Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (2019)
GCA_009769605.1
n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
40,986
(3.65 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
38,787
(3.82 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1
n/a 12,415
(1.42 %)
23,266
(1.78 %)
n/a 46.76
(99.99 %)
1,555
(0.01 %)
2,294
(100.00 %)
1,077,039
(17.72 %)
548,450
(13.79 %)
4,965,697
(43.00 %)
29,460
(3.04 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1
n/a 11,832
(1.45 %)
22,508
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
4,491
(99.99 %)
980,493
(17.23 %)
496,946
(14.39 %)
5,155,337
(42.38 %)
28,236
(3.22 %)
5 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCF_026170545.1
41,049
(4.47 %)
11,830
(1.45 %)
22,522
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
4,489
(99.99 %)
980,471
(17.23 %)
496,933
(14.40 %)
5,155,020
(42.38 %)
28,236
(3.22 %)
6 Adelie penguin
GCF_000699105.1
17,638
(3.05 %)
11,763
(1.71 %)
10,671
(1.99 %)
n/a 41.51
(95.58 %)
95,110
(4.45 %)
114,374
(95.55 %)
360,323
(4.64 %)
126,490
(0.70 %)
6,900,013
(18.31 %)
27,176
(0.96 %)
7 African ostrich
GCF_000698965.1
29,026
(4.42 %)
12,011
(1.64 %)
17,852
(1.82 %)
34,707
(3.37 %)
41.05
(96.74 %)
72,649
(3.29 %)
79,564
(96.71 %)
321,765
(3.17 %)
152,444
(0.82 %)
7,196,207
(17.79 %)
33,542
(1.33 %)
8 African ostrich (bStrCam1hap1 2024)
GCF_040807025.1
70,988
(5.69 %)
14,024
(1.60 %)
24,944
(1.95 %)
n/a 44.34
(100.00 %)
116
(0.00 %)
262
(100.00 %)
710,321
(8.33 %)
473,161
(7.22 %)
5,692,215
(24.23 %)
46,493
(8.90 %)
9 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1
n/a 13,036
(1.56 %)
32,740
(2.89 %)
n/a 45.71
(100.00 %)
82
(0.00 %)
250
(100.00 %)
651,979
(9.34 %)
459,653
(10.08 %)
4,547,348
(28.27 %)
49,261
(10.50 %)
10 American crow
GCF_000691975.1
36,379
(6.32 %)
12,151
(1.86 %)
11,346
(2.24 %)
n/a 41.85
(96.40 %)
79,099
(3.62 %)
89,646
(96.38 %)
416,990
(6.08 %)
224,964
(1.60 %)
6,343,680
(18.42 %)
20,148
(0.77 %)
11 American flamingo (2019)
GCA_009819775.1
n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
52,012
(5.96 %)
12 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
51,895
(5.89 %)
13 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
14,903
(1.46 %)
14 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
12,257
(1.95 %)
14,633
(2.35 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
15 bald eagle
GCF_000737465.1
26,869
(3.49 %)
13,007
(1.88 %)
15,874
(2.35 %)
n/a 41.68
(98.38 %)
30,862
(1.63 %)
31,786
(98.37 %)
355,319
(3.99 %)
119,526
(0.44 %)
6,923,742
(18.48 %)
33,353
(1.97 %)
16 band-tailed pigeon (hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1
n/a 13,319
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
219
(0.59 %)
453
(100.00 %)
700,173
(13.18 %)
457,546
(13.85 %)
4,523,003
(31.73 %)
42,686
(7.00 %)
17 band-tailed pigeon (hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1
36,326
(4.04 %)
13,317
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
219
(0.59 %)
452
(100.00 %)
700,166
(13.18 %)
457,543
(13.85 %)
4,522,973
(31.73 %)
42,686
(7.00 %)
18 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1
15,393
(2.18 %)
11,432
(1.52 %)
23,733
(1.98 %)
n/a 41.38
(99.58 %)
50,921
(0.42 %)
105,649
(99.58 %)
386,871
(6.20 %)
142,825
(0.82 %)
6,474,942
(19.87 %)
18,662
(0.63 %)
19 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1
46,583
(5.22 %)
13,036
(1.82 %)
22,849
(2.14 %)
n/a 41.65
(95.89 %)
259
(4.11 %)
70
(100.00 %)
610,994
(5.59 %)
254,870
(1.12 %)
7,109,716
(19.00 %)
38,384
(2.94 %)
20 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
30,305
(2.79 %)
21 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,548
(2.85 %)
22 Bengalese finch
GCF_005870125.1
32,857
(5.06 %)
12,604
(1.98 %)
23,707
(2.41 %)
n/a 41.59
(97.06 %)
37,862
(2.95 %)
2,015
(100.00 %)
507,898
(7.97 %)
424,913
(2.80 %)
6,456,852
(20.03 %)
29,692
(2.46 %)
23 bird A.albertisi (hap1 2024)
GCA_039906565.1
n/a 13,007
(1.87 %)
23,375
(2.27 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
439
(0.01 %)
592
(100.00 %)
467,217
(6.83 %)
273,604
(2.43 %)
6,154,114
(21.83 %)
23,203
(2.12 %)
24 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1
n/a 12,101
(1.93 %)
21,258
(2.30 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
344
(0.01 %)
525
(100.00 %)
412,944
(6.30 %)
232,333
(2.21 %)
5,715,517
(21.35 %)
20,873
(2.13 %)
25 bird A.imberbis (Cuckoo-Finch-1a 21T00152 2023)
GCF_031753505.1
53,868
(5.67 %)
12,992
(1.79 %)
25,575
(2.33 %)
n/a 43.43
(99.99 %)
431
(0.01 %)
1,370
(100.00 %)
437,810
(3.71 %)
484,607
(8.45 %)
5,614,533
(25.04 %)
45,374
(4.99 %)
26 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1
n/a 12,607
(2.39 %)
22,429
(2.59 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
331
(0.01 %)
425
(100.00 %)
521,486
(5.26 %)
266,418
(2.40 %)
5,305,054
(20.63 %)
19,590
(2.16 %)
27 bird E.chinensis (hap2 2024)
GCA_039878825.1
n/a 12,731
(2.42 %)
22,580
(2.63 %)
n/a 41.64
(99.99 %)
330
(0.01 %)
191
(100.00 %)
520,888
(5.33 %)
274,030
(2.07 %)
5,360,112
(20.48 %)
19,673
(2.18 %)
28 bird N.grandis (bNycGra1 primary hap 2020)
GCF_013368605.1
33,115
(3.89 %)
13,120
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
243
(0.49 %)
190
(100.00 %)
610,506
(15.46 %)
210,373
(1.13 %)
6,501,918
(23.95 %)
35,788
(2.78 %)
29 bird P.flaviventris (CSIRO_AGI_PZ_B2104156 2023)
GCF_033815535.1
46,130
(4.40 %)
13,292
(1.73 %)
24,384
(2.16 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
n/a 993
(100.00 %)
514,287
(6.54 %)
355,123
(8.64 %)
5,531,059
(27.22 %)
28,362
(1.86 %)
30 bird P.pipra (hap1 2024)
GCF_036250125.1
55,558
(6.99 %)
12,807
(1.82 %)
23,359
(2.28 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
323
(0.01 %)
696
(100.00 %)
429,643
(4.10 %)
293,428
(3.59 %)
6,059,402
(21.89 %)
29,574
(2.42 %)
31 bird Z.leucophrys gambelii (GWCS_2022_RI 2023)
GCF_028769735.1
42,284
(5.19 %)
12,694
(1.84 %)
25,490
(2.39 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
339
(0.00 %)
3,792
(100.00 %)
398,368
(3.10 %)
569,232
(5.31 %)
6,675,899
(23.29 %)
31,995
(2.37 %)
32 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2
41,421
(4.72 %)
13,027
(1.98 %)
22,616
(2.25 %)
n/a 41.96
(99.99 %)
130
(0.01 %)
568
(100.00 %)
636,501
(5.67 %)
297,964
(1.45 %)
6,820,083
(21.47 %)
31,725
(3.49 %)
33 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
42,650
(2.59 %)
34 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
35,457
(2.90 %)
35 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
42,444
(3.62 %)
36 black-headed gull (primary hap 2024)
GCA_963924245.1
n/a 13,244
(1.58 %)
25,111
(1.96 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
462
(0.01 %)
729
(100.00 %)
516,350
(4.84 %)
268,175
(14.83 %)
5,880,256
(31.31 %)
45,313
(4.92 %)
37 black-headed gull (primary hap 2024)
GCF_963924245.1
46,133
(4.67 %)
13,243
(1.58 %)
24,048
(1.89 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
462
(0.01 %)
728
(100.00 %)
516,346
(4.84 %)
268,169
(14.83 %)
5,880,218
(31.31 %)
45,313
(4.92 %)
38 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
45,318
(4.71 %)
39 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
42,776
(4.88 %)
40 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1
n/a 12,249
(1.86 %)
23,692
(2.34 %)
n/a 42.36
(99.99 %)
970
(0.01 %)
600
(100.00 %)
491,914
(6.04 %)
365,884
(2.89 %)
6,453,998
(20.73 %)
30,076
(2.44 %)
41 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
25,451
(2.38 %)
42 blackcap (primary hap 2019 refseq)
GCF_009819655.1
31,610
(4.74 %)
12,379
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
190
(100.00 %)
582,016
(10.36 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,626
(19.76 %)
26,838
(2.34 %)
43 blue tit
GCF_002901205.1
42,986
(5.81 %)
12,162
(1.76 %)
16,442
(2.29 %)
n/a 41.18
(92.58 %)
24,797
(7.42 %)
29,297
(100.00 %)
486,455
(6.02 %)
423,142
(2.68 %)
6,777,615
(18.84 %)
26,565
(0.98 %)
44 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
25,153
(2.06 %)
45 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
26,750
(2.02 %)
46 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1
42,586
(5.25 %)
12,442
(1.93 %)
16,972
(2.49 %)
n/a 41.74
(97.93 %)
22,456
(2.07 %)
23,501
(97.93 %)
470,567
(6.92 %)
226,975
(1.27 %)
6,395,476
(19.17 %)
24,084
(1.85 %)
47 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1
n/a 12,250
(1.92 %)
19,607
(2.10 %)
n/a 41.72
(93.42 %)
3,560,856
(6.92 %)
1,498
(100.00 %)
559,187
(10.05 %)
144,509
(0.66 %)
5,883,053
(17.90 %)
18,581
(1.17 %)
48 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1
n/a 12,339
(1.91 %)
20,350
(2.13 %)
n/a 41.72
(93.49 %)
3,559,082
(6.85 %)
3,232
(100.00 %)
501,831
(8.21 %)
144,313
(0.66 %)
5,882,906
(17.92 %)
18,584
(1.17 %)
49 Bourke's parrot (Australia Nb327-2 2023)
GCF_033783945.1
43,924
(4.72 %)
13,092
(1.91 %)
23,195
(2.31 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
37
(0.00 %)
1,864
(100.00 %)
469,079
(6.31 %)
205,954
(1.49 %)
5,911,944
(20.89 %)
22,555
(1.70 %)
50 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1
n/a 13,202
(1.80 %)
24,416
(2.14 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
327
(0.00 %)
569
(100.00 %)
832,469
(7.06 %)
531,644
(7.37 %)
6,294,434
(28.49 %)
34,786
(3.61 %)
51 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1
n/a 12,578
(1.76 %)
23,066
(2.06 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
244
(0.00 %)
720
(100.00 %)
773,452
(7.75 %)
522,491
(10.88 %)
5,592,104
(31.80 %)
33,981
(4.60 %)
52 bronzed cowbird (106 2024)
GCF_037042795.1
30,276
(4.54 %)
12,775
(1.77 %)
24,737
(2.30 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
67
(0.00 %)
528
(100.00 %)
410,661
(3.03 %)
498,610
(9.50 %)
6,332,690
(26.06 %)
33,278
(2.51 %)
53 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1
n/a 13,027
(2.37 %)
22,748
(2.48 %)
n/a 41.03
(98.67 %)
114,232
(1.35 %)
2,408
(100.00 %)
523,649
(0.00 %)
228,783
(1.17 %)
6,134,418
(20.24 %)
19,702
(2.00 %)
54 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2
31,871
(5.31 %)
12,561
(1.89 %)
24,218
(2.41 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
318
(0.01 %)
692
(99.99 %)
598,355
(12.36 %)
420,712
(3.73 %)
6,496,704
(21.26 %)
28,568
(2.41 %)
55 brown kiwi
GCF_001039765.1
26,121
(3.23 %)
12,909
(1.54 %)
23,267
(1.91 %)
n/a 41.28
(86.08 %)
368,297
(13.97 %)
24,718
(100.00 %)
367,446
(2.94 %)
316,602
(7.36 %)
7,164,456
(14.67 %)
59,756
(2.40 %)
56 brown roatelo
GCF_000695765.1
16,756
(2.26 %)
12,208
(1.55 %)
27,079
(2.12 %)
n/a 41.32
(99.66 %)
51,602
(0.35 %)
119,122
(99.65 %)
345,102
(5.17 %)
194,444
(1.21 %)
6,441,258
(19.39 %)
19,018
(0.67 %)
57 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1
n/a 12,659
(1.89 %)
22,063
(2.28 %)
n/a 41.89
(94.20 %)
388
(5.80 %)
930
(100.00 %)
504,677
(9.95 %)
268,616
(3.12 %)
5,481,198
(20.78 %)
20,278
(1.55 %)
58 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
59 budgerigar (paternal 2020)
GCA_012275275.1
n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
20,205
(1.61 %)
60 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1
25,525
(4.05 %)
12,188
(1.82 %)
15,819
(2.26 %)
n/a 41.25
(97.26 %)
51,022
(2.75 %)
70,863
(97.25 %)
465,974
(9.37 %)
127,353
(0.54 %)
5,864,264
(19.05 %)
15,886
(0.88 %)
61 burrowing owl
GCF_003259725.1
30,559
(4.30 %)
11,741
(1.72 %)
10,976
(2.04 %)
n/a 40.92
(98.92 %)
33,737
(1.09 %)
445
(100.00 %)
492,320
(6.21 %)
182,281
(0.73 %)
6,811,984
(19.35 %)
22,840
(1.08 %)
62 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1
n/a 11,551
(1.57 %)
22,390
(2.09 %)
n/a 44.21
(99.99 %)
1,672
(0.01 %)
3,563
(100.00 %)
465,417
(6.39 %)
218,050
(11.40 %)
4,588,632
(30.42 %)
22,622
(2.16 %)
63 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1
n/a 12,725
(1.54 %)
24,572
(2.13 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
319
(0.00 %)
964
(100.00 %)
522,782
(6.36 %)
226,563
(14.09 %)
5,497,483
(32.27 %)
24,529
(1.77 %)
64 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2
27,527
(3.38 %)
12,653
(1.75 %)
21,924
(1.97 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
434,141
(3.82 %)
177,389
(0.88 %)
7,171,770
(20.32 %)
34,918
(3.00 %)
65 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1
n/a 12,948
(1.71 %)
24,838
(2.01 %)
n/a 43.36
(100.00 %)
248
(0.00 %)
1,601
(100.00 %)
1,359,516
(35.69 %)
599,039
(11.78 %)
3,454,101
(36.94 %)
36,496
(2.55 %)
66 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1
n/a 12,718
(2.12 %)
23,363
(2.40 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
287
(0.00 %)
608
(100.00 %)
881,563
(19.85 %)
308,707
(5.50 %)
5,409,060
(25.34 %)
25,268
(2.42 %)
67 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1
28,823
(3.21 %)
12,791
(1.50 %)
26,511
(2.06 %)
n/a 44.24
(100.00 %)
n/a 627
(100.00 %)
473,712
(3.18 %)
586,987
(10.80 %)
4,965,312
(32.86 %)
48,369
(2.73 %)
68 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1
n/a 13,061
(1.95 %)
24,149
(2.23 %)
n/a 42.13
(98.37 %)
15,389
(1.64 %)
28,876
(98.36 %)
715,113
(7.61 %)
319,386
(1.67 %)
6,810,836
(21.27 %)
40,389
(4.15 %)
69 carmine bee-eater (2019)
GCA_009819595.1
n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
30,881
(2.41 %)
70 carmine bee-eater alternate hap pseudohaplotype 2019)
GCA_009819585.1
n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
31,638
(2.54 %)
71 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
39,042
(6.25 %)
72 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
21,151
(2.71 %)
73 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
25,664
(2.75 %)
74 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6
62,183
(8.40 %)
13,099
(2.32 %)
18,797
(2.76 %)
73,407
(9.29 %)
42.23
(99.08 %)
952
(0.92 %)
2,380
(99.08 %)
684,052
(12.74 %)
307,144
(2.92 %)
5,863,131
(21.16 %)
24,405
(2.72 %)
75 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
27,781
(2.90 %)
76 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
19,653
(2.66 %)
77 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
24,413
(2.63 %)
78 chicken white leghorn layer X broiler (broiler haplotype 2021 v2 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
24,469
(2.59 %)
79 chicken white leghorn layer X broiler (leghorn haplotype v2 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
24,409
(2.60 %)
80 Chilean tinamou
GCF_003342845.1
24,894
(4.16 %)
12,545
(2.09 %)
18,167
(2.87 %)
n/a 42.04
(98.74 %)
1,226,739
(1.39 %)
2,217
(100.00 %)
496,518
(5.43 %)
290,573
(1.50 %)
5,870,743
(19.53 %)
44,640
(5.21 %)
81 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2
15,969
(2.53 %)
12,045
(1.82 %)
18,580
(2.07 %)
n/a 41.40
(96.00 %)
65,471
(4.02 %)
84,174
(95.98 %)
469,979
(5.99 %)
194,781
(2.21 %)
6,361,618
(19.70 %)
12,438
(0.41 %)
82 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2
17,193
(2.21 %)
12,092
(1.49 %)
28,685
(1.89 %)
n/a 40.76
(99.62 %)
56,333
(0.39 %)
125,214
(99.61 %)
516,189
(5.36 %)
202,882
(1.12 %)
6,588,198
(20.47 %)
8,029
(0.24 %)
83 collared flycatcher
GCF_000247815.1
28,360
(4.07 %)
12,200
(1.78 %)
14,028
(2.24 %)
33,113
(3.87 %)
44.22
(98.57 %)
11,403
(1.43 %)
30,843
(98.57 %)
559,053
(7.88 %)
597,207
(11.39 %)
6,656,400
(23.61 %)
29,879
(1.50 %)
84 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024)
GCA_964188355.1
n/a 13,512
(1.75 %)
24,417
(2.13 %)
n/a 43.17
(99.99 %)
471
(0.01 %)
546
(100.00 %)
439,018
(4.62 %)
244,865
(6.73 %)
6,778,625
(23.94 %)
43,400
(4.80 %)
85 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1
n/a 13,593
(1.72 %)
24,541
(2.09 %)
n/a 43.49
(99.99 %)
471
(0.01 %)
929
(99.99 %)
439,011
(4.19 %)
247,629
(8.40 %)
6,711,875
(25.06 %)
49,141
(4.61 %)
86 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1
32,985
(4.99 %)
12,248
(1.89 %)
15,910
(2.38 %)
n/a 42.17
(98.21 %)
47,138
(1.81 %)
3,536
(100.00 %)
477,249
(6.30 %)
313,951
(2.10 %)
6,525,604
(19.58 %)
25,722
(1.90 %)
87 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1
41,390
(5.57 %)
12,314
(1.93 %)
23,133
(2.37 %)
n/a 42.36
(99.95 %)
1,055
(0.05 %)
685
(100.00 %)
553,077
(10.89 %)
322,311
(2.75 %)
6,543,183
(20.47 %)
26,268
(2.31 %)
88 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
24,010
(1.80 %)
89 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
25,268
(1.73 %)
90 common goldeneye (primary hap 2024)
GCA_964059595.1
n/a 13,374
(1.90 %)
24,308
(2.28 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
454
(0.01 %)
544
(100.00 %)
751,865
(6.78 %)
400,294
(3.80 %)
6,184,781
(24.97 %)
35,712
(2.66 %)
91 common mallard (Pekin duck 2017)
GCA_002743455.1
n/a 12,871
(1.94 %)
25,038
(2.26 %)
n/a 41.42
(95.05 %)
25,623
(4.96 %)
21,442
(100.00 %)
760,634
(7.52 %)
360,866
(1.37 %)
6,710,465
(20.25 %)
32,823
(2.15 %)
92 common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024)
GCA_964237585.1
n/a 12,976
(1.68 %)
23,758
(2.12 %)
n/a 44.70
(99.99 %)
603
(0.01 %)
845
(100.00 %)
499,923
(5.57 %)
250,214
(7.38 %)
6,350,978
(25.68 %)
27,790
(2.32 %)
93 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1
n/a 12,745
(1.75 %)
23,052
(2.18 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
536
(0.01 %)
931
(99.99 %)
483,812
(5.59 %)
210,131
(3.30 %)
6,332,994
(22.33 %)
26,285
(2.20 %)
94 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
25,210
(3.70 %)
95 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
32,293
(3.87 %)
96 common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024)
GCA_964211825.1
n/a 13,505
(1.83 %)
24,961
(2.21 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
474
(0.01 %)
870
(100.00 %)
833,892
(8.17 %)
576,230
(8.04 %)
6,149,355
(27.84 %)
34,089
(2.69 %)
97 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1
n/a 12,828
(1.96 %)
23,534
(2.35 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
405
(0.01 %)
767
(99.99 %)
725,169
(7.34 %)
472,156
(5.81 %)
5,786,296
(25.35 %)
30,917
(2.80 %)
98 common starling
GCF_001447265.1
28,711
(4.57 %)
12,585
(2.01 %)
17,785
(2.59 %)
n/a 41.49
(97.70 %)
23,392
(2.31 %)
22,666
(97.69 %)
427,543
(5.30 %)
310,445
(1.74 %)
6,482,337
(19.49 %)
23,883
(1.99 %)
99 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
18,864
(1.75 %)
100 common swift (bApuApu2 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
101 common tern (2019)
GCA_009819605.1
n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
45,694
(3.73 %)
102 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
47,352
(3.95 %)
103 common yellowthroat (2019)
GCA_009764595.1
n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
25,004
(2.02 %)
104 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
21,397
(1.91 %)
105 Cory's shearwater (bCalBor7.hap1.1 2024)
GCA_964195595.1
n/a 13,703
(1.71 %)
26,310
(2.10 %)
n/a 43.29
(99.99 %)
525
(0.01 %)
414
(100.00 %)
479,045
(5.03 %)
336,466
(4.95 %)
5,910,298
(24.89 %)
48,046
(4.19 %)
106 Cory's shearwater (bCalBor7.hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
41,821
(4.50 %)
107 crested ibis (BGI_Y956 2014)
GCF_000708225.1
17,134
(2.52 %)
12,801
(1.77 %)
14,062
(2.19 %)
n/a 41.83
(97.20 %)
70,475
(2.81 %)
130,030
(97.19 %)
395,055
(4.53 %)
182,744
(0.97 %)
7,244,849
(18.69 %)
39,156
(2.06 %)
108 cuckoo roller (BGI_N330 2014)
GCF_000691785.1
16,484
(2.21 %)
12,195
(1.53 %)
24,940
(1.96 %)
n/a 41.82
(99.74 %)
56,010
(0.27 %)
113,170
(99.73 %)
349,912
(4.65 %)
131,678
(0.66 %)
6,778,773
(18.46 %)
35,090
(1.44 %)
109 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1
n/a 13,157
(1.67 %)
30,413
(2.59 %)
n/a 43.53
(100.00 %)
290
(0.00 %)
353
(100.00 %)
609,076
(8.83 %)
331,584
(6.01 %)
5,966,458
(23.99 %)
45,694
(7.05 %)
110 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
44,051
(8.95 %)
111 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
38,398
(5.49 %)
112 Dalmatian pelican (BGI_N334 2014)
GCF_000687375.1
16,438
(2.13 %)
11,927
(1.44 %)
25,409
(1.84 %)
n/a 41.39
(99.65 %)
57,580
(0.36 %)
121,562
(99.64 %)
394,453
(5.19 %)
159,315
(0.83 %)
6,832,864
(19.52 %)
25,648
(0.91 %)
113 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
39,705
(5.14 %)
114 Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024)
GCA_964211835.1
n/a 13,401
(1.75 %)
24,999
(2.15 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
930
(0.01 %)
819
(100.00 %)
685,992
(5.59 %)
452,303
(8.91 %)
5,976,185
(28.48 %)
43,672
(4.38 %)
115 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1
n/a 12,473
(1.84 %)
22,849
(2.21 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
754
(0.01 %)
1,135
(99.99 %)
594,136
(5.06 %)
375,813
(7.54 %)
5,497,978
(26.76 %)
39,164
(4.55 %)
116 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
24,105
(1.81 %)
117 Downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
118 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1
16,274
(2.23 %)
12,032
(1.55 %)
26,131
(1.84 %)
n/a 41.21
(99.65 %)
58,359
(0.36 %)
111,850
(99.64 %)
374,845
(4.51 %)
130,655
(0.66 %)
6,753,184
(18.86 %)
26,202
(0.96 %)
119 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
33,323
(3.81 %)
120 East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020)
GCA_011004875.1
n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
36,626
(3.69 %)
121 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
27,831
(2.52 %)
122 emperor penguin
GCF_000699145.1
20,055
(3.28 %)
12,513
(1.77 %)
11,986
(2.13 %)
n/a 41.62
(94.30 %)
72,501
(5.72 %)
83,173
(94.28 %)
478,239
(5.68 %)
200,181
(2.24 %)
7,154,684
(17.95 %)
31,615
(1.38 %)
123 emu (2018)
GCF_003342905.1
36,047
(5.11 %)
12,857
(1.77 %)
17,727
(2.32 %)
n/a 41.63
(99.02 %)
1,408,082
(1.11 %)
2,778
(100.00 %)
440,224
(4.29 %)
175,539
(0.70 %)
7,218,815
(17.59 %)
43,752
(4.64 %)
124 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1
54,479
(5.65 %)
13,972
(1.59 %)
25,695
(1.97 %)
n/a 43.79
(100.00 %)
129
(0.00 %)
271
(100.00 %)
713,839
(12.11 %)
418,774
(7.08 %)
5,668,105
(24.04 %)
51,137
(7.32 %)
125 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1
n/a 12,839
(1.57 %)
24,113
(1.98 %)
n/a 44.40
(100.00 %)
101
(0.00 %)
242
(100.00 %)
657,460
(14.23 %)
397,600
(8.84 %)
4,824,789
(26.94 %)
48,081
(7.49 %)
126 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
41,752
(6.24 %)
127 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024)
GCA_964273445.1
n/a 13,292
(1.69 %)
25,387
(2.13 %)
n/a 41.80
(99.99 %)
696
(0.01 %)
2,451
(100.00 %)
489,065
(4.78 %)
331,025
(13.58 %)
6,196,233
(29.98 %)
37,567
(3.51 %)
128 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1
n/a 13,051
(1.80 %)
24,815
(2.25 %)
n/a 42.33
(99.99 %)
683
(0.01 %)
584
(100.00 %)
482,819
(5.02 %)
292,761
(7.61 %)
6,282,928
(25.46 %)
35,630
(3.58 %)
129 Eurasian crane (hap1 2024)
GCA_964106855.1
n/a 13,457
(1.70 %)
24,519
(2.05 %)
n/a 44.24
(99.99 %)
593
(0.01 %)
754
(100.00 %)
516,462
(4.57 %)
262,941
(8.12 %)
5,356,948
(26.79 %)
48,488
(7.36 %)
130 Eurasian curlew (hap1 2024)
GCA_964106895.1
n/a 13,239
(1.66 %)
24,512
(2.02 %)
n/a 43.98
(99.99 %)
785
(0.01 %)
1,834
(100.00 %)
600,399
(6.45 %)
616,756
(7.75 %)
5,607,190
(28.35 %)
39,863
(3.53 %)
131 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1
n/a 12,728
(1.78 %)
23,645
(2.18 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
693
(0.01 %)
1,504
(99.99 %)
544,959
(6.24 %)
393,773
(4.49 %)
5,839,698
(24.52 %)
35,759
(3.26 %)
132 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
21,942
(1.89 %)
133 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1
n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
24,805
(1.90 %)
134 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1
43,477
(5.70 %)
12,550
(1.95 %)
24,541
(2.43 %)
n/a 42.02
(99.82 %)
4,765
(0.18 %)
18,975
(100.00 %)
464,973
(6.08 %)
492,684
(3.98 %)
6,663,773
(20.49 %)
28,741
(2.30 %)
135 European golden plover (bPluApr1 primary hap 2021)
GCA_017639485.1
n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
40,661
(3.41 %)
136 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
22,977
(2.32 %)
137 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2
n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
30,391
(2.60 %)
138 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
32,162
(3.60 %)
139 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
37,247
(3.95 %)
140 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
34,682
(2.57 %)
141 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
29,692
(2.35 %)
142 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
37,413
(3.59 %)
143 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
26,594
(2.34 %)
144 garden warbler (bSylBor1 primary hap 2020)
GCA_014839755.1
n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
27,799
(2.40 %)
145 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
38,495
(3.10 %)
146 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
27,767
(3.57 %)
147 golden pheasant
GCA_003413605.1
n/a 12,891
(2.28 %)
21,429
(2.37 %)
n/a 40.87
(97.55 %)
51,170
(2.47 %)
65,464
(97.53 %)
541,931
(8.01 %)
249,405
(2.01 %)
6,173,989
(19.98 %)
22,227
(1.31 %)
148 golden-collared manakin
GCF_001715985.3
27,575
(4.33 %)
11,806
(1.85 %)
13,267
(2.32 %)
n/a 41.42
(97.44 %)
20,874
(2.57 %)
3,619
(100.00 %)
447,084
(7.00 %)
197,843
(1.19 %)
6,198,932
(18.50 %)
18,804
(1.03 %)
149 great cormorant (BGI_N336 2014)
GCF_000708925.1
15,472
(2.07 %)
11,547
(1.44 %)
22,727
(1.73 %)
n/a 41.28
(99.25 %)
98,475
(0.77 %)
162,787
(99.23 %)
324,530
(4.59 %)
144,409
(1.43 %)
6,724,538
(18.06 %)
14,330
(0.42 %)
150 great cormorant (primary hap 2024)
GCA_963921805.1
n/a 13,434
(1.76 %)
30,619
(3.17 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
493
(0.01 %)
351
(100.00 %)
556,740
(10.18 %)
303,279
(3.45 %)
6,599,611
(22.65 %)
38,341
(5.45 %)
151 great cormorant (primary hap 2024)
GCF_963921805.1
46,253
(5.46 %)
13,432
(1.76 %)
23,419
(2.08 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
493
(0.01 %)
350
(100.00 %)
556,733
(10.18 %)
303,277
(3.45 %)
6,599,550
(22.65 %)
38,340
(5.45 %)
152 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
29,548
(2.77 %)
153 great potoo (bNycGra1 primary hap 2020)
GCA_013368605.1
n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
35,785
(2.69 %)
154 great tit
GCF_001522545.3
46,201
(6.78 %)
12,250
(2.00 %)
16,577
(2.52 %)
n/a 41.37
(98.24 %)
24,615
(1.76 %)
24,044
(98.24 %)
447,566
(5.89 %)
249,384
(1.36 %)
6,330,291
(19.11 %)
23,876
(1.88 %)
155 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1
20,607
(2.63 %)
12,184
(1.76 %)
21,560
(2.12 %)
n/a 43.63
(100.00 %)
556
(0.00 %)
1,452
(100.00 %)
804,583
(12.49 %)
291,451
(3.14 %)
5,887,349
(28.34 %)
19,623
(1.55 %)
156 greater prairie chicken
GCA_001870855.1
n/a 12,923
(2.36 %)
24,062
(2.50 %)
n/a 41.23
(99.63 %)
48,408
(0.39 %)
60,594
(99.61 %)
544,139
(7.50 %)
214,682
(0.99 %)
6,153,628
(19.86 %)
23,154
(2.26 %)
157 greater rhea
GCA_003343005.1
n/a 12,895
(1.81 %)
20,976
(2.06 %)
n/a 40.79
(98.79 %)
2,075,293
(1.40 %)
2,162
(100.00 %)
509,589
(0.00 %)
196,258
(0.73 %)
6,982,184
(18.70 %)
41,811
(3.95 %)
158 greater sage-grouse
GCF_019232065.1
36,656
(5.50 %)
12,419
(2.36 %)
21,319
(2.40 %)
n/a 41.16
(96.34 %)
9,894
(3.66 %)
1,502
(100.00 %)
574,006
(8.05 %)
196,630
(0.72 %)
5,996,002
(19.65 %)
18,807
(1.81 %)
159 green peafowl
GCA_016647715.1
n/a 12,897
(2.25 %)
23,427
(2.41 %)
n/a 41.73
(98.15 %)
32,668
(1.85 %)
2,446
(100.00 %)
481,865
(6.04 %)
188,685
(1.04 %)
6,268,032
(20.57 %)
22,330
(1.85 %)
160 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1
n/a 13,159
(1.57 %)
41,528
(2.68 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
4,777
(0.03 %)
54,154
(99.97 %)
525,535
(7.07 %)
222,932
(1.16 %)
6,301,005
(19.38 %)
28,978
(2.14 %)
161 ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023)
GCF_028554395.1
41,746
(4.05 %)
13,173
(1.89 %)
24,269
(2.31 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
n/a 8,090
(100.00 %)
468,845
(6.23 %)
261,918
(2.42 %)
5,956,005
(21.98 %)
25,573
(1.77 %)
162 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
11,838
(2.15 %)
163 gyrfalcon (bFalRus1 primary hap 2020)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
24,760
(2.03 %)
164 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
58,446
(5.44 %)
165 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
60,606
(5.66 %)
166 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
23,288
(3.74 %)
167 Hawaiian crow (bCorHaw1 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
46,118
(3.85 %)
168 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1
55,435
(7.96 %)
12,866
(2.29 %)
18,391
(2.68 %)
n/a 41.73
(98.08 %)
15,598
(1.93 %)
2,739
(100.00 %)
486,655
(7.97 %)
173,056
(0.98 %)
6,144,176
(20.18 %)
26,577
(2.39 %)
169 hoatzin (BGI_N306 2014)
GCF_000692075.1
14,928
(2.31 %)
11,454
(1.65 %)
11,717
(2.07 %)
n/a 42.42
(94.92 %)
99,371
(5.11 %)
109,627
(94.89 %)
360,821
(6.34 %)
145,440
(1.01 %)
6,679,356
(18.72 %)
40,581
(1.42 %)
170 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
58,754
(5.54 %)
171 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
53,781
(5.77 %)
172 hooded crow (v6 S_Up_H32 2022)
GCF_000738735.6
42,787
(6.57 %)
11,856
(1.93 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
458,399
(8.32 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
173 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
28,740
(2.98 %)
174 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
30,897
(2.53 %)
175 house sparrow (hap1 2024)
GCA_036417665.1
n/a 12,831
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
202
(0.00 %)
334
(100.00 %)
647,396
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,524
(30.36 %)
36,193
(2.91 %)
176 house sparrow (hap1 2024)
GCF_036417665.1
75,216
(7.36 %)
12,832
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
204
(0.00 %)
335
(100.00 %)
647,402
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,561
(30.36 %)
36,193
(2.91 %)
177 House sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
33,424
(2.42 %)
178 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
27,953
(3.83 %)
179 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
33,172
(3.38 %)
180 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2
n/a 12,424
(1.21 %)
43,440
(2.06 %)
n/a 41.86
(99.95 %)
1,098
(0.00 %)
260,829
(100.00 %)
497,886
(5.29 %)
184,967
(0.96 %)
6,167,538
(20.22 %)
33,529
(1.55 %)
181 jackdaw
GCA_013407035.1
n/a 12,072
(1.93 %)
20,925
(2.08 %)
n/a 42.15
(99.72 %)
511
(0.28 %)
41
(100.00 %)
428,760
(6.13 %)
173,436
(1.02 %)
6,231,317
(19.25 %)
26,177
(2.17 %)
182 Japanese quail
GCF_001577835.2
49,210
(7.77 %)
12,864
(2.54 %)
22,540
(2.69 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
559,601
(7.91 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
183 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
32,592
(5.25 %)
184 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
54,426
(4.92 %)
185 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
5,487
(1.71 %)
186 kakapo (Jane v2 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
22,278
(1.77 %)
187 kea
GCF_000696875.1
15,953
(2.35 %)
11,985
(1.66 %)
22,107
(2.01 %)
n/a 41.09
(99.60 %)
51,381
(0.42 %)
93,561
(99.58 %)
368,226
(5.60 %)
138,157
(0.75 %)
5,905,331
(18.06 %)
7,218
(0.22 %)
188 killdeer
GCF_000708025.1
16,480
(2.43 %)
12,356
(1.72 %)
12,853
(2.15 %)
n/a 41.88
(97.24 %)
63,995
(2.78 %)
79,162
(97.22 %)
424,095
(5.93 %)
167,406
(0.94 %)
7,070,701
(19.44 %)
37,082
(1.57 %)
189 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1
n/a 13,641
(1.52 %)
24,293
(1.78 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
154
(0.00 %)
130
(100.00 %)
484,661
(3.34 %)
252,569
(16.01 %)
5,595,734
(32.51 %)
77,942
(3.59 %)
190 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1
n/a 12,764
(1.49 %)
23,033
(1.77 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
128
(0.00 %)
140
(100.00 %)
432,536
(3.01 %)
230,315
(20.91 %)
4,960,923
(35.56 %)
86,907
(3.76 %)
191 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
24,909
(2.64 %)
192 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
32,237
(2.61 %)
193 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
25,377
(1.97 %)
194 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
25,589
(2.05 %)
195 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
31,611
(2.72 %)
196 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
32,398
(2.65 %)
197 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
44,108
(6.34 %)
198 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
27,552
(2.26 %)
199 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
200 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1
51,352
(6.92 %)
12,689
(2.35 %)
22,377
(2.51 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
58
(0.00 %)
206
(100.00 %)
498,179
(5.36 %)
218,390
(1.80 %)
6,038,211
(20.76 %)
20,648
(2.33 %)
201 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1
n/a 13,105
(1.81 %)
25,654
(2.45 %)
n/a 40.86
(98.66 %)
1,039,616
(1.43 %)
3,019
(100.00 %)
522,333
(5.61 %)
208,867
(0.79 %)
7,080,214
(19.15 %)
42,016
(4.35 %)
202 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
34,698
(5.69 %)
203 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
45,073
(5.83 %)
204 little egret
GCF_000687185.1
25,843
(3.55 %)
12,162
(1.73 %)
10,954
(2.03 %)
n/a 42.25
(95.99 %)
88,871
(4.04 %)
100,662
(95.96 %)
490,997
(6.84 %)
165,380
(1.23 %)
6,955,585
(18.98 %)
31,136
(1.15 %)
205 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1
n/a 13,329
(1.88 %)
23,888
(2.25 %)
n/a 42.30
(99.99 %)
544
(0.01 %)
272
(100.00 %)
784,647
(6.78 %)
501,860
(7.36 %)
6,388,957
(26.13 %)
34,028
(3.04 %)
206 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
15,809
(1.43 %)
207 long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
15,922
(1.43 %)
208 Macqueen's bustard (BGI_N324 2014)
GCF_000695195.1
15,790
(2.21 %)
11,632
(1.52 %)
24,790
(1.96 %)
n/a 41.10
(99.68 %)
56,130
(0.33 %)
115,823
(99.67 %)
391,856
(4.80 %)
148,075
(0.90 %)
6,682,530
(20.03 %)
27,675
(1.15 %)
209 Macqueen's bustard (maternal 2024)
GCA_036417535.1
n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
47,331
(8.09 %)
210 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
42,560
(7.71 %)
211 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
27,330
(3.35 %)
212 maguari stork (bCicMag1 primary hap 2021)
GCA_017639555.1
n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
31,653
(3.02 %)
213 mallard (CAU_Wild1.0 2019)
GCA_008746955.1
n/a 13,260
(1.85 %)
25,071
(2.17 %)
n/a 42.41
(99.90 %)
318
(0.10 %)
1,665
(100.00 %)
849,782
(8.18 %)
438,622
(5.10 %)
6,729,782
(25.03 %)
34,670
(3.03 %)
214 mallard (hap1 2024)
GCA_964188345.1
n/a 13,680
(1.77 %)
26,845
(2.33 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
571
(0.01 %)
936
(100.00 %)
941,876
(15.92 %)
570,703
(9.50 %)
6,169,980
(28.67 %)
41,791
(3.18 %)
215 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1
n/a 12,715
(1.89 %)
24,338
(2.42 %)
n/a 42.70
(99.99 %)
485
(0.01 %)
972
(99.99 %)
795,168
(13.44 %)
445,147
(7.71 %)
5,728,430
(26.21 %)
35,679
(3.13 %)
216 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1
54,114
(7.47 %)
12,199
(1.86 %)
15,363
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.77 %)
71,703
(0.26 %)
2,150
(100.00 %)
770,322
(8.16 %)
357,617
(3.09 %)
6,587,406
(21.92 %)
29,913
(2.33 %)
217 mallard ZJU1.0
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
35,030
(3.06 %)
218 Mariana crow
GCF_017639235.1
48,460
(7.00 %)
12,506
(1.97 %)
22,580
(2.35 %)
n/a 42.14
(98.94 %)
10,579
(1.06 %)
1,443
(100.00 %)
434,280
(5.91 %)
169,629
(0.82 %)
6,323,058
(18.94 %)
27,390
(2.04 %)
219 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
12,908
(3.26 %)
220 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
36,076
(2.82 %)
221 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
16,659
(1.74 %)
222 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
24,675
(1.70 %)
223 medium ground-finch
GCF_000277835.1
22,226
(4.24 %)
11,887
(1.83 %)
11,438
(2.19 %)
n/a 41.61
(97.77 %)
68,589
(2.25 %)
95,828
(97.75 %)
433,244
(5.91 %)
322,831
(2.24 %)
6,548,136
(19.49 %)
18,135
(0.69 %)
224 monk parakeet
GCA_017639245.1
n/a 13,067
(1.85 %)
n/a n/a 42.29
(99.99 %)
352
(0.01 %)
291
(100.00 %)
582,436
(9.49 %)
253,709
(2.79 %)
5,820,920
(22.52 %)
23,101
(1.75 %)
225 Montezuma quail (F1298 2024)
GCF_038088225.1
28,327
(3.95 %)
12,793
(2.29 %)
22,305
(2.47 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
234
(0.00 %)
521
(100.00 %)
458,084
(6.03 %)
243,493
(3.14 %)
5,553,010
(22.13 %)
22,147
(2.41 %)
226 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
25,667
(3.86 %)
227 mute swan (bCygOlo1 v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
31,278
(3.07 %)
228 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
29,485
(4.55 %)
229 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
31,693
(3.88 %)
230 New Caledonian crow (2019)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
31,909
(2.48 %)
231 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
26,107
(2.52 %)
232 Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank)
GCA_036013445.1
n/a 13,359
(1.72 %)
24,921
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
117
(0.00 %)
807
(100.00 %)
705,078
(18.28 %)
342,299
(9.55 %)
6,410,095
(28.06 %)
38,589
(9.40 %)
233 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1
34,506
(4.09 %)
13,358
(1.72 %)
24,851
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
117
(0.00 %)
806
(100.00 %)
705,074
(18.28 %)
342,297
(9.55 %)
6,410,054
(28.06 %)
38,589
(9.40 %)
234 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
37,728
(3.88 %)
235 night parrot (Australia 2023)
GCF_034315485.1
48,921
(5.26 %)
12,986
(1.89 %)
22,892
(2.24 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,593
(100.00 %)
487,881
(6.13 %)
259,865
(3.37 %)
5,961,641
(22.88 %)
24,673
(1.77 %)
236 North Island brown kiwi (bAptMan1hap1 2024)
GCF_036417845.1
39,806
(3.75 %)
13,668
(1.52 %)
25,226
(1.90 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
170
(0.00 %)
408
(100.00 %)
713,264
(8.42 %)
603,930
(6.25 %)
5,379,069
(27.65 %)
50,913
(9.74 %)
237 North Island brown kiwi (hap1 2024)
GCA_036417845.1
n/a 13,670
(1.52 %)
33,383
(2.64 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
170
(0.00 %)
409
(100.00 %)
713,271
(8.42 %)
603,937
(6.25 %)
5,379,113
(27.65 %)
50,913
(9.74 %)
238 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
54,278
(9.43 %)
239 northern bobwhite
GCA_008692595.2
n/a 12,584
(2.37 %)
22,327
(2.53 %)
n/a 41.41
(99.04 %)
33,134
(0.97 %)
39,169
(99.03 %)
460,369
(4.63 %)
213,800
(1.34 %)
5,813,961
(19.54 %)
22,156
(2.37 %)
240 northern fulmar
GCF_000690835.1
16,383
(2.20 %)
11,965
(1.51 %)
24,294
(1.87 %)
n/a 41.17
(99.50 %)
54,825
(0.51 %)
112,214
(99.49 %)
330,541
(3.74 %)
146,735
(0.83 %)
6,838,937
(18.42 %)
24,859
(0.79 %)
241 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
34,879
(3.83 %)
242 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30,873
(3.03 %)
243 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
244 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v2 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
245 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
35,691
(4.26 %)
246 northern pintail (primary hap 2024)
GCA_963932015.1
n/a 13,218
(1.88 %)
23,888
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
631
(0.01 %)
395
(100.00 %)
734,763
(5.74 %)
422,947
(7.08 %)
6,491,165
(25.88 %)
34,601
(2.98 %)
247 northern pintail (primary hap 2024)
GCF_963932015.1
61,479
(7.27 %)
13,217
(1.88 %)
23,886
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
631
(0.01 %)
394
(100.00 %)
734,760
(5.74 %)
422,946
(7.08 %)
6,491,116
(25.88 %)
34,601
(2.98 %)
248 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
34,247
(3.02 %)
249 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1
43,838
(4.59 %)
13,232
(1.76 %)
18,641
(2.35 %)
n/a 41.52
(98.49 %)
696,987
(1.57 %)
4,120
(100.00 %)
482,272
(4.98 %)
178,540
(0.70 %)
7,407,982
(18.33 %)
43,081
(4.88 %)
250 Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020)
GCA_010365825.1
n/a 12,953
(1.76 %)
25,275
(2.07 %)
24,636
(2.89 %)
41.70
(98.42 %)
42,691
(1.58 %)
151,517
(98.42 %)
494,677
(6.28 %)
222,654
(1.07 %)
7,211,171
(19.25 %)
41,048
(2.24 %)
251 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
26,313
(2.41 %)
252 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
253 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1
37,506
(5.42 %)
12,670
(1.80 %)
11,311
(2.11 %)
n/a 41.77
(98.44 %)
76,069
(1.58 %)
83,081
(98.42 %)
437,234
(5.32 %)
170,160
(0.93 %)
7,157,857
(18.38 %)
22,325
(0.89 %)
254 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1
41,770
(4.95 %)
12,712
(1.86 %)
24,157
(2.37 %)
n/a 42.69
(100.00 %)
338
(0.00 %)
484
(100.00 %)
641,523
(14.11 %)
414,142
(6.03 %)
6,230,412
(23.70 %)
49,402
(3.94 %)
255 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
28,391
(3.74 %)
256 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
36,343
(3.63 %)
257 pink-footed goose (primary hap 2024)
GCA_964034855.1
n/a 13,275
(1.76 %)
24,103
(2.11 %)
n/a 43.68
(99.98 %)
1,137
(0.02 %)
715
(100.00 %)
792,215
(9.76 %)
471,286
(10.34 %)
6,448,623
(29.48 %)
49,485
(4.41 %)
258 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
30,478
(4.03 %)
259 plumbeous ibis (bTheCae1 primary hap 2021)
GCA_020745775.1
n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
32,920
(3.37 %)
260 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2
n/a 12,000
(1.69 %)
22,393
(2.01 %)
n/a 41.66
(74.61 %)
137,572
(25.41 %)
200,284
(74.59 %)
536,198
(8.55 %)
200,698
(0.96 %)
5,147,882
(14.30 %)
14,572
(0.41 %)
261 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1
n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
38,960
(3.02 %)
262 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
40,926
(2.91 %)
263 red-backed fairy wren (Western Australia 2023)
GCF_030028575.1
29,027
(5.08 %)
12,371
(2.00 %)
24,297
(2.42 %)
n/a 41.70
(96.94 %)
3,337,637
(3.40 %)
10,634
(100.00 %)
349,349
(2.76 %)
398,866
(2.71 %)
6,299,092
(18.40 %)
27,078
(2.11 %)
264 red-billed tropicbird (maternal hap 2024)
GCA_964289735.1
n/a 13,231
(1.68 %)
24,060
(2.00 %)
n/a 43.15
(99.98 %)
1,269
(0.02 %)
660
(100.00 %)
440,963
(5.78 %)
187,847
(3.22 %)
6,601,610
(24.99 %)
54,002
(5.24 %)
265 red-billed tropicbird (paternal hap 2024)
GCA_964289755.1
n/a 11,989
(1.71 %)
21,527
(2.03 %)
n/a 43.19
(99.98 %)
1,072
(0.02 %)
1,572
(99.98 %)
383,852
(5.39 %)
164,123
(3.45 %)
5,859,520
(24.45 %)
48,825
(5.37 %)
266 red-crested pochard (primary hap 2024)
GCA_964035555.1
n/a 13,234
(1.92 %)
23,753
(2.26 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
714
(0.01 %)
141
(100.00 %)
772,537
(6.34 %)
437,831
(4.05 %)
6,488,340
(24.52 %)
31,577
(2.49 %)
267 red-crested turaco (2019)
GCA_009769465.1
n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
43,051
(3.40 %)
268 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
39,766
(3.41 %)
269 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
23,381
(1.81 %)
270 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020)
GCA_015220805.1
n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
26,519
(1.76 %)
271 Red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020)
GCF_015220805.1
44,843
(4.51 %)
12,341
(1.60 %)
23,205
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
307
(0.47 %)
252
(100.00 %)
981,758
(15.82 %)
378,855
(4.28 %)
6,003,474
(35.88 %)
26,519
(1.76 %)
272 red-legged partridge
GCA_019345075.1
n/a 12,441
(2.23 %)
20,933
(2.29 %)
n/a 41.44
(96.96 %)
18,534
(3.05 %)
29,132
(96.95 %)
543,702
(6.02 %)
222,583
(0.97 %)
5,978,744
(20.17 %)
19,970
(0.97 %)
273 red-legged seriema (2019)
GCA_009819825.1
n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
32,899
(2.77 %)
274 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
26,293
(2.86 %)
275 red-throated loon (BGI_N328 2014)
GCF_000690875.1
15,829
(2.14 %)
11,589
(1.46 %)
22,840
(1.76 %)
n/a 41.12
(99.40 %)
64,882
(0.61 %)
126,713
(99.39 %)
293,224
(3.50 %)
123,593
(0.80 %)
6,849,573
(18.22 %)
17,100
(0.51 %)
276 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
39,810
(3.37 %)
277 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
38,305
(3.37 %)
278 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1
29,994
(3.93 %)
12,687
(1.75 %)
25,287
(2.30 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
106
(0.00 %)
516
(100.00 %)
785,960
(17.62 %)
522,256
(9.27 %)
6,371,580
(25.40 %)
32,643
(2.66 %)
279 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1
15,595
(2.24 %)
11,495
(1.55 %)
25,766
(1.88 %)
n/a 42.65
(98.44 %)
118,543
(1.60 %)
180,800
(98.40 %)
271,331
(3.93 %)
134,645
(1.25 %)
6,383,631
(17.75 %)
24,531
(0.79 %)
280 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
15,730
(1.88 %)
281 rifleman (bAcaChl1 primary hap 2021)
GCA_016904835.1
n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
20,145
(1.83 %)
282 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1
33,221
(6.38 %)
13,027
(2.35 %)
19,960
(2.74 %)
n/a 41.21
(99.22 %)
19,995
(0.78 %)
39,678
(100.00 %)
586,827
(8.20 %)
291,437
(1.68 %)
6,237,616
(20.77 %)
22,365
(2.11 %)
283 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1
52,369
(6.40 %)
12,577
(1.87 %)
14,272
(2.42 %)
n/a 41.48
(98.13 %)
85,176
(1.90 %)
100,099
(98.10 %)
480,221
(6.94 %)
268,561
(1.86 %)
6,408,260
(19.42 %)
29,801
(1.43 %)
284 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036010775.2
n/a 12,450
(1.75 %)
23,660
(2.21 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
33,479
(3.29 %)
285 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036013475.2
n/a 13,146
(1.66 %)
25,463
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
249
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,969
(11.76 %)
412,670
(12.92 %)
6,047,584
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
286 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCF_036013475.1
70,874
(7.24 %)
13,145
(1.66 %)
25,462
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
249
(0.00 %)
869
(100.00 %)
656,963
(11.76 %)
412,665
(12.92 %)
6,047,535
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
287 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
33,479
(3.29 %)
288 rock pigeon (racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1
n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
289 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
19,210
(2.23 %)
290 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
21,346
(2.37 %)
291 ruddy duck
GCF_011077185.1
50,326
(5.76 %)
13,124
(1.98 %)
23,592
(2.23 %)
n/a 41.82
(97.27 %)
18,437
(2.73 %)
28,026
(97.27 %)
808,998
(7.97 %)
389,509
(1.34 %)
6,722,581
(21.16 %)
34,567
(3.30 %)
292 ruff
GCF_001431845.1
34,257
(4.61 %)
12,979
(1.79 %)
15,969
(2.42 %)
n/a 42.45
(96.26 %)
30,404
(3.75 %)
34,157
(96.25 %)
308,688
(1.08 %)
337,661
(3.70 %)
7,220,063
(20.45 %)
27,939
(1.42 %)
293 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1
35,381
(4.92 %)
12,603
(1.95 %)
24,965
(2.42 %)
n/a 42.00
(99.80 %)
5,524
(0.20 %)
24,055
(100.00 %)
514,274
(6.32 %)
411,146
(2.77 %)
6,584,761
(19.85 %)
29,372
(2.28 %)
294 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1
40,473
(5.86 %)
12,903
(1.96 %)
23,477
(2.35 %)
n/a 42.26
(99.87 %)
181
(0.13 %)
1,692
(100.00 %)
439,625
(4.09 %)
338,042
(2.23 %)
6,366,832
(20.27 %)
28,572
(2.11 %)
295 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1
45,898
(5.06 %)
12,908
(1.86 %)
21,103
(2.48 %)
n/a 42.28
(99.01 %)
15,342
(0.99 %)
38,089
(100.00 %)
496,308
(7.14 %)
333,391
(1.97 %)
6,646,625
(20.87 %)
32,671
(2.19 %)
296 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1
n/a 16,893
(1.07 %)
43,426
(1.70 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
12
(0.00 %)
43,047
(100.00 %)
1,180,596
(3.55 %)
1,932,696
(16.57 %)
6,340,063
(43.85 %)
66,996
(3.45 %)
297 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1
n/a 12,804
(1.50 %)
25,425
(1.97 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
200
(0.00 %)
1,339
(100.00 %)
699,755
(3.36 %)
1,030,540
(15.69 %)
5,226,748
(36.13 %)
36,539
(2.71 %)
298 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
29,420
(2.47 %)
299 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
300 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1
36,497
(5.34 %)
12,572
(1.79 %)
10,629
(2.08 %)
27,857
(3.09 %)
41.71
(98.00 %)
70,035
(2.03 %)
75,898
(97.97 %)
433,484
(5.29 %)
166,251
(1.03 %)
7,121,848
(18.23 %)
19,927
(0.72 %)
301 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
32,734
(4.25 %)
302 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
35,549
(5.05 %)
303 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1
n/a 16,954
(1.37 %)
46,692
(2.27 %)
n/a 43.66
(99.99 %)
1,822
(0.01 %)
31,565
(99.99 %)
680,766
(3.36 %)
930,904
(8.76 %)
7,502,726
(27.96 %)
56,390
(5.99 %)
304 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1
n/a 12,665
(1.79 %)
25,654
(2.40 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
339
(0.00 %)
337
(100.00 %)
428,675
(3.22 %)
588,040
(7.38 %)
6,466,447
(24.39 %)
33,599
(4.75 %)
305 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
39,406
(5.26 %)
306 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
48,871
(4.18 %)
307 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1
30,090
(4.91 %)
12,645
(1.95 %)
17,146
(2.49 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
185
(0.01 %)
1,527
(99.99 %)
457,266
(6.02 %)
477,426
(4.49 %)
6,482,932
(22.03 %)
27,271
(2.40 %)
308 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1
n/a 12,662
(1.93 %)
23,695
(2.34 %)
25,763
(3.61 %)
42.49
(99.99 %)
224
(0.01 %)
1,951
(99.99 %)
458,154
(6.01 %)
482,974
(4.97 %)
6,466,067
(22.21 %)
27,890
(2.42 %)
309 song sparrow (bMelMel2 primary hap 2024)
GCF_035770615.1
41,069
(3.95 %)
12,946
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
299
(0.07 %)
353
(100.00 %)
515,851
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,851
(39.23 %)
47,268
(3.90 %)
310 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1
n/a 15,672
(1.16 %)
40,690
(1.82 %)
n/a 45.19
(100.00 %)
5
(0.00 %)
34,693
(100.00 %)
1,068,703
(34.46 %)
796,004
(19.02 %)
6,315,990
(40.22 %)
57,647
(3.95 %)
311 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1
n/a 12,580
(1.53 %)
24,737
(2.00 %)
n/a 44.45
(100.00 %)
323
(0.00 %)
501
(100.00 %)
697,818
(28.44 %)
510,301
(17.90 %)
5,319,400
(34.64 %)
36,632
(3.59 %)
312 song sparrow (primary hap 2024)
GCA_035770615.1
n/a 12,940
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
299
(0.07 %)
354
(100.00 %)
515,857
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,880
(39.23 %)
47,269
(3.90 %)
313 South Island takahe (alternate 2021)
GCA_020801775.1
n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
22,941
(1.98 %)
314 South Island takahe (primary 2021)
GCA_020800305.1
n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
23,810
(2.02 %)
315 speckled mousebird (bColStr4 hap1 2023)
GCF_028858725.1
37,067
(4.23 %)
12,815
(1.76 %)
23,175
(2.17 %)
n/a 42.29
(99.52 %)
161
(0.48 %)
191
(100.00 %)
572,944
(12.88 %)
256,368
(3.55 %)
5,868,966
(23.42 %)
27,158
(2.30 %)
316 speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023)
GCA_028858625.2
n/a 12,332
(1.76 %)
22,895
(2.24 %)
n/a 42.74
(99.53 %)
136
(0.47 %)
242
(100.00 %)
521,023
(11.26 %)
304,406
(7.39 %)
5,319,571
(25.46 %)
27,299
(2.35 %)
317 speckled mousebird (BGI_N325 2014)
GCF_000690715.1
15,894
(2.09 %)
11,566
(1.44 %)
25,387
(1.84 %)
n/a 40.95
(99.65 %)
44,462
(0.35 %)
114,650
(99.65 %)
345,458
(6.87 %)
154,693
(1.27 %)
6,152,475
(19.42 %)
7,821
(0.23 %)
318 speckled mousebird (hap1 2023)
GCA_028858725.1
n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
25,552
(2.34 %)
319 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
28,905
(2.31 %)
320 steelblue widowfinch (merged hap OUT-0048 2022)
GCA_026979565.1
n/a 12,819
(1.94 %)
24,247
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
458
(0.02 %)
178
(100.00 %)
616,749
(11.96 %)
411,917
(3.56 %)
6,385,102
(20.91 %)
37,940
(2.83 %)
321 steelblue widowfinch (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
15,490
(8.23 %)
322 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1
n/a 12,217
(1.73 %)
25,261
(2.32 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
200
(0.00 %)
957
(100.00 %)
423,239
(3.30 %)
362,061
(4.83 %)
4,954,262
(27.09 %)
42,188
(4.05 %)
323 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1
n/a 12,789
(1.82 %)
24,509
(2.35 %)
n/a 43.18
(100.00 %)
223
(0.00 %)
352
(100.00 %)
413,598
(3.28 %)
318,919
(3.99 %)
5,977,564
(23.65 %)
33,675
(3.21 %)
324 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1
n/a 12,871
(1.88 %)
22,508
(2.20 %)
n/a 42.01
(96.97 %)
578,921
(3.08 %)
1,570
(100.00 %)
554,367
(10.05 %)
180,644
(0.89 %)
6,158,602
(21.14 %)
21,695
(1.62 %)
325 sunbittern
GCF_000690775.1
15,772
(2.11 %)
11,564
(1.45 %)
25,522
(1.98 %)
n/a 42.33
(99.55 %)
52,471
(0.46 %)
115,170
(99.54 %)
346,556
(5.38 %)
117,881
(0.88 %)
6,391,987
(18.82 %)
32,970
(1.31 %)
326 Suruca trogon (bRtoSur1 primary hap 2021)
GCA_020746105.1
n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
41,376
(3.37 %)
327 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
37,752
(3.68 %)
328 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
329 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
330 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
31,261
(3.21 %)
331 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
32,064
(3.27 %)
332 Swan (goose HZ-2024a 2024)
GCF_040182565.1
68,379
(7.95 %)
13,715
(1.90 %)
24,704
(2.28 %)
n/a 43.07
(100.00 %)
42
(0.00 %)
75
(100.00 %)
780,603
(10.80 %)
463,894
(5.65 %)
6,593,404
(24.63 %)
41,265
(4.48 %)
333 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1
62,728
(8.50 %)
12,903
(1.98 %)
21,943
(2.24 %)
n/a 41.68
(97.40 %)
63,061
(2.62 %)
64,863
(97.38 %)
590,350
(4.68 %)
253,525
(1.38 %)
6,926,961
(19.71 %)
40,011
(3.69 %)
334 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1
n/a 12,965
(1.97 %)
25,182
(2.35 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
716
(0.01 %)
2,119
(100.00 %)
650,271
(7.44 %)
270,668
(1.26 %)
6,776,820
(21.19 %)
35,560
(4.27 %)
335 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1
43,215
(5.89 %)
12,148
(1.89 %)
19,386
(2.07 %)
29,870
(3.24 %)
41.36
(96.87 %)
84,351
(3.16 %)
91,944
(96.84 %)
481,707
(5.57 %)
230,143
(1.26 %)
6,665,312
(19.42 %)
38,930
(2.06 %)
336 Swift parrot (hap1 2024)
GCF_037157495.1
50,082
(5.09 %)
12,974
(1.75 %)
22,545
(2.07 %)
n/a 42.67
(99.82 %)
186
(0.18 %)
367
(100.00 %)
541,918
(6.97 %)
347,387
(6.90 %)
5,657,314
(26.08 %)
25,816
(2.01 %)
337 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1
n/a 11,928
(1.78 %)
20,879
(2.12 %)
n/a 42.78
(99.75 %)
122
(0.25 %)
413
(100.00 %)
481,463
(6.65 %)
359,572
(7.59 %)
5,094,615
(26.27 %)
23,296
(2.08 %)
338 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
22,424
(2.33 %)
339 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
25,785
(2.35 %)
340 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
30,602
(2.52 %)
341 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
27,952
(2.71 %)
342 tawny-flanked prinia (Zambia CZ2003 2024)
GCF_021018805.1
40,939
(5.96 %)
12,510
(1.84 %)
24,378
(2.37 %)
n/a 42.64
(99.99 %)
378
(0.01 %)
538
(100.00 %)
384,533
(3.09 %)
345,667
(4.24 %)
6,199,979
(21.86 %)
33,587
(2.53 %)
343 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1
28,736
(4.57 %)
12,828
(2.02 %)
17,743
(2.65 %)
n/a 41.69
(98.76 %)
21,646
(1.24 %)
27,052
(98.76 %)
443,797
(5.51 %)
346,281
(2.29 %)
6,423,932
(19.90 %)
27,086
(2.31 %)
344 tourmaline sunangel (hap1 2024)
GCA_036169615.1
n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
19,080
(1.72 %)
345 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
17,191
(1.69 %)
346 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1
n/a 12,203
(1.76 %)
25,216
(2.40 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
97
(0.00 %)
450
(100.00 %)
430,792
(3.25 %)
542,908
(5.67 %)
5,289,916
(24.99 %)
36,805
(3.52 %)
347 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022)
GCA_023055355.1
n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
33,378
(2.70 %)
348 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
29,882
(2.41 %)
349 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
27,920
(2.56 %)
350 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3
38,427
(6.01 %)
13,095
(1.96 %)
23,974
(2.27 %)
30,549
(3.14 %)
41.35
(96.83 %)
65,045
(3.16 %)
250,220
(96.84 %)
609,750
(9.03 %)
243,534
(1.26 %)
6,043,889
(21.06 %)
31,818
(1.42 %)
351 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1
n/a 12,910
(2.37 %)
23,038
(2.58 %)
53,269
(6.57 %)
41.12
(100.00 %)
81
(0.00 %)
151
(100.00 %)
618,023
(8.91 %)
227,783
(1.43 %)
6,123,721
(21.03 %)
20,379
(2.19 %)
352 village indigobird (OUT-0048 2022)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
37,940
(2.83 %)
353 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1
n/a 12,732
(1.51 %)
23,395
(1.91 %)
n/a 44.28
(99.99 %)
668
(0.00 %)
4,450
(100.00 %)
526,500
(5.75 %)
269,598
(14.29 %)
4,825,913
(32.19 %)
27,465
(2.18 %)
354 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1
n/a 12,760
(1.53 %)
23,262
(2.16 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
197
(0.00 %)
1,299
(100.00 %)
497,104
(5.09 %)
271,530
(15.72 %)
5,291,065
(32.37 %)
24,669
(1.78 %)
355 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
17,864
(2.58 %)
356 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
21,287
(2.50 %)
357 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1
n/a 12,480
(1.72 %)
22,915
(2.17 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
168
(0.00 %)
1,631
(100.00 %)
394,733
(2.99 %)
364,498
(6.04 %)
4,803,453
(27.52 %)
42,022
(4.90 %)
358 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1
n/a 13,128
(1.62 %)
25,648
(2.11 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
272
(0.00 %)
1,393
(100.00 %)
449,314
(3.08 %)
505,129
(6.52 %)
4,634,925
(31.99 %)
51,884
(4.81 %)
359 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
20,481
(1.61 %)
360 whiskered treeswift (bHemCor1 primary hap 2021)
GCA_020745705.1
n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
24,061
(1.62 %)
361 white wagtail
GCF_015832195.1
47,145
(6.80 %)
12,127
(1.86 %)
22,301
(2.31 %)
n/a 42.72
(99.92 %)
906
(0.08 %)
619
(100.00 %)
479,546
(6.15 %)
349,751
(5.62 %)
6,384,256
(22.41 %)
28,008
(2.68 %)
362 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1
53,731
(6.26 %)
12,981
(1.91 %)
23,916
(2.40 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
n/a 643
(100.00 %)
417,020
(3.98 %)
366,209
(3.55 %)
5,992,950
(21.48 %)
28,964
(2.22 %)
363 white-crowned manakin (hap1 2024)
GCA_036250125.1
n/a 12,807
(1.82 %)
25,568
(2.46 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
323
(0.01 %)
697
(100.00 %)
429,646
(4.10 %)
293,431
(3.59 %)
6,059,494
(21.89 %)
29,574
(2.42 %)
364 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
25,275
(2.50 %)
365 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1
45,894
(5.34 %)
12,730
(1.91 %)
19,044
(2.50 %)
n/a 41.81
(99.24 %)
13,527
(0.76 %)
9,068
(100.00 %)
489,252
(7.14 %)
246,346
(1.38 %)
6,500,956
(19.79 %)
25,941
(1.84 %)
366 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1
34,717
(4.88 %)
12,599
(1.97 %)
24,083
(2.44 %)
n/a 42.03
(99.81 %)
4,869
(0.19 %)
11,576
(100.00 %)
502,151
(6.20 %)
449,641
(3.22 %)
6,554,257
(20.25 %)
28,891
(2.32 %)
367 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1
20,744
(2.82 %)
11,490
(1.49 %)
22,258
(1.77 %)
n/a 40.90
(99.56 %)
60,579
(0.45 %)
111,484
(99.55 %)
325,669
(3.74 %)
116,707
(0.60 %)
6,725,133
(18.14 %)
11,615
(0.32 %)
368 white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_947461875.1
52,797
(5.74 %)
13,736
(1.76 %)
24,846
(2.12 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
424
(0.01 %)
189
(100.00 %)
585,279
(12.89 %)
291,297
(6.10 %)
6,474,102
(23.66 %)
54,851
(4.05 %)
369 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
34,573
(4.56 %)
370 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1
39,072
(5.37 %)
12,919
(2.36 %)
23,624
(2.48 %)
n/a 41.37
(97.63 %)
10,501
(2.38 %)
7,343
(100.00 %)
587,593
(8.19 %)
231,665
(1.12 %)
6,007,601
(20.08 %)
21,298
(2.05 %)
371 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1
16,342
(2.18 %)
12,040
(1.50 %)
26,704
(1.97 %)
n/a 41.51
(99.50 %)
65,286
(0.51 %)
132,071
(99.49 %)
353,892
(5.61 %)
125,195
(0.74 %)
6,873,137
(19.59 %)
41,005
(1.45 %)
372 white-throated dipper (primary hap 2023)
GCA_963662255.1
n/a 12,856
(1.79 %)
23,827
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
658
(0.01 %)
278
(100.00 %)
431,536
(3.38 %)
345,533
(10.59 %)
5,840,462
(26.59 %)
29,711
(3.56 %)
373 white-throated dipper (primary hap 2023)
GCF_963662255.1
29,618
(3.60 %)
12,854
(1.79 %)
23,825
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
658
(0.01 %)
277
(100.00 %)
431,531
(3.38 %)
345,532
(10.59 %)
5,840,421
(26.59 %)
29,711
(3.56 %)
374 white-throated sparrow
GCF_000385455.1
31,167
(5.71 %)
11,241
(1.81 %)
13,429
(2.26 %)
n/a 41.52
(95.61 %)
41,460
(4.40 %)
37,661
(95.60 %)
439,216
(5.96 %)
364,202
(2.52 %)
6,300,584
(19.09 %)
15,091
(0.85 %)
375 white-throated tinamou
GCF_000705375.1
18,997
(2.72 %)
12,287
(1.75 %)
20,132
(2.48 %)
n/a 41.41
(97.88 %)
59,853
(2.12 %)
142,367
(97.88 %)
366,311
(3.62 %)
226,347
(1.35 %)
6,300,683
(18.94 %)
47,608
(2.60 %)
376 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
42,795
(4.66 %)
377 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
38,582
(3.77 %)
378 willow flycatcher
GCF_003031625.1
37,909
(4.43 %)
12,708
(1.90 %)
19,591
(2.57 %)
n/a 42.01
(95.33 %)
39,319
(4.68 %)
7,791
(100.00 %)
550,172
(7.15 %)
242,394
(1.27 %)
6,421,292
(18.87 %)
27,080
(1.82 %)
379 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2
42,551
(5.86 %)
12,535
(1.90 %)
23,300
(2.38 %)
n/a 42.06
(99.73 %)
758
(0.26 %)
1,768
(100.00 %)
480,705
(7.12 %)
240,463
(1.87 %)
6,316,566
(20.20 %)
25,317
(2.02 %)
380 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1
n/a 13,053
(1.78 %)
24,963
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
342
(0.00 %)
1,350
(100.00 %)
444,809
(3.08 %)
473,154
(7.96 %)
5,336,472
(25.82 %)
37,198
(3.14 %)
381 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 refseq)
GCF_029207755.1
40,944
(5.15 %)
13,050
(1.78 %)
24,948
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
1,694
(100.00 %)
444,856
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,456
(25.82 %)
37,210
(3.14 %)
382 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1
n/a 12,426
(1.63 %)
27,565
(2.37 %)
n/a 43.59
(100.00 %)
246
(0.00 %)
776
(100.00 %)
447,274
(3.06 %)
612,008
(10.28 %)
5,606,168
(28.79 %)
39,449
(2.66 %)
383 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1
n/a 12,556
(1.69 %)
26,545
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
284
(0.00 %)
971
(100.00 %)
440,673
(3.12 %)
581,112
(9.17 %)
6,158,372
(26.15 %)
35,577
(2.57 %)
384 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024)
GCA_039720435.1
n/a 13,169
(1.63 %)
23,545
(1.98 %)
n/a 43.42
(100.00 %)
198
(0.00 %)
1,679
(100.00 %)
579,903
(8.32 %)
295,345
(9.90 %)
4,361,776
(30.37 %)
28,647
(1.82 %)
385 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1
n/a 12,079
(1.50 %)
21,895
(1.84 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
138
(0.00 %)
2,468
(100.00 %)
514,155
(7.08 %)
298,648
(19.26 %)
3,943,979
(37.27 %)
27,272
(1.79 %)
386 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1
n/a 12,692
(1.61 %)
24,720
(2.07 %)
n/a 44.79
(100.00 %)
n/a 4,673
(100.00 %)
486,967
(5.03 %)
248,816
(10.71 %)
6,176,494
(29.58 %)
44,101
(6.72 %)
387 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCA_964199755.1
n/a 13,396
(1.62 %)
25,176
(2.03 %)
n/a 44.64
(99.99 %)
500
(0.01 %)
618
(100.00 %)
521,539
(5.15 %)
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(11.68 %)
5,827,639
(29.76 %)
44,532
(6.28 %)
388 yellow-throated sandgrouse (2019)
GCA_009769525.1
n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
28,848
(2.23 %)
389 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
26,357
(2.20 %)
390 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1
n/a 11,340
(1.85 %)
22,921
(2.37 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,647
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
24,649
(2.35 %)
391 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
19,512
(1.90 %)
392 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
23,838
(2.47 %)
393 zebra finch (Blue55 2020)
GCA_009859065.2
n/a 12,796
(1.92 %)
24,658
(2.44 %)
n/a 41.91
(98.03 %)
789
(1.97 %)
541
(100.00 %)
554,338
(9.67 %)
339,851
(2.27 %)
6,613,146
(20.04 %)
28,678
(2.32 %)
394 zebra finch (Blue55 maternal v3 2020)
GCA_008822115.3
n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,110
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
27,387
(2.57 %)
395 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1
n/a 12,384
(1.97 %)
23,021
(2.44 %)
n/a 41.74
(98.02 %)
828
(1.98 %)
202
(100.00 %)
511,324
(8.38 %)
351,624
(2.53 %)
6,328,918
(19.99 %)
25,871
(2.29 %)
396 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
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(2.56 %)
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(20.12 %)
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(2.36 %)
397 zebra finch (Blue55 v1.4 primary hap 2021)
GCF_003957565.2
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TOTALS:total assembly count 397

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Birds 397 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 1103 assemblies assembly stats track stats
Plants 303 assemblies assembly stats track stats
Fungi 899 assemblies assembly stats track stats
Viruses 287 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 107 assemblies assembly stats track stats
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CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 775 assemblies assembly stats track stats