Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	cpg islands
1	aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad) GCF_000298275.1	25,607 (1.08 %)	18,351 (1.06 %)	20,358 (0.98 %)	n/a	40.07 (76.89 %)	411,144 (23.15 %)	433,653 (76.85 %)	n/a	536,700 (0.74 %)	18,176,790 (39.08 %)	26,235 (0.40 %)
2	African grass rat (maternal 2020) GCA_011750645.1	n/a	20,916 (2.01 %)	19,513 (1.43 %)	n/a	41.37 (98.89 %)	1,526 (1.11 %)	1,610 (100.00 %)	4,928,847 (37.45 %)	1,652,295 (5.20 %)	13,507,965 (32.27 %)	17,712 (0.51 %)
3	African grass rat (paternal 2020) GCA_011762545.1	n/a	20,796 (2.00 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.42 (97.70 %)	1,563 (2.30 %)	1,740 (100.00 %)	4,904,243 (37.25 %)	1,672,608 (5.37 %)	13,465,246 (32.19 %)	17,677 (0.50 %)
4	African grass rat (paternal X 2020 refseq) GCF_011762505.1	45,963 (2.46 %)	20,878 (1.99 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	4,939,557 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,429 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
5	African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank) GCA_011762505.2	n/a	19,637 (1.95 %)	19,610 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	5,399,465 (42.90 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
6	African hunting dog GCA_001887905.1	n/a	18,956 (1.75 %)	17,562 (1.41 %)	n/a	40.98 (92.89 %)	1,415,298 (7.28 %)	803 (100.00 %)	4,458,183 (39.99 %)	658,637 (1.13 %)	13,671,493 (28.24 %)	47,644 (1.64 %)
7	African hunting dog (LycPic1hap1 2024) GCA_040955645.1	n/a	18,688 (1.61 %)	19,670 (1.44 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	82 (0.00 %)	86 (100.00 %)	4,281,139 (31.62 %)	959,378 (2.78 %)	12,859,760 (32.95 %)	49,122 (2.32 %)
8	African hunting dog (LycPic1hap2 2024) GCA_040955705.1	n/a	19,463 (1.58 %)	20,378 (1.42 %)	n/a	41.30 (100.00 %)	91 (0.00 %)	77 (100.00 %)	4,513,580 (32.16 %)	1,008,611 (2.91 %)	13,570,452 (33.71 %)	50,954 (2.21 %)
9	African savanna elephant (2009 refseq) GCF_000001905.1	46,043 (2.30 %)	19,169 (1.26 %)	19,664 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,363,315 (57.54 %)	365,797 (0.88 %)	16,073,053 (44.89 %)	33,513 (0.68 %)
10	African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1	n/a	18,845 (1.07 %)	22,426 (1.10 %)	n/a	41.34 (99.85 %)	169 (0.15 %)	1,253 (99.85 %)	4,406,744 (29.55 %)	925,868 (4.71 %)	15,966,881 (50.49 %)	68,531 (1.61 %)
11	African savanna elephant (hap2 2023 genbank) GCA_030014295.1	n/a	18,981 (1.10 %)	22,759 (1.12 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	880 (100.00 %)	4,426,756 (29.95 %)	832,908 (4.08 %)	16,118,910 (49.47 %)	62,315 (1.49 %)
12	African savanna elephant (hap2 2023 refseq) GCF_030014295.1	64,034 (3.35 %)	18,980 (1.10 %)	21,593 (1.06 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	879 (100.00 %)	4,426,749 (29.95 %)	832,904 (4.08 %)	16,118,888 (49.47 %)	62,314 (1.49 %)
13	agile gracile mouse opossum GCF_016433145.1	30,697 (1.32 %)	17,361 (0.78 %)	17,596 (0.81 %)	n/a	37.86 (91.75 %)	85,142 (8.25 %)	60,714 (100.00 %)	7,917,577 (49.04 %)	1,054,566 (1.57 %)	22,701,659 (37.69 %)	27,301 (0.49 %)
14	alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.4	54,987 (3.56 %)	18,439 (1.93 %)	18,426 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	166,272 (4.17 %)	77,389 (100.00 %)	3,004,413 (33.17 %)	315,092 (1.36 %)	12,458,272 (24.89 %)	54,502 (1.38 %)
15	Alpine marmot (2019) GCF_001458135.2	69,587 (3.43 %)	19,047 (1.54 %)	17,768 (1.39 %)	n/a	39.80 (96.13 %)	88,858 (3.88 %)	14,031 (100.00 %)	3,726,252 (26.48 %)	746,953 (1.83 %)	14,066,368 (30.30 %)	30,191 (0.63 %)
16	Alvarez's mastiff bat (A012 2023) GCA_031001765.1	n/a	19,086 (1.55 %)	22,040 (1.52 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,182 (0.01 %)	1,369 (99.99 %)	3,846,728 (31.78 %)	639,852 (2.90 %)	11,937,936 (38.98 %)	75,377 (2.21 %)
17	Alvarez's mastiff bat (hap1 2024) GCA_037157525.1	n/a	18,980 (1.50 %)	22,394 (1.50 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	80 (0.00 %)	326 (100.00 %)	3,896,863 (31.56 %)	659,711 (4.74 %)	11,945,162 (40.81 %)	76,769 (2.57 %)
18	Alvarez's mastiff bat (hap2 2024) GCA_037176705.1	n/a	19,066 (1.48 %)	22,356 (1.48 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	75 (0.00 %)	287 (100.00 %)	3,908,607 (31.48 %)	664,931 (5.23 %)	11,892,191 (41.08 %)	76,453 (2.43 %)
19	American beaver (Ward 2017 refseq) GCF_001984765.1	40,013 (2.15 %)	20,867 (1.53 %)	24,201 (1.33 %)	n/a	39.72 (99.99 %)	3,321 (0.01 %)	21,157 (100.00 %)	4,526,430 (33.75 %)	486,353 (1.30 %)	14,347,145 (31.96 %)	23,046 (0.72 %)
20	American bison (2014 refseq) GCF_000754665.1	38,686 (2.34 %)	19,782 (1.47 %)	20,444 (1.25 %)	n/a	41.82 (93.12 %)	341,984 (6.92 %)	470,415 (93.08 %)	n/a	419,596 (0.95 %)	13,519,877 (37.66 %)	60,388 (1.03 %)
21	American black bear (L20-20 alternate hap 2022) GCA_024610745.1	n/a	22,502 (1.17 %)	43,431 (1.28 %)	n/a	43.14 (99.99 %)	n/a	77,311 (100.00 %)	4,587,986 (32.30 %)	773,829 (6.39 %)	14,594,034 (35.67 %)	78,849 (3.32 %)
22	American black bear (L20-20 primary hap 2022) GCA_024610735.1	n/a	18,458 (1.52 %)	21,049 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	22 (0.00 %)	317 (100.00 %)	4,000,508 (32.69 %)	641,903 (5.91 %)	13,210,530 (35.54 %)	68,981 (3.00 %)
23	American black bear (UA15103 2021) GCF_020975775.1	53,916 (3.11 %)	18,840 (1.73 %)	20,969 (1.50 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	2,213 (100.00 %)	3,936,528 (34.53 %)	594,864 (2.90 %)	13,725,005 (32.35 %)	62,580 (1.91 %)
24	American mink (2018) GCA_900108605.1	n/a	18,686 (1.70 %)	20,016 (1.50 %)	36,997 (1.74 %)	41.60 (92.95 %)	154,172 (7.07 %)	161,347 (92.93 %)	4,350,343 (38.70 %)	606,128 (1.17 %)	13,605,797 (28.74 %)	54,199 (1.98 %)
25	American mink (hap1 2024) GCA_964106545.1	n/a	19,203 (1.43 %)	22,174 (1.33 %)	n/a	42.39 (99.98 %)	2,957 (0.02 %)	435 (100.00 %)	4,188,829 (30.04 %)	802,295 (5.81 %)	14,041,290 (37.98 %)	65,430 (2.64 %)
26	American mink (hap2 2024) GCA_964106205.1	n/a	18,890 (1.43 %)	21,684 (1.33 %)	n/a	42.35 (99.98 %)	2,849 (0.02 %)	3,200 (99.98 %)	4,158,563 (30.22 %)	786,430 (5.25 %)	13,845,377 (37.58 %)	64,307 (2.75 %)
27	American mink (M4711 2021 Dalhousie U) GCF_020171115.1	50,253 (2.26 %)	18,949 (1.49 %)	20,914 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	n/a	183 (100.00 %)	4,705,680 (39.15 %)	795,684 (5.50 %)	14,085,357 (37.99 %)	63,307 (2.38 %)
28	American pika (hap1 2023) GCF_030435755.1	45,008 (1.93 %)	17,997 (1.35 %)	23,185 (1.49 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	432 (0.00 %)	5,864 (100.00 %)	4,126,248 (43.60 %)	628,344 (15.71 %)	11,100,962 (42.69 %)	60,350 (1.67 %)
29	American pika (hap2 2023) GCA_030435715.1	n/a	16,911 (1.23 %)	21,107 (1.43 %)	n/a	44.43 (100.00 %)	375 (0.00 %)	6,123 (100.00 %)	1,808,768 (10.42 %)	561,106 (21.05 %)	10,283,513 (45.97 %)	54,919 (1.33 %)
30	American pika 3.0 (2012 Broad refseq) GCF_000292845.1	26,253 (1.93 %)	17,576 (1.61 %)	20,076 (1.70 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	132,962 (87.18 %)	2,761,257 (29.47 %)	414,896 (1.07 %)	10,968,698 (26.71 %)	44,652 (1.14 %)
31	American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020) GCF_014633375.1	31,887 (1.92 %)	17,532 (1.60 %)	19,609 (1.65 %)	n/a	43.35 (87.14 %)	124,941 (12.88 %)	9,351 (100.00 %)	2,827,662 (29.77 %)	414,980 (1.07 %)	10,969,165 (26.69 %)	44,743 (1.13 %)
32	Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq) GCF_000464555.1	33,681 (2.23 %)	17,929 (1.49 %)	15,090 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	157,032 (97.56 %)	n/a	831,136 (1.67 %)	13,654,437 (31.78 %)	65,229 (1.60 %)
33	Antarctic minke whale GCA_000978805.1	n/a	23,312 (1.49 %)	45,535 (1.26 %)	n/a	40.73 (99.37 %)	299,456 (0.64 %)	720,900 (99.36 %)	4,011,313 (41.13 %)	504,837 (1.04 %)	13,553,641 (30.96 %)	56,223 (1.31 %)
34	Antillean ghost-faced bat GCA_004026545.1	n/a	20,088 (1.74 %)	31,558 (1.63 %)	n/a	41.74 (99.97 %)	1,835 (0.01 %)	207,094 (99.99 %)	3,025,044 (30.67 %)	332,606 (0.70 %)	12,504,556 (28.79 %)	65,503 (2.30 %)
35	aoudad GCA_002201775.1	n/a	19,905 (1.62 %)	27,488 (1.60 %)	n/a	42.01 (95.96 %)	186,672 (4.05 %)	263,992 (95.95 %)	5,418,013 (45.05 %)	471,426 (1.19 %)	13,396,252 (36.94 %)	48,844 (1.32 %)
36	Arabian camel (Drom800 2019 refseq) GCF_000803125.2	64,519 (3.85 %)	18,483 (1.89 %)	20,554 (1.62 %)	n/a	41.51 (99.22 %)	47,342 (0.79 %)	21,070 (100.00 %)	3,233,022 (34.07 %)	345,049 (1.55 %)	13,383,050 (26.19 %)	58,872 (1.79 %)
37	Arabian camel (hap2 2024) GCA_036321565.1	n/a	17,085 (1.73 %)	19,317 (1.59 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	210 (0.00 %)	173 (100.00 %)	2,818,446 (29.44 %)	316,646 (8.90 %)	11,192,133 (31.47 %)	52,135 (1.67 %)
38	Arabian camel (paternal hap 2024 genbank) GCA_036321535.1	n/a	18,080 (1.66 %)	20,345 (1.52 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	172 (100.00 %)	3,040,473 (29.22 %)	343,482 (10.93 %)	11,797,012 (33.50 %)	55,428 (1.61 %)
39	Arabian camel (paternal hap 2024 refseq) GCF_036321535.1	62,940 (3.46 %)	18,078 (1.66 %)	21,071 (1.56 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	171 (100.00 %)	3,040,467 (29.22 %)	343,480 (10.93 %)	11,796,955 (33.50 %)	55,427 (1.61 %)
40	Arctic fox (Blue_001 2021 refseq) GCF_018345385.1	60,759 (3.11 %)	19,942 (1.72 %)	19,529 (1.38 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	529 (0.00 %)	929 (100.00 %)	4,821,229 (41.22 %)	1,006,124 (2.31 %)	13,556,149 (32.92 %)	49,997 (2.23 %)
41	Arctic ground squirrel GCF_003426925.1	39,569 (2.25 %)	18,954 (1.74 %)	19,372 (1.45 %)	n/a	39.95 (89.51 %)	2,429,461 (10.59 %)	15,883 (100.00 %)	4,400,304 (32.67 %)	672,831 (1.50 %)	13,913,477 (26.41 %)	27,575 (0.72 %)
42	Asian palm civet GCA_004024585.1	n/a	22,124 (1.43 %)	43,710 (1.39 %)	n/a	42.52 (99.95 %)	4,533 (0.02 %)	442,658 (99.98 %)	4,877,367 (40.32 %)	754,440 (1.35 %)	14,557,779 (32.29 %)	148,246 (5.67 %)
43	Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022) GCA_024166345.1	n/a	17,906 (1.18 %)	21,966 (1.14 %)	n/a	41.14 (100.00 %)	n/a	6,361 (100.00 %)	3,818,524 (29.72 %)	533,426 (3.22 %)	14,381,781 (47.30 %)	50,264 (1.15 %)
44	Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1	61,202 (2.60 %)	18,887 (1.13 %)	21,194 (1.06 %)	n/a	41.14 (99.90 %)	126 (0.10 %)	64 (100.00 %)	4,358,470 (31.27 %)	663,094 (4.56 %)	16,261,778 (48.66 %)	69,120 (1.32 %)
45	Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020) GCA_014523465.1	n/a	19,569 (1.59 %)	21,293 (1.35 %)	n/a	41.97 (99.68 %)	257 (0.32 %)	128 (100.00 %)	5,390,761 (47.15 %)	451,837 (1.15 %)	13,157,608 (40.67 %)	44,158 (1.19 %)
46	Asiatic tapir (hap1 2023) GCA_031878655.1	n/a	18,969 (1.75 %)	20,207 (1.36 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	79 (0.00 %)	262 (100.00 %)	3,650,963 (38.06 %)	355,322 (2.63 %)	14,837,952 (31.37 %)	37,174 (1.87 %)
47	Asiatic tapir (hap2 2023) GCA_031878705.1	n/a	18,931 (1.76 %)	19,988 (1.37 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	92 (0.00 %)	193 (100.00 %)	3,632,286 (38.21 %)	350,074 (2.22 %)	14,785,531 (30.90 %)	36,699 (1.70 %)
48	ass (Dezhou 2021) GCF_016077325.2	84,046 (4.01 %)	18,838 (1.75 %)	20,239 (1.42 %)	69,689 (3.29 %)	41.42 (99.86 %)	1,922 (0.15 %)	50 (100.00 %)	3,840,509 (41.57 %)	319,943 (0.81 %)	14,889,114 (29.46 %)	41,082 (1.37 %)
49	ass (Maral har 2015 refseq) GCF_001305755.1	48,989 (3.12 %)	18,838 (1.78 %)	19,295 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	69,593 (1.38 %)	2,167 (100.00 %)	3,731,432 (40.84 %)	289,737 (0.96 %)	14,695,308 (28.58 %)	40,025 (1.06 %)
50	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024) GCA_964270905.1	n/a	18,773 (1.50 %)	21,069 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,034 (0.01 %)	900 (100.00 %)	3,975,427 (35.64 %)	1,054,000 (10.27 %)	12,281,095 (41.92 %)	79,762 (4.08 %)
51	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024) GCA_964270935.1	n/a	17,961 (1.59 %)	20,087 (1.36 %)	n/a	42.05 (99.99 %)	917 (0.01 %)	1,796 (99.99 %)	3,626,392 (35.51 %)	824,778 (7.32 %)	11,499,904 (39.18 %)	74,348 (3.46 %)
52	Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020) GCA_015852515.1	n/a	13,505 (1.03 %)	18,978 (1.47 %)	n/a	45.32 (99.98 %)	26 (0.02 %)	3,482 (100.00 %)	6,880,857 (41.88 %)	1,099,932 (7.47 %)	8,156,735 (56.68 %)	70,515 (2.88 %)
53	Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1	42,938 (2.28 %)	14,891 (1.01 %)	19,714 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	524 (1.39 %)	310 (100.00 %)	7,814,876 (42.89 %)	1,219,764 (6.93 %)	9,488,325 (55.68 %)	78,364 (2.73 %)
54	Bactrian camel (Alxa 2014 refseq) GCF_000767855.1	52,178 (3.64 %)	18,303 (1.98 %)	17,097 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	67,435 (99.31 %)	2,966,704 (34.06 %)	306,997 (0.95 %)	12,209,949 (25.43 %)	49,790 (1.25 %)
55	banded mongoose GCA_004023785.1	n/a	21,568 (1.57 %)	30,427 (1.43 %)	n/a	42.00 (99.96 %)	4,510 (0.02 %)	316,874 (99.98 %)	4,768,524 (40.51 %)	684,187 (1.30 %)	13,713,756 (33.42 %)	78,648 (2.80 %)
56	bank vole GCF_902806735.1	56,410 (2.99 %)	18,977 (1.71 %)	18,408 (1.50 %)	n/a	41.86 (98.62 %)	53,506 (1.39 %)	54,142 (98.61 %)	3,222,366 (21.59 %)	933,697 (2.20 %)	12,831,232 (31.50 %)	18,784 (0.42 %)
57	banner-tailed kangaroo rat GCF_019054845.1	43,753 (1.82 %)	18,397 (1.18 %)	24,180 (1.39 %)	n/a	40.83 (100.00 %)	n/a	2,026 (100.00 %)	5,587,719 (30.97 %)	1,363,513 (3.95 %)	12,128,920 (48.74 %)	36,371 (1.27 %)
58	banteng 2023 GCF_032452875.1	71,974 (3.56 %)	19,305 (1.36 %)	21,174 (1.20 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	84 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	3,344,481 (20.63 %)	1,039,571 (11.74 %)	13,031,356 (47.36 %)	73,031 (1.72 %)
59	bats A.intermedius (hap2 2024) GCA_038363225.1	n/a	17,124 (1.63 %)	18,342 (1.54 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	56 (0.00 %)	187 (100.00 %)	2,597,378 (26.81 %)	332,733 (4.43 %)	10,957,327 (33.52 %)	63,688 (2.22 %)
60	beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020) GCA_009917745.1	n/a	19,239 (1.79 %)	22,513 (1.43 %)	35,878 (1.82 %)	41.25 (97.57 %)	27,070 (2.43 %)	52,780 (97.57 %)	4,021,599 (43.53 %)	544,323 (1.08 %)	12,738,162 (33.47 %)	59,710 (1.51 %)
61	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019) GCF_002288925.2	59,400 (3.08 %)	18,667 (1.79 %)	20,314 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.49 %)	24,414 (1.52 %)	29,444 (98.48 %)	4,001,248 (43.73 %)	543,276 (1.11 %)	12,802,735 (34.18 %)	59,307 (1.53 %)
62	big brown bat (BU_THK_EF1 2012) GCF_000308155.1	59,162 (3.17 %)	18,334 (1.94 %)	20,121 (1.78 %)	n/a	42.93 (89.41 %)	160,269 (10.62 %)	167,057 (89.38 %)	2,842,065 (25.82 %)	614,712 (1.89 %)	10,407,733 (28.90 %)	66,720 (2.99 %)
63	big brown bat (TK198812 2023) GCF_027574615.1	46,266 (2.61 %)	18,620 (1.80 %)	21,271 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	75 (0.00 %)	48 (100.00 %)	3,041,145 (25.08 %)	904,075 (3.80 %)	10,530,666 (37.05 %)	77,605 (3.68 %)
64	bighorn sheep (Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCF_042477335.1	75,387 (2.66 %)	18,667 (1.37 %)	20,248 (1.35 %)	n/a	44.07 (100.00 %)	3 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,081,260 (20.10 %)	796,298 (12.14 %)	12,235,764 (46.75 %)	50,538 (11.18 %)
65	bighorn sheep (BS48 2019) GCA_004026945.1	n/a	23,059 (1.34 %)	36,486 (1.19 %)	n/a	43.20 (99.90 %)	9,412 (0.03 %)	1,057,548 (99.97 %)	6,321,577 (50.75 %)	716,846 (1.66 %)	13,904,326 (44.98 %)	95,564 (1.72 %)
66	bilby (mMagLag1 2024) GCA_037893015.1	n/a	18,686 (0.72 %)	17,238 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	4,431 (0.34 %)	609 (100.00 %)	6,263,094 (27.34 %)	2,223,995 (5.89 %)	23,994,844 (43.69 %)	51,039 (3.47 %)
67	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024) GCA_043290085.1	n/a	20,713 (0.64 %)	21,469 (0.64 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	770 (0.00 %)	470 (100.00 %)	3,860,121 (14.52 %)	1,230,113 (2.81 %)	1,239 (100.00 %)	49,878 (0.73 %)
68	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024) GCA_043290065.1	n/a	19,814 (0.63 %)	20,140 (0.63 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	723 (0.00 %)	315 (100.00 %)	3,657,357 (14.24 %)	1,158,716 (2.84 %)	22,924,986 (64.53 %)	46,774 (0.90 %)
69	black flying fox GCF_000325575.1	46,978 (3.15 %)	18,089 (2.00 %)	20,668 (1.75 %)	n/a	39.74 (97.93 %)	104,566 (2.08 %)	170,164 (97.92 %)	2,975,186 (34.05 %)	481,859 (1.45 %)	12,582,349 (26.52 %)	62,483 (3.88 %)
70	black rat GCF_011064425.1	39,601 (2.37 %)	20,793 (1.98 %)	17,944 (1.37 %)	n/a	42.14 (99.98 %)	6,158 (0.02 %)	2,173 (100.00 %)	4,715,157 (41.57 %)	1,432,294 (3.45 %)	13,275,550 (32.36 %)	18,055 (0.48 %)
71	black rhinoceros (alternate hap 2021) GCA_020826835.1	n/a	19,000 (1.37 %)	22,547 (1.26 %)	n/a	41.56 (99.97 %)	178 (0.03 %)	1,199 (100.00 %)	4,340,245 (37.22 %)	564,468 (8.07 %)	14,384,523 (40.40 %)	44,971 (1.16 %)
72	black rhinoceros (BS38 2019 Broad) GCA_004027315.1	n/a	21,713 (1.32 %)	32,731 (1.18 %)	n/a	41.22 (99.85 %)	7,256 (0.02 %)	2,029,914 (99.98 %)	4,618,655 (36.76 %)	618,834 (2.21 %)	16,248,532 (40.32 %)	44,113 (0.97 %)
73	black rhinoceros (primary hap 2021 refseq) GCF_020826845.1	56,255 (2.28 %)	18,774 (1.38 %)	22,348 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	215 (0.05 %)	1,076 (100.00 %)	4,200,390 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,693 (40.14 %)	43,525 (1.14 %)
74	black-footed cat GCA_004023925.1	n/a	22,895 (1.14 %)	51,789 (1.13 %)	n/a	41.92 (99.90 %)	13,476 (0.06 %)	603,600 (99.94 %)	5,261,265 (44.11 %)	943,514 (1.77 %)	13,681,435 (34.77 %)	86,892 (2.23 %)
75	black-footed ferret (SB6536 2022) GCF_022355385.1	56,402 (2.78 %)	18,681 (1.55 %)	20,685 (1.40 %)	n/a	41.55 (96.71 %)	33,042 (3.30 %)	20,575 (100.00 %)	4,087,717 (30.94 %)	695,805 (1.18 %)	13,880,116 (32.08 %)	54,060 (2.11 %)
76	black-lipped pika GCF_017591425.1	46,297 (2.64 %)	18,529 (1.63 %)	23,458 (1.83 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	54 (0.00 %)	2,214 (100.00 %)	1,843,705 (12.62 %)	471,798 (2.76 %)	11,394,992 (31.27 %)	63,124 (1.85 %)
77	Blainville's beaked whale (alternate hap 2022) GCA_025094165.1	n/a	17,838 (1.54 %)	21,389 (1.35 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,198 (100.00 %)	3,542,727 (35.35 %)	650,369 (8.86 %)	10,971,320 (41.15 %)	62,389 (1.68 %)
78	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq) GCF_025265405.1	47,540 (2.07 %)	19,041 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	97 (0.03 %)	74 (100.00 %)	3,964,038 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,229 (41.78 %)	70,851 (1.80 %)
79	blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019) GCA_008658375.1	n/a	17,285 (1.80 %)	21,295 (1.43 %)	n/a	41.22 (100.00 %)	n/a	12,574 (100.00 %)	3,196,354 (43.47 %)	467,194 (1.26 %)	10,176,588 (33.66 %)	56,916 (1.85 %)
80	Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020) GCA_008658375.2	n/a	16,997 (1.82 %)	20,609 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	3 (0.00 %)	10,999 (100.00 %)	3,126,800 (43.49 %)	454,452 (1.23 %)	9,916,868 (33.63 %)	55,436 (1.85 %)
81	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2	58,750 (2.71 %)	19,162 (1.80 %)	20,576 (1.41 %)	36,291 (1.99 %)	40.88 (98.91 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,870 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,384 (34.60 %)	67,032 (1.73 %)
82	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022) GCA_022079275.1	n/a	24,877 (1.23 %)	48,382 (1.39 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	4,716 (0.01 %)	72,827 (99.99 %)	6,403,412 (33.31 %)	1,269,531 (1.94 %)	17,771,689 (33.82 %)	100,915 (3.00 %)
83	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022) GCF_022079265.1	45,362 (2.39 %)	18,576 (1.65 %)	20,510 (1.41 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	24 (0.00 %)	75 (100.00 %)	4,970,082 (43.28 %)	894,002 (1.80 %)	13,648,384 (34.21 %)	69,211 (2.68 %)
84	boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023) GCA_019903745.2	n/a	20,135 (1.60 %)	22,598 (1.47 %)	n/a	41.46 (96.98 %)	34,682 (3.03 %)	12,266 (100.00 %)	3,134,107 (24.41 %)	394,920 (0.92 %)	13,154,929 (36.43 %)	48,826 (1.07 %)
85	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022) GCA_024803775.1	n/a	18,647 (0.96 %)	23,998 (1.13 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	124 (0.00 %)	3,340 (100.00 %)	3,775,862 (22.40 %)	1,257,803 (21.71 %)	9,347,543 (61.85 %)	33,757 (1.35 %)
86	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022) GCA_024803745.1	n/a	17,791 (1.12 %)	22,667 (1.29 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	106 (0.00 %)	2,898 (100.00 %)	6,293,452 (41.30 %)	1,076,688 (17.94 %)	8,553,272 (57.13 %)	31,102 (1.31 %)
87	Botta's pocket gopher (hap1 2023) GCA_031878675.1	n/a	18,247 (1.61 %)	22,673 (1.83 %)	n/a	41.12 (99.99 %)	775 (0.01 %)	835 (100.00 %)	2,918,285 (18.64 %)	868,090 (5.77 %)	9,427,604 (40.78 %)	27,049 (1.25 %)
88	Botta's pocket gopher (hap2 2023) GCA_031878665.1	n/a	17,612 (1.68 %)	22,099 (1.91 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	541 (0.01 %)	365 (100.00 %)	2,748,918 (17.16 %)	827,542 (4.51 %)	8,832,809 (39.20 %)	26,416 (1.35 %)
89	boutu (hap1 2024) GCA_036417435.1	n/a	18,667 (1.46 %)	20,817 (1.26 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	284 (0.00 %)	903 (100.00 %)	4,004,895 (35.23 %)	925,158 (12.15 %)	11,999,784 (42.65 %)	63,428 (1.55 %)
90	boutu (hap2 2024) GCA_036417475.1	n/a	17,954 (1.51 %)	19,994 (1.30 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	240 (0.00 %)	800 (100.00 %)	3,723,164 (34.96 %)	809,880 (11.02 %)	11,359,211 (41.42 %)	60,067 (1.55 %)
91	Brandt's bat GCF_000412655.1	46,912 (2.84 %)	19,267 (1.75 %)	18,495 (1.62 %)	n/a	42.59 (94.06 %)	155,664 (5.95 %)	325,414 (94.05 %)	2,897,662 (25.08 %)	634,208 (3.20 %)	11,323,618 (31.06 %)	66,749 (1.59 %)
92	Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023) GCA_030848825.1	n/a	19,039 (1.66 %)	21,660 (1.59 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	20 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,805,818 (31.80 %)	640,446 (2.50 %)	11,793,353 (36.15 %)	68,896 (2.40 %)
93	Brazilian guinea pig GCA_000688575.1	n/a	16,531 (1.49 %)	11,177 (1.44 %)	n/a	39.81 (64.76 %)	2,565,595 (35.61 %)	3,131 (100.00 %)	2,529,479 (25.87 %)	342,907 (0.66 %)	10,719,517 (21.05 %)	19,508 (0.31 %)
94	Brazilian tapir GCA_004025025.1	n/a	21,581 (1.61 %)	30,818 (1.32 %)	n/a	41.12 (99.93 %)	2,273 (0.01 %)	805,779 (99.99 %)	3,877,938 (38.36 %)	344,032 (0.79 %)	15,601,710 (32.81 %)	43,382 (1.17 %)
95	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018) GCF_003584765.2	50,242 (2.92 %)	18,811 (1.77 %)	21,073 (1.52 %)	n/a	41.84 (99.31 %)	17,380 (0.70 %)	21,813 (99.30 %)	4,201,043 (40.86 %)	567,586 (1.23 %)	13,807,211 (30.86 %)	62,125 (1.80 %)
96	brown bear (v2.0 North America Adak 2023) GCF_023065955.2	66,371 (4.20 %)	18,615 (1.68 %)	21,434 (1.53 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	250 (0.00 %)	362 (100.00 %)	4,030,019 (33.22 %)	630,008 (4.17 %)	13,240,060 (32.92 %)	64,814 (2.05 %)
97	brown big-eared bat (primary hap 2023) GCA_963455305.1	n/a	19,138 (1.72 %)	20,370 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	1,237 (0.01 %)	65 (100.00 %)	3,201,470 (26.24 %)	957,903 (4.27 %)	10,687,995 (39.65 %)	60,671 (2.39 %)
98	brown-throated sloth GCA_004027775.1	n/a	17,043 (1.21 %)	37,090 (1.36 %)	n/a	42.76 (99.76 %)	462 (0.00 %)	1,772,267 (100.00 %)	2,487,215 (36.18 %)	316,812 (1.60 %)	7,948,666 (37.96 %)	62,325 (2.36 %)
99	cactus mouse (2023) GCF_949786415.1	47,524 (2.02 %)	18,894 (1.46 %)	20,159 (1.22 %)	n/a	42.40 (99.98 %)	2,603 (0.02 %)	4,297 (100.00 %)	7,181,232 (52.75 %)	1,247,378 (18.35 %)	13,329,318 (43.03 %)	19,540 (0.49 %)
100	California mouse (IS 2022) GCF_007827085.1	62,274 (3.80 %)	18,959 (1.75 %)	19,378 (1.41 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	547 (0.00 %)	237 (100.00 %)	5,970,582 (45.08 %)	1,165,743 (3.67 %)	13,734,349 (33.67 %)	19,529 (0.58 %)
101	California sea lion (alternate hap 2019) GCA_009762295.1	n/a	18,348 (1.81 %)	18,692 (1.47 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,093 (100.00 %)	3,722,619 (42.89 %)	488,086 (1.26 %)	10,893,132 (33.14 %)	44,449 (1.57 %)
102	California sea lion (LMU 2018 refseq) GCF_900631625.1	69,240 (2.99 %)	20,741 (1.78 %)	20,298 (1.40 %)	n/a	41.38 (99.81 %)	47,716 (0.20 %)	10,423 (100.00 %)	4,530,259 (43.28 %)	573,086 (1.12 %)	13,442,336 (33.58 %)	50,583 (1.46 %)
103	California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020) GCA_009762295.2	n/a	18,319 (1.81 %)	18,772 (1.48 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,096 (100.00 %)	3,724,021 (42.91 %)	488,356 (1.26 %)	10,891,276 (33.15 %)	44,467 (1.57 %)
104	California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2	70,801 (3.05 %)	20,915 (1.77 %)	20,179 (1.40 %)	44,926 (2.10 %)	41.40 (99.23 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,525,652 (43.65 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,648 (33.76 %)	51,899 (1.50 %)
105	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023) GCA_028537755.1	n/a	19,409 (1.86 %)	20,578 (1.69 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	43 (0.00 %)	310 (100.00 %)	3,161,054 (22.60 %)	891,453 (5.62 %)	11,087,206 (33.12 %)	19,104 (0.65 %)
106	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023) GCA_028537955.1	n/a	19,681 (1.86 %)	21,257 (1.62 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	51 (0.00 %)	350 (100.00 %)	4,957,057 (42.33 %)	943,226 (5.63 %)	11,695,871 (33.83 %)	20,062 (0.64 %)
107	Canada lynx (alternate hap LIC74 2019) GCA_007474575.1	n/a	12,029 (1.42 %)	15,171 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	3 (0.00 %)	15,036 (100.00 %)	2,937,491 (43.50 %)	544,410 (1.76 %)	7,641,565 (32.72 %)	39,082 (2.44 %)
108	Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020) GCA_007474575.2	n/a	12,041 (1.42 %)	15,226 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	5 (0.00 %)	15,046 (100.00 %)	2,939,291 (43.50 %)	544,849 (1.76 %)	7,650,345 (32.74 %)	39,099 (2.44 %)
109	Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2	50,142 (2.69 %)	18,273 (1.65 %)	19,264 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	842 (0.12 %)	54 (100.00 %)	5,011,165 (43.72 %)	904,525 (1.75 %)	13,467,551 (34.19 %)	66,799 (2.48 %)
110	Cantor's roundleaf bat GCA_004027415.1	n/a	23,788 (1.42 %)	45,328 (1.68 %)	38,254 (1.57 %)	41.36 (99.91 %)	6,366 (0.03 %)	846,566 (99.97 %)	3,997,370 (31.48 %)	775,742 (1.42 %)	12,770,948 (33.45 %)	41,527 (1.41 %)
111	Cape elephant shrew GCF_000299155.1	25,406 (1.08 %)	23,258 (1.07 %)	24,266 (1.16 %)	n/a	40.30 (86.29 %)	279,394 (13.74 %)	288,162 (86.26 %)	3,765,232 (16.90 %)	604,351 (0.89 %)	20,072,078 (42.36 %)	25,977 (0.42 %)
112	Cape golden mole (2012 Broad) GCF_000296735.1	25,323 (1.07 %)	20,961 (1.07 %)	21,723 (1.04 %)	n/a	40.01 (79.93 %)	370,844 (20.11 %)	391,344 (79.89 %)	4,924,640 (21.03 %)	500,830 (1.95 %)	18,946,663 (41.18 %)	21,186 (0.33 %)
113	Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014) GCA_000152225.2	n/a	18,455 (1.10 %)	22,103 (1.12 %)	n/a	41.00 (88.89 %)	259,879 (11.14 %)	325,568 (88.86 %)	6,210,235 (51.92 %)	381,915 (1.06 %)	20,080,212 (36.28 %)	29,690 (0.50 %)
114	Cape rock hyrax (US060 2019 Broad) GCA_004026925.1	n/a	21,401 (0.85 %)	45,353 (1.14 %)	n/a	41.08 (99.93 %)	4,203 (0.01 %)	1,048,940 (99.99 %)	7,222,494 (54.48 %)	430,286 (0.85 %)	21,775,991 (44.61 %)	37,158 (0.70 %)
115	capybara GCA_004027455.1	n/a	20,152 (1.22 %)	28,931 (1.29 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	5,747 (0.02 %)	661,089 (99.98 %)	4,220,878 (29.16 %)	777,357 (2.04 %)	15,214,944 (35.16 %)	34,558 (0.85 %)
116	carabao (swamp buffalo K-KA32 2023) GCF_029407905.1	77,279 (2.89 %)	19,433 (1.40 %)	21,166 (1.23 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	21 (0.00 %)	115 (100.00 %)	3,479,445 (21.92 %)	547,054 (6.39 %)	12,840,677 (45.22 %)	99,752 (3.73 %)
117	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,927 (4.11 %)	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	46,864 (1.37 %)
118	cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014) GCF_000003055.6	57,977 (2.74 %)	19,583 (1.56 %)	20,581 (1.31 %)	n/a	41.82 (99.23 %)	74,464 (0.78 %)	75,598 (99.22 %)	5,607,556 (49.02 %)	440,521 (1.25 %)	13,167,657 (40.78 %)	42,869 (1.24 %)
119	Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad) GCA_004024745.2	n/a	18,603 (1.52 %)	22,330 (1.36 %)	n/a	42.35 (98.12 %)	57,013 (1.80 %)	1,240,743 (98.20 %)	5,255,211 (43.27 %)	2,502,373 (4.37 %)	12,968,788 (40.96 %)	172,178 (3.66 %)
120	cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022) GCF_027475565.1	80,997 (4.53 %)	18,420 (1.70 %)	19,561 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	22 (0.00 %)	195 (100.00 %)	4,611,842 (35.10 %)	837,685 (1.68 %)	13,649,125 (33.06 %)	60,367 (2.22 %)
121	cheetah (Rico 2018) GCF_003709585.1	72,154 (3.33 %)	18,472 (1.70 %)	20,443 (1.42 %)	n/a	41.55 (99.55 %)	24,173 (0.45 %)	3,220 (100.00 %)	4,853,945 (42.85 %)	831,106 (1.53 %)	13,663,571 (32.84 %)	60,744 (2.17 %)
122	Chinese forest musk deer (Sichuan 2022) GCF_022376915.1	51,612 (2.80 %)	19,565 (1.43 %)	22,280 (1.29 %)	n/a	42.30 (99.97 %)	1,781 (0.03 %)	2,446 (100.00 %)	3,257,347 (21.65 %)	399,120 (3.81 %)	12,906,274 (43.79 %)	46,689 (1.12 %)
123	Chinese hamster (17A/GY CHO 2020) GCF_003668045.3	55,440 (2.79 %)	20,030 (1.84 %)	18,721 (1.41 %)	67,900 (3.41 %)	41.51 (99.90 %)	4,164 (0.10 %)	647 (100.00 %)	8,121,057 (33.74 %)	1,095,058 (2.91 %)	12,923,274 (32.25 %)	19,341 (0.58 %)
124	Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI) GCF_000223135.1	45,993 (2.59 %)	20,602 (1.78 %)	17,467 (1.35 %)	n/a	41.37 (96.61 %)	156,635 (3.40 %)	265,787 (96.60 %)	4,541,936 (33.03 %)	1,072,129 (2.66 %)	13,150,189 (30.04 %)	12,522 (0.25 %)
125	Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd) GCA_900186095.1	n/a	19,874 (1.85 %)	19,298 (1.44 %)	n/a	41.45 (98.56 %)	63,334 (1.45 %)	71,598 (98.55 %)	4,521,726 (33.66 %)	1,060,619 (2.55 %)	12,867,288 (31.26 %)	17,960 (0.54 %)
126	Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022) GCA_026545065.1	n/a	20,293 (1.81 %)	18,881 (1.42 %)	n/a	41.62 (71.16 %)	924,541 (28.93 %)	1,236,122 (71.07 %)	4,330,728 (30.92 %)	987,319 (3.70 %)	13,374,062 (21.92 %)	18,838 (0.40 %)
127	Chinese pangolin (2020 Yunnan U) GCF_014570555.1	69,694 (3.21 %)	18,206 (1.70 %)	20,508 (1.48 %)	n/a	40.79 (95.54 %)	34,903 (4.47 %)	4,694 (100.00 %)	2,927,176 (35.60 %)	269,964 (0.67 %)	12,610,535 (29.10 %)	35,278 (1.05 %)
128	Chinese pangolin (hap1 2023) GCF_030020395.1	71,445 (2.98 %)	18,379 (1.34 %)	21,837 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	383 (0.23 %)	661 (100.00 %)	3,318,871 (34.65 %)	618,193 (3.68 %)	12,009,669 (39.02 %)	47,708 (1.22 %)
129	Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023) GCA_030020945.1	n/a	18,538 (1.34 %)	21,724 (1.27 %)	n/a	41.09 (99.48 %)	190 (0.52 %)	700 (100.00 %)	3,362,899 (34.48 %)	678,384 (4.11 %)	12,024,241 (39.52 %)	48,960 (1.19 %)
130	Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU) GCA_000738955.1	n/a	18,749 (1.63 %)	22,506 (1.40 %)	n/a	40.93 (90.69 %)	257,424 (9.33 %)	230,927 (90.67 %)	2,691,116 (34.48 %)	316,518 (1.96 %)	11,538,086 (25.40 %)	30,693 (0.58 %)
131	Chinese rufous horseshoe bat GCA_001888835.1	n/a	26,871 (2.34 %)	25,467 (1.89 %)	n/a	40.52 (97.22 %)	212,601 (2.80 %)	63,439 (100.00 %)	3,219,611 (33.86 %)	495,126 (1.20 %)	12,476,551 (27.16 %)	32,993 (0.98 %)
132	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCA_036562045.1	n/a	17,893 (1.95 %)	19,249 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,055,304 (33.11 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,144 (29.52 %)	30,884 (1.08 %)
133	Chinese tree shrew GCF_000334495.1	47,005 (2.07 %)	21,375 (1.39 %)	19,231 (1.28 %)	n/a	41.73 (95.10 %)	191,695 (4.92 %)	242,445 (95.08 %)	5,060,321 (23.05 %)	1,046,388 (4.15 %)	14,978,259 (38.04 %)	88,806 (1.44 %)
134	chiru GCA_000400835.1	n/a	20,320 (1.60 %)	42,654 (2.51 %)	n/a	42.01 (93.04 %)	283,069 (7.00 %)	298,127 (93.00 %)	5,342,241 (43.54 %)	425,329 (1.25 %)	13,714,420 (34.66 %)	43,135 (1.89 %)
135	clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023) GCA_028018655.1	n/a	16,430 (1.52 %)	21,057 (1.44 %)	n/a	41.79 (100.00 %)	n/a	10,377 (100.00 %)	3,845,437 (33.39 %)	794,587 (2.14 %)	10,765,695 (33.40 %)	56,375 (2.45 %)
136	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1	81,219 (3.62 %)	18,300 (1.65 %)	20,361 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	181 (0.06 %)	33 (100.00 %)	4,224,269 (34.84 %)	992,668 (2.08 %)	13,618,866 (34.42 %)	67,830 (2.45 %)
137	common bottlenose dolphin (maternal 2020) GCA_011762535.1	n/a	18,837 (1.77 %)	20,857 (1.43 %)	n/a	41.43 (99.73 %)	649 (0.27 %)	985 (100.00 %)	4,073,893 (46.15 %)	630,039 (2.15 %)	12,628,219 (35.41 %)	65,379 (1.89 %)
138	common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020) GCF_011762595.1	67,207 (3.31 %)	18,766 (1.77 %)	20,528 (1.42 %)	35,852 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,069,115 (46.17 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,891 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
139	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq) GCF_001922835.1	45,975 (2.99 %)	17,255 (1.69 %)	17,058 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	114,003 (0.57 %)	2,648 (100.00 %)	3,845,938 (43.89 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,098 (32.18 %)	48,030 (1.35 %)
140	common bottlenose dolphin (paternal 2020) GCA_011762515.1	n/a	18,537 (1.77 %)	20,619 (1.44 %)	n/a	41.42 (98.08 %)	868 (1.92 %)	1,166 (100.00 %)	3,997,801 (45.93 %)	609,838 (1.85 %)	12,400,272 (34.53 %)	64,630 (1.84 %)
141	common brushtail (alternate hap 2020) GCA_011100645.1	n/a	14,863 (0.75 %)	15,426 (0.89 %)	n/a	39.41 (100.00 %)	313 (0.00 %)	12,446 (100.00 %)	5,846,769 (38.56 %)	987,917 (1.99 %)	16,764,356 (40.14 %)	13,303 (0.35 %)
142	common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1	37,674 (1.80 %)	18,653 (0.80 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,116 (38.90 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,306 (40.56 %)	17,762 (0.38 %)
143	common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1	n/a	17,216 (1.82 %)	19,202 (1.79 %)	n/a	42.55 (99.97 %)	1,546 (0.03 %)	323 (100.00 %)	2,953,532 (23.94 %)	805,142 (2.83 %)	9,964,846 (34.69 %)	57,295 (2.83 %)
144	common pipistrelle (alternate hap 2020) GCA_903992515.1	n/a	15,974 (1.72 %)	20,563 (1.66 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	12 (0.00 %)	10,459 (100.00 %)	2,634,333 (23.76 %)	703,674 (2.65 %)	8,909,525 (33.95 %)	50,430 (2.54 %)
145	common pipistrelle (Broad 2019) GCA_004026625.1	n/a	21,938 (1.35 %)	53,915 (1.60 %)	n/a	42.88 (99.88 %)	10,870 (0.05 %)	736,974 (99.95 %)	3,499,501 (22.91 %)	1,046,301 (2.96 %)	11,759,516 (37.96 %)	92,062 (3.23 %)
146	common vampire bat (HL8 alternate hap 2022) GCA_022682395.1	n/a	17,520 (1.75 %)	18,995 (1.67 %)	n/a	42.89 (99.99 %)	580 (0.01 %)	430 (100.00 %)	2,597,497 (28.17 %)	356,620 (2.88 %)	10,797,225 (31.23 %)	61,931 (2.30 %)
147	common vampire bat (HL8 alternate hap 2022) GCA_022682395.2	n/a	17,485 (1.76 %)	18,907 (1.66 %)	n/a	42.87 (99.99 %)	576 (0.01 %)	429 (100.00 %)	2,592,246 (28.20 %)	352,985 (2.87 %)	10,737,944 (31.11 %)	61,125 (2.28 %)
148	common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.1	58,054 (3.40 %)	18,280 (1.71 %)	19,515 (1.59 %)	n/a	42.98 (99.99 %)	611 (0.01 %)	573 (100.00 %)	2,761,826 (28.38 %)	427,942 (3.89 %)	11,250,529 (32.57 %)	70,701 (2.48 %)
149	common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022) GCA_022682495.2	n/a	18,311 (1.71 %)	19,456 (1.59 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	615 (0.01 %)	573 (100.00 %)	2,767,071 (28.35 %)	431,575 (3.90 %)	11,286,853 (32.63 %)	71,506 (2.50 %)
150	common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018) GCF_002940915.2	51,031 (3.24 %)	18,503 (1.88 %)	18,071 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,246 (2.23 %)	83,364 (97.77 %)	2,799,509 (29.62 %)	275,242 (1.03 %)	11,796,826 (28.19 %)	51,634 (1.37 %)
151	common warthog (WHEZ1 2021) GCF_016906955.1	55,088 (2.64 %)	18,264 (1.56 %)	19,251 (1.34 %)	54,816 (2.83 %)	41.95 (99.61 %)	523 (0.39 %)	194 (100.00 %)	3,898,243 (30.33 %)	588,742 (1.17 %)	12,955,929 (36.44 %)	75,592 (1.86 %)
152	common wombat GCF_900497805.2	46,365 (1.78 %)	19,437 (0.86 %)	18,947 (0.96 %)	n/a	38.86 (99.68 %)	67,461 (0.33 %)	14,183 (100.00 %)	8,645,969 (41.99 %)	1,203,246 (1.61 %)	23,878,215 (39.11 %)	18,752 (0.37 %)
153	Corsac fox (zsh2022 2023) GCA_030463245.1	n/a	19,527 (1.61 %)	18,923 (1.35 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	107 (0.00 %)	202 (100.00 %)	4,435,406 (32.05 %)	981,019 (1.98 %)	13,673,245 (32.65 %)	49,252 (2.20 %)
154	coyote (coyote_06102 2023) GCA_034620425.1	n/a	19,251 (1.60 %)	19,585 (1.40 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	93 (0.00 %)	120 (100.00 %)	4,493,000 (32.28 %)	982,814 (2.01 %)	13,803,318 (33.09 %)	50,777 (2.23 %)
155	creeping vole GCF_018167655.1	54,941 (2.31 %)	23,033 (1.55 %)	25,427 (1.53 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	n/a	2,147 (100.00 %)	4,549,519 (25.66 %)	1,153,429 (13.60 %)	13,568,297 (40.65 %)	23,141 (0.54 %)
156	crested porcupine GCA_004026905.1	n/a	21,005 (1.32 %)	35,975 (1.39 %)	n/a	41.51 (99.89 %)	4,351 (0.02 %)	1,140,949 (99.98 %)	4,303,147 (30.69 %)	600,488 (1.19 %)	14,049,490 (33.80 %)	57,196 (1.33 %)
157	Cuvier's beaked whale GCA_004364475.1	n/a	23,700 (0.90 %)	51,715 (0.86 %)	n/a	42.01 (99.76 %)	3,229 (0.01 %)	3,761,505 (99.99 %)	6,544,424 (43.61 %)	1,417,186 (3.11 %)	16,127,873 (42.25 %)	68,668 (1.15 %)
158	Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI) GCF_000743615.1	52,373 (2.57 %)	17,983 (1.45 %)	17,063 (1.43 %)	n/a	40.34 (97.96 %)	87,815 (2.05 %)	162,545 (97.95 %)	4,053,433 (30.86 %)	545,281 (1.74 %)	13,406,483 (30.65 %)	37,008 (0.74 %)
159	Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo) GCF_012274545.1	58,091 (2.74 %)	17,780 (1.44 %)	16,515 (1.42 %)	n/a	40.34 (97.94 %)	88,899 (2.07 %)	73,970 (100.00 %)	4,035,140 (30.95 %)	544,772 (1.73 %)	13,390,872 (30.61 %)	37,008 (0.74 %)
160	dassie-rat GCA_004026965.1	n/a	20,479 (1.16 %)	42,937 (1.41 %)	n/a	41.86 (99.89 %)	9,645 (0.04 %)	920,324 (99.96 %)	4,563,054 (28.83 %)	660,623 (1.92 %)	12,899,807 (34.48 %)	46,569 (1.25 %)
161	Daubenton's bat (alternate hap 2023) GCA_963242275.1	n/a	18,895 (1.78 %)	24,235 (1.81 %)	n/a	43.39 (100.00 %)	n/a	4,930 (100.00 %)	2,813,870 (23.75 %)	718,406 (5.18 %)	9,977,320 (37.24 %)	62,910 (2.66 %)
162	Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963259705.1	64,558 (3.32 %)	19,141 (1.72 %)	22,133 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	1,099 (0.01 %)	121 (100.00 %)	3,040,232 (24.03 %)	796,911 (6.38 %)	10,478,180 (38.84 %)	64,920 (2.51 %)
163	Daurian ground squirrel GCA_002406435.1	n/a	20,990 (1.31 %)	17,575 (1.17 %)	n/a	39.77 (96.15 %)	141,850 (3.84 %)	502,654 (96.16 %)	5,783,538 (34.36 %)	924,038 (3.73 %)	17,533,301 (30.85 %)	27,955 (0.39 %)
164	David's myotis bat GCF_000327345.1	37,645 (2.70 %)	18,744 (1.78 %)	17,565 (1.62 %)	n/a	42.69 (91.23 %)	223,511 (8.80 %)	325,280 (91.20 %)	2,680,166 (23.79 %)	532,273 (1.90 %)	11,016,028 (29.55 %)	59,615 (1.59 %)
165	degu (3935 2012 refseq) GCF_000260255.1	48,152 (2.13 %)	22,242 (1.41 %)	22,101 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,772 (15.68 %)	259,904 (84.32 %)	4,901,673 (27.74 %)	898,945 (1.50 %)	14,282,003 (29.30 %)	40,135 (0.82 %)
166	desert hamster (2022) GCF_943737965.1	37,279 (2.11 %)	19,744 (1.74 %)	20,215 (1.50 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	n/a	2,079 (100.00 %)	4,038,079 (31.01 %)	1,132,871 (2.71 %)	11,946,112 (32.62 %)	17,053 (0.51 %)
167	Desmarest's hutia GCA_004027915.1	n/a	23,535 (0.78 %)	50,796 (0.95 %)	n/a	42.03 (99.83 %)	3,492 (0.01 %)	2,355,850 (99.99 %)	5,790,506 (26.72 %)	1,062,134 (1.71 %)	16,977,224 (35.29 %)	54,479 (1.01 %)
168	dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW) GCF_012295265.1	102,060 (4.04 %)	19,777 (1.69 %)	20,341 (1.41 %)	n/a	41.29 (99.69 %)	325 (0.31 %)	477 (100.00 %)	4,950,808 (42.83 %)	1,033,921 (2.36 %)	13,745,703 (33.32 %)	51,835 (2.25 %)
169	dingo (Sandy 2020 James Cook U) GCF_003254725.2	104,332 (4.50 %)	19,710 (1.72 %)	19,857 (1.42 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	69 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,547,906 (33.32 %)	993,474 (2.19 %)	13,701,060 (33.18 %)	51,216 (2.28 %)
170	dog (Basenji MU ID 185726 2019) GCA_004886185.2	n/a	19,889 (1.67 %)	20,501 (1.39 %)	n/a	41.36 (99.99 %)	1,388 (0.01 %)	3,630 (99.99 %)	4,950,227 (43.32 %)	1,059,639 (2.97 %)	13,694,849 (33.70 %)	51,443 (2.16 %)
171	dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021) GCA_013276365.2	n/a	19,310 (1.60 %)	19,947 (1.42 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	149 (0.00 %)	631 (100.00 %)	4,452,916 (32.14 %)	960,590 (2.23 %)	13,685,353 (33.01 %)	50,715 (2.22 %)
172	dog (Bernese Mountain Dog BD 2023) GCA_031010765.1	n/a	19,211 (1.60 %)	20,327 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	641 (0.00 %)	175 (100.00 %)	4,471,016 (32.18 %)	984,776 (2.03 %)	13,719,474 (32.88 %)	51,050 (2.25 %)
173	dog (Bernese Mountain Dog OD 2023) GCA_031010635.1	n/a	19,279 (1.60 %)	20,348 (1.44 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	1,015 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,491,081 (32.21 %)	996,142 (2.01 %)	13,761,195 (32.97 %)	51,490 (2.25 %)
174	dog (boxer Tasha 2011) GCF_000002285.3	82,549 (3.63 %)	19,772 (1.66 %)	19,565 (1.39 %)	n/a	41.31 (99.25 %)	23,876 (0.76 %)	27,106 (99.24 %)	4,918,098 (43.29 %)	991,835 (2.81 %)	13,644,959 (33.60 %)	53,269 (2.07 %)
175	dog (boxer Tasha 2020) GCF_000002285.5	93,774 (3.84 %)	19,392 (1.71 %)	19,572 (1.42 %)	52,141 (3.27 %)	41.26 (100.00 %)	1,028 (0.00 %)	147 (100.00 %)	23,927,903 (42.42 %)	972,851 (2.05 %)	13,611,845 (33.11 %)	50,679 (2.26 %)
176	dog (Cairn Terrier CA611 2023) GCA_031010295.1	n/a	19,255 (1.61 %)	20,479 (1.45 %)	n/a	41.19 (100.00 %)	262 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,490,019 (32.25 %)	989,383 (1.99 %)	13,710,808 (32.97 %)	50,883 (2.22 %)
177	dog (German shepard Mischka 2020) GCF_011100685.1	96,734 (3.71 %)	20,135 (1.64 %)	20,871 (1.38 %)	56,772 (3.19 %)	41.50 (100.00 %)	585 (0.00 %)	2,782 (100.00 %)	20,264,827 (43.87 %)	1,152,879 (3.22 %)	13,784,690 (34.30 %)	53,518 (2.23 %)
178	dog (German Shepherd Nala 2020) GCA_008641055.3	n/a	19,757 (1.69 %)	20,201 (1.41 %)	n/a	41.32 (99.74 %)	458 (0.26 %)	410 (100.00 %)	4,974,233 (43.03 %)	1,048,366 (2.46 %)	13,881,889 (33.61 %)	51,900 (2.21 %)
179	dog (Labrador retriever 2023) GCA_031165255.1	n/a	19,256 (1.61 %)	20,247 (1.44 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	516 (0.00 %)	675 (100.00 %)	4,456,220 (32.19 %)	960,584 (1.96 %)	13,688,006 (32.82 %)	50,670 (2.21 %)
180	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	52,469 (2.25 %)
181	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU) GCF_000181335.3	72,089 (3.30 %)	18,662 (1.64 %)	20,897 (1.37 %)	n/a	41.73 (98.20 %)	436 (1.80 %)	5,079 (98.20 %)	5,086,462 (43.51 %)	964,126 (2.68 %)	13,947,871 (33.33 %)	69,701 (2.41 %)
182	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU) GCA_000181335.5	n/a	18,378 (1.53 %)	21,242 (1.40 %)	n/a	41.73 (98.21 %)	422 (1.79 %)	5,010 (98.31 %)	4,683,703 (33.33 %)	964,129 (2.68 %)	13,948,305 (33.33 %)	69,725 (2.42 %)
183	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021) GCA_000181335.6	n/a	18,357 (1.55 %)	20,085 (1.38 %)	n/a	41.76 (98.18 %)	422 (1.82 %)	1,254 (98.28 %)	4,661,997 (33.78 %)	947,221 (2.58 %)	13,867,949 (33.67 %)	68,011 (2.41 %)
184	domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U) GCF_018350175.1	99,222 (4.40 %)	18,456 (1.66 %)	19,833 (1.39 %)	94,133 (5.63 %)	41.81 (100.00 %)	39 (0.00 %)	102 (100.00 %)	4,965,571 (43.65 %)	932,424 (1.95 %)	13,596,808 (33.85 %)	67,329 (2.48 %)
185	domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020) GCF_011764305.1	68,855 (3.09 %)	19,019 (1.55 %)	21,812 (1.42 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	n/a	1,224 (100.00 %)	4,650,028 (39.49 %)	745,115 (2.02 %)	13,758,447 (36.14 %)	58,684 (2.16 %)
186	domestic ferret (Sable 2011 Broad) GCA_000239315.1	n/a	18,778 (1.67 %)	19,571 (1.47 %)	n/a	41.48 (96.89 %)	72,670 (3.12 %)	76,914 (96.88 %)	4,491,876 (40.13 %)	618,556 (1.07 %)	13,721,938 (31.04 %)	54,600 (1.94 %)
187	domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023) GCF_034190915.1	79,333 (3.55 %)	17,999 (1.09 %)	21,509 (1.20 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	84 (0.00 %)	672 (100.00 %)	5,037,431 (41.68 %)	886,785 (13.97 %)	14,620,284 (42.71 %)	39,682 (0.89 %)
188	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	37,093 (0.85 %)
189	domestic yak (maiwa yakHY00 2019) GCA_005887515.3	n/a	18,672 (1.39 %)	19,408 (1.24 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	646 (0.00 %)	343 (100.00 %)	3,570,978 (23.00 %)	583,762 (8.57 %)	14,055,227 (40.52 %)	43,883 (1.17 %)
190	dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1	n/a	18,354 (1.22 %)	20,434 (1.08 %)	n/a	40.65 (100.00 %)	96 (0.00 %)	198 (100.00 %)	4,458,084 (33.00 %)	444,499 (1.79 %)	15,031,940 (47.42 %)	29,863 (0.83 %)
191	dugong (hap2 mDugDug1 2023) GCA_030020955.1	n/a	18,538 (1.23 %)	20,775 (1.09 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	89 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,455,227 (33.01 %)	444,021 (1.73 %)	14,946,847 (47.37 %)	29,828 (0.79 %)
192	dwarf mongoose GCA_004023845.1	n/a	21,478 (1.57 %)	32,174 (1.43 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	10,815 (0.05 %)	200,185 (99.95 %)	4,574,991 (40.34 %)	595,520 (1.11 %)	13,720,585 (32.94 %)	70,689 (2.42 %)
193	eastern cottontail (primary hap 2023) GCA_949820135.1	n/a	18,522 (1.26 %)	22,314 (1.28 %)	n/a	43.69 (100.00 %)	316 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,699,683 (20.55 %)	935,350 (11.22 %)	13,112,318 (44.07 %)	99,224 (2.27 %)
194	eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022) GCA_921998335.2	n/a	21,903 (2.13 %)	19,801 (1.40 %)	108,675 (4.42 %)	41.79 (99.89 %)	207 (0.11 %)	211 (100.00 %)	4,630,645 (40.56 %)	1,531,506 (3.70 %)	13,011,312 (35.48 %)	22,270 (0.54 %)
195	eastern mole GCA_004024925.1	n/a	19,631 (1.57 %)	32,414 (1.63 %)	n/a	42.02 (99.91 %)	7,239 (0.03 %)	647,535 (99.97 %)	3,145,725 (29.42 %)	554,620 (1.75 %)	10,663,504 (32.88 %)	55,063 (3.69 %)
196	eastern quoll GCA_020854095.1	n/a	15,715 (0.80 %)	16,750 (0.93 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	431 (0.00 %)	76 (100.00 %)	5,256,999 (24.81 %)	1,280,160 (3.39 %)	21,362,866 (41.74 %)	24,508 (0.70 %)
197	Egyptian rousette (1219 2016 Boston U) GCF_001466805.2	54,791 (4.93 %)	18,221 (2.05 %)	24,192 (1.88 %)	46,601 (2.22 %)	40.02 (99.97 %)	638 (0.03 %)	2,490 (100.00 %)	2,815,693 (32.23 %)	440,119 (1.01 %)	12,346,041 (26.86 %)	56,244 (6.54 %)
198	Egyptian rousette (v1 2020 refseq) GCF_014176215.1	65,163 (4.76 %)	17,642 (2.07 %)	22,317 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	242 (1.41 %)	29 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,414 (1.02 %)	12,031,597 (26.52 %)	53,573 (4.84 %)
199	Egyptian spiny mouse GCA_004027535.1	n/a	23,498 (1.69 %)	36,970 (1.40 %)	30,076 (1.58 %)	42.71 (99.88 %)	20,469 (0.09 %)	391,811 (99.91 %)	4,983,574 (35.17 %)	1,342,514 (3.45 %)	13,029,270 (32.79 %)	19,944 (0.55 %)
200	elk (wapiti) GCF_019320065.1	66,846 (3.00 %)	20,090 (1.67 %)	21,999 (1.44 %)	n/a	41.62 (99.93 %)	6,643 (0.08 %)	185 (100.00 %)	4,884,711 (43.14 %)	429,925 (1.65 %)	13,135,255 (37.85 %)	47,099 (1.31 %)
201	ermine (2020) GCF_009829155.1	74,332 (3.19 %)	18,855 (1.65 %)	20,667 (1.43 %)	44,584 (2.07 %)	41.56 (99.12 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,934 (41.44 %)	714,174 (1.30 %)	13,845,904 (33.42 %)	56,065 (2.25 %)
202	ermine (alternate hap 2020) GCA_009829165.1	n/a	13,583 (1.65 %)	15,403 (1.46 %)	n/a	41.72 (100.00 %)	n/a	3,327 (100.00 %)	3,139,035 (40.57 %)	480,111 (1.29 %)	9,106,061 (31.93 %)	39,139 (2.25 %)
203	Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1	n/a	19,332 (1.42 %)	22,424 (1.40 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	27 (0.00 %)	726 (100.00 %)	4,362,536 (31.74 %)	801,232 (4.02 %)	13,893,672 (37.73 %)	65,806 (4.13 %)
204	Eurasian badger (v3.2 2022) GCA_922984935.2	n/a	19,268 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	41,043 (1.93 %)	42.48 (100.00 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,417,203 (31.72 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,720 (38.08 %)	66,524 (3.95 %)
205	Eurasian field mouse (2024) GCA_964023405.1	n/a	20,487 (1.88 %)	19,707 (1.34 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	182 (0.00 %)	61 (100.00 %)	5,115,510 (39.18 %)	1,868,284 (4.29 %)	13,503,826 (37.29 %)	26,414 (0.61 %)
206	Eurasian red squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685485.1	n/a	12,437 (1.51 %)	12,702 (1.22 %)	n/a	40.06 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,657 (100.00 %)	2,303,176 (35.38 %)	353,996 (1.49 %)	7,218,556 (31.67 %)	24,268 (1.07 %)
207	Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2	n/a	21,309 (1.58 %)	21,026 (1.36 %)	33,465 (1.53 %)	40.08 (94.33 %)	1,177 (5.67 %)	639 (100.00 %)	4,677,412 (35.73 %)	704,218 (1.42 %)	14,992,063 (31.49 %)	48,159 (1.04 %)
208	Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1	67,145 (2.95 %)	18,842 (1.54 %)	20,178 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,259,294 (33.39 %)	713,721 (1.36 %)	13,626,048 (34.37 %)	57,073 (1.82 %)
209	Eurasian river otter (alternate hap 2019) GCA_902653095.1	n/a	9,910 (1.59 %)	11,315 (1.31 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	n/a	8,506 (100.00 %)	2,052,338 (42.25 %)	316,084 (1.64 %)	6,222,460 (33.12 %)	27,057 (1.96 %)
210	Eurasian water vole (alternate hap 2020) GCA_903992525.1	n/a	16,761 (1.66 %)	19,715 (1.37 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	105 (0.00 %)	16,473 (100.00 %)	3,118,266 (26.44 %)	829,463 (2.82 %)	9,700,482 (31.37 %)	14,146 (0.57 %)
211	Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2	45,544 (2.51 %)	19,733 (1.78 %)	19,053 (1.47 %)	36,935 (2.27 %)	42.15 (99.74 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	3,993,912 (25.74 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,770 (32.42 %)	19,000 (0.58 %)
212	European hare (LE1 primary hap 2023) GCF_033115175.1	46,528 (2.09 %)	19,392 (1.25 %)	23,070 (1.29 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	418 (0.00 %)	651 (100.00 %)	4,011,592 (19.81 %)	1,000,204 (8.44 %)	13,414,251 (44.25 %)	98,831 (2.33 %)
213	European harvest mouse (primary hap 2024) GCA_963924665.1	n/a	20,236 (1.71 %)	19,368 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	2,020 (0.02 %)	894 (100.00 %)	4,892,811 (36.49 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,907,631 (42.51 %)	17,423 (0.62 %)
214	European mink (alternate hap 2023) GCA_030435785.1	n/a	15,419 (1.50 %)	21,175 (1.51 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	12,043 (100.00 %)	2,952,218 (30.62 %)	538,508 (2.18 %)	9,303,303 (34.20 %)	47,810 (2.50 %)
215	European mink (primary hap 2023 refseq) GCF_030435805.1	69,556 (3.13 %)	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	39 (0.00 %)	25 (100.00 %)	4,237,791 (30.90 %)	792,897 (2.69 %)	13,417,195 (36.59 %)	67,132 (2.54 %)
216	European mole (hap1 2024) GCA_964194135.1	n/a	18,085 (1.69 %)	19,509 (1.58 %)	n/a	42.08 (99.99 %)	1,056 (0.01 %)	464 (100.00 %)	2,569,380 (23.32 %)	565,465 (2.18 %)	10,506,666 (33.68 %)	46,367 (3.09 %)
217	European mole (hap2 2024) GCA_964194205.1	n/a	18,064 (1.69 %)	19,764 (1.59 %)	n/a	42.07 (99.99 %)	1,040 (0.01 %)	1,396 (99.99 %)	2,567,492 (23.34 %)	570,250 (2.16 %)	10,485,959 (33.56 %)	46,213 (3.27 %)
218	European pine marten (primary hap 2023) GCA_963455335.1	n/a	18,336 (1.50 %)	20,807 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	2,250 (0.02 %)	477 (100.00 %)	4,096,160 (31.55 %)	707,337 (3.28 %)	13,715,382 (34.73 %)	61,481 (4.29 %)
219	European shrew (alternate hap 2023) GCA_027595995.1	n/a	17,506 (1.26 %)	25,527 (1.52 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	n/a	5,699 (100.00 %)	2,400,784 (15.19 %)	1,062,793 (3.20 %)	13,284,496 (41.93 %)	77,009 (2.86 %)
220	European shrew (GB8-d 2012) GCF_000181275.1	23,525 (1.54 %)	17,290 (1.33 %)	22,005 (1.50 %)	n/a	42.90 (90.49 %)	188,953 (9.54 %)	201,798 (90.46 %)	4,400,127 (33.22 %)	946,629 (2.03 %)	13,377,581 (35.30 %)	77,851 (2.58 %)
221	European shrew (primary hap 2023) GCF_027595985.1	44,643 (2.60 %)	17,479 (1.26 %)	21,293 (1.37 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	1,427 (0.54 %)	65 (100.00 %)	2,474,584 (15.18 %)	1,107,884 (3.28 %)	13,638,467 (41.72 %)	79,785 (2.86 %)
222	European snow vole (alternate hap 2023) GCA_950005115.1	n/a	18,364 (1.79 %)	20,379 (1.63 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,256 (100.00 %)	3,049,618 (22.22 %)	852,708 (4.50 %)	10,501,392 (33.34 %)	17,629 (0.60 %)
223	European snow vole (primary hap 2023 refseq) GCF_950005125.1	47,025 (2.69 %)	19,592 (1.78 %)	21,173 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	197 (0.00 %)	160 (100.00 %)	5,048,186 (44.12 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,053 (34.97 %)	20,725 (0.63 %)
224	European suslik (primary hap 2024) GCA_964194105.1	n/a	20,075 (1.28 %)	20,274 (1.19 %)	n/a	39.90 (99.99 %)	1,436 (0.01 %)	502 (100.00 %)	4,357,247 (31.78 %)	882,536 (12.27 %)	14,882,486 (41.66 %)	39,275 (0.88 %)
225	European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1	54,114 (2.24 %)	19,959 (1.65 %)	19,953 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	1,129 (0.01 %)	497 (100.00 %)	4,863,650 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,732 (40.58 %)	23,961 (0.53 %)
226	European woodmouse (alternate hap 2022) GCA_947179525.1	n/a	18,692 (1.72 %)	22,021 (1.36 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,863 (100.00 %)	4,055,957 (36.08 %)	1,513,576 (9.53 %)	11,306,811 (39.67 %)	20,865 (0.55 %)
227	fallow deer (Ldn47 2023) GCF_033118175.1	57,013 (2.35 %)	20,187 (1.33 %)	23,290 (1.33 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	44 (0.00 %)	284 (100.00 %)	3,308,241 (20.72 %)	513,748 (18.20 %)	12,996,819 (48.19 %)	214,480 (2.98 %)
228	false killer whale (hap1 2024 genbank) GCA_039906515.1	n/a	18,718 (1.50 %)	20,929 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	439 (100.00 %)	3,958,932 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,131 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
229	false killer whale (hap1 2024 refseq) GCF_039906515.1	75,958 (3.31 %)	18,718 (1.50 %)	20,982 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	438 (100.00 %)	3,958,926 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,061 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
230	false killer whale (hap2 2024) GCA_039906525.1	n/a	17,866 (1.45 %)	21,079 (1.46 %)	n/a	42.37 (99.08 %)	133 (0.92 %)	416 (100.00 %)	3,852,502 (34.98 %)	1,112,185 (16.42 %)	11,435,533 (44.17 %)	75,215 (4.36 %)
231	fat dormouse (US078 2019) GCA_004027185.1	n/a	23,122 (1.24 %)	48,677 (1.27 %)	n/a	42.33 (99.92 %)	10,685 (0.04 %)	444,115 (99.96 %)	6,783,404 (37.03 %)	1,642,515 (3.72 %)	12,706,289 (39.97 %)	65,521 (1.47 %)
232	fat sand rat (mPsaObe1 2021) GCF_907164565.1	43,211 (2.50 %)	18,543 (1.78 %)	20,094 (1.42 %)	n/a	41.95 (99.11 %)	50,482 (0.90 %)	11,389 (100.00 %)	4,686,377 (43.10 %)	920,563 (1.85 %)	12,813,848 (35.08 %)	22,480 (0.71 %)
233	fat sand rat (Psa_ob012049795 2017) GCA_002215935.1	n/a	21,644 (1.71 %)	31,665 (1.41 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	n/a	96,427 (100.00 %)	4,646,110 (38.87 %)	946,664 (2.24 %)	13,134,526 (33.94 %)	26,411 (0.73 %)
234	fishing cat (Anna 2022 U Missouri) GCF_022837055.1	68,015 (2.86 %)	18,432 (1.63 %)	19,912 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	63 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,777,906 (34.85 %)	937,432 (2.30 %)	13,438,032 (34.55 %)	70,402 (2.61 %)
235	Florida manatee (CSIC 2023) GCA_030013775.1	n/a	19,432 (1.24 %)	24,035 (1.14 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	33 (0.00 %)	15,641 (100.00 %)	4,400,331 (33.07 %)	439,615 (1.04 %)	14,884,753 (46.98 %)	32,563 (0.80 %)
236	Florida manatee (Lorelei 2012 refseq) GCF_000243295.1	39,645 (2.08 %)	18,308 (1.37 %)	20,588 (1.23 %)	32,868 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	166,490 (89.22 %)	n/a	389,315 (0.74 %)	14,633,038 (38.46 %)	27,462 (0.64 %)
237	fossa GCA_004023885.1	n/a	21,156 (1.56 %)	29,809 (1.38 %)	n/a	41.51 (99.94 %)	6,335 (0.03 %)	470,371 (99.97 %)	4,962,168 (42.36 %)	814,639 (1.52 %)	13,708,904 (34.14 %)	78,033 (2.52 %)
238	Gambian giant pouched rat GCA_004027575.1	n/a	21,189 (1.59 %)	32,806 (1.43 %)	n/a	42.11 (99.88 %)	7,473 (0.03 %)	1,110,425 (99.97 %)	4,137,605 (24.57 %)	1,071,627 (2.76 %)	12,905,250 (32.78 %)	32,359 (0.80 %)
239	gayal (CVASU_BF_001 2021) GCA_017311355.1	n/a	24,549 (1.09 %)	55,194 (1.15 %)	n/a	42.05 (99.91 %)	n/a	1,262,134 (100.00 %)	3,691,398 (22.78 %)	677,397 (2.00 %)	14,380,670 (42.36 %)	75,114 (1.33 %)
240	gayal (Nagaland 2019) GCA_007844835.1	n/a	22,715 (1.55 %)	23,635 (1.33 %)	n/a	41.67 (96.51 %)	301,761 (3.52 %)	306,776 (96.48 %)	6,243,468 (45.69 %)	518,664 (1.99 %)	15,147,647 (37.64 %)	45,586 (0.89 %)
241	Geoffroy's cat GCF_018350155.1	85,331 (3.53 %)	18,469 (1.66 %)	19,516 (1.36 %)	93,795 (4.83 %)	41.75 (100.00 %)	45 (0.00 %)	82 (100.00 %)	5,021,854 (43.23 %)	930,175 (1.84 %)	13,757,469 (34.29 %)	65,918 (2.36 %)
242	giant anteater GCA_004026745.1	n/a	24,383 (0.91 %)	44,315 (0.93 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	8,283 (0.02 %)	1,629,691 (99.98 %)	5,333,757 (35.57 %)	575,140 (0.91 %)	21,181,213 (39.97 %)	57,558 (0.94 %)
243	giant otter GCA_004024605.1	n/a	21,199 (1.46 %)	30,565 (1.34 %)	n/a	41.71 (99.93 %)	7,431 (0.03 %)	652,159 (99.97 %)	5,113,769 (41.55 %)	788,677 (1.46 %)	14,385,279 (35.77 %)	82,376 (2.05 %)
244	giant panda (Jingjing v3 2020) GCF_002007445.2	65,468 (3.27 %)	19,077 (1.67 %)	20,176 (1.39 %)	n/a	41.68 (98.09 %)	189,277 (1.92 %)	73,514 (100.00 %)	4,012,144 (34.40 %)	617,803 (1.99 %)	14,216,587 (30.41 %)	59,449 (1.50 %)
245	goat (v2 San Clemente 2016 USDA) GCF_001704415.2	47,159 (2.31 %)	19,342 (1.38 %)	22,346 (1.24 %)	n/a	43.16 (100.00 %)	790 (0.00 %)	29,886 (100.00 %)	3,502,527 (22.45 %)	760,831 (7.07 %)	13,024,178 (44.85 %)	125,662 (4.00 %)
246	Gobi jerboa GCA_004027895.1	n/a	22,410 (0.91 %)	45,268 (1.02 %)	n/a	41.94 (99.88 %)	10,987 (0.04 %)	1,295,369 (99.96 %)	8,828,417 (40.19 %)	1,979,806 (6.43 %)	14,759,732 (47.73 %)	24,314 (0.52 %)
247	golden hamster (Baylor 2021) GCF_017639785.1	67,831 (3.37 %)	19,354 (1.71 %)	19,863 (1.47 %)	69,903 (4.39 %)	42.04 (96.99 %)	711 (3.01 %)	7,058 (96.99 %)	3,981,818 (27.65 %)	976,456 (3.46 %)	12,580,903 (32.87 %)	21,268 (0.61 %)
248	golden hamster (Broad 2013 refseq) GCF_000349665.1	42,636 (2.91 %)	18,976 (1.82 %)	19,149 (1.51 %)	29,936 (1.96 %)	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	237,700 (82.88 %)	3,599,795 (26.09 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,956 (24.29 %)	18,591 (0.51 %)
249	golden spiny mouse (2020) GCF_903995435.1	36,997 (1.96 %)	20,006 (1.91 %)	19,132 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,785,907 (32.61 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,958,061 (32.33 %)	20,760 (0.59 %)
250	gracile shrew mole GCA_004024945.1	n/a	19,165 (1.25 %)	43,816 (1.48 %)	n/a	41.08 (99.89 %)	8,248 (0.04 %)	732,083 (99.96 %)	2,957,465 (23.76 %)	783,289 (2.60 %)	11,503,344 (31.38 %)	92,729 (3.60 %)
251	gray fox (Vermont ataVT051 2023) GCA_032313775.1	n/a	19,352 (1.42 %)	20,724 (1.33 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	26 (0.00 %)	898 (100.00 %)	4,418,039 (36.90 %)	1,050,244 (11.63 %)	13,240,305 (39.50 %)	89,246 (2.69 %)
252	gray seal GCF_012393455.1	79,009 (3.73 %)	19,882 (1.73 %)	22,416 (1.46 %)	n/a	41.44 (100.00 %)	117 (0.00 %)	6,880 (100.00 %)	4,448,588 (43.28 %)	557,710 (1.32 %)	13,340,576 (33.41 %)	55,637 (1.78 %)
253	gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023) GCA_027917375.1	n/a	12,662 (0.70 %)	15,124 (0.89 %)	n/a	37.74 (100.00 %)	24 (0.00 %)	8,086 (100.00 %)	4,098,004 (25.33 %)	806,470 (2.98 %)	16,244,072 (43.39 %)	24,879 (0.67 %)
254	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1	73,383 (3.04 %)	16,637 (0.72 %)	16,036 (0.85 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	5,562,359 (25.40 %)	1,096,620 (2.60 %)	22,322,748 (43.37 %)	28,894 (0.57 %)
255	gray short-tailed opossum (MonDom5 2007) GCF_000002295.2	68,375 (2.34 %)	16,663 (0.75 %)	16,162 (0.84 %)	n/a	37.82 (97.26 %)	67,660 (2.75 %)	72,674 (97.25 %)	7,753,175 (55.85 %)	1,051,473 (2.34 %)	22,274,001 (42.23 %)	30,883 (0.53 %)
256	gray squirrel (2020) GCF_902686445.1	58,884 (2.46 %)	20,752 (1.49 %)	21,107 (1.31 %)	32,732 (1.45 %)	40.06 (99.98 %)	1,824 (0.02 %)	752 (100.00 %)	4,605,578 (34.50 %)	728,192 (1.65 %)	15,467,412 (33.91 %)	51,878 (1.11 %)
257	gray squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685475.1	n/a	17,156 (1.53 %)	18,190 (1.33 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	2 (0.00 %)	9,510 (100.00 %)	3,455,580 (34.94 %)	530,053 (1.56 %)	10,927,458 (32.64 %)	38,976 (1.13 %)
258	gray wolf (2021) GCA_905319855.2	n/a	19,474 (1.55 %)	20,394 (1.40 %)	72,806 (4.12 %)	41.49 (100.00 %)	166 (0.00 %)	82 (100.00 %)	4,550,524 (31.76 %)	1,063,944 (3.96 %)	13,588,117 (34.74 %)	51,996 (2.15 %)
259	gray wolf (alternate hap 2021) GCA_905319845.1	n/a	12,760 (1.57 %)	14,423 (1.42 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,537 (100.00 %)	2,725,227 (31.66 %)	616,862 (3.40 %)	8,041,744 (32.68 %)	32,293 (2.35 %)
260	great fruit-eating bat (hap1 2024) GCA_038363145.1	n/a	18,022 (1.56 %)	19,824 (1.51 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	71,574 (2.28 %)
261	great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024) GCA_038363175.2	n/a	16,978 (1.61 %)	18,544 (1.54 %)	n/a	42.42 (100.00 %)	54 (0.00 %)	312 (100.00 %)	2,601,985 (26.67 %)	331,187 (4.87 %)	10,884,729 (33.93 %)	63,610 (2.71 %)
262	great fruit-eating bat (v2 hap1 2024) GCA_038363095.2	n/a	18,051 (1.56 %)	19,955 (1.51 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	45 (0.00 %)	487 (100.00 %)	2,841,143 (26.67 %)	379,430 (5.52 %)	11,651,542 (35.11 %)	72,337 (2.76 %)
263	great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016) GCF_001890085.2	50,895 (3.26 %)	18,993 (2.01 %)	19,633 (1.65 %)	41,769 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	172,750 (12.60 %)	7,387 (100.00 %)	2,946,981 (30.72 %)	495,272 (1.05 %)	11,587,728 (25.43 %)	32,949 (0.96 %)
264	greater bulldog bat GCA_004026585.1	n/a	20,774 (1.62 %)	28,140 (1.63 %)	n/a	40.92 (99.94 %)	6,171 (0.03 %)	304,393 (99.97 %)	3,288,598 (29.60 %)	478,424 (1.16 %)	11,427,553 (35.29 %)	44,124 (1.99 %)
265	Greater cane rat GCA_004025085.1	n/a	20,383 (0.98 %)	47,456 (1.25 %)	n/a	42.85 (99.83 %)	8,825 (0.03 %)	1,898,466 (99.97 %)	5,569,185 (30.19 %)	946,696 (3.12 %)	13,144,109 (41.83 %)	97,686 (2.61 %)
266	greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019) GCA_004115295.1	n/a	14,896 (1.85 %)	18,939 (1.59 %)	n/a	40.69 (100.00 %)	2 (0.00 %)	13,426 (100.00 %)	2,426,330 (34.43 %)	418,341 (1.36 %)	8,763,234 (27.86 %)	24,370 (1.08 %)
267	greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2	53,353 (3.13 %)	18,641 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,218,744 (34.52 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	32,445 (1.06 %)
268	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	61,023 (2.69 %)
269	greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850765.1	55,259 (2.53 %)	18,321 (1.40 %)	21,048 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	468 (1.27 %)	256 (100.00 %)	4,247,145 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,157 (43.30 %)	101,620 (2.01 %)
270	greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U) GCF_019186645.2	50,563 (2.96 %)	18,224 (1.70 %)	20,689 (1.67 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	55 (0.00 %)	534 (100.00 %)	2,961,591 (0.00 %)	387,908 (0.97 %)	12,179,612 (30.91 %)	62,189 (5.35 %)
271	grey whale GCA_004363415.1	n/a	21,827 (1.52 %)	32,191 (1.24 %)	n/a	41.22 (99.88 %)	10,622 (0.04 %)	1,046,770 (99.96 %)	4,841,166 (45.56 %)	780,015 (1.83 %)	13,559,563 (39.86 %)	72,343 (1.59 %)
272	grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023) GCA_028021475.1	n/a	19,129 (1.37 %)	24,628 (1.24 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	n/a	14,442 (100.00 %)	3,892,130 (35.74 %)	874,864 (15.70 %)	11,484,916 (45.69 %)	73,507 (1.72 %)
273	grey whale (primary hap 2023 genbank) GCA_028021215.1	n/a	19,288 (1.38 %)	21,791 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	704 (100.00 %)	4,116,900 (35.85 %)	966,065 (16.74 %)	12,154,173 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
274	grey whale (primary hap 2023 refseq) GCF_028021215.1	49,276 (1.90 %)	19,295 (1.38 %)	21,790 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	703 (100.00 %)	4,116,894 (35.85 %)	966,064 (16.74 %)	12,154,101 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
275	hairy big-eared bat (US037 2019 Broad) GCA_004026765.1	n/a	21,360 (1.44 %)	37,376 (1.52 %)	n/a	42.38 (99.94 %)	3,218 (0.01 %)	553,308 (99.99 %)	3,519,246 (30.77 %)	393,318 (0.85 %)	12,525,258 (34.42 %)	84,875 (2.37 %)
276	harbor porpoise (primary hap 2024 genbank) GCA_963924675.1	n/a	18,529 (1.58 %)	20,583 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	442 (100.00 %)	3,760,716 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,240 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
277	harbor porpoise (primary hap 2024 refseq) GCF_963924675.1	33,578 (1.54 %)	18,528 (1.58 %)	20,582 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	1,405 (99.99 %)	3,760,713 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,181 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
278	harbor seal GCF_004348235.1	50,670 (2.98 %)	19,484 (1.76 %)	20,771 (1.44 %)	33,296 (1.58 %)	41.38 (99.09 %)	16,480 (0.91 %)	21,161 (99.09 %)	4,526,182 (43.28 %)	576,921 (1.11 %)	13,421,780 (33.06 %)	54,592 (1.70 %)
279	Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U) GCF_002201575.2	37,605 (1.99 %)	19,483 (1.73 %)	19,767 (1.35 %)	n/a	41.41 (98.23 %)	25,763 (1.77 %)	7,487 (100.00 %)	4,575,217 (43.59 %)	583,394 (1.11 %)	13,374,131 (33.69 %)	52,067 (1.50 %)
280	hazel dormouse GCA_004027005.1	n/a	21,556 (1.24 %)	40,971 (1.33 %)	n/a	41.60 (99.91 %)	15,076 (0.06 %)	481,881 (99.94 %)	6,679,641 (33.98 %)	1,653,419 (3.72 %)	12,685,676 (43.98 %)	71,478 (1.57 %)
281	hazel dormouse (alternate hap 2023) GCA_963383665.1	n/a	11,130 (1.23 %)	22,071 (1.36 %)	n/a	42.15 (99.99 %)	n/a	31,856 (100.00 %)	2,958,239 (41.25 %)	788,242 (4.52 %)	6,056,268 (41.88 %)	36,143 (1.96 %)
282	hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1	n/a	18,620 (1.42 %)	22,403 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1,805 (0.01 %)	214 (100.00 %)	6,063,911 (41.66 %)	1,593,657 (4.46 %)	12,229,281 (43.98 %)	71,058 (1.88 %)
283	hippopotamus (BS01 2019 Broad) GCA_004027065.1	n/a	24,267 (1.55 %)	34,820 (1.30 %)	n/a	41.43 (99.91 %)	4,730 (0.02 %)	972,599 (99.98 %)	4,579,311 (41.26 %)	606,731 (1.02 %)	14,514,493 (36.58 %)	54,753 (1.59 %)
284	hippopotamus (HIP001 2018) GCA_002995585.1	n/a	22,343 (1.70 %)	31,687 (1.45 %)	n/a	40.96 (94.63 %)	153,125 (5.38 %)	281,897 (94.62 %)	3,952,905 (38.55 %)	476,243 (1.97 %)	14,216,817 (27.43 %)	48,380 (1.43 %)
285	hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1	n/a	20,391 (1.63 %)	20,668 (1.37 %)	n/a	41.62 (100.00 %)	83 (0.00 %)	545 (100.00 %)	3,778,764 (35.17 %)	563,345 (3.63 %)	13,524,869 (35.56 %)	48,164 (1.90 %)
286	hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq) GCF_030028045.1	64,153 (2.73 %)	20,331 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	226 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,783,440 (35.17 %)	567,797 (3.38 %)	13,462,531 (35.48 %)	48,365 (1.91 %)
287	hirola (BS46 2019 Broad) GCA_004027495.1	n/a	22,264 (1.40 %)	36,984 (1.26 %)	n/a	42.31 (99.93 %)	9,287 (0.03 %)	545,176 (99.97 %)	5,809,405 (48.62 %)	465,001 (1.08 %)	13,326,245 (42.35 %)	48,312 (1.15 %)
288	Hispaniolan solenodon GCA_004363575.1	n/a	18,805 (1.55 %)	27,454 (1.64 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	5,186 (0.02 %)	181,804 (99.98 %)	2,669,787 (26.78 %)	431,610 (1.04 %)	13,429,711 (27.35 %)	53,444 (2.30 %)
289	hispid cotton rat GCA_004025045.1	n/a	25,324 (1.49 %)	31,681 (1.31 %)	39,953 (1.43 %)	39.77 (99.89 %)	13,744 (0.05 %)	897,290 (99.95 %)	4,384,099 (28.17 %)	1,132,313 (3.34 %)	14,729,737 (38.08 %)	17,558 (0.40 %)
290	Hoffmann's two-fingered sloth GCA_000164785.2	n/a	24,546 (1.30 %)	30,273 (1.15 %)	n/a	39.80 (98.09 %)	101,085 (1.91 %)	370,035 (98.09 %)	5,145,551 (52.20 %)	614,819 (1.62 %)	17,932,269 (39.26 %)	55,943 (1.04 %)
291	hog-nosed bat GCA_004027555.1	n/a	20,591 (1.30 %)	39,589 (1.39 %)	n/a	40.99 (99.88 %)	6,224 (0.03 %)	1,230,480 (99.97 %)	4,081,924 (31.12 %)	1,008,077 (2.20 %)	12,068,828 (39.98 %)	55,567 (2.02 %)
292	Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.3	49,071 (2.78 %)	17,588 (1.64 %)	19,357 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,648 (0.21 %)	25,848 (100.00 %)	2,708,400 (27.89 %)	366,870 (1.48 %)	11,795,308 (31.27 %)	59,066 (1.72 %)
293	horse (maternal 2024) GCA_036418255.1	n/a	16,789 (1.65 %)	18,017 (1.36 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	210 (0.00 %)	821 (100.00 %)	3,146,381 (34.68 %)	430,664 (5.91 %)	13,246,059 (32.62 %)	37,293 (2.80 %)
294	horse (paternal hap 2024) GCA_036426135.1	n/a	19,073 (1.67 %)	20,636 (1.38 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	114 (0.00 %)	602 (100.00 %)	3,521,953 (35.39 %)	461,571 (5.26 %)	14,833,688 (32.77 %)	43,527 (2.54 %)
295	horse (Twilight 2018) GCF_002863925.1	76,567 (4.06 %)	18,997 (1.73 %)	20,914 (1.42 %)	113,346 (6.08 %)	41.50 (99.62 %)	6,294 (0.38 %)	4,701 (100.00 %)	4,080,319 (44.85 %)	395,037 (1.44 %)	15,169,517 (29.93 %)	44,825 (1.77 %)
296	house mouse (129S1_SvImJv1 2016) GCA_001624185.1	n/a	21,289 (2.22 %)	18,626 (1.42 %)	102,148 (4.16 %)	41.77 (85.00 %)	366,945 (15.05 %)	62,882 (95.15 %)	5,075,137 (40.38 %)	1,400,072 (2.80 %)	13,497,076 (26.20 %)	16,957 (0.40 %)
297	house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022) GCA_921998555.2	n/a	21,780 (2.13 %)	19,436 (1.37 %)	110,376 (4.47 %)	41.79 (99.60 %)	1,557 (0.40 %)	188 (100.00 %)	4,653,663 (40.74 %)	1,550,342 (3.54 %)	12,930,784 (35.48 %)	23,211 (0.57 %)
298	house mouse (AKR_J v3 2022) GCA_922000895.2	n/a	21,721 (2.13 %)	19,324 (1.37 %)	110,654 (4.48 %)	41.80 (99.85 %)	2,714 (0.15 %)	201 (100.00 %)	4,645,513 (40.70 %)	1,547,237 (3.56 %)	13,016,932 (35.69 %)	23,309 (0.57 %)
299	house mouse (alternate hap 2023) GCA_949316305.1	n/a	661 (0.88 %)	720 (0.54 %)	n/a	38.59 (100.00 %)	n/a	1,806 (100.00 %)	97,279 (72.21 %)	40,071 (55.89 %)	208,928 (64.94 %)	506 (0.31 %)
300	house mouse (A_J v3 2022) GCA_921998355.2	n/a	21,869 (2.13 %)	19,400 (1.37 %)	110,389 (4.48 %)	41.80 (99.39 %)	608 (0.61 %)	163 (100.00 %)	4,668,553 (40.80 %)	1,556,835 (3.58 %)	12,995,938 (35.53 %)	23,203 (0.56 %)
301	house mouse (BALB_cJ v3 2022) GCA_921997145.2	n/a	21,891 (2.13 %)	19,499 (1.37 %)	110,461 (4.47 %)	41.79 (99.80 %)	274 (0.20 %)	217 (100.00 %)	4,673,990 (40.79 %)	1,560,327 (3.63 %)	13,018,071 (35.70 %)	23,196 (0.56 %)
302	house mouse (C3H_HeJ v3 2022) GCA_921997125.2	n/a	21,793 (2.13 %)	19,516 (1.38 %)	110,049 (4.46 %)	41.79 (99.05 %)	844 (0.95 %)	174 (100.00 %)	4,657,005 (40.76 %)	1,551,107 (3.53 %)	12,949,100 (35.32 %)	23,262 (0.56 %)
303	house mouse (C57BL_6J T2T 2024) GCA_964188535.1	n/a	21,496 (1.92 %)	19,278 (1.25 %)	n/a	41.31 (99.85 %)	108 (0.15 %)	345 (99.85 %)	4,519,975 (46.81 %)	1,564,206 (14.33 %)	12,267,542 (42.16 %)	23,119 (0.55 %)
304	house mouse (CBA_J v3 2022) GCA_921998905.2	n/a	21,829 (2.13 %)	19,841 (1.39 %)	110,858 (4.48 %)	41.79 (99.52 %)	658 (0.48 %)	145 (100.00 %)	4,658,032 (40.77 %)	1,552,298 (3.59 %)	12,948,038 (35.52 %)	23,232 (0.56 %)
305	house mouse (DBA_2J v3 2022) GCA_921998315.2	n/a	22,302 (2.08 %)	19,749 (1.35 %)	113,269 (4.42 %)	41.72 (100.00 %)	153 (0.00 %)	361 (100.00 %)	4,785,676 (41.69 %)	1,597,598 (4.56 %)	13,190,158 (36.58 %)	24,140 (0.59 %)
306	house mouse (FVB_NJ v3 2022) GCA_921998635.2	n/a	21,633 (2.15 %)	19,565 (1.40 %)	110,246 (4.50 %)	41.82 (98.35 %)	6,244 (1.65 %)	384 (100.00 %)	4,621,601 (40.42 %)	1,537,622 (3.48 %)	12,818,729 (34.77 %)	22,696 (0.55 %)
307	house mouse (LP_J v3 2022) GCA_947599735.1	n/a	22,452 (1.91 %)	19,841 (1.23 %)	110,073 (3.98 %)	41.29 (99.99 %)	386 (0.01 %)	515 (100.00 %)	4,839,574 (46.33 %)	1,645,163 (11.88 %)	12,936,515 (41.49 %)	24,374 (0.54 %)
308	house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022) GCA_921998325.2	n/a	21,797 (2.13 %)	19,521 (1.38 %)	109,890 (4.48 %)	41.80 (99.50 %)	1,462 (0.50 %)	170 (100.00 %)	4,650,016 (40.74 %)	1,547,220 (3.54 %)	12,918,125 (35.45 %)	23,253 (0.56 %)
309	house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022) GCA_947593165.1	n/a	22,481 (1.93 %)	19,932 (1.26 %)	109,670 (4.03 %)	41.34 (100.00 %)	234 (0.00 %)	441 (100.00 %)	4,822,230 (45.92 %)	1,637,027 (11.19 %)	13,082,730 (41.04 %)	24,187 (0.54 %)
310	house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1	n/a	22,351 (1.96 %)	19,629 (1.26 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	101 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,774,018 (45.31 %)	1,620,102 (10.50 %)	13,181,250 (40.47 %)	23,955 (0.54 %)
311	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	130,343 (4.85 %)	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	23,794 (0.53 %)
312	house mouse C57BL_6NJ (2016) GCA_001632555.1	n/a	21,177 (2.23 %)	18,495 (1.42 %)	103,002 (4.20 %)	41.76 (82.53 %)	410,660 (17.53 %)	49,821 (96.37 %)	5,081,049 (40.22 %)	1,392,942 (2.58 %)	13,476,268 (25.21 %)	16,877 (0.39 %)
313	house mouse C57BL_6NJ (2022) GCA_921999865.2	n/a	21,817 (2.13 %)	19,349 (1.37 %)	n/a	41.79 (99.76 %)	1,127 (0.24 %)	214 (100.00 %)	4,661,104 (40.76 %)	1,552,079 (3.56 %)	12,953,662 (35.57 %)	23,204 (0.56 %)
314	humpback whale (KW2013002 2024) GCA_041834305.1	n/a	19,463 (1.32 %)	22,424 (1.19 %)	n/a	42.05 (100.00 %)	88 (0.00 %)	1,355 (100.00 %)	4,164,459 (34.02 %)	1,281,751 (18.33 %)	12,412,281 (48.28 %)	82,412 (1.67 %)
315	hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2	n/a	19,096 (1.59 %)	20,674 (1.34 %)	n/a	41.99 (99.75 %)	277 (0.25 %)	1,435 (100.00 %)	5,290,422 (47.51 %)	478,946 (1.94 %)	12,568,313 (41.15 %)	45,850 (1.37 %)
316	hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1	63,234 (2.88 %)	19,601 (1.57 %)	21,699 (1.34 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	302 (0.06 %)	1,250 (100.00 %)	5,524,454 (47.57 %)	459,928 (1.40 %)	13,208,799 (41.21 %)	41,359 (1.10 %)
317	Iberian mole (v2.1 TD23 2020) GCF_014898055.3	56,973 (3.41 %)	18,431 (1.69 %)	20,317 (1.59 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	3,575 (0.11 %)	3,202 (100.00 %)	2,635,974 (23.38 %)	496,514 (1.29 %)	10,969,546 (32.61 %)	47,466 (2.89 %)
318	Indian false vampire GCA_004026885.1	n/a	20,067 (1.37 %)	36,544 (1.53 %)	32,548 (1.37 %)	40.84 (99.83 %)	6,266 (0.02 %)	1,909,067 (99.98 %)	4,096,409 (31.50 %)	699,311 (1.81 %)	12,307,198 (39.96 %)	92,830 (3.12 %)
319	Indian flying fox GCF_902729225.1	64,763 (3.85 %)	18,222 (2.01 %)	23,187 (1.82 %)	45,389 (2.18 %)	39.83 (99.10 %)	17,500 (0.90 %)	16,113 (100.00 %)	2,972,300 (34.11 %)	487,157 (1.49 %)	12,486,528 (27.37 %)	57,869 (3.73 %)
320	Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023) GCA_030015415.1	n/a	17,560 (2.04 %)	21,687 (1.83 %)	n/a	39.77 (100.00 %)	26 (0.00 %)	181 (100.00 %)	2,598,385 (30.48 %)	486,921 (1.41 %)	11,828,726 (27.28 %)	37,476 (5.58 %)
321	Indochinese shrew (US011 2019 Broad) GCA_004027635.1	n/a	18,870 (0.51 %)	55,636 (0.81 %)	n/a	39.81 (99.83 %)	5,267 (0.02 %)	2,420,679 (99.98 %)	4,130,068 (16.60 %)	1,663,335 (3.30 %)	18,728,711 (46.19 %)	31,453 (0.55 %)
322	Indus River dolphin GCA_004363435.1	n/a	24,321 (1.30 %)	47,065 (1.14 %)	n/a	41.72 (99.88 %)	11,702 (0.04 %)	1,110,492 (99.96 %)	5,093,308 (45.60 %)	845,860 (1.72 %)	13,162,111 (41.37 %)	68,257 (1.40 %)
323	intermediate roundleaf bat (primary hap 2023) GCA_031876335.1	n/a	19,064 (1.67 %)	20,800 (1.49 %)	n/a	41.55 (100.00 %)	119 (0.00 %)	69 (100.00 %)	3,393,548 (30.92 %)	723,545 (6.58 %)	12,073,117 (35.40 %)	43,736 (1.20 %)
324	jaguar (BS21 2019) GCA_004023805.1	n/a	21,431 (1.51 %)	32,835 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.89 %)	21,329 (0.09 %)	460,121 (99.91 %)	5,420,861 (43.75 %)	1,049,353 (1.93 %)	13,848,545 (34.90 %)	71,066 (2.37 %)
325	jaguar (Sample0147 2023) GCF_028533385.1	71,565 (4.12 %)	19,122 (1.67 %)	21,950 (1.36 %)	n/a	41.58 (99.31 %)	56,371 (0.70 %)	36,243 (100.00 %)	4,552,854 (33.37 %)	897,371 (1.63 %)	13,732,912 (32.89 %)	63,777 (2.41 %)
326	jaguarundi GCF_014898765.1	72,564 (3.15 %)	18,602 (1.64 %)	20,510 (1.39 %)	n/a	41.75 (97.85 %)	42,499 (2.16 %)	10,948 (100.00 %)	5,035,745 (43.29 %)	907,329 (1.61 %)	13,590,905 (33.57 %)	69,090 (2.29 %)
327	Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U) GCF_014825515.1	48,705 (2.72 %)	19,921 (1.66 %)	23,614 (1.68 %)	39,384 (2.12 %)	41.95 (98.87 %)	110,840 (1.13 %)	56,740 (100.00 %)	2,972,388 (28.79 %)	405,474 (2.15 %)	12,458,880 (30.65 %)	61,973 (1.87 %)
328	Jamaican fruit-eating bat (2021) GCF_021234435.1	55,114 (3.18 %)	17,875 (1.68 %)	19,958 (1.66 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	3 (0.00 %)	868 (100.00 %)	2,697,287 (28.17 %)	318,700 (0.84 %)	11,750,329 (31.61 %)	61,951 (1.93 %)
329	Japanese wild mouse (2022) GCA_921999095.2	n/a	23,292 (2.05 %)	20,114 (1.31 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	397 (0.00 %)	1,449 (100.00 %)	4,952,306 (42.53 %)	1,635,456 (4.60 %)	12,838,321 (38.56 %)	24,168 (0.56 %)
330	Java mouse-deer (US108 2019 Broad) GCA_004024965.1	n/a	23,081 (1.38 %)	38,181 (1.41 %)	n/a	42.73 (99.91 %)	2,829 (0.01 %)	1,159,819 (99.99 %)	4,791,310 (34.97 %)	448,498 (1.92 %)	13,175,375 (39.89 %)	68,778 (2.92 %)
331	killer whale (2022) GCF_937001465.1	78,470 (3.76 %)	18,710 (1.51 %)	21,101 (1.30 %)	34,448 (1.49 %)	41.91 (100.00 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	3,955,401 (36.81 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,568 (41.63 %)	77,307 (3.08 %)
332	killer whale (alternate hap 2022) GCA_937001455.1	n/a	14,982 (1.50 %)	19,185 (1.30 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	n/a	12,410 (100.00 %)	2,752,892 (35.61 %)	589,217 (10.15 %)	8,371,032 (41.11 %)	57,347 (3.41 %)
333	killer whale (Morgan 2013) GCF_000331955.2	70,972 (3.55 %)	18,736 (1.86 %)	20,365 (1.48 %)	n/a	41.35 (94.82 %)	78,441 (5.20 %)	80,100 (94.80 %)	3,978,339 (43.98 %)	555,737 (1.13 %)	12,773,973 (31.51 %)	61,145 (1.59 %)
334	koala (Bilbo 61053 2022) GCA_003287225.2	n/a	17,087 (0.81 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	6,280,029 (29.77 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,316 (39.24 %)	15,957 (0.35 %)
335	Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1	63,293 (2.96 %)	17,918 (1.89 %)	20,819 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	394 (0.69 %)	202 (100.00 %)	2,897,422 (23.58 %)	797,420 (2.76 %)	10,057,100 (34.56 %)	55,965 (2.99 %)
336	large flying fox GCF_000151845.1	52,243 (3.10 %)	18,454 (1.91 %)	23,631 (1.73 %)	n/a	39.82 (91.80 %)	189,340 (8.24 %)	225,433 (91.76 %)	3,117,045 (36.49 %)	504,277 (3.03 %)	13,025,556 (25.00 %)	78,404 (3.24 %)
337	large Japanese field mouse (IB14-021 2017) GCA_002335545.1	n/a	22,630 (1.74 %)	33,810 (1.26 %)	n/a	42.04 (57.78 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,626,044 (57.65 %)	3,638,537 (31.76 %)	1,048,253 (1.87 %)	12,039,926 (16.61 %)	19,817 (0.34 %)
338	large tree shrew (BS70 2022) GCA_026018925.1	n/a	21,678 (1.34 %)	22,317 (1.25 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	1,188 (0.00 %)	1,198 (100.00 %)	5,530,547 (22.20 %)	1,357,640 (10.13 %)	14,334,312 (46.09 %)	123,453 (2.17 %)
339	leopard (Hobbes primary hap 2022) GCF_024362965.1	70,488 (3.29 %)	18,472 (1.56 %)	20,388 (1.41 %)	n/a	41.75 (99.99 %)	335 (0.01 %)	382 (100.00 %)	4,634,038 (33.80 %)	932,991 (2.25 %)	13,686,652 (34.03 %)	65,793 (2.64 %)
340	leopard (Maewha 2016 refseq) GCF_001857705.1	73,266 (3.20 %)	18,881 (1.63 %)	21,010 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	265,330 (96.15 %)	5,247,029 (42.87 %)	1,059,446 (5.13 %)	14,265,573 (32.20 %)	77,001 (2.45 %)
341	leopard cat GCF_016509475.1	59,965 (3.05 %)	18,472 (1.65 %)	19,934 (1.38 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	56 (0.00 %)	123 (100.00 %)	4,978,115 (43.28 %)	901,754 (1.84 %)	13,596,535 (34.23 %)	67,390 (2.50 %)
342	Leschenault's rousette (2020) GCA_015472975.1	n/a	17,815 (2.05 %)	23,917 (1.90 %)	n/a	40.13 (99.14 %)	100,669 (0.88 %)	108,810 (99.12 %)	2,688,705 (31.20 %)	428,968 (1.19 %)	12,245,385 (26.51 %)	58,118 (6.81 %)
343	lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1	51,730 (1.99 %)	20,129 (1.24 %)	22,089 (1.24 %)	40,414 (1.76 %)	42.00 (99.52 %)	561 (0.48 %)	160 (100.00 %)	7,346,291 (41.25 %)	1,187,587 (2.92 %)	14,222,177 (44.13 %)	34,688 (0.86 %)
344	lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021) GCA_020740715.1	n/a	17,777 (1.27 %)	19,232 (1.28 %)	n/a	42.13 (92.75 %)	2,875 (7.25 %)	508 (100.00 %)	6,476,967 (33.93 %)	999,133 (2.78 %)	11,809,834 (40.52 %)	29,872 (0.82 %)
345	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq) GCF_000280705.1	25,991 (1.44 %)	19,408 (1.38 %)	20,312 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	337,360 (87.13 %)	6,125,934 (38.31 %)	832,825 (1.53 %)	13,661,612 (33.98 %)	26,669 (0.59 %)
346	lesser horseshoe bat (hap1 2024) GCA_964194185.1	n/a	19,031 (1.88 %)	21,003 (1.63 %)	n/a	40.81 (99.99 %)	1,627 (0.01 %)	723 (100.00 %)	3,133,745 (33.46 %)	660,064 (3.79 %)	11,720,176 (32.32 %)	35,414 (1.75 %)
347	lesser horseshoe bat (hap2 2024) GCA_964194215.1	n/a	18,875 (1.72 %)	21,166 (1.58 %)	n/a	41.18 (99.99 %)	1,648 (0.01 %)	2,727 (99.99 %)	3,160,659 (34.00 %)	696,130 (6.23 %)	11,662,645 (34.26 %)	36,176 (1.80 %)
348	lesser noctule (mNycLei1.hap1.1 2024) GCA_964264875.1	n/a	18,260 (1.53 %)	23,046 (1.60 %)	n/a	43.05 (99.99 %)	1,662 (0.01 %)	1,281 (100.00 %)	3,246,021 (21.13 %)	1,298,965 (12.06 %)	9,752,193 (42.90 %)	66,137 (2.85 %)
349	lesser noctule (mNycLei1.hap2.1 2024) GCA_964264895.1	n/a	17,557 (1.64 %)	22,484 (1.74 %)	n/a	43.06 (99.98 %)	1,563 (0.02 %)	2,898 (99.98 %)	2,999,553 (21.19 %)	1,122,371 (10.04 %)	9,331,392 (40.02 %)	61,834 (2.95 %)
350	lesser panda (RP43 2017) GCA_002007465.1	n/a	19,120 (1.69 %)	20,591 (1.50 %)	n/a	41.60 (98.56 %)	137,333 (1.45 %)	148,922 (98.55 %)	4,513,888 (40.87 %)	692,778 (1.62 %)	13,691,859 (31.36 %)	64,369 (2.52 %)
351	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850995.1	53,210 (2.49 %)	18,323 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	573 (0.76 %)	168 (100.00 %)	4,224,344 (28.69 %)	1,030,576 (2.60 %)	12,591,989 (42.30 %)	98,189 (2.06 %)
352	lion GCF_018350215.1	67,745 (2.86 %)	17,956 (1.69 %)	19,033 (1.40 %)	61,242 (3.04 %)	41.71 (100.00 %)	55 (0.00 %)	99 (100.00 %)	4,666,951 (42.23 %)	889,987 (1.87 %)	13,151,686 (33.40 %)	62,675 (2.56 %)
353	little brown bat GCF_000147115.1	50,660 (2.76 %)	19,314 (1.86 %)	22,683 (1.70 %)	n/a	42.50 (96.66 %)	61,131 (3.35 %)	72,785 (96.65 %)	3,682,263 (37.05 %)	634,854 (2.15 %)	10,841,759 (33.45 %)	57,630 (1.79 %)
354	little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022) GCA_024363435.1	n/a	19,150 (1.52 %)	23,435 (1.64 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	229 (0.00 %)	718 (100.00 %)	n/a	1,051,300 (12.43 %)	9,858,628 (43.20 %)	48,101 (2.62 %)
355	little pocket mouse (longimembris primary hap 2022) GCA_024363575.1	n/a	19,760 (1.50 %)	24,317 (1.63 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	215 (0.00 %)	1,135 (100.00 %)	3,913,744 (28.43 %)	1,095,577 (12.70 %)	10,273,833 (43.74 %)	49,636 (2.61 %)
356	little tube-nosed bat GCA_004026665.1	n/a	22,009 (1.26 %)	45,725 (1.35 %)	n/a	43.80 (99.90 %)	6,795 (0.03 %)	886,972 (99.97 %)	3,372,804 (23.57 %)	1,014,476 (3.00 %)	11,948,592 (41.18 %)	71,530 (2.05 %)
357	long-finned pilot whale (primary hap 2023) GCF_963455315.1	61,797 (2.84 %)	18,712 (1.51 %)	20,920 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	993 (100.00 %)	4,125,420 (35.62 %)	1,577,899 (12.03 %)	12,347,226 (42.01 %)	71,821 (5.51 %)
358	long-finned pilot whale (primary hap 2024) GCA_963455315.2	n/a	18,726 (1.51 %)	20,948 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	995 (100.00 %)	4,125,459 (35.62 %)	1,577,896 (12.03 %)	12,347,226 (42.01 %)	71,822 (5.51 %)
359	long-finned pilot whale (primary hap 2024) GCF_963455315.2	61,447 (2.80 %)	18,725 (1.51 %)	20,946 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	2,076 (99.99 %)	4,125,452 (35.62 %)	1,577,896 (12.03 %)	12,347,170 (42.01 %)	71,822 (5.51 %)
360	long-finned pilot whale (X-22926-18 2019) GCF_006547405.1	66,104 (3.28 %)	18,772 (1.80 %)	21,031 (1.46 %)	33,672 (1.78 %)	41.29 (99.58 %)	14,859 (0.42 %)	20,999 (99.58 %)	3,962,125 (45.58 %)	557,247 (1.11 %)	12,616,535 (34.70 %)	62,905 (1.69 %)
361	long-tailed chinchilla GCF_000276665.1	54,841 (2.98 %)	18,096 (1.59 %)	19,514 (1.52 %)	n/a	41.06 (95.56 %)	78,817 (4.46 %)	81,656 (95.54 %)	4,018,866 (30.94 %)	607,082 (1.15 %)	13,528,234 (28.15 %)	46,931 (1.25 %)
362	long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad) GCA_004027375.1	n/a	19,208 (1.99 %)	31,180 (1.92 %)	n/a	39.56 (99.97 %)	2,056 (0.01 %)	174,041 (99.99 %)	2,893,453 (32.61 %)	597,516 (1.76 %)	12,093,608 (28.14 %)	63,015 (4.70 %)
363	Lowland paca GCA_004365215.1	n/a	21,953 (0.62 %)	56,356 (0.80 %)	n/a	40.83 (99.78 %)	3,060 (0.01 %)	3,771,510 (99.99 %)	5,892,507 (29.20 %)	802,811 (1.38 %)	18,630,883 (38.61 %)	61,715 (0.94 %)
364	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq) GCF_001685135.1	48,591 (2.76 %)	19,458 (1.57 %)	24,783 (1.38 %)	41,272 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	984,658 (7.81 %)	80,670 (100.00 %)	3,064,599 (35.21 %)	866,309 (3.08 %)	13,310,859 (28.76 %)	35,558 (0.84 %)
365	Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1	68,043 (3.50 %)	18,167 (1.72 %)	20,453 (1.54 %)	n/a	40.83 (91.78 %)	57,746 (8.23 %)	17,969 (100.00 %)	2,864,567 (34.23 %)	277,996 (1.69 %)	12,659,207 (25.72 %)	33,486 (1.00 %)
366	Masai giraffe (MA1 2016 Penn St) GCA_001651235.1	n/a	20,950 (1.52 %)	28,854 (1.33 %)	n/a	41.39 (96.50 %)	257,672 (3.48 %)	770,838 (96.52 %)	5,502,479 (43.94 %)	531,418 (2.64 %)	13,936,018 (36.18 %)	40,504 (1.02 %)
367	meadow jumping mouse GCA_004024765.1	n/a	22,236 (1.08 %)	44,719 (1.21 %)	n/a	42.31 (99.88 %)	7,610 (0.03 %)	1,165,710 (99.97 %)	6,135,446 (33.31 %)	1,525,146 (3.34 %)	13,854,475 (39.91 %)	26,633 (0.68 %)
368	meadow vole (hap1 2024) GCA_037038515.1	n/a	19,134 (1.78 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	60 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,818,689 (41.90 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,222 (34.42 %)	23,781 (0.74 %)
369	meadow vole (hap2 2024) GCA_037039175.1	n/a	19,001 (1.82 %)	20,271 (1.68 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	53 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,141,368 (21.37 %)	898,900 (4.24 %)	11,475,531 (32.14 %)	22,186 (0.75 %)
370	meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq) GCF_006229205.1	58,806 (2.67 %)	19,009 (1.64 %)	19,088 (1.36 %)	n/a	41.68 (99.72 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,564,931 (40.13 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	64,858 (2.22 %)
371	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022) GCA_024711525.1	n/a	18,555 (1.22 %)	24,508 (1.35 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	181 (0.00 %)	3,482 (100.00 %)	6,419,007 (53.84 %)	1,384,128 (15.63 %)	11,486,822 (50.51 %)	38,521 (1.60 %)
372	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCA_024711535.1	n/a	21,281 (1.16 %)	28,592 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,354 (100.00 %)	4,378,955 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,786 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
373	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCF_024711535.1	68,331 (2.37 %)	21,280 (1.16 %)	28,582 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,535 (100.00 %)	4,378,949 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,725 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
374	Merriam's long-tongued bat (hap1 2024) GCA_039655065.1	n/a	18,172 (1.67 %)	20,736 (1.60 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	47 (0.00 %)	82 (100.00 %)	2,998,913 (29.48 %)	418,833 (1.07 %)	11,783,716 (32.96 %)	65,956 (4.38 %)
375	Merriam's long-tongued bat (hap2 2024) GCA_039656995.1	n/a	18,105 (1.68 %)	20,751 (1.60 %)	n/a	42.18 (100.00 %)	45 (0.00 %)	71 (100.00 %)	2,994,788 (29.48 %)	415,375 (1.07 %)	11,752,432 (32.88 %)	65,597 (4.38 %)
376	minke whale (2013 refseq) GCF_000493695.1	42,553 (2.38 %)	19,159 (1.73 %)	18,656 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	184,072 (94.04 %)	n/a	573,951 (1.48 %)	13,504,347 (30.96 %)	65,448 (1.38 %)
377	minke whale (alternate hap 2023) GCA_950005055.1	n/a	20,412 (1.46 %)	27,421 (1.34 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	21,272 (100.00 %)	3,811,435 (36.24 %)	959,712 (10.27 %)	12,159,896 (41.30 %)	69,852 (1.62 %)
378	minke whale (primary hap 2023 refseq) GCF_949987535.1	61,711 (2.51 %)	19,550 (1.49 %)	21,499 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	1,177 (0.01 %)	1,374 (100.00 %)	4,006,927 (35.92 %)	1,058,105 (12.08 %)	12,708,103 (42.66 %)	72,756 (1.59 %)
379	Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.) GCF_002204375.1	40,346 (2.29 %)	21,215 (1.83 %)	24,305 (1.47 %)	n/a	42.09 (95.23 %)	91,601 (4.78 %)	68,793 (100.00 %)	4,821,343 (37.74 %)	940,776 (1.82 %)	13,848,274 (31.31 %)	24,154 (0.74 %)
380	Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI) GCA_008131255.1	n/a	19,952 (1.59 %)	23,462 (1.36 %)	n/a	41.98 (99.01 %)	103,843 (0.97 %)	412,933 (99.03 %)	5,009,454 (0.00 %)	1,042,929 (2.52 %)	14,121,194 (34.63 %)	26,044 (0.71 %)
381	Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023) GCF_030254825.1	65,502 (2.97 %)	19,045 (1.53 %)	20,203 (1.29 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	53 (0.00 %)	193 (100.00 %)	4,477,607 (37.21 %)	1,124,432 (5.22 %)	13,244,320 (39.20 %)	25,300 (0.76 %)
382	monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021) GCA_019395325.1	n/a	16,419 (0.77 %)	17,219 (0.89 %)	n/a	39.03 (100.00 %)	33 (0.00 %)	9,959 (100.00 %)	6,332,360 (29.69 %)	1,065,454 (2.09 %)	17,908,986 (42.25 %)	13,856 (0.35 %)
383	monito del monte (primary hap 2021 refseq) GCF_019393635.1	47,034 (2.02 %)	18,399 (0.80 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	260 (0.09 %)	17 (100.00 %)	9,107,968 (41.08 %)	1,249,635 (2.12 %)	21,135,324 (42.80 %)	16,598 (0.36 %)
384	Montane guinea pig GCA_004027695.1	n/a	20,064 (1.06 %)	31,321 (1.18 %)	39,905 (1.42 %)	40.09 (99.88 %)	11,321 (0.04 %)	1,379,500 (99.96 %)	4,730,634 (30.02 %)	1,583,664 (6.57 %)	15,806,339 (40.40 %)	37,371 (0.76 %)
385	mountain beaver GCA_004027875.1	n/a	22,428 (1.10 %)	38,670 (1.12 %)	n/a	40.58 (99.89 %)	7,253 (0.02 %)	1,286,779 (99.98 %)	5,859,004 (32.29 %)	914,052 (2.37 %)	16,249,666 (38.21 %)	39,133 (0.76 %)
386	muskrat GCA_004026605.1	n/a	22,540 (1.52 %)	32,136 (1.35 %)	n/a	41.59 (99.93 %)	6,243 (0.02 %)	571,599 (99.98 %)	4,437,736 (28.49 %)	922,826 (2.38 %)	13,945,732 (35.23 %)	19,876 (0.50 %)
387	naked mole-rat (MEF-2018 2020) GCA_014060925.1	n/a	22,011 (1.30 %)	21,392 (1.22 %)	n/a	40.13 (95.11 %)	139,535 (4.91 %)	148,797 (95.09 %)	4,885,102 (35.91 %)	654,418 (1.90 %)	16,401,315 (34.21 %)	40,717 (0.98 %)
388	naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq) GCF_000247695.1	74,574 (3.56 %)	21,332 (1.74 %)	20,861 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	114,653 (88.41 %)	4,179,991 (32.69 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,561 (27.63 %)	31,950 (0.88 %)
389	narwhal (Baffin Bay 2019) GCF_005190385.1	51,639 (2.71 %)	18,741 (1.78 %)	20,365 (1.40 %)	33,148 (1.79 %)	41.22 (99.52 %)	18,323 (0.49 %)	6,972 (100.00 %)	4,011,742 (43.97 %)	565,367 (1.22 %)	12,720,018 (34.85 %)	60,492 (1.58 %)
390	narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022) GCA_005190385.3	n/a	18,681 (1.79 %)	19,816 (1.40 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	313 (0.00 %)	101 (100.00 %)	3,618,235 (37.24 %)	612,229 (1.52 %)	12,641,632 (35.02 %)	60,518 (1.78 %)
391	Natal long-fingered bat GCF_001595765.1	32,050 (3.03 %)	18,015 (2.17 %)	18,293 (1.87 %)	n/a	42.07 (96.24 %)	204,616 (3.79 %)	1,269 (100.00 %)	2,565,457 (28.95 %)	376,532 (1.91 %)	10,427,823 (26.35 %)	63,261 (2.07 %)
392	Natterer's bat (mMyoNat1.hap1.1 2024) GCA_964212035.1	n/a	19,180 (1.72 %)	22,635 (1.71 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	1,620 (0.02 %)	343 (100.00 %)	3,081,500 (24.27 %)	797,071 (5.37 %)	10,372,159 (38.30 %)	64,460 (2.57 %)
393	Natterer's bat (mMyoNat1.hap2.1 2024) GCA_964212025.1	n/a	18,275 (1.81 %)	21,799 (1.80 %)	n/a	43.28 (99.99 %)	1,387 (0.01 %)	1,706 (99.99 %)	2,833,193 (23.73 %)	705,278 (5.10 %)	9,802,564 (36.67 %)	61,024 (2.68 %)
394	neotropical fruit bat GCF_014824575.2	49,109 (2.78 %)	17,703 (1.63 %)	19,389 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,675 (0.21 %)	26,068 (100.00 %)	2,862,405 (29.31 %)	366,960 (1.48 %)	11,796,203 (31.27 %)	59,091 (1.70 %)
395	Nilgiri tahr GCA_004026825.1	n/a	22,735 (1.44 %)	34,961 (1.27 %)	n/a	42.37 (99.93 %)	10,387 (0.04 %)	479,550 (99.96 %)	5,793,761 (48.50 %)	535,297 (1.34 %)	13,378,352 (42.46 %)	57,653 (1.29 %)
396	nine-banded armadillo (hap2 2023) GCF_030445035.1	69,043 (2.70 %)	20,516 (1.05 %)	n/a	n/a	41.00 (99.68 %)	771 (0.32 %)	539 (100.00 %)	4,656,325 (32.86 %)	726,574 (1.99 %)	19,585,522 (43.65 %)	140,990 (2.86 %)
397	nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023) GCA_030445055.1	n/a	19,429 (1.06 %)	22,396 (1.07 %)	n/a	40.96 (99.27 %)	845 (0.73 %)	594 (100.00 %)	4,369,568 (32.83 %)	673,707 (1.55 %)	18,586,102 (42.41 %)	131,852 (2.78 %)
398	nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023) GCA_030445055.2	n/a	19,350 (1.07 %)	22,207 (1.07 %)	n/a	40.97 (99.27 %)	823 (0.73 %)	588 (100.00 %)	4,330,716 (32.85 %)	661,966 (1.52 %)	18,302,021 (42.22 %)	130,245 (2.79 %)
399	nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor) GCF_000208655.3	46,110 (1.87 %)	20,820 (1.08 %)	25,226 (1.08 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,437 (9.13 %)	314,788 (90.87 %)	4,552,770 (34.01 %)	651,225 (1.26 %)	19,266,969 (38.27 %)	139,490 (2.47 %)
400	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022) GCA_026167925.1	n/a	19,342 (1.57 %)	20,947 (1.48 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	229 (0.00 %)	1,006 (100.00 %)	4,161,568 (23.13 %)	1,278,205 (8.22 %)	13,148,019 (37.60 %)	23,523 (0.71 %)
401	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022) GCA_026229955.1	n/a	19,700 (1.54 %)	22,354 (1.46 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	244 (0.00 %)	2,082 (100.00 %)	6,089,884 (47.99 %)	1,358,786 (9.39 %)	13,799,349 (39.08 %)	24,733 (0.70 %)
402	North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023) GCA_028500835.1	n/a	15,210 (1.55 %)	18,316 (1.43 %)	n/a	41.06 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,051 (100.00 %)	3,911,633 (40.55 %)	565,546 (1.54 %)	10,853,726 (32.61 %)	40,925 (1.35 %)
403	North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1	n/a	18,102 (1.58 %)	20,073 (1.40 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	277 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,958,089 (41.64 %)	719,163 (1.59 %)	13,867,662 (33.89 %)	51,299 (1.36 %)
404	North Atlantic right whale (hap1 2023) GCA_028571275.1	n/a	18,699 (1.61 %)	20,354 (1.28 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	385 (0.16 %)	947 (100.00 %)	3,815,900 (43.46 %)	718,935 (11.38 %)	11,928,210 (42.25 %)	85,881 (1.90 %)
405	North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq) GCF_028564815.1	49,646 (1.86 %)	19,562 (1.46 %)	21,631 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	367 (0.17 %)	789 (100.00 %)	1,368,536 (2.24 %)	841,303 (13.08 %)	12,527,582 (43.92 %)	94,259 (1.92 %)
406	North Pacific right whale GCA_004363455.1	n/a	23,145 (1.43 %)	38,161 (1.21 %)	n/a	41.15 (99.88 %)	7,094 (0.03 %)	1,361,057 (99.97 %)	5,039,622 (45.69 %)	694,986 (1.31 %)	14,063,101 (40.51 %)	74,800 (1.52 %)
407	northern American river otter GCF_010015895.1	53,945 (2.18 %)	18,974 (1.68 %)	21,247 (1.45 %)	n/a	41.41 (99.58 %)	7,620 (0.42 %)	13,541 (99.58 %)	4,538,847 (41.18 %)	685,281 (1.20 %)	13,840,953 (32.61 %)	53,559 (1.88 %)
408	northern bat (alternate hap 2023) GCA_951640545.1	n/a	18,343 (1.80 %)	23,253 (1.77 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	4,899 (100.00 %)	1,174,241 (2.96 %)	825,170 (5.11 %)	9,889,579 (36.12 %)	76,164 (3.52 %)
409	northern bat (primary hap 2023) GCA_951640355.1	n/a	18,636 (1.75 %)	21,446 (1.68 %)	n/a	43.32 (99.99 %)	1,423 (0.01 %)	207 (100.00 %)	1,259,729 (2.95 %)	905,676 (6.25 %)	10,554,535 (38.21 %)	77,656 (3.27 %)
410	northern black mastiff bat (mMolNig1 2022) GCA_026936385.1	n/a	18,924 (1.53 %)	22,934 (1.58 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	199 (0.00 %)	146 (100.00 %)	3,850,624 (31.21 %)	648,359 (3.76 %)	11,788,702 (39.25 %)	85,908 (2.60 %)
411	northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024) GCA_039880945.1	n/a	18,933 (1.44 %)	23,629 (1.50 %)	n/a	42.60 (100.00 %)	113 (0.00 %)	366 (100.00 %)	4,027,155 (30.73 %)	712,278 (5.22 %)	12,003,034 (41.58 %)	96,116 (3.02 %)
412	northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024) GCA_039880925.1	n/a	18,305 (1.49 %)	22,534 (1.56 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	80 (0.00 %)	282 (100.00 %)	3,783,543 (30.10 %)	656,592 (4.68 %)	11,353,707 (40.26 %)	92,041 (3.01 %)
413	northern bottlenose whale (alternate hap 2023) GCA_949752845.1	n/a	19,537 (1.44 %)	27,826 (1.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	n/a	23,401 (100.00 %)	3,634,923 (35.56 %)	672,860 (11.00 %)	11,175,398 (41.72 %)	62,007 (1.94 %)
414	northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1	n/a	19,073 (1.44 %)	20,821 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	1,098 (0.01 %)	757 (100.00 %)	3,997,911 (34.76 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,820 (44.83 %)	67,258 (2.00 %)
415	northern elephant seal (BS05 2019 Broad) GCA_004023865.1	n/a	22,834 (1.54 %)	36,083 (1.32 %)	n/a	41.52 (99.94 %)	9,483 (0.04 %)	330,739 (99.96 %)	4,849,944 (43.83 %)	600,306 (1.16 %)	13,420,049 (34.43 %)	57,236 (1.62 %)
416	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank) GCA_029215605.1	n/a	19,278 (1.60 %)	19,908 (1.39 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	596 (100.00 %)	4,348,333 (34.40 %)	621,985 (2.21 %)	13,251,768 (35.32 %)	69,898 (2.38 %)
417	Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq) GCF_029215605.1	74,106 (3.88 %)	19,277 (1.60 %)	20,000 (1.36 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	595 (100.00 %)	4,348,327 (34.40 %)	621,980 (2.21 %)	13,251,706 (35.32 %)	69,897 (2.38 %)
418	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023) GCA_029215635.1	n/a	19,340 (1.59 %)	19,732 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	60 (0.00 %)	482 (100.00 %)	4,365,070 (34.26 %)	627,639 (2.43 %)	13,174,494 (35.47 %)	74,314 (2.49 %)
419	northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022) GCF_021288785.2	53,819 (3.32 %)	20,099 (1.75 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,368,400 (33.93 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	52,064 (1.59 %)
420	northern fur seal GCF_003265705.1	54,940 (2.43 %)	23,408 (1.78 %)	23,666 (1.43 %)	52,089 (2.17 %)	41.48 (98.01 %)	38,666 (1.99 %)	52,469 (98.01 %)	5,047,032 (43.38 %)	638,130 (1.06 %)	14,922,442 (33.12 %)	57,281 (1.44 %)
421	northern gundi GCA_004027205.1	n/a	18,035 (1.39 %)	27,379 (1.57 %)	n/a	42.68 (99.91 %)	5,037 (0.02 %)	865,110 (99.98 %)	4,149,883 (27.83 %)	654,063 (1.64 %)	12,342,565 (33.72 %)	47,533 (1.43 %)
422	northern mole vole GCA_001685095.1	n/a	23,252 (1.39 %)	44,209 (1.25 %)	n/a	41.68 (99.04 %)	371,627 (0.98 %)	722,087 (99.02 %)	3,923,814 (25.79 %)	898,453 (2.47 %)	13,708,986 (29.04 %)	16,583 (0.36 %)
423	northern white rhinoceros GCA_004027795.1	n/a	25,328 (1.34 %)	61,003 (1.95 %)	n/a	41.32 (99.90 %)	7,054 (0.03 %)	949,480 (99.97 %)	4,330,882 (38.89 %)	484,754 (1.12 %)	15,544,248 (33.11 %)	43,689 (2.08 %)
424	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank) GCA_036323735.1	114,725 (42.69 %)	21,917 (1.75 %)	19,476 (1.26 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	77 (100.00 %)	4,700,726 (39.99 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,813 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
425	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq) GCF_036323735.1	114,725 (5.38 %)	21,870 (1.74 %)	19,989 (1.27 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	76 (100.00 %)	5,294,185 (42.75 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,760 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
426	Norway rat (F344/Stm 2024) GCA_041222355.1	n/a	21,764 (1.78 %)	20,141 (1.30 %)	n/a	41.87 (99.96 %)	234 (0.04 %)	120 (100.00 %)	4,636,987 (39.98 %)	1,579,595 (5.22 %)	13,544,768 (38.06 %)	20,127 (0.46 %)
427	Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1	n/a	3,096 (1.64 %)	2,450 (1.02 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	6 (0.00 %)	3,156 (100.00 %)	517,347 (50.76 %)	157,701 (3.90 %)	1,502,752 (34.14 %)	1,806 (0.40 %)
428	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	99,139 (4.10 %)	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	19,244 (0.46 %)
429	Norway rat celera GCF_000002265.2	39,745 (2.91 %)	21,492 (1.95 %)	19,112 (1.38 %)	n/a	41.98 (95.28 %)	111,391 (4.74 %)	118,423 (95.26 %)	9,721,869 (43.57 %)	1,387,703 (3.05 %)	13,224,921 (32.45 %)	18,944 (0.42 %)
430	Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5	69,456 (3.34 %)	22,369 (1.83 %)	20,269 (1.32 %)	n/a	41.93 (95.13 %)	145,731 (4.89 %)	76,195 (95.16 %)	5,329,187 (44.14 %)	1,620,304 (3.72 %)	14,520,050 (33.09 %)	22,600 (0.47 %)
431	Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022 GCA_023515785.1	n/a	21,116 (1.68 %)	20,103 (1.27 %)	57,027 (2.45 %)	41.85 (99.82 %)	1,256 (0.18 %)	2,151 (100.00 %)	4,704,388 (38.22 %)	1,611,144 (5.76 %)	13,524,575 (38.35 %)	20,720 (0.48 %)
432	Norway rat SHRSP/BppUtx 2022 GCA_021556685.1	n/a	22,366 (1.71 %)	20,531 (1.26 %)	57,580 (2.44 %)	41.86 (99.94 %)	1,610 (0.06 %)	2,734 (100.00 %)	5,238,574 (46.36 %)	1,638,412 (5.87 %)	13,769,141 (38.49 %)	21,006 (0.49 %)
433	Norway rat WKY/Bbb 2022 GCA_023515805.1	n/a	21,607 (1.68 %)	21,244 (1.28 %)	58,136 (2.47 %)	41.92 (99.80 %)	1,456 (0.20 %)	3,553 (100.00 %)	4,811,412 (38.21 %)	1,650,950 (5.41 %)	13,740,644 (38.24 %)	21,449 (0.51 %)
434	nutria GCA_004027025.1	n/a	24,707 (1.00 %)	47,533 (1.18 %)	n/a	41.70 (99.84 %)	15,249 (0.05 %)	1,684,916 (99.95 %)	6,961,690 (30.09 %)	1,698,977 (3.31 %)	15,207,563 (42.57 %)	59,854 (1.00 %)
435	okapi GCA_001660835.1	n/a	21,483 (1.43 %)	31,061 (1.26 %)	n/a	41.48 (95.11 %)	376,008 (4.86 %)	1,213,177 (95.14 %)	5,808,036 (42.90 %)	619,044 (4.22 %)	14,940,153 (35.17 %)	47,417 (1.12 %)
436	Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1	30,625 (2.21 %)	17,959 (1.54 %)	19,318 (1.54 %)	n/a	42.06 (92.36 %)	83,035 (7.65 %)	148,226 (92.35 %)	4,337,455 (33.76 %)	1,140,316 (7.60 %)	10,422,685 (36.59 %)	61,921 (3.56 %)
437	pacarana GCA_004027595.1	n/a	20,748 (1.20 %)	33,195 (1.31 %)	n/a	41.81 (99.90 %)	6,392 (0.02 %)	1,164,830 (99.98 %)	4,374,443 (30.16 %)	660,811 (1.38 %)	14,062,133 (35.99 %)	59,382 (1.23 %)
438	Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad) GCA_004363475.1	n/a	21,575 (1.07 %)	47,478 (1.31 %)	n/a	41.87 (99.76 %)	18,801 (0.07 %)	2,428,619 (99.93 %)	4,881,232 (20.80 %)	1,352,971 (4.11 %)	12,583,960 (48.42 %)	74,961 (2.33 %)
439	Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo) GCF_023159225.1	46,202 (2.48 %)	18,752 (1.50 %)	22,526 (1.60 %)	n/a	41.98 (99.96 %)	1,807 (0.04 %)	6,180 (100.00 %)	3,313,319 (16.79 %)	1,066,382 (10.88 %)	9,981,468 (42.63 %)	49,134 (2.83 %)
440	Pacific walrus GCF_000321225.1	27,163 (1.89 %)	20,293 (1.71 %)	20,982 (1.48 %)	n/a	41.36 (95.85 %)	66,766 (4.16 %)	70,656 (95.84 %)	4,372,578 (41.12 %)	511,500 (1.05 %)	13,507,582 (30.43 %)	45,142 (1.29 %)
441	Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1	65,947 (3.26 %)	18,743 (1.79 %)	20,862 (1.45 %)	31,917 (1.69 %)	41.28 (99.56 %)	16,699 (0.44 %)	21,350 (99.56 %)	3,971,820 (45.64 %)	574,056 (1.14 %)	12,602,965 (34.83 %)	62,275 (1.67 %)
442	pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019) GCA_004115245.1	n/a	18,118 (1.63 %)	23,536 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,873 (100.00 %)	3,001,130 (29.46 %)	375,042 (0.79 %)	11,813,971 (29.64 %)	67,712 (4.23 %)
443	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020) GCA_004115245.2	n/a	18,116 (1.63 %)	23,608 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,895 (100.00 %)	3,002,448 (29.46 %)	375,226 (0.79 %)	11,824,034 (29.65 %)	67,718 (4.23 %)
444	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2	54,932 (3.31 %)	18,171 (1.69 %)	20,025 (1.62 %)	42,786 (3.39 %)	42.38 (99.28 %)	884 (0.72 %)	77 (100.00 %)	3,069,141 (30.00 %)	385,664 (0.81 %)	12,050,232 (30.57 %)	63,905 (3.75 %)
445	Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1	48,421 (2.20 %)	18,667 (1.61 %)	21,915 (1.59 %)	n/a	42.35 (97.95 %)	349 (2.05 %)	60 (100.00 %)	3,863,217 (32.76 %)	624,933 (1.88 %)	11,572,319 (37.09 %)	79,984 (2.45 %)
446	pallid bat (TK200870 primary hap 2023) GCA_027563665.1	n/a	19,688 (1.69 %)	21,998 (1.64 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	234 (0.28 %)	112 (99.99 %)	2,794,986 (22.60 %)	938,016 (3.72 %)	11,241,518 (39.41 %)	70,272 (2.89 %)
447	Parnell's mustached bat (2013) GCA_000465405.1	n/a	21,436 (1.40 %)	57,232 (2.18 %)	n/a	40.82 (99.34 %)	265,720 (0.70 %)	443,121 (99.30 %)	2,780,805 (29.26 %)	290,520 (0.63 %)	12,354,814 (27.13 %)	69,806 (1.89 %)
448	Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021) GCF_021234165.1	37,033 (2.48 %)	18,339 (1.76 %)	21,630 (1.69 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	12 (0.00 %)	333 (100.00 %)	2,828,339 (30.56 %)	333,670 (0.75 %)	12,444,271 (30.90 %)	53,180 (4.61 %)
449	particolored bat (primary hap 2024) GCA_963924515.1	n/a	17,913 (1.72 %)	20,720 (1.72 %)	n/a	43.54 (99.99 %)	980 (0.01 %)	185 (100.00 %)	2,932,869 (21.94 %)	874,665 (4.83 %)	10,263,103 (37.46 %)	77,397 (4.55 %)
450	Patagonian cavy GCA_004027295.1	n/a	21,143 (0.94 %)	40,887 (1.10 %)	n/a	39.86 (99.87 %)	6,223 (0.02 %)	1,911,987 (99.98 %)	5,194,890 (30.95 %)	892,551 (2.11 %)	17,052,577 (40.22 %)	45,730 (0.84 %)
451	Pere David's deer GCA_002443075.1	n/a	20,723 (1.65 %)	23,551 (1.43 %)	n/a	41.58 (97.49 %)	144,642 (2.51 %)	339,454 (97.49 %)	5,171,293 (43.30 %)	427,987 (1.20 %)	13,665,133 (35.97 %)	48,374 (1.14 %)
452	Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022) GCA_027409165.1	n/a	18,794 (1.72 %)	21,421 (1.40 %)	n/a	40.18 (100.00 %)	n/a	1,750 (100.00 %)	4,001,442 (39.37 %)	547,894 (2.75 %)	13,870,563 (34.33 %)	40,162 (1.31 %)
453	Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank) GCA_027409185.1	n/a	20,384 (1.64 %)	22,124 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,492,423 (39.31 %)	627,842 (4.79 %)	15,561,515 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
454	Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq) GCF_027409185.1	44,950 (1.91 %)	20,385 (1.64 %)	22,123 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	130 (100.00 %)	4,492,417 (39.31 %)	627,841 (4.79 %)	15,561,458 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
455	pig (Bamei 2023) GCA_030704935.1	n/a	18,472 (1.44 %)	19,911 (1.28 %)	n/a	42.63 (99.98 %)	878 (0.02 %)	379 (100.00 %)	3,996,827 (27.97 %)	2,094,728 (7.23 %)	12,677,118 (40.57 %)	81,791 (2.82 %)
456	pig (Duroc 2017) GCF_000003025.6	77,695 (4.05 %)	18,980 (1.64 %)	19,453 (1.32 %)	59,876 (4.84 %)	41.87 (98.81 %)	544 (1.19 %)	1,313 (98.81 %)	5,021,184 (45.67 %)	710,994 (1.32 %)	13,243,289 (36.33 %)	79,132 (1.82 %)
457	pig (USMARCv1 2017) GCA_002844635.1	n/a	19,458 (1.54 %)	21,487 (1.27 %)	58,655 (2.58 %)	42.49 (95.20 %)	661 (4.80 %)	14,157 (100.00 %)	5,159,244 (47.53 %)	902,079 (3.63 %)	13,145,120 (36.86 %)	82,442 (2.62 %)
458	plains zebra (Etosha38 2022 UCLA) GCF_021613505.1	55,779 (2.87 %)	19,529 (1.76 %)	21,214 (1.39 %)	n/a	41.38 (99.04 %)	14,595 (0.96 %)	11,098 (100.00 %)	3,683,862 (38.74 %)	314,723 (0.68 %)	15,217,328 (29.38 %)	41,391 (1.27 %)
459	platypus (alternate hap Pmale09 2020) GCA_004115175.2	n/a	13,244 (1.26 %)	19,241 (1.68 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	25 (0.00 %)	5,868 (100.00 %)	4,420,884 (51.59 %)	513,006 (3.13 %)	7,749,797 (49.18 %)	81,538 (8.24 %)
460	platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2	51,392 (3.07 %)	14,778 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,071,089 (51.34 %)	578,614 (2.89 %)	9,113,848 (48.93 %)	87,796 (6.47 %)
461	polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq) GCF_000687225.1	35,764 (2.39 %)	18,466 (1.69 %)	15,384 (1.38 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	134,162 (98.33 %)	4,123,540 (40.16 %)	553,196 (1.29 %)	13,765,581 (29.91 %)	54,907 (1.17 %)
462	polar bear (UCSC 2021) GCF_017311325.1	52,188 (2.92 %)	18,588 (1.75 %)	20,731 (1.54 %)	n/a	41.88 (99.60 %)	45,532 (0.41 %)	3,900 (100.00 %)	4,204,162 (40.75 %)	572,129 (1.75 %)	13,926,894 (30.79 %)	63,315 (1.93 %)
463	prairie deer mouse (Baylor 2013) GCF_000500345.1	50,187 (2.51 %)	20,427 (1.69 %)	20,874 (1.45 %)	n/a	42.34 (94.06 %)	182,263 (5.97 %)	212,962 (94.03 %)	n/a	1,229,123 (2.83 %)	14,447,916 (30.09 %)	23,246 (0.56 %)
464	prairie deer mouse (Harvard 2020) GCF_003704035.1	69,779 (3.28 %)	19,755 (1.73 %)	19,194 (1.43 %)	n/a	42.28 (95.07 %)	147,442 (4.96 %)	155,966 (95.04 %)	4,751,621 (29.04 %)	1,172,212 (2.66 %)	13,934,672 (29.87 %)	22,444 (0.57 %)
465	prairie vole GCF_000317375.1	40,484 (2.72 %)	19,648 (1.91 %)	19,489 (1.62 %)	n/a	42.25 (92.03 %)	180,677 (8.00 %)	187,012 (92.00 %)	3,779,126 (25.51 %)	879,192 (2.11 %)	12,360,347 (27.34 %)	18,233 (0.52 %)
466	proboscis bat (hap1 2024) GCA_037038545.1	n/a	17,919 (1.46 %)	19,330 (1.31 %)	n/a	40.78 (100.00 %)	68 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,707,234 (28.28 %)	643,817 (2.22 %)	12,106,384 (41.48 %)	54,438 (1.38 %)
467	proboscis bat (hap2 2024) GCA_037038555.1	n/a	17,253 (1.51 %)	18,507 (1.35 %)	n/a	40.91 (100.00 %)	39 (0.00 %)	38 (100.00 %)	3,466,835 (27.96 %)	585,261 (1.91 %)	11,364,898 (40.65 %)	50,527 (1.37 %)
468	pronghorn (PH2016 2021) GCA_021018645.1	n/a	21,848 (1.58 %)	27,614 (1.56 %)	n/a	41.70 (96.83 %)	74,027 (3.17 %)	140,480 (96.83 %)	3,335,744 (24.40 %)	405,435 (4.11 %)	13,855,606 (34.67 %)	48,670 (1.19 %)
469	Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq) GCF_000696695.1	45,076 (2.76 %)	19,546 (1.69 %)	22,107 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	134,060 (99.12 %)	3,787,533 (40.54 %)	435,607 (1.73 %)	14,738,418 (28.36 %)	40,752 (0.94 %)
470	puma (L17-30 alternate hap 2023) GCA_028749965.1	n/a	18,380 (1.53 %)	20,701 (1.40 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	96 (0.00 %)	304 (100.00 %)	4,881,674 (33.96 %)	978,817 (2.17 %)	13,422,986 (35.08 %)	69,437 (2.62 %)
471	puma (L17-30 primary hap 2023) GCA_028749985.1	n/a	17,553 (1.53 %)	19,299 (1.39 %)	n/a	41.89 (100.00 %)	134 (0.00 %)	390 (100.00 %)	4,629,539 (33.53 %)	919,008 (2.02 %)	12,766,157 (34.70 %)	65,437 (2.53 %)
472	puma (SC36_Marlon 2018 refseq) GCF_003327715.1	25,575 (1.43 %)	17,664 (1.57 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	178,992 (4.69 %)	2,175 (100.00 %)	4,885,335 (42.70 %)	833,138 (1.76 %)	13,705,778 (31.28 %)	58,912 (1.65 %)
473	punctate agouti GCA_004363535.1	n/a	22,612 (1.05 %)	45,433 (1.19 %)	n/a	40.79 (99.92 %)	6,459 (0.02 %)	993,123 (99.98 %)	5,671,738 (32.53 %)	945,722 (1.69 %)	17,003,309 (36.58 %)	85,696 (1.65 %)
474	pygmy sperm whale GCA_004363705.1	n/a	22,661 (1.30 %)	42,546 (1.15 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	6,053 (0.02 %)	1,258,125 (99.98 %)	5,185,912 (43.65 %)	836,752 (1.88 %)	14,150,125 (39.88 %)	95,344 (2.15 %)
475	pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq) GCF_026419965.1	56,261 (2.22 %)	18,496 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	143 (0.19 %)	581 (100.00 %)	3,817,659 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,998 (39.96 %)	101,353 (2.90 %)
476	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1	n/a	18,550 (1.51 %)	20,491 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	138 (0.01 %)	391 (100.00 %)	3,860,112 (33.83 %)	820,375 (9.58 %)	12,159,196 (41.59 %)	106,168 (2.78 %)
477	Pyrenean desman (IBE-C5619 2021) GCA_019455555.1	n/a	17,527 (1.87 %)	20,474 (1.83 %)	n/a	41.67 (98.52 %)	63,679 (1.49 %)	75,985 (98.51 %)	2,147,379 (23.41 %)	327,740 (0.98 %)	10,539,226 (28.05 %)	44,487 (4.39 %)
478	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq) GCF_009806435.1	83,045 (4.16 %)	19,486 (1.31 %)	23,267 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	18,178 (2.32 %)	3,160 (100.00 %)	4,072,524 (21.41 %)	976,273 (2.33 %)	13,766,413 (39.76 %)	113,371 (2.46 %)
479	rabbit (primary hap 2024) GCA_964237555.1	n/a	19,386 (1.31 %)	22,863 (1.35 %)	n/a	44.02 (99.98 %)	2,276 (0.02 %)	222 (100.00 %)	4,099,590 (21.20 %)	1,062,902 (3.78 %)	13,416,878 (41.72 %)	116,524 (2.66 %)
480	rabbit (primary hap 2024) GCF_964237555.1	95,289 (4.22 %)	19,385 (1.31 %)	22,631 (1.31 %)	n/a	44.02 (99.98 %)	2,276 (0.02 %)	221 (100.00 %)	4,099,586 (21.20 %)	1,062,900 (3.78 %)	13,416,814 (41.72 %)	116,523 (2.66 %)
481	rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq) GCF_000003625.3	43,655 (2.34 %)	18,665 (1.39 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,890,480 (44.71 %)	883,939 (1.73 %)	13,254,520 (38.27 %)	110,337 (2.33 %)
482	raccoon dog (2021) GCF_905146905.1	52,564 (2.89 %)	19,628 (1.60 %)	20,274 (1.43 %)	n/a	41.28 (99.98 %)	70 (0.02 %)	811 (100.00 %)	4,499,368 (31.98 %)	1,005,212 (2.04 %)	13,884,201 (32.95 %)	52,450 (2.27 %)
483	Rambouillet sheep (Baylor 2017) GCF_002742125.1	50,096 (2.48 %)	19,992 (1.47 %)	22,506 (1.31 %)	41,290 (1.46 %)	41.91 (99.99 %)	4,847 (0.01 %)	7,486 (99.99 %)	5,764,757 (47.38 %)	507,629 (1.55 %)	14,138,601 (41.27 %)	51,748 (1.29 %)
484	Rambouillet sheep (U.Idaho 2021) GCF_016772045.1	70,474 (3.21 %)	19,413 (1.59 %)	21,222 (1.35 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	84 (0.00 %)	142 (100.00 %)	5,300,958 (46.83 %)	455,553 (1.24 %)	13,023,443 (40.62 %)	43,959 (1.30 %)
485	ratel GCA_004024625.1	n/a	22,196 (1.21 %)	35,937 (1.18 %)	n/a	42.00 (99.85 %)	6,511 (0.02 %)	2,074,823 (99.98 %)	6,171,383 (41.93 %)	877,669 (1.49 %)	15,269,908 (41.22 %)	95,094 (1.91 %)
486	red bat GCA_004026805.1	n/a	27,510 (1.22 %)	65,467 (1.48 %)	n/a	42.69 (99.94 %)	6,380 (0.02 %)	525,280 (99.98 %)	4,644,227 (28.24 %)	1,170,868 (2.68 %)	15,628,238 (39.97 %)	125,564 (3.55 %)
487	red deer (2021) GCF_910594005.1	68,992 (2.68 %)	20,470 (1.48 %)	22,563 (1.32 %)	n/a	42.98 (100.00 %)	40 (0.00 %)	144 (100.00 %)	5,501,063 (44.60 %)	503,301 (12.23 %)	13,102,622 (44.55 %)	88,756 (1.66 %)
488	red deer (alternate hap 2021) GCA_910593805.1	n/a	18,817 (1.29 %)	21,916 (1.20 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	22 (0.00 %)	4,021 (100.00 %)	3,279,005 (20.48 %)	472,706 (21.87 %)	11,466,609 (50.26 %)	128,858 (2.07 %)
489	red fox (hap1 2024) GCA_964106825.2	n/a	19,622 (1.57 %)	20,371 (1.38 %)	n/a	41.34 (99.98 %)	1,845 (0.02 %)	461 (100.00 %)	4,519,485 (31.91 %)	1,018,114 (2.59 %)	13,810,284 (32.99 %)	52,053 (2.31 %)
490	red fox (hap2 2024) GCA_964106925.2	n/a	19,517 (1.57 %)	20,105 (1.37 %)	n/a	41.31 (99.99 %)	1,819 (0.02 %)	350 (100.00 %)	4,487,839 (31.79 %)	1,010,106 (2.64 %)	13,838,711 (33.07 %)	51,373 (2.26 %)
491	red fox (tameXaggressive cross 2018) GCF_003160815.1	43,495 (2.67 %)	19,826 (1.69 %)	18,893 (1.40 %)	n/a	41.08 (97.06 %)	246,167 (2.96 %)	82,424 (100.00 %)	4,919,102 (40.79 %)	954,461 (2.46 %)	14,190,625 (30.86 %)	53,204 (1.88 %)
492	reed vole (MF-2015 2020) GCF_014885135.2	55,722 (3.60 %)	19,808 (1.93 %)	20,787 (1.69 %)	n/a	42.36 (95.60 %)	67,118 (4.40 %)	10,460 (100.00 %)	3,130,955 (20.09 %)	831,969 (2.09 %)	11,985,657 (28.48 %)	18,764 (0.58 %)
493	Reeves' muntjac (alternate hap 2024) GCA_963930665.1	n/a	18,947 (1.29 %)	24,114 (1.28 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	n/a	8,892 (100.00 %)	3,375,476 (23.21 %)	654,539 (6.64 %)	11,132,469 (48.29 %)	79,357 (2.66 %)
494	Reeves' muntjac (primary hap 2024) GCF_963930625.1	52,442 (2.57 %)	19,577 (1.52 %)	22,283 (1.38 %)	n/a	41.89 (99.99 %)	682 (0.01 %)	267 (100.00 %)	3,294,672 (23.89 %)	527,436 (2.98 %)	13,137,581 (39.89 %)	57,436 (1.81 %)
495	reindeer (2023) GCA_963422255.1	n/a	21,329 (1.58 %)	25,201 (1.59 %)	n/a	41.46 (98.35 %)	131,886 (1.65 %)	259,765 (98.35 %)	3,254,173 (23.49 %)	440,431 (2.00 %)	14,258,607 (36.17 %)	48,931 (1.20 %)
496	reindeer (US061 2019) GCA_004026565.1	n/a	24,150 (1.39 %)	39,911 (1.41 %)	n/a	42.08 (99.89 %)	4,769 (0.02 %)	1,365,508 (99.98 %)	6,083,178 (46.10 %)	546,470 (1.23 %)	14,434,855 (43.16 %)	55,319 (1.23 %)
497	Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1	n/a	19,396 (1.48 %)	21,693 (1.26 %)	n/a	41.62 (97.80 %)	131 (2.20 %)	1,039 (100.00 %)	3,973,936 (35.55 %)	987,571 (11.66 %)	12,473,459 (42.11 %)	74,971 (1.64 %)
498	Rice's whale (hap2 2023 refseq) GCF_028023285.1	59,888 (2.34 %)	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	73,126 (1.69 %)
499	Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024) GCA_036010255.1	n/a	18,982 (1.81 %)	22,002 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	n/a	105 (100.00 %)	2,909,847 (24.53 %)	757,964 (3.03 %)	10,561,925 (36.25 %)	57,318 (2.32 %)
500	Ryukyu mouse (v2 2017) GCF_900094665.2	53,779 (2.85 %)	21,351 (2.29 %)	18,073 (1.39 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	306,599 (10.98 %)	30,835 (92.70 %)	4,479,912 (35.83 %)	1,351,677 (2.59 %)	12,964,608 (27.49 %)	15,963 (0.43 %)
501	Saanen dairy goat GCA_015443085.1	n/a	19,257 (1.54 %)	21,221 (1.32 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	170 (0.00 %)	1,362 (100.00 %)	5,336,862 (47.58 %)	515,161 (2.87 %)	13,144,895 (41.67 %)	58,623 (2.22 %)
502	saddleback dolphin (alternate hap 2023) GCA_949987525.1	n/a	18,509 (1.54 %)	22,514 (1.36 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	3,675,922 (35.75 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	63,587 (3.15 %)
503	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq) GCF_949987515.1	46,746 (2.39 %)	18,624 (1.49 %)	20,662 (1.31 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	630 (100.00 %)	4,020,676 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,748 (42.64 %)	66,179 (3.91 %)
504	saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_949987515.2	46,014 (2.36 %)	18,616 (1.49 %)	20,618 (1.32 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	1,598 (99.99 %)	4,020,525 (35.99 %)	1,258,165 (13.09 %)	12,359,758 (42.64 %)	66,188 (3.91 %)
505	saiga antelope GCA_004024985.1	n/a	23,736 (0.84 %)	55,133 (0.88 %)	n/a	42.52 (99.87 %)	2,867 (0.01 %)	1,775,066 (99.99 %)	6,485,113 (49.43 %)	447,097 (0.88 %)	13,972,753 (44.46 %)	46,883 (0.82 %)
506	Schreibers' long-fingered bat (hap1 2024) GCA_964146895.1	n/a	17,882 (1.96 %)	21,291 (1.88 %)	n/a	42.53 (99.99 %)	1,322 (0.01 %)	265 (100.00 %)	2,639,522 (28.12 %)	453,024 (5.66 %)	10,206,715 (31.11 %)	59,363 (2.86 %)
507	Schreibers' long-fingered bat (hap2 2024) GCA_964145185.1	n/a	17,115 (2.05 %)	19,972 (1.93 %)	n/a	42.62 (99.99 %)	1,137 (0.01 %)	1,305 (99.99 %)	2,445,695 (27.61 %)	386,295 (4.40 %)	9,657,997 (29.32 %)	56,451 (2.93 %)
508	Schreibers' long-fingered bat (US075 2019) GCA_004026525.1	n/a	20,147 (2.06 %)	31,271 (1.82 %)	n/a	42.27 (99.94 %)	6,918 (0.04 %)	184,538 (99.96 %)	2,772,932 (29.66 %)	366,782 (1.13 %)	10,477,531 (28.60 %)	62,520 (2.73 %)
509	scimitar-horned oryx GCF_014754425.2	51,527 (2.72 %)	19,713 (1.57 %)	21,928 (1.32 %)	n/a	41.74 (99.30 %)	16,241 (0.70 %)	9,089 (100.00 %)	5,435,109 (46.76 %)	414,279 (0.98 %)	13,490,956 (40.45 %)	42,961 (1.10 %)
510	Screaming hairy armadillo GCA_004027955.1	n/a	24,532 (0.39 %)	56,725 (0.46 %)	n/a	39.68 (99.70 %)	2,747 (0.01 %)	7,680,080 (99.99 %)	8,978,735 (36.02 %)	1,516,551 (1.58 %)	32,918,217 (47.67 %)	234,762 (1.56 %)
511	sea otter (GAN:26980312 2017 refseq) GCF_002288905.1	38,127 (2.16 %)	18,578 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,179 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	23,134 (1.21 %)	29,589 (98.79 %)	4,703,044 (41.42 %)	721,750 (1.39 %)	14,065,653 (32.89 %)	55,388 (1.87 %)
512	Seba's short-tailed bat GCA_004027735.1	n/a	21,878 (0.94 %)	55,858 (1.10 %)	n/a	42.70 (99.84 %)	3,864 (0.01 %)	1,929,203 (99.99 %)	3,802,235 (28.35 %)	606,320 (1.03 %)	15,171,250 (31.99 %)	118,227 (2.28 %)
513	sheep (OAR_USU_Benz2616 2023) GCF_016772045.2	89,680 (5.44 %)	19,308 (1.52 %)	21,506 (1.35 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	84 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,275,767 (22.85 %)	464,346 (1.26 %)	12,987,607 (40.61 %)	44,477 (1.28 %)
514	sheep (Texel 2015) GCA_000298735.2	n/a	19,179 (1.56 %)	19,001 (1.26 %)	48,105 (1.85 %)	41.90 (98.94 %)	44,566 (1.07 %)	48,481 (98.93 %)	5,429,824 (46.13 %)	540,267 (1.64 %)	13,509,668 (38.83 %)	43,911 (1.13 %)
515	shrew mouse GCF_900095145.1	46,279 (2.64 %)	20,549 (2.23 %)	18,979 (1.49 %)	94,079 (3.98 %)	41.89 (90.53 %)	269,643 (9.50 %)	17,879 (93.73 %)	4,788,498 (38.32 %)	1,499,714 (3.03 %)	13,021,757 (27.83 %)	16,787 (0.47 %)
516	Siberian hamster (SSSS 2022) GCA_023856395.1	n/a	18,375 (1.83 %)	17,066 (1.44 %)	n/a	41.27 (99.64 %)	88,601 (0.37 %)	7,756 (100.00 %)	3,152,242 (21.63 %)	1,087,009 (2.64 %)	12,055,167 (29.20 %)	15,455 (0.48 %)
517	Siberian musk deer (BS20 2019 Broad) GCA_004024705.1	n/a	23,440 (1.32 %)	37,497 (1.19 %)	n/a	42.32 (99.86 %)	19,764 (0.07 %)	1,195,467 (99.93 %)	6,726,950 (49.79 %)	437,480 (1.57 %)	14,155,240 (46.22 %)	49,177 (1.05 %)
518	small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2	37,090 (1.93 %)	18,969 (1.19 %)	19,298 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.43 %)	270,406 (11.60 %)	7,490 (100.00 %)	3,789,337 (28.89 %)	429,226 (0.87 %)	16,951,112 (32.23 %)	39,993 (0.70 %)
519	smoky shrew (2023) GCF_029834395.1	37,165 (1.66 %)	17,572 (1.06 %)	24,146 (1.29 %)	n/a	43.43 (100.00 %)	n/a	497 (100.00 %)	2,593,080 (14.11 %)	1,194,567 (7.25 %)	14,051,522 (48.20 %)	107,473 (2.80 %)
520	snow leopard (11264 2022) GCF_023721935.1	53,556 (3.37 %)	18,780 (1.67 %)	21,038 (1.40 %)	n/a	41.60 (99.30 %)	23,786 (0.70 %)	2,636 (100.00 %)	4,714,429 (34.93 %)	919,518 (1.59 %)	13,711,504 (33.24 %)	64,690 (2.41 %)
521	snowshoe hare GCA_004026855.1	n/a	23,263 (0.88 %)	55,811 (1.01 %)	n/a	44.12 (99.87 %)	10,153 (0.03 %)	1,602,982 (99.97 %)	4,767,120 (21.29 %)	1,040,992 (2.22 %)	15,680,144 (43.23 %)	126,152 (2.28 %)
522	social tuco-tuco GCA_004027165.1	n/a	25,166 (1.12 %)	41,316 (1.26 %)	n/a	40.71 (99.89 %)	16,191 (0.06 %)	823,762 (99.94 %)	5,390,906 (28.28 %)	1,027,922 (2.15 %)	15,241,308 (38.39 %)	31,883 (0.72 %)
523	soprano pipistrelle (alternate hap 2023) GCA_949987765.1	n/a	17,590 (1.81 %)	21,597 (1.85 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,717 (100.00 %)	2,734,555 (21.46 %)	795,752 (6.56 %)	9,601,735 (36.35 %)	62,524 (3.25 %)
524	soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1	n/a	18,056 (1.78 %)	21,158 (1.79 %)	n/a	42.67 (100.00 %)	161 (0.00 %)	249 (100.00 %)	2,899,535 (21.64 %)	853,717 (7.80 %)	10,162,216 (37.72 %)	63,256 (3.06 %)
525	South African ground squirrel GCA_004024805.1	n/a	22,802 (1.44 %)	33,892 (1.27 %)	n/a	39.97 (99.92 %)	9,745 (0.04 %)	587,115 (99.96 %)	5,256,998 (34.93 %)	594,122 (1.27 %)	14,462,947 (33.96 %)	34,141 (0.80 %)
526	Southeastern Asian house mouse (2016) GCA_001624445.1	n/a	21,103 (2.24 %)	18,682 (1.45 %)	102,099 (4.16 %)	41.83 (86.23 %)	424,005 (13.83 %)	52,352 (97.85 %)	4,990,851 (39.88 %)	1,356,202 (2.67 %)	13,469,640 (26.15 %)	16,724 (0.41 %)
527	Southeastern Asian house mouse (2022) GCA_921999005.2	n/a	21,799 (2.13 %)	19,729 (1.40 %)	110,356 (4.43 %)	41.78 (99.19 %)	278 (0.81 %)	151 (100.00 %)	4,663,228 (40.41 %)	1,549,985 (3.70 %)	13,012,600 (34.99 %)	21,349 (0.52 %)
528	Southeastern Asian house mouse (T2T 2024) GCA_964188545.1	n/a	22,529 (1.85 %)	20,409 (1.22 %)	n/a	41.10 (99.90 %)	78 (0.10 %)	416 (99.90 %)	4,880,101 (47.77 %)	1,689,287 (15.13 %)	12,822,147 (42.92 %)	22,642 (0.54 %)
529	southern elephant seal GCF_011800145.1	53,210 (2.86 %)	19,520 (1.73 %)	20,727 (1.41 %)	39,634 (1.86 %)	41.45 (99.36 %)	22,850 (0.64 %)	1,115 (100.00 %)	4,728,105 (43.75 %)	585,443 (1.13 %)	13,463,979 (33.65 %)	53,182 (1.62 %)
530	southern grasshopper mouse (2020) GCF_903995425.1	47,152 (2.39 %)	19,356 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,460 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,540,762 (32.73 %)	18,046 (0.54 %)
531	southern multimammate mouse GCF_008632895.1	69,045 (3.04 %)	20,313 (2.11 %)	17,745 (1.38 %)	n/a	41.39 (91.90 %)	146,713 (8.12 %)	28 (100.00 %)	4,875,400 (38.43 %)	1,454,350 (2.93 %)	13,104,717 (28.82 %)	16,715 (0.45 %)
532	southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022) GCA_023853755.1	n/a	20,179 (1.21 %)	24,249 (1.19 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	4 (0.00 %)	7,866 (100.00 %)	3,953,031 (35.88 %)	531,111 (1.14 %)	16,354,874 (39.96 %)	59,907 (1.35 %)
533	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCA_023851605.1	n/a	20,058 (1.26 %)	22,196 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	961 (0.56 %)	201 (100.00 %)	4,037,291 (46.02 %)	593,019 (1.17 %)	18,033,833 (40.56 %)	65,039 (1.33 %)
534	southern three-banded armadillo GCA_004025125.1	n/a	29,138 (0.73 %)	56,522 (0.75 %)	n/a	39.20 (99.82 %)	15,801 (0.04 %)	2,941,308 (99.96 %)	6,990,740 (38.88 %)	839,452 (1.23 %)	24,805,397 (43.95 %)	71,951 (0.98 %)
535	southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020) GCA_015220265.1	n/a	22,897 (1.23 %)	27,007 (1.18 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	70 (0.00 %)	12,050 (100.00 %)	4,502,020 (38.27 %)	576,759 (1.02 %)	17,143,050 (40.65 %)	51,339 (1.15 %)
536	southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1	63,054 (2.39 %)	21,998 (1.29 %)	23,177 (1.18 %)	45,345 (1.69 %)	39.89 (97.48 %)	1,243 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,559,690 (39.66 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,630 (40.50 %)	51,430 (1.14 %)
537	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq) GCF_000283155.1	37,037 (2.11 %)	18,398 (1.71 %)	19,753 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	57,824 (96.04 %)	3,685,898 (38.31 %)	421,694 (0.97 %)	14,765,529 (28.93 %)	36,281 (1.02 %)
538	Sowerby's beaked whale (hap1 2024) GCA_964165515.1	n/a	19,471 (1.39 %)	22,951 (1.24 %)	n/a	42.04 (99.99 %)	1,095 (0.01 %)	1,604 (100.00 %)	4,307,839 (34.31 %)	825,475 (10.97 %)	11,375,945 (45.31 %)	76,527 (3.10 %)
539	Sowerby's beaked whale (hap2 2024) GCA_964148845.1	n/a	18,591 (1.46 %)	21,588 (1.27 %)	n/a	42.00 (99.99 %)	974 (0.01 %)	2,126 (99.99 %)	3,961,403 (34.20 %)	742,897 (9.73 %)	10,832,739 (43.68 %)	70,803 (2.85 %)
540	Sowerby's beaked whale (US080 2019) GCA_004027085.1	n/a	22,800 (1.32 %)	38,247 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.84 %)	8,597 (0.03 %)	1,810,317 (99.97 %)	5,520,986 (45.05 %)	1,081,962 (2.69 %)	13,480,261 (43.01 %)	69,001 (1.39 %)
541	sperm whale (SW-GA 2023) GCF_002837175.3	62,615 (2.83 %)	19,485 (1.75 %)	22,707 (1.41 %)	n/a	41.33 (95.82 %)	121,387 (4.20 %)	133,555 (95.80 %)	3,906,439 (36.43 %)	691,647 (2.39 %)	13,489,368 (32.95 %)	86,751 (2.23 %)
542	star-nosed mole GCF_000260355.1	30,444 (2.86 %)	16,116 (1.82 %)	17,403 (1.78 %)	n/a	41.55 (95.10 %)	82,557 (4.92 %)	84,595 (95.08 %)	1,855,039 (18.90 %)	308,473 (0.86 %)	9,571,561 (26.02 %)	48,079 (2.76 %)
543	Steller sea lion GCF_004028035.1	46,044 (2.38 %)	21,171 (1.78 %)	21,626 (1.43 %)	36,701 (1.75 %)	41.38 (99.41 %)	18,994 (0.59 %)	24,485 (99.41 %)	4,556,415 (43.53 %)	577,797 (1.09 %)	13,545,012 (33.71 %)	51,355 (1.45 %)
544	Stephens's kangaroo rat GCA_004024685.1	n/a	20,638 (1.19 %)	43,541 (1.37 %)	n/a	41.90 (99.85 %)	8,882 (0.04 %)	1,278,525 (99.96 %)	4,886,095 (30.36 %)	1,229,832 (5.30 %)	11,334,494 (44.33 %)	38,450 (1.17 %)
545	steppe mouse (ZRU 2018) GCA_003336285.1	n/a	22,032 (2.17 %)	20,891 (1.41 %)	n/a	41.70 (95.78 %)	123,681 (4.24 %)	161,217 (95.76 %)	4,964,415 (42.35 %)	1,414,584 (2.75 %)	12,989,925 (31.80 %)	17,544 (0.44 %)
546	straw-colored fruit bat GCA_000465285.1	n/a	20,161 (1.66 %)	40,283 (1.50 %)	n/a	39.24 (99.62 %)	154,908 (0.40 %)	288,446 (99.60 %)	2,814,732 (32.92 %)	372,539 (1.01 %)	12,351,823 (25.93 %)	67,245 (2.34 %)
547	stripe-headed round-eared bat GCA_004024845.1	n/a	20,248 (1.62 %)	29,173 (1.61 %)	n/a	42.04 (99.96 %)	2,860 (0.01 %)	252,670 (99.99 %)	3,018,746 (29.48 %)	333,243 (0.74 %)	12,128,116 (30.51 %)	59,513 (1.87 %)
548	striped dolphin (alternate hap 2023) GCA_951394445.1	n/a	18,204 (1.54 %)	21,036 (1.34 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	n/a	3,464 (100.00 %)	3,767,720 (35.65 %)	1,102,723 (10.92 %)	11,794,617 (40.96 %)	67,537 (3.57 %)
549	striped dolphin (primary hap 2023) GCA_951394435.1	n/a	18,595 (1.48 %)	20,637 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	993 (0.01 %)	639 (100.00 %)	4,097,623 (35.88 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,327,244 (43.08 %)	68,498 (4.29 %)
550	striped hyena (BS54 2019 Broad) GCA_004023945.1	n/a	22,373 (1.45 %)	39,382 (1.45 %)	n/a	41.66 (99.93 %)	11,849 (0.05 %)	362,072 (99.95 %)	5,048,667 (42.42 %)	712,073 (1.24 %)	13,879,012 (34.58 %)	69,835 (2.20 %)
551	striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U) GCF_003009895.1	48,870 (2.41 %)	18,793 (1.67 %)	20,950 (1.44 %)	n/a	41.56 (99.29 %)	23,058 (0.71 %)	5,761 (100.00 %)	4,782,500 (41.88 %)	701,157 (1.32 %)	13,436,624 (33.05 %)	58,977 (2.20 %)
552	sugar glider (PSGF00001 2023) GCA_028583685.1	n/a	19,326 (0.81 %)	17,560 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,895 (100.00 %)	6,382,198 (27.07 %)	1,058,207 (1.74 %)	22,508,040 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
553	sugar glider (PSGF00001 2023) GCF_028583685.1	55,990 (2.41 %)	19,328 (0.81 %)	17,559 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,896 (100.00 %)	6,382,203 (27.07 %)	1,058,208 (1.74 %)	22,508,106 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
554	Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017) GCA_002844835.1	n/a	20,368 (1.53 %)	24,204 (1.23 %)	n/a	41.05 (95.54 %)	50,876 (4.40 %)	1,112,463 (95.60 %)	4,516,240 (39.90 %)	561,540 (1.56 %)	15,821,451 (34.68 %)	45,201 (1.03 %)
555	Sumatran serow (serow.1 2024) GCF_032405125.1	36,400 (1.65 %)	19,192 (1.42 %)	22,014 (1.41 %)	n/a	43.08 (100.00 %)	6 (0.00 %)	159 (100.00 %)	3,242,768 (21.18 %)	612,565 (8.05 %)	12,812,990 (44.37 %)	75,177 (5.86 %)
556	Sunda flying lemur (2014 WashU) GCF_000696425.1	34,734 (1.83 %)	21,356 (1.55 %)	25,832 (1.21 %)	n/a	40.21 (87.96 %)	412,608 (12.07 %)	511,878 (87.93 %)	4,961,153 (38.35 %)	854,441 (3.33 %)	17,562,576 (28.82 %)	82,988 (1.05 %)
557	Sunda flying lemur (US047 2019 Broad) GCA_004027255.1	n/a	24,882 (1.29 %)	43,546 (1.12 %)	n/a	40.46 (99.88 %)	5,895 (0.02 %)	1,655,642 (99.98 %)	5,807,241 (38.62 %)	953,765 (2.48 %)	18,836,777 (37.68 %)	114,955 (1.43 %)
558	tailed tailless bat GCA_004027475.1	n/a	19,920 (1.58 %)	28,017 (1.58 %)	n/a	41.76 (99.95 %)	4,640 (0.02 %)	341,895 (99.98 %)	3,139,817 (30.43 %)	381,536 (0.81 %)	12,069,229 (32.73 %)	54,528 (2.15 %)
559	takin (Tak-1 2022) GCF_023091745.1	31,914 (1.65 %)	19,290 (1.42 %)	21,656 (1.27 %)	n/a	43.32 (100.00 %)	152 (0.00 %)	1,363 (100.00 %)	3,256,033 (21.01 %)	714,375 (8.32 %)	13,010,154 (44.58 %)	49,134 (7.43 %)
560	Talazac's shrew tenrec GCA_004026705.1	n/a	22,605 (0.81 %)	50,725 (1.09 %)	n/a	43.03 (99.93 %)	6,619 (0.02 %)	795,514 (99.98 %)	3,493,378 (14.58 %)	705,274 (1.31 %)	20,975,335 (36.85 %)	70,793 (1.26 %)
561	tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023) GCA_028389975.1	n/a	11,133 (0.77 %)	13,869 (0.98 %)	n/a	38.63 (100.00 %)	2 (0.00 %)	14,285 (100.00 %)	3,114,522 (26.10 %)	661,874 (3.02 %)	11,667,649 (38.41 %)	12,393 (0.46 %)
562	tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023) GCA_028372415.1	n/a	17,652 (0.77 %)	15,774 (0.88 %)	n/a	38.73 (99.81 %)	515 (0.19 %)	315 (100.00 %)	5,836,160 (26.14 %)	1,193,709 (2.72 %)	22,682,658 (39.52 %)	23,629 (0.48 %)
563	Tasmanian devil GCF_902635505.1	52,057 (2.36 %)	15,918 (0.85 %)	16,111 (0.91 %)	n/a	36.16 (100.00 %)	354 (0.00 %)	106 (100.00 %)	6,789,158 (44.28 %)	1,246,027 (2.19 %)	21,434,803 (41.20 %)	23,609 (0.65 %)
564	thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC) GCF_016881025.1	69,352 (3.50 %)	18,934 (1.68 %)	16,775 (1.37 %)	n/a	39.91 (93.25 %)	146,412 (6.77 %)	7,132 (100.00 %)	4,262,890 (35.64 %)	640,624 (1.64 %)	14,118,452 (27.90 %)	28,317 (0.64 %)
565	Tibetan sand fox (lyu1992 2022) GCA_024500485.1	n/a	19,552 (1.59 %)	19,307 (1.35 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	145 (0.00 %)	234 (100.00 %)	4,500,832 (32.18 %)	999,068 (2.01 %)	13,646,015 (32.98 %)	49,402 (2.19 %)
566	tiger GCF_018350195.1	71,226 (2.84 %)	18,513 (1.68 %)	19,919 (1.39 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	65 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,878,003 (42.77 %)	912,595 (1.82 %)	13,804,650 (33.76 %)	64,312 (2.55 %)
567	Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230055.1	n/a	19,370 (1.77 %)	21,062 (1.61 %)	n/a	42.81 (100.00 %)	219 (0.00 %)	610 (100.00 %)	2,923,694 (25.49 %)	772,382 (3.25 %)	10,654,074 (37.41 %)	48,226 (2.42 %)
568	Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230045.1	n/a	18,627 (1.82 %)	20,108 (1.67 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	217 (0.00 %)	182 (100.00 %)	2,733,927 (24.79 %)	715,258 (3.17 %)	10,099,456 (36.35 %)	47,139 (2.58 %)
569	Transcaucasian mole vole GCA_001685075.1	n/a	20,173 (1.62 %)	18,627 (1.30 %)	n/a	41.51 (96.09 %)	440,846 (3.96 %)	499,269 (96.04 %)	3,827,136 (25.51 %)	810,597 (2.65 %)	13,634,524 (27.54 %)	9,596 (0.16 %)
570	Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq) GCF_000622305.1	54,667 (2.07 %)	19,704 (1.26 %)	21,262 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	356,097 (95.17 %)	6,165,645 (34.95 %)	1,197,750 (2.77 %)	16,282,383 (36.21 %)	22,905 (0.49 %)
571	Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019) GCA_005458795.1	n/a	19,867 (1.62 %)	15,893 (1.33 %)	n/a	39.77 (94.43 %)	296,819 (5.60 %)	315,631 (94.40 %)	4,452,628 (33.94 %)	751,210 (1.84 %)	13,917,879 (30.08 %)	26,541 (0.58 %)
572	vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019) GCA_008692045.1	n/a	9,367 (1.66 %)	11,297 (1.30 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	9,470 (100.00 %)	1,708,360 (43.81 %)	267,584 (1.67 %)	5,373,410 (33.52 %)	29,783 (1.94 %)
573	vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1	60,106 (3.00 %)	18,611 (1.76 %)	20,103 (1.39 %)	35,176 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	212 (0.34 %)	64 (100.00 %)	4,067,454 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,582 (35.55 %)	66,806 (1.79 %)
574	water buffalo (Mediterranean 2018) GCF_003121395.1	69,771 (3.14 %)	19,465 (1.58 %)	21,849 (1.37 %)	46,051 (1.86 %)	41.81 (99.99 %)	410 (0.01 %)	509 (100.00 %)	5,407,697 (47.11 %)	473,976 (1.54 %)	13,015,899 (41.23 %)	43,120 (1.15 %)
575	water buffalo (Murrah 2021) GCF_019923935.1	80,552 (3.26 %)	19,402 (1.59 %)	20,375 (1.31 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	659 (0.00 %)	26 (100.00 %)	5,358,548 (47.11 %)	447,338 (1.14 %)	13,034,537 (41.28 %)	40,189 (1.07 %)
576	Weddell seal (WS11-02 2013 refseq) GCF_000349705.1	48,251 (2.73 %)	21,063 (1.73 %)	22,333 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	169,547 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,256 (0.66 %)	13,410,237 (22.09 %)	48,738 (1.01 %)
577	western European hedgehog (2012 refseq) GCF_000296755.1	29,923 (1.67 %)	18,067 (1.33 %)	19,777 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	225,567 (85.91 %)	6,594,783 (45.66 %)	1,271,533 (2.29 %)	12,374,161 (42.02 %)	28,528 (0.71 %)
578	western European hedgehog (alternate hap 2023) GCA_950295305.1	n/a	14,370 (1.06 %)	24,297 (1.27 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	26,601 (100.00 %)	3,360,923 (19.59 %)	1,043,098 (3.92 %)	8,511,380 (53.68 %)	23,321 (0.97 %)
579	western European hedgehog (primary hap 2023 refseq) GCF_950295315.1	61,103 (2.36 %)	18,125 (1.16 %)	20,689 (1.21 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	3,760 (0.03 %)	1,174 (100.00 %)	4,891,329 (19.68 %)	1,507,929 (3.81 %)	12,571,105 (54.50 %)	32,667 (0.90 %)
580	western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022) GCA_921998345.2	n/a	21,722 (2.14 %)	19,586 (1.39 %)	108,856 (4.46 %)	41.81 (98.87 %)	1,233 (1.13 %)	233 (100.00 %)	4,634,551 (40.61 %)	1,541,826 (3.49 %)	13,030,566 (35.21 %)	22,985 (0.56 %)
581	western spotted skunk GCA_004023965.1	n/a	21,665 (1.46 %)	34,370 (1.32 %)	n/a	41.61 (99.92 %)	11,822 (0.05 %)	433,831 (99.95 %)	4,889,781 (40.77 %)	901,906 (2.30 %)	13,931,764 (34.80 %)	54,394 (1.54 %)
582	western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022) GCA_921997135.2	n/a	21,699 (2.10 %)	18,837 (1.32 %)	n/a	41.69 (99.51 %)	1,576 (0.49 %)	143 (100.00 %)	4,507,329 (41.24 %)	1,517,241 (3.77 %)	12,832,499 (36.17 %)	22,568 (0.53 %)
583	whiskered bat (hap1 2024) GCA_964094495.2	n/a	19,504 (1.78 %)	22,272 (1.73 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	1,566 (0.02 %)	533 (100.00 %)	3,046,246 (25.06 %)	753,151 (4.86 %)	10,596,418 (37.62 %)	66,785 (2.55 %)
584	whiskered bat (hap2 2024) GCA_964195625.1	n/a	18,681 (1.83 %)	21,523 (1.79 %)	n/a	43.13 (99.99 %)	1,414 (0.01 %)	1,741 (99.99 %)	2,849,223 (24.50 %)	688,594 (4.80 %)	9,968,980 (36.80 %)	64,365 (2.68 %)
585	white-beaked dolphin (alternate hap 2023) GCA_949774935.1	n/a	17,639 (1.50 %)	25,684 (1.35 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	n/a	25,619 (100.00 %)	3,039,324 (36.05 %)	637,912 (8.02 %)	9,746,398 (38.98 %)	56,325 (3.33 %)
586	white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949774975.1	59,982 (2.43 %)	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	68,551 (3.58 %)
587	white-footed mouse GCF_004664715.2	54,479 (2.82 %)	19,971 (1.69 %)	20,132 (1.42 %)	n/a	42.23 (99.95 %)	2,299 (0.05 %)	1,857 (100.00 %)	5,060,487 (30.71 %)	1,258,073 (2.85 %)	14,007,098 (32.99 %)	23,456 (0.67 %)
588	white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq) GCF_002102435.1	57,774 (2.93 %)	20,661 (1.75 %)	23,085 (1.50 %)	40,987 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	107,058 (0.91 %)	48,653 (99.10 %)	4,800,704 (41.29 %)	413,129 (2.59 %)	13,296,779 (34.22 %)	44,165 (1.19 %)
589	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022) GCA_024140225.1	n/a	12,198 (1.10 %)	18,494 (1.29 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	26 (0.00 %)	14,841 (100.00 %)	1,725,021 (17.81 %)	802,415 (4.26 %)	8,321,474 (45.72 %)	15,669 (0.79 %)
590	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1	40,430 (1.81 %)	17,575 (1.21 %)	21,880 (1.35 %)	47,496 (1.55 %)	39.81 (99.57 %)	1,010 (0.43 %)	147 (100.00 %)	2,846,063 (18.57 %)	1,252,362 (3.89 %)	13,776,063 (46.50 %)	24,589 (0.78 %)
591	wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020) GCF_009834535.1	70,235 (4.11 %)	18,202 (1.93 %)	20,199 (1.66 %)	42,728 (2.35 %)	41.66 (99.99 %)	2,345 (0.01 %)	2,043 (100.00 %)	3,091,018 (33.31 %)	332,720 (5.33 %)	12,161,286 (28.79 %)	55,524 (1.75 %)
592	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq) GCF_000311805.1	34,726 (2.40 %)	18,746 (1.96 %)	17,104 (1.61 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	60,971 (1.18 %)	68,872 (98.82 %)	2,991,821 (33.93 %)	353,632 (1.23 %)	12,349,615 (25.12 %)	45,437 (1.02 %)
593	wild goat GCA_000978405.1	n/a	19,104 (1.48 %)	16,198 (1.21 %)	n/a	41.91 (91.72 %)	279,195 (8.31 %)	368,693 (91.69 %)	5,563,294 (45.39 %)	452,402 (1.99 %)	13,802,376 (35.47 %)	41,935 (0.63 %)
594	wild yak GCF_000298355.1	29,776 (1.92 %)	19,936 (1.62 %)	19,914 (1.32 %)	n/a	41.71 (95.48 %)	192,006 (4.54 %)	233,198 (95.46 %)	5,348,663 (46.08 %)	449,880 (1.38 %)	13,572,902 (36.62 %)	41,147 (0.82 %)
595	woodchuck (v1.1 L192 2022) GCF_021218885.2	68,030 (3.47 %)	19,116 (1.55 %)	21,017 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	47 (0.00 %)	3,380 (100.00 %)	5,285,788 (43.20 %)	912,552 (2.73 %)	14,538,866 (35.15 %)	36,914 (1.02 %)
596	woodland dormouse GCA_004027655.1	n/a	23,556 (1.09 %)	55,517 (1.33 %)	n/a	41.52 (99.86 %)	15,691 (0.06 %)	1,283,630 (99.94 %)	7,674,195 (34.99 %)	1,698,258 (3.76 %)	13,705,886 (42.23 %)	68,562 (1.41 %)
597	woodland thicket rat GCF_004785775.1	43,129 (2.40 %)	22,710 (2.13 %)	21,042 (1.49 %)	n/a	41.17 (98.57 %)	76,623 (1.44 %)	23,656 (100.00 %)	4,732,544 (38.04 %)	1,424,025 (3.23 %)	13,549,399 (30.42 %)	18,232 (0.48 %)
598	Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq) GCF_003031525.2	43,297 (2.49 %)	18,747 (1.81 %)	19,638 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	66,343 (99.28 %)	3,547,466 (35.83 %)	540,760 (1.65 %)	12,691,756 (32.88 %)	59,050 (1.48 %)
599	Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.2	26,115 (1.61 %)	18,978 (1.74 %)	20,661 (1.39 %)	n/a	41.24 (98.69 %)	123,788 (1.33 %)	148,598 (98.67 %)	3,788,303 (37.04 %)	690,288 (1.96 %)	12,841,906 (35.04 %)	62,458 (1.54 %)
600	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019) GCF_003676075.3	42,654 (2.16 %)	19,547 (1.52 %)	21,406 (1.40 %)	n/a	39.89 (97.96 %)	35,509 (2.04 %)	66,442 (97.96 %)	3,814,223 (27.39 %)	800,865 (1.96 %)	14,323,977 (32.63 %)	34,122 (0.91 %)
601	yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCF_016432865.1	47,606 (2.50 %)	15,703 (0.78 %)	16,155 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	620 (0.01 %)	486 (100.00 %)	5,191,383 (23.81 %)	1,269,772 (2.59 %)	21,430,585 (42.69 %)	28,118 (0.66 %)
602	yellow-spotted hyrax GCA_004026845.1	n/a	20,424 (0.86 %)	43,984 (1.27 %)	n/a	40.93 (99.94 %)	3,815 (0.01 %)	971,748 (99.99 %)	5,365,974 (31.41 %)	435,699 (1.22 %)	21,229,266 (45.17 %)	38,521 (0.68 %)
603	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1	n/a	17,610 (1.00 %)	20,322 (1.04 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	276 (0.00 %)	62 (100.00 %)	3,295,935 (23.58 %)	389,907 (6.37 %)	19,525,382 (45.90 %)	31,831 (0.63 %)
604	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023) GCA_028571665.1	n/a	16,320 (1.03 %)	20,318 (1.13 %)	n/a	40.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,169 (100.00 %)	2,911,332 (23.50 %)	347,110 (4.57 %)	17,256,419 (44.04 %)	28,674 (0.68 %)
605	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023) GCA_028536395.1	n/a	19,188 (1.79 %)	21,673 (1.72 %)	n/a	43.03 (100.00 %)	215 (0.00 %)	250 (100.00 %)	3,043,589 (24.76 %)	773,853 (4.49 %)	10,648,494 (37.26 %)	61,910 (2.52 %)
606	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023) GCA_028538775.1	n/a	18,587 (1.82 %)	21,049 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	685 (100.00 %)	2,890,086 (24.28 %)	719,555 (4.26 %)	10,089,514 (36.35 %)	60,975 (2.61 %)
607	zebu cattle (Hainan HN024 2024) GCA_039881165.1	n/a	19,162 (1.53 %)	20,991 (1.34 %)	n/a	41.77 (99.99 %)	350 (0.01 %)	292 (100.00 %)	3,296,209 (23.14 %)	440,574 (1.28 %)	12,824,144 (40.98 %)	39,400 (1.07 %)
608	zebu cattle (Nelore 2014 refseq) GCF_000247795.1	39,817 (2.52 %)	18,603 (1.59 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,770 (92.59 %)	5,119,428 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,672 (36.60 %)	35,241 (0.84 %)
TOTALS:	total assembly count 608

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	221 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	608 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	399 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	425 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	280 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1114 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	305 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	918 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	287 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	110 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	527 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1067 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	96 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	778 assemblies	assembly stats	track stats

Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links