 (9.14 %) |
253,008 (2.04 %) |
5,936,177 (19.93 %) |
20,145 (1.83 %) |
282 | ring-necked pheasant GCF_004143745.1 |
33,221 (6.38 %) |
13,027 (2.35 %) |
19,960 (2.74 %) |
n/a | 41.21 (99.22 %) |
19,995 (0.78 %) |
39,678 (100.00 %) |
586,827 (8.20 %) |
291,437 (1.68 %) |
6,237,616 (20.77 %) |
22,365 (2.11 %) |
283 | rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI) GCF_000337935.1 |
52,369 (6.40 %) |
12,577 (1.87 %) |
14,272 (2.42 %) |
n/a | 41.48 (98.13 %) |
85,176 (1.90 %) |
100,099 (98.10 %) |
480,221 (6.94 %) |
268,561 (1.86 %) |
6,408,260 (19.42 %) |
29,801 (1.43 %) |
284 | rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024) GCA_036010775.2 |
n/a | 12,450 (1.75 %) |
23,660 (2.21 %) |
n/a | 42.27 (100.00 %) |
192 (0.00 %) |
673 (100.00 %) |
586,422 (10.85 %) |
392,341 (12.38 %) |
5,521,172 (28.56 %) |
33,479 (3.29 %) |
285 | rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024) GCA_036013475.2 |
n/a | 13,146 (1.66 %) |
25,463 (2.12 %) |
n/a | 42.00 (100.00 %) |
249 (0.00 %) |
870 (100.00 %) |
656,969 (11.76 %) |
412,670 (12.92 %) |
6,047,584 (29.90 %) |
36,847 (3.12 %) |
286 | rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024) GCF_036013475.1 |
70,874 (7.24 %) |
13,145 (1.66 %) |
25,462 (2.12 %) |
n/a | 42.00 (100.00 %) |
249 (0.00 %) |
869 (100.00 %) |
656,963 (11.76 %) |
412,665 (12.92 %) |
6,047,535 (29.90 %) |
36,847 (3.12 %) |
287 | rock pigeon (racing homer maternal 2024) GCA_036010775.1 |
n/a | 12,450 (1.75 %) |
25,274 (2.35 %) |
n/a | 42.27 (100.00 %) |
192 (0.00 %) |
673 (100.00 %) |
586,422 (10.85 %) |
392,341 (12.38 %) |
5,521,172 (28.56 %) |
33,479 (3.29 %) |
288 | rock pigeon (racing homer paternal W 2024) GCA_036013475.1 |
n/a | 13,145 (1.66 %) |
28,883 (2.53 %) |
n/a | 42.00 (100.00 %) |
248 (0.00 %) |
870 (100.00 %) |
656,923 (11.76 %) |
412,678 (12.92 %) |
6,047,578 (29.90 %) |
36,847 (3.12 %) |
289 | rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022) GCA_023344045.1 |
n/a | 12,090 (2.36 %) |
21,910 (2.57 %) |
n/a | 41.56 (100.00 %) |
13 (0.00 %) |
3,212 (100.00 %) |
585,577 (10.45 %) |
202,342 (1.61 %) |
5,390,780 (20.38 %) |
19,210 (2.23 %) |
290 | rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq) GCF_023343835.1 |
51,619 (7.29 %) |
12,832 (2.31 %) |
23,047 (2.56 %) |
n/a | 41.57 (99.99 %) |
210 (0.01 %) |
165 (100.00 %) |
526,839 (5.87 %) |
268,431 (2.63 %) |
5,885,345 (21.73 %) |
21,346 (2.37 %) |
291 | ruddy duck GCF_011077185.1 |
50,326 (5.76 %) |
13,124 (1.98 %) |
23,592 (2.23 %) |
n/a | 41.82 (97.27 %) |
18,437 (2.73 %) |
28,026 (97.27 %) |
808,998 (7.97 %) |
389,509 (1.34 %) |
6,722,581 (21.16 %) |
34,567 (3.30 %) |
292 | ruff GCF_001431845.1 |
34,257 (4.61 %) |
12,979 (1.79 %) |
15,969 (2.42 %) |
n/a | 42.45 (96.26 %) |
30,404 (3.75 %) |
34,157 (96.25 %) |
308,688 (1.08 %) |
337,661 (3.70 %) |
7,220,063 (20.45 %) |
27,939 (1.42 %) |
293 | rufous-necked snowfinch GCF_017590135.1 |
35,381 (4.92 %) |
12,603 (1.95 %) |
24,965 (2.42 %) |
n/a | 42.00 (99.80 %) |
5,524 (0.20 %) |
24,055 (100.00 %) |
514,274 (6.32 %) |
411,146 (2.77 %) |
6,584,761 (19.85 %) |
29,372 (2.28 %) |
294 | rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022) GCF_022539395.1 |
40,473 (5.86 %) |
12,903 (1.96 %) |
23,477 (2.35 %) |
n/a | 42.26 (99.87 %) |
181 (0.13 %) |
1,692 (100.00 %) |
439,625 (4.09 %) |
338,042 (2.23 %) |
6,366,832 (20.27 %) |
28,572 (2.11 %) |
295 | saffron-crested tyrant-manakin GCF_003984885.1 |
45,898 (5.06 %) |
12,908 (1.86 %) |
21,103 (2.48 %) |
n/a | 42.28 (99.01 %) |
15,342 (0.99 %) |
38,089 (100.00 %) |
496,308 (7.14 %) |
333,391 (1.97 %) |
6,646,625 (20.87 %) |
32,671 (2.19 %) |
296 | sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022) GCA_021966175.1 |
n/a | 16,893 (1.07 %) |
43,426 (1.70 %) |
n/a | 44.67 (100.00 %) |
12 (0.00 %) |
43,047 (100.00 %) |
1,180,596 (3.55 %) |
1,932,696 (16.57 %) |
6,340,063 (43.85 %) |
66,996 (3.45 %) |
297 | sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022) GCA_021963965.1 |
n/a | 12,804 (1.50 %) |
25,425 (1.97 %) |
n/a | 43.46 (100.00 %) |
200 (0.00 %) |
1,339 (100.00 %) |
699,755 (3.36 %) |
1,030,540 (15.69 %) |
5,226,748 (36.13 %) |
36,539 (2.71 %) |
298 | Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022) GCA_023634115.1 |
n/a | 12,258 (1.66 %) |
25,579 (2.30 %) |
n/a | 43.39 (100.00 %) |
2 (0.00 %) |
4,162 (100.00 %) |
506,343 (6.77 %) |
182,589 (7.22 %) |
5,435,776 (23.60 %) |
29,420 (2.47 %) |
299 | Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq) GCF_023634085.1 |
50,290 (5.75 %) |
12,973 (1.67 %) |
21,670 (1.90 %) |
n/a | 43.15 (99.70 %) |
258 (0.30 %) |
283 (100.00 %) |
548,090 (7.21 %) |
201,488 (8.55 %) |
7,030,877 (24.94 %) |
31,791 (2.57 %) |
300 | Saker falcon (BGI 2013) GCF_000337975.1 |
36,497 (5.34 %) |
12,572 (1.79 %) |
10,629 (2.08 %) |
27,857 (3.09 %) |
41.71 (98.00 %) |
70,035 (2.03 %) |
75,898 (97.97 %) |
433,484 (5.29 %) |
166,251 (1.03 %) |
7,121,848 (18.23 %) |
19,927 (0.72 %) |
301 | saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023) GCA_027887135.1 |
n/a | 12,826 (1.74 %) |
26,019 (2.35 %) |
n/a | 43.09 (100.00 %) |
n/a | 3,054 (100.00 %) |
482,850 (3.37 %) |
523,437 (10.15 %) |
6,386,315 (26.20 %) |
32,734 (4.25 %) |
302 | saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887145.1 |
27,528 (4.03 %) |
12,832 (1.69 %) |
25,514 (2.23 %) |
n/a | 43.50 (99.76 %) |
363 (0.24 %) |
282 (100.00 %) |
541,958 (3.43 %) |
566,692 (13.38 %) |
6,205,274 (28.98 %) |
35,549 (5.05 %) |
303 | Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022) GCA_022578375.1 |
n/a | 16,954 (1.37 %) |
46,692 (2.27 %) |
n/a | 43.66 (99.99 %) |
1,822 (0.01 %) |
31,565 (99.99 %) |
680,766 (3.36 %) |
930,904 (8.76 %) |
7,502,726 (27.96 %) |
56,390 (5.99 %) |
304 | Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022) GCA_022577445.1 |
n/a | 12,665 (1.79 %) |
25,654 (2.40 %) |
n/a | 43.10 (100.00 %) |
339 (0.00 %) |
337 (100.00 %) |
428,675 (3.22 %) |
588,040 (7.38 %) |
6,466,447 (24.39 %) |
33,599 (4.75 %) |
305 | Savannah sparrow (primary hap 2023) GCA_031885435.1 |
n/a | 12,986 (1.66 %) |
27,028 (2.29 %) |
n/a | 43.66 (99.78 %) |
249 (0.22 %) |
110 (100.00 %) |
464,600 (3.28 %) |
681,402 (9.28 %) |
6,314,744 (26.92 %) |
39,406 (5.26 %) |
306 | seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024) GCA_036010785.1 |
n/a | 12,858 (1.52 %) |
25,777 (2.02 %) |
n/a | 44.04 (99.85 %) |
365 (0.15 %) |
501 (100.00 %) |
580,376 (4.24 %) |
636,266 (12.18 %) |
4,804,433 (34.52 %) |
48,871 (4.18 %) |
307 | small tree finch (2019) GCF_901933205.1 |
30,090 (4.91 %) |
12,645 (1.95 %) |
17,146 (2.49 %) |
n/a | 42.38 (99.99 %) |
185 (0.01 %) |
1,527 (99.99 %) |
457,266 (6.02 %) |
477,426 (4.49 %) |
6,482,932 (22.03 %) |
27,271 (2.40 %) |
308 | small tree finch (2020) GCA_902806625.1 |
n/a | 12,662 (1.93 %) |
23,695 (2.34 %) |
25,763 (3.61 %) |
42.49 (99.99 %) |
224 (0.01 %) |
1,951 (99.99 %) |
458,154 (6.01 %) |
482,974 (4.97 %) |
6,466,067 (22.21 %) |
27,890 (2.42 %) |
309 | song sparrow (bMelMel2 primary hap 2024) GCF_035770615.1 |
41,069 (3.95 %) |
12,946 (1.39 %) |
26,698 (1.87 %) |
n/a | 44.96 (99.93 %) |
299 (0.07 %) |
353 (100.00 %) |
515,851 (3.07 %) |
681,436 (15.73 %) |
5,004,851 (39.23 %) |
47,268 (3.90 %) |
310 | song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022) GCA_022749775.1 |
n/a | 15,672 (1.16 %) |
40,690 (1.82 %) |
n/a | 45.19 (100.00 %) |
5 (0.00 %) |
34,693 (100.00 %) |
1,068,703 (34.46 %) |
796,004 (19.02 %) |
6,315,990 (40.22 %) |
57,647 (3.95 %) |
311 | song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022) GCA_022749695.1 |
n/a | 12,580 (1.53 %) |
24,737 (2.00 %) |
n/a | 44.45 (100.00 %) |
323 (0.00 %) |
501 (100.00 %) |
697,818 (28.44 %) |
510,301 (17.90 %) |
5,319,400 (34.64 %) |
36,632 (3.59 %) |
312 | song sparrow (primary hap 2024) GCA_035770615.1 |
n/a | 12,940 (1.39 %) |
26,698 (1.87 %) |
n/a | 44.96 (99.93 %) |
299 (0.07 %) |
354 (100.00 %) |
515,857 (3.07 %) |
681,436 (15.73 %) |
5,004,880 (39.23 %) |
47,269 (3.90 %) |
313 | South Island takahe (alternate 2021) GCA_020801775.1 |
n/a | 12,655 (1.70 %) |
n/a | n/a | 43.63 (99.16 %) |
238 (0.84 %) |
178 (100.00 %) |
554,912 (9.42 %) |
230,808 (4.34 %) |
6,406,358 (24.83 %) |
22,941 (1.98 %) |
314 | South Island takahe (primary 2021) GCA_020800305.1 |
n/a | 12,942 (1.69 %) |
23,221 (2.13 %) |
n/a | 43.74 (99.58 %) |
327 (0.42 %) |
174 (100.00 %) |
577,553 (9.77 %) |
259,017 (5.20 %) |
6,430,968 (25.90 %) |
23,810 (2.02 %) |
315 | speckled mousebird (bColStr4 hap1 2023) GCF_028858725.1 |
37,067 (4.23 %) |
12,815 (1.76 %) |
23,175 (2.17 %) |
n/a | 42.29 (99.52 %) |
161 (0.48 %) |
191 (100.00 %) |
572,944 (12.88 %) |
256,368 (3.55 %) |
5,868,966 (23.42 %) |
27,158 (2.30 %) |
316 | speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023) GCA_028858625.2 |
n/a | 12,332 (1.76 %) |
22,895 (2.24 %) |
n/a | 42.74 (99.53 %) |
136 (0.47 %) |
242 (100.00 %) |
521,023 (11.26 %) |
304,406 (7.39 %) |
5,319,571 (25.46 %) |
27,299 (2.35 %) |
317 | speckled mousebird (BGI_N325 2014) GCF_000690715.1 |
15,894 (2.09 %) |
11,566 (1.44 %) |
25,387 (1.84 %) |
n/a | 40.95 (99.65 %) |
44,462 (0.35 %) |
114,650 (99.65 %) |
345,458 (6.87 %) |
154,693 (1.27 %) |
6,152,475 (19.42 %) |
7,821 (0.23 %) |
318 | speckled mousebird (hap1 2023) GCA_028858725.1 |
n/a | 11,956 (1.78 %) |
25,177 (2.60 %) |
n/a | 42.38 (99.48 %) |
143 (0.52 %) |
189 (100.00 %) |
523,056 (12.47 %) |
243,547 (3.72 %) |
5,408,003 (23.43 %) |
25,552 (2.34 %) |
319 | speckled mousebird (hap2 2023) GCA_028858625.1 |
n/a | 13,169 (1.74 %) |
26,896 (2.47 %) |
n/a | 42.62 (99.56 %) |
151 (0.44 %) |
243 (100.00 %) |
570,907 (11.75 %) |
317,226 (6.96 %) |
5,854,600 (25.51 %) |
28,905 (2.31 %) |
320 | steelblue widowfinch (merged hap OUT-0048 2022) GCA_026979565.1 |
n/a | 12,819 (1.94 %) |
24,247 (2.44 %) |
n/a | 42.23 (99.98 %) |
458 (0.02 %) |
178 (100.00 %) |
616,749 (11.96 %) |
411,917 (3.56 %) |
6,385,102 (20.91 %) |
37,940 (2.83 %) |
321 | steelblue widowfinch (purged dups hap OUT-0048 2022) GCA_026979555.1 |
n/a | 2,176 (1.79 %) |
7,719 (4.37 %) |
n/a | 49.74 (100.00 %) |
n/a | 1,939 (100.00 %) |
136,312 (29.31 %) |
157,341 (15.03 %) |
648,725 (34.67 %) |
15,490 (8.23 %) |
322 | Steller's jay (frontalis alternate hap 2022) GCA_026168045.1 |
n/a | 12,217 (1.73 %) |
25,261 (2.32 %) |
n/a | 44.10 (100.00 %) |
200 (0.00 %) |
957 (100.00 %) |
423,239 (3.30 %) |
362,061 (4.83 %) |
4,954,262 (27.09 %) |
42,188 (4.05 %) |
323 | Steller's jay (frontalis primary hap 2022) GCA_026167965.1 |
n/a | 12,789 (1.82 %) |
24,509 (2.35 %) |
n/a | 43.18 (100.00 %) |
223 (0.00 %) |
352 (100.00 %) |
413,598 (3.28 %) |
318,919 (3.99 %) |
5,977,564 (23.65 %) |
33,675 (3.21 %) |
324 | sun parakeet (2019) GCA_902168055.1 |
n/a | 12,871 (1.88 %) |
22,508 (2.20 %) |
n/a | 42.01 (96.97 %) |
578,921 (3.08 %) |
1,570 (100.00 %) |
554,367 (10.05 %) |
180,644 (0.89 %) |
6,158,602 (21.14 %) |
21,695 (1.62 %) |
325 | sunbittern GCF_000690775.1 |
15,772 (2.11 %) |
11,564 (1.45 %) |
25,522 (1.98 %) |
n/a | 42.33 (99.55 %) |
52,471 (0.46 %) |
115,170 (99.54 %) |
346,556 (5.38 %) |
117,881 (0.88 %) |
6,391,987 (18.82 %) |
32,970 (1.31 %) |
326 | Suruca trogon (bRtoSur1 primary hap 2021) GCA_020746105.1 |
n/a | 12,884 (1.85 %) |
23,805 (2.23 %) |
n/a | 42.80 (99.12 %) |
253 (0.88 %) |
182 (100.00 %) |
539,771 (9.26 %) |
181,564 (1.14 %) |
6,538,228 (22.49 %) |
41,376 (3.37 %) |
327 | Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021) GCA_020746095.1 |
n/a | 11,628 (1.91 %) |
21,635 (2.31 %) |
n/a | 42.86 (100.00 %) |
17 (0.00 %) |
1,535 (100.00 %) |
421,231 (6.57 %) |
146,070 (1.11 %) |
5,727,350 (21.91 %) |
37,752 (3.68 %) |
328 | Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020) GCA_009819505.2 |
n/a | 13,403 (1.85 %) |
27,669 (2.52 %) |
n/a | 42.86 (100.00 %) |
13 (0.00 %) |
3,601 (100.00 %) |
704,976 (13.16 %) |
649,859 (4.89 %) |
6,740,713 (22.65 %) |
49,076 (3.54 %) |
329 | Swainson's thrush (bCatUst1 v2 primary hap 2020) GCF_009819885.2 |
40,121 (5.41 %) |
13,004 (1.87 %) |
24,795 (2.41 %) |
n/a | 42.48 (98.86 %) |
429 (1.14 %) |
160 (100.00 %) |
493,071 (5.80 %) |
589,858 (4.32 %) |
6,708,638 (22.44 %) |
49,404 (3.53 %) |
330 | swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023) GCA_028019105.1 |
n/a | 12,160 (1.83 %) |
24,622 (2.46 %) |
n/a | 43.37 (100.00 %) |
n/a | 862 (100.00 %) |
383,634 (3.06 %) |
527,550 (8.40 %) |
5,916,654 (24.97 %) |
31,261 (3.21 %) |
331 | swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018845.1 |
29,544 (4.27 %) |
12,375 (1.75 %) |
24,577 (2.31 %) |
n/a | 43.08 (99.89 %) |
236 (0.11 %) |
40 (100.00 %) |
419,473 (3.09 %) |
439,909 (7.61 %) |
6,077,743 (24.47 %) |
32,064 (3.27 %) |
332 | Swan (goose HZ-2024a 2024) GCF_040182565.1 |
68,379 (7.95 %) |
13,715 (1.90 %) |
24,704 (2.28 %) |
n/a | 43.07 (100.00 %) |
42 (0.00 %) |
75 (100.00 %) |
780,603 (10.80 %) |
463,894 (5.65 %) |
6,593,404 (24.63 %) |
41,265 (4.48 %) |
333 | swan goose (Sichuan white goose 2017) GCF_002166845.1 |
62,728 (8.50 %) |
12,903 (1.98 %) |
21,943 (2.24 %) |
n/a | 41.68 (97.40 %) |
63,061 (2.62 %) |
64,863 (97.38 %) |
590,350 (4.68 %) |
253,525 (1.38 %) |
6,926,961 (19.71 %) |
40,011 (3.69 %) |
334 | swan goose (Tianfu 2020) GCA_013030995.1 |
n/a | 12,965 (1.97 %) |
25,182 (2.35 %) |
n/a | 42.15 (99.99 %) |
716 (0.01 %) |
2,119 (100.00 %) |
650,271 (7.44 %) |
270,668 (1.26 %) |
6,776,820 (21.19 %) |
35,560 (4.27 %) |
335 | swan goose (Zhedong 2015) GCF_000971095.1 |
43,215 (5.89 %) |
12,148 (1.89 %) |
19,386 (2.07 %) |
29,870 (3.24 %) |
41.36 (96.87 %) |
84,351 (3.16 %) |
91,944 (96.84 %) |
481,707 (5.57 %) |
230,143 (1.26 %) |
6,665,312 (19.42 %) |
38,930 (2.06 %) |
336 | Swift parrot (hap1 2024) GCF_037157495.1 |
50,082 (5.09 %) |
12,974 (1.75 %) |
22,545 (2.07 %) |
n/a | 42.67 (99.82 %) |
186 (0.18 %) |
367 (100.00 %) |
541,918 (6.97 %) |
347,387 (6.90 %) |
5,657,314 (26.08 %) |
25,816 (2.01 %) |
337 | Swift parrot (hap2 2024) GCA_037157625.1 |
n/a | 11,928 (1.78 %) |
20,879 (2.12 %) |
n/a | 42.78 (99.75 %) |
122 (0.25 %) |
413 (100.00 %) |
481,463 (6.65 %) |
359,572 (7.59 %) |
5,094,615 (26.27 %) |
23,296 (2.08 %) |
338 | tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023) GCA_028020675.1 |
n/a | 11,432 (1.95 %) |
20,528 (2.37 %) |
n/a | 42.31 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
911 (100.00 %) |
470,125 (9.51 %) |
140,846 (3.57 %) |
5,002,695 (22.08 %) |
22,424 (2.33 %) |
339 | tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023) GCA_028020825.1 |
n/a | 13,321 (1.76 %) |
24,102 (2.15 %) |
n/a | 42.35 (99.83 %) |
203 (0.17 %) |
1,038 (100.00 %) |
593,409 (10.51 %) |
202,463 (9.29 %) |
6,160,173 (27.65 %) |
25,785 (2.35 %) |
340 | tawny owl (hap1 2023) GCA_031877795.1 |
n/a | 13,204 (1.60 %) |
23,981 (1.99 %) |
n/a | 42.70 (99.70 %) |
281 (0.30 %) |
212 (99.85 %) |
443,228 (4.74 %) |
272,738 (10.86 %) |
5,812,837 (27.42 %) |
30,602 (2.52 %) |
341 | tawny owl (hap2 2023) GCA_031877785.1 |
n/a | 12,367 (1.72 %) |
21,445 (2.03 %) |
n/a | 42.53 (99.88 %) |
206 (0.12 %) |
184 (100.00 %) |
392,959 (4.59 %) |
235,300 (7.72 %) |
6,437,772 (24.82 %) |
27,952 (2.71 %) |
342 | tawny-flanked prinia (Zambia CZ2003 2024) GCF_021018805.1 |
40,939 (5.96 %) |
12,510 (1.84 %) |
24,378 (2.37 %) |
n/a | 42.64 (99.99 %) |
378 (0.01 %) |
538 (100.00 %) |
384,533 (3.09 %) |
345,667 (4.24 %) |
6,199,979 (21.86 %) |
33,587 (2.53 %) |
343 | Tibetan ground-tit GCF_000331425.1 |
28,736 (4.57 %) |
12,828 (2.02 %) |
17,743 (2.65 %) |
n/a | 41.69 (98.76 %) |
21,646 (1.24 %) |
27,052 (98.76 %) |
443,797 (5.51 %) |
346,281 (2.29 %) |
6,423,932 (19.90 %) |
27,086 (2.31 %) |
344 | tourmaline sunangel (hap1 2024) GCA_036169615.1 |
n/a | 12,509 (1.97 %) |
21,020 (2.33 %) |
n/a | 41.63 (99.99 %) |
437 (0.01 %) |
131 (100.00 %) |
532,267 (5.46 %) |
332,284 (2.69 %) |
6,084,978 (21.20 %) |
19,080 (1.72 %) |
345 | tourmaline sunangel (hap2 2024) GCA_036172335.1 |
n/a | 11,697 (2.00 %) |
19,544 (2.34 %) |
n/a | 41.82 (99.99 %) |
370 (0.01 %) |
200 (100.00 %) |
480,724 (5.14 %) |
292,213 (3.66 %) |
5,608,823 (21.79 %) |
17,191 (1.69 %) |
346 | tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022) GCA_023055385.1 |
n/a | 12,203 (1.76 %) |
25,216 (2.40 %) |
n/a | 43.65 (100.00 %) |
97 (0.00 %) |
450 (100.00 %) |
430,792 (3.25 %) |
542,908 (5.67 %) |
5,289,916 (24.99 %) |
36,805 (3.52 %) |
347 | tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022) GCA_023055355.1 |
n/a | 12,867 (1.81 %) |
26,393 (2.48 %) |
n/a | 42.85 (100.00 %) |
97 (0.00 %) |
311 (100.00 %) |
429,011 (3.16 %) |
564,849 (5.52 %) |
6,336,716 (23.32 %) |
33,378 (2.70 %) |
348 | tufted duck (2019) GCF_009819795.1 |
29,492 (4.02 %) |
12,972 (1.98 %) |
22,757 (2.27 %) |
n/a | 41.66 (99.16 %) |
163 (0.84 %) |
105 (100.00 %) |
826,451 (8.47 %) |
411,356 (1.71 %) |
6,691,445 (22.36 %) |
29,882 (2.41 %) |
349 | tufted duck (alternate hap 2019) GCA_009819845.1 |
n/a | 12,117 (2.03 %) |
21,464 (2.36 %) |
n/a | 41.71 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
780 (100.00 %) |
732,317 (7.82 %) |
353,660 (1.57 %) |
6,119,549 (21.70 %) |
27,920 (2.56 %) |
350 | turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014) GCF_000146605.3 |
38,427 (6.01 %) |
13,095 (1.96 %) |
23,974 (2.27 %) |
30,549 (3.14 %) |
41.35 (96.83 %) |
65,045 (3.16 %) |
250,220 (96.84 %) |
609,750 (9.03 %) |
243,534 (1.26 %) |
6,043,889 (21.06 %) |
31,818 (1.42 %) |
351 | turkey (WU_HG_1 2021) GCA_905368555.1 |
n/a | 12,910 (2.37 %) |
23,038 (2.58 %) |
53,269 (6.57 %) |
41.12 (100.00 %) |
81 (0.00 %) |
151 (100.00 %) |
618,023 (8.91 %) |
227,783 (1.43 %) |
6,123,721 (21.03 %) |
20,379 (2.19 %) |
352 | village indigobird (OUT-0048 2022) GCF_026979565.1 |
44,961 (5.49 %) |
12,817 (1.94 %) |
24,245 (2.44 %) |
n/a | 42.23 (99.98 %) |
458 (0.02 %) |
177 (100.00 %) |
616,746 (11.96 %) |
411,917 (3.57 %) |
6,385,057 (20.91 %) |
37,940 (2.83 %) |
353 | Virginia rail (171378401 alternate hap 2022) GCA_022605895.1 |
n/a | 12,732 (1.51 %) |
23,395 (1.91 %) |
n/a | 44.28 (99.99 %) |
668 (0.00 %) |
4,450 (100.00 %) |
526,500 (5.75 %) |
269,598 (14.29 %) |
4,825,913 (32.19 %) |
27,465 (2.18 %) |
354 | Virginia rail (171378401 primary hap 2022) GCA_022605955.1 |
n/a | 12,760 (1.53 %) |
23,262 (2.16 %) |
n/a | 44.16 (100.00 %) |
197 (0.00 %) |
1,299 (100.00 %) |
497,104 (5.09 %) |
271,530 (15.72 %) |
5,291,065 (32.37 %) |
24,669 (1.78 %) |
355 | western capercaillie (alternate hap 2023) GCA_951394355.1 |
n/a | 11,226 (2.33 %) |
20,526 (2.54 %) |
n/a | 41.53 (100.00 %) |
n/a | 5,463 (100.00 %) |
436,894 (5.48 %) |
209,008 (1.73 %) |
4,790,071 (20.27 %) |
17,864 (2.58 %) |
356 | western capercaillie (primary hap 2023) GCA_951394365.1 |
n/a | 12,775 (2.33 %) |
22,516 (2.50 %) |
n/a | 41.49 (99.98 %) |
973 (0.02 %) |
318 (100.00 %) |
518,194 (5.54 %) |
276,294 (2.21 %) |
5,866,033 (21.12 %) |
21,287 (2.50 %) |
357 | western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023) GCA_028536645.1 |
n/a | 12,480 (1.72 %) |
22,915 (2.17 %) |
n/a | 44.29 (100.00 %) |
168 (0.00 %) |
1,631 (100.00 %) |
394,733 (2.99 %) |
364,498 (6.04 %) |
4,803,453 (27.52 %) |
42,022 (4.90 %) |
358 | western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023) GCA_028536675.1 |
n/a | 13,128 (1.62 %) |
25,648 (2.11 %) |
n/a | 44.58 (100.00 %) |
272 (0.00 %) |
1,393 (100.00 %) |
449,314 (3.08 %) |
505,129 (6.52 %) |
4,634,925 (31.99 %) |
51,884 (4.81 %) |
359 | whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021) GCA_020745695.1 |
n/a | 11,632 (1.83 %) |
20,659 (2.18 %) |
n/a | 42.16 (100.00 %) |
1 (0.00 %) |
2,405 (100.00 %) |
553,633 (11.80 %) |
147,999 (0.81 %) |
5,825,472 (20.55 %) |
20,481 (1.61 %) |
360 | whiskered treeswift (bHemCor1 primary hap 2021) GCA_020745705.1 |
n/a | 12,681 (1.84 %) |
21,784 (2.14 %) |
n/a | 42.12 (99.13 %) |
218 (0.87 %) |
146 (100.00 %) |
520,200 (9.32 %) |
170,778 (0.83 %) |
6,455,910 (21.44 %) |
24,061 (1.62 %) |
361 | white wagtail GCF_015832195.1 |
47,145 (6.80 %) |
12,127 (1.86 %) |
22,301 (2.31 %) |
n/a | 42.72 (99.92 %) |
906 (0.08 %) |
619 (100.00 %) |
479,546 (6.15 %) |
349,751 (5.62 %) |
6,384,256 (22.41 %) |
28,008 (2.68 %) |
362 | white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022) GCF_025592945.1 |
53,731 (6.26 %) |
12,981 (1.91 %) |
23,916 (2.40 %) |
n/a | 42.43 (100.00 %) |
n/a | 643 (100.00 %) |
417,020 (3.98 %) |
366,209 (3.55 %) |
5,992,950 (21.48 %) |
28,964 (2.22 %) |
363 | white-crowned manakin (hap1 2024) GCA_036250125.1 |
n/a | 12,807 (1.82 %) |
25,568 (2.46 %) |
n/a | 42.66 (99.99 %) |
323 (0.01 %) |
697 (100.00 %) |
429,646 (4.10 %) |
293,431 (3.59 %) |
6,059,494 (21.89 %) |
29,574 (2.42 %) |
364 | white-crowned manakin (hap2 2024) GCA_036250135.1 |
n/a | 12,135 (1.94 %) |
21,591 (2.38 %) |
n/a | 42.49 (99.99 %) |
307 (0.01 %) |
595 (100.00 %) |
375,468 (3.93 %) |
263,979 (3.93 %) |
5,786,346 (21.36 %) |
25,275 (2.50 %) |
365 | white-ruffed manakin GCF_003945725.1 |
45,894 (5.34 %) |
12,730 (1.91 %) |
19,044 (2.50 %) |
n/a | 41.81 (99.24 %) |
13,527 (0.76 %) |
9,068 (100.00 %) |
489,252 (7.14 %) |
246,346 (1.38 %) |
6,500,956 (19.79 %) |
25,941 (1.84 %) |
366 | white-rumped snowfinch GCF_017590055.1 |
34,717 (4.88 %) |
12,599 (1.97 %) |
24,083 (2.44 %) |
n/a | 42.03 (99.81 %) |
4,869 (0.19 %) |
11,576 (100.00 %) |
502,151 (6.20 %) |
449,641 (3.22 %) |
6,554,257 (20.25 %) |
28,891 (2.32 %) |
367 | white-tailed eagle (BGI_N329 2014) GCF_000691405.1 |
20,744 (2.82 %) |
11,490 (1.49 %) |
22,258 (1.77 %) |
n/a | 40.90 (99.56 %) |
60,579 (0.45 %) |
111,484 (99.55 %) |
325,669 (3.74 %) |
116,707 (0.60 %) |
6,725,133 (18.14 %) |
11,615 (0.32 %) |
368 | white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq) GCF_947461875.1 |
52,797 (5.74 %) |
13,736 (1.76 %) |
24,846 (2.12 %) |
n/a | 43.15 (99.99 %) |
424 (0.01 %) |
189 (100.00 %) |
585,279 (12.89 %) |
291,297 (6.10 %) |
6,474,102 (23.66 %) |
54,851 (4.05 %) |
369 | white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022) GCA_947461935.1 |
n/a | 7,755 (1.71 %) |
16,331 (2.39 %) |
n/a | 43.66 (100.00 %) |
n/a | 4,971 (100.00 %) |
304,566 (13.21 %) |
116,307 (6.64 %) |
3,407,853 (22.91 %) |
34,573 (4.56 %) |
370 | white-tailed ptarmigan GCF_019238085.1 |
39,072 (5.37 %) |
12,919 (2.36 %) |
23,624 (2.48 %) |
n/a | 41.37 (97.63 %) |
10,501 (2.38 %) |
7,343 (100.00 %) |
587,593 (8.19 %) |
231,665 (1.12 %) |
6,007,601 (20.08 %) |
21,298 (2.05 %) |
371 | white-tailed tropicbird GCF_000687285.1 |
16,342 (2.18 %) |
12,040 (1.50 %) |
26,704 (1.97 %) |
n/a | 41.51 (99.50 %) |
65,286 (0.51 %) |
132,071 (99.49 %) |
353,892 (5.61 %) |
125,195 (0.74 %) |
6,873,137 (19.59 %) |
41,005 (1.45 %) |
372 | white-throated dipper (primary hap 2023) GCA_963662255.1 |
n/a | 12,856 (1.79 %) |
23,827 (2.25 %) |
n/a | 42.82 (99.99 %) |
658 (0.01 %) |
278 (100.00 %) |
431,536 (3.38 %) |
345,533 (10.59 %) |
5,840,462 (26.59 %) |
29,711 (3.56 %) |
373 | white-throated dipper (primary hap 2023) GCF_963662255.1 |
29,618 (3.60 %) |
12,854 (1.79 %) |
23,825 (2.25 %) |
n/a | 42.82 (99.99 %) |
658 (0.01 %) |
277 (100.00 %) |
431,531 (3.38 %) |
345,532 (10.59 %) |
5,840,421 (26.59 %) |
29,711 (3.56 %) |
374 | white-throated sparrow GCF_000385455.1 |
31,167 (5.71 %) |
11,241 (1.81 %) |
13,429 (2.26 %) |
n/a | 41.52 (95.61 %) |
41,460 (4.40 %) |
37,661 (95.60 %) |
439,216 (5.96 %) |
364,202 (2.52 %) |
6,300,584 (19.09 %) |
15,091 (0.85 %) |
375 | white-throated tinamou GCF_000705375.1 |
18,997 (2.72 %) |
12,287 (1.75 %) |
20,132 (2.48 %) |
n/a | 41.41 (97.88 %) |
59,853 (2.12 %) |
142,367 (97.88 %) |
366,311 (3.62 %) |
226,347 (1.35 %) |
6,300,683 (18.94 %) |
47,608 (2.60 %) |
376 | whooping crane (maternal hap 2023 refseq) GCF_028858705.1 |
55,408 (5.57 %) |
13,574 (1.81 %) |
24,739 (2.19 %) |
n/a | 43.07 (99.63 %) |
262 (0.37 %) |
930 (100.00 %) |
616,300 (10.57 %) |
211,558 (2.90 %) |
6,785,192 (22.11 %) |
42,795 (4.66 %) |
377 | whooping crane (paternal hap 2023) GCA_028858595.1 |
n/a | 13,284 (1.87 %) |
23,528 (2.20 %) |
n/a | 42.47 (99.50 %) |
586 (0.50 %) |
395 (100.00 %) |
569,940 (8.69 %) |
162,569 (0.98 %) |
7,021,319 (20.20 %) |
38,582 (3.77 %) |
378 | willow flycatcher GCF_003031625.1 |
37,909 (4.43 %) |
12,708 (1.90 %) |
19,591 (2.57 %) |
n/a | 42.01 (95.33 %) |
39,319 (4.68 %) |
7,791 (100.00 %) |
550,172 (7.15 %) |
242,394 (1.27 %) |
6,421,292 (18.87 %) |
27,080 (1.82 %) |
379 | wire-tailed manakin (2020) GCF_003945595.2 |
42,551 (5.86 %) |
12,535 (1.90 %) |
23,300 (2.38 %) |
n/a | 42.06 (99.73 %) |
758 (0.26 %) |
1,768 (100.00 %) |
480,705 (7.12 %) |
240,463 (1.87 %) |
6,316,566 (20.20 %) |
25,317 (2.02 %) |
380 | wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023) GCA_029207785.1 |
n/a | 13,053 (1.78 %) |
24,963 (2.30 %) |
n/a | 43.93 (100.00 %) |
342 (0.00 %) |
1,350 (100.00 %) |
444,809 (3.08 %) |
473,154 (7.96 %) |
5,336,472 (25.82 %) |
37,198 (3.14 %) |
381 | wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 refseq) GCF_029207755.1 |
40,944 (5.15 %) |
13,050 (1.78 %) |
24,948 (2.30 %) |
n/a | 43.93 (100.00 %) |
353 (0.00 %) |
1,694 (100.00 %) |
444,856 (3.08 %) |
473,471 (7.97 %) |
5,336,456 (25.82 %) |
37,210 (3.14 %) |
382 | yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022) GCA_024372515.1 |
n/a | 12,426 (1.63 %) |
27,565 (2.37 %) |
n/a | 43.59 (100.00 %) |
246 (0.00 %) |
776 (100.00 %) |
447,274 (3.06 %) |
612,008 (10.28 %) |
5,606,168 (28.79 %) |
39,449 (2.66 %) |
383 | yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022) GCA_024362935.1 |
n/a | 12,556 (1.69 %) |
26,545 (2.35 %) |
n/a | 43.09 (100.00 %) |
284 (0.00 %) |
971 (100.00 %) |
440,673 (3.12 %) |
581,112 (9.17 %) |
6,158,372 (26.15 %) |
35,577 (2.57 %) |
384 | yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024) GCA_039720435.1 |
n/a | 13,169 (1.63 %) |
23,545 (1.98 %) |
n/a | 43.42 (100.00 %) |
198 (0.00 %) |
1,679 (100.00 %) |
579,903 (8.32 %) |
295,345 (9.90 %) |
4,361,776 (30.37 %) |
28,647 (1.82 %) |
385 | yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024) GCA_039720425.1 |
n/a | 12,079 (1.50 %) |
21,895 (1.84 %) |
n/a | 44.31 (100.00 %) |
138 (0.00 %) |
2,468 (100.00 %) |
514,155 (7.08 %) |
298,648 (19.26 %) |
3,943,979 (37.27 %) |
27,272 (1.79 %) |
386 | yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024) GCA_964199725.1 |
n/a | 12,692 (1.61 %) |
24,720 (2.07 %) |
n/a | 44.79 (100.00 %) |
n/a | 4,673 (100.00 %) |
486,967 (5.03 %) |
248,816 (10.71 %) |
6,176,494 (29.58 %) |
44,101 (6.72 %) |
387 | yellow-legged gull (primary hap 2024) GCA_964199755.1 |
n/a | 13,396 (1.62 %) |
25,176 (2.03 %) |
n/a | 44.64 (99.99 %) |
500 (0.01 %) |
618 (100.00 %) |
521,539 (5.15 %) |
267,365 (11.68 %) |
5,827,639 (29.76 %) |
44,532 (6.28 %) |
388 | yellow-throated sandgrouse (2019) GCA_009769525.1 |
n/a | 12,697 (1.89 %) |
25,289 (2.53 %) |
n/a | 42.40 (99.62 %) |
242 (0.38 %) |
89 (100.00 %) |
510,633 (7.10 %) |
213,742 (1.12 %) |
6,627,716 (21.17 %) |
28,848 (2.23 %) |
389 | yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019) GCA_009769505.1 |
n/a | 11,788 (1.85 %) |
23,306 (2.45 %) |
n/a | 42.31 (100.00 %) |
n/a | 1,958 (100.00 %) |
467,960 (6.96 %) |
182,645 (0.99 %) |
6,050,545 (20.78 %) |
26,357 (2.20 %) |
390 | zebra finch (alternate hap Black17 2018) GCA_003957525.1 |
n/a | 11,340 (1.85 %) |
22,921 (2.37 %) |
n/a | 41.73 (99.98 %) |
45 (0.01 %) |
5,381 (99.99 %) |
480,647 (8.44 %) |
365,668 (2.89 %) |
5,859,698 (20.27 %) |
24,649 (2.35 %) |
391 | zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020) GCA_009859025.1 |
n/a | 10,734 (1.84 %) |
19,978 (2.21 %) |
n/a | 41.07 (99.99 %) |
16 (0.01 %) |
4,677 (100.00 %) |
436,071 (7.44 %) |
217,580 (1.43 %) |
5,800,691 (19.24 %) |
19,512 (1.90 %) |
392 | zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021) GCA_003957525.2 |
n/a | 11,213 (2.01 %) |
21,533 (2.54 %) |
n/a | 41.92 (100.00 %) |
10 (0.00 %) |
1,646 (100.00 %) |
470,860 (9.54 %) |
387,943 (3.32 %) |
5,428,128 (20.68 %) |
23,838 (2.47 %) |
393 | zebra finch (Blue55 2020) GCA_009859065.2 |
n/a | 12,796 (1.92 %) |
24,658 (2.44 %) |
n/a | 41.91 (98.03 %) |
789 (1.97 %) |
541 (100.00 %) |
554,338 (9.67 %) |
339,851 (2.27 %) |
6,613,146 (20.04 %) |
28,678 (2.32 %) |
394 | zebra finch (Blue55 maternal v3 2020) GCA_008822115.3 |
n/a | 11,950 (2.00 %) |
22,828 (2.51 %) |
n/a | 42.06 (98.45 %) |
583 (1.55 %) |
206 (100.00 %) |
494,110 (9.54 %) |
347,933 (2.80 %) |
5,875,448 (20.29 %) |
27,387 (2.57 %) |
395 | zebra finch (Blue55 paternal 2019) GCA_008822125.1 |
n/a | 12,384 (1.97 %) |
23,021 (2.44 %) |
n/a | 41.74 (98.02 %) |
828 (1.98 %) |
202 (100.00 %) |
511,324 (8.38 %) |
351,624 (2.53 %) |
6,328,918 (19.99 %) |
25,871 (2.29 %) |
396 | zebra finch (Blue55 paternal W 2020) GCF_008822105.2 |
50,407 (7.20 %) |
12,470 (1.95 %) |
23,352 (2.42 %) |
n/a | 41.81 (97.98 %) |
857 (2.02 %) |
205 (100.00 %) |
529,829 (9.55 %) |
357,586 (2.56 %) |
6,359,599 (20.12 %) |
27,755 (2.36 %) |
397 | zebra finch (Blue55 v1.4 primary hap 2021) GCF_003957565.2 |
49,311 (7.41 %) |
12,747 (1.97 %) |
24,009 (2.47 %) |
n/a | 41.86 (99.66 %) |
352 (0.34 %) |
199 (100.00 %) |
544,577 (9.57 %) |
458,903 (3.33 %) |
6,338,748 (20.92 %) |
29,202 (2.47 %) |
TOTALS: | total assembly count 397 |